TEMA 4: El flujo de la información genética

1. La estructura de los genes eucariotas

2. Empaquetamiento del genoma eucariota
3. Replicación del DNA
4. Transcripción: síntesis del RNA
5. Traducción: síntesis de proteínas

1. La estructura de los genes eucariotas

La cantidad de DNA que presenta los cromosomas es diferente. Los organismos más sencillos (las bacterias)
van a presentar un genoma más reducido que el eucariota. El tamaño de los genomas se relaciona con la
complejidad de los organismos. Los organismos más sencillos tienen el genoma más sencillo.
Cuando comparamos organismos que tiene la misma complejidad, el tamaño del genoma se relaciona con la
complejidad del organismo con el número de genes. La levadura tiene un genoma más pequeño que los
organismos eucariotas pluricelulares (animales, plantas).
COMPLEJIDAD
ORGANISMOS EUCARIOTAS PLURICELULARES >EUCARIOTAS UNICELULARES >PROCARIOTAS UNICELULARES.
Cuando comparamos organismos que tienen una complejidad similar, el tamaño del genoma no se relaciona
con la complejidad del organismo. Por ejemplo un lirio (más genoma que el ser humano), una salamandra o
el ser humano (eucariotas pluricelulares). Para compararse entre ellos, se diferencian en su número de genes
y no en el tamaño del genoma.

2. Empaquetamiento del genoma eucariota

Son segmentos de DNA que codifican un producto génico (puede ser una proteína, RNAtransferente,
RNAribosómico).
Los genes eucariotas están formados por dos tipos de secuencias:
Unas codifican producto génico (EXONES) Otras que no codifican producto génico
(INTRONES)
En la expresión génica
1º etapa: (transcripcion) El gen se va a transcribir y se va a formar una molécula de RNAmensajero (si el
producto génico es una proteína) inmadura recibe el nombre de transcrito primario. Contiene las secuencias
de los intrones. Durante la maduración del transcrito primario, esos intrones son eliminados (esa eliminación
se denomina splicing). Empalmándose los exones dando lugar al RNAmensajero maduro.
Un gen humano típico contiene como promedio 10 exones, suman un total de 4300 pares de bases. Un 10 %
del tamaño del gen. El otro 90 % son intrones.
Dentro de esos exones (7%) vamos a encontrar partes que no codifican proteína (regiones 5’UTR y 3’UTR sin
traducir)
En conclusión un gen humano típico solo tiene un 3% de sus secuencias que codifican proteínas.
¿Para qué sirven los intrones? Tienen dos funciones principales:
En los intrones se localizan secuencias que regulan la expresión de los genes (fundamental durante el
desarrollo de los organismos pluricelulares).
Se encuentran secuencias que permiten el splicing alternativo (permite que a partir de un transcrito primero
de RNA se forme diferentes moléculas de RNAmensajero maduro). Y estas moléculas RNA mensajero cuando
se traducen según la etapa de la expresión de los genes cuando se traducen dan lugar a diferentes proteínas.
La mayoría de los genes humanos presentan splicing alternativo y pueden formar de promedio 6 moleculas
de RNAmensajero maduras diferentes que darán lugar a 4 proteínas distintas. 20000 genes eucariotas
producen 80000 proteínas.
Una célula eucariota humana contiene en su núcleo 2m de DNA, esos metros tienen que entrar en un núcleo
que apenas tiene entre 10-15 micras de diámetro.
El DNA tiene que empaquetarse para entrar en el núcleo.
1º nivel de empaquetamiento (fibra de 10 nanómetros o collar de perlas): El
DNA da 2 vueltas alrededor de un octamero de histonas, ese octamero de
histonas está formado por 2 histonas H2A, 2 histonas H2B, 2 histonas H3 y 2
histonas H4. El complejo formado por DNA (las dos vueltas) y el octamero de
histonas se denomina nucleosoma. Existe otra histona adicional (H1) que se va
a localizar en el DNA espacionador entre nucleosomas. Con este
empaquetamiento se reduce su longitud 6 veces.
2º nivel de empaquetamiento: Los nucleosomas se acomodan formando una
especie de hélice proceso en el que juega un papel muy importante la histona
H1. Se obtiene una fibra o solenoide de 30 nanómetros de espesor con el DNA
densamente empaquetado con las proteínas histónicas.
3º nivel de empaquetamiento: Recibe el nombre de fibra de 80 nanómetros. La
fibra de 30 nm se dispone formando radiales alrededor de un conjunto de
proteínas no histónicas.
4º nivel de empaquetamiento: Es cuando se forma el cromosoma metafásico.
Se reduce el DNA.

3. Replicación del DNA

Es un proceso que permite que el DNA bicatenario antiparalelo puede replicarse dando lugar a dos hebras
fijas exactamente entre sí, e iguales a la molécula progenitora.
El modelo que explica cómo se lleva a cabo esta replicación se
llama modelo conservativo. En este modelo cada molécula hija
tiene una hebra de DNA antigua y otra hebra de síntesis se inicia
en las regiones del DNA denominado orígenes de replicación.
Las bacterias solo tienen 1 y las eucariotas muchos orígenes de
replicación. Para asegurar que la replicación de DNA se lleve en
un tiempo adecuado a los orígenes de replicación el DNA se va
a separar las dos hebras, esa área se llama burbuja de replicación, Este tiene 2 horquillas de aplicación a cada
extremo.
Presenta una enzima clave que es la DNA polimerasa. Estas poseen 2 características.
1º no es capaz de iniciar la replicación si no hay un extremo 3’-OH necesita un cebador que le proporciona
3’OH. Ese cebador le proporciona la primasa.
2º tiene actividad polimerasa añade nuevos nucleótidos al extremo 5’-3’
Las hebras se han desarrollado una de las hebras sigue teniendo el
extremo 3 libre por la que es una hebra continua. La otra hebra es
retrasada. Estos fragmentos se denominan Okazaki. La lleva acabo el DNA
polimerasa (I). Es la DNA polimerasa I es la que se encarga de eliminar los
cebadores porque tiene actividad contraria (actividad
exonucleasa).Elimina cebadores y en su lugar tiene exonucleasa 3’-5’ y
polimerasa 5-3’. Los huecos que quedan los rellena de DNA. (EN BACTERIAS).

La DNA polimerasa II corrige los errores. Es extrema donde es precisa, se comete

muy pocos errores. En las células eucariotas es el mismo proceso con algunas
diferencias:

Tiene muchos orígenes de replicación y aparece el DNA polimerasa  y 

Van a participar otras proteínas antígenas nucleares en PCNA. Estos antígenos
nucleares tienen forma de anillo y se van a unir al DNA en la región donde el
cebador está unido al DNA.
Las proteínas se van a unir a la hebra sencilla y evita que el DNA monocatenario
vuelva a asociarse antes de ser replicado
Cuando un cromosoma lineal se replica y posteriormente los cebadores son eliminados por
la DNA polimerasa I aquellos cebadores que se ubican en los extremos 5’ no van a poder
ser rellenados por DNA, el resto sí. Esto provoca que cada vez que se divide y se replica un
cromosoma lineal se pierda secuencia por los extremos (se denominan telómeros).
Al principio no sucede nada porque en los telómeros de los cromosomas no hay gen pero
tras 40 o 50 divisiones la información que se pierde de estos telómeros empieza a afectar
a secuencias que codifican productos génicos. Cuando eso sucede la célula va a entrar en
apoptosis (muerte celular).
Solo hay dos tipos celulares que no tienen este problema, células germinales y tumorales.
Las células germinales y tumorales se dividen muchas veces y no les pasa nada porque están destinadas a
dividirse muchas veces y sus telomeros no se acortarán porque tienen una enzima (telomerasa, que se encarga
de rellenar los huecos de los telómeros).
4. Transcripción: síntesis del RNA
Es la primera etapa de la expresión génica. Es el proceso mediante el cual
la hebra molde de un gen se va a copiar a RNA. (La otra hebra se denomina
codificante)
5’ CTCATGCTCAT 3’
3’ GAGTACGAGTA 5’  LA HEBRA MOLDE
5’ CUCAUGCUCAU 3’  RNA
En esta etapa juega un papel fundamental las RNA polimerasas, guardan
semejanzas y diferencias con las DNA polimerasas.
Semejanzas:
RNA polimerasas sintetizan una cadena de RNA utilizando la hebra molde de DNA añadiendo nucleótidos al
extremo 3’ de la cadena RNA naciente. Tienen actividad polimerasa, con lo cual 5’-3’.
Las DNA polimerasa sintetizaban una hebra de DNA añadiendo nucleótidos al extremo 3’
Diferencias:
Las RNA polimerasas utilizan ribonucleótidos trifosfato para sintetizar el RNA
Las DNA polimerasas utilizan desoxiribonucleótidos trifosfato para sintentizar el DNA
Las DNA polimerasas no podían iniciar la síntesis de nuevo, necesitan un cebador
Las RNA polimerasas no necesitan cebadores

EN BACTERIAS:
La RNA polimerasa es un complejo multiproteico formado por 6
subunidades 2 alfa, 2 beta, 1 omega y 1 delta.
La delta se une con menos fuerza al complejo y juega un papel
fundamental identificando cual es el primer nucleótido del gen
que se va a transcribir (ese nucleótido es el nucleótido+1).

Para ello la subunidad delta pueda reconocer cual es el primer nucleótido que se va
a transcribir del gen, antes del gen formando parte del gen pero antes del primer
nucleótido los genes poseen una región promotora, en la que aparecen siempre en
bacterias dos secuencias consenso; la primera secuencia consenso 10 nucleótidos
antes del inicio de la transcripción es la secuencia TATAAT y la segunda secuencia
consenso es la secuencia TTGACA 35 nucleótidos antes de transcribirse.
Todos los genes bacterianos tienen en su secuencia promotora que no se transcribe
y dos secuencias consenso
La subunidad delta reconocerá las secuencias consenso y sabrá que a partir de los x
nucleótidos tendrá que empezar a transcribir.
Una vez realizado eso la subunidad delta lo que hará será desenrollar la RNA
polimerasa desnaturaliza el DNA, separa las dos hebras de DNA y forma una burbuja
de transcripción. Y se inicia la transcripción y la subunidad delta abandona la RNA polimerasa.

Ahora la RNA polimerasa avanzará leyendo la hebra molde sintetizando la cadena de RNA complementaria
(se llama esta etapa elongación) hasta que encuentre secuencias de terminación de la transcripción.
Esas secuencias de terminación de la transcripción pueden ser
secuencias complementarias intercaladas por una región no
complementaria.
Cuando se transcribe la secuencia de terminación de la transcripción se
va a formar un RNA que tiene una parte que es complementaria a la otra
parte. Cuando se juntan esas dos secuencias complementarias se forma
la horquilla y hace que el RNA abandone la RNA polimerasa termina la
transcripción. Esta secuencia puede ser complementaria intercalada por una región no complementaria. En
las células son más complejas.
5. Traducción: síntesis de proteínas
Es la 2º etapa de la expresión génica de los genes que codifican proteínas.
Se lleva a cabo en los ribosomas. Los ribosomas están formados por dos subunidades grande y pequeña que
están formados por RNA ribosómico y proteínas. Los ribosomas procariotas son muy parecidos a los eucariotas
con la única diferencia de que son un poco más pequeños.
COMPOSICIÓN DE LOS RIBOSOMAS PROCARIOTA
SUBUNIDAD GRANDE: encontramos dos RNA ribosómicos 23S
(cataliza el enlace peptídico una ribozima, peptidil transferasa,
une a los aminoácidos durante la traducción) y 5S, encontramos
proteínas.
SUBUNIDAD PEQUEÑA: encontramos un RNA ribosómico 16S
(permite que se inicie de manera adecuada la traducción,
responsable de que el codón de inicio AUG se sitúe en el sitio P
del ribosoma) y proteínas.
En las células eucariotas el ribosoma es un poco más grande, está formado por dos subunidades:
SUBUNIDAD GRANDE: encontramos 3 RNA ribosómicos 28S (cataliza el enlace peptído), 5,8S y 5S y proteínas.
SUBUNIDAD PEQUEÑA: encontramos un RNA ribosómico el 18S
Cuando las dos unidades se encuentran unidas se encuentras 3 sitios donde se encuentra el RNA transferente
que son los sitios E, P, A.
En la traducción además de los rna ribosómicos que forman parte de los ribosomas van a participar rna
transferentes que poseen un triplete que recibe el nombre de anticodon complementario a otro triplete que
se localiza en el rna mensajero que se llama codón, estos rna transferentes pueden incorporar por su extremo
3’ un aminoácidos. La enima encargada de unir un aminoácido a este 3’ se llama aminoacil-tRNA sintetasa esta
enzima incorpora a este extremo 3’ dependiendo del anticodon que presente esta molécula.L a molécula que
se forma recibe el nombre de aminoacil trna. La traducción por lo tanto es el proceso que determina en el
interior del ribosoma sintetizar proteínas apartir de una información
contenida en un RNAmensajero.
Los ARN mensajeros en las bacterias son policistrónicos porque tienen
multiples sitios de inicio de la traducción dando lugar a múltiples
proteínas mientras que los RNAmensajeros en las eucariotas son
monocistrónicos es decir que solo tiene un lugar de iniciación dando
lugar a una sola proteína.

TRADUCCIÓN EN BACTERIAS (mismo proceso que en las células

eucariotas)
Distinguimos 3 etapas:
Iniciación, elongación y terminación
1ºINICIACIÓN:
La subunidad pequeña del ribosoma bacteriano se une al ARNmensajero y va a ubicar el hueco P de su
subunidad en el codón de iniciación AUG.
La subunidad pequeña se une al ARNmensajero, porque contiene un ARNribosómico 16S, que a su vez es
complementario a una secuencia que aparece antes del codón de inicio y se denomina secuencia de shine-
dalgarno, la poseen todos los RNAmensajero bacteriano.
Se une el primer aminoacil-tRNA que corta el primer aminoácido
(metionina modificada), para que entre el primer aminoacil-tRNA
necesita la ayuda de proteínas que son los factores de iniciación
(IF). IF2: colabora para que entre el primer aminoacil-tRNA al sitio
P.
Además del IF2, participan el IF1 (situado en el sitio A, bloquea
que algún aminoacil-tRNA entre antes de tiempo), IF3 (situado
en el sitio E, evita que se una la subunidad grande antes de tiempo)
Cuando la subunidad pequeña del ribosoma se ha unido correctamente al RNAmensajero y el codón de inicio
está ubicado en el sitio P, cuando el primer aminoacil-tRNA que incorpora metionina se ha unido al primer
codón los IF3, IF1 y IF2 abandonan el complejo. La iniciación ha concluido y la subunidad grande del ribosoma
se unirá.
2ºELONGACIÓN:
Dependiendo de cual sea el 2º codón entrara un segundo aminoacil-tRNA con su anticodon complementario.
En la entrada de este segundo aminoacil-tRNA van a participar
factores de elongación. A continuación las moléculas de
RNAribosómico 23S es la encargada de unir los dos
aminoácidos, forman el enlace peptídico. Como resultado de la
formación del enlace peptídico los dos aminoácidos pasan a
estar unidos y unidos al RNAtransferente del sitio A.
Mientras que el RNAtransferente que portaba el primer
aminoácido y que estaba ubicado en el sitio P pasa a estar
desnudo.
En el sitio A se encuentra un dipeptidil-tRNA y en el sitio P un RNAtranferente desnudo.
A continuación tiene lugar la translocación, el ribosoma avanza 3 nucleótidos, avanza un codo moviéndose
hacia el extremo 3’ del RNAmensajero.
Con el resultado de la translocación el dipeptidil-tRNA que ocupaba el sitio A pasa a estar ubicado en el sitio
P, el RNAtransferente que ocupaba el sitio P pasa a estar ubicado al sitio E que terminará abandonado el
ribosoma, y aparece un nuevo codón en el sitio A.
3ºTERMINACIÓN
Y la translocación avanzara a medida que pase el tiempo
hasta que el sitio A aparezca un codón de terminación y en
el sitio A no entrará un aminoacil-tRNA, sino que entrará un
factor de liberación, una proteína que provoca que la
proteína que se está sintetizando salga del ribosoma.