Location via proxy:   [ UP ]  
[Report a bug]   [Manage cookies]                

Presentasi PKL

Unduh sebagai pptx, pdf, atau txt
Unduh sebagai pptx, pdf, atau txt
Anda di halaman 1dari 19

PERBEDAAN KUALITAS DAN

KUANTITAS DNA DARAH SAPI YANG


DISIMPAN PADA WAKTU DAN SUHU
YANG BERVARIASI

PRAKTEK KERJA LAPANGAN


Salsabilla Audy
3425162851
Pembimbing I: Dr. Yulia Irnidayanti, M.Si
Pembimbing II: Saiful Anwar M.Si
PENDAHULUAN
LATAR BELAKANG

DNA Darah Waktu dan suhu Kualitas dan


penyimpanan Kuantitas DNA
sampel darah
RUMUSAN MASALAH

“Bagaimana perbedaan kualitas dan kuantitas


DNA darah sapi yang disimpan pada waktu dan
temperatur yang bervariasi?”
TUJUAN PENELITIAN
1. Menguji perbedaan kualitas DNA dengan teknik
elektroforesis berdasarkan waktu dan suhu penyimpanan
sampel darah.
2. Menguji perbedaan kuantitas DNA dengan teknik
nanophotometer berdasarkan waktu dan suhu
penyimpanan sampel darah.
MANFAAT PENELITIAN
1. Mendapatkan informasi tentang kualitas dan kuantitas
DNA berdasarkan waktu dan suhu penyimpanan yang
berbeda.
2. Melatih keterampilan di penelitian bidang bioteknologi
molekuler selama Praktek Kerja Lapangan.
TINJAUAN PUSTAKA

DARAH KUALITAS SAMPEL KUALITAS DAN


 Target pemeriksaan DARAH KUANTITAS DNA
umum untuk studi  Golden rule: sampel di  Kemurnian DNA
fisik dan studi ekstraksi langsung  Konsentrasi DNA
biomedis. setelah diperoleh.  Nanophotometer
(Huang, 2017)  PCR
 Kualitas sampel  Uji elektroforesis
rendah  hasil tidak
konsisten.
METODE PENELITIAN

• Tempat dan waktu penelitian


Waktu : Selasa, 27 Agustus 2019 – Rabu, 4
September 2019
Tempat: Laboratorium Reproduksi, Pemuliaan,
dan Kultur Sel Hewan LIPI

• Metode : Deskriptif
ALAT DAN BAHAN
• Tabung vaccutainer • Primer F & R • Elution Buffer
• Jarum flashback • Master mix • Vortex
• Waterbath
• Holder • DW • Microsentrifuge
• Alcohol swap
• Sampel yang telah diekstraksi • Tube 1,5 ml
• Ice box
• Gene Aid Kit
• Mesin PCR
• Ice gel • PCR tube
• Glove
• Disposable syringe • Alat nanofotometer
• Foam • Micropipet dan tips
• Alkohol 70%
• Mikropipet & Tips
• Micropipet dan tips
PROSEDUR PENELITIAN

PENGAMBILAN DARAH SAPI

EKSTRAKSI DNA

NANOPHOTOMETER

PCR

ELEKTROFORESIS
PROSEDUR PENELITIAN
PENGAMBILAN SAMPEL DARAH

Darah sapi simmental


diambil sebanyak ± 3 ml dari
vena jugularis dan vena
ekor.

Sampel darah disimpan di


tabung vaccutainer berisi
K3EDTA.
PROSEDUR PENELITIAN
DISTRIBUSI SAMPEL DARAH
Darah dikelompokkan sebagai berikut:
Suhu Penyimpanan Waktu Kode
Penyimpanan Sampel
Cold Temperature 1 hari 1 CT
(4°C) 3 hari 3 CT
6 hari 6 CT
Room Temperature 1 hari 1 RT
(±25°C) 3 hari 3 RT
6 hari 6 RT

CT = Cold Temperature
RT = Room Temperature

1 CT 1 RT 3 CT 3 RT 6 CT 6 RT
PROSEDUR PENELITIAN
EKSTRAKSI DNA
Ekstraksi DNA darah dilakukan
sesuai dengan protokol kit
GeneAid yang terdiri atas 4
tahap:
Cell lysis

DNA binding

DNA washing

DNA elution
PROSEDUR PENELITIAN
NANOPHOTOMETER

Dinyalakan alat
nanophotometer

Diatur nanophotometer
dengan lid faktor 10

Kuvet dielusi menggunakan


elution buffer

Dimasukkan sampel DNA


sebanyak 3 µl kedalam kuvet
PROSEDUR PENELITIAN
PCR (POLYMERASE CHAIN REACTION)
Gen: FASN ex 34
Kode Program: F34F
Master mix : 3,5
Primer F :1 Tahap Suhu Waktu Siklus
(C)
R :1 Pra 94 5’ 1x
DW : 2,5 Denaturasi
Denaturasi 94 25’’ 35 x
DNA :2 Annealing 58 25’’ 35 x
Total : 10 Ekstensi 72 25’’ 35 x
Awal
Ekstensi 72 5’
Akhir
Hold 20 ∞
PROSEDUR PENELITIAN
ELEKTROFORESIS

Dibuat gel Dimasukkan Elektroforesi Visualisasi


agarose 1% sampel DNA 3 s selama 27 dengan Gel
µl + loading menit ; 70 V Documentation
dye 1µl Box
HASIL DAN PEMBAHASAN
NANOPHOTOMETER
Sampel Konsentrasi A260/A280
(ng/𝝁𝒍)
1 CT 5,250 1,830
1 RT 5,550 1,870
3 CT 4,500 1,700
3 RT 4,500 1,655
6 CT < 4,500 Too low
6 RT < 4,500 Too low

Keterangan Indikator DNA murni


CT = Cold Temperature (4°C) A260/A280 = 1,8 – 2,0
RT = Room Temperature (25°C)0
HASIL DAN PEMBAHASAN
VISUALISASI DNA

M 1 CT 1 RT 3 CT 3 RT 6 CT 6 RT

5oo bp

Keterangan
M = Marker (DNA ladder 100 bp)
CT = Cold Temperature
RT = Room Temperature
KESIMPULAN

1. Tidak terdapat perbedaan nyata antara kualitas dan


kuantitas DNA pada sampel darah yang disimpan selama
6 hari pada variasi waktu dan suhu penyimpanan
berbeda.
2. Penyimpanan sampel darah selama 6 hari masih ideal
untuk analisis DNA di kedua suhu penyimpanan karena
mempunyai kualitas dan kuantitas yang baik.
3. Semakin lama waktu penyimpanan, konsentrasi DNA
menurun.
4. Waktu penyimpanan sampel darah tidak mempengaruhi
kualitas DNA.
SARAN

Ekstraksi sampel darah dilakukan dengan teknik manual


sehingga mendapatkan konsentrasi DNA yang jauh lebih
tinggi dibandingkan menggunakan kit.
TERIMAKASIH

Anda mungkin juga menyukai