TRPV2

TRPV2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2F37
Ідентифікатори
Символи	TRPV2, VRL, VRL-1, VRL1, transient receptor potential cation channel subfamily V member 2
Зовнішні ІД	OMIM: 606676 MGI: 1341836 HomoloGene: 7993 GeneCards: TRPV2
Реагує на сполуку
Канабідіол, амілорид
Онтологія гена Молекулярна функція • ion transmembrane transporter activity • ion channel activity • cation channel activity • calcium channel activity Клітинна компонента • цитоплазма • integral component of membrane • cell body • мембрана • Меланосома • клітинна мембрана • growth cone membrane • axonal growth cone • integral component of plasma membrane • внутрішньоклітинний • cell surface • аксон Біологічний процес • sensory perception • response to heat • ion transport • positive regulation of calcium ion import • calcium ion transmembrane transport • positive regulation of axon extension • response to temperature stimulus • calcium ion transport • трансмембранний транспорт • positive regulation of cold-induced thermogenesis Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	51393	22368
Ensembl	ENSG00000187688	ENSMUSG00000018507
UniProt	Q9Y5S1	Q9WTR1
RefSeq (мРНК)	NM_016113	NM_011706 NM_001382489 NM_001382490 NM_001382491 NM_001382492
RefSeq (білок)	NP_057197	NP_035836 NP_001369418 NP_001369419 NP_001369420 NP_001369421
Локус (UCSC)	Хр. 17: 16.42 – 16.44 Mb	Хр. 11: 62.47 – 62.49 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TRPV2 (англ. Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 764 амінокислот, а молекулярна маса — 85 981.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MTSPSSSPVF		RLETLDGGQE		DGSEADRGKL		DFGSGLPPME		SQFQGEDRKF
APQIRVNLNY		RKGTGASQPD		PNRFDRDRLF		NAVSRGVPED		LAGLPEYLSK
TSKYLTDSEY		TEGSTGKTCL		MKAVLNLKDG		VNACILPLLQ		IDRDSGNPQP
LVNAQCTDDY		YRGHSALHIA		IEKRSLQCVK		LLVENGANVH		ARACGRFFQK
GQGTCFYFGE		LPLSLAACTK		QWDVVSYLLE		NPHQPASLQA		TDSQGNTVLH
ALVMISDNSA		ENIALVTSMY		DGLLQAGARL		CPTVQLEDIR		NLQDLTPLKL
AAKEGKIEIF		RHILQREFSG		LSHLSRKFTE		WCYGPVRVSL		YDLASVDSCE
ENSVLEIIAF		HCKSPHRHRM		VVLEPLNKLL		QAKWDLLIPK		FFLNFLCNLI
YMFIFTAVAY		HQPTLKKQAA		PHLKAEVGNS		MLLTGHILIL		LGGIYLLVGQ
LWYFWRRHVF		IWISFIDSYF		EILFLFQALL		TVVSQVLCFL		AIEWYLPLLV
SALVLGWLNL		LYYTRGFQHT		GIYSVMIQKV		ILRDLLRFLL		IYLVFLFGFA
VALVSLSQEA		WRPEAPTGPN		ATESVQPMEG		QEDEGNGAQY		RGILEASLEL
FKFTIGMGEL		AFQEQLHFRG		MVLLLLLAYV		LLTYILLLNM		LIALMSETVN
SVATDSWSIW		KLQKAISVLE		MENGYWWCRK		KQRAGVMLTV		GTKPDGSPDE
RWCFRVEEVN		WASWEQTLPT		LCEDPSGAGV		PRTLENPVLA		SPPKEDEDGA
SEENYVPVQL		LQSN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до іонних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт, транспорт кальцію. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані.

Література

• Caterina M.J., Rosen T.A., Tominaga M., Brake A.J., Julius D. (1999). A capsaicin-receptor homologue with a high threshold for noxious heat. Nature. 398: 436—441. PMID 10201375 DOI:10.1038/18906
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• McCleverty C.J., Koesema E., Patapoutian A., Lesley S.A., Kreusch A. (2006). Crystal structure of the human TRPV2 channel ankyrin repeat domain. Protein Sci. 15: 2201—2206. PMID 16882997 DOI:10.1110/ps.062357206

Див. також

• Хромосома 17