Location via proxy:   [ UP ]  
[Report a bug]   [Manage cookies]                
NCBI Logo
GEO Logo
   NCBI > GEO > Accession DisplayHelp Not logged in | LoginHelp
GEO help: Mouse over screen elements for information.
          Go
Platform GPL11533 Query DataSets for GPL11533
Status Public on Jan 18, 2011
Title [MoGene-1_1-st] Affymetrix Mouse Gene 1.1 ST Array [transcript (gene) version]
Technology type in situ oligonucleotide
Distribution commercial
Organism Mus musculus
Manufacturer Affymetrix
Manufacture protocol see manufacturer's web site
 
Description Affymetrix submissions are typically submitted to GEO using the GEOarchive method described at http://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/geo/info/geo_affy.html

MoGene-1_1-st-v1.na31.mm9.transcript.csv
#%create_date=Fri Aug 27 17:50:02 2010 PDT
#%chip_type=MoGene-1_1-st-v1
#%lib_set_name=MoGene-1_1-st
#%lib_set_version=v1
#%genome-species=Mus musculus
#%genome-version=mm9
#%genome-version-ucsc=mm9
#%genome-version-ncbi=37
#%genome-version-create_date=2007-07-00
#%genome-lifted-method=liftOver
#%genome-lifted_from-species=Mus musculus
#%genome-lifted_from-version-ucsc=mm8
#%genome-lifted_from-version-ncbi=36
#%netaffx-annotation-date=2010-07-15
#%netaffx-annotation-netaffx-build=31
 
Web link http://www.affymetrix.com/browse/products.jsp?navMode=34000&productId=131555&navAction=jump&aId=productsNav#1_1
http://www.affymetrix.com/analysis/index.affx
Submission date Jan 18, 2011
Last update date Apr 18, 2017
Organization Affymetrix, Inc.
E-mail(s) geo@ncbi.nlm.nih.gov, support@affymetrix.com
Phone 888-362-2447
URL http://www.affymetrix.com/index.affx
Street address
City Santa Clara
State/province CA
ZIP/Postal code 95051
Country USA
 
Samples (4230) GSM691419, GSM691420, GSM691421, GSM691422, GSM691423, GSM691424 
Series (174)
GSE27960 Sensing prokaryotic mRNA signifies microbial viability and promotes immunity
GSE32513 Identification of the core gene-regulatory network that governs the dynamic adaptation of intestinal homeostasis during conventionalization in mice
GSE32515 Caspase-1 deficiency reduces intestinal and hepatic triglyceride-rich lipoprotein secretion
Relations
Alternative to GPL16695
Alternative to GPL17153 (Alternative CDF [MoGene11stv1_Mm_ENTREZG_15.1.0])
Alternative to GPL17997 (alternative)
Alternative to GPL19138 (Alternative CDF [MoGene11stv1_Mm_ENTREZG_14.1.0])
Alternative to GPL19143 (Alternative CDF [MoGene11stv1_Mm_ENTREZG_17.0.0])
Alternative to GPL20837 (Alternative CDF [MoGene11stv1_Mm_ENTREZG_19.0.0])
Alternative to GPL23319 (transcript-level na35ens81)

Data table header descriptions
ID transcript_cluster_id
GB_LIST GenBank and RefSeq Accessions from mrna_assignment column
SPOT_ID genomic location of the transcript cluster in the version of the genome assembly used at annotation time. Coordinates are standard 1-based (length=stop-start+1).
seqname chromosome number
RANGE_GB NCBI RefSeq for chromosome of current build
RANGE_STRAND strand (+|-)
RANGE_START start (integer). Coordinates are standard 1-based (length=stop-start+1).
RANGE_STOP stop (integer). Coordinates are standard 1-based (length=stop-start+1).
total_probes Total number of probes contained by this transcript cluster.
gene_assignment Gene information for each assigned mRNA for mRNAs that corresponds to known genes (multipart).
mrna_assignment Description of the public mRNAs that should be detected by the sets within this transcript cluster based on sequence alignment (multipart).
category Array design category of the transcript cluster

Data table
ID GB_LIST SPOT_ID seqname RANGE_GB RANGE_STRAND RANGE_START RANGE_STOP total_probes gene_assignment mrna_assignment category
10344614 XR_030628 chr1:3044314-3044814 chr1 NC_000067.5 + 3044314 3044814 33 --- GENSCAN00000037374 // ENSEMBL // cdna:Genscan chromosome:NCBIM37:1:3018707:3044814:1 // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XR_030628 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus hypothetical protein LOC100044384 (LOC100044384), misc RNA. // chr1 // 21 // 100 // 7 // 33 // 1 /// GENSCAN00000005494 // ENSEMBL // cdna:Genscan chromosome:NCBIM37:3:4161125:4188920:-1 // chr1 // 12 // 100 // 4 // 33 // 1 main
10344616 chr1:3092097-3092206 chr1 NC_000067.5 + 3092097 3092206 25 --- ENSMUST00000082908 // ENSEMBL // ncrna:snRNA chromosome:NCBIM37:1:3092097:3092206:1 gene:ENSMUSG00000064842 // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 main
10344620 chr1:3670652-3670993 chr1 NC_000067.5 + 3670652 3670993 25 ENSMUST00000097833 // Gm10568 // predicted gene 10568 // --- // 100038431 ENSMUST00000097833 // ENSEMBL // Putative uncharacterized protein gene:ENSMUSG00000073742 // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 main
10344622 XR_030609, NM_024221, BC094468 chr1:4761212-4762280 chr1 NC_000067.5 + 4761212 4762280 8 ENSMUST00000097833 // Gm10568 // predicted gene 10568 // --- // 100038431 /// ENSMUST00000097833 // Gm10568 // predicted gene 10568 // --- // 100038431 /// ENSMUST00000097833 // Gm10568 // predicted gene 10568 // --- // 100038431 /// XR_030609 // Gm6123 // predicted gene 6123 // 1 A1 // 620009 XR_030609 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus similar to pyruvate dehydrogenase (lipoamide) beta (LOC620009), misc RNA. // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000047522 // ENSEMBL // cdna:Genscan chromosome:NCBIM37:1:4761212:4762280:1 // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NM_024221 // RefSeq // Mus musculus pyruvate dehydrogenase (lipoamide) beta (Pdhb), nuclear gene encoding mitochondrial protein, mRNA. // chr1 // 33 // 75 // 2 // 6 // 1 /// ENSMUST00000022268 // ENSEMBL // Pyruvate dehydrogenase E1 component subunit beta, mitochondrial gene:ENSMUSG00000021748 // chr1 // 33 // 75 // 2 // 6 // 1 /// BC094468 // GenBank // Mus musculus pyruvate dehydrogenase (lipoamide) beta, mRNA (cDNA clone MGC:102377 IMAGE:5011266), complete cds. // chr1 // 33 // 75 // 2 // 6 // 1 main
10344624 NM_008866, BC013536 chr1:4797943-4836817 chr1 NC_000067.5 + 4797943 4836817 23 NM_008866 // Lypla1 // lysophospholipase 1 // 1 A1 // 18777 /// ENSMUST00000027036 // Lypla1 // lysophospholipase 1 // 1 A1 // 18777 /// BC013536 // Lypla1 // lysophospholipase 1 // 1 A1 // 18777 /// ENSMUST00000115529 // Lypla1 // lysophospholipase 1 // 1 A1 // 18777 NM_008866 // RefSeq // Mus musculus lysophospholipase 1 (Lypla1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000027036 // ENSEMBL // Isoform 1 of Acyl-protein thioesterase 1 gene:ENSMUSG00000025903 // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC013536 // GenBank // Mus musculus lysophospholipase 1, mRNA (cDNA clone MGC:19218 IMAGE:4240573), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000115529 // ENSEMBL // 21 kDa protein gene:ENSMUSG00000025903 // chr1 // 100 // 74 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000137887 // ENSEMBL // cdna:known chromosome:NCBIM37:1:4797979:4831050:1 gene:ENSMUSG00000025903 // chr1 // 100 // 78 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000131119 // ENSEMBL // cdna:known chromosome:NCBIM37:1:4798318:4831174:1 gene:ENSMUSG00000025903 // chr1 // 100 // 74 // 17 // 17 // 0 main
10344633 NM_011541, NM_001159750, NM_001159751, BC083127 chr1:4847895-4887990 chr1 NC_000067.5 + 4847895 4887990 8 NM_011541 // Tcea1 // transcription elongation factor A (SII) 1 // 1 A1 // 21399 /// NM_001159750 // Tcea1 // transcription elongation factor A (SII) 1 // 1 A1 // 21399 /// NM_001159751 // Tcea1 // transcription elongation factor A (SII) 1 // 1 A1 // 21399 /// ENSMUST00000081551 // Tcea1 // transcription elongation factor A (SII) 1 // 1 A1 // 21399 /// BC083127 // Tcea1 // transcription elongation factor A (SII) 1 // 1 A1 // 21399 NM_011541 // RefSeq // Mus musculus transcription elongation factor A (SII) 1 (Tcea1), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NM_001159750 // RefSeq // Mus musculus transcription elongation factor A (SII) 1 (Tcea1), transcript variant 3, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NM_001159751 // RefSeq // Mus musculus transcription elongation factor A (SII) 1 (Tcea1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 63 // 5 // 5 // 0 /// ENSMUST00000081551 // ENSEMBL // Isoform 2 of Transcription elongation factor A protein 1 gene:ENSMUSG00000033813 // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// BC083127 // GenBank // Mus musculus transcription elongation factor A (SII) 1, mRNA (cDNA clone MGC:103154 IMAGE:6390364), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 main
10344637 NM_133826, BC009154 chr1:5073253-5152630 chr1 NC_000067.5 + 5073253 5152630 30 NM_133826 // Atp6v1h // ATPase, H+ transporting, lysosomal V1 subunit H // 1 A1 // 108664 /// ENSMUST00000044369 // Atp6v1h // ATPase, H+ transporting, lysosomal V1 subunit H // 1 A1 // 108664 /// BC009154 // Atp6v1h // ATPase, H+ transporting, lysosomal V1 subunit H // 1 A1 // 108664 NM_133826 // RefSeq // Mus musculus ATPase, H+ transporting, lysosomal V1 subunit H (Atp6v1h), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000044369 // ENSEMBL // V-type proton ATPase subunit H gene:ENSMUSG00000033793 // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC009154 // GenBank // Mus musculus ATPase, H+ transporting, lysosomal V1 subunit H, mRNA (cDNA clone MGC:11985 IMAGE:3601621), complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 main
10344653 NM_011011, L11065 chr1:5578574-5592947 chr1 NC_000067.5 + 5578574 5592947 25 NM_011011 // Oprk1 // opioid receptor, kappa 1 // 1 A2-A3|1 5.5 cM // 18387 /// ENSMUST00000027038 // Oprk1 // opioid receptor, kappa 1 // 1 A2-A3|1 5.5 cM // 18387 /// L11065 // Oprk1 // opioid receptor, kappa 1 // 1 A2-A3|1 5.5 cM // 18387 NM_011011 // RefSeq // Mus musculus opioid receptor, kappa 1 (Oprk1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000027038 // ENSEMBL // Kappa-type opioid receptor gene:ENSMUSG00000025905 // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// L11065 // GenBank // Mouse kappa opioid receptor mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 main
10344658 NM_009826, AB070619 chr1:6204743-6265656 chr1 NC_000067.5 + 6204743 6265656 29 NM_009826 // Rb1cc1 // RB1-inducible coiled-coil 1 // 1 A2 // 12421 /// ENSMUST00000027040 // Rb1cc1 // RB1-inducible coiled-coil 1 // 1 A2 // 12421 /// AB070619 // Rb1cc1 // RB1-inducible coiled-coil 1 // 1 A2 // 12421 NM_009826 // RefSeq // Mus musculus RB1-inducible coiled-coil 1 (Rb1cc1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000027040 // ENSEMBL // RB1-inducible coiled-coil protein 1 gene:ENSMUSG00000025907 // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AB070619 // GenBank // Mus musculus Rb1cc1 mRNA for transcription factor, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 main
10344674 AK087278, XM_975315 chr1:6349422-6381175 chr1 NC_000067.5 + 6349422 6381175 25 AK087278 // Fam150a // family with sequence similarity 150, member A // 1 A1 // 620393 /// XM_975315 // Fam150a // family with sequence similarity 150, member A // 1 A1 // 620393 AK087278 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E030041H06 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr1 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000133144 // ENSEMBL // ncrna:lincRNA chromosome:NCBIM37:1:6349537:6384812:1 gene:ENSMUSG00000087247 // chr1 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// XM_975315 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene, EG620393 (EG620393), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000003147 // ENSEMBL // cdna:Genscan chromosome:NCBIM37:1:6204213:6362066:1 // chr1 // 100 // 24 // 6 // 6 // 0 main
10344679 NM_173868, BC118528 chr1:6720132-6851021 chr1 NC_000067.5 + 6720132 6851021 25 NM_173868 // St18 // suppression of tumorigenicity 18 // 1 A1 // 240690 /// ENSMUST00000043578 // St18 // suppression of tumorigenicity 18 // 1 A1 // 240690 /// BC118528 // St18 // suppression of tumorigenicity 18 // 1 A1 // 240690 NM_173868 // RefSeq // Mus musculus suppression of tumorigenicity 18 (St18), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000043578 // ENSEMBL // Suppression of tumorigenicity 18 protein gene:ENSMUSG00000033740 // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC118528 // GenBank // Mus musculus suppression of tumorigenicity 18, mRNA (cDNA clone MGC:144173 IMAGE:40098452), complete cds. // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000140079 // ENSEMBL // cdna:known chromosome:NCBIM37:1:6477312:6851015:1 gene:ENSMUSG00000033740 // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000150761 // ENSEMBL // cdna:known chromosome:NCBIM37:1:6720182:6849551:1 gene:ENSMUSG00000033740 // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000131494 // ENSEMBL // cdna:known chromosome:NCBIM37:1:6477412:6851021:1 gene:ENSMUSG00000033740 // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000151281 // ENSEMBL // cdna:known chromosome:NCBIM37:1:6720183:6848894:1 gene:ENSMUSG00000033740 // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000131467 // ENSEMBL // cdna:known chromosome:NCBIM37:1:6720151:6785631:1 gene:ENSMUSG00000033740 // chr1 // 100 // 24 // 6 // 6 // 0 /// ENSMUST00000139838 // ENSEMBL // cdna:known chromosome:NCBIM37:1:6724951:6792769:1 gene:ENSMUSG00000033740 // chr1 // 100 // 20 // 5 // 5 // 0 /// ENSMUST00000155921 // ENSEMBL // cdna:known chromosome:NCBIM37:1:6720257:6792529:1 gene:ENSMUSG00000033740 // chr1 // 100 // 16 // 4 // 4 // 0 main
10344707 NM_183028, BC110360 chr1:7079231-7163709 chr1 NC_000067.5 + 7079231 7163709 17 NM_183028 // Pcmtd1 // protein-L-isoaspartate (D-aspartate) O-methyltransferase domain containing 1 // 1 A1 // 319263 /// ENSMUST00000061280 // Pcmtd1 // protein-L-isoaspartate (D-aspartate) O-methyltransferase domain containing 1 // 1 A1 // 319263 /// BC110360 // Pcmtd1 // protein-L-isoaspartate (D-aspartate) O-methyltransferase domain containing 1 // 1 A1 // 319263 NM_183028 // RefSeq // Mus musculus protein-L-isoaspartate (D-aspartate) O-methyltransferase domain containing 1 (Pcmtd1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000061280 // ENSEMBL // Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1 gene:ENSMUSG00000051285 // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// BC110360 // GenBank // Mus musculus protein-L-isoaspartate (D-aspartate) O-methyltransferase domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:117877 IMAGE:5326388), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 main
10344713 NM_016661, L32836 chr1:7167820-7169118 chr1 NC_000067.5 + 7167820 7169118 32 NM_016661 // Ahcy // S-adenosylhomocysteine hydrolase // 2 H1|2 89.0 cM // 269378 /// ENSMUST00000054607 // Ahcy // S-adenosylhomocysteine hydrolase // 2 H1|2 89.0 cM // 269378 /// L32836 // Ahcy // S-adenosylhomocysteine hydrolase // 2 H1|2 89.0 cM // 269378 /// ENSMUST00000029124 // Ahcy // S-adenosylhomocysteine hydrolase // 2 H1|2 89.0 cM // 269378 NM_016661 // RefSeq // Mus musculus S-adenosylhomocysteine hydrolase (Ahcy), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000054607 // ENSEMBL // Adenosylhomocysteinase gene:ENSMUSG00000027597 // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// L32836 // GenBank // Mus musculus (clone C7/B9) S-adenosyl homocysteine hydrolase (ahcy) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000029124 // ENSEMBL // S-adenosylhomocysteine hydrolase gene:ENSMUSG00000048538 // chr1 // 100 // 31 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000137242 // ENSEMBL // cdna:known chromosome:NCBIM37:2:154891396:154900183:-1 gene:ENSMUSG00000027597 // chr1 // 100 // 31 // 10 // 10 // 0 main
10344715 AK036865 chr1:7488080-7488381 chr1 NC_000067.5 + 7488080 7488381 25 --- ENSMUST00000067345 // ENSEMBL // cdna:pseudogene chromosome:NCBIM37:1:7488080:7488381:1 gene:ENSMUSG00000054338 // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// AK036865 // GenBank HTC // Mus musculus adult female vagina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9930020B22 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr1 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 main
10344717 chr1:8806219-8806328 chr1 NC_000067.5 + 8806219 8806328 24 --- ENSMUST00000102181 // ENSEMBL // ncrna:miRNA chromosome:NCBIM37:1:8806219:8806328:1 gene:ENSMUSG00000076135 // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 main
10344719 chr1:8846844-8847185 chr1 NC_000067.5 + 8846844 8847185 47 --- ENSMUST00000151704 // ENSEMBL // cdna:pseudogene chromosome:NCBIM37:1:8846009:8846348:-1 gene:ENSMUSG00000086195 // chr1 // 91 // 98 // 42 // 46 // 0 /// GENSCAN00000016384 // ENSEMBL // cdna:Genscan chromosome:NCBIM37:1:8846844:8911992:1 // chr1 // 100 // 64 // 30 // 30 // 0 main
10344721 chr1:9448751-9448853 chr1 NC_000067.5 + 9448751 9448853 25 --- ENSMUST00000083691 // ENSEMBL // ncrna:snRNA chromosome:NCBIM37:1:9448751:9448853:1 gene:ENSMUSG00000065625 // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 main
10344723 NM_021511, BC055925 chr1:9535507-9537533 chr1 NC_000067.5 + 9535507 9537533 9 NM_021511 // Rrs1 // RRS1 ribosome biogenesis regulator homolog (S. cerevisiae) // 1 A2|1 8.0 cM // 59014 /// ENSMUST00000072079 // Rrs1 // RRS1 ribosome biogenesis regulator homolog (S. cerevisiae) // 1 A2|1 8.0 cM // 59014 /// BC055925 // Rrs1 // RRS1 ribosome biogenesis regulator homolog (S. cerevisiae) // 1 A2|1 8.0 cM // 59014 NM_021511 // RefSeq // Mus musculus RRS1 ribosome biogenesis regulator homolog (S. cerevisiae) (Rrs1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000072079 // ENSEMBL // Ribosome biogenesis regulatory protein homolog gene:ENSMUSG00000061024 // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// BC055925 // GenBank // Mus musculus RRS1 ribosome biogenesis regulator homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:68331 IMAGE:4235851), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 main
10344725 NM_175236, NR_027664, BC026584 chr1:9538161-9568049 chr1 NC_000067.5 + 9538161 9568049 29 NM_175236 // Adhfe1 // alcohol dehydrogenase, iron containing, 1 // 1 A2 // 76187 /// NR_027664 // Adhfe1 // alcohol dehydrogenase, iron containing, 1 // 1 A2 // 76187 /// BC026584 // Adhfe1 // alcohol dehydrogenase, iron containing, 1 // 1 A2 // 76187 NM_175236 // RefSeq // Mus musculus alcohol dehydrogenase, iron containing, 1 (Adhfe1), nuclear gene encoding mitochondrial protein, transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NR_027664 // RefSeq // Mus musculus alcohol dehydrogenase, iron containing, 1 (Adhfe1), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr1 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// BC026584 // GenBank // Mus musculus alcohol dehydrogenase, iron containing, 1, mRNA (cDNA clone MGC:37234 IMAGE:4972323), complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000144177 // ENSEMBL // cdna:known chromosome:NCBIM37:1:9538029:9568051:1 gene:ENSMUSG00000025911 // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 main
10344741 NM_053263, BC158038, AF463524, BC062198, BC057655, XR_032858, XR_030710, XR_005102, XR_034932, XR_034464, XR_033067 chr1:9564657-9565730 chr1 NC_000067.5 + 9564657 9565730 41 NM_053263 // Hnrnpa3 // heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A3 // 2 A7.2 // 229279 /// ENSMUST00000090792 // Hnrnpa3 // heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A3 // 2 A7.2 // 229279 /// BC158038 // Hnrnpa3 // heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A3 // 2 A7.2 // 229279 /// AF463524 // Hnrnpa3 // heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A3 // 2 A7.2 // 229279 /// BC062198 // Hnrnpa3 // heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A3 // 2 A7.2 // 229279 /// BC057655 // Hnrnpa3 // heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A3 // 2 A7.2 // 229279 /// ENSMUST00000076974 // Hnrnpa3 // heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A3 // 2 A7.2 // 229279 /// ENSMUST00000111961 // Hnrnpa3 // heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A3 // 2 A7.2 // 229279 /// ENSMUST00000071732 // Gm11847 // predicted gene 11847 // 4 A1 // 545592 /// XR_032858 // Gm12229 // predicted gene 12229 // 11 B1.3 // 677786 /// XR_030710 // Gm5896 // predicted gene 5896 // 7 B3 // 545955 /// XR_030710 // Gm5896 // predicted gene 5896 // 7 B3 // 545955 /// XR_030710 // Gm5896 // predicted gene 5896 // 7 B3 // 545955 /// XR_005102 // LOC674654 // similar to heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A3 // --- // 674654 /// XR_005102 // LOC674654 // similar to heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A3 // --- // 674654 NM_053263 // RefSeq // Mus musculus heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A3 (Hnrnpa3), transcript variant c, mRNA. // chr1 // 95 // 100 // 39 // 41 // 0 /// ENSMUST00000090792 // ENSEMBL // Isoform 1 of Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A3 gene:ENSMUSG00000059005 // chr1 // 100 // 88 // 37 // 36 // 0 /// BC158038 // GenBank // Mus musculus heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A3, mRNA (cDNA clone MGC:189841 IMAGE:9007341), complete cds. // chr1 // 95 // 100 // 39 // 41 // 0 /// AF463524 // GenBank // Mus musculus ribonucleoprotein heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A3 (Hnrnpa3) mRNA, complete cds. // chr1 // 95 // 100 // 39 // 41 // 0 /// BC062198 // GenBank // Mus musculus heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A3, mRNA (cDNA clone MGC:70225 IMAGE:2655879), complete cds. // chr1 // 95 // 95 // 37 // 39 // 0 /// BC057655 // GenBank // Mus musculus heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A3, mRNA (cDNA clone IMAGE:3496518), partial cds. // chr1 // 95 // 100 // 39 // 41 // 0 /// ENSMUST00000076974 // ENSEMBL // Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A3 gene:ENSMUSG00000059005 // chr1 // 95 // 95 // 37 // 39 // 0 /// ENSMUST00000111961 // ENSEMBL // Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A3 gene:ENSMUSG00000059005 // chr1 // 95 // 95 // 37 // 39 // 0 /// ENSMUST00000071732 // ENSEMBL // similar to heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A3, isoform 12 gene:ENSMUSG00000060989 // chr1 // 95 // 95 // 37 // 39 // 0 /// ENSMUST00000073014 // ENSEMBL // cdna:known chromosome:NCBIM37:5:16235811:16238781:-1 gene:ENSMUSG00000059179 // chr1 // 95 // 100 // 39 // 41 // 0 /// ENSMUST00000089593 // ENSEMBL // cdna:known chromosome:NCBIM37:7:72930101:72930840:1 gene:ENSMUSG00000068480 // chr1 // 100 // 44 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000121942 // ENSEMBL // cdna:pseudogene chromosome:NCBIM37:1:9564629:9565730:1 gene:ENSMUSG00000081441 // chr1 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000088671 // ENSEMBL // cdna:pseudogene chromosome:NCBIM37:1:9564657:9565730:1 gene:ENSMUSG00000081441 // chr1 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000073495 // ENSEMBL // cdna:pseudogene chromosome:NCBIM37:4:111479963:111481031:-1 gene:ENSMUSG00000060887 // chr1 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000091130 // ENSEMBL // cdna:pseudogene chromosome:NCBIM37:3:54285388:54286461:1 gene:ENSMUSG00000069014 // chr1 // 95 // 100 // 39 // 41 // 0 /// ENSMUST00000120017 // ENSEMBL // cdna:pseudogene chromosome:NCBIM37:4:111479963:111481028:-1 gene:ENSMUSG00000060887 // chr1 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000088183 // ENSEMBL // cdna:pseudogene chromosome:NCBIM37:X:77702078:77703151:1 gene:ENSMUSG00000081205 // chr1 // 95 // 100 // 39 // 41 // 0 /// ENSMUST00000117582 // ENSEMBL // cdna:pseudogene chromosome:NCBIM37:X:77702081:77703148:1 gene:ENSMUSG00000081205 // chr1 // 95 // 95 // 37 // 39 // 0 /// ENSMUST00000125165 // ENSEMBL // cdna:pseudogene chromosome:NCBIM37:4:12159980:12161098:1 gene:ENSMUSG00000060989 // chr1 // 100 // 85 // 37 // 35 // 0 /// ENSMUST00000085507 // ENSEMBL // cdna:pseudogene chromosome:NCBIM37:14:122517160:122518231:1 gene:ENSMUSG00000066538 // chr1 // 83 // 100 // 34 // 41 // 0 /// ENSMUST00000089931 // ENSEMBL // cdna:pseudogene chromosome:NCBIM37:16:94463881:94464954:-1 gene:ENSMUSG00000041929 // chr1 // 80 // 100 // 33 // 41 // 0 /// ENSMUST00000117287 // ENSEMBL // cdna:pseudogene chromosome:NCBIM37:2:180951432:180952504:1 gene:ENSMUSG00000083993 // chr1 // 82 // 95 // 32 // 39 // 0 /// ENSMUST00000122378 // ENSEMBL // cdna:pseudogene chromosome:NCBIM37:X:68450302:68451346:1 gene:ENSMUSG00000082262 // chr1 // 57 // 90 // 21 // 37 // 0 /// XR_032858 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus similar to heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A3 (LOC677786), misc RNA. // chr1 // 56 // 61 // 14 // 25 // 0 /// XR_030710 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus similar to heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A3 (LOC545955), misc RNA. // chr1 // 41 // 83 // 14 // 34 // 0 /// XR_005102 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus similar to heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A3 (LOC674654), misc RNA. // chr1 // 83 // 98 // 33 // 40 // 0 /// GENSCAN00000034610 // ENSEMBL // cdna:Genscan chromosome:NCBIM37:1:9564657:9615050:1 // chr1 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// GENSCAN00000046407 // ENSEMBL // cdna:Genscan chromosome:NCBIM37:X:77702078:77769327:1 // chr1 // 95 // 100 // 39 // 41 // 0 /// GENSCAN00000038250 // ENSEMBL // cdna:Genscan chromosome:NCBIM37:15:41753627:41799197:1 // chr1 // 54 // 100 // 22 // 41 // 0 /// ENSMUST00000119643 // ENSEMBL // cdna:pseudogene chromosome:NCBIM37:X:71380472:71381526:-1 gene:ENSMUSG00000081118 // chr1 // 39 // 93 // 15 // 38 // 1 /// ENSMUST00000119765 // ENSEMBL // cdna:pseudogene chromosome:NCBIM37:X:8586153:8587203:-1 gene:ENSMUSG00000083468 // chr1 // 36 // 88 // 13 // 36 // 1 /// ENSMUST00000121434 // ENSEMBL // cdna:pseudogene chromosome:NCBIM37:2:131925605:131926635:1 gene:ENSMUSG00000082990 // chr1 // 26 // 93 // 10 // 38 // 1 /// ENSMUST00000119442 // ENSEMBL // cdna:pseudogene chromosome:NCBIM37:2:24848877:24849863:-1 gene:ENSMUSG00000083796 // chr1 // 20 // 85 // 7 // 35 // 1 /// XR_034932 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus similar to heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A3 (LOC626513), misc RNA. // chr1 // 30 // 98 // 12 // 40 // 1 /// XR_034464 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus similar to heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A3 (LOC665114), misc RNA. // chr1 // 25 // 98 // 10 // 40 // 1 /// XR_033067 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus similar to heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A3 (LOC637851), misc RNA. // chr1 // 32 // 90 // 12 // 37 // 1 main

Total number of rows: 35556

Table truncated, full table size 30369 Kbytes.






Download family Format
SOFT formatted family file(s) SOFTHelp
MINiML formatted family file(s) MINiMLHelp

Supplementary data files not provided
| NLM | NIH | GEO Help | Disclaimer | Accessibility |
NCBI Home NCBI Search NCBI SiteMap