KHOUBZI Siham - Contribution À L'évaluation de Quelques Caractères
KHOUBZI Siham - Contribution À L'évaluation de Quelques Caractères
KHOUBZI Siham - Contribution À L'évaluation de Quelques Caractères
MÉMOIRE DE MASTER
Domaine : Sciences de la nature et de la vie
Filière : Sciences biologiques
Spécialité : Microbiologie appliquée
Réf. : ………………………………………………
Thème
Contribution à l’évaluation de quelques
caractères probiotiques de Lactobacillus
isolées de lait de chamelle
Jury :
Remerciement
Avant tout nous remercions "Allah" tout puissant qui nous a donné
Merci de nous
Mes très spéciaux remerciements reviennent à nous familles et nous amies pour leurs
Mes remerciements vont également à nous enseignants qui nous accompagné pendant notre
cursus universitaire.
Finalement, nous remercient tous ceux ou celles qui ont contribué de près ou de loin à
L’accomplissement de ce mémoire.
Dédicace
A mes frères chamseeddine et Tarek et Bachir et ma très chère petite sœur Rania
et mes sœur wahiba et Hanna et Amel.
A toute la famille « khoubzi » et « kadri »
A tous mes amis(es) sans exception surtout : Wafa,
Djehayna, hanan, roukaia, zaineb, kawthar
Et mes amis de l’hôpital.
A mes cousin : Yasmine, sabrine, Malek, khadidja
A toutes les personnes qui de près ou de loin m’ont apporté leur aide
A tous, du fond de mon cœur je vous dédie ce travail.
A tous mes collègues d’études surtout la promotion de microbiologie.
Table des matières
Sommaire
Remerciement
Dédicace
Table des matières
Introduction générale ......................................................................................................................................................... 1
Synthèse Bibliographique
1.1.Historique ................................................................................................................................................................ 5
1.2.Présentation des Lactobacilles................................................................................................................................. 5
1.3.Position taxonomique .............................................................................................................................................. 5
1.4.Les caractères biochimiques .................................................................................................................................... 5
1.5.Caractères morphologiques ..................................................................................................................................... 6
1.6.Caractères culturaux ................................................................................................................................................ 6
1.7.Habitat ..................................................................................................................................................................... 7
1.8.Lait de chamelle ...................................................................................................................................................... 7
1.8.1.Définition.............................................................................................................................................................. 7
1.8.2Caractéristiques organoleptiques et physico-chimiques du lait de chamelle ......................................................... 7
1.8.2.1.Caractéristiques organoleptiques ....................................................................................................................... 7
1.8.2.2.Caractéristiques physico-chimiques .................................................................................................................. 8
1.8.3.Composition du lait de chamelle .......................................................................................................................... 8
1.8.4.Microbiologie du lait camelin .............................................................................................................................. 9
1.8.5.Propriétés thérapeutiques et médicinales.............................................................................................................. 9
Chapitre 2 Les probiotique
2 .1.Historique ............................................................................................................................................................. 11
2.2.Définition............................................................................................................................................................... 11
2.3.Les principales souches microbiennes à potentiel probiotique.............................................................................. 11
2.4.Les probiotiques et leurs effets bénéfiques sur la santé......................................................................................... 11
2.5.Critères de sélection des souches à potentiel probiotique ..................................................................................... 12
2.6.Mécanismes d’action et d’adaptation des probiotiques ......................................................................................... 13
Chapitre 3 Partie Expérimentale
3.1.Echantillonnage ..................................................................................................................................................... 17
3.2.Isolement des bactéries lactiques........................................................................................................................... 17
3.3.Purification et conservation ................................................................................................................................... 17
3.4.Évaluation des caractéristiques probiotiques......................................................................................................... 17
3.4.1. Tolérances à l'acidité ......................................................................................................................................... 17
3.4.2.La tolérance aux sels biliaire .............................................................................................................................. 18
3.4.3.Auto-aggrégation ................................................................................................................................................ 18
3.4.4.Hydrophobicité de la surface cellulaire .............................................................................................................. 19
3.4.5.Co-agrégation ..................................................................................................................................................... 19
3.4.6.Activité antibactérienne ...................................................................................................................................... 19
3.4.7.Sensibilité aux antibiotiques ............................................................................................................................... 19
3.4.8.Test d’hémolyse ................................................................................................................................................. 20
3.4.9.La production des Exopolysaccharrides ............................................................................................................. 20
3.4.10.Profil de fermentation ....................................................................................................................................... 20
3.4.10.1.Dénombrement bactérienne et pH ................................................................................................................. 21
3.4.10.2.L’activité protéolytique (OPA)...................................................................................................................... 21
3.4.11.Hydrolyse des sels biliaires(BSH) .................................................................................................................... 21
3.4.12.Élimination du cholestérol................................................................................................................................ 22
3.4.13.La résistance aux lysozymes ............................................................................................................................ 23
3.4.14.La résistance à la chaleur .................................................................................................................................. 23
4. Identification des isolats sélectionnés par séquençage de l'ADNr 16S ............................................................... 23
Chapitre 4 Résultats et Discussion
4.1.Caractérisation générale des isolats ....................................................................................................................... 25
4.2.Tolérances à l'acidité et aux les sels biliaires ........................................................................................................ 25
4.3.1. L‘ Autoagrégation et hydrophobicité ................................................................................................................ 28
4.4.Co-agrégation ........................................................................................................................................................ 29
4.5.L’activité antimicrobienne et la résistance aux antibiotiques ................................................................................ 33
4.6.Hydrolyse des sels biliaires (BSH) et élimination du cholestérol ......................................................................... 34
4.7.Tolérances à la chaleur et au lysozyme ................................................................................................................. 36
4.8.Activité hémolytique et production d’Exopolysaccharides (EPS) ........................................................................ 37
4.9. Identification des isolats sélectionnés par séquençage de l'ADNr 16S ................................................................ 38
4.10.Profil de fermentation .......................................................................................................................................... 39
Conclusion
Conclusion ....................................................................................................................................................................... 42
Bibliographie
Bibliographie ................................................................................................................................................................... 44
Annexes ........................................................................................................................................................................... 47
Liste des Tableaux
Tableau 1. Les différents habitats des lactobacilles (BELKEZI, 2020) .................................... 7
Tableau 2. Caractéristiques physicochimique de lait camelin (MENAD, 2017) ...................... 8
Tableau 3. Composition chimique(%) du lait camelin (selon différents auteurs) ..................... 8
Tableau 4 . Les principaux effets bénéfiques attribuées aux probiotiques.............................. 12
Tableau 5. La tolérence à l'cidité et à la bile de 23 isolts de lait de chamelle . (Abushelaibi,
Al-Mahadin, El-Tarabily, P. Shah, & Ayyash, 2017) ..................... Erreur ! Signet non défini.
Tableau 6. les pourcentage de l'autoagragatio et l'hydrophobicité .......................................... 28
Tableau 7. les pourcentages de co-agrégation des BL en présence de 4 bactéries pathogènes
pendant 4 h à deux température d 'incubation différents (Abushelaibi, Al-Mahadin, El-
Tarabily, P. Shah, & Ayyash, 2017)......................................................................................... 32
Tableau 8. L 'activité antagoniste contre 4 bactéries pathogènes et la résistance aux 6
antibiotiques différents . (Abushelaibi, Al-Mahadin, El-Tarabily, P. Shah, & Ayyash, 2017) 34
Tableau 9. l'activité d'hydrolyser les sels biliaires ( activité spécifique U/mg ) (Abushelaibi,
Al-Mahadin, El-Tarabily, P. Shah, & Ayyash, 2017) .............................................................. 35
Tableau 10. La résistance à la chaleur (60°C/ 5min) et au lysozymes (Log 10 UFC/ml).
(Abushelaibi, Al-Mahadin, El-Tarabily, P. Shah, & Ayyash, 2017) ....................................... 36
Tableau 11. L'activité hémolytique et production de EPS (Abushelaibi, Al-Mahadin, El-
Tarabily, P. Shah, & Ayyash, 2017)......................................................................................... 38
Tableau 12. Profil de fermentation ( nombre des bactéries ,OPA (340 nm),pH ) des BL
pendant 21 jours à 4°C. (Abushelaibi, Al-Mahadin, El-Tarabily, P. Shah, & Ayyash, 2017)
......................................................................................................... Erreur ! Signet non défini.
I
Liste des Figures
II
Liste des abréviations
% : pour cent
°C : Degrés Celsius
BL : Bactéries lactiques
DO : Densité Optique
E:Escherichia
EPS: Exopolysaccharride
h : heure
iso : isolat
L: Listeria
Lb: Lactobacillus
nm: nanomètre
p / v : poids/volume
III
PCR : Polymérase Chain réaction
PH : Potentiel d’Hydrogène
PM : poids moléculaire
T : Température
t : temps
tr : Tour
IV
Introduction générale
Introduction générale
Le lait de chamelle est un aliment de notre vie quotidienne, ça place est irremplaçable ;
grâce à leur richesse en nutriments tel que les glucides, les protéines, les lipides, les
minéraux et les vitamines.
Les bactéries lactiques sont des microorganismes largement répandus dans la nature,
sont trouvées dans le sol ,sur les végétaux ,elle constituant une fraction important de notre
flore intestinale ,aussi pour la muqueuses buccale ,nasale et vaginale ;elle jouent un rôle
primordiale de notre santé car elle contribuant à nous de protégés contre les germes
pathogènes . (Bilarbi, 2011)
Les BL est un groupe de bactéries à Gram positif, produisent de l’acide lactique comme
résultat de la fermentation des carbohydrates. Elles possèdent en effet un statut GRAS
(Generally Recognized As Safe) qui autorise leur usage dans les applications alimentaires de
façon officielle. (Kassas, 2017)
Actuellement, les bactéries lactiques présentent une grande importance pour leurs
valeurs nutritionnelles et thérapeutiques dans les industries agroalimentaires et
pharmaceutiques. La connaissance de ces BL pourrait nous permettre de les utiliser dans la
bioconservation, l’amélioration de la valeur nutritive des aliments et les préparations
probiotiques. Elles sont considérées comme des microorganismes à propriétés probiotique.
Selon la F.A.O./OMS, (2002) ; les probiotiques sont des microorganismes vivants qui,
lorsqu’ils sont consommés en quantité suffisante exercent un fait positif sur la santé au-delà
des effets nutritionnels. Pour garantir cette propriétés, les BL doivent répondre à un certain
nombre de critères tel que la tolérance à l’acidité et aux sels biliaires
(Fuller, 1989; Saito, 2004)
1
Introduction générale
Dans notre travail pratique nous avons essayé de étudiées quelques caractères
probiotiques des Lactobacillus isolé à partir du lait de chamelle collecté de Biskra, cependant,
le travail pratique n’était pas possible de l’achevé suite aux circonstances de l’épidémie de
COVID-19.
Suite à cette cause nous avons changé notre objectif et une bibliographique sur les
lactobacilles et leurs effets probitiques et une analyse d’article des lactobacilles isolé de lait
chamelle.
2
Synthèse Bibliographique
Chapitre 1
Les lactobacilles
Chapitre 1 Les lactobacilles
1.1.Historique
Au plan de la morphologie, métabolisme et phylogénie. Les lactobacilles forment un
groupe très disparate, malgré cette diversité, l’identification de certaines espèces de
lactobacilles par les méthodes classiques reste délicate voire impossible. Dans ces cas, seule
approches moléculaires ou une combinaison d’approches moléculaires et phénotypiques
permettent une identification précise, cette dernière est importante car elle permet une
description juste des espèces présentes dans les niches écologiques et l’étude de leur
dynamique, ce genre est l'un des genres les plus importants impliqués dans la microbiologie
alimentaire et la nutrition humaine, en raison de leur rôle dans la préservation des aliments,
ainsi que leurs propriétés probiotique. Les espèces du genre Lactobacillus sont très répandues
dans la matière fermentescible. Les lactobacilles contribuent à la saveur des aliments
fermentés par la production de diacétyle, le sulfure d’hydrogène et les amines, ils jouent un
rôle dans la production aussi bien dans la détérioration des aliments. (Choucroute, ensilage,
produits laitiers, produits carnées, produits de la pêche et boissons). (Kassas, 2017)
1.3.Position taxonomique
Depuis le développement des techniques moléculaires, le genre Lactobacillus a été
revisité une nouvelle fois à travers l’analyse et la comparaison des séquences d’ARN
ribosomiaux 16S (ARNr). Cette étude a montré que les lactobacilles ne forment pas un groupe
monophylétique .Trois grands groupes ont été constitués sur la base de la comparaison de ces
séquences : le groupe Lactobacillus delbrueckii, le groupe Lactobacillus casei, Pediococcus
tel que le groupe Leuconostoc paramesenteroides.
5
Chapitre 1 Les lactobacilles
Les Lactobacillus sont subdivisé par leur type fermentaire par Orla-Jensen en trois
groupes et cette classification est encore utilisée en milieu industriel (BELHAMRA, 2017)
1.5.Caractères morphologiques
Les Lactobacillus sont des bacilles à Gram positif (+), ils sont non sporulées et
généralement immobiles, ils peuvent se présenter sous forme en bâtonnets longs, fins ou
courts, incurvés ou ovoïdes. (BELKEZI, 2020) .La figure 1 montre l’aspect
microscopique d’une souche de lactobacilles observée par microscopie électronique .
1.6.Caractères culturaux
6
Chapitre 1 Les lactobacilles
La plupart des lactobacilles se multiplient dans des températures comprise entre 15°C et
42°C. Certaines espèces de lactobacilles dites « thermophiles » restent viables à 55°C,
certaines souches peuvent croitre à des températures allant de 2 à 55°C. (MENAD, 2017)
Le milieu le plus adapté à leur culture est celui de MRS (Man Rogosa et Sharpe) et en
milieu gélosé, les colonies sont dans la plupart des cas de petites tailles, lisses, brillantes et
dans des rares cas, elles sont de couleur jaunâtre ou rougeâtre (BELKEZI, 2020) . Ils se
développent dans la condition acide quand le pH allant de 5.4 à 6.4 (quelques espèces peuvent
pousser à un pH de 2.8 tel que Lactobacillus suebicus). La croissance optimal est obtenu dans
des conditions micro-aérophiles bien que la plus part des souches soient anaérobies
facultatives.
1.7.Habitat
Les lactobacilles sont présents dans de nombreux biotope. (tab.1) (BELKEZI, 2020)
1.8.Lait de chamelle
1.8.1.Définition
Le lait est définit en produit de secrétions des glandes mammaires, des mammifères
comme la vache et la brebis, destinés à l’alimentation de jeune animal naissant.
7
Chapitre 1 Les lactobacilles
luzerne, lui donne un goût sucré, alors que l’ingestion de certaines plantes halophytes comme
Atriplix, Salosa et Acaciale rend salé . (Naceur, 2017)
1.8.2.2.Caractéristiques physico-chimiques
Le lait camelin est légèrement plus acide, son pH varie entre 6,2 à 6, 5. (tab.2).
(MENAD, 2017).
Les fluctuations qui existent dans les valeurs des constantes physico-chimiques rapportées par
différents auteurs sont liées aux teneurs variables des différents composants de ce lait.
(MENAD, 2017)
8
Chapitre 1 Les lactobacilles
Le lait peut aussi être contaminé par des germes, issus des fèces et des téguments de
l’animal, du sol de la litière et des aliments, de l’air et l’eau, des équipements de traite et de
stockage, des manipulateurs et de vecteurs divers. (DRA Ghislaine, 2018).
9
Chapitre 2
Les probiotique
Chapitre 2 Les probiotiques
2 .1.Historique
Le concept des probiotique provient d’un chercheur et Prix Nobel Russe, Elie
Metchnikoff (1907) qui avait pour théorie que la longévité des paysans bulgares était
directement liée à leur consommation de laits fermentés. (RAHLI, 2015)
Ensuite, Parker (1974) élargit cette définition à des « organismes et substances qui
contribuent à l’équilibre de la microflore intestinale». Cette définition englobant les
microorganismes et les métabolites microbiens produits (les antibiotiques), a été modifiée par
(Fuller, 1989) qui redéfinit les probiotique comme étant: « des préparations microbiennes
vivantes utilisées comme additifs alimentaires et qui ont une action bénéfique sur l’animal
hôte en améliorant la digestion et l’hygiène intestinale ».
2.2.Définition
Le terme probiotique dérive des deux mots grecs « pros » et « bio »qui signifient
littéralement "pour la vie". Il a été introduit pour la première fois par Lilly et Stilwell en 1965.
Selon la définition actuellement adoptée par la FAO / OMS (2002) ; « les probiotique sont des
microorganismes vivants administrés en quantités adéquates et qui sont bénéfiques pour la
santé de l'hôte » (Bouguerra, 2012).
11
Chapitre 2 Les probiotiques
(HADEF, 2012)
➢ Non pathogène.
12
Chapitre 2 Les probiotiques
13
Chapitre 2 Les probiotiques
14
Partie
Expérimentale
Chapitre 3
Matériels et Méthodes
Chapitre 3 Matériels et méthodes
3.1.Echantillonnage
Les échantillons ont été ramassés de différentes fermes de chameaux à Abu Dhabi,
Émirats arabes unis, cinquante échantillonnes fraîche ont été collectés de lait de chamelle en
bonne santé dans des bouteilles stérilisées, puis conservés dans la glace ; et doit transportés au
laboratoire de microbiologie alimentaire de l'Université des Émirats arabes unis pour
isolement et l’étude de caractérisation.
3.3.Purification et conservation
Pour maintenir la pureté des colonies, des repiquages ont été faites dans du bouillon
MRS est stockée dans du glycérol (50%) à - 80 °C.
Chaque souche a été repiquées 3 fois avant chaque test, suivie d'une centrifugation après le
dernier repiquage, ensuite les cellules sont remis en suspension et inoculé (1% v/v) dans le
bouillon MRS traité.
17
Chapitre 3 Matériels et méthodes
la tolérance aux acides a été déterminée en comparant le nombre des colonies après 2 h
avec le comptage initial 0 h.
Trois types de bile ont été utilisés, à savoir l'oxgall, l'acide cholique et l'acide taurocholique,
pour étudier la tolérance à la bile des de souches isollées.
Un bouillon MRS contenant 0,30% (poids / vol) d’oxgall, d’acide cholique, ou l'acide
taurocholique a été inoculé avec chaque souche, et incubé à 37 ° C. MRS exempte de sels est
utilisé comme témoin.
Les valeurs d'absorbance obtenues ont été tracées en fonction du temps d'incubation, et la
tolérance à la bile de chaque souche a été basée sur le temps nécessaire pour que la valeur
d'absorbance augmente de 0,3 unité.
Les valeurs de pH de tous les bouillons de fermentation au temps = 0 ont été mesurées, et une
autre mesure a été prise après l'augmentation de l'absorbance de 0,3 unité.
Toutes les expériences ont été répliquées deux fois.
3.4.3.Auto-aggrégation
L’autoaggrégation est déterminée selon la méthode de (Angmo, Kumari, Savitri, &
Bhalla, 2016) , une culture fraîche des cellules bactérienne sont récupérées par centrifugation
à 4000 tr/10 min, le culot bactérien obtenu est lavé deux fois avec du tampon PBS et remis en
suspension dans la même solution. La densité optique de la suspension est ajustée à (A0h) =
0,5 ± 0,02 à 600 nm. (3 ml) de la suspension bactérienne est agitée par vortex pendant 10 s.
Après incubation à 37°C pendant 2 h, la densité optique du surnageant est mesurée à 600 nm
(A2 h) et le pourcentage d'Auto-aggrégation est exprimé en ; % Auto agrégation = 1-(A2
h/A0 h) x 100 , où A2 représente l'absorbance au temps t et A 0 représente l'absorbance à t =
0.
18
Chapitre 3 Matériels et méthodes
3.4.5.Co-agrégation
La co-agrégation des isolats contre quatre pathogènes à 20 C et 37 C pendant 4
heures d’ incubation est déterminée selon (Zuo, et al., 2016). Le pourcentage de co-
agrégation a été exprimé comme suit : [(A0-At)/A0]x100
La préparation des suspensions cellulaires était la même que pour l’auto– aggrégation,
un volume de 1 ml de suspensions cellulaires de souches isolées et 1 ml la suspension de la
souche pathogène Listeria monocytogenes ont été mélangées dans un cuvette, et la DO600 a
été immédiatement mesurée, après incubation du mélange à 37 ° C pendant 2 h, La DO600 a
de nouveau été mesurée.
3.4.6.Activité antibactérienne
Afin d’évaluer l'activité antimicrobienne, MRS gélose solide en boîtes de Pétri est recouvert
par 7 ml de gélose nutritive molle inoculée avec 20 µl d’une culture jeune de souches
pathogènes. Après solidification, différents puits sont creusés et puis remplit par 50 µl du
surnageant obtenu en centrifugeant de cultures bactériennes de 24 heures. Le surnagent
neutralisé à pH 6,5 a été également inoculé dans les puits. Le diamètre de la zone d'inhibition
entourant les puits a été mesuré et une zone claire de 1 mm ou plus a été considérée comme
une inhibition positive.
3.4.7.Sensibilité aux antibiotiques
19
Chapitre 3 Matériels et méthodes
La résistance des isolats aux antibiotiques a été réalisée selon Das, Khowala, and Biswas
(2016). Les antibiotiques utilisés sont comme suit : PEN: penicillin (10 µg); TRI:
trimethoprim (25 µ g); AMP: ampicillin (10 µ g); CLI: clindamycin (2 µg); VAN:
vancomycin (30 µ g); ERY: erythromycin (15µg).
Les tests ont été réalisés en triple et les diamètres de zone d'inhibition de croissance (mm), s'il
y en a, ont été notés.
3.4.8.Test d’hémolyse
Selon (Angmo, Kumari, Savitri, & Bhalla, 2016),
L’activité hémolytique des isolats a est teté selon Angmo et al , (2016). les isolats ont été
ensemencés en milieu Columbia gélose complétées supplémenté par 5% sang de mouton, puis
incubées les échantillonnes à 37 ° C pendant 24 h.
Les résultats de l’hémolyse soit une zone d'hémolyse claire (beta- hémolytique ou
hémolytique complète), ou bien ayant un halo verdâtre (alpha -hémolytique ou hémolytique
partiel), ou pas d’halo qui signifiée l’absence d’hémolyse (gamma- hémolytique).
3.4.10.Profil de fermentation
Les capacités de fermentation des isolats de LB sélectionnés ont été évaluées selon
(Angmo, Kumari, Savitri, & Bhalla, 2016), Le lait écrémé bovin reconstitué (5% p / v) a été
stérilisé à 105 C pendant 5 min puis remettre à 37 C et inoculé par 1,5% d'isolats LB
activement sélectionnés, suivi d'une incubation à 37 C pendant 24 h. Les échantillons de lait
fermenté ont été conservés à 4 C pendant 21 jours. Des échantillons ont été prélevés chaque
20
Chapitre 3 Matériels et méthodes
7 jours pendant la période de stockage pour le dénombrement des cellules bactériennes, puis
mesurée le pH et l’activité protéolytique à l'aide de l'OPA.
3.4.10.1.Dénombrement bactérienne et pH
Ont été préparées des dilutions en série appropriées dans une solution de peptone et
d'eau à 0,1%, et les populations des LB ont été comptées à l'aide de la gélose MRS. Les boites
de Pétri inoculées en double ont été incubées à 37 ° C pendant 48 h en anaérobie en utilisant
des jarres anaérobies, le pH ont été mesurées de chaque échantillon en utilisant un pH-mètre
numérique.
Les activités BSH d'isolats purs ont été mesurées en déterminant la quantité d'acides
aminés libérés des sels biliaires conjugués par les souches selon Liong et Shah (2005).
Brièvement, les cellules cultivées dans un bouillon MRS pendant 20 h ont été
centrifugées à 10 000 g à 4° C pendant 10 min. Le culot cellulaire a été lavé deux fois avant
suspension dans 10 ml de tampon phosphate 0,1 M (pH 7,0). La concentration cellulaire a été
ajustée à une valeur de DO de 1 unité à 600 nm.
Cinq millilitres de la suspension cellulaire ont été mis en sonification pendant 3 min
avec un refroidissement constant dans de la glace, suivi par une centrifugation à 10 000 g à 4°
C pendant 10 min. A 0,1 ml de surnageant correctement dilué obtenu, 1,8 ml de tampon
21
Chapitre 3 Matériels et méthodes
phosphate de sodium 0,1 M (pH 6) et 0,1 ml de sel biliaire conjugué ont été ajoutés. La bile
conjuguée utilisée était le glycocholate de sodium 6 mM, le taurocholate de sodium 6 mM ou
le mélange de sels biliaires conjugués 6 mM (acide glycocholique, acide
glycochénodésoxycholique, acide taurocholique, acide taurochènodésoxycholique, et l’acide
taurodésoxycholique .
Le mélange a été incubé à 37 ° C pendant 30 minutes. La réaction enzymatique a été
interrompue en ajoutant 0,5 ml d'acide trichloroacétique (15% poids vol 1) à 0,5 ml
d'échantillon. Le mélange a été centrifugé et 0,2 ml de surnageant obtenu a été ajouté à 1 ml
d'eau distillée et 1 ml de réactif ninhydrine (0,5 ml de ninhydrine à 1% dans un tampon citrate
0,5 M pH 5,5, 1,2 ml de glycérol à 30%, 0,2 ml de tampon citrate 0,5 M pH 5,5).
La préparation a été vortexée et bouillie pendant 14 min. Après refroidissement
ultérieur, l'absorbance à 570 nm a été déterminée en utilisant de la glycine ou de la taurine
comme standards. Une unité d'activité BSH a été définie comme la quantité d'enzyme qui a
libéré 1 mmol d'acide aminé du substrat par minute.
3.4.12.Élimination du cholestérol
MRS bouillon fraîchement préparé contenant 0,3% d'oxgall a été inoculé avec chaque
souche isolée et incubé pendant 24 h à 37 ° C. Les cellules sont récoltées par centrifugation à
4000 x g à 4 ° C pendant 20 min et lavées deux fois avec de l'eau stérile.
Pour préparer les cellules tuées par la chaleur, les culots cellulaires ont été mis en
suspension dans 10 ml d'eau et autoclavés à 121 ° C pendant 15 min. Les cellules tuées par la
chaleur ont été en outre mises en suspension dans un bouillon MRS supplémenté avec 0,3%
(p / v) d'acide oxgall et 100 g / ml de cholestérol soluble dans l'eau et incubées pendant 24 h à
37 ° C. Pour préparer les cellules au repos, les culots cellulaires ont été mis en suspension
dans 10 mL de tampon phosphate stérile (0,05 M, pH 6,8) contenant 0,3% (p / v) d'acide
oxgall et 100 mg / mL de solution aqueuse de cholestérol et incubés pendant 24 h à 37 ° C.
Après incubation, les mélanges est centrifugés à 4000 xg à 4 ° C pendant 20 min et
les concentrations de cholestérol dans les surnageant ont été mesurées en utilisant la méthode
spectrophotométrique selon Liong et Shah (2005).
22
Chapitre 3 Matériels et méthodes
(7 000 tr / min, 10 min, 4 ° C). Les cellules ont été lavées deux fois avec du PBS et les culots
ont été remis en suspension dans une solution de Ringer ,(10 µl) de suspension été inoculée
dans une solution d'électrolyte stérile (CaCl2 0,22 g / l; NaCl 6,2 g / l; KCl 2,2 g / l; NaHC03
1,2 g / l) avec 100 mg / l de lysozyme, puis incubés à 37 ° C et après 2 h d'incubation, le
nombre de cellules viables a été dénombré en utilisant la méthode de comptage sur boites .
L'ADNr 16S de souches sélectionnées a été ampli fi é par la procédure de PCR décrite dans
Angmo et al. (2016).
Le séquençage a été fait par la firme Macrogen, Korea. Les résultats de la séquence ont été
alignés sur la base de données NCBI en utilisant l'algorithme BLAST. Les numéros
d'accession ont été reçus pour certains isolats LAB par GenBank. La méthode de voisinage a
été appliquée pour déterminer l'espèce bactérienne la plus proche (Saitou et Nei, 1987) à l'aide
du logiciel MEGA 7.0.
23
Chapitre 4
Résultats et Discussion
Chapitre 4 Résultats et discussion
Dans l'ensemble, les isolats 15, 70, 34, 66, 76, 22, 51, 73 et 47(tableau 5), entre autres, ont
exprimé une résistance plus élevée contre les sels biliaires. Sur la base des tolérances à l'acide
et à la bile, les isolats 15, 70, 34, 66, 76, 22, 51, 73 et 47 ont été sélectionnés pour une
caractérisation ultérieure.
Des résultats similaires ont été obtenus par Mahmoudi et al 2016 où 19 isolats de
lactobacillus ont exprimé une résistance supérieure à 90% à pH 2, ce qui est considéré comme
une bonne résistance aux acides.
La résistance aux sels biliaires a été étudiée également par (MAHMOUDI, et al., 2016) , où 6
souches de Lb.plantarum ont exprimé une viabilité de 92,38% jusqu’au 99.4%.
Des résultats similaires à notre étude ont été rapportés par Angmo et al. (2016) et Das et al.
(2016) pour des lactobacillus isolé de boissons du Ladakh et d'échantillons marins.
De la même façon, la résistance aux acides des isolats sélectionnés dans cette étude étaient
plus élevées que celles rapportées par Angmo et al. (2016) à pH 2,0.
Les tolérances aux stress acides et biliaires sont des propriétés importantes pour toute bactérie
possédant un potentiel probiotique. La capacité du probiotique à survivre, en nombre
suffisant, après avoir été soumis à une acidité gastrique (pH bas) et aux conditions de l'intestin
(sels biliaires) est important pour être utilisé dans l'industrie alimentaire (Chalas et al., 2016).
25
Chapitre 4 Résultats et discussion
La tolérance aux acides et à la bile de tous les isolats est variée considérablement en raison de
la spécificité de la souche ou de l'espèce.
26
Chapitre 4 Résultats et discussion
Tableau 5. La tolérence à l'cidité et à la bile de 23 isolts de lait de chamelle (Abushelaibi, Al-Mahadin, El-Tarabily, P. Shah, & Ayyash,
2017)
27
Chapitre 4 Résultats et discussion
Les neuf isolats (15, 70, 34, 66, 76, 22, 51, 73 et 47 ont présentés un bon pourcentage
d'autoagrégation allant de 0,1 - 10% et de 0,6 - 38% pendant 3 h et 24 h d'incubation . L'étude
statique utilisant ANOVA a montré que l'autoaggrégation augmentait (p <0,05) pendant la
période d'incubation.
Après 24 h, les isolats 51, 70, 22, 47 et 66 présentaient une autoaggrégation la plus
élevée que les autres isolats. Les résultats du tableau 6 ont révélé que les propriétés
hydrophobes des 9 isolats vis-à-vis du xylène et de l'octane étaient plus élevées (p <0,05) que
celles de l'hexadécane.
En général, les isolats 51, 76, 47, 22 et 66 ont montré une hydrophobicité plus élevée
que les autres isolats étudiés.
Les propriétés de surface cellulaire testées par hydrophobicité et autoagrégation sont des
paramètres indicatifs de l'adhésion des cellules probiotiques aux cellules épithéliales dans
l'intestin humain.
Plusieurs chercheurs ont rapporté que les tests d'agrégation et d'hydrophobicité possèdent une
corrélation avec les propriétés d'adhésion des bactéries probiotiques (Botes et al, (2008) et
Duary et al, (2011).
Dans la présente étude, les isolats LAB ont montré des pourcentages remarquables
d'autoagrégation et d'hydrophobicité vis-à-vis des hydrocarbures. Cependant, des différences
significatives existaient entre les souches étudiées, qui peuvent être attribuées à la variation
des extensions hydrophiles / hydrophobes dans la paroi cellulaire des isolats de bactéries
lactiques.
Angmo et coll. (2016) ont rapporté une hydrophobicité contre l'hexadécane et les résultats ont
variés de <5% à 47% pour les souches LAB. L'inconvénient de l'étude précédente (Angmo et
al., 2016) était que l'hydrophobicité du LAB était testée contre un seul hydrocarbure
(hexadécane).
28
Chapitre 4 Résultats et discussion
Dans notre étude, les isolats ont montré une hydrophobicité comparativement plus élevée par
rapport à l'étude précédente, en particulier contre le xylène et l'octane.
Das et et, (2016) ont également signalé une hydrophobicité et autoagrégation de 3 isolats de
bactéries lactiques provenant de sources différentes de la mer indienne.
Ces auteurs ont rapporté la fourche d’hydrophobicité de 22,2% à 25,0%, ce qui est inférieur
par rapport à nos résultats, alors que les pourcentages d'auto-agrégation sont conformes à nos
résultats.
4.4.Co-agrégation
29
Chapitre 4 Résultats et discussion
pathogènes à la température d'incubation 37° C ont eté les plus élevés (P> 0,05) par rapport à
20 C, en particulier en présence de L. monocytogenes et S. aureus.
Dans l'ensemble, les isolats 34 et 70 ont démontré une capacité de co-agrégation la plus
élevée que les autres isolats étudiés.
le tableau 7 montre que les souches isolées ont présentées une co-aggrégation plus élevée (p>
0,05) envers les pathogènes Gram-négatifs (E. coli O157: H7 et S. typhimurium) au cours des
2 premières heures par rapport aux Gram-positifs (L. monocytogenes, et S. aureus).
Cette tendance a changé lorsque le temps d'incubation s'est prolongé à 4 h. Dans l'ensemble,
les souches 22, 47, 34 et 70 ont démontré une capacité de co-aggrégation élevée que les autres
isolats étudiés.
Plusieurs auteurs ont révélé que l'aggrégation cellulaire est positive pour favoriser la
colonisation cellulaire des bactéries probiotiques.
Les résultats de la coaggrégation de notre étude concordent avec ceux rapportés par d'autres
(Angmo et al., 2016; Ben Taheur et al., 2016; Collado et al, 2008).
La capacité des BL isolés à coaggréger avec les agents pathogènes peut être attribuée aux
composants de la surface cellulaire, mais les mécanismes doivent encore être étudiés.
Des interactions entre les glucides-lectine et les composants protéiniques présents à la surface
cellulaire peuvent être impliquées (Tareb et al., 2013). Néanmoins, les pourcentages de
coagrégation dépendent de la souche (probiotique et pathogène) et du temps d'incubation
(Collado et al., 2008).
Notre étude a montré que la température d'incubation n'influençait pas de manière significative la co-
agrégation. Notre résultat contredit celui de Collado et al. (2008) qui ont rapporté que la
température d'incubation affecte la coaggrégation des probiotiques étudiés, mais les données
n'ont pas été présentées. Par conséquent, ces auteurs ont choisi la température de 20° c pour
effectuer le test de co-aggregation (Collado et al., 2008).
30
Chapitre 4 Résultats et discussion
Nous pensons que la co-aggrégation influencée par les conditions environnementales à besoin
doit être etudiée davantage afin de standardiser le test de coagrégation. La tendance imprévue
de la coagrégation des isolats de LAB dans cette étude envers les pathogènes Gram-positifs
pendant les 2 premières heures d'incubation nécessite des études supplémentaires .
31
Chapitre 4 Résultats et discussion
Tableau 7. les pourcentages de co-agrégation des BL avec 4 bactéries pathogènes pendant 2 heure et 4 heures à deux température d
'incubation différents (Abushelaibi, Al-Mahadin, El-Tarabily, P. Shah, & Ayyash, 2017)
32
Chapitre 4 Résultats et discussion
Les activités antimicrobiennes des isolats de BL ont fluctuées entre la petite activité
(zone de 0,1 mm) à la plus élevée (zone de> 2,0 mm).
Les isolats 15, 34, 47, 66, 70 et 76 ont présenté de fortes activités antimicrobiennes
contre les 4 agents pathogènes et particulièrement un effet très important contre S. aureus par
rapport à d'autres agents pathogènes (tableau 8). les deux isolats 34 et 70 ont parmi ces
souches à forte activité antimicrobienne ,on cite que l’isolat 34 à un faible effet sur E. coli
O157 : H7 et S. typhimurium avec une zones d’inhibition de 0,1 à 1,0 mm , et un effet
modéré sur L.monocytogenes et S. aureus avec une diamètre d’inhibition de 1,1 à 2,0 mm .
les résultats de cette étude sont en accord avec ceux trouvés Mahmoudi et al., (201) en
étudiant l’activité antibacterien de 16 isolat de Lb.plantrum contre les souches pathogenes
précédentes. De même, Hamed et Elattar,2013 ont rapporté des résultats similaires où la seul
Lb.plantarum isolées a eu une activité maximale contre E. coli O157 : H7, et une action
modérée contre S. typhimurium.
En général, toutes les souches BL ont pu résister à l'impact des antibiotiques. Cependant, les
isolats 22, 51 et 73 étaient sensibles aux antibiotiques.
L'activité antimicrobienne des souches de BL peut être attribuée à certains composés produits
pendant la croissance des BL, notamment les métabolites, les acides organiques et les
bactériocines (Zuo et al., 2016).
Les activités antimicrobiennes de la présente étude sont en accord avec les résultats rapportés
par d'autres auteurs (Angmo et al., 2016; Das et al., 2016; Zuo et al., 2016). Ces études ont
également révélé que l'activité antimicrobienne dépendait de l'espèce et de la souche.
33
Chapitre 4 Résultats et discussion
un antibiotique particulier peut être due à l'absence de site cible de cet antibiotique
particulier dans la cellule BL (DeLisle et Perl, 2003).
Ces résultats sont presque en accord avec ceux d'Angmo et al. (2016) et Teles Santos et
al. (2016) qui ont isolé des BL à partie des produits fermentés indiens et du cacao
fermenté , respectivement.
Cependant, des différences mineures par rapport à notre étude peuvent être attribuées à
des différences entre les souches et les espèces.
2017)
(-) aucun inhibition ,(+) zone d’ inhibition de 0,1et 1,0 mm ;(++) zone d’ inhibition de 1,1et 2,0 mm ; (+++)
zone d’ inhibition de > 2,1mm .PEN: pénicilline (10 mg); TRI: triméthoprime (25 mg); AMP: ampicilline (10
mg); CLI: clindamycine (2 mg); VAN: vancomycine (30 mg); ERY: érythromycine (15 mg), R: résistante, MS:
moyennement sensible , S: sensitive
Toutes les souches de BL ont montré la capacité d'hydrolyser les trois sels biliaires étudiés
en produisant de l'acide cholique.
Les isolats 70, 22, 34, 76 et 15 présentaient des activités BSH élevées par rapport aux
autres isolats (tableau 9).
34
Chapitre 4 Résultats et discussion
En général, les différences de BSH entre 3 sels biliaires à chaque isolat étaient non
significatives (p <0,05). Comme le montre la figure 1, les isolats BL étaient capables
d'éliminer le cholestérol du milieu MRS. Les isolats 15, 34, 76 et 70 ont démontré une
capacité d'élimination du cholestérol plus élevée (p <0,05) que les autres BL.
De plus, la capacité du LAB à hydrolyser les sels biliaires dans l'intestin humain réduirait
l'absorption du cholestérol dans l'intestin (Jones,
Tomaro- Duchesneau, Martoni et Prakash, 2013).
Dans notre étude, les isolats étudiés présentaient une baisse du cholestérol et des activités
BSH. Les résultats de notre étude sur la capacité d'abaissement du cholestérol sont en accord
avec les résultats rapportés par Das et al. (2016), alors que les activités de BSH sont
conformes à celles rapportées par Miremadi et al. (2014).
35
Chapitre 4 Résultats et discussion
36
Chapitre 4 Résultats et discussion
Turchi et al. (2013) ont rapporté que les taux de survie de 37 souches de BL étudiées
provenant de produits alimentaires italiens étaient> 80%. Ces résultats sont en accord avec
nos résultats (tableau). Les résultats de la résistance au lysozyme dans notre étude sont
également conformes aux résultats rapportés par Angmo et al. (2016).
des résultats identique par (Amara, Zadi-Karam, & Karam, 2019) et (MAHMOUDI, et al.,
2016), pour tooutes tous les souches de Lactobacillus plantarum isolées .
La présence de mucus de couleur blanc filé sur des plaques de lait écrémé rouge ruthénium
produisant des lactobacilles sont les producteurs d'EPS. Plusieurs travailleurs ont rapporté des
résultats EPS similaires en utilisant les mêmes tests de cette étude (Angmo et al., 2016;
Kumari, Angmo, Monika et Bhalla, 2016).
Les 3 isolats qui ont démontré des activités hémolytiques de type α ou βl'hémolyse n'ont pas
été prises en compte pour l'identification.
37
Chapitre 4 Résultats et discussion
(-) aucun hémolyse ; (Α) hémolyse alfa ; (β) hémolyse beta ; (-) EPS négative ; (+) EPS
positive.
les Six probiotiques potentiels ont été identifiés par la séquence du gène de l'ARNr 16S.
Les amplicons PCR étaient compris entre 1 200 et 1 400 pb. Les alignements ont été
effectués à l'aide de BLAST. Les isolats identifiés ont été désignés sous le nom de bactéries
lactiques probiotiques.
L'analyse de la phylogénie moléculaire et l'arbre phylogénique ont été effectués pour
identifier les Bl au niveau de l'espèce sur la base des séquences d'ADNr 16S à partir de
distances évolutives par la méthode de neighbor-
joining. L'arbre phylogénique des 6 isolats sont montré sur la figure . L'analyse de séquence a
montré que 50% de l'ADNr 16S étaient regroupés avec la séquence de lactobacilles et les
50% restants regroupés avec la séquence de lactocoques. Les numéros d'accession de Ge
38
Chapitre 4 Résultats et discussion
Tableau 11. Isolats LAB identifiés par séquençage du gène de l'ADNr 16S et leurs
numéros d'accès Genbank
4.10.Profil de fermentation
Le dénombrement bactérien, évaluation de la protéolyse et valeurs du pH du lait
fermenté pendant 21 jours de stockage sont mentionné dans ( tab.12 ) .Les 6 isolats ont
conservé un nombre élevé de bactéries pendant 21 jours de stockage à 4 C avec une
abaissement légère des numérations bactériennes , sauf L. lactis KX881782 qui a chuté de
manière significative. En revanche, les deux souches de Lb. plantarum ont augmenté pendant
le stockage.
39
Chapitre 4 Résultats et discussion
Tableau 12. Profil de fermentation (nombre des bactéries, OPA (340 nm), pH ) des BL pendant ours à
40
Conclusion
Conclusion
Conclusion
42
Bibliographie
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46
Annexe
Annexes
Composition des milieux de culture d’isolement Gélose MRS (Bouguerra, 2012)
(Quantité en g)
Peptone 10
D(+)-Glucose 20
Di potassium hydrogène phosphate 2.0
Agar 15
Tween 80 1 ml
-Fguiri, Imen, et al. «Isolation and characterisation of lactic acid bacteria strains from
raw camel milk for potential use in the production of fermented Tunisian dairy products.»
International Journal of Dairy Technology, 2016: 11:103-113.
-Hamed, Eman, et Aisha Elattar. «Identification and Some Probiotic Potential of Lactic
Annexe
Acid Bacteria Isolated From Egyptian Camels Milk.» Life Science Journal, 2013: 10:1952-
1961.
الملخص
وتحديدها، كانت العزالت على شكل عصوي.) ساللة من بكتريا حمض الالكتيك من لبن اإلبل23( أدت هذه الدراسة إلى عزل وتعريف ثالثة وعشرين
الهدف من هذه الدراسة هو تقييم بعض صفات البروبيوتيكية. ونحن نركز على أنواع الكتوباسيلوس بالتينيوم، الكتوباسيلوس:يتعلق بالجنس
والقدرة على تحليل، وتحمل الحموضة والصفراء، اتضح أن العزالت تظهر فعالية جيدة على التحلل البروتيني والدهون.والخصائص الفسيولوجية
، و غيلب النشاط االنحاللي و األنشطة القوية المضادة للميكروبات، )EPS( وإنتاج السكريات الخارجية، والتخلص من الكوليسترول، ملح الصفراء
.) والتجمع المشترك، والتجمع الذاتي، وبعض خصائص سطح الخلية (كره الماء، ومقاومة الليزوزيم وستة مضادات حيوية
. المقاومة، البروبيوتيكية، الالكتوباسيلوس، حليب اإلبل، البكتيريا حمض الكتيك: الكلمات المفتاحية
Résumée
Cette étude a conduit à l’isolement et l’identification de vingt-huit (23) souches de bactéries lactiques à
partir du lait de chamelle. Les isolats était de forme bâtonnets, leur identification est aboutis qui sont à le
genres: Lactobacillus ,on concentre sur l’espèces de Lb. plantarum . Le but de cette étude est l’évaluation de
quelques caractères probiotiques et propriétés physiologiques ; indiquent que les isolats présentent un bon
pouvoir protéolytique, et lipolytique, tolérance aux l’acidité et à la bile, capacité de hydrolyser les sel biliaire,
élimination du cholestérol, production d'exopolysaccharides (EPS), absence d’activité hémolytique et une fortes
activités antimicrobien , résistance au lysozyme et six antibiotiques, et quelques propriétés de surface cellulaire
(hydrophobicité, autoagrégation, co-agrégation).
Abstract
This study led to the isolation and identification of twenty-eight (23) strains of lactic acid bacteria from
camel milk. The isolates were rod shaped, their identification is about the genera: Lactobacillus, we focus on the
species of Lb. plantarum. The aim of this study is the evaluation of some probiotics characters and physiological
properties; that the indicating solates exhibit good proteolysis’ and lipolytic power, tolerance to acidity and bile,
ability to hydrolyze bile salt, elimination of cholesterol, production of exopolysaccharides (EPS), absence of
hemolytic activity and strong antimicrobial activities, resistance to lysozyme and six antibiotics, and some cell
surface properties (hydrophobicity, auto-aggregation, co-aggregation).
Key words: lactic acid bacteria, camel milk, Lactobacillus, probiotics, resistance.