SF3B4

SF3B4
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1X5T, 1X5U
Ідентифікатори
Символи	SF3B4, AFD1, Hsh49, SAP49, SF3b49, splicing factor 3b subunit 4
Зовнішні ІД	OMIM: 605593 MGI: 109580 HomoloGene: 134086 GeneCards: SF3B4
Пов'язані генетичні захворювання
Nager acrofacial dysostosis
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • RNA binding Клітинна компонента • U12-type spliceosomal complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • spliceosomal complex • ядерце • U2-type precatalytic spliceosome • Рибонуклеопротеїни Біологічний процес • RNA splicing, via transesterification reactions • mRNA splicing, via spliceosome • positive regulation of mRNA splicing, via spliceosome • mRNA processing • Сплайсинг РНК Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10262	107701
Ensembl	ENSG00000143368	ENSMUSG00000068856
UniProt	Q15427 Q5SZ64	Q8QZY9
RefSeq (мРНК)	NM_005850	NM_153053
RefSeq (білок)	NP_005841	NP_694693
Локус (UCSC)	Хр. 1: 149.92 – 149.93 Mb	Хр. 3: 96.08 – 96.08 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SF3B4 (англ. Splicing factor 3b subunit 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 424 амінокислот, а молекулярна маса — 44 386.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAAGPISERN		QDATVYVGGL		DEKVSEPLLW		ELFLQAGPVV		NTHMPKDRVT
GQHQGYGFVE		FLSEEDADYA		IKIMNMIKLY		GKPIRVNKAS		AHNKNLDVGA
NIFIGNLDPE		IDEKLLYDTF		SAFGVILQTP		KIMRDPDTGN		SKGYAFINFA
SFDASDAAIE		AMNGQYLCNR		PITVSYAFKK		DSKGERHGSA		AERLLAAQNP
LSQADRPHQL		FADAPPPPSA		PNPVVSSLGS		GLPPPGMPPP		GSFPPPVPPP
GALPPGIPPA		MPPPPMPPGA		AGHGPPSAGT		PGAGHPGHGH		SHPHPFPPGG
MPHPGMSQMQ		LAHHGPHGLG		HPHAGPPGSG		GQPPPRPPPG		MPHPGPPPMG
MPPRGPPFGS		PMGHPGPMPP		HGMRGPPPLM		PPHGYTGPPR		PPPYGYQRGP
LPPPRPTPRP		PVPPRGPLRG		PLPQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, сплайсінг мРНК, ацетиляція. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Champion-Arnaud P., Reed R. (1994). The prespliceosome components SAP 49 and SAP 145 interact in a complex implicated in tethering U2 snRNP to the branch site. Genes Dev. 8: 1974—1983. PMID 7958871 DOI:10.1101/gad.8.16.1974
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Das R., Zhou Z., Reed R. (2000). Functional association of U2 snRNP with the ATP-independent spliceosomal complex E. Mol. Cell. 5: 779—787. PMID 10882114 DOI:10.1016/S1097-2765(00)80318-4
• Golas M.M., Sander B., Will C.L., Luhrmann R., Stark H. (2003). Molecular architecture of the multiprotein splicing factor SF3b. Science. 300: 980—984. PMID 12738865 DOI:10.1126/science.1084155

Див. також

• Хромосома 1