Derivagenicayendogamia
Derivagenicayendogamia
Derivagenicayendogamia
UNIDAD 2
Supongamos que en una población un gen tiene dos alelos A y a, en frecuencias 0,4 y
0,6. La frecuencia de A en la generación siguiente puede ser menor o mayor que 0,4
simplemente debido a que por casualidad, el alelo A está presente menos veces o más
veces que las esperadas entre los gametos que formarán los cigotos de esa generación.
La deriva es un proceso casual y representa un error o variación de muestreo. Los
errores de muestreo están inversamente relacionados con el tamaño de la muestra:
cuanto menor es la muestra, mayor es el error. En las poblaciones, cuanto menor es el
número de individuos que se reproduce, mayores pueden ser los cambios en la
frecuencia alélica debidos a deriva al azar.
Esto puede expresarse como una matriz cuadrada T con los elementos Tij dando la
probabilidad de transición del estado i al j para i,j = 0, 1, 2,...2N. Este modelo
matemático se conoce como cadenas de Markov.
Por ejemplo, una población con 2N= 4:
j Alelos en la generación t + 1
i 0 1 2 3 4
Alelos en
la
generac.
t
0 1 0 0 0 0
1 0.316 0.422 0.211 0.047 0.004
2 0.062 0.25 0.375 0.25 0.062
3 0.04 0.047 0.211 0.422 0.316
4 0 0 0 0 1
Fisher (1922) encontró que la deriva génica puede describirse por la ecuación de
difusión del calor por una barra sólida. La distribución de poblaciones con
frecuencias alélicas de 0 a 1 es Φ(x,t) donde x representa la frecuencia alélica y t el
tiempo, como en la Fig. anterior. El problema es encontrar una ecuación que describa
como Φ(x,t) cambia con la deriva génica y Fisher usó la de difusión del calor. (Fig.
5).
Las dos familias de curvas son las distribuciones Φ(x,t) de la frecuencia alélica entre
poblaciones no fijadas después de distintos tiempos medidos en unidades de N
generaciones.
Cuando la frecuencia inicial es p=0,5 después de t=2N generaciones la distribución de
la frecuencia alélica es esencialmente chata y la mitad de las poblaciones aún están
segregando. A medida que pasa el tiempo, más y más poblaciones se fijan y las
distribuciones crecen en los valores 0 y 1.
Cuando la frecuencia inicial es p=0,1 la curva se aplana recién en t=4N y por ese
tiempo, solamente el 10% de las poblaciones continúa segregando. El tiempo
requerido para la fijación de un alelo depende entonces de su frecuencia (Fig. 6).
A menos que una población sea muy pequeña, los cambios en la frecuencia alélica
por deriva génica de una generación a otra serán pequeños, pero a lo largo de las
generaciones pueden ser grandes, resultando en la fijación de un alelo y la
eliminación de los otros. La probabilidad de que un alelo se fije por deriva es
precisamente su frecuencia. Por ejemplo si pA=0,2 la probabilidad de fijación de A es
0,2 pero esto puede requerir mucho tiempo. El número promedio de generaciones
requeridas para la fijación es cuatro veces el número efectivo, o sea 4N.
Es poco probable que la deriva por sí sola afecte las frecuencias alélicas durante
largos períodos de tiempo; mutación, migración y selección también las estarán
afectando. Estos tres son procesos deterministas de cambio evolutivo. Sea x el valor
de la tasa de mutación, de migración o el coeficiente de selección, la frecuencia
4
alélica estará afectada por la deriva sólo si 4Nx << 1. Pero si 4Nx = 1 o > 1 entonces
las frecuencias alélicas estarán afectadas por los procesos deterministas. Por ejemplo,
si x=10-5 que es la tasa de mutación en una población de 100 individuos que se
reproducen,
4. 100. 10-5 = 0,004 << 1
Pero si la población tiene un tamaño efectivo de un millón de individuos,
4. 106 . 10-5 = 40 >1
Si 2 cada 100 individuos migran, o sea x=0,02 aún en poblaciones pequeñas de
N=100,
4. 100. 0,02 = 8 >1
Casos extremos de deriva génica se dan cuando una nueva población se establece a
partir de unos pocos individuos, lo que se conoce como efecto fundador. Debido a
deriva, las frecuencias alélicas en ese pequeño grupo pueden ser muy diferentes de la
población original y tener profundos efectos en la evolución de la nueva población.
ENDOGAMIA O CONSANGUINIDAD
Lo mismo sucede con alelos múltiples porque la propiedad Ht= ½ Ht-1 es intrínseca de
la autofecundación.
Lo mismo con dos loci de segregación independiente, aunque en este caso el doble
heterocigoto se reduce a ¼ cada generación, pero los heterocigotos simples no lo
hacen tan rápido porque son parcialmente producidos por el anterior.
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En un locus, un individuo puede tener dos alelos que son copia de un mismo alelo de
un antecesor común: se llaman alelos idénticos por descendencia o autocigotos. O
bien puede tener dos alelos provenientes de distintos ancestros, no idénticos o
alocigotos, ya sean iguales (homocigotos) o diferentes (heterocigotos). F es la
probabilidad de homocigotos idénticos o autocigotos (que llevan dos copias de un
mismo alelo ancestral) y es determinado directamente por el sistema de apareamiento.
Ver figura.
Consecuencias de la endogamia
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• Las frecuencias genotípicas se alteran pero las frecuencias alélicas permanecen sin
cambios.
• Las especies autógamas son altamente homocigóticas.
• Las especies autógamas contienen pocos alelos recesivos perjudiciales porque la
homocigosis hace que sean eliminados por selección natural.
• Las autógamas raramente producen nuevas clases de gametos por recombinación,
debido a la alta homocigosis. Por lo mismo, suelen mostrar desequilibrio de
ligamiento.
• Las especies alógamas se hacen homocigotas para alelos recesivos perjudiciales y
sufren depresión por endogamia, directamente proporcional al F.
• Si dos líneas se mantienen por autofecundación por muchas generaciones, F se
acercará a 1. Pero si esas dos líneas altamente endocriadas se cruzan, F en la
progenie instantáneamente vuelve a cero.
• El híbrido de dos líneas endocriadas generalmente muestra vigor híbrido o
heterosis.
Muchas de las importantes consecuencias de la deriva génica surgen del hecho de que
la estructura de la población implica una forma especial de endogamia. La población
se compone de subpoblaciones locales, dentro de las cuales el apareamiento es al azar
y se cumple el principio de Hardy-Weinberg. Llegará un momento en que todas las
subpoblaciones estén fijadas para uno u otro alelo, pero aún así cumplirán con el
equilibrio. En la población total, en un momento dado algunas subpoblaciones estarán
fijadas para p (una fracción p) y otras para q (una fracción q), de modo que si se
muestrean y se calculan las frecuencias alélicas, se encontrarán valores de p(A) y q(a)
y podríamos asumir que hay 2pq heterocigotos, aunque todos los individuos
muestreados sean AA o aa. Esta deficiencia de heterocigotos en la población total,
aunque existe apareamiento al azar, es una consecuencia de la deriva génica debida al
tamaño finito de las subpoblaciones: semeja el efecto de la endogamia.
Ejemplo: Una colonia de ratones se estableció a partir de una población grande (F0=0)
30 generaciones atrás y ha mantenido un tamaño de 20 individuos cada generación.
Cuál será el coeficiente de endogamia?
Ft = 1 - (1-1/2N)t = 1 - (1-1/2.20)30 = 0.532
Esto demuestra que hay mucha consanguinidad a pesar de que el apareamiento es al
azar y las frecuencias genotípicas están en equilibrio. La consanguinidad resulta del
pequeño tamaño de la población.
Muchas plantas son capaces de autofecundarse o cruzarse y han desarrollado una serie
de mecanismos para regular la cantidad de semilla que se produce por cada
mecanismo. El modelo de apareamiento es fácil de analizar si consideramos a la
población como una mezcla de individuos autofecundados (S) y cruzados (1-S) donde
S es la proporción autofecundante (T=1-S sería la proporción con fecundación
cruzada). Entonces:
Ft+1 = S[(1/2)(1+Ft)] + (1-S) (0) = S/2(1+Ft)
APAREAMIENTO PREFERENCIAL
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Si no hay dominancia, las consecuencias de este apareamiento sobre un locus con dos
alelos o alelos múltiples son las mismas que las de la autofecundación. No ocurre lo
mismo con dominancia o con poligenes que actúan de manera aditiva. Si hay
dominancia, los apareamientos serán: Recesivo x Recesivo y Dominante x
Dominante.
En consecuencia habrá un aumento de homocigotos y pérdida de heterocigotos, pero
como en endogamia, no hay cambios en las frecuencias alélicas. A diferencia con la
endogamia, que afecta a todos los genes por igual, el apareamiento preferencial afecta
solamente a los genes asociados con el fenotipo elegido. La varianza para ese fenotipo
aumenta rápidamente. Por ejemplo, para tiempo de floración o para altura y CI en
humanos.
B C
D E
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Procedimiento de cálculo de F:
1. Localizar los antecesores comunes en el pedigre: El individuo I sólo puede ser
autocigoto si el alelo se hereda a través de los padres desde un antecesor común. En
este caso el único antecesor es A.
2. Trazar todos los pasos de los gametos desde uno de los padres de I hasta el
antecesor y de allí al otro padre: este es el camino a través del que I puede ser
autocigoto. En este caso es DBACE y se subraya A para identificarlo como el
antecesor común.
3. Calcular la probabilidad de transmisión de un alelo a través de los pasos anteriores:
En este caso es 1/2 para todos los individuos, excepto para A, porque la segregación
mendeliana predice que un alelo tiene esa probabilidad de ser transmitido a la
progenie.
1/2(1+FA)
A
1/2 B C 1/2
1/2 D E 1/2
C D C D C D
E G E G E G
I I I
En este caso hay dos antecesores, A y B, y dos caminos (uno a través de cada uno). Si
FA = FB = 0 entonces FI será: (1/2)5 por ECADG + (1/2)5 por ECBDG = 1/16
En general para un gen autosómico el coeficiente de endogamia es:
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FI = Σ(1/2)i(1+FA)
donde i es el número de individuos en cada paso y A el antecesor común de cada
camino.
Los machos tiene un solo cromosoma X y no pueden ser nunca autocigotos para
genes ligados al sexo, por eso para estos genes siempre F=0 en los machos. Ya que
los machos transmiten siempre el cromosoma Y a sus hijos, para el cálculo de F se
tienen en cuenta solamente las hembras. Para calcular F en estos casos: 1) Ignorar
todos los caminos donde haya dos o más machos consecutivos; 2) Ignorar los machos
cuando se cuenta el número de pasos de cada camino. Ver Fig. 6 pp. 243.
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PROBLEMAS
1. Qué método usaría para calcular F en organismos como las abejas, en que los
machos son haploides, desarrollados a partir de óvulos no fecundados?
2. Qué valor tendrá F en una población grande que se mantiene por autofecundación
en las generaciones pares y por polinización abierta en las generaciones impares?