TEMA 8: REGULACIÓN DE LA EXPRESIÓN GÉNICA EN VIRUS

1. Regulación del ciclo lítico o lisogénico de un virus

Tanto el ciclo lítico y el lisogénico (con fase “durmiente”):

1- Introducción del material genético del gafo a la célula hospedadora

2- Usando la maquinaria transcripcional de la célula duplicarán su material genético.

En el lisogénico la bacteria (célula hospedadora) incorpora el DNA del fago “dormido”, la

bacteria hará vida normal y puede ser inmune a la infección de otros fagos, hasta que gracias a
una señal vuelve al ciclo lítico.

Cambian la maquinaria transcripcional de la célula hospedadora o bacteria. El proceso de

traducción se produce de la misma manera, pero con la información genética del fago.

2. La vida lítica en fagos: características generales

- La transcripción del hospedador es modificada para que se expresen mayoritariamente
los genes del fago.
- La traducción del hospedador No es modificada, el fago va a usar la maquinaria del
hospedador.
- Se caracterizan dos etapas de infección: la temprana (hasta la replicación) y la tardía
(hasta el lisado).

2.1. Fases del ciclo lítico

Fase temprana: participan enzimas de síntesis de DNA, recombinasas…

Fase tardía: encontramos los componentes estructurales del virus.

2.2. Cascada de señales

FASE LÍTICA se produce gracias a una cascada de señales consecutivas:

1- El fago penetra en la célula hospedadora e inserta su DNA o material genético.

2- En la fase temprana se producen enzimas relacionadas con la síntesis de DNA
3- Comienza la replicación del ADN fago
4- Fase tardía sintetizan proteínas estructurales del fago (cabeza y cola) y se ensamblan.
5- Se produce la apoptosis de la célula hospedadora, rompiendo su membrana
plasmática (de la bacteria) y los fagos ya ensamblados salen para volver a penetrar en
células vecinas.

CASCADA DE SEÑALES:

1º FASE: Se expresan genes codificantes para factores sigma o antiterminación y para ello
necesitan los promotores del ADN bacteriano para que la ADN polimerasa bacteriana
identifique ese gen, iniciado con el promotor bacteriano, como bacteriano y lo codifique.

2º FASE: El objetivo es obtener promotores modificados o el inicial para poder codificar

nuevos factores sigma (estructurales), enzimas de replicación y factores de
antiterminación.

Obtendríamos enzimas para la producción de replicas de DNA del fago.

 3º FASE: El promotor modificado con un factor de antiterminación hace que no haya factor
de terminación y se sigan transcribiendo genes estructurales del fago hasta la siguiente
señal de terminación.

Codifica componentes estructurales del fago

EN CADA GRUPO DE GENES SE EXPRESA UN REGULADOR REQUERIDO PARA EL SIGUENTE

GRUPO (CONTROLES SUCESIVOS)

2.3. Control por factor sigma o antiterminación

EL FACTOR SIGMA: reconoce o identifica al promotor (regulador) al que se engancha o une la
ADN polimerasa. Los genes se expresan por fases.

EL FACTOR ANTITERMINACIÓN: Se une la ARN polimerasa e impide que se pase la replicación

en ese terminador, permite que continua con la elongación hasta el siguiente sin factor de
antiterminación. Se usa cuando se require que los genes se sigan expresando, puede expresar
tanto los primeros como los segundos.

El control sigma es un mecanismo de control de la transcripción en el que la subunidad sigma de la RNA polimerasa
reconoce y se une a secuencias específicas de ADN, conocidos como promotores, para iniciar la transcripción de un
gen en ARN. En las bacterias, existen diferentes subunidades sigma que se unen a promotores específicos en
respuesta a señales ambientales y regulan la expresión de los genes en consecuencia.

La antiterminación, por otro lado, es un mecanismo de control de la transcripción en el que un factor de

antiterminación, como el factor N en las bacterias, se une a la RNA polimerasa durante la elongación de la
transcripción y previene la terminación prematura de la transcripción en determinados genes. Esto permite que los
genes se transcriban en su totalidad y produzcan ARN funcional.

En resumen, el control sigma es un mecanismo que regula el inicio de la transcripción, mientras que la
antiterminación es un mecanismo que regula la elongación de la transcripción. Ambos mecanismos son importantes
para la regulación precisa de la expresión génica en las células.

3. Fago Lamba. Genoma y control de la cascada

El fago lambda es un virus que infecta a la bacteria Escherichia coli y tiene un ciclo de vida que
puede incluir tanto una fase lítica como una fase lisogénica.

En la fase lítica, el fago lambda entra en la célula bacteriana y utiliza la maquinaria celular para
replicar su ADN y producir nuevas partículas virales. Al final del ciclo, la célula bacteriana se lisa
o se rompe, liberando los nuevos virus en el entorno.

En la fase lisogénica, el ADN del fago se integra en el genoma de la célula hospedadora y

permanece latente hasta que se produce un estímulo que desencadena su activación y la
entrada del ciclo lítico. Durante la fase lisogénica, el fago no produce nuevas partículas virales
y la célula hospedadora no se rompe.

Tiene un “inicio de transcripción” con dos promotores en sentidos opuestos para los IEG*: N y
cro.

*Los IEG (por sus siglas en inglés "Immediate Early Genes") son genes que se expresan
rápidamente y de manera transitoria en respuesta a un estímulo extracelular. Estos genes se
denominan "tempranos" porque su expresión ocurre rápidamente después de la exposición al
estímulo, en cuestión de minutos, y "inmediatos" porque no requiere la síntesis previa de
proteínas para su activación. Los IEG son importantes en la respuesta celular a una amplia
variedad de estímulos, incluyendo señales químicas, cambios ambientales y estrés celular. La
expresión de estos genes puede activar o reprimir otros genes, lo que puede dar lugar a una
variedad de respuestas celulares, como la proliferación celular, la diferenciación celular, la
apoptosis (muerte celular programada) y la respuesta inmunitaria.

La proteína que codifica N (pN) es un antiterminador que permite que continúe la

transcripción a los DEG.

Los genes tardíos usan el antiterminador pQ (codificado por el gen Q) para poder continuar (su
promotor Pr es válido durante todo el ciclo, pero el producto es muy pequeño).

3.1. Lisogenia
Este represor también expresa la aparición de inmunidad frente a otros fagos cuando hay
lisogenia. Si otro fago infecta el hospedador, el represor se unirá a la región OI/Or e impedirá
la transcripción (si la secuencia es similar). Si se meten fagos nuevos, la proteína CI se une a la
región de inmunidad impidiendo su replicación (siempre que el promotor del virus sea
parecido).

La ARN polimerasa reconoce las regiones Pr y PL y transcribe, a partir de ahí, los genes
concretos N y cro hasta el terminador. El gen N dará lugar a proteínas que se unirán al
terminador para inhibirlo (proteínas antiterminador) y seguir transcribiendo.

La Pr y PL poseen la región de control que se une a l represor transcripcional CI para que el

promotor no funcione y no se expresen. Regulamos el CI para que se regulen los promotores
Prm y Pre = bucle de retroalimentación positiva: la proteína CI provoca que se produzca más
copias del gen que la expresa.

La Pr y PL al transcribir se encuentran con el represor y lo transcriben (CI), esta proteína se

unirá a la regiones PL/OL y Pr/Or y dejará de transcribir = el fago entra en lisogénia.

El ciclo lisogénico es autoregulatorio (la proteína es necesaria para la transcripción de su

propio gen).

Paradoja: ¿Cómo se establece lisogénia en un primer momento? El fago lambda no dispara

siempre por defecto el ciclo lisogénico, ¿Cómo se produce?
Necesitamos el producto (proteína CI) para generar ese producto o activar la proteína. Para
ello usamos otro gen CII capaz de activar la ARN polimerasa y producir CI; no desde el
promotor, sino desde el Pre.

PASAR DE LISOGÉNICO A LÍTICO FORMAS:

La inducción (paso de lisogénico a lítico) sucede por la rotura (UV) de los monómeros del
represor. Se pierde capacidad de unión al DNA. Si se pierde el regresor CI: si se rompen los
monómeros de las cadenas, bajan los niveles de transcripción de la CI por lo que se produce
una inhibición de los factores de regulación del CI, reactivando la transcripción de los genes.
 3.2. Lisis
Cro expresa un represor similar a Ci que inhibe Prm (Cl) y también Pl/Pr (para la respuesta
inmediata y solo deja la respuesta tardía).

El proceso de lisis se desencadena cuando la cantidad de partículas virales producidas es tan

grande que la célula no puede contenerlas y se rompe. Durante la lisis, se liberan enzimas
lisosómicas y otros contenidos celulares que pueden ser dañinos para las células cercanas y
contribuir a la propagación del virus.

La lisis del fago lambda puede ser inducida experimentalmente mediante la adición de
sustancias químicas como el cloruro de sodio (NaCl) o la mitomicina C, que dañan el ADN del
fago y provocan la liberación de partículas virales en el entorno. Este proceso se utiliza
normalmente en la investigación molecular para obtener grandes cantidades de virus para su
estudio.

3.3. Balance
El balance entre Cro y cI (ambos se expresan en delayed early stage, etapa temprana
retrasada) determinará lisis o lisogenia [fundamentalmente la expresión de cII]

El equilibrio entre los factores de transcripción Cro y Cl (línea clara) es un aspecto importante
del control de la fase lítica y lisogénica en el ciclo de vida del fago lambda.

Durante la fase lisogénica, el factor de transcripción Cl se une al ADN del fago y reprime la
expresión de los genes virales que son necesarios para la entrada en la fase lítica. Esto permite
que el ADN viral se integre en el genoma de la célula hospedadora y permanezca inactivo hasta
que se produzca un estímulo que desencadene su activación.

Por otro lado, durante la fase lítica, el factor de transcripción Cro se une al ADN viral y
reemplaza a Cl como el principal regulador de la transcripción de los genes virales. Cro activa la
expresión de los genes necesarios para la replicación del ADN del fago y la producción de
nuevas partículas virales, lo que finalmente conduce a la lisis de la célula hospedadora.

El equilibrio entre Cl y Cro está regulado por una serie de mecanismos de realimentación
positiva y negativa que garantizan que la transición de la fase lisogénica a la fase lítica se
produce solo en las condiciones adecuadas. Cuando hay una cantidad baja de Cro en la célula,
Cl puede unirse al ADN del fago y reprimir la expresión de los genes necesarios para la lisis. Sin
embargo, cuando la cantidad de Cro aumenta, puede unirse al ADN y activar la expresión de
los genes líticos.

En resumen, el equilibrio entre los factores de transcripción Cro y Cl es importante para el

control del ciclo de vida del fago lambda y para la transición adecuada entre la fase lisogénica y
la fase lítica.

4. ¿Qué sucede cuándo hay múltiples infecciones al mismo tiempo?

Cuando una célula está infectada con múltiples virus al mismo tiempo, puede resultar una
competencia entre los virus por los recursos celulares necesarios para su replicación y
propagación.
En algunos casos, la presencia de múltiples virus puede llevar a la producción de partículas
virales híbridas, que contienen información genética de ambos virus y pueden tener
características únicas.

Además, la infección simultánea de una célula con múltiples virus puede tener un impacto en
la evolución y la selección natural de los virus. En algunas situaciones, los virus pueden
intercambiar información genética a través de la recombinación, lo que puede dar lugar a
nuevos virus con características diferentes a las de los virus originales. En otros casos, los virus
pueden coexistir y complementarse entre sí, lo que puede llevar a una mayor diversidad y
complejidad en la comunidad viral.

En general, la interacción entre múltiples virus durante una infección depende de una serie de
factores, incluyendo la especificidad del huésped, la carga viral y las características biológicas y
genéticas de los virus individuales. La comprensión de estos procesos puede ser importante
para el desarrollo de nuevas estrategias de prevención y tratamiento de enfermedades virales.

La infección con múltiples copias del mismo virus puede aumentar la cantidad de virus dentro
de la célula y acelerar el proceso de replicación viral, pero la respuesta inmune de la célula
también puede verse afectada por la cantidad de virus presente. La comprension de estos
procesos es importante para el desarrollo de nuevas estrategias de prevencion y tratamiento
de enfermedades virales