Semana 15 - Diagnotico Molecular
Semana 15 - Diagnotico Molecular
Semana 15 - Diagnotico Molecular
Unidad: IV
CLASE N° 15
Diagnostico Molecular.
Mg.
Diagnostico molecular
DEFINICION
El concepto de “diagnóstico molecular” es un término
amplio que incluye técnicas de biología molecular en
beneficio de la salud humana, detectando y/o
cuantificando secuencias genéticas específicas de
ácido desoxirribonucleico (ADN), ácido ribonucleico
(ARN) o proteínas.
Inicialmente, el concepto de “Biología Molecular” se
aplicó a los trabajos realizados
sobre el ADNy se consideraba materia solo académica y
de investigación.
Diagnostico molecular
Vieja
Forma
Muestra de
Tejido del Patologi
paciente a
Proteomica
Proteina
Nueva s
Forma
Espectrometria de Imagen
masas Proteomica
Genomica
Muestra de
Tejido del
paciente o
muestra de
sangre Chip Imagen de
genetico microarrays
¿Cual es el futuro del diagnóstico molecular?
Microarray de genes
Paciente con
muestra patrón de proteína Durante su tratamiento,
"marcador" La quimioterapia
cancer
combinada interrumpe los patrones de
una de las redes del
cáncer.
expresión de proteínas
Paciente
debe se utilizan para
responder
a los asegurarse de que su
medicamen
tos A y B tratamiento interrumpa
Muestra de Paciente
Tejido del esta en efectivamente la vía
paciente o remision celular dirigida en su
muestra de tumor.
sangre
Microarray de proteínas Después del tratamiento,
muestra proteínas
activas más patrones de
expresión de genes y
proteínas verifican que
el cáncer está en
remisión.
¿ Por qué se han desarrollado tantas
herramientas para realizar
diagnósticos utilizando la biología
molecular?
Porque introducen un cambio
positivo en la vida de los
pacientes…….
Diagnóstico Molecular
Proteómica
Genómica
Maldi TOF
PCR
RT-PCR
q-PCR
Microarray
FISH
Técnicas más comunes para del dx por
molecular
• FISH:
• Fluorescent In Situ Hybridization
• De gran utilidad en estudios citogenéticos.
• Detección de genes anómalos.
• Detección/diagnóstico de enfermedades congénitas.
• Detección/diagnóstico de cáncer.
Enfermedades congénitas.
Mutaciones
Epidemiología
Filogenética
MicroArrays:
Es una superficie sólida a la cual se une una colección de fragmentos de ADN. Se
usan para analizar expresión diferencial de genes. Su funcionamiento consiste
en medir el nivel de hibridación entre la sonda específica, y su target, que se
refleja comúnmente mediante análisis de imágenes de la intensidad de
fluorescencia.
Técnicas más comunes para del dx por
molecular
• PCR
• “PCR is a technique that allows chemists to easily, and inexpensively, replicate
as much precise DNA as they need”.
• La PCR es un proceso biosintético in vitro que simula los procesos naturales
de la replicación de ácidos nucleicos mediante el control de variables
básicas como tiempo, temperatura y adición de reactivos.
Microbiología
DIGANOSTICO SEGUIMIENTO
Carga viral
DETECCIÓN/
IDENTIFICACIÓN
HIV CMV
Bacteriología Virología
Micología
Aplicaciones de Biología Molecular
PCR
Microbiología
DIGANOSTICO
Consiste en la detección de un
A partir de un
gen de un patógeno
A partir de una aislamiento
muestra previo
Infecciones
respiratorias Hemocultivos
Gastrointestinales
SNC
Microbiología
SEGUIMIENTO
Carga
viral/secuenciamient
o
CMV
HIV HCV
JC/BK
Tratamiento
Evolución patología
Implementación de corrección terapéutica
Abordaje clínico
qPCR
Aplicaciones de Biología
Molecular
Algunos ejemplos
Los avances en medicina del
Cáncer cáncer se han logrado en gran
parte gracias a BM
• Pronóstico:
• Mediante detección de mutaciones (PCR/MICRO)
• Oncogenes (met, ret)
• Genes de regulación (Rb, p53)
• Genes care giver (BRCA 1, XP)
• Diagnóstico:
• Cáncer cérvix, genotipificación de HPV detección de genotipos
de alto riesgo (PCR/LIPA/CH)
Aplicaciones de Biología
Molecular Algunos ejemplos
Cáncer
• Seguimiento:
• Transcripción de oncogenes (ARNm) PCR/FISH
• Producción de proteínas (proteómica)
• Tratamiento:
• Cáncer de mama, tumores ErbB positivos (FISH/PCR).
Cáncer
Galarza Marco, Guio Heinner, Reques Jenny, Piscoya Omar, Rodríguez Mitzi. Diagnóstico molecular de tuberculosis multidrogorresistente en muestras de
esputo mediante el análisis de curvas de melting. Rev. perú. med. exp. salud publica [Internet]. 2018 Jul [citado 2020 Mar 08] ; 35( 3 ): 433-440. Disponible
en: http://www.scielo.org.pe/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1726-46342018000300009&lng=es. http://dx.doi.org/10.17843/rpmesp.2018.353.3402.
Bordetella pertussis
Tos ferina
El diagnóstico se realiza mediante:
• Técnicas de cultivo microbiológico (sensibilidad entre un 12-
60%, alta especificidad)
• Ensayos de inmunofluorescencia (similar al anterior, mismo
día)
• Diagnóstico molecular, principalmente PCR-TR. (sensibilidad
entre 70-99% y una especificidad de 86-100%, tiempo de
detección de 1-4 horas. (Leber, 2014).
Farfán Mauricio. Biología molecular aplicada al diagnóstico clínico
molecular biology in clinical diagnosis bq. REV. MED. CLIN. CONDES -
2015; 26(6) 788-793]
Linfoma Non-Hodgkin's
El linfoma no Hodgkin (también conocido como LNH o simplemente
como linfoma) es un cáncer que comienza en las células llamadas
linfocitos, La fórmula de predicción de 17
genes identificó a los pacientes con
el peor pronóstico mejor que
cualquier otro método.
https://cisncancer.org/research/new_treatments/molecular_diagnostics/how_it_works.
html
Cromosoma Filadelfia
Anomalía del cromosoma 22 en la que este recibe una parte del cromosoma 9. En la leucemia
mielógena crónica y la leucemia linfocítica aguda, con frecuencia se encuentran células de la médula
ósea que contienen el cromosoma Filadelfia. El cromosoma 22 alterado se llama cromosoma
Filadelfia
RPC-TR es
posible
monitorear la
enfermedad
cuantificando
Presente los transcritos
aproximadamente en: de la fusión
• El 95% de los casos
leucemia mieloide
BCR-ABL
fusión de genes
crónica BCR-ABL
• 25-30% de los casos
leucemia linfoblástica
aguda en el adulto El gen ABL del
cromosoma 9 se une al
gen BCR del
cromosoma 22 para
formar el gen de fusión
BCR-ABL.
Farfán Mauricio. Biología molecular aplicada al diagnóstico clínico molecular biology in clinical diagnosis bq. REV. MED. CLIN. CONDES - 2015; 26(6) 788-793]
Cáncer colon rectal
El cáncer colorrectal es el que se origina en el colon o el recto. A estos cánceres también se les puede
llamar cáncer de colon o cáncer de recto (rectal) dependiendo del lugar donde se originen.
la detección de mutaciones en el gen que codifica para la proteína K-Ras (KRAS) permite determinar
la respuesta a la terapia utilizando anticuerpos contra el receptor del factor de crecimiento epidérmico
(EGFR).
Por lo tanto, el diagnóstico molecular de mutaciones en KRAS es un test realizado en pacientes que
podrían verse beneficiados por esta terapia (Dietel y cols, 2015). Actualmente, existen varios test
diagnósticos disponibles en el mercado, la mayoría con certificación IVD que aseguran la calidad de
los resultados.
Farfán Mauricio. Biología molecular aplicada al diagnóstico clínico molecular biology in clinical diagnosis
bq. REV. MED. CLIN. CONDES - 2015; 26(6) 788-793]
Ejemplo de mejoramiento de la terapia
usando diagnostico molecular
La administración de Herceptina (anticuerpo desarrollado con
farmacogenómica) en la comida y medicamentos a finales de 1998 en
mujeres con altos niveles de la proteína Her-2/neu, (25 a 30 % de pacientes
con cáncer de mama de rápido crecimiento)
https://cisncancer.org/research/new_treatments/molecular_diagnostics/how_it_works.htm
l
El uso de pruebas de diagnóstico en el
punto de atención (Point-of-Care POC)
Farfán Mauricio. Biología molecular aplicada al diagnóstico clínico molecular biology in clinical diagnosis
bq. REV. MED. CLIN. CONDES - 2015; 26(6) 788-793]
El uso de pruebas de diagnóstico en el punto de
atención instrumentos (Point-of-Care POC)
Farfán Mauricio. Biología molecular aplicada al diagnóstico clínico molecular biology in clinical diagnosis bq. REV. MED.
CLIN. CONDES - 2015; 26(6) 788-793]
El uso de pruebas de diagnóstico en el punto de
atención instrumentos (Point-of-Care POC)
(Filmarray
gastrointestinal),
microorganismo
asociados a sepsis
(Filmarray BCID) o
meningitis/encefalitis
(Filmarray ME),
El uso de pruebas de diagnóstico en el punto de
atención instrumentos (Point-of-Care POC)
La secuenciación de
la nueva generación
(NGS: Next-
Generation sequenci)
estudio de
polimorfismos
genéticos (SNP:
single nucleotide
polymorphisms)
Los microareglos
La secuenciación de la nueva generación (NGS: Next-
Generation)
Genoma humano
¿QUÉ ES EL GENOMA HUMANO?
Un genoma es la colección completa
de ADN de un organismo.
GENÓMICA
Ciencia que se encarga de localizar,
dentro del ADN, secuencias que
constituyan la estructura genética de
nuestra especie.
Recuperado de: R.L. Nussbaum, R.R McInnes, H. F. Willard. (2008). Thompson & Thompson: Genética en Medicina.Editorial: ELSEVIER
MASSON.
Proyecto del Genoma humano
Who?
Consorcio HGP and Celera
Genomics
https://es.slideshare.net/vinithasekar/human-genome-project-72272927
Genoma humano
https://www2.le.ac.uk/projects/oer/oers/genetics/oers/Genomics%20and%20the%20Human%20Genome%20Project/Genomics%20and%20the%20Human%20G
enome%20Project-TRF.pdf
https://www.kaufmanhall.com/ideas-resources/article/precision-medicine-future-now
Composición y complejidad
Haploide part
https://www.lehigh.edu/~inbios21/PDF/Fall2014/Marzillier_09052014.pdf
Contenido de ADN de los cromosomas
humanos
http://genoma.unsam.edu.ar/cursos/genetica_humana/teoricas/GenHumCap7_OrgGenoma_alumnos.pdf
Tamaño promedio de exones y intrones
en genes humanos
Genes superpuestos
http://genoma.unsam.edu.ar/cursos/genetica_humana/teoricas/GenHumCap7_OrgGenoma_alumnos.pdf
Genes dentro de genes
Organización del genoma humano
https://es.slideshare.net/revil4/clase-7-organizacin-del-genoma-humano
2% son genes
Relación entre el contenido de G +C y densidad de
genes
Biología Med
Medicina
Celular Regen
Regenerativa
MEDICINA REGENERATIVA: reposición o regeneración de células, tejidos u órganos
dañados mediante, células madre, moléculas solubles con efectos sobre estas células e
ingeniería de tejidos entre otros.
PLASTICIDAD Y AUTORENOVACIÓN
CÉLULAS
MADRE CLASIFICACIÓ
N
ADULTAS,
EMBRIONARIAS,
iPSCs
Medicina regenerativa
• Se basa en el empleo de la terapia celular y en la
ingeniería de tejidos para sustituir las células
dañadas de un órgano por células sanas
procedentes de otros
• Se fundamenta en la capacidad de las células
madres de convertirse en células especificas de
diferentes tejidos
• Constituye una importante revolución en el campo
de la medicina.
Células madre
La medicina regenerativa
• Reemplazo, reparación o
restauración de tejidos lesionados.
• Surge como necesidad de
reconstrucción en niños y adultos
en los que el tejido ha sido dañado
por enfermedades, traumas y
anomalías congénitas.
• La investigación con células madre
tienen un potencial ilimitado para
dividirse y esta fuerza se usa para
la regeneración y reparación de
células dentro del cuerpo durante
el daño tisular.
Ramakrishna1*, P. B. Janardhan1 and L. Sudarsanareddy. Células madre y medicina regenerativa: una revisión. Annual Review & Research in
Biology 1(4): 79-110, 2011 Disponible en: https://www.researchgate.net/publication/222277556_Stem_Cells_and_Regenerative_Medicine_-
A_Review [consultado el 09 de marzo de 2020].
Eltérmino inglés es “Stem cells”
(CÉLULAS TRONCO)
Células Troncales o Tronco.
·• .
.,
1
(;~
,
'Embrión
-
Embrión de
I de
6 semanas Fet Adult
5-7 día
,s o o
Celulas Tejidos
diferenciadas que fetales, cordón
Multi pueden formar umbilical y
células de otros celulas madre
potente tejidos adulto
Tipos de células madre utilizadas
en las investigaciones
Células epiteliales amnióticas
Vadde Ramakrishna and Jana Pb L. Sudarsanareddy. Stem Cells and Regenerative Medicine –A Review. May 2011
https://www.researchgate.net/publication/222277556_Stem_Cells_and_Regenerative_Medicine_-A_Review
https://www.ddw-online.com/therapeutics/p92858-stem-cells-for-cellular-therapy-space.html
Tipos de clase terapéutica celular
abordada de todas las compañías
Vadde Ramakrishna and Jana Pb L. Sudarsanareddy. Stem Cells and Regenerative Medicine –A Review.
May 2011
https://www.researchgate.net/publication/222277556_Stem_Cells_and_Regenerative_Medicine_-A_Review
https://www.ddw-online.com/therapeutics/p92858-stem-cells-for-cellular-therapy-space.html
muestra el desglose de aproximadamente 23,000 publicaciones que se ajustan a los criterios
presentados aquí. Tenga en cuenta que los cuadrantes rojos representan áreas de concentración de
publicaciones, como las células madre hematopoyéticas para trasplante, leucemia, así como bajo los
esquemas de búsqueda de terapia celular.
https://www.ddw-online.com/therapeutics/p92858-stem-cells-for-cellular-therapy-space.html
HSCT: una plataforma de la terapia celular
Trasplante de células madre
hematopoyéticas
El trasplante de
precursores
hematopoyéticos
conocido
genéricamente
como trasplante
de médula ósea,
es un
procedimiento
mediante el cual
se destruye la
médula ósea
dañada de un
paciente y se la
reemplaza por
precursores
hematopoyéticos
nuevos y sanos.
Kitterman/Science Translational Medicine
https://stm.sciencemag.org/content/10/436/eaap9630/tab-figures-data
Kitterman/Science Translational Medicine
https://stm.sciencemag.org/content/10/436/eaap9630/tab-figures-data
Terapia de células T en la era de la
medicina de precisión
Ramakrishna1*, P. B. Janardhan1 and L. Sudarsanareddy. Células madre y medicina regenerativa: una revisión.
Annual Review & Research in Biology 1(4): 79-110, 2011 Disponible en:
https://www.researchgate.net/publication/222277556_Stem_Cells_and_Regenerative_Medicine_-A_Review
[consultado el 09 de marzo de 2020].
IV.-REFERENCIAS BIBLIOGRÁFICAS
• Nuffield Council on Bioethics Genome Editing and Human Reproduction: social and ethical issues (London:
Nuffield Council on Bioethics). 2018
https://www.nuffieldbioethics.org/assets/pdfs/Genome-editing-and-human-reproduction-report.pdf
• Farfán Mauricio. Biología molecular aplicada al diagnóstico clínico molecular biology in clinical diagnosis
bq. REV. MED. CLIN. CONDES - 26(6) 788-793] 2015
• Galarza Marco, Guio Heinner, Reques Jenny, Piscoya Omar, Rodríguez Mitzi. Diagnóstico molecular de
tuberculosis multidrogorresistente en muestras de esputo mediante el análisis de curvas de melting. Rev.
perú. med. exp. salud publica [Internet]. 2018 Jul [citado 2020 Mar 08] ; 35( 3 ): 433-440. Disponible en:
http://www.scielo.org.pe/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1726-46342018000300009&lng=es.
http://dx.doi.org/10.17843/rpmesp.2018.353.3402
• Ramakrishna1*, P. B. Janardhan1 and L. Sudarsanareddy. Células madre y medicina regenerativa: una
revisión. Annual Review & Research in Biology 1(4): 79-110, 2011 Disponible en:
https://www.researchgate.net/publication/222277556_Stem_Cells_and_Regenerative_Medicine_-
A_Review [consultado el 09 de marzo de 2020].
• Vadde Ramakrishna and Jana Pb L. Sudarsanareddy. Stem Cells and Regenerative Medicine –A Review. May
2011 https://www.researchgate.net/publication/222277556_Stem_Cells_and_Regenerative_Medicine_-
A_Review
• Venter, J. C., et al. The sequence of the human genome. Science 291, 1304–1351 (2001)
https://science.sciencemag.org/content/sci/291/5507/1304.full.pdf