Universidad Nacional de Trujillo Sede Guadalupe Escuela de Agronomía Experiencia Curricular: Bioquímica Agrícola
Universidad Nacional de Trujillo Sede Guadalupe Escuela de Agronomía Experiencia Curricular: Bioquímica Agrícola
Universidad Nacional de Trujillo Sede Guadalupe Escuela de Agronomía Experiencia Curricular: Bioquímica Agrícola
SEDE GUADALUPE
ESCUELA DE AGRONOMÍA
EXPERIENCIA CURRICULAR: BIOQUÍMICA AGRÍCOLA
SEMANA 7:
1
CICLO DE KREBS
(CICLO DE LOS ÁCIDOS
TRICARBOXÍLICOS o del
ÁCIDO CÍTRICO)
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Prof. E. Marino Olivares de la Cruz Bioquímica Agrícola
Localización de las
rutas metabólicas
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GLICÓLISIS
CICLO DE
KREBS
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Visión general del Ciclo de Krebs (CK)
1 oxalacetato (4 C) se condensa con 1 acetil-CoA (2 C) para dar citrato
(acido tricarboxilico, 6 C); el citrato se descarboxila 2 veces da 1
compuesto de 4 C a partir del cual se regenera el oxalacetato
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Complejo piruvato deshidrogenasa (PDH)
Componentes del
complejo PDH
Enzimas (3):
• Piruvato deshidrogenasa.
• Dihidrolipoil transacetilasa. Pir pasa al interior
de la mitocondria
• Dihidrolipoil
deshidrogenasa.
descarboxilación
Coenzimas (5): oxidativa
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La Rx catalizada por el complejo PDH es clave en el metabolismo porque:
• Sirve como conexión de la via glucolítica y el ciclo de Krebs.
• El piruvato y el acetil-CoA son componentes comunes de varias rutas
biosintéticas y degradativas.
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Regulación de la PDH
La PDH tiene una posición estratégica en el metabolismo su actividad
esta regulada con precisión.
REGULACION EN EL CICLO:
• Citrato sintasa: Es (-) (disminuye su actividad) al ↑ [NADH y/o ATP] por
encima de lo normal se (-) la formación de citrato.
• Isocitrato deshidrogenasa: Es (-) por el NADH y ATP y (+) por el NAD+ y
ADP.
• -cetoglutarato deshidrogenasa: Es (-) por sus productos finales:
Succinil-CoA y el NADH.
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CICLO DEL ÁCIDO
GLIOXÍLICO
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GENERALIDADES
Transición de semilla a plántula:
Cambios fenotípicos durante el 1. Hidratación.
ciclo de vida de una planta: 2. Salida de la raíz primitiva (radícula).
3. Salida de los cotiledones o el tallo
(coléptilo).
4. Enverdecimiento de las hojas: los
cloroplastos.
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En la semilla se almacenan las moléculas de reserva necesarias para
el desarrollo de una planta
Carbohidratos: El contenido de reserva determina el metabolismo
• Almidón. 1rio de la semilla durante la germinación:
• Hemicelulosas.
Lípidos:
Triacilgliceroles.
Proteínas:
Aminoácidos.
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Una vez que la planta emerge del suelo se vuelve
fotosintéticamente activa:
Etapa heterotrófa:
• Metabolismo dependiente de las
reservas de C, N, P… que se
encuentran en ≠ tejidos de la semilla.
• Ocurre la movilización de moléculas
de reserva.
• En la mayoría de las semillas que
contienen lípidos se induce el CICLO
DEL GLIOXILATO.
Etapa autótrofa:
La planta es fotosintéticamete activa.
H A
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CICLO DEL GLIOXILATO (CGx)
Definición:
• Variante o modificación del ciclo de Krebs (CK) que permite
generar Glu a partir de ácidos grasos (AG).
Es un "by-pass" de las etapas descarboxilantes: El CGx "evita" las 2 Rx de
descarboxilación del CK se conservan los 2 C en forma de Glioxilato.
* En el CK se pierden (como CO2) los C equivalentes (que entraron como Acetil-CoA)
provenientes de la β-Oxidación en el CK no es posible sintetizar Glu a partir de AG.
• Vía metabolica por la cual 2 acetil-CoA se convierten en 1 succinato,
teniendo como un intermediario al glioxilato.
Ocurre en los glioxisomas de la mayoría de plantas, hongos y protozoos.
* No ocurre en animales superiores ya que carecen de las 2 enzimas clave de la vía: no
sintetizan oxaloacetato desde el acetil-CoA no convierten AG en Glu.
Importancia:
• En semillas (mayor parte de energía usada para su desarrollo está como triacilgliceroles)
permite formar Glu a partir de AG o el acetato (en forma de Acetil-CoA).
• Células vegetales y las de algunos microorganismos sintetizan CHOs a partir de grasas.
• Succinato → oxalacetato → Gluconeogénesis → Glu → Sacarosa.
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Reacciones bioquímicas:
1) Acetil-CoA (procedente de la oxidación de AG) reacciona con el oxalacetato,
formando citrato: (la misma Rx 1 del CK)
Citrato sintasa*
Acetil-CoA + Oxalacetato Citrato
2) Citrato forma isocitrato por acción de la E aconitasa*: (la misma Rx 2 del CK)
Aconitasa*
Citrato → Cis-aconitato Isocitrato
3) Isocitrato (C6) se fragmenta en glioxilato (C2) y succinato (C4): (Rx única)
Isocitrato liasa
Isocitrato Glioxilato + Succinato
4a) Succinato es metabolizado en forma ≈ que en el CK a fumarato y luego a malato:
Succinato Succinato DH Fumarato Fumarasa Malato
4b) Acetil-CoA transfiere un acetilo al glioxilato produciendo malato: (Rx única)
Glioxilato + Acetil-CoA Malato sintasa* Malato
5) Malato se deshidrogena para formar nuevamente oxalacetato:
Malato DH
Malato Oxalacetato
El oxalacetato es capaz de generar Glu mediante gluconeogénesis.
*
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Ciclo del glioxilato: En c/vuelta del ciclo se utilizan 2 acetil-CoA y 1 succinato.
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Si no se encuentran
las Es claves del
CGx los AG se
oxidan vía el CK y la
fosforilación oxidativa
hasta CO2 y H2O.
Malato Isocitrato
sintetasa liasa
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REGULACIÓN / CONTROL DEL CGx
Actividad del CGx durante la germinación y post-germinación: Se regula
a nivel transcripcional.
Transición del metabolismo heterotrófico → fotoautotrófico
GerminaciónPostgerminación
Heterotrófico
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CADENA RESPIRATORIA
(CADENA DE TRANSPORTE
DE ELECTRONES)
FOSFORILACIÓN OXIDATIVA
(SÍNTESIS DE ATP)
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GENERALIDADES
OXIDACIÓN REDUCCIÓN
• Ganancia de oxígeno • Pérdida de oxígeno
• Pérdida de electrones (e–) • Ganancia de electrones (e–)
• Pérdida de hidrógeno (H+) • Ganancia de hidrógeno (H+)
Este principio de óxido- reducción (REDOX) se aplica a los sistemas
bioquímicos, en los procesos por el cual las células obtienen energía (ATP)
REACCIONES REDOX
Oxidorreductasas: Catalizan reacciones redox.
Oxidorreductasa
Ared + Box Aox + Bred
A: Reductor o dador de e-; en el curso de la Rx se oxida (pierde e- )
B: Oxidante o aceptor de e-; en el curso de la reacción se reduce (gana e-)
En las Rx redox, siempre están presentes a la vez el aceptor y el dador de e-.
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• Las Rx redox son fuertemente exergónicas. Energía se libera en forma
fraccionada, no en forma brusca la célula aprovecha la mayor parte
de energía.
*
*: Acopla la CR a la síntesis de ATP. 32
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Prof. E. Marino Olivares de la Cruz Bioquímica Agrícola
Reacciones que proveen de NADH+H+ a la CR
• Reacción de la piruvato deshidrogenasa:
Complejo piruvato
DH (E1 + E2 + E3)
H3C-CO-COOH + CoA-SH + NAD+ H3C-CO~S-CoA + CO2 + NADH+H+
(Piruvato) (Acetil-CoA)
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INHIBICION DE LA CR Y LA SÍNTESIS DE ATP
• Inhibidores del transporte de e–: (-) solamente el transporte de e–.
• Inhibidores de la fosforilación: (-) síntesis de ATP e indirectamente el transporte de e–
Oligomicina: (-) el flujo de H+ a través de F0 (-) la fosforilación: se (-) la síntesis de ATP.
- Se acumulan H+ y se produce una fuerza inversa deteniéndose el transporte de e–.
Desacoplantes: Desacoplan la CR (flujo de e–) de la fosforilación oxidativa al actuar como
ionóforos / al eliminar el gradiente de H+ (-) la síntesis de ATP, pero no bloquean el flujo o
transporte de e–.
- 2,3-dinitrofenol (DNF):
Transfiere H+ desde el lado
externo hacia la matriz y
anula el gradiente de H+
creado por la CR.
• Inhibidores de la
translocasa: (-) la
entrada de ADP y la
salida de ATP desde
la mitocondria. 41
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Azida
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Sistemas de lanzaderas
¿Qué son?
Permiten la oxidación del NADH citosólico su energía es usada en la
CR y en la síntesis de ATP.
Tipos:
• Lanzadera de malato-
aspartato.
• Lanzadera glicerol-3-
fosfato.
Surgen de la necesidad de
recuperar el NAD+
citosólico, dado que la
MMI es impermeable a
este compuesto
Fosforilación
28 ATP
(lanzadera
M-A)
ó
26 ATP
(lanzadera
G-3-P)
26
ó 28 ATP
30 ó 32 ATP
(Total)
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Cuadro 07: Balance energético general en la oxidación total de una molécula de
glucosa. Rendimiento de ATP (Generación de ATP). (Modelo actual)
Ciclo de Krebs:
• Oxidación de 6 NADH+H+ 15 ATP -- 15 ATP
en la cadena respiratoria.
• Oxidación de 2 FADH2 en 3 ATP -- 3 ATP
la cadena respiratoria.
• A nivel de sustrato. 2 GTP** -- 2 ATP**
TOTAL 34 ATP 2 ATP 32 ATP*
* Considerando la vía de la lanzadera del malato-aspartato. Si se sigue la vía de la
lanzadera del glicerol-3-fosfato serían solamente 30 ATP.
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MUCHAS GRACIAS
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