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    Elia Ambrosio

    Recent molecular studies have identified substantial fungal diversity in indoor environments. Fungi and fungal particles have been linked to a range of potentially unwanted effects in the built environment, including asthma, decay of... more
    Recent molecular studies have identified substantial fungal diversity in indoor environments. Fungi and fungal particles have been linked to a range of potentially unwanted effects in the built environment, including asthma, decay of building materials, and food spoilage. The study of the built mycobiome is hampered by a number of constraints, one of which is the poor state of the metadata annotation of fungal DNA sequences from the built environment in public databases. In order to enable precise interrogation of such data – for example, “retrieve all fungal sequences recovered from bathrooms” – a workshop was organized at the University of Gothenburg (May 23-24, 2016) to annotate public fungal barcode (ITS) sequences according to the MIxS-Built Environment annotation standard (http://gensc.org/mixs/). The 36 participants assembled a total of 45,488 data points from the published literature, including the addition of 8,430 instances of countries of collection from a total of 83 countries, 5,801 instances of building types, and 3,876 instances of surface-air contaminants. The results were implemented in the UNITE database for molecular identification of fungi (http://unite.ut.ee) and were shared with other online resources. Data obtained from human/animal pathogenic fungi will furthermore be verified on culture based metadata for subsequent inclusion in the ISHAM-ITS database (http://its.mycologylab.org).
    Research Interests:
    Liguria (NW Italy) is a region characterised by a great richness in habitats, flora, and mycobiota. In the first half of last century, many areas of Liguria were frequently reforested with conifers, mainly pines. This type of habitat is... more
    Liguria (NW Italy) is a region characterised by a great richness in habitats, flora, and mycobiota. In the first half of last century, many areas of Liguria were frequently reforested with conifers, mainly pines. This type of habitat is still uninvestigated from a mycological perspective. As a consequence, our work aims at assessing mycodiversity under Pinus nigra Arnold plantations and at checking possible correlations between fungal diversity/abundance and ecological parameters. Eleven permanent plots were surveyed in two serpentine areas in Liguria (Northwestern Italy) through three years. Sporomata were collected and identified in all seasons of fungal growth. Shannon’s diversity index and Jaccard’s similarity index were calculated for each plot, and then the indices were correlated with the main ecological parameters. 94 macrofungal species were found. For each plot, Shannon’s index shows a low level of macrofungal diversity. Significant correlations exist between the mycodiver...
    La micologia forense sta riscuotendo negli ultimi tempi un crescente interesse e, sebbene sia considerata dai più una nuova branca nell’ambito delle discipline forensi, in realtà vanta solide radici storiche grazie al contributo di... more
    La micologia forense sta riscuotendo negli ultimi tempi un crescente interesse e, sebbene sia considerata dai più una nuova branca nell’ambito delle discipline forensi, in realtà vanta solide radici storiche grazie al contributo di valenti studiosi del passato, in particolar modo italiani. Basti pensare ai primi pionieristici e al contempo straordinari lavori di Giuseppe Bianchini del 1923, che collaborò a stretto contatto con Arturo Nannizzi, per poi arrivare al lavoro esemplare degli anni ‘40 di Raffaele Ciferri tra i padri della micologia medica italiana e non solo, che affrontò a sua volta anche queste tematiche. Gli aspetti che tali autori principalmente affrontarono riguardavano il ruolo dei funghi nei processi trasformativi post mortali. Diverse possono essere le applicazioni in campo forense della micologia, ma uno degli aspetti di maggior interesse riguarda l’utilizzo dei funghi come indicatori tanatocronologici. In ambito medico-legale la datazione dell’epoca della morte e...
    Research Interests:
    Corticioid fungi are essential organisms in forest ecosystems due to the key role played in the decomposition process of dead organic matter, nutrient cycle and soil formation. Despite their functional and ecological importance, this... more
    Corticioid fungi are essential organisms in forest ecosystems due to the key role played in the decomposition process of dead organic matter, nutrient cycle and soil formation. Despite their functional and ecological importance, this group of fungi is particularly overlooked in the Mediterranean area and information about species diversity and distribution are very fragmented. The present work constitutes the first study in Liguria (Northwestern Italy), unsurveyed region by "corticioids viewpoint". Surveys were performed in 40 plots located in two different broadleaf forests: 20 plots characterized by the presence of Fagus sylvatica, and 20 by Castanea sativa. A total of 25 and 17 taxa were respectively recorded in the studied sites. Among these, 21 species are new records in Liguria. It is worth noting the presence of the rare species Scotomyces subviolaceous that is included in the draft European red list. Statistical performed analyses show that both wood debris volume ...
    Le Corticiaceae s.l. (Aphyllophorales s.l., Basidiomycota) comprendono funghi tradizionalmente riuniti in un unico gruppo per la morfologia resupinata dei basidiomi: generalmente semplice, spianata e con margini lievemente revoluti.... more
    Le Corticiaceae s.l. (Aphyllophorales s.l., Basidiomycota) comprendono funghi tradizionalmente riuniti in un unico gruppo per la morfologia resupinata dei basidiomi: generalmente semplice, spianata e con margini lievemente revoluti. Questi funghi svolgono una funzione determinante in ambito forestale poiché degradando il legno partecipano attivamente alla produzione dell’humus, rendendo nuovamente disponibili alle piante gli elementi semplici (2). Numerosi studi realizzati nel nord Europa hanno, inoltre, dimostrato il ruolo delle Corticiaceae s.l. come bioindicatori (7), poichè sono risultati un valido strumento per la valutazione della qualità ambientale e della salute dell’ecosistema bosco. Dal punto di vista sistematico, sebbene studiati anche con metodi molecolari, la loro classificazione ha subito molteplici cambiamenti e le diverse specie sono state ripartite in numerosi ordini e famiglie, non ancora chiaramente delineate. Visto l’importante ruolo ecologico e il loro possibile...
    Recent molecular studies have identified substantial fungal diversity in indoor environments. Fungi and fungal particles have been linked to a range of potentially unwanted effects in the built environment, including asthma, decay of... more
    Recent molecular studies have identified substantial fungal diversity in indoor environments. Fungi and fungal particles have been linked to a range of potentially unwanted effects in the built environment, including asthma, decay of building materials, and food spoilage. The study of the built mycobiome is hampered by a number of constraints, one of which is the poor state of the metadata annotation of fungal DNA sequences from the built environment in public databases. In order to enable precise interrogation of such data – for example, “retrieve all fungal sequences recovered from bathrooms” – a workshop was organized at the University of Gothenburg (May 23-24, 2016) to annotate public fungal barcode (ITS) sequences according to the MIxS-Built Environment annotation standard (http://gensc.org/mixs/). The 36 participants assembled a total of 45,488 data points from the published literature, including the addition of 8,430 instances of countries of collection from a total of 83 countries, 5,801 instances of building types, and 3,876 instances of surface-air contaminants. The results were implemented in the UNITE database for molecular identification of fungi (http://unite.ut.ee) and were shared with other online resources. Data obtained from human/animal pathogenic fungi will furthermore be verified on culture based metadata for subsequent inclusion in the ISHAM-ITS database (http://its.mycologylab.org).
    ABSTRACT In order to fill the lack of knowledge on macrofungal component associated with Abies alba, this paper presents a study on the above-ground macrofungal communities of a planted Abies alba stand in North-west Sardinia (Italy). The... more
    ABSTRACT In order to fill the lack of knowledge on macrofungal component associated with Abies alba, this paper presents a study on the above-ground macrofungal communities of a planted Abies alba stand in North-west Sardinia (Italy). The knowledge on macrofungal diversity associated with this kind of habitat in Italy is very poor and fragmented since very few studies have been carried out. Field surveys performed in the Sardinian stand have revealed the presence of 119 species. Several species such as Amanita pseudoregalis, Cortinarius vernus, and Mycena algeriensis are very rare and uncommon and their peculiar morphological and ecological characters are discussed. The ectomycorrhizal fungi group was the richest both in number and in percentage of species recorded. The comparison of our results with those from other Italian natural and planted A. alba forests showed a similar species composition between natural and artificial stands.
    In order to fill the lack of knowledge on macrofungal component associated with Abies alba, this paper presents a study on the above-ground macrofungal communities of a planted Abies alba stand in North-west Sardinia (Italy). The... more
    In order to fill the lack of knowledge on macrofungal component associated with Abies alba, this paper presents a study on the above-ground macrofungal communities of a planted Abies alba stand in North-west Sardinia (Italy). The knowledge on macrofungal diversity associated with this kind of habitat in Italy is very poor and fragmented since very few studies have been carried out. Field surveys performed in the Sardinian stand have revealed the presence of 119 species. Several species such as Amanita pseudoregalis, Cortinarius vernus, and Mycena algeriensis are very rare and uncommon and their peculiar morphological and ecological characters are discussed. The ectomycorrhizal fungi group was the richest both in number and in percentage of species recorded. The comparison of our results with those from other Italian natural and planted A. alba forests showed a similar species composition between natural and artificial stands.
    The availability of real and potential distribution maps of edible fungi represents a powerful tool for an effective preservation of the areas where precious species grow or might grow. The thematic cartographies can also contribute to... more
    The availability of real and potential distribution maps of edible fungi represents a powerful tool for an effective preservation of the areas where precious species grow or might grow. The thematic cartographies can also contribute to develop useful management models and to identify unknown productive areas. During the last years, several thematic maps, referred to edible fungi, were compiled in Liguria. This coastal North-western Italian region, in spite of the little percentage of the Italian territory covered (2%), is characterized by a high presence and variety of forest types (e.g. beech, oak, chestnut, conifer, holm oak woods) and an high level of mycodiversity. The habitat richness affect also the mycobiota, which is represented by a high number and diversity of species. Among these, several precious edible species, such as Boletus edulis Bull., Hygrophorus marzuolus (Fr.) Bres., Tuber aestivum Vittad., T. magnatum Pico., T. melanosporum Vittad., T. brumale Vittad., were cho...
    Una delle attività svolte durante il primo workshop nazionale sulle ectomicorrize è stata quella di valutare la diversità macrofungina presente nell’area di studio prescelta: una riforestazione ad abete bianco nel Nord-Ovest della... more
    Una delle attività svolte durante il primo workshop nazionale sulle ectomicorrize è stata quella di valutare la diversità macrofungina presente nell’area di studio prescelta: una riforestazione ad abete bianco nel Nord-Ovest della Sardegna (Tempio Pausania, OT). Tale valutazione è stata eseguita mediante l’applicazione di un metodo di campionamento standardizzato. Questa metodologia, ampiamente utilizzata in Nord Europa, e già applicata anche in ambiente mediterraneo, precisamente in Liguria, consente di valutare la micodiversità dell’area di studio. In totale sono stati rilevati 52 taxa, con netta predominanza, per frequenza ed abbondanza, di specie ectomicorriziche. Amanita, Inocybe, Lactarius, Russula e Tricholoma, sono stati, infatti, i generi più numerosi. Significativa è stata anche la presenza di specie saprotrofe appartenenti al genere Mycena. I dati quantitativi (numero di sporomi per specie), sono stati utilizzati per calcolare un set d’indici di biodiversità e biomassa, t...
    ITA: La Liguria è ben nota per una grande varietà di prodotti agricoli e forestali (olio, fiori, produzioni orticole, funghi eduli epigei), ma non per la produzione di tartufi. Nonostante in molte valli dell'entroterra crescano tutte... more
    ITA: La Liguria è ben nota per una grande varietà di prodotti agricoli e forestali (olio, fiori, produzioni orticole, funghi eduli epigei), ma non per la produzione di tartufi. Nonostante in molte valli dell'entroterra crescano tutte e nove le specie ammesse alla vendita in Italia, la raccolta e soprattutto la coltivazione dei tartufi sono ancora risorse poco conosciute e di conseguenza non sfruttate. Vengono riportati i risultati relativi alle prime indagini inerenti la tartuficoltura ligure, finalizzate all'individuazione di impianti tartufigeni e alla stima della superficie attualmente dedicata a tale pratica. Le ricerche, svolte con la collaborazione dell'Associazione Tartufai e Tartuficoltori Liguri (A.T.T.L.), si riferiscono alla Val Bormida (SV), poiché è il territorio con tradizioni più antiche legate a questo prodotto. I risultati ottenuti riguardano il numero di piante ectomicorrizate acquistate, il numero di impianti messi a dimora e mostrano una situazione co...
    Nell’ambito dei prodotti non legnosi del bosco, i funghi eduli rappresentano una delle maggiori risorse, sia dal punto di vista ecologico, che economico. Negli ultimi decenni tuttavia, il progressivo abbandono delle aree montane e la... more
    Nell’ambito dei prodotti non legnosi del bosco, i funghi eduli rappresentano una delle maggiori risorse, sia dal punto di vista ecologico, che economico. Negli ultimi decenni tuttavia, il progressivo abbandono delle aree montane e la scarsa attenzione ad una corretta gestione forestale, hanno fortemente inciso sulla produttività dei boschi, determinando così la necessità di mettere a punto pratiche e trattamenti silvicolturali mirati all’incremento della produzione fungina, con particolare interesse alle specie eduli pregiate. In Italia, così come in molti altri paesi europei, scarsa è stata l’attenzione dedicata, fino ad oggi, allo studio delle dinamiche forestali e le interazioni con la produzione fungina, in particolare quella epigea. Uno degli scopi del progetto “Amycoforest” (ALCOTRA 2012-2013), che ha visto il coinvolgimento di enti pubblici e privati liguri, piemontesi e francesi, è stato quello di sviluppare e mettere in pratica trattamenti forestali mirati all’incremento de...
    This work was carried out in the frame of a Ministerial Study Project to monitoring the old growth forest of the National Park of Cilento and Vallo di Diano. The project involves different Italian Universities, in order to study and... more
    This work was carried out in the frame of a Ministerial Study Project to monitoring the old growth forest of the National Park of Cilento and Vallo di Diano. The project involves different Italian Universities, in order to study and maintain biodiversity and to lay the foundation for possible future bio-ecological reorganization of these areas. The mycocenological study was carried out in 2008, from spring to winter, in four selected areas characterized by Quercus ilex L. and Quercus cerris L. woods, respectively. Species are also analyzed by trophic point of view, based on the presence and abundance of mycorrhizal species, to analyze the quality of the selected ecosystems. Finally, the results obtained in evergreen and deciduous oak-woods were compared with data from other surveys carried out in different phytocoenosis in the same year and same Park, such as beech and chestnut forests, to observe the composition and distribution of epigeous macromycetes in various forest ecosystems...
    ABSTRACT Nel presente contributo sono riportati i risultati di uno studio sulla diversità della comunità fungina ectomicorrizica (ECM) presente in un impianto artificiale di conifere alloctone (Abies alba Mill., Pinus nigra Arnold e... more
    ABSTRACT Nel presente contributo sono riportati i risultati di uno studio sulla diversità della comunità fungina ectomicorrizica (ECM) presente in un impianto artificiale di conifere alloctone (Abies alba Mill., Pinus nigra Arnold e Cedrus atlantica (Endl.) Manetti ex Carrière), in cui è presente rinnovazione di A. alba e di Quercus ilex L., unica specie vegetale arborea autoctona presente nell’ambiente di studio. L’area d’indagine è localizzata a Tempio Pausania (Sardegna), sul monte Limbara in località Madonna della Neve (1262 s.l.m). Al suo interno sono stati individuati 5 plot omogenei, ed in ciascuno di essi sono stati prelevati frammenti radicali dalla base di esemplari adulti di A. alba, P. nigra e C. atlantica e da esemplari di 1-2 anni di Q. ilex e A. alba. In laboratorio le ectomicorrize di ciascun ospite sono state isolate e sottoposte ad analisi morfologiche e genetiche. In totale sono state osservate 54 unità tassonomiche operative, delle quali 41 attribuite a Basidiomycota, 5 ad Ascomycota e 8 non classificate. La famiglia più rappresentata è quella delle Thelephoraceae con 3 generi e 15 specie. Dal confronto tra le comunità ECM associate ai diversi ospiti quella osservata nelle piantine di leccio ha la maggiore ricchezza in specie e diversità. Più del 40% delle specie ECM osservate sull’abete bianco sono esclusive di questa specie. Le piantine di leccio e abete bianco hanno comunità ectomicorriziche abbastanza diverse, infatti, esse condividono solo 6 specie fungine ECM. Tuttavia, è interessante notare che 3 di queste specie sono presenti solo su esemplari di abete e leccio giovani e non su piante adulte, trattandosi, probabilmente, di specie che entrano in simbiosi solo con piante di giovane età. Il 65% delle specie trovate su conifere sono tipiche di questo tipo di ospiti vegetali. Tra queste sono presenti 4 delle specie che dominano la comunità ECM nel complesso. Infine il 65% delle specie osservate sul leccio sono presenti anche sulle conifere. Ciò evidenzia l’importante ruolo che queste specie forestali hanno nel favorire il processo di rinaturalizzazione del leccio all’interno del popolamento artificiale oggetto dell’indagine.
    This paper presents the results of the study on the mycoflora of a botanical garden located in Liguria (NW Italy). Mycological investigations were performed to list the presence of both epigeous and hypogeous macrofungal species in the... more
    This paper presents the results of the study on the mycoflora of a botanical garden located in Liguria (NW Italy). Mycological investigations were performed to list the presence of both epigeous and hypogeous macrofungal species in the historical Hanbury Botanical Gardens. The results show that several interesting and uncommon species, especially among hypogeous fungi, occur in the site. Ectomycorrhizal species and soil saprotrophs were more numerous than woody decaying and parasite fungi. This site, declared a Regional Protected Area and a Site of Community Importance for its high plant biodiversity, also constitutes an interesting area from a mycological perspective. Due to the importance of fungi in terrestrial ecosystems functioning and their potential interactions with plants, further studies should be planned in order to increase knowledge on the fungal components that can are present in botanical gardens.
    Research Interests: