MBD3

Материал из Википедии — свободной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
Белок метил-CpG связывающего домена 3
Доступные структуры
PDB Поиск ортологов: PDBe, RCSB
Идентификаторы
Символ MBD3
Внешние ID OMIM: 603573 MGI1333812 HomoloGene2917 GeneCards: Ген MBD3
Профиль экспрессии РНК
Больше информации
Ортологи
Вид Человек Мышь
Entrez 53615 17192
Ensembl ENSG00000071655 ENSMUSG00000035478
UniProt O95983 Q9Z2D8
RefSeq (мРНК) NM_001281453 NM_013595
RefSeq (белок) NP_001268382 NP_038623
Локус (UCSC) Chr 19:
1.58 – 1.59 Mb
Chr 10:
80.39 – 80.4 Mb
Поиск в PubMed Искать Искать

Белок метил-CpG-связывающего домена 3 белок, кодируемый у человека геном MBD3[1][2][3].

Метилирование ДНК является основной модификацией генома эукариот и играет важную роль в развитии млекопитающих. Белки человека MECP2, MBD1, MBD2, MBD3 и MBD4 относятся к семейству ядерных белков, объединённых по признаку наличия метил-CpG связывающего домена[англ.]. Однако, в отличие от других членов семейства, MBD3 не способен связываться с метилированной ДНК, но вместо этого связывается с гидроксиметилированной ДНК [1]. Первичная структура MBD3 на 71 % и 94 % идентична структуре MBD2 (изоформа1) и мышиному Mbd3. MBD3 является субъединицей мультисубъединичного комплекса NuRD, способный модифицировать нуклеосомы и обладающего гистондеацетилазной активностью. MBD3 опосредует связывания метастаз-ассоциироованного белка 2 (MTA2) с ядром гистондеацетилазного комплекса[3].

MBD3 также содержит домен спиральной катушки (coiled-coil), общий для всех трех известных изоформ MBD3. Именно домен спиральной катушки, а не MBD домен, помогает поддерживать плюрипотентность эмбриональных стволовых клеток, направляя поликомб репрессорный комплекс 2 (PRC2) на подмножества генов, связанных с развитием и органогенезом, тем самым поддерживая их стабильную репрессию[4].

Взаимодействия

[править | править код]

MBD3,как было выявлено, взаимодействует с:

Примечания

[править | править код]
  1. Hendrich B., Bird A. Identification and characterization of a family of mammalian methyl-CpG binding proteins (англ.) // Mol Cell Biol : journal. — 1998. — November (vol. 18, no. 11). — P. 6538—6547. — PMID 9774669. — PMC 109239.
  2. Hendrich B., Abbott C., McQueen H., Chambers D., Cross S., Bird A. Genomic structure and chromosomal mapping of the murine and human Mbd1, Mbd2, Mbd3, and Mbd4 genes (англ.) // Mamm Genome[англ.] : journal. — 1999. — September (vol. 10, no. 9). — P. 906—912. — doi:10.1007/s003359901112. — PMID 10441743.
  3. 1 2 Entrez Gene: MBD3 methyl-CpG binding domain protein 3.
  4. Hirasaki, M., Ueda, A., Asaka, M. N., Uranishi, K., Suzuki, A., Kohda, M., ... & Koseki, H. (2018). Identification of the Coiled‐Coil Domain as an Essential Mbd3 Element for Preserving Lineage Commitment Potential of Embryonic Stem Cells. STEM CELLS. doi:10.1002/stem.2849
  5. 1 2 3 Sakai H., Urano T., Ookata K., Kim M.H., Hirai Y., Saito M., Nojima Y., Ishikawa F. MBD3 and HDAC1, two components of the NuRD complex, are localized at Aurora-A-positive centrosomes in M phase (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2002. — Vol. 277, no. 50. — P. 48714—48723. — doi:10.1074/jbc.M208461200. — PMID 12354758.
  6. Brackertz M., Boeke J., Zhang R., Renkawitz R. Two highly related p66 proteins comprise a new family of potent transcriptional repressors interacting with MBD2 and MBD3 (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2002. — Vol. 277, no. 43. — P. 40958—40966. — doi:10.1074/jbc.M207467200. — PMID 12183469.
  7. Feng Q., Cao R., Xia L., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Zhang Y. Identification and functional characterization of the p66/p68 components of the MeCP1 complex (англ.) // Mol. Cell. Biol. : journal. — 2002. — Vol. 22, no. 2. — P. 536—546. — doi:10.1128/MCB.22.2.536-546.2002. — PMID 11756549. — PMC 139742.
  8. 1 2 3 Zhang Y., Ng H.H., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Bird A., Reinberg D. Analysis of the NuRD subunits reveals a histone deacetylase core complex and a connection with DNA methylation (англ.) // Genes Dev. : journal. — 1999. — Vol. 13, no. 15. — P. 1924—1935. — doi:10.1101/gad.13.15.1924. — PMID 10444591. — PMC 316920.
  9. 1 2 Saito M., Ishikawa F. The mCpG-binding domain of human MBD3 does not bind to mCpG but interacts with NuRD/Mi2 components HDAC1 and MTA2 (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2002. — Vol. 277, no. 38. — P. 35434—35439. — doi:10.1074/jbc.M203455200. — PMID 12124384.
  10. Jiang C.L., Jin S.G., Pfeifer G.P. MBD3L1 is a transcriptional repressor that interacts with methyl-CpG-binding protein 2 (MBD2) and components of the NuRD complex (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2004. — Vol. 279, no. 50. — P. 52456—52464. — doi:10.1074/jbc.M409149200. — PMID 15456747.

Литература

[править | править код]
  • Shen L., Zhang Y. 5-Hydroxymethylcytosine: generation, fate, and genomic distribution (англ.) // Current Opinion in Cell Biology[англ.] : journal. — Elsevier, 2013. — Vol. 25, no. 3. — P. 289—296. — doi:10.1016/j.ceb.2013.02.017. — PMID 23498661.
  • Abbott W.M., Mellor A., Edwards Y., Feizi T. Soluble bovine galactose-binding lectin. cDNA cloning reveals the complete amino acid sequence and an antigenic relationship with the major encephalitogenic domain of myelin basic protein. (англ.) // Biochem. J.[англ.] : journal. — 1989. — Vol. 259, no. 1. — P. 283—290. — PMID 2470348. — PMC 1138502.
  • Zhang Y., LeRoy G., Seelig H.P., Lane W.S., Reinberg D. The dermatomyositis-specific autoantigen Mi2 is a component of a complex containing histone deacetylase and nucleosome remodeling activities. (англ.) // Cell : journal. — Cell Press, 1998. — Vol. 95, no. 2. — P. 279—289. — doi:10.1016/S0092-8674(00)81758-4. — PMID 9790534.
  • Tong J.K., Hassig C.A., Schnitzler G.R., Kingston R.E., Schreiber S.L. Chromatin deacetylation by an ATP-dependent nucleosome remodelling complex. (англ.) // Nature : journal. — 1998. — Vol. 395, no. 6705. — P. 917—921. — doi:10.1038/27699. — PMID 9804427.
  • Zhang Y., Ng H.H., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Bird A., Reinberg D. Analysis of the NuRD subunits reveals a histone deacetylase core complex and a connection with DNA methylation. (англ.) // Genes Dev. : journal. — 1999. — Vol. 13, no. 15. — P. 1924—1935. — doi:10.1101/gad.13.15.1924. — PMID 10444591. — PMC 316920.
  • Wade P.A., Gegonne A., Jones P.L., Ballestar E., Aubry F., Wolffe A.P. Mi-2 complex couples DNA methylation to chromatin remodelling and histone deacetylation. (англ.) // Nat. Genet. : journal. — 1999. — Vol. 23, no. 1. — P. 62—6. — doi:10.1038/12664. — PMID 10471500.
  • Tatematsu K.I., Yamazaki T., Ishikawa F. MBD2-MBD3 complex binds to hemi-methylated DNA and forms a complex containing DNMT1 at the replication foci in late S phase. (англ.) // Genes Cells[англ.] : journal. — 2000. — Vol. 5, no. 8. — P. 677—688. — doi:10.1046/j.1365-2443.2000.00359.x. — PMID 10947852.
  • Humphrey G.W., Wang Y., Russanova V.R., Hirai T., Qin J., Nakatani Y., Howard B.H. Stable histone deacetylase complexes distinguished by the presence of SANT domain proteins CoREST/kiaa0071 and Mta-L1. (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2001. — Vol. 276, no. 9. — P. 6817—6824. — doi:10.1074/jbc.M007372200. — PMID 11102443.
  • Shi Y., Downes M., Xie W., Kao H.Y., Ordentlich P., Tsai C.C., Hon M., Evans R.M. Sharp, an inducible cofactor that integrates nuclear receptor repression and activation. (англ.) // Genes Dev. : journal. — 2001. — Vol. 15, no. 9. — P. 1140—1151. — doi:10.1101/gad.871201. — PMID 11331609. — PMC 312688.
  • Feng Q., Cao R., Xia L., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Zhang Y. Identification and functional characterization of the p66/p68 components of the MeCP1 complex. (англ.) // Mol. Cell. Biol. : journal. — 2002. — Vol. 22, no. 2. — P. 536—546. — doi:10.1128/MCB.22.2.536-546.2002. — PMID 11756549. — PMC 139742.
  • Schlegel J., Güneysu S., Mennel H.D. Expression of the genes of methyl-binding domain proteins in human gliomas. (англ.) // Oncol. Rep.[англ.] : journal. — 2002. — Vol. 9, no. 2. — P. 393—395. — doi:10.3892/or.9.2.393. — PMID 11836615.
  • Saito M., Ishikawa F. The mCpG-binding domain of human MBD3 does not bind to mCpG but interacts with NuRD/Mi2 components HDAC1 and MTA2. (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2002. — Vol. 277, no. 38. — P. 35434—35439. — doi:10.1074/jbc.M203455200. — PMID 12124384.
  • Brackertz M., Boeke J., Zhang R., Renkawitz R. Two highly related p66 proteins comprise a new family of potent transcriptional repressors interacting with MBD2 and MBD3. (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2002. — Vol. 277, no. 43. — P. 40958—40966. — doi:10.1074/jbc.M207467200. — PMID 12183469.
  • Sakai H., Urano T., Ookata K., Kim M.H., Hirai Y., Saito M., Nojima Y., Ishikawa F. MBD3 and HDAC1, two components of the NuRD complex, are localized at Aurora-A-positive centrosomes in M phase. (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2003. — Vol. 277, no. 50. — P. 48714—48723. — doi:10.1074/jbc.M208461200. — PMID 12354758.
  • Fujita N., Jaye D.L., Kajita M., Geigerman C., Moreno C.S., Wade P.A. MTA3, a Mi-2/NuRD complex subunit, regulates an invasive growth pathway in breast cancer. (англ.) // Cell : journal. — Cell Press, 2003. — Vol. 113, no. 2. — P. 207—219. — doi:10.1016/S0092-8674(03)00234-4. — PMID 12705869.
  • Fujita N., Jaye D.L., Geigerman C., Akyildiz A., Mooney M.R., Boss J.M., Wade P.A. MTA3 and the Mi-2/NuRD complex regulate cell fate during B lymphocyte differentiation. (англ.) // Cell : journal. — Cell Press, 2004. — Vol. 119, no. 1. — P. 75—86. — doi:10.1016/j.cell.2004.09.014. — PMID 15454082.