Liazy
Liazy (EC 4[1]) – klasa enzymów katalizujących rozrywanie wiązań C−C, C−O, C−N, C−S, C−X (X = halogen), P−O i innych w sposób inny niż hydroliza lub utlenianie[2]. Pękaniu wiązania towarzyszy powstanie nowego wiązania podwójnego lub pierścienia w rozszczepianej cząsteczce, np.[2][3]:
CH−C−OH ⇄ C=C + H 2O |
(dla przejrzystości pominięto podstawniki przy atomach węgla) |
W reakcjach w jednym kierunku ich substratem jest pojedyncza cząsteczka, a produktem dwie cząsteczki, podczas gdy w reakcji w kierunku odwrotnym substratem są dwie cząsteczki, a produktem jedna cząsteczka (enzymy, dla których ten drugi kierunek reakcji jest ważniejszy mogą być nazywane syntazami)[2]:
- A ⇄ B + C
Nazwy systematyczne liaz tworzy się wg schematu „grupa substratu-liaza”, natomiast nazwy zwyczajowe są typu „dekarboksylaza”, „aldolaza” lub „hydrolaza”[2].
Dzielą się na podklasy (wymienione są wszystkie podklasy EC poziomu 2 i 3)[1]:
- 4.1. Liazy węgiel–węgiel:
- 4.1.1. Karboksy-liazy (dekarboksylazy)
- Przykłady:
- 4.1.1.1. Karboksy-liaza 2-oksokwasów – dekarboksylaza pirogronianowa. Jest to białko zawierające pirofosforan tiaminy jako koenzym. Katalizuje reakcję: kwas pirogronowy = aldehyd octowy.
- 4.1.1.3. Karboksy-liaza szczawiooctanu – dekarboksylaza szczawiooctanowa, katalizująca przemianę szczawiooctanu do pirogronianu, z wydzieleniem dwutlenku węgla.
- 4.1.1.11. Karboksy-liaza L-asparaginianu – 1-dekarboksylaza asparaginianowa. Jest to białko zawierające w swym składzie fosforan pirydoksalu.
- 4.1.2. Aldehydo-liazy
- Przykład:
- 4.1.2.13. Aldolaza
- 4.1.3. Liazy ketokwasów
- Przykład:
- 4.1.3.6. Szczawiowooctano-liaza cytrynianu (acetylująca CoA) – katalizuje rozpad cytrynianu do octanu i szczawianu.
- 4.1.99. Inne liazy węgiel–węgiel
- 4.2. Liazy węgiel–tlen:
- 4.2.1. Hydro-liazy
- Przykłady:
- 4.2.1.2. Hydro-liaza L-jabłczanu – hydrataza fumarowa (fumaraza). Przekształca, odwracalnie jabłczan do fumaranu z wydzieleniem cząsteczki wody.
- 4.2.1.3. Hydro-liaza cytrynianu (izocytrynianu) – hydrataza akonitanowa (akonitaza). Jest również enzymem z cyklu Krebsa. Odłączając wodę od cytrynianu, przekształca go najpierw do cis-akonitanu, później dołączając kolejną cząsteczkę wody – do izocytrynianu.
- 4.2.2. Liazy węgiel–tlen działające na polisacharydach
- 4.2.3. Liazy węgiel–tlen działające na fosforanach
- 4.2.99. Inne liazy węgiel–tlen
- 4.3. Liazy węgiel–azot:
- 4.4. Liazy węgiel–siarka
- 4.4.1. Liazy węgiel–siarka
- 4.5. Liazy węgiel–halogen
- 4.5.1. Liazy węgiel–halogen
- 4.6. Liazy fosfor–tlen
- 4.6.1. Liazy fosfor–tlen
- 4.7. Liazy węgiel–fosfor
- 4.7.1. Liazy węgiel–fosfor
- 4.99. Inne liazy
- 4.99.1. Inne liazy
Przypisy
[edytuj | edytuj kod]- ↑ a b Enzyme entry: EC 4.-.-.-, [w:] Enzyme nomenclature database [online], SIB Swiss Institute of Bioinformatics (ang.).
- ↑ a b c d EC 4. Introduction, [w:] Recommendations of the Nomenclature Committee of the International Union of Biochemistry and Molecular Biology on the Nomenclature and Classification of Enzymes by the Reactions they Catalyse [online], School of Biological and Chemical Sciences, Queen Mary University of London [zarchiwizowane z adresu 2012-07-16] (ang.).
- ↑ Edward Bańkowski, Biochemia. Podręcznik dla studentów uczelni medycznych, Wrocław: Urban & Partner, 2004, s. 62–63, ISBN 83-89581-10-8, OCLC 749167067 .