Sequenciamento de Novas Geraçoes - Genetica - WILLIAN
Sequenciamento de Novas Geraçoes - Genetica - WILLIAN
Sequenciamento de Novas Geraçoes - Genetica - WILLIAN
aplicações
Sequênciamento de DNA
Em termos moleculares, é indubitável que a molécula de DNA é conhecida
através da leitura de sua sequência de nucleotídeos. Ou seja, a função de um gene é
determinado pelas sequências de genes conhecidos. Sendo assim, a informação da
sequência de nucleotídeos é importante para determinar a presença de mutações de
um só par de bases.
Plataforma 454: O princípio desta tecnologia foi proposto por Hyman (1988), mas
somente em 2005 tivemos o primeiro sequenciador de segunda geração. Essa
tecnologia dispensa a clonagem e tem baixo custo (comparado a outros métodos
existentes), e o sistema de sequenciamento é cerca de 100 vezes mais rápido quando
comparado ao método de sequenciamento padrão de Sanger. A eficiência e rapidez
da técnica foram comprovadas pelo ressequenciamento do genoma da bactéria
Mycoplasma genitalium com 96% de cobertura e 99.96% de precisão num único
processamento de quatro horas. Este método pode ser dividido em três etapas:
Ion Torrent: Nesse método, a maioria dos sequenciadores utiliza apenas uma
DNA polimerase para gerar a fita complementar ao template, bases marcadas por
fluoroforos, e câmeras a detecção. O Ion Torrent é diferente pois a sua detecção é
reflexo de um processo direto, ou seja, a reação de polimerização gera naturalmente
um H+3, ou seja, um próton, que altera o pH do meio. Essa alteração do pH é
detectada por um transistor ISFET e convertida em um sinal elétrico.
APLICAÇOES
- http://www.scielo.br/pdf/cr/v40n3/a505cr1820.pdf
- http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/5/5166/tde-29102015-115502/pt-br.php
- http://lvaruzza.com/files/apostila_bioinfo_2.0.1.pdf
- http://www.bioqmed.ufrj.br/docentes/textos/next-generation-sequencing-estado-
da-arte/