Virologie

Virologie
La virologie est l'étude des virus et des agents infectieux associés.

Elle cherche à décrire leurs structures, évolutions, les mécanismes leur
permettant d'infecter les cellules et de mettre à profit les mécanismes
cellulaires pour se reproduire, afin de les classer. Cette étude concerne
aussi les maladies causées par les virus, les techniques pour les isoler
et les cultiver, et leur usage en recherche et en thérapie. La virologie
est généralement considérée comme une branche de la microbiologie
ou de la pathologie. Lire le média
Le laboratoire de virologie du CHU de
Rouen.
Sommaire
Domaines étudiées par les virologues
Structure et classification des virus
Techniques de virologie
Techniques appliquées aux cellules
Titrage viral
Test d'activité antivirale
Techniques de biologie moléculaire
L'apport de la bioinformatique
Histoire
Notes et références
Voir aussi
Articles connexes
Domaines étudiées par les virologues

la réplication virale
les pathologies virales
l'immunité antivirale
les vaccins viraux
les méthodes de diagnostic
la virothérapie
les mesures de contrôle d'une infection
les différents signes de manifestation du virus
Structure et classification des virus

Les virus ont une taille variant de 30 à 450 nm environ, ce qui implique que la plupart d'entre eux ne puissent
pas être observés par un microscope photonique La forme et la structure des virus peut cependant être étudiée
pas être observés par un microscope photonique. La forme et la structure des virus peut cependant être étudiée
en microscopie électronique, en spectroscopie de résonance magnétique nucléaire, et, de façon très courante,
par cristallographie aux rayons X.
Un courant majeur de la virologie se charge de classer les virus. Les virus peuvent être classés selon le type de
cellule hôte qu'ils infectent: zoovirus (cellule animale), phytovirus (cellule végétale), fongivirus (cellule de
champignon), et bactériophage (virus infectant des bactéries, catégorie comprenant les virus les plus
complexes). Une autre classification s'appuie sur la forme géométrique de leur capside (souvent une hélice ou
un icosaèdre) ou sur la structure du virus (présence ou absence d'une enveloppe lipidique par exemple). Le
système de classification le plus largement utilisé distingue les virus selon le type d'acide nucléique qu'ils
utilisent comme matériel génétique et la méthode de réplication qu'ils emploient pour pousser la cellule hôte à
produire de nouvelles particules virales. On distingue:
les virus à ADN (subdivisés en virus à ADN double brin, et les moins courants virus à ADN
simple brin) ;
les virus à ARN (subdivisés en virus à ARN simple brin à polarité positive, virus à ARN
simple brin à polarité négative, rétrovirus, et les moins courants virus à ARN double brin).
Et aussi :
la biologie moléculaire
des virus bactériophages
Techniques de virologie
Comme toute discipline scientifique, la virologie utilisent des techniques communes à d'autres domaines,
comme la culture cellulaire, mais aussi des techniques spécifiques à la virologie.
Techniques appliquées aux cellules
Les lignées cellulaires sont aujourd'hui largement utilisées pour effectuer des tests de criblage, ou pour obtenir
1
des résultats préliminaires .
Titrage viral
Le titrage viral est une technique permettant de déterminer la concentration d'un virus dans un milieu donné.
Deux méthodes existent : la méthode des plages de lyse, et la méthode du DICT50 (équivalent de l'IC50 pour
les produits toxiques). Dans les deux cas, le principe général est de diluer en série une suspension de virus, et
2
de l'administrer à des cultures cellulaires . Après un temps d'incubation variable, l'observation de cellules
lysées par le virus (=plages de lyse), ou de cellules modifiées par l'infection (=effet cytopathique) permet de
quantifier les virus. Cette méthode ne permet cependant pas de quantifier les virus non-infectieux présents.
Test d'activité antivirale
Cette méthode permet de vérifier si une molécule a, ou non, des propriétés antivirales. Le produit à tester est
administré aux cellules, ainsi que le virus. L'observation d'un effet cytopathique, d'une mortalité cellulaire, ou
de marqueurs viraux est ensuite utilisée pour évaluer l'efficacité de la molécule.
Techniques de biologie moléculaire
Les techniques de biologie moléculaire utilisées en virologie sont générales aux autres domaines Les
Les techniques de biologie moléculaire utilisées en virologie sont générales aux autres domaines. Les
principales techniques sont la PCR, la RT-PCR et la PCR quantitative.
L'apport de la bioinformatique
Les virus étant difficilement observables à cause de leur petite taille, la bio-informatique est de plus en plus
utilisée pour des mesures prédictives, notamment en ce qui concerne les changements de conformation des
3
virus .
Histoire
1898 : Découverte du virus de la mosaïque du tabac, alors nommé Contagium vivum fluidum
1898 à 1901 : Découvertes de premiers virus impliqués dans des zoonoses et maladies
humaines (fièvre aphteuse, fièvre jaune)
1917 : Premières découvertes de virus dits bactériophages (infectant des bactéries)
1931 : Première découverte d'un virus oncogène (induisant le cancer chez le poulet)
1939 : Première photographie au microscope électronique d'un virus
4
1957 : Définition « classique » des virus par Lwoff
1983 : Identification du VIH, rétrovirus responsable du SIDA
1989 : Première évaluation du nombre des virus marins (4 à 10 millions dans chaque 1 ml
d'eau)
2003 : Première découverte d'un virus géant (le Mimivirus, dont le génome sera séquencé en
2004)
2008 : Découverte d'un virus encore plus gros, le Mamavirus, et découverte d'un virus
« virophage » capable d'infecter un autre virus
5, 6
2013 : Découverte de deux espèces de Pandoravirus
Notes et références
1. Elsevier Masson, « Culture cellulaire et virologie. Intérêts et applications de la culture cellulaire
en virologie » (http://www.em-consulte.com/article/263914/culture-cellulaire-et-virologie-interets
-et-applic), sur EM-Consulte (consulté le 27 mars 2018)
2. J. B. Brooksby et E. Wardle, « Titration of the virus of foot-and-mouth disease in culture », The
Journal of Hygiene, vol. 52, no 1, mars 1954, p. 87–99 (ISSN 0022-1724 (http://worldcat.org/iss
n/0022-1724&lang=fr), PMID 13152368 (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/13152368),
PMCID PMC2217709 (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2217709), lire en ligne (ht
tps://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/13152368), consulté le 27 mars 2018)
3. V. S. Reddy, H. A. Giesing, R. T. Morton et A. Kumar, « Energetics of quasiequivalence:
computational analysis of protein-protein interactions in icosahedral viruses », Biophysical
Journal, vol. 74, no 1, janvier 1998, p. 546–558 (ISSN 0006-3495 (http://worldcat.org/issn/0006-
3495&lang=fr), PMID 9449355 (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/9449355),
PMCID PMC1299407 (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1299407),
DOI 10.1016/S0006-3495(98)77813-0 (https://dx.doi.org/10.1016%2FS0006-3495%2898%2977
, lire en ligne (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/9449355), consulté le 27 mars 2018)
4. (en) André Lwoff, « The Concept of Virus », Journal of General Microbiology, vol. 17, no 2,
octobre 1957, p. 239-253
(DOI 10.1099/00221287-17-2-239 (https://dx.doi.org/10.1099%2F00221287-17-2-239))
5. (en) Philippe N, Legendre M, Doutre G, Couté Y, Poirot O, Lescot M, Arslan D, Seltzer V,
Bertaux L, Bruley C, Garin J, Claverie JM, Abergel C., « Pandoraviruses: amoeba viruses with
genomes up to 2.5 Mb reaching that of parasitic eukaryotes », Science, vol. 341, no 6143,
19 juillet 2013, p. 281-6. (PMID 23869018 (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23869018),
DOI 10.1126/science.1239181 (https://dx.doi.org/10.1126%2Fscience.1239181), résumé (http://
www.sciencemag.org/content/341/6143/281.abstract))
6. Pandoravirus : découverte d’un chaînon manquant entre le monde viral et le monde cellulaire (h
ttp://www.cea.fr/le-cea/actualites/pandoravirus-114119), article sur le site du CEA, daté du 19
juillet 2013.
Voir aussi
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