In campionato gli aragonesi raggiungono il dodicesimo posto, mentre in Coppa del Re sono i protagonisti e raggiungono la vittoria.
Il loro cammino inizia ai trentaduesimi di finale, contro il modesto Mirandés. Il club di Miranda de Ebro non affronta una squadra della massima serie da doci anni e il Real Saragozza è dato come favorito[1].
All'Estadio Anduva non ci sono sorprese e il Real Saragozza passa il turno grazie ai gol di Soriano ed Espadas. Nel turno successivo, in casa del Salamanca, la partita è più combattuta e si decide soltanto ai tempi supplementari, quando Luciano Galletti regala la vittoria agli aragonesi.
Agli Ottavi di finale gli aragonesi si impongono per 3-1 sugli andalusi del Betis alla Romareda grazie a una doppietta di Drulić e a un gol di Vellisca.
Il 22 gennaio, al Camp Nou, il Real Saragozza batte il Barcellona grazie a un rigore realizzato al 90' da David Villa.
Al ritorno i catalani passano in vantaggio con Luis Garcia ma un gol di Yordi nel secondo tempo manda il Real Saragozza alle semifinali.
Gli aragonesi si contendono l'accesso alla finale con il Deportivo Alavés, club della Segunda División finalista in Coppa UEFA 2000-2001 nel 2001. A Vitoria i padroni di casa vanno in vantaggio con Vučko ma il Real Saragozza pareggia grazie a un gol del brasiliano Sávio allo scadere del secondo tempo.
A Saragozza la partita finisce a reti inviolate e così i neopromossi raggiungono la finale, che si gioca allo stadio olimpico Lluís Companys di Barcellona. Gli avversari sono i campioni di Spagna del Real Madrid, che nella stagione precedente avevano vinto il campionato.
Nel primo tempo il Real Madrid passa in vantaggio grazie a una rete realizzata da Beckham ma gli aragonesi rimontano il risultato con i gol di Daniel García Lara e David Villa. All'inizio del secondo tempo Roberto Carlos porta il risultato sul 2-2. La partita finisce in parità e si va ai tempi supplementari.
Al 110' Luciano Galletti segna il gol che sconfigge i Galacticos e regala agli aragonesi la sesta Coppa del Re della loro storia[2].