一太郎7までは毎年のように拡張子が変わっていましたが、1997年発売の一太郎8で拡張子.jtd になってからは、ずっと同じファイル形式です。
「新バージョンの一太郎で作ったファイルを旧バージョンの一太郎で開いた」場合でも未対応の機能を使っていてもそれっぽく開けます。レイアウトが崩れるレベルの問題に出会ったことはほとんどないですね。
パソコンによって入ってるバージョンが違うような状況で一太郎を常用していますが、同じファイルを一太郎2015と2012と2011で編集、なんてことをしていても特に問題が起きたことはありません。

互換性情報 [justsystems.com]にも、昔のファイル形式に対しての注意はありますが、最近のバージョンアップでは特に情報が無い程度には、互換性は非常に重視してる感じ。