たぶん、元のPDFに埋め込まれている画像が、もともと90度回転したものなのでしょうね。 さて貼り付ける際に、 「編集」→「形式を選択して貼り付け」→ ○図（Windowsメタファイル） ○ビットマップ ○ビットマップ(DIB) ○図（拡張メタファイル） から（解像度とかファイルサイズなどの都合で）適当なもの選択し貼り付けます。 その後、貼り付けた図を選択し右クリックし、「図の書式」から、「レイアウトタブ」を選択し、前面(F)か背面(B)を選択し、いったん確定します。 もう一度、図の書式設定を選択し、「サイズ」タブを選択し、回転角度を調節してみてください。 オートシェイプの回転を利用しても、図が90度調節できるかと考えます。