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Stéréochimie des molécules organiques

Les propriétés des substances dépendent de l’arrangement spatial de leurs atomes. Il est
donc nécessaire de préciser un langage et des représentations de ces structures dans l’espace :
c’est le « but » de la Stéréochimie.

1) Représentation d’un composé organique

1.1 ) Formule brute
1.1.1 ) Définition : Formule brute d’un composé

La formule brute donne, pour une molécule donnée, la nature des atomes la constituant
ainsi que leur nombre. Une molécule organique s’écrira donc sous la forme Cx Hy Nt Oz . . ., (x,
y, z, t nombres entiers). Une telle description porte le nom de formule brute.
Remarque : En chimie organique, les atomes autres que le carbone et l’hydrogène portent
le nom d’hétéroatomes.
Exemple :
l’éthanol a pour formule brute C2 H6 O, l’éthanol est constituée de 2 atomes de carbone, 6
atomes d’hydrogène et 1 atome d’oxygène.

1.1.2 ) Détermination expérimentale de la formule brute

Si la masse molaire moléculaire M a été précédemment déterminée par spectrométrie de
masse, on accède alors facilement à la formule brute Cx Hy Oz Nt

Exemple : L’alanine est un acide aminé de formule brute Cx Hy Oz Nt . Sa masse molaire

a été déterminée : M ≈ 89, 09gmol−1 . Par analyse élémentaire, on trouve les pourcentages
massiques suivants : %C ≈ 40, 3%, %H ≈ 8, 0% et %N ≈ 15, 5%.

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1. REPRÉSENTATION D’UN COMPOSÉ ORGANIQUE 5

1.1.3 ) Nombre d’insaturation

- À chaque fois que l’on retire à un alcane aliphatique, de formule brute Cn H2n+2 deux
atomes d’hydrogène on dira que l’on a un degré d’insaturation supplémentaire.

- Une insaturation correspond à une double liaison ou à un cycle, une liaison triple compte
pour 2 insaturations.
- Si on considère une molécule de formule brute Cc Hh Nn Oo Xx où c, h, n, o et x sont bien
évidemment des nombres entiers, le degré d’insaturation Ni est donné par la formule :
2c + 2 − h + n − x
Ni =
2

Ni

1.2 ) Formule développée

La formule développée donne l’enchaîne- Exemple :

ment des atomes dans la molécule et la nature
des liaisons (simple, double, triple. . .) les unis-
sant, en adoptant (optionnellement) une repré-
sentation de Lewis

1.3 ) Formule semi-développée

La formule semi-développée est une repré- Exemple :

sentation simplifiée qui s’obtient à partir de la
formule développée en ne faisant pas figurer les
liaisons des atomes de carbone avec les atomes
d’hydrogène et où l’écriture de certains grou-
pements est condensée.

1.4 ) Formule topologique plane

En chimie organique, les liaisons C _ H et 1/ on représente les liaisons C_ C par des lignes
_
C C sont très fréquentes, et on allège encore brisées (en les doublant ou triplant en cas de
les représentations selon les conventions sui- liaison multiple) ;
vantes de la formule topologique plane : 2/ les atomes de carbone et d’hydrogène por-

tés par un atome de carbone ne sont plus ex- Exemple :

plicitement représentés ; seuls les hétéroatomes
(atomes différents de C ou H) et les atomes
d’hydrogène portés par un hétéroatome le sont.

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6 CHAPITRE 1. STÉRÉOCHIMIE DES MOLÉCULES ORGANIQUES

Remarques :
- On peut décider de représenter un atome de carbone spécifique ou bien un atome d’hy-
drogène sur lequel on veut insister.
Par exemple, un aldéhyde (le butanal ici) peut être représenté de l’une des ces quatre façons :

- Les atomes d’hydrogène doivent toujours être écrits lorsqu’ils sont lies un hétéroatome ou
bien à un atome de carbone que l’on a choisi d’indiquer :

- Les liaisons triples conduisant à une géométrie linéaire (type VSEPR AX2 ), on n’utilise
pas une ligne brisée dans ce cas mais on aligne les atomes :

Application :

2) Nomenclature

Voir Document 1.

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2. NOMENCLATURE 7

3) Représentation plane des structures spatiales

3.1 ) Représentation de Cram
Elle permet de représenter la géométrie des liaisons autour d’un atome dans l’espace, et
particulièrement autour des atomes adoptant un environnement tétraédrique.

Un trait plein représente une liaison entre deux atomes situés dans le plan de
la figure. Les angles entre les liaisons ainsi représentées doivent être respectés.

Un triangle allongé plein représente une liaison entre un atome situé dans le
plan de la figure (à la pointe du triangle) et un atome situé en avant de ce
plan (à la base du triangle), donc une liaison dirigée du plan de la figure vers
l’observateur.

un triangle allongé hachuré ou un trait discontinu représente une liaison entre

un atome dans le plan de la figure et un atome situé en arrière du plan de la
figure.

Exemple : Représentation de Cram de la molécule d’éthane

Application : Représenter en Cram les molécules suivantes : éthanol, prop-1-ène.

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8 CHAPITRE 1. STÉRÉOCHIMIE DES MOLÉCULES ORGANIQUES

3.2 ) Projection de Newman

Elle permet de visualiser l’environnement des deux atomes d’une liaison privilégiée (souvent
une liaison C − C) selon son axe.
1/ On regarde la molécule dans l’axe de cette liaison choisie ;
2/ L’atome de devant est représenté par un point, et celui de derrière, masqué par le premier,
par un cercle ;
3/ Les différentes liaisons autour des deux atomes sont projetées dans le plan perpendiculaire
à l’axe, et partent soit du point (atome de devant), soit du cercle (atome de derrière).
Exemple : Projection de Newman de la molécule d’éthane

Application 1 : Représenter les molécules suivantes suivant la liaison C1 − C2 :

Application 2 : Donner la représentation de Cram des molécules suivantes :

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4. ISOMÉRIE 9

3.3 ) Représentation en perspective cavalière

Cette représentation est essentiellement utilisée pour représenter les composées de type
cyclohexane, et plus généralement pour les cycles.

4) Isomérie

4.1 ) Définition
À une formule brute donnée peuvent correspondre plusieurs composés. On appelle isomères
des composés de même formule brute mais qui diffèrent par leur formule développée (isomères
de constitution) ou, s’ils ont même formule semi-développée, par leur structure spatiale (sté-
réoisomères).

4.2 ) Isomérie de constitution

Au sein des isoméries de constitution, on distingue trois types particuliers :

– Les isomères de fonction : ils diffèrent par la nature des fonctions chimiques présentes
dans la molécule. Cette isomérie de constitution est celle qui a le plus de répercutions sur les
propriétés physico-chimiques et la réactivité des molécules. Par exemple, pour C3 H6 O, le
Prop-2-én-1-ol: et le propanal sont deux isomères de fonction :

Prop-2-én-1-ol: propanal :

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10 CHAPITRE 1. STÉRÉOCHIMIE DES MOLÉCULES ORGANIQUES

– Les isomères de chaine : ils diffèrent par leur squelette carboné (l’enchainement des
atomes de carbone). Par exemple, pour C4 H10 , le butane et le 2-méthylpropane sont deux
isomères de chaine :

butane : 2-méthylpropane :

– Les isomères de position : ils diffèrent par la position des différentes fonctions chi-
miques sur la chaine carbonée. Par exemple, pour C5 H12 O, le pentan-1-ol et le pentan-2-ol sont
deux isomères de position :

pentan-1-ol : pentan-2-ol :

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