Épidemiologie بهى (Enregistrement Automatique) (Enregistrement Automatique)
Épidemiologie بهى (Enregistrement Automatique) (Enregistrement Automatique)
Épidemiologie بهى (Enregistrement Automatique) (Enregistrement Automatique)
Docteur EPIDEMIOLOGIE
en Ecologie et Environnement
M. ABOUFARAS
• Mesures d’association
Epidémiologie • Enquête épidémiologique (les types d’enquête)
analytique
• Surveillance épidémiologique
• - Maladies à déclaration obligatoire
Surveillance
épidémiologiqu • - Contrôle sanitaire aux frontière
e et mesures de
prévention
• Activités et mesures de prévention
5
Qu’est-ce que l’épidémiologie ?
◦ Un terme ambigu, au sens variés, dont la définition n’a cessé de changer au
cours de l’histoire.
◦ À l'époque d'Hippocrate: tout événement affectant une
communauté humaine : désastres, cataclysmes naturels, guerres.
◦ Peu à peu: sens limité aux phénomènes pathologiques.
◦ À l'ère de Pasteur (découvertes en microbiologie): l'épidémiologie
↔ maladies infectieuses.
et depuis : l'épidémiologie est souvent comprise comme étant
l'étude des épidémies
EPIDEMIOLOGIE
Définition
◦ Une science multidisciplinaire, aux contours
incertains, exercée par des spécialistes de tous bords
(médecins, vétérinaires, pharmaciens, biologistes, infirmiers, ingénieurs sanitaires,
statisticiens, démographes, géographes, économistes, responsables de santé
publique, etc).
8
La comparaison des taux de morbidité dans plusieurs sous-groupes
de population est devenue une pratique courante à la fin du XIXe
siècle et au début du XXe. Cette approche a d’abord été appliquée à
la lutte contre les maladies transmissibles, mais s’est avérée
efficace pour mettre en évidence une association entre certaines
conditions ou agents environnementaux et des maladies
déterminées.
9
Définition de l’épidémiologie
◦ Par ses trois mots clés, cette définition englobe tous les
principes et les méthodes de la démarche
épidémiologique:
Selon le contexte, un événement de santé désigne une
maladie, une complication d’une maladie, le décès (parfois
un signe mineur ou le simple dépassement d’une valeur
biologique de référence)
Définitions des concepts (1)
Épidémiologie :
◦ C’est une science qui étudie un phénomène morbide :
Sa fréquence
Sa distribution dans le temps et dans l’espace
Ses déterminants
Possibilités de prévention, de contrôle ou d’éradication
Domaine de l’épidémiologie
Étude des états morbides
16
Place de l’épidémiologie en santé
publique
Patient Population
Diagnostic clinique Diagnostic épidémiologique
Patient Individu Communauté ou groupe à risque
Symptômes et histoire Apparition de signes Apparition de nouveaux cas
de la maladie fonctionnels et physiques
Evolution Courbe de température Courbe épidémique
Distribution Nombre et type d'organes Répartition géographique des cas
atteints
Durée incubation Entre l'exposition et le début des Entre l'exposition et l'apparition des
symptômes cas
Voies de transmission Sang, nerfs, cellule à cellule Air, eau, aliments, vecteurs,
personne à personne ...
Analyses Laboratoire, radiologie pour Laboratoire, et analyse
établir la cause de la maladie épidémiologique pour établir la
cause de l'épidémie
Objectif Guérir le malade Arrêter l'épidémie
18
Épidémiologie et santé publique
La santé publique, d’une façon générale, fait référence à des mesures collectives visant
à améliorer la santé de la population. L’épidémiologie qui est un des instruments
permettant d’améliorer la santé publique, a plusieurs types d'applications (Figures
1.3-1.6)
En ce sens, l’épidémiologie est une science médicale fondamentale dont l’objectif est
d’améliorer la santé des populations et plus particulièrement celles qui sont défavorisées.
◦ même si quelques maladies sont uniquement dues à des facteurs génétiques, la
plupart résultent d’une interaction entre facteurs génétiques et environnementaux. Le
diabète, par exemple. On
définira ici l’environnement de façon générale afin
d’englober tous les facteurs biologiques, chimiques,
physiques, psychologiques, économiques ou culturels qui
peuvent avoir un effet sur la santé (voir chapitre 9).
DEMARCHE ET RAISONNEMENT
EPIDEMIOLOGIQUE
Raisonnement épidémiologique
23
Une fois l'association déterminée, il faut évaluer sa validité en
éliminant certaines éventualités possibles :
- L'association pourrait être simplement due au fait du hasard
(chance). D'où l'intérêt des tests de signification statistique pour
exclure cette éventualité.
24
Une fois l'association statistique établie il faut s'assurer qu'il y a une
relation de cause à effet entre le facteur étudié (exposition) et la maladie
(issue).
Ainsi la démarche épidémiologique consiste à mesurer la fréquence d'un
phénomène de santé, telle qu'une maladie, d'en faire la distribution selon
les caractéristiques de personne, de lieu et de temps afin d'émettre des
hypothèses sur les déterminants de cette fréquence. Une fois les
hypothèses vérifiées, des actions appropriées seront menées pour
contrôler voire éliminer le phénomène en question. L'impact des actions,
mises en place, sur la fréquence du phénomène de santé est ensuite
évalué.
La mesure de la fréquence peut se faire que par la surveillance
épidémiologique (qui est la source de données en épidémiologie) ou par
des études épidemiologiques. 25
Démarche épidémiologique
ETAPE
D
FFREQUENCE EXISTE Ensemble des cas PREVALENCE E
Nbe de fois
S
SURVIENT Nouveaux cas INCIDENCE
C
R
QUI? PERSONNE I
P
DISTRIBUTION Répartition: OU? LIEU
3 Caractéristiques T
3 questions I
QUAND? TEMPS
V
E
Pourquoi?? Cette FREQUENCE selon cette DISTRIBUTION??
HYPOTHESE(S)
ETAPE
DETERMINANTS FACTEUR(S) de
RISQUE (Protection)
A
N
MESURE DE RISQUE L’EXPOSITION L’ISSUE
A
MESURE DE L’ASSOCIATION Entre: (Facteurs de risque) (Phénomène de santé)
L
HASARD TESTS STATISTIQUES Y
EVALUER LA VALIDITE de cette T
BIAIS A PREVENIR /DISCUTER I
association
FACTEURS CONFONDANTS A NEUTRALISER Q
U
E
La fréquence La distribution
- Prévalence ? - Qui ? (personne)
- Où ? (lieu)
- Incidence ?
- Quand ? (temps)
Pourquoi ?
Les déterminants ?
Hypothèses sur les facteurs
(de risque ou de protection)
Etudes épidémiologique
‘’Tester’’ les hypothèses
DEMARCHE EPIDEMIOLOGIQUE
Etudes épidémiologique
- Collecte des données
- Analyse des données
Association statistique ? (entre événement et facteurs)
Validité de l’association ?
(Hasard ? Biais ? Facteurs de confusion ?)
Critères de causalité ? (relation de cause à effet)
A
Proportion= x100
A+B
34
3- Taux
C'est une forme particulière de proportion qui renferme la notion de
temps. Il exprime la vitesse de changement d'un phénomène dans le
temps.
◦ TL =
◦ Exemple : Parmi les 100 cas de gastro-entérite 15 sont décédés, le taux de létalité est
de : 15/100 = 15%.
17/09/2023 50
Taux brut de mortalité (TBM)
◦ C'est la proportion de décès dans une population pendant une période définie.
◦ TBM =
◦
◦ Le TBM n'est pas un bon indicateur, surtout quand on veut comparer la mortalité dans
différentes populations, il donne des conclusions erronées.
17/09/2023 51
Taux spécifique de mortalité (TSM)
17/09/2023 52
EXERCICE
◦
500 personnes ont assisté à un mariage(dont 300 femmes et 200 hommes). Dans les
24 heures suivantes, 75
parmi eux développèrent une gastroentérite (50 femmes et 25 hommes) et 5
femmes décédèrent d'une complication aigue.
Calculez :
◦
1- Le sexe Ratio
◦ 2- Le taux d'attaque de la maladie ?
3- Le taux de mortalité brut ?
4- Le taux de létalité ?
5- Le taux d'attaque spécifique par sexe ?
Corrigé
◦ Sexe ratio: 2 femmes pour un homme
◦ TA : 75/500 = 15%
TMB: 5/500 = 1%
TL: 5/75 = 6,66 %
TSA par sexe: f: 50/300 = 16,6 % et h: 25/200 = 12,5 %
LES MESURES DE DISTRIBUTION
◦
C'est l'étude quantitative de la distribution des
phénomènes de santé parmi la population selon les
caractéristiques de personne, de temps et de lieu (QUI,
QUAND, OU)
◦ . Caractéristiques de personne
L'âge, le sexe, l'occupation professionnelle, l'état
matrimonial, la classe sociale, le groupe ethnique et la
race…
◦ 2. Caractéristique de temps
• Tendance séculaire : variations sur une longue période
• Variations périodiques : changement cyclique (mois, saisons…)
• Variations non périodiques : lors d'épidémies ou de pandémies
◦ 3. Caractéristique de lieu
Permet d'identifier les zones à haut risque.
MESURES DU RISQUE ET
D'ASSOCIATION
◦
Ce sont les mesures utilisées pour évaluer l'association
entre un facteur de risque et un phénomène de santé.
1.Les mesures du risque :
◦
Le risque est la probabilité qu'un événement (phénomène de santé) survienne dans
une population donnée, pendant une période donnée.
◦ Exemple : 4 000 personnes saines ont été suivies pendant 10 ans. Au cours de cette
période, 100 personnes ont développé une maladie "M". Le risque à 10
ans est de 100/4 000, soit 2,5%.
Un facteur de risque (FR).
◦ Ce FR peut être(voir partie déterminant) :
RR = R exp+ / R exp-
◦
Dan notre exemple : RR = 3% / 1,33% = 2,2556 = 2,26
Interprétation
◦ Un RR > 1 indique que le FR en question est un facteur de risque .
Plus le RR est élevé plus l'association entre le FR et l'issue
(maladie) est forte, et plus la probabilité que la relation soit
causale est élevée.
◦ Un RR = 1 indique qu'il n' y a pas de relation entre le FR et
l'issue.
◦ Un RR < 1 indique que le FR en question est un facteur de
protection.
◦
Exercice
◦
Consommation de tabac chez des personnes souffrant ou non du cancer
de l’œsophage
◦ Estimez le risque relatif pour cette exposition (tabac) et commentez les résultats.
Corrigé
◦
Le risque relatif Pour le tabac, le RR est de 9 (1,8/0,2)
◦ 9 > 1 indique que le tabac est un facteur de risque du cancer de l’oesophage .
◦ Le risque d’être atteint d’un cancer de l’œsophage pour une personne
qui consomme le tabac est 9 fois plus élevé que pour une personne qui
n’en consomme pas.
Types d’études épidémiologiques
LES GRANDS AXES DE
L’ EPIDEMIOLOGIE
Classification des études épidémiologiques :
▪ Selon le temps :
◦ L’étude rétrospective
◦ L’étude transversale
◦ L’étude prospective
◦ Selon l’élément de départ de l’étude
◦ l’étude de cas au série de cas
◦ l’étude de corrélation
◦ l’étude de cohorte
◦ l’étude de cas témoins
◦ Selon l’objectif de l’étude
◦ L’étude d’observation
◦ Descriptive
◦ analytique
◦ L’étude expérimentale (d’intervention)
◦ L’étude d’évaluation
Types d’études
épidémiologiques
DEUX GRANDS TYPES
ETUDES ETUDES
EXPERIMENTALES
NON
EXPERIMENTALES
manipulation de l’exposition au
facteur étudié pour ensuite
observer l’effet
Réalité observée
telle qu’elle se
présente (étude
d’observation)
ETUDES NON EXPERIMENTALES
ETUDES EXPERIMENTALES
RANDOMISEES
NON RANDOMISEES
ETUDES NON EXPERIMENTALES :
ETUDES DESCRIPTIVES
• Elles étudient la fréquence et la répartition des indicateurs de santé
• Elles permettent de soulever, à partir de ces observations, des hypothèses sur les
facteurs de risque des maladies
◦ ETUDES TRANVERSALES
Comparaiso
Population n
Temps
ETUDE DE COHORTE
comparais
on
ISSUE
(Maladie)
OUI NON
OUI A B A+B
Exposition Etude de
(Facteur de risque) Cohorte
NON C D C+D
A+C B+D N
Etude
CAS-
TEMOINS
ETUDES TRANSVERSALES
▪ Essais cliniques
- Essais thérapeutiques
◦ Évalue l’effet d’un schéma thérapeutique ou d’une procédure sur une maladie (prévention
secondaire)
- Essais préventifs
Evalue la capacité d’un produit ou d’une pratique sur le risque de développer une maladie
(prévention primaire)
▪ Etudes d’évaluation
Types :
▪ NON RANDOMISEES
▪ RANDOMISEES
ETUDE EXPERIMENTALE
RANDOMISEE
RANDOMISEES
NON RANDOMISEES
Non contrôlé
Surveillance épidémiologique
Surveillance épidémiologique
Les données épidémiologiques les plus importantes sont celles issues des
activités de routine. Les éléments de surveillance épidémiologique sont:
- Déclarations des décès,
- Déclarations des maladies,
- Déclarations des épidémies,
- Rapports des investigations des épisodes épidémiques,
- Rapport des enquêtes autour des cas,
- Déclarations et rapports des laboratoires,
- Etudes épidémiologiques,
- Informations sur la distribution des réservoirs et des vecteurs,
- Information sur la distribution des médicaments,
- Données démographiques,
- Données environnementales,
- Informations publiques et médiatiques.
91
DEFINITION:
La surveillance est un processus de collecte, de compilation et d’analyse des données, ainsi que
leur diffusion à ceux qui ont besoin d’être informés.
TYPES DE SURVEILLANCE:
1- Surveillance passive: les informations sont acheminées sans sollicitation ou intervention de la
part des services responsables de la surveillance(rapport et statistiques).
94
CRITERES DE QUALITE D’UN SYSTEME DE SURVEILLANCE:
95
4-Validité: Sensibilité, spécificité et valeur prédictive positive (VPP):
96
Sensibilité = A/A+C
A
= Capacité de détecter un phénomène quand il existe
réellement. A + C
Test COVID 19
◦ Possibilité de faux positifs et faux négatifs (moins sensible et spécifique)
Sensibilité vs Spécificité
◦Il faut toujours prendre en considération la sensibilité et la
spécificité d’une définition de cas. Une définition très
sensible aura comme avantage la détection de la plupart
des cas ; mais elle va inclure même des faux positifs. Une
définition très spécifique ne va identifier que les cas
presque certains.
EXEMPLE DE DEFINITION DE CAS
◦ Définition de cas de biliharziose :
- Cas suspect : personne présentant une hématurie,
- Cas confirmé : personne présentant d'œufs de S. héamatobium dans les
urines.
103
Démarche de l’investigation
épidémiologique(enquête)
L'objectif Iaire de l'investigation d'une épidémie est de prévenir la continuation
de la transmission de l'agent étiologique dans l'immédiat et dans le futur.
L'investigation d'une épidémie se compose de 10 étapes (3 phases):
Phase descriptive :
1- Confirmer l'existence de l'épidémie.
2- Vérifier le diagnostic(clinique et paraclinique).
3- Etablir la définition des cas(cas confirmés, probables ,suspect).
4- Collecte des données(fiche d’enquête englobant les informations nécessaires).
5- Décrire l'épidémie selon les caractéristiques : lieu, personnes et temps.
Phase des hypothèses :
6- Formuler des hypothèses. (facteurs possibles: l'agent causal, sa source, et son mode de transmission.
Phase analytique :
7- Tester les hypothèses(cas témoins/étude cohorte: RR/statistiques .
8- Proposer les mesures de contrôle( prévention et actions ).
9- Préparer le rapport.
104
10- Continuer la surveillance et l'évaluation des mesures instaurées
MALADIES
DocteurTRANSMISSIBLES
en Ecologie et Environnement
Classification des maladies
Les maladies sont classées selon les codes de la
Classification Internationale des Maladies (CIM) établie
par L’OMS. La CIM sert de base pour établir les
tendances et les statistiques sanitaires, partout dans le
monde, et contient environ 55 000 codes uniques pour les
traumatismes, les maladies et les causes de décès. Elle
fournit un langage commun grâce auquel les
professionnels de la santé peuvent échanger des
informations sanitaires partout dans le monde.
L'OMS publie sa nouvelle CIM (CIM-11) en 2018.
106
Introduction
107
Est ce que les maladies infectieuses ne constituent plus
des problèmes de santé publique?
108
Définitions
Maladie infectieuse: c’est une maladie provoquée par un agent infectieux
(ou ses toxines) qui passe, directement ou indirectement d’un sujet ou
d’un animal contaminé à un hôte sensible.
Ainsi, une maladie infectieuse peut être ou non contagieuse, alors que
l'inverse est toujours le cas.
109
On distingue:
Maladie inapparente: suit le cours complet d’une contagion sans
manifestation de symptômes cliniques (cas sub-clinique).
Maladie manifeste: possède tous les caractères typiques de la
maladie.
Maladie latente: représente une période d’équilibre entre l’agent
infectieux et l’hôte (sans signes cliniques) et l’agent infectieux
n’est pas éliminé dans l’environnement (pas de contamination).
Maladie foudroyante: un cours précipité avec des signes d’une
gravité exceptionnelle et un taux de létalité en général élevé.
T.Directe
Réservoir de germes Facteurs favorisants
✓ Homme ✓ Promiscuité
✓ Animaux ✓ Profession
✓ Milieu extérieur T.Indirecte ✓ Manque d’hygiène..
- Vecteur
Véhicule
Hôte
I- CHAINE DE TRANSMISSION DE LA MALADIE
◦ A- Agent causal :
C’est un microorganisme capable de produire une infection ou une
maladie infectieuse.
B- Réservoir de germe :
Le réservoir de germe peut être l’homme, la plante, le sol ou la matière
organique, qui assure la survie d’un agent pathogène transmissible à
l’homme.
C- Porteur de gène (porteur sain):
C’est un sujet cliniquement sain, mais dont les excrétas contiennent
des germes pathogènes qui peuvent produire une maladie contagieuse.
D- le vecteur :
C’est un être vivant capable de transmettre une infection après
évolution dans son organisme du germe responsable de cette infection.
◦ E- Hôte intermédiaire :
C’est un être vivant dans l’organisme duquel un parasite se développe
à l’état larvaire ou dons une phase d’immaturité sexuelle. Il peut cependant
se multiplier.
F- Hôte définitif :
C’est un être vivant dont l’organisme duquel vit un parasite à l’état
adulte et mature sexuellement.
G- Sujet réceptif :
C’est un être vivant ou un animal présumé dépourvu de résistance à
l’égard d’un agent pathogène particulier et prédisposé pour cette raison à
contracter une maladie, si il est exposé à l’agent pathogène correspondant.
H- Porte d’entrée :
C’est « l’orifice » par lequel le germe pathogène passe dans l’organisme
du sujet contaminé.
Signes
spécifiques de la
Contamination maladie Défervescence
puis
convalescence
118
III- LES PHASES D’EVOLUTION D’UNE MALADIE
TRANSMISSIBLE
1- Incubation :
:
C’est la période qui s’écoule entre la contamination de l’organisme par un agent pathogène et
l’apparition dans le temps des premiers symptômes de la maladie. Cette période varie selon la
nature de la maladie.
2- Invasion :
C’est la période qui suit la période d’incubation, elle s’étend depuis l’apparition des premiers signes
jusqu’à la période d’état.
3- La période d’état :
La période durant laquelle les symptômes de la maladie sont à leur intensité, la maladie reste en
quelque sorte stationnaire pendant cette période.
4- La convalescence :
C’est la période pendant laquelle se rétablie progressivement le fonctionnement normal de
l’organisme après une maladie.
Elle est de durée variable et ne se termine qu’après la reprise de l’état de santé initial du sujet avant
la maladie.
Déclaration des maladies
120
1. Les déclarations immédiates et quotidiennes: Ces déclarations
concernent:
- les maladies soumises au règlement sanitaire international
- les paralysies flasques aigues (PFA)
- La rage humaine
- La méningite cérébro-spinale probable ou confirmée
- Epidémie de tous genre (grippe, conjonctivites…)
- Les cas confirmés de leishmaniose, paludisme et bilharziose
121
2. Les déclarations hebdomadaires: concernent essentiellement les
PFA.
◦ c. La prévention tertiaire :
Elle vise à diminuer les incapacités chroniques, réduire au maximum
les invalidités fonctionnelles et réadapter les malades et faciliter leur
réinsertion professionnel et sociale
◦ 3- Eviction scolaire :
C’est l’exclusion temporaire de l’école d’un élève atteint d’une maladie
contagieuse ( ex gale ).
4-Isoloment :
C’est la séparation de son milieu habituel d’un malade atteint d’une
maladie contagieuse. C’est la séparation de la personne infectée des autres personnes
durant la période de contagiosité afin d’empêcher la transmission directe ou indirecte
de l’agent infectieux.
L’isolement se fait habituellement dans des services hospitalisés
spéciaux ou dans des chambres particulières.
Dépistage
Le dépistage d’une maladie – ou de facteurs de risque favorisant une maladie – est motivé par les
avantages potentiels présentés par la prévention secondaire grâce à la détection et au traitement
précoces.
◦ Définition
Le dépistage est le processus qui, à l’aide de tests pratiqués à grande échelle, permet de repérer la
présence d’une maladie chez des personnes apparemment en bonne santé. Les tests de dépistage ne
permettent pas en général de poser un diagnostic, mais plutôt d’établir la présence ou l’absence d’un
facteur de risque identifié, et ils nécessitent donc un suivi et un traitement individuels.
◦ Le dépistage peut également être employé pour identifier une exposition élevée à des facteurs de
risque. Par exemple, on peut rechercher du plomb dans des prélèvements de sang réalisés chez les
enfants dans les endroits où l’on utilise beaucoup les peintures au plomb.
Types de dépistage
◦ Il existe différents types de dépistage, dont chacun a des objectifs propres :
x Le dépistage de masse qui porte sur l’ensemble d’une population (ou d’un sous-groupe) ;
◦ x Le dépistage multiple ou multiphasique qui repose sur l’exécution simultanée de plusieurs tests
de dépistage ;
◦ x Le dépistage ciblé de groupes faisant l’objet d’une exposition particulière, par exemple les
ouvriers des fonderies de plomb, est souvent utilisé en médecine du travail et en hygiène de
l’environnement
◦ –Méthode de travail
◦ Comparaisons: qui portent sur la fréquence de guérison, d’accidents, de maladies ou
de décès entre les groupe bénéficiant d’une intervention sanitaire et celui n’en
bénéficiant pas
◦ Principes:
• Deux groupe de patients: