tp2 Microbiologie Du Sol Mme Ghanem
tp2 Microbiologie Du Sol Mme Ghanem
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M1 EDP
1- Introduction
Les organismes vivants du sol sont des bactéries, des champignons, des algues, les parties
souterraines des plantes ainsi que des animaux très variés. Tous participent d'une manière ou d'une
autre à la formation et à l'évolution de sol (Gobat et al, 2003).
Bactéries, actinomycètes, champignons et algues, sont les micro-organismes qui entrent dans la
composition des microbiocénoses de presque la plupart des sols.
Les techniques utilisées aux laboratoires pour l’étude de des micro-organismes du sol
sont globalement dans le but
du dénombrement
d’identification et taxonomie des groupements fonctionnels
L'estimation de la masse microbienne est indispensable pour étudier les flux dans le sol de
certains éléments tels que le carbone et l'azote. Or, la plupart des techniques actuellement
disponibles ne peuvent donner des valeurs absolues et des résultats fiables.
Les dynamiques microbiennes peuvent aussi être appréhendées par dénombrement des
bactéries par deux grands types de méthodes.
La première consiste en un comptage indirect sur des milieux de culture.
La seconde méthode consiste en un comptage direct par observation au microscope.
Parmi les méthodes de dénombrement indirectes, les deux méthodes les plus utilisées sont
la méthode standard de culture sur boîte de pétri est la technique de dénombrement dite
«Technique du nombre le plus probable» (MPN). Cette dernière est très utilisée car elle permet
l'estimation des populations bactériennes ayant des fonctionnalités données comme la
dénitrification.
La technique utilisée pour la numération des germes tellurique comprend plusieurs étapes allant de
la préparation de la suspension dilutions jusqu'à l'interprétation des résultats.
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