ISSN: 1561-0837
lromeroc@unmsm.edu.pe
Universidad Nacional Mayor de San Marcos
Per
Ramrez, Rina; Borda, Vctor; Romero, Pedro; Ramirez, Jorge; Congrains, Carlos; Chirinos, Jenny;
Ramrez, Pablo; Velsquez, Luz Elena; Meja, Kember
Biodiversidad y endemismo de los caracoles terrestres Megalobulimus y Systrophia en la Amazonia
occidental
Revista Peruana de Biologa, vol. 19, nm. 1, abril, 2012, pp. 59-74
Universidad Nacional Mayor de San Marcos
Lima, Per
En este trabajo realizamos un estudio biogeogrfico de dos gneros de caracoles terrestres amaznicos,
Megalobulimus (Strophocheilidae) y Systrophia (Scolodontidae). Se utilizaron individuos colectados en diversas
localidades de la Amazonia peruana as como informacin bibliogrfica. Se utilizaron los marcadores moleculares 5.8S-ITS2-28S rRNA y 16S rRNA para reconstruir filogenias y obtener hiptesis sobre las relaciones
evolutivas entre los gneros amaznicos y otras especies de distribucin global. La filogenia nuclear permiti
determinar la posicin evolutiva de ambos gneros y la filogenia mitocondrial permiti la diferenciacin de
las especies a nivel intragenrico. Megalobulimus form parte del clado no-achatinoideo en la filogenia de
los gastrpodos Stylommatophora, como lo esperado, pero no pudo ser demostrada su cercana a la familia
Acavidae, mientras que Systrophia qued fuera de los dos clados establecidos, formando uno basal dentro
de los Stylommatophora. El gen mitocondrial 16S rRNA permiti diferenciar a las especies de Megalobulimus,
actuando como cdigo de barras de ADN de estos caracoles comestibles. El anlisis de distribucin geogrfica
revel varios endemismos para la Amazonia peruana para especies de ambos gneros, resaltando las unidades
biogeogrficas de Chanchamayo e Inambari.
Palabras claves. 16S rRNA, ITS, sistemtica molecular, cdigo de barras de ADN, endemismos
Abstract
In this work we performed a biogeographic study of two genera of Amazonian land snails, Megalobulimus
(Strophocheilidae) and Systrophia (Scolodontidae). We used samples from different regions of the Peruvian
Amazon, as well as bibliographic information. We analyzed both nuclear (5.8S-ITS2-28S rRNA) and mitochondrial
(16S rRNA) genes to reconstruct phylogenies and obtain hypotheses concerning the evolutionary relationships
among Amazonian genera and other species with global distribution. The nuclear phylogeny allowed us to determine the evolutionary position of both genera, and the mitochondrial phylogeny permitted the differentiation
of species at the intrageneric level. We found that Megalobulimus clustered with the non-achatinoid clade within
Stylommatophora, as expected, but its relationship to family Acavidae could not be demonstrated. Systrophia
did not cluster with any of the two established clades, but formed a basal one within Stylommatophora. The
mitochondrial gene 16S rRNA allowed us to differentiate Megalobulimus species, and performed well for DNA
barcoding of these edible snails. Biogeographical analysis revealed several endemic species in the Peruvian
Amazon within both genera, highlighting the Chanchamayo and Inambari biogeographic units.
Keywords. 16S rRNA, ITS, molecular systematics, DNA barcode, endemism.
Introduccin
Amrica del Sur alberga la mayor biodiversidad del mundo,
aunque an no se conocen todas sus especies que la componen,
en especial las de la Amazonia (Vieira et al. 2008). En este continente existen grandes reas de endemismos como la cuenca
amaznica occidental, las vertientes boscosas de los Andes y el
bosque atlntico de Brasil (Moritz et al. 2000), que estn experimentando una acelerada prdida de hbitats, por lo que son
conocidas tambin como hotspots (Myers 1988; Myers et al.
2000). Los moluscos son uno de los componentes conspicuos
de esa biodiversidad, el segundo phylum con mayor nmero
de especies animales (Ponder & Lindberg 2008), pero al mismo tiempo con muy pocos estudios en la Amazonia (Bruggen
1995). Entre los ms estudiados estan los gneros Megalobulimus
(Fam. Strophocheilidae) y Systrophia (Fam. Scolodontidae); el
primero alberga caracoles comestibles y la especie de mayor
tamao en Amrica, M. popelairianus (163 mm) (Bequaert
1948), y Systrophia tiene conchas aplanadas de no ms de 25.5
mm (Ramrez 1993). Ambas familias son endmicas de Amrica
del Sur (Parodiz 1982) y los gneros mencionados estn bien
representados en la Amazonia occidental. Los Megalobulimus
(Fig. 1) son conocidos en el Per como congompes (DouroRev. peru. biol. 19(1): 059 - 074 (April 2012)
jeanni 1965; Ramrez & Cceres 1991; Borda et al. 2010), son
utilizados como alimento en Per (Castro et al. 1976; Ramrez
& Cceres 1991) y Ecuador (Bequaert 1948). Los Systrophia
constituyen los moluscos ms representativos de los bosques de
la Amazonia occidental; y especies como S. helicycloides (Fig. 2)
han permitido desarrollar estudios filogeogrficos que han demostrando los efectos histricos de la dinmica de la Amazonia
(Romero 2010).
El inters creciente por las propiedades regeneradoras o
rejuvenecedoras de la piel atribuidas a los caracoles terrestres
(Abad 1996; Wang et al. 2010) ha propiciado extracciones
indiscriminadas para su comercializacin informal. Poco es lo
que se ha logrado en el cultivo de especies nativas (Campoverde
1992; Rengifo et al. 2004), a diferencia de lo que sucede con el
introducido caracol europeo Helix aspersa que se ha convertido
en plaga de cultivos principalmente de la costa de Per.
En la actualidad se sabe que no slo la diversidad de especies,
sino que la diversidad gentica juega un papel muy importante
en la biodiversidad (Primack & Rodrguez 2001). Estudios en
genmica estn resolviendo una serie de incgnitas que permiten
un mejor aprovechamiento de la biodiversidad al emplear se-
59
Ramrez et al.
Figura 1. Conchas de Megalobulimus spp. procedentes de Per (A-F, H-J) y Colombia (G.). (A) M. capillaceus (Dpto. San Martn). (B) M.
separabilis (Dpto. Hunuco). (C) M. leucostoma (Dpto. Cusco). (D) M. carrikeri (Dpto. Junn). (E) M. huascari (Dpto. Junn). (F) M. lichtensteini
(Dpto. Amazonas). (G) M. oblongus (Dpto. Caldas, Colombia). (H) M. maximus (Dpto. Madre de Dios). (I) M. thammianus (Dpto. Junn). (J)
M. popelairianus (Dpto. Madre de Dios).
60
de Amrica del Sur, los caracoles terrestres de los gneros Megalobulimus (Strophocheilidae) y Systrophia (Scolodontidae),
enfatizando el anlisis molecular, as como un comentario sobre
el uso de congompes.
Material y mtodos
Material biolgico.- El material usado para el anlisis molecular de Megalobulimus spp. (Fig. 1) fue colectado en varias
localidades de la Amazonia peruana, as como en mercados de
abastos de Tarapoto y Juanjui (Dpto. San Martn) e Iquitos
(Dpto. Loreto: Mercado Beln), y el de Systrophia helicycloides
(Fig. 2) en el Dpto. Madre de Dios (Tab. 1). Los especimenes
fueron conservados en etanol 96% y depositados en el Departamento de Malacologa y Carcinologa del Museo de Historia
Natural de la Universidad Nacional Mayor de San Marcos.
Extraccin, amplificacin y secuenciamiento de ADN.El ADN total fue aislado de msculo del pie de caracoles
preservados en etanol usando una modificacin del mtodo de
CTAB (Doyle & Doyle 1987; Ramrez 2004). Un segmento
variable del gen mitocondrial 16S rRNA fue amplificado por
PCR usando primers y protocolos descritos por Ramrez (2004).
Para el marcador nuclear se usaron los primers LSU1 y LSU3
de Wade y Morgan (2000), para amplificar la regin 3 del gen
5.8S rRNA (aprox. 80pb), el ITS-2 completo y la regin 5 del
gen 28S rRNA (aprox. 370pb). Ambas hebras fueron secuen-
Tabla 1. Procedencia de los especmenes de Megalobulimus y Systrophia de los que se obtuvieron secuencias en este estudio, con sus
nmeros de accesin en el GenBank (Benson et al. 2011).
Especie
Individuo
Procedencia
Coordenadas (LS/LO)
M. capillaceus
Moy-M16-6
SM. Moyobamba
60211.2 / 765826.2
Nuclear
16S rRNA
M. capillaceus
Sap-M61-10.2
SM. Saposoa
656 / 7647
JN604718
JN604726
M. capillaceus
Tar-M19-1
SM. Tarapoto
62818 / 762214.6
JN604719
JN604727
M. huascari
JSP-N47-1
1048'43.8'' / 7512'02.8''
JN604728
M. huascari
JLE-N46-2
1114'27.5'' / 7522'02.6''
JN604729
M. huascari
Utc-N55-1
JU: Uctuyacu
1117'19.5' / 7519'29.4''
JN604730
M. lichtensteini
Shu-M73-17.2
CA: Shumba
532'33.07" / 7848'59.15"
JN604731
M. lichtensteini
Nar-N29-2
AM. Naranjito
549" / 7816"
JN604732
JN604725
M. lichtensteini
Nar-M88-1
AM. Naranjito
549" / 7816"
10
M. maximus
Ink-M86-1
MD. Inkaterra
1235' / 6905'
JN604720
JN604734
11
M. maximus
Ink-M100-2
MD. Inkaterra
1235' / 6905'
JN604721
JN604735
12
M. maximus
Biot-N70-2
1235' / 6905'
13
M. popelairianus
TarM-M90-13
JN604737
14
M. popelairianus
TarM-N58-1
JN604738
15
M. popelairianus
SapJM-M78-1
JN604739
16
M. popelairianus
MIq-H14-3
17
M. popelairianus
Ink-M85-2
MD. Inkaterra
1235' / 6905'
18
M. popelairianus
Rio-M67-9.1
SM. Rioja
649 / 771083
19
M. popelairianus
SapCH-M95-10.4
SM. Saposoa-Chambira
JN604743
20
M. separabilis
HuA-N36
HU. Ambo
1007'43" / 7612'48.1"
JN604744
21
M. thammianus
DBo-N39-u
1110'38.7'' / 7521'18.3''
JN604745
22
M. thammianus
Flo-N40-u
1049'54.9'' / 7506'40.9''
JN604746
23
M. thammianus
Flo-N42-1
JN604747
24
M. thammianus
Oco-H25-1
1105'39.2'' / 7418'31.3''
JN604748
25
M. thammianus
Biot-N27-8a
1235' / 6905'
26
S. helicycloides
Ami-CLo-P20-a
1234.15' / 706.06'
JN604723
27
S. helicycloides
Ink-Pal-P29-g
MD. Inkaterra
1235' / 6905'
JN604724
JN604733
JN604736
JN604740
JN604741
JN604722
JN604742
JN604749
Per, dptos. Amazonas (AM), Cajamarca (CA), Hunuco (HU), Junn (JU), Loreto (LO), Madre de Dios (MD) y San Martn (SM).
61
Ramrez et al.
Tabla 2.Taxa usados en las filogenias moleculares basadas en el marcador nuclear >5.8S rRNA-ITS2-28S rRNA< y el marcador mitocondrial
16S rRNA. Las 72 secuencias se encuentran en el GenBank y proceden de Wade et al. (2006), Herbert y Mitchell (2009) (1), Ramrez et al.
(2011) (2), Rowson et al. (2011) (3), Moussalli et al. (2009) (4), Breure et al. (2010) (5) y del presente estudio (6).
Familia
Especie
Nmero de Accesin
Phylum Mollusca, Clase Gastropoda, Subclase Pulmonata, Orden Eupolmonata, Suborden Stylommatophora
Infraorden Orthurethra
Vertiginidae
Vertigo antivergo (Draparnaud 1801)
Gastrocopta armifera (Say 1821)
Enidae
Mastus pupa (Bruguire 1792)
Partulidae
Partula suturalis Pfeiffer 1855
Infraorden Mesurethra
Clausiliidae
Clausilia bidentata (Strm 1765)
Macrogastra rolphii (Turton 1826)
Cochlodina laminata (Montagu 1803)
Albinaria xantostoma (Boettger 1883)
Pinguiphaedusa platydera (Martens 1876)
Infraorden Elasmognatha
Succineidae
Succinea striata (Krauss 1848)
Athoracophoridae
Athoracophorus bitentaculatus (Quoy y Gaimard 1832)
Infraorden Sigmurethra
Orthalicidae
Bulimulus sporadicus (dOrbigny 1835)
Orthalicus ponderosus Strebel y Pfeffer 1882 (5)
Placostylus eddystonensis (Pfeiffer 1855)
Bostryx aguilari Weyrauch 1967 (2, 6)
Amphibulimulidae
Cerionidae
Ferussaciidae
Subulinidae
Achatinidae
Spiraxidae
Tesatacellidae
Streptaxidae
Strophocheilidae
Dorcasidae
Acavidae
Caryodidae
Rhytididae
Chlamydephoridae
Haplotrematidae
Corillidae
Punctidae
Charopidae
Nuclear
16S rRNA
AY014027
AY841286
AY014038-9
AY014042
AY014051
AY014052
AY014047
AY014048
AY841292
AY841295
AY014018
AY841299
HM027506
AY841296-7
HM116230,
JN604717
AY841301
AY014060
AY841302
AY014061
AY014065
AY014062
AY014072
AY014074
AY014075
AY014076
AY014077
JN604718-9
JN604720-1
AY014078
JN604722
HQ328370
HQ328283
HQ328274
JN604725-7
JN604728-30
JN604731-3
JN604734-6
JN604737-43
JN604744
JN604745-9
AY014079
AY014080-1
AY014082-3
AY014084-5
AY014086
AY014087
AY014088
FJ262219
FJ262230
FJ262237
AY014089
AY014090
AY014091-2
AY014093
AY014094-5
continua...
62
Especie
Otoconchidae
Discidae
Arionidae
Philomycidae
Scolodontidae
Euconulidae
Helicarionidae
Ariophantidae
Urocyclidae
Pristilomatidae
Oxychilidae
Milacidae
Poligyridae
Helicidae
Bradybaenidae
Helminthoglyptidae
Nmero de Accesin
AY014096
AY014097
AY841309
AY014098
AY014103
AY841312
EU622017
AY014113
AY014114
AY014117
AY841316
AY014128
AY841333
AY014138
AY841346
AY014142
AY014143
AY841349
HM067823,
HM116229
HM067824
HM067825
HM116227-8
JN604723-4
AY014147
AY014149-50
AY014151
AY014153-4
63
Ramrez et al.
evolutivo que mejor se ajuste a los datos, en el anlisis filogentico de ML, utilizamos el programa jModeltest (Posada 2008)
y el criterio de informacin de Akaike corregido para muestras
pequeas (AICc); el modelo elegido fue TPM3uf+I(0.1320)+G
(=0.3650). Para el anlisis bayesiano se utiliz el programa
MrModeltest (Nylander 2004) y el criterio de informacin de
Akaike; el modelo elegido fue GTR+I+G. El anlisis ML fue
realizado con el programa PhyML (Guindon & Gascuel 2003)
(http://www.atgc-montpellier.fr/phyml). El anlisis de IB fue
llevado a cabo con MrBayes con cuatro Cadenas de Markov
Monte Carlo por 10 millones de generaciones, muestreadas
cada 1000 generaciones y burn-in de 9000.
Distribucin geogrfica.- Para el anlisis de las distribuciones se hizo el levantamiento de la informacin geogrfica
publicada por Bequaert (1948) y Simone (2006), para Megalo-
Figura 3. rbol NJ que muestra la posicin evolutiva de dos familias endmicas de Amrica del Sur en la filogenia de los pulmonados Stylommatophora. Strophocheilidae y Scolodontidae estn indicadas con llaves. Los clados "achatinoideo" y "no-achatinoideo" son segn Wade et al.
(2006). Se muestra el soporte de bootstrap en los nodos. La escala representa distancias genticas en sustituciones de nucletidos por sitio.
64
Figura 4. rbol filogentico obtenido por inferencia bayesiana que muestra la posicin evolutiva de dos familias endmicas de Amrica del Sur
en la filogenia de los pulmonados Stylommatophora. Strophocheilidae y Scolodontidae estn indicadas con llaves. Los clados "achatinoideo"
y "no-achatinoideo" son segn Wade et al. (2006). El nmero junto a los nodos indica la probabilidad posterior para el anlisis bayesiano. La
escala representa distancias genticas en sustituciones de nucletidos por sitio.
Rev. peru. biol. 19(1): 059 - 074 (April 2012)
65
Ramrez et al.
En el caso de las secuencias de Scolodontidae (dos del presente estudio y cuatro del GenBank) analizadas junto con cinco
secuencias del clado achatinoideo como grupo externo, result
en una mejor resolucin. En el rbol NJ (Fig. 6), las secuencias
de Systrophia helycicloides y Systrophia eatoni formaron un grupo
monofiltico junto con S. (Entodina) jekylli, y basal a stas, las
secuencias de Scolodonta spp.
El anlisis filogentico utilizando todos los sitios del alineamiento de las cinco secuencias de Megalobulimus, junto con
la de M. oblongus y otras tres como grupo externo, obtenidas
del GenBank, resulta en una mejor resolucin. En el rbol NJ
(Fig. 5), el clado Megalobulimus queda altamente sustentado
(bootstrap: 100%), as como la agrupacin de M. capillaceus
con M. oblongus.
66
Relaciones evolutivas de las especies del gnero Megalobulimus de la Amazonia occidental sobre la base del marcador
mitocondrial 16S rRNA.- En el presente estudio se obtuvieron
25 secuencias para el marcador molecular del gen mitocondrial
Figura 8. rbol Neighbour-Joining de siete especies de Megalobulimus de la Amazonia occidental, basado en un segmento del gen
mitocondrial 16S rRNA. Se muestra el soporte de bootstrap en los
nodos. La escala representa distancias genticas en sustituciones
de nucletidos por sitio.
Tabla 3. Especies del gnero Megalobulimus (Strophocheilidae) con distribucin en la Amazonia. Se indica los pases y altitudes en las que
han sido reportadas.
Especie
Pas (altitud)
1.
2.
3.
4.
5.
6.
7.
8.
9.
10.
11.
12.
COLOMBIA: Orinoquia (467 m), Andina (352-1200 m), Caribea (0-150 m). VENEZUELA (8502,220 m). BRASIL: Amazonia (90 m), Cerrado (678 m). BOLIVIA (200-400 m). ARGENTINA (450 m).
PARAGUAY (124 m). Islas del Caribe.
13.
BRASIL (37-20m)
14.
15.
16.
17.
18.
19.
BOLIVIA (1600m)
COLOMBIA
PER (2000-2010m)
PERU (200-1488m). COLOMBIA (442m). Ecuador (1000-2000m).
BOLIVIA (300-400m). PER (1600m). BRASIL (1041m)
67
Ramrez et al.
68
Especie
Pas
Altitud (m)
Per
Per
Amrica Del Sur
Brasil; Per; Bolivia
Per
Bolivia; Per; Colombia
Amrica Del Sur
Per
Ecuador; Per
Per
Per; Bolivia
Per
Per
Brasil
Per; Brasil
Bolivia
Per
Per
Per
120 - 1000
2100 - 2600
100-300
2100
Per (186 - 1600) / Bolivia (180-400) / Colombia (40-150)
1400-3000
Ecuador (2818)
670
Per 1400/ Bolivia 1000
3000
100
38
Per (870 - 1600)
2000
300-600
700 - 1200
69
Ramrez et al.
70
como sinnimas de M. popelairianus (Simone 2006). Ejemplares del complejo de especies M. popelairianus colectados en
distintas localidades del Per formaron un grupo monofiltico,
en donde los de la localidad tipo de M. thammianus (Martens,
1876), Chanchamayo (Junn, Per), formaron un clado bien
sustentado junto con otros dos ejemplares de Madre de Dios, lo
que podra respaldar a M. thammianus como una especie vlida.
Para definir el verdadero estatus taxonmico de M. popelairianus
y M. thammianus se requiere de un anlisis ms extensivo, donde
se incluya ejemplares procedentes de la amplitud de sus distribuciones geogrficas, ambas especies estn reportadas tambin
para Ecuador y Colombia (Tab. 3).
La concha de M. capillaceus (Pfeiffer 1855) tiene el peristoma
rojo, por lo que ha sido confundida con otras dos especies que
tambin lo presentan (M. oblongus y M. separabilis) (Bequaert
1948). Recientemente, Borda (2011) deslind este problema
taxonmico mediante anlisis del sistema reproductor, encontrando que son especies vlidas, con M. separabilis muy diferente
de M. capillaceus y M. oblongus; estas dos ltimas presentan
sinapomorfas en el epifalo y en el oviducto libre. Asimismo,
que lo reportado para Bolivia podra no corresponder a M.
capillaceus. Nosotros hemos encontrado, mediante la filogenia
molecular sobre la base del rADN nuclear, que efectivamente M.
capillaceus y M. oblongus forman un grupo monofiltico (Figs.
3-5), y que, con el anlisis filogentico sobre la base del marcador
mitocondrial 16S rRNA, M. capillaceus est totalmente alejada
de M. separabilis (Figs. 8-9).
Una identificacin rpida y segura de las especies es altamente necesaria, por bioseguridad, autenticacin alimentaria,
contra comercio ilegal, etc., lo que ahora es posible gracias a la
biologa molecular (Wong & Hanner 2008; Ferri et al. 2009).
La identificacin taxonmica de especies ampliamente usadas
en alimentacin humana es primordial, aun fuera de los mbitos
cientficos. La identificacin taxonmica de las especies de moluscos comercializados a nivel local, al momento actual requieren
de una carta de presentacin que pueda elevar su credibilidad
para el biocomercio a nivel internacional, como sucede con
peces, por ejemplo (Handy et al. 2011). La biologa molecular
est ayudando grandemente en esta tarea, al permitir caracterizar
a las especies mediante cdigo de barras de ADN, al igual que
los cdigos de barras de los productos en los supermercados; un
segmento del gen mitocondrial de la citocromo oxidasa C subunidad I (COI) ha sido propuesto como el marcador de estndar
global para animales (Hebert et al. 2003a, b; Hebert & Gregory
2005; Hajibabaei et al. 2007). Sin embargo, se ha encontrado
que el gen 16S rRNA es tan bueno o mejor que el COI, para
algunos grupos como anfibios (Vences et al. 2005) e Hydrozoa
(Cnidaria) (Moura et al. 2008). Asimismo, para moluscos se
haba encontrado que el gen 16S rRNA provea suficiente variacin intraespecfica como para tambin ser usado en estudios
poblacionales, fuera de su comprobada eficiencia para resolver
relaciones filogenticas entre especies o categoras taxonmicas
superiores (Chiba 1999; Ramirez et al. 2009), y a la fecha ya
ha sido utilizado especficamente como cdigo de barras en
bivalvos de la familia Pectinidae (Feng et al. 2011) y en babosas
del gnero Arion (Barr et al. 2009). Una de las razones que se
aduce para respaldar al COI como estndar global es que existen
primers universales para su amplificacin por PCR (Folmer et al.
1994); no obstante, para los bivalvos Pectinidae no amplific en
lo absoluto (Feng et al. 2011). En el caso particular de caracoles
Rev. peru. biol. 19(1): 059 - 074 (April 2012)
71
Ramrez et al.
72
Literatura citada
Abad R. 1996. Therapeutic and cosmetic compositions for treatement
of skin. United States Patent. Patent N 5,538,740.
Alves R. & T. Dias. 2010. Usos de invertebrados na medicina popular
no Brasil e suas implicaes para conservao. Tropical
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