SESIÓN 3.

Aminoácidos y relación estructura-

función de proteínas.
Sebastián González Catrilelbún
Bioquímico y Dr. Microbiología
sgonzalezc@docente.uss.cl
• Reconocimiento de la estructura de
los aminoácidos y sus grupos
funcionales.
• Variación de la carga del radical de
un aminoácido a distintos pH
fisiológico.
• Relación estructura función de las
proteínas. Proteínas globulares y
fibrosas.
• Descripción de hidrólisis y
desnaturación y su efecto sobre la
función proteica.
Estructura de los aminoácidos y
carga del grupo radical
 Los aminoácidos comparten características
estructurales comunes

Radical R tiene una estructura variable, que determina la identidad

y las propiedades de cada uno de los diferentes aminoácidos
Los aminoácidos pueden ser clasificados según su grupo R.
Grupo R, alifáticos no-polares
Grupo R, Aromáticos

El triptófano y tirosina, y en un
menor grado la fenilalanina,
absorben la luz ultravioleta
Grupo R, no-cargados y polares

Los enlaces disulfuro desempeñan un

papel especial en las estructuras de
muchas proteínas mediante la formación
de enlaces covalentes entre las partes de
una molécula de proteína o entre dos
cadenas polipeptídicas diferentes.
Grupo R, cargados positivamente (básicos)
Grupo R, cargados negativamente (ácidos)
Aminoácido Abreviación
Zwitterión: molécula
que puede ionizarse
positiva o
negativamente. Un
aminoácido es un
zwitterión.

pH
+1 0 -1
pK’s DE AMINOÁCIDOS

ESPECIALES
ÁCIDOS
BASICOS
Formas que alteran la estructura
proteica
 Factores que alteran la estructura proteica.

I. Alteración en el plegamiento normal. La proteína no logra

su estructura nativa.
II. Mutaciones.
III. Desnaturalización o denaturación. Alteran la estructura
nativa de una
IV. Hidrólisis. proteína.

I. Alteración en plegamiento normal.

- No cumple su función
- Tiende a unirse a otras moléculas
- Suele ser degradada, aunque otras veces se acumula en forma
patológica.
- Consume recursos celulares (materia y energía)
 Ejemplos de patologías asociadas a alteraciones del plegamiento
de ciertas proteínas

1. Enfermedad de Alzheimer: se ha observado

alteración en el plegamiento del péptido beta-
amiloide, formado a partir de la proteína
transmembrana PPA (proteína precursora del
amiloide), formándose depósitos extracelulares:
placas amiloides.
También alteración en el citoesqueleto de
neuronas.
2. Enfermedades causadas por Priones:
Prion: partícula infecciosa de naturaleza proteica
• Enfermedad de Creutzfeldt-Jacob en humanos.
• Encefalopatía espongiforme bovina (enf. de las vacas locas).
Forma Normal, plegada en α-hélice (A).
Forma Patológica, una parte en configuración β (B). Proteínas β
sirven de molde para cambiar el plegamiento de las normales y
así se expande la lesión.
 II. Mutaciones.
EJEMPLO DE ENFERMEDADES POR MUTACIONES

- mutaciones no patogénicas.
- mutaciones patogénicas que inducen enfermedades no invasivas.
- mutaciones carcinogénicas.

Algunos tipos de cáncer tienen origen en:

- mutaciones en proteínas que controlan velocidad de división celular.
- mutaciones en factores que regulan expresión de genes.
- mutaciones que inhiben apoptosis.
- mutaciones que afectan detección de alteración de transcripción
 III. Desnaturalización de proteínas

Definición: Destrucción de la estructura tridimensional La desnaturalización de proteínas puede

de una proteína que no supone la separación de sus ser reversible o irreversible. Esto depende del
aminoácidos constituyentes. grado de cambios estructurales que haya
sufrido la proteína durante el proceso de
desnaturalización y también de la solubilidad
Desnaturación
de la forma desplegada, y del tipo de agente
denaturante utilizado.
Si la desnaturalización es reversible, la proteína
puede volver a su conformación nativa
(funcional) si el agente desnaturalizante es
removido. Este proceso opuesto se conoce
como renaturalización.
En el caso de desnaturalización irreversible, la
Proteína reestructuración de la proteína de vuelta a su
Proteína normal Renaturación
denaturalizada conformación espacial funcional puede ser
(Nativa)
lento, desde horas hasta días, o puede ser
totalmente imposible.
 ¿Cómo actúan los agentes desnaturantes?

Nota: Agentes reductores como el beta-mercaptoetanol pueden romper enlaces disúlfuros.

 Ejemplo de desnaturalización

En la figura a,

% de desplegado
Desplegada
¿cuál proteína es
más resistente a
la denaturación?
% de desplegado

Temperatura (ºC)

% de desplegado
Plegada

[Agente denaturante]
 Hidrólisis de proteínas

Es la ruptura química o enzimática de moléculas de proteína en péptidos de tamaños

diversos y/o aminoácidos. Este fenómeno es irreversible y, por tanto, la proteína pierde su
estructura y función permanentemente.
 Tipos de hidrólisis

Ruptura del enlace peptídico => fragmentación de la proteína

Hidrólisis química
• HCl 6 M a 110ºC por 24 ó más horas. Inespecífico.
• Bromuro de cianógeno (BrCN). Corte específico post Metionina.

Hidrólisis enzimática
• Proteasas que rompen enlaces de secuencias específicas
• Ej. Pepsina, tripsina, quimotripsina
• Ocurre en aparato digestivo o dentro de la célula (en lisosomas, proteosomas)
Relación estructura y función de
proteínas
 Las proteínas pueden clasificarse en dos grandes grupos
Fibrosas
Globulares
- Proporcionar soporte mecánico . - Llevan a cabo la gran mayoría de las funciones
- Suelen ser insolubles. celulares.
- Formadas por una unidad repetitiva simple - Se degradan más fácilmente que las proteínas
que se ensambla para formar fibras. fibrosas.
- Suelen ser solubles en disoluciones acuosas.
Ej: Colágeno - Los grupos apolares (radicales hidrofóbicos) se
agrupan en el interior de la molécula, mientras que
los polares (radicales hidrofílicas) se disponen
hacia el exterior.

Ej: Mioglobina
 Ejemplos proteínas fibrosas: Queratinas

α −Queratina

Presente en todos los vertebrados superiores (pelo, cuerno, uñas, plumas).

Está constituida por agrupaciones de pares de hélices alfa arrolladas. Aparecen
entrecruzamientos intercatenarios por puentes disulfuro que las hacen insolubles. Las
queratinas duras (pelo, cuerno, uñas) contienen más disulfuros que las blandas (piel).
 Ejemplos proteínas fibrosas: Colágeno

Es la proteína más abundante de los vertebrados, es extracelular y forma fibras insolubles que resisten la
tensión en estructuras tales como: hueso, diente, cartílagos, tendones, ligamentos, piel, y vasos sanguíneos.
Consisten en enrollamientos de 3 hélices y en mamíferos hay 17 cadenas polipeptídicas diferentes que forman
distintos tipos de moléculas de colágeno.
 Estructura del Colágeno

Residuos de glicina

El colágeno exhibe una secuencia

característica (G-X-Y)n, donde X es
frecuentemente prolina e Y es
frecuentemente Hidroxiprolina. Al
asociarse tres de estas hélices, los
residuos de glicina quedan en el
interior permitiendo un contacto
íntimo de las hélices. La deficiencia
de ácido ascórbico, cofactor de la
enzima prolil-hidroxilasa, impide la
hidroxilación de prolinas y hace
que la temperatura de
desnaturalización del colágeno
baje de 39 a 24 grados provocando
el escorbuto.
Hélice de colágeno Tropocolágeno
 Ejemplos proteínas fibrosas: Fibrina

Es una proteína fibrilar con la capacidad de formar redes

tridimensionales de vasos sanguíneos y tendones. Esta
proteína actúa como una especie de pegamento o hilo entres
las plaquetas que se exponen en alguna herida; la fibrina
mantiene a la costra pegada a la herida hasta que aparezca
una nueva capa de piel.
 Ejemplos proteínas globulares

Sandwich β

Miohemeritrina Prealbúmina

Piruvato quinasa, dominio 1

Cilindro β antiparalelo
Proteína de la cubierta del
virus del mosaico de tabaco Inmunoglobulina, dominio V2 Hexoquinasa, dominio 2

a) Predominantemente hélice α b) Predominantemente lámina c) Hélice α y lámina β mezcladas

β
 Ejemplos proteínas globulares: Albúmina

Es una proteína de estructura terciaria que se

sintetiza a nivel hepático, siendo la principal
proteína de la sangre y abundante en el ser humano.
La concentración normal en sangre oscila entre 3,5 y
6,0 g/dL y supone un 54,3% de las proteínas
plasmáticas. Entre sus principales funciones está el
mantenimiento de la presión oncótica, distribución
de moléculas liposolubles, hormonas tiroidales,
metales, fármacos y líquidos corporales entre el
compartimento intravascular y el extracelular.

Existe edema cuando la concentración de albúmina es menor a 2 g/dL de sangre.

 Midamos el aprendizaje:

De acuerdo con la estructura de su cadena lateral del siguiente

aminoácido, ¿cuál será la interacción más probable en la que
participará?

a) Interacciones iónicas.
b) Puente de hidrógeno.
c) Puente disulfuro.
d) Interacciones hidrofóbicas.
 Midamos el aprendizaje:

De acuerdo con la estructura de su cadena lateral del siguiente

aminoácido, ¿cómo se clasificaría este aminoácido?

a) Polar no cargado.

b) Alifático no polar.

c) Cargado positivamente.
d) Cargado negativamente.
 Midamos el aprendizaje:
¿Cuál de las siguientes características estructurales
corresponde a una proteína de tipo fibrosa?

a) Su estructura secundaria se compone principalmente de hojas beta.

b) Se pliega sobre sí misma generando una estructura compacta y redondeada.

c) Tiene una gran cantidad de residuos polares por lo que es muy soluble en
agua.

d) Muestra una repetición de secuencias de aminoácidos a lo largo de su

cadena polipeptídica.
 Midamos el aprendizaje:
¿Qué unión intermolecular (interacción o enlace) permite
estabilizar las estructuras secundarias en una proteína?

A) Unión covalente entre el grupo alfa-amino de un aminoácido

con el alfa-carboxilo del siguiente aminoácido
B) Interacción entre un átomo de oxígeno con polaridad
negativa y uno de hidrógeno con polaridad positiva
C) Unión covalente entre las cadenas laterales de dos cisteínas (-
SH) distantes
D) Interacciones entre aminoácidos distantes cuyos radicales
presentan carga