Inizialmente la CBF decise di organizzare un campionato con 28 squadre. Tra queste non figuravano Botafogo e Coritiba che decisero di ricorrere ad un tribunale per vedere riconosciuto il proprio diritto a partecipare al campionato. Le due squadre vinsero la causa e così il Clube dos 13, di cui faceva parte il Botafogo, organizzò un proprio campionato, la Copa União, invitando altre 3 squadre (Coritiba, Goiás e Santa Cruz) e la CBF un torneo parallelo, il Modulo Giallo (in portogheseMódulo Amarelo) per altri 16 club.
Primo turno: 16 squadre divise in 2 gruppi di 8 club ciascuno. Nella prima fase ciascuna squadra affronta una volta tutte le componenti dell'altro girone, nella seconda tutte le componenti del proprio girone. Si qualificano alle semifinali i vincitori della prima e della seconda fase di ogni raggruppamento.
Semifinali e finale: gare in partita di andata e ritorno. In caso di parità sono previsti i tempi supplementari e, nel caso del perdurare del risultato di pareggio, i rigori, a meno che una delle due squadre abbia vinto in proprio girone in entrambie le fasi del precedente turno. In questo caso tale squadra è vincitrice in caso di pareggio.
Quadrangolare finale: la CBF decise di far disputare alle 4 finaliste dei due moduli un quadrangolare con gare di andata e ritorno per decretare il campione nazionale. Flamengo e Internacional, finalisti del Modulo Verde, tuttavia decisero di non partecipare e quindi a disputarsi il titolo e ad essere iscritte per la Coppa Libertadores 1988 dalla CBF furono Sport e Guarani, finalisti del Modulo Giallo.
Flamengo e Internacional, finalisti del Modulo Verde, rifiutarono di partecipare al quadrangolare finale. Di conseguenza il quadrangolare si ridusse a sole 2 partite in una sorta di rivincita tra le finaliste del Modulo Giallo, Sport e Guarani.
Sport campione del Brasile 1987. Successivamente, nel febbraio 2011, la CBF ha riconosciuto anche il Flamengo come vincitore del torneo 1987,[7][8] ma il 15 giugno seguente la decisione è stata revocata su ordine della 10ª Corte Federale di Primo Grado della Sezione Giudiziaria del Pernambuco,[9] che il 29 novembre 2011 ha respinto il successivo ricorso del Flamengo e quindi lo Sport è riconosciuto come unico vincitore del campionato 1987.[10][11][12]
^Le statistiche comprendono tutte le partite effettivamente giocate. Sono pertanto inclusi gli spareggi ed escluse quelle con risultato deciso a tavolino.
^16 nel Modulo Verde e 15 nel Modulo Giallo. Inizialmente anche il Modulo Giallo era previsto a 16 squadre, ma l'América-RJ rifiutò di parteciparvi.
^La CBF ha riconosciuto il Flamengo come vincitore del torneo 1987 insieme allo Sport nel febbraio 2011 ma il 15 giugno seguente la decisione è stata revocata su ordine della 10ª Corte Federale di Primo Grado della Sezione Giudiziaria del Pernambuco, che il 29 novembre 2011 ha respinto il successivo ricorso del Flamengo e quindi lo Sport è riconosciuto come unico vincitore del campionato 1987.
^abL'América-RJ fu invitato dalla CBF a partecipare al Modulo Giallo, ma si ritirò per protesta in quanto non invitata dal Clube dos 13 a partecipare al Modulo Verde, ritenuto più prestigioso.
^abcSport e Guarani interruppero i tiri di rigore sul punteggio di 11-11, decidendo di condividere il titolo di campione del Modulo Giallo. Il 22 gennaio 1988, però, il Guarani decise di rinunciare alla condivisione del titolo e quindi la CBF dichiarò vincitore del Modulo Giallo lo Sport.
^(PT) CBF reconhece título do Fla, su cbf.com.br, 21 febbraio 2011. URL consultato il 16 febbraio 2013 (archiviato dall'url originale il 23 ottobre 2012).
^(PT) Resolução da Presidência 06/2011, su cbf.com.br, 15 giugno 2011. URL consultato il 16 febbraio 2013 (archiviato dall'url originale il 23 maggio 2012).
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