Biologi Molekuler

DNA merupakan materi yang membentuk kromosom-kromosom dan juga merupakan informasi genetik yang tersimpan dalam tubuh makhluk hidup. Informasi genetik ini pada dasarnya merupakan kumpulan instruksi/perintah yang mengatur sel untuk bisa melakukan hal-hal tertentu. Molekul DNA dalam suatu sel dapat diekstraksi atau diisolasi untuk berbagai macam keperluan seperti amplifikasi dan analisis DNA melalui elektroforesis. Isolasi DNA dilakukan dengan tujuan untuk memisahkan DNA dari bahan lain seperti protein, lemak, dan karbohidrat. Isolasi DNA adalah proses pengeluaran DNA dari tempatnya berada (ekstraksi atau lisis) biasanya dilakukan dengan homogenasi dan penambahan buffer ekstraksi atau buffer lisis untuk mencegah DNA rusak. Prisnsip utama dalam isolasi DNA ada tiga yakni penghancuran (lisis), ektraksi atau pemisahan DNA dari bahan padat seperti selulosa dan protein, serta pemurnian DNA. Ada beberapa hal yang perlu diperhatikan dalam proses isolasi DNA antara lain harus menghasilkan DNA tanpa adanya kontaminan seperti protein dan RNA; metodenya harus efektif dan bisa dilakukan untuk semua spesies metode yang dilakukan tidak boleh mengubah struktur dan fungsi molekul DNA; dan metodenya harus sederhana dan cepat. Analisis tingkat molekuler dengan DNA sebagai objeknya diawali dengan proses ektraksi DNA untuk mendapatkan DNA yang murni dengan konsentrasi tinggi sehingga dapat digunakan untuk analisis molekuler selanjutnya, seperti PCR,(Fatchiyah , 2011). Ekstraksi DNA dapat dilakukan dengan berbagai metode, baik konvensional maupun menggunakan kit. Ekstraksi DNA secara konvensional bisa dilakukan antara lain dengan metode CTAB/NaCl (Mulyani et al., 2011),metode SDS, dan metode fenol kloroform. Seiring perkembangan ilmu pengetahuan dan teknologi, ektraksi DNA dapat dilakukan menggunakan kit dari berbagai merk. Bahkan beberapa teknik menjadi lebih mudah dengan menggunakan kit yang diproduksi oleh suatu perusahaan. Namun tahapan-tahapan isolasi DNA dalam setiap langkahnya memiliki protokol sendiri yang disesuaikan dengan keperluan. Pada praktikum kali ini praktikan menggunan Kit Ekstraksi DNA gSYNC ™ , kit ini dioptimalkan untuk pemurnian DNA genomik, mitokondria, dan virus seluruh darah (darah segar dan darah beku), jaringan, jaringan yang tertanam parafin-formalin cairan ketuban, serangga dan sperma dalam satu kit. Kit ekstraksi DNA ini menggunakan Proteinase K dan garam chaotropic untuk melisiskan sel dan mendegradasi protein, memungkinkan DNA untuk mengikat matriks bertujuan untuk memisahkan DNA dari makromolekul sel lainnya. Kontaminan dipisahkan menggunakan Wash Buffer dan DNA genomik murni dielusi dengan buffer, TE atau air. Seluruh prosedur dapat diselesaikan dalam 20 menit tanpa ekstraksi fenol / kloroform atau pengendapan alkohol. DNA yang dimurnikan (sekitar 20-30 kb) cocok untuk digunakan dalam PCR atau reaksi enzimatik lainnya. (Geneaid, 2017). B. Tujuan Praktikum Mahasiswa mampu mengisolasi DNA menggunakan Kit Ekstraksi DNA gSYNC ™.

Genetika adalah telaah mengenai pewarisan dan keragaman ciri-ciri suatu organisme. Serealia atau tumbuhan rumput-rumputan berbiji merupakan tumbuhan yang menyuplai 50% makanan pokok penduduk dunia. Namun, serealia tidak memiliki simbion bakteri akar-akarnya untuk memfiksasi nitrogen, sehingga kebutuhan nitrogen (N2) diperoleh dari penambahan pupuk buatan. Salah satu contoh tanaman serealia yang sangat dibutuhkan adalah gandum (Triticum aestivum L). Untuk itu diperlukan bantuan rekombinasi gen agar tanaman tersebut dapat bersimbiosis dengan bakteri pengikat nitrogen tanah. Azotobacter chroococum adalah spesies yang paling sering ditemui di dalam tanah. Azotobacter mampu mengubah nitrogen (N2) dalam atmosfer menjadi amonia (NH4+) melalui proses pengikatan nitrogen dimana ammonia diubah menjadi protein yang dibutuhkan oleh tanaman. Rekombinasi gen yang digunakan pada peningkatan nitrogen tanah ini adalah transformasi gen.

NIK : P07134019086R Dibuat skema dan penjelasan singkat kontrol siklus sel selain checkpoint fase siklus sel Sistem kontrol siklus sel bisa dianalogikan dgn sistem kontrol pada mesin cuci otomatis, seperti pengatur waktu mesin cuci, sistem kontrol siklus sel berjalan sendiri menurut jam internalnya. Mesin cuci otomatis dipengaruhi oleh faktor internal (misalnya sensor air) dan faktor eksternal (misalnya penyalaan saklar on/off). Begitu pula pada siklus sel, diregulasi pada titik-titik pemeriksaan (checkpoint) tertentu oleh sinyal internal maupun eksternal. Checkpoint adalah titik kontrol saat sinyal berhenti dan sinyal maju terus dapat meregulasi siklus. Keterangan Skema : Sistem Kontrol Pada Siklus Sel Terjadi Pada 3 Tahapan. Pertama, pada akhir fase G1 akan masuk fase S. Kedua, pada akhir fase G2 mau masuk fase M. Ketiga, pada fase M. Pada fase G1 dimulai dengan melakukan kontrol mengecek kesiapan sel. Lalu lanjut ke fase S untuk penggandaan materi genetik. Lanjut ke fase G2 untuk memastikan sel siap membelah. Terakir ke fase M untuk proses pembelahan sel.