フォトショップで、PDFで保存しようとする時、JPEGが選べません。

#4です。 すみません、chun-2さんご指摘のように ファイル形式を勘違いしておりました。 申し訳ないです。 「モード」から別のカラーモードを選択して 保存してみてください。 ソフト自体の不具合と思われる場合には 再インストールするか、更新情報を参考に アップデートされてみてください。

一部、回答の中でPDFとPSDを勘違いされている方がいるようですが、私の環境（MacOSX、Photoshop7.0）では、レイヤーを統合しなくても、PhotoshopPDFでの保存でエンコードにJPEGを選ぶことが可能です。 現状、私には原因は分かりませんが、お使いのOS、Photoshopのバージョンと症状が起きる経緯（全てのファイルに対してトラブルが起きるのか、特定のファイルに対してか？いつから起きるようになったか？その直前にどんな操作をしたか？環境設定をデフォルトから変えたところはあるか？など）の詳細を補足されると有効な回答が得られるかもしれません。

PDFはフォトショップでレイヤーを 複数、そのままの状態で保存したファイルです。 フォトショップ専用のファイル形式でJPEGとは 別のものです。PDF保存の選択肢にJPEGがあるわけでは ありません。 JPEG形式で保存するにはレイヤーを統合するか ファイル>>WEB用に保存、という形で保存します。 ただし、後からレイヤーを操作する事はできません。 1枚の画像になります。 後でまだ操作が必要な場合にはPDF、 これ以上操作の必要が無ければJPEGで 保存するようにすれば良いと思います。

アクロバット5.0はインストールされていますか？ どうしても駄目なら一度JPEGで出力してからPDF化にすればどうでしょうか？ アクロバットの「Distillr」で変換すると結構サイズが小さくなります

レイヤーの統合をしてから保存してください。 今度はJPEGが選択できるはずです。