1 - Cours Bisostat - M1 - Chapitre 1

Biostatistique
Dr. Makouanzi Ekomono Chrissy Garel

Maître-assistant CAMES en Génétique et Amélioration des Plantes
Université Marien NGOUABI
Email: garelmak@yahoo.fr
Garel Makouanzi
1
LA BIOSTATISTIQUE
La biostatistique (biométrie) est l’application

des concepts et principes statistiques à des
données biologiques
2
Pourquoi faire la Statistique en Biologie ?
Quantité : En biologique on collecte des
quantités pharamineuses de données qu’il
faille analyser
Variabilité : Une expérience en biologie
présente de la variabilité suivant les conditions

3
L’analyse des données est utilisée pour décrire les

phénomènes étudiés (illustration des tendances),
expliquer des évènements, faire des prévisions et
prendre des décisions fondées sur la
connaissance objective des faits
4
En cela, la statistique est un outil

essentiel pour la compréhension et la
gestion des phénomènes plus ou
moins complexes.
5
But du cours de Biostatistique
À la fin de ce module, l’étudiant (e)

devrait
Maitriser la terminologie de base en

biostatistique
6
devrait
Comprendre les bases de

l’expérimentation statistique
7
devrait
Comprendre l’utilité de la statistique

descriptive lors de toute analyse
préliminaire des données 8
devrait
Savoir identifier et mettre en œuvre le

test statistique approprié à l’objectif
d’une étude 9
devrait
Savoir réaliser des analyses

multivariées et la modélisation
10
devrait
Savoir interpréter les résultats avec

fiabilité 11
Déroulement du cours
48h soit 16 séances de 3 heures
Cours magistral (support de cours)
2 TD
2 CC (Sur table et Analyse critique d’article

scientifique)
1 Examen et son éventuel Rattrapage 12

Plan du cours
Chapitre I: INTRODUCTION A LA BIOSTATISTIQUE
Chapitre II: L’EXPERIMENTATION STATISTIQUE
Chapitre III: LA STATISTIQUE DESCRIPTIVE
Chapitre IV: LES TESTS STATISTIQUES
Chapitre V: LA STATISTIQUE MULTIDIMENTIONNELLE
Chapitre VI : LA MODELISATION
13
Chapitre 1
INTRODUCTION A LA BIOSTATISTIQUE
14
Chapitre 1 : INTRODUCTION A LA BIOSTATISTIQUE
Bibliographie de référence
15
La biostatistique ou biométrie est
l’application des concepts et principes
statistiques à des données biologiques.
16
La biostatistique vise :
- la collecte des données
- le traitement des données
- l’analyse des données
- l’interprétation des données
Les méthodes statistiques permettent d’éprouver la validité

des résultats avec la plus grande rigueur scientifique.
17
La terminologie biostatistique
Population
Ensemble d’éléments de même nature
Population cible ou statistique

Ensemble d’éléments sur lequel on aimerait
que les conclusions d’une étude portent.
18
Individu
Unité quelconque de la population
L’ensemble des individus forme une

population
19
Echantillon
Sous ensemble de la population cible
Fraction de la population statistique sur

laquelle des mesures sont faites
20
L’échantillon est identifié par son effectif (n)
L’échantillonnage est le mécanisme de

génération de l’échantillon
21
L’échantillonnage peut être principalement

de 2 types :
- aléatoire
- représentatif
22
Echantillonnage aléatoire simple

Prélèvement au hasard et de façon indépendante
d’un certain nombre d’éléments de la population
statistique à N éléments.
Chaque élément de la population a la même
probabilité d’être sélectionné.
23
Echantillonnage aléatoire simple
24
Echantillonnage aléatoire en grappe
25
Echantillonnage aléatoire à plusieurs degré
26
Echantillonnage représentatif
Prélèvement reflète fidèlement la

composition de la population.
27
Echantillonnage représentatif
28
L’inférence statistique
Extrapolation des résultats observés sur un

échantillon à la population cible. 29
L’inférence statistique
Un résultat n’est intéressant que s’il est possible de le généraliser

à des conditions suffisamment étendues. 30
Variable ou Caractére
Caractéristique mesurable ou observable sur
tous les éléments d’une population ou d’un
échantillon.
2 types de variables:
Quantitatives & Qualitatives
31
Binaire
32
Variable quantitative
Les modalités expriment des quantités numériques
Une variable quantitative peut être:
- continue (les modalités sont des nombres réels

non dénombrables)
- discrète (les modalités sont dénombrables)

33
Variable qualitative
Les modalités n’expriment pas des quantités
numériques
Une variable qualitative peut être:
- Catégorielle ou Nominale (les modalités ne

sont pas hiérarchisées);
- Ordinale (les modalités sont hiérarchisées)
- binaire (présence/absence) 34
Variable semi-quantitative
Variable dont la mesure correspond à une échelle

arbitraire
Exemple: Échelle de jugement sur l’attaque d’une

culture :
0: plantes non attaquées
5: plantes sévèrement attaquées
1-4: plantes plus ou moins attaquées 35
Percevoir la limite entre une variable qualitative

ordinale et une variable quantitative discrète
Position dans une fratrie: 1 – 2 – 3
Nombre d’enfants: 1 – 2 – 3
36
Facteur
Série d’éléments de même nature pouvant être
comparés au cours d’une expérimentation.
Exemple : une série d’essences forestières, un ensemble

de produits phytosanitaires, différentes rations
alimentaires, etc.
37
Les facteurs peuvent être classés en :
- facteur qualitatif, caractérisé par des éléments qui ne
peuvent être classés à priori (exemples : variétés,
fongicides, …)
- facteur quantitatif, dont les éléments se classent de façon

logique à priori (exemples : doses d’un engrais,
températures, …)
On distingue des facteurs étudiés et des facteurs

aléatoires 38
Les facteurs étudiés sont ceux introduits volontairement
dans l’expérience (variétés, doses de fertilisation, …)
Les facteurs aléatoires ce dit des facteurs inhérents au

milieu.
Ceux-ci peuvent être contrôlés lorsque le dispositif

expérimental utilisé les prend en compte (le facteur devient
alors étudié)
39
Traitement ou l’objet
Variante ou niveau d’un facteur unique, de même que
toute combinaison de variantes ou de niveaux de deux
ou plusieurs facteurs.
Exemples : Dans une étude comparative de race (facteur) chez
les bovins, la races ndama et Nelores sont des traitements,
La race ndama traitée avec une dose x d’un vermifuge constitue

une combinaison des variantes de 2 facteurs. 40
Le témoin
Il est fondamental d’examiner l’opportunité d’introduire
ou non, dans l’expérience, un ou plusieurs témoins ou
objets de référence.
Éviter d’inclure d’office un témoin dans une expérience

quand celui-ci n’est pas essentiel pour atteindre
l’objectif fixé au départ.
41
L’unité expérimentale
Unité sur laquelle sont effectuées les observations
Elément de base de l’expérience
Exemples: Parcelle comportant un nombre de plants défini
Groupe d’animaux soumis à un même traitement
Placeau d’arbres
42
La notion de bordure
Pour éviter que les interférences (compétition par exemple)
n’inﬂuencent les résultats
43
Contrôle de connaissances
Effet des ETM sur la fertilité des femmes

dans les ménages périurbains de Brazzaville
Quelle est la population statistique ?
Quelle est la variable étudiée ?
Quel est le facteur étudié ?

44
Contrôle de connaissances
Déterminer la nature des variables suivantes :
1- La taille des arbres
2- Le nombre de fruits produits par un arbre
3- Le statut sérologique des étudiants de la salle
4- La provenance de 5 cultivars de blé
5- Le statut socio-économique des familles en zone rurale
6- Le nombre de boutures produit par un pied mère
7- La surface foliaire d’une population clonale d’Eucalyptus
8- L’appartenance à une famille botanique

45

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La biostatistique (biométrie) est l’application

Quantité : En biologique on collecte des

quantités pharamineuses de données qu’il

Variabilité : Une expérience en biologie

présente de la variabilité suivant les conditions

L’analyse des données est utilisée pour décrire les

En cela, la statistique est un outil

À la fin de ce module, l’étudiant (e)

Maitriser la terminologie de base en

Comprendre les bases de

Comprendre l’utilité de la statistique

Savoir identifier et mettre en œuvre le

Savoir réaliser des analyses

Savoir interpréter les résultats avec

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Chapitre I: INTRODUCTION A LA BIOSTATISTIQUE

Chapitre II: L’EXPERIMENTATION STATISTIQUE

Chapitre III: LA STATISTIQUE DESCRIPTIVE

Chapitre IV: LES TESTS STATISTIQUES

Chapitre V: LA STATISTIQUE MULTIDIMENTIONNELLE

- la collecte des données

- le traitement des données

- l’analyse des données

- l’interprétation des données

Les méthodes statistiques permettent d’éprouver la validité

Ensemble d’éléments de même nature

Population cible ou statistique

Unité quelconque de la population

L’ensemble des individus forme une

Sous ensemble de la population cible

Fraction de la population statistique sur

L’échantillon est identifié par son effectif (n)

L’échantillonnage est le mécanisme de

L’échantillonnage peut être principalement

Echantillonnage aléatoire simple

Prélèvement reflète fidèlement la

Extrapolation des résultats observés sur un

Un résultat n’est intéressant que s’il est possible de le généraliser

Les modalités expriment des quantités numériques

Une variable quantitative peut être:

- continue (les modalités sont des nombres réels

- discrète (les modalités sont dénombrables)

- Catégorielle ou Nominale (les modalités ne

- Ordinale (les modalités sont hiérarchisées)

Variable dont la mesure correspond à une échelle

Exemple: Échelle de jugement sur l’attaque d’une

Percevoir la limite entre une variable qualitative

Position dans une fratrie: 1 – 2 – 3

Exemple : une série d’essences forestières, un ensemble

- facteur quantitatif, dont les éléments se classent de façon

On distingue des facteurs étudiés et des facteurs

Les facteurs aléatoires ce dit des facteurs inhérents au

Ceux-ci peuvent être contrôlés lorsque le dispositif