VPNが暗号化するものについて

OpenVPNなどのVPNを用いた通信間では、どのようなプロトコルを使用しているかも暗号化されるのでしょうか。 第三者から見て、暗号化プロトコルを使用していることは分かると思います。その他にファイル転送プロトコルのFTPなどを使用していることも第三者から見て分かってしまうのかという質問です。