Enzimas Parte Fedra
Enzimas Parte Fedra
Enzimas Parte Fedra
Enzimas: son biomoléculas cuya función es aumentar o disminuir la velocidad de las reacciones bioquímicas
Para que las reacciones se produzcan a una velocidad adecuada para la célula.
Se canalicen hacia rutas donde se produzca mejor energía libre de activación.
Para que se regulen la producción de distintas sustancias según la necesidad de la célula.
7. Eficiencia catalítica:
Tienen una velocidad 10₃ a 10⁸ veces mayor que las reacciones no catalizadas.
Cofactor
-Constituyente no proteico que utilizan las enzimas para poder cumplir su función como catalizadores.
- Son iones o moléculas inorgánicas, están unidos débilmente a la enzima y los requieren para su actividad.
Coenzima
-Reacciona con la enzima de igual modo que el sustrato uniéndose al centro activo.
Grupo prostético
1. Nombre común:
Nombre del sustrato de las reacciones + reacción + terminación asa (Glucosidasa, ureasa)
Descripción de la actividad efectuada (Deshidrogenasa del lactatosina, adenilciclasa).
Nombres triviales (Tripsina, pepsina) (Trivial suministra poca información sobre las reacciones que
catalizan).
2. Nombre sistemático:
Se le asigna a cada enzima un número de 4 dígitos que caracteriza el tipo de reacción catalizada.
El código numérico encabezado por las letras EC
1° Digito: clase.
2° Digito: subclase
4° Dígito: Enzima
1- Oxidoreductasas:
Subclases Oxidoreductasas
Las hidroxilasas incorporan un átomo del oxígeno molecular en el sustrato; el segundo oxigeno forma
agua.
2- Transferasas:
Subclases Transferasas
3- Hidrolasas:
Nota: ruptura hidrolitica o hidrolisis→ es la descomposición de sustancias orgánicas por acción del agua
Subclases Hidrolasas
- Adición de grupos a dobles enlaces o formación de dobles enlaces por eliminación de grupos.
Subclases Liasas
5- Isomerasas:
-Enzimas que catalizan cambios geométricos, ópticos o estructurales dentro de la misma molécula.
6- Ligasas:
-Catalizan la unión o formación de enlace de dos compuestos (C-C, C-S, C-O, C-N), mediante la energía
liberada en la ruptura de una molécula de ATP.
Sitio activo:
-Es una pequeña porción de la enzima constituida por una serie de aminoácidos que interaccionan con el
sustrato.
La alta especificidad se debe a que su estructura terciaria le permite formar cavidades llamadas sitios activos,
- Este modelo supone que la estructura del sustrato y del centro activo son complementarias (Como una
llave encaja en una cerradura).
El acoplamiento es tan bueno que el complejo enzima-sustrato es mucho más estable y por lo tanto costara mucho
separarlo, De esta manera la enzima nunca encontrara que el sustrato se convierta en producto.
Es válido en muchos casos pero no es siempre el correcto porque explica la especificidad pero no la catálisis.
-Además existen otros criterios que dicen que algunas enzimas tienen una configuración semejante a otras y se ha
demostrado que algunos sitios de unión de la enzima- sustrato son similares y para aceptar este método tendrían
que ser altamente específicas.
Catálisis enzimática
Mecanismos catalíticos
Energía de activación:
Barrera de energía que hay que superar para que se produzca la reacción.
Efecto de la proximidad: Las enzimas logran en su centro activo una concentración local de reactivos mucho
mayor que cuando están en solución.
-Parte de la energía de activación se utiliza para que los sustratos roten y se enfrenten con los átomos
correctos para formar los enlaces.
- La eficacia de los choques dependen de la orientación de las moléculas en el momento del choque, ya que en
ocasiones los choques pueden regenerar las moléculas de los mismos reactivos.
- Las interacciones enzimas– sustratos orientan los grupos reactantes y los juntan unos con otros.
Efecto de orientación:
- Una vez situadas correctamente sobre la superficie enzimática los sustratos pueden ser tensionados hacia el
estado de transición (Transición: Pasar de un estado a otro)
- Los sustratos quedan preparados para la catálisis acido básica y/o catálisis covalente
- La enzima puede inducir una tensión o una distorsión en el enlace susceptible de la molécula de
sustrato, que determina que la ruptura del enlace sea más fácil.
Catálisis ácido básicas específicas: En ella los catalizadores son propiamente los iones H+ o OH-, procedentes
de la ionización de ácidos y bases, sin que los respectivos aniones de estos ácidos o los cationes de estas bases
presentan capacidad catalítica.
Es la producida por procesos de transferencias de protones entre los catalizadores que se han de considerar
como ácidos o bases de Bronsted, frente al sustrato que tiene carácter de base o de ácido de Bronsted.
Catálisis Covalente: Es un tipo de catálisis en la que el catalizador no solo estabiliza energéticamente el
complejo activado.
Sino que además el sustrato se ve modificado transitoriamente por formación de enlace covalente con la
enzima para dar lugar a un intermedio covalente muy reactivo.
Dependiendo del tipo de reacción implicada en la formación del enlace covalente, La Catálisis covalente
puede ser:
Catálisis nucleofilica
Catálisis Electrofilica
Catálisis por iones metálicos: Los iones metálicos participan en diferentes formas de catálisis:
Cinética Enzimática
Cinética Química: Estudia la velocidad de la reacción de los procesos químicos en función de todas las
variables que afectan la velocidad de la reacción.
Velocidad de reacción: Es el cambio en la cantidad (moles, gramos) de producto que se genera, o la cantidad
de reactivos que se consumen por unidad de tiempo.
En la reacción ocurre:
Ecuaciones de velocidad: Tambien llamadas leyes de velocidad. Muestran como varia la concentracion de una
molecula en función del tiempo de reacción.
Orden de reacción: Se refiere al número de moléculas involucradas en la reacción para formar un producto.
Cinética enzimática
Las mediciones de la cinética enzimática proporcionan una herramienta bioquímica útil para:
La actividad de las enzimas está controlada por las concentraciones de la enzima y el sustrato.
Unidad de actividad enzimática (U): Es la cantidad de enzima que cataliza la conversión de un µmol de
sustrato en un minuto.
1 katal= 6x107 U
NOTA: La concentración de enzima se expresa en unidades enzimáticas por unidad de volumen (U/mL).
Velocidad inicial (Vi): Se utiliza para calcular los parámetros cinéticos de la reacción.
Reacción de un substrato (S) con una enzima (E) para formar el complejo activado (ES).
El complejo se descompone originando el producto (P) y la enzima.
El complejo también puede revertirse hacia el substrato.
E+S ES E+P
Valor de Km: Equivale a la concentración de sustrato con la que la velocidad de la reacción es la mitad
de la velocidad máxima.
Refleja la afinidad de la enzima por su sustrato
El valor de Km no varía con la concentración de enzima.
Valores de Km pequeños reflejan una elevada afinidad de la enzima por su sustrato.
Valores de Km grandes reflejan una baa afinidad de la enzima por su sustrato.
1. Efecto del pH: Por encima o por debajo del pH óptimo disminuye bruscamente la velocidad de
reacción.
Esto ocurre porque las enzimas son de naturaleza proteica por lo que se desnaturalizan y pierden su
actividad si el pH varia más allá de sus límites óptimos.
Los efectos del pH sobre la velocidad de reacción pueden atribuirse a ionización de aquellos grupos
ácidos y básicos de la enzima y el sustrato.
2. Efecto de la temperatura: En general, el rango de temperatura óptima para las reacciones enzimáticas
es muy estrecho.
Por ello los ligeros cambios en la temperatura suelen tener una influencia considerable en cambios a la
estructura proteica causando perdida de la actividad enzimática.
La mayoría de las enzimas son muy termolábiles y habitualmente cuando se aplica una temperatura de
40-80°C por 2-5 min. Se destruye su actividad.
Básicamente, la velocidad de reacción aumenta con la temperatura, pero luego desciende según
aumenta la temperatura.
4. Concentración de enzimas: A mayor cantidad de enzima, mayor será la velocidad de reacción, porque
hay mayor probabilidad de contacto entre la enzima y el sustrato, de modo que se necesita mayor
cantidad de sustrato para alcanzar la saturación.
5. Presencia de Inhibidores: Los inhibidores son moléculas que pueden unirse a la enzima reduciendo
total o parcialmente su actividad catalítica.
Los inhibidores pueden aumentar la Km o reducir Vmax.
Estas moléculas son diferentes al sustrato. Hay fármacos que actúan reduciendo o eliminando
la actividad de enzimas específicas.
Inhibición reversible: Cuando las concentraciones del inhibidor caen, la actividad de la enzima se regenera.
Inhibición Competitiva: El inhibidor se fija al centro activo de la enzima libre, impidiendo la fijación del
sustrato.
*La unión del inhibidor al centro activo compite con el sustrato.
*Aumenta Km
*No cambia Vmax.
Características:
Las fijaciones del sustrato e inhibidor son mutuamente exclusivas.
A muy altas concentraciones del sustrato desaparece la inhibición.
Por lo general, el inhibidor competitivo es un análogo químico del sustrato. Es decir, pueden
tener un aspecto semejante pero no son homólogos.
Inhibición acompetitiva: El inhibidor no se une en el mismo sitio que el sustrato, pero su unión a la
enzima aumenta la afinidad del sustrato por la enzima, dificultando su disociación e impidiendo la
formación de los productos.
*Disminuye Km
*Disminuye Vmax.
Ligandos de metales: Como el ion cianuro CN-, actúa sobre los sistemas de hierro heminico como la
citocromo oxidasa, de la que deriva su elevada toxicidad.
El hierro heminico es el hierro que proviene de fuentes animales. Forma parte de la hemoglobina o
mioglobina animal
Metales pesados
Inhibidores suicidas: Son moléculas que se unen al centro activo de manera específica, igual que el sustrato o
los inhibidores competitivos.
Una vez unido al centro activo, la enzima transforma a la molécula en una especie química muy reactiva que
modifica covalentemente la enzima inactivándola.
Este inhibidor tiene:
La especificidad del inhibidor competitivo
La potencia de los inhibidores irreversibles.
Ejemplo:
Las enzimas catalizan pasos individuales en las vías metabólicas mediante una secuencia de reacciones.
Por otro lado, la concentración de la enzima es modulada continuamente en respuesta a las necesidades
fisiológicas.
Modulación no covalente:
a) Retroinhibicion o inhibición por producto final.
Simple
Secuencial
Acumulativo
b) Regulación cruzada.
Modulación covalente:
Zimógenos: Generalmente las pro-enzimas se sintetizan en abundancia, se almacenan en
gránulos secretorios y se activan covalentemente luego de que han sido liberadas de su sitio de
almacenamiento.
Ejemplos.
*Pepsinogeno, tripsinogeno y quimiotripsinogeno. Estos dan origen a enzimas proteolíticas
digestivas.
*Muchas de las proteínas involucradas en la cascada de coagulación.
Fosforilacion dependiente de AMPc.
Alosterismo:
Enzimas alostericas: Oligomero cuya actividad biológica es afectada por otras sustancias que lo enlazan. Estas
sustancias cambian la actividad enzimática mediante la modificación de la estructura cuaternaria.
Se dividen en 2 clases:
Clase K
Clase V
Efector alosterico: Es una sustancia que modifica el comportamiento de una enzima alosterica.
Puede ser:
Inhibidor alosterico: Moléculas que favorecen la forma T.
Activador alosterico: Moléculas que favorecen la forma R
Sistemas K y Sistemas V: Son dos formas por las que la actividad enzimática puede alterarse por la acción de
efectores alostericos.
Muchas enzimas alostericas responden a varios efectores con comportamiento tipo-K y tipo-V.
En ausencia de ligando la proteína existe en una conformación. Cuando el ligando se une, induce un cambio
conformacional que es transmitido al resto de la enzima modificando las constantes de afinidad.
Efecto Homotropico: Los 2 ligandos influencian la capacidad del otro para unirse, pueden ser químicamente
idénticos. Aquí actúa:
Sustrato sobre sustrato. Activador sobre activador.
Izoenzimas
Son las distintas formas moleculares de una misma enzima que presentan especificidad por el mismo
sustrato. Es decir, catalizan la misma reacción.
Estas enzimas están presentes a diferentes concentraciones en diferentes órganos.
La técnica que se emplea para estudiar las izoenzimas es la electroforesis.
El estudio de las izoenzimas es fundamental en la investigación de la base molecular de la
diferenciación celular y de la morfogénesis.
Variabilidad tisular: Distintos tejidos u órganos de un mismo individuo muestran diferentes formas
moleculares o distintas cantidades relativas de la misma izoenzima.
Variabilidad ontogénica: Un mismo tejido u órgano en distintos momentos del desarrollo muestra
diferentes formas moleculares o distintas cantidades relativas de la misma izoenzima.
Láctico deshidrogenasa (LDH): Es una enzima glucolitica. Su medición es esencial para el diagnóstico
de infarto agudo de miocardio. Esta enzima existe en 5 formas muy relacionadas (Izoenzimas)
ubicadas de la siguiente manera:
1. LDH1: Corazón, musculo y hematíes.
2. LDH2: Sistema retículo endotelial y leucocitos
3. LDH3: Pulmones
4. LDH4: Riñones, placenta y páncreas.
5. LDH5: Hígado y musculo.
Asparaginasa: Enzima extraída de E. Coli Usada en el tratamiento de los pacientes con Leucemia
Linfoblastica Aguda (LLA) y linfoma no hodgkin.
Produce la hidrolisis del aminoácido aspargina en aspartato el cual no satisface las necesidades de las
células malignas por lo cual produce una disminución de la viabilidad del tumor.
Estreptoquinasa: Es producida por estreptococcus β-hemolitico del grupo C. Usada en pacientes con
infarto agudo de miocardio en tromboembolismos.
Es un activador exógeno del sistema fibrinolitico humano. Por lo que disuelve coágulos sanguíneos que
se forman en el corazón, los vasos sanguíneos o pulmones después de un ataque cardiaco a de alguna
otra enfermedad.
Uroquinasa: Es una proteasa obtenida a partir de cultivos celulares, es usado para deshacer los
coágulos de sangre que están causando un ataque al corazón. También es usada para destruir los
coágulos de sangre en los pulmones venas o arterias.