イラストレーター10でのコピー

レイヤーごとにコピーアンドペーストを繰り返す場合に、位置関係がくずれないようにするには、ペーストではなくて、全面へペーストを使用すればｏｋです。

全部まとめてコピーすると、グループ化と一緒で一つのデータにまとまってしまいます。コピーされる領域（クリップボードとか言いますが）の仕様なのでしょうがありません。 どうしてもということであれば、レーヤーごとにコピペするか、別名保存したファイルに書き込むかどちらかでしょうな。