The PhD training program at IBAR organized under the auspices of the Romanian Academy is designed for highly motivated students, graduates from natural sciences, or medical school wishing to obtain an academic formation in biochemistry and molecular biology. The PhD training program is part of the SCOSAAR- Advanced Studies School of the Romanian Academy.
The PhD program is conceived to educate students dedicated to research, aiming at pursuing internationally competitive careers in universities, governmental research institutes or private companies.
The mentored research area covered by the doctorate program includes: molecular mechanisms of proteins synthesis and degradation, molecular and cell biology, enzymology, structural biochemistry, bioinformatics and molecular modelling with applications in cancer, diabetes and immunology.
Doctoral candidates should own a diploma in biology, chemistry, physics, medical studies, pharmacy. Students with excellent academic qualifications and a strong commitment for research are encouraged to apply.
For any further details, please contact Dr. Stefana Petrescu, Tel: (+4) .021.223.90.69, e-mail: stefana.petrescu@biochim.ro.
Molecular Cell Biology - PhD Supervisor: Ştefana M Petrescu, PhD
Ştefana M Petrescu is running the Department of Molecular Cell Biology. Dr Petrescu's research aims to understand the folding and degradation pathways regulating protein synthesis and maturation within the endoplasmic reticulum of mammalian cells., with significant contributions in the development of glycobiology by deciphering the association of calnexin with glycoproteins during folding. Other major research topics include: -Protein degradation associated with the ER, ERAD, and the particular function of EDEM family proteins in this pathway - Proinsulin folding and maturation within the ER, a process that influences proinsulin conversion to insulin and insulin secretion in the pancreatic islets - Role of ERAD in the antigen processing and presentation pathway -Proteomics and discovery of new biomarkers in pancancers.
Molecular Virology - PhD Supervisor: Norica-Beatrice Nichita, PhD
Norica Nichita is a senior researcher at the Institute of Biochemistry and the head of the Molecular Virology Department, which studies mainly hepatic viruses (HBV and HCV), but also other pathogens of economic or public health relevance. The group is focused on two main research directions: a) understanding the virus-cell host interactions at molecular level with the aim to identify novel targets for antiviral therapies; b) development of prophylactic strategies to combat HBV and HCV infections, by designing and producing viral antigens with improved immunogenic properties in alternative expression systems. Dr. Nichita has been coordinating national and international projects that have significantly contributed to our current understanding of HBV infection, intracellular trafficking and protein degradation. The group has successfully demonstrated in premiere the feasibility to use plants and algae for expression of high-quality complex viral glycoproteins that trigger virus neutralizing immune response in vaccinated animals, thus paving the way for the development of a biotechnological platform for cost-efficient production of novel vaccine candidates.
Enzymology - PhD Supervisor: Ștefan Eugen Szedlacsek, PhD
Ștefan Eugen Szedlacsek is Head of the Enzymology Department at the Institute of Biochemistry of the Romanian Academy. He holds a Ph.D. in Biotechnology from the Polytechnic University of Bucharest, a Master's degree in Organic Synthesis (Polytechnic University of Bucharest) and a Master's degree in Mathematics (University of Bucharest). Professor Szedlacsek is a fellow of the Alexander von Humboldt Foundation (Germany) and the Fulbright Foundation (USA). The central research theme of Professor Szedlacsek and his team is the study of the structure-function relationship of enzymes involved in cell signalling and their application in diagnosis and therapy. Specific ongoing research projects include: - Identification of signalling mechanisms involved in tumourigenesis; - Novel affibody-based molecular vectors for tumour diagnosis and therapy; - Investigation of the mechanism of action of interference peptides involved in the inhibition of neuronal AMPA receptor internalisation (US patent recently granted).
Bionformatics and Structural Biochemistry - PhD Supervisor: Andrei-J. Petrescu, PhD
Andrei-J. Petrescu, Professor at the School of Advanced Studies of the Romanian Academy, has established and coordinates the Department of Bioinformatics and Structural Biochemistry of the Institute of Biochemistry of the Romanian Academy which aims to develop computational assisted experimental research in biochemistry, molecular biology and life sciences at molecular level in general. In his research Andrei focuses on finding most efficient ways to combine bioinformatics, molecular modeling and simulation, systems biology, machine learning or drug design with physical biochemistry techniques, site directed mutagenesis and mass spectrometry in understanding structure function relations, evolution and molecular optimization of complex bio-molecular systems with large number of applications in many fields of molecular life sciences such as from immunobilology or glycobiology to pharmacology or biotechnology.
Programul de doctorat al Institutului de Biochimie (IBAR), organizat sub auspiciile Academiei Române, se adresează studenților de performanta, absolvenți cu studii superioare în științe naturale sau medicină care doresc o formare academică în biochimie și biologie moleculară. Formarea doctorală IBAR face parte din Școala de Studii Avansate a Academiei Române (SCOSAAR).
Programul de doctorat este conceput pentru a educa studenți dedicați cercetării, care au ca scop să urmeze cariere competitive internaționale, în universități, institute guvernamentale sau companii private.
Domeniul de cercetare acoperit de programul de doctorat include: mecanisme moleculare de sinteză și degradare a proteinelor, biologie celulară și moleculară, enzimologie, biochimie structurală, bioinformatică și modelare moleculară, cu aplicații în cancer, diabet și imunologie.
Candidații la doctorat trebuie să dețină o diplomă în biologie, chimie, fizică, sau medicină. Studenții cu calificări academice excelente și un angajament puternic în cercetarea de laborator sunt încurajați să aplice.
Pentru detalii, vă rugăm să o contactați pe dna dr. Stefana Petrescu, tel: (+4) .021.223.90.68, e-mail: stefana.petrescu@biochim.ro.
Biologie Moleculară si Celulară - Conducător de doctorat: Ştefana M Petrescu, PhD
Ştefana M Petrescu este cercetător stiinţific gradul I în cadrul Institutului de Biochimie al Academiei Române si conducător al Departamentului de Biologie Moleculară si Celulară. Interesele sale de cercetare stiinţifică in domeniul biochimiei si biologiei moleculare se centrează pe dezvoltarea domeniului stiintei proteinelor, scopul principal al cercetărilor fiind inţelegerea proceselor de reglare a homeostaziei proteinelor. Contribuţiile aduse in acest domeniu se referă la: a) dezvoltarea glicobiologiei prin inţelegerea mecanismelor fundamentale ale asocierii calnexinei cu glicoproteinele in reticulul endoplasmic; b) definirea familiei de proteine inrudite cu tirozinaza ca nou model de studiu pentru investigarea proceselor de maturare a proteinelor; c) identificarea rolului proteinelor EDEM in procesele de degradare ale glicoproteinelor.
Virusologie Moleculară - Conducător de doctorat: Norica-Beatrice Nichita, PhD
Norica Nichita este cercetător stiinţific gradul I în cadrul Institutului de Biochimie si conducător al Departamentului de Virusologie Moleculara, care se ocupă cu studiul virusurilor hepatice B si C (HBV si HCV). Interesele sale de cercetare si activitatea stiinţifică actuală se concentrează pe două direcţii principale: a) inţelegerea interacţiei virus - celulă gazd ă la nivel molecular si identificarea de noi ţinte pentru terapia antivirală si b) dezvoltarea de strategii profilactice pentru combaterea infecţiilor cu HBV si HCV, prin obţinerea de antigene virale in sisteme alternative de producţie si caracterizarea proprietăţilor imunogenice ale acestora. În acest sens, Dr. Norica Nichita a coordonat mai multe proiecte nationale si internaţionale de cercetare care s-au concretizat cu stabilirea mecanismului de internalizare a HBV, descifrarea căilor intracelulare de transport si degradare, precum si cu producerea in plante, in premiera, a unor antigene virale HBV/HCV noi care induc raspuns imun neutralizant al infecţiei virale, in animale vaccinate.
Enzimologie - Conducător de doctorat: Ștefan Eugen Szedlacsek, PhD
Ștefan Eugen Szedlacsek este șeful Departamentului de Enzimologie din cadrul Institutului de Biochimie al Academiei Române. Este doctor în Biotehnologie la Universitatea Politehnică din București, are un master în Sinteză Organică (Universitatea Politehnică din București) și un master în Matematică (Universitatea din București). Profesorul Szedlacsek este bursier al Fundației Alexander von Humboldt (Germania) și al Fundației Fulbright (SUA). Tema centrală de cercetare a profesorului Szedlacsek și a echipei sale este studiul relației structură-funcție a enzimelor implicate în semnalizarea celulară și aplicarea lor în diagnostic și terapie. Proiectele specifice de cercetare în curs de desfășurare includ: - Identificarea mecanismelor de semnalizare implicate în tumorigeneză; - Noi vectori moleculari pe bază de affibody pentru diagnosticarea și terapia tumorilor; - Investigarea mecanismului de acțiune a peptidelor de interferență implicate în inhibarea internalizării receptorilor AMPA neuronali (brevet american recent acordat).
Bioinformatică şi Biochimie Structurală - Conducător de doctorat: Andrei-J. Petrescu, PhD
Andrei-J. Petrescu, profesor în cadrul Şcolii de Studii Avansate a Academiei Române, a înfiinţat şi coordonează Departamentul de Bioinformatică şi Biochimie Structurală al Institutului de Biochimie al Academiei Române care a dezvoltat în premieră în România tehnicile de cercetare experimentală asistată computaţional în domeniul biochimiei şi biologiei la nivel molecular. Cercetările dr. Andrei-J. Petrescu se concentrează pe identificarea celor mai eficiente căi de îmbinare a tehnicilor de modelare şi simulare moleculară, bioinformatică, biologie sistemică, machine learning sau drug design cu cele experimentale de biochimie fizică, mutageneză dirijată, spectrometrie de masă în înţelegerea bazelor moleculare ale vieţii, a evoluţiei şi optimizărilor moleculare cu aplicaţii în rezolvarea unei palete largi de probleme concrete în biochimie, biologie moleculară, imunobiologie, glicobiologie şi farmacologie.
ID Candidat | Nota finală la probele susținute | Conducător de doctorat | Admis* | |
Cu bursă | Fără bursă | |||
125 | 9,80 | Dr. Andrei J Petrescu | DA | - |
127 | 9,80 | Dr. Norica Nichita | DA | - |
126 | 9,75 | Dr. Stefana Petrescu | DA | - |
124 | 9,70 | Dr. Stefana Petrescu | DA | - |
123 | 9,65 | Dr. Norica Nichita | DA | - |
131 | 9,50 | Dr. Stefan Szedlacsek | DA | - |
Conducator doctorat | Nr. locuri stipendiu | Tematică și bibliografie |
---|---|---|
Dr. Ştefana M Petrescu | 2 |
Biologie moleculara si celulara
Alberts - Molecular Biology Of The Cell_5th.Ed, Capitole : 3. Proteins; 8. Manipulating proteins, DNA and RNA; 9. Visualising cells; 12. Intracellular Compartments and Proteins sorting
New panel of biomarkers to discriminate between amelanotic and melanotic metastatic melanoma , IV Militaru et al., Frontiers in Oncology 12, 1061832, doi: 10.3389/fonc.2022.1061832
Affinity proteomics and deglycoproteomics uncover novel EDEM2 endogenous substrates and an integrative ERAD network CVA Munteanu et al, Mol Cell Proteomics 2021:20:100125. doi: 10.1016/j.mcpro.2021.100125
Bi-allelic variants in the ER quality-control mannosidase gene EDEM3 cause a congenital disorder of glycosylation, Daniel L. Polla, Am J Hum Genet. 2021 Jul 1; 108(7): 1342–1349. doi: 10.1016/j.ajhg.2021.05.010
Proteogenomic characterization of 2002 human cancers reveals pan-cancer molecular subtypes and associated pathways, Yiqun Zhang, et al, Nature Communications volume 13, Article number: 2669 (2022) https://doi.org/10.1038/s41467-022-30342-3 |
Dr. Stefan E Szedlacsek | 4 |
Enzimologie si semnalizare celulara
"Lehninger principles of biochemistry - David L. Nelson, Michael M. Cox. New York, W.H. Freeman,6th Edition (2013)" Capitolele: 3. Amino Acids, Peptides, and Proteins 4. The Three-Dimensional Structure of Proteins 6. Enzymes 8. Nucleotides and Nucleic Acids 9. DNA-Based Information Technologies
12. Biosignaling
|
Dr. Andrei-J. Petrescu | 2 |
Bioinformatică şi Biocalcul Structura şi interacţiile sistemelor biologice la nivel molecular
Bioinformatică, Biocalcul şi Biologie sistemică
Shaik NA, Hakeem KR, Banaganapalli B, Elango R (eds) Essentials of Bioinformatics Vol. 1, 2, 3 - Springer Nature Switzerland AG, 2019 ISBN 978-3-030-02633-2, 978-3-030-18374-5, 978-3-030-19317-1
Momand J, McCurdy A. Concepts in Bioinformatics and Genomics - Oxford University Press, 2017 ISBN 9780199936991
Bassi S. Python for bioinformatics - Boca Raton CRC Press, 2017 ISBN 9781138094376
Bourne PE, Helge W (eds) Structural bioinformatics, Willey-Liss, 2003 ISBN 0-471-20200-2
Schwede T, Peitsch MC. (eds) Computational Structural Biology: Methods and Applications - World Scientific Publishing, 2008 ISBN 978-981-277-877-2 |
Dr. Norica B Nichita | 4 |
Virusologie Moleculara Dezvoltarea de tratamente antivirale si profilactice in infectiile virale. Investigarea mecanismelor moleculare care care stau la baza relatiei patogen-celula gazda.
Alberts - Molecular Biology Of The Cell_5th.Ed, Capitole : 3. Proteins; 8. Manipulating proteins, DNA and RNA; 9. Visualising cells; 12. Intracellular Compartments and Proteins sorting
The role of autophagy in viral infections, Chen et al. Journal of Biomedical Science (2023) 30:5; https://doi.org/10.1186/s12929-023-00899-2
Antiviral Approaches against Influenza Virus, Kumari et al. Clin Microbiol Rev (2023) 36:e00040-22. https://doi.org/10.1128/cmr.00040-22
HBV Infection and Host Interactions: The Role in Viral Persistence and Oncogenesis, Int. J. Mol. Sci. 2023, 24(8), 7651; https://doi.org/10.3390/ijms24087651 |
Lista cu numarul de locuri propuse spre aprobare pentru inscrierea la doctorat in anul universitar 2023-2024.
Conducator doctorat | Nr. locuri solicitate | ||
---|---|---|---|
fara stipendiu | cu stipendiu | ||
1 | Dr. Petrescu Ştefana Maria | 0 | 1 |
2 | Dr. Szedlacsek Ştefan Eugen | 0 | 1 |
3 | Dr. Petrescu Andrei Jose | 0 | 1 |
4 | Dr. Nichita Norica Beatrice | 0 | 1 |
ID Candidat | Conducător de doctorat | Nota finală la probele susținute | Admis* | |
Cu bursă/ stipendium | Fără bursă/ stipendium | |||
15d | Dr. Stefana M. Petrescu | 10 | DA | - |
16d | Dr. Norica B. Nichita | 10 | DA | - |
12d | Dr. Andrei J. Petrescu | 10 | DA | - |
Approved student positions at the Institute of Biochemistry: 4.
PhD Advisor | Training topic | Number of open positions | Bibliography | ||
---|---|---|---|---|---|
without bursary | with bursary | ||||
1 | Dr. Petrescu Ştefana Maria | Cellular and molecular biology | 0 | 2 | bibliography |
2 | Dr. Szedlacsek Ştefan Eugen | Enzimology and cellular signaling | 0 | 2 | bibliography |
Total: 4 |
Candidate | PhD Advisor | With/without bursary |
---|---|---|
NĂVLIGU A.M. DIANA GEORGIANA | Dr. Ştefana Petrescu | with bursary |
Approved student positions at the Institute of Biochemistry: 8.
PhD Advisor | Training topic | Number of open positions | Bibliography | ||
---|---|---|---|---|---|
without bursary | with bursary | ||||
1 | Dr. Petrescu Ştefana Maria | Cellular and molecular biology | 0 | 2 | bibliography |
2 | Dr. Szedlacsek Ştefan Eugen | Enzimology and cellular signaling | 0 | 2 | bibliography |
3 | Dr. Petrescu Andrei Jose | Bioinformatics and structural biology | 1 | 2 | bibliography |
4 | Dr. Nichita Norica Beatrice | Molecular virusology | 0 | 1 | bibliography |
Total: 8 |
Candidate | PhD Advisor | With/without bursary |
---|---|---|
TECUCIANU I. RAMONA MIHAELA | Dr. Ştefana Petrescu | with bursary |
TUDOR V.C. MONICA | Dr. Ştefana Petrescu | with bursary |
COȘOREANU L. L. ANDRA-ELENA | Dr. Ștefan Eugen Szedlacsek | with bursary |
BUZĂȚOIU I. ȘTEFANIA-ARIADNA | Dr. Norica Nichita | with bursary |
TRIȚĂ A.G. CRISTIANA | Dr. Norica Nichita | with bursary |
BECTAȘ FLORIANA-SIBEL | Dr. Andrei Petrescu | with bursary |
MANOLIU R. LAURA CRISTINA-ELENA | Dr. Andrei Petrescu | without bursary |
TRIF E. COSMIN | Dr. Andrei Petrescu | with bursary |
For the registration to the doctoral colloquium, the Romanian candidates must bring the following documents:
Approved student positions at the Institute of Biochemistry: 7.
PhD Advisor | Training topic | Number of open positions | Bibliography | ||
---|---|---|---|---|---|
without bursary | with bursary | ||||
1 | Dr. Petrescu Ştefana Maria | Cellular and molecular biology | 0 | 2 | bibliography |
2 | Dr. Szedlacsek Ştefan Eugen | Enzimology and cellular signaling | 0 | 2 | bibliography |
3 | Dr. Petrescu Andrei Jose | Bioinformatics and structural biology | 0 | 2 | bibliography |
4 | Dr. Nichita Norica Beatrice | Molecular virusology | 0 | 1 | bibliography |
Total: 7 |
Following the contest on September 8-9, 2020, 6 candidates were accepted.
PhD Field | PhD Advisor | Approved candidates |
---|---|---|
Biology | Dr. Petrescu Ştefana Maria | Chiosa I. Andrei-Cosmin |
Biology | Dr. Nichita Norica Beatrice | Dore I. Ioana-Mădălina |
Biology | Dr. Petrescu Andrei Jose |
Șulea A. Teodor Asvadur
Ursu Gh. Eugen |
Biology | Dr. Szedlacsek Ştefan Eugen |
Puiu T.M. Adina–Gabriela
Vasilescu A. Andrei Mihai |
Admiterea la programul de doctorat se acordă pe baza unui examen care va fi organizat la Institutul de Biochimie.
Pentru admiterile din 2019, înregistrarea se poate face prin depunerea unei cereri la Institutul de Biochimie, Splaiul Independenței 296, Sector 6, București, în perioada 02-13 septembrie 2019.
Examenul va avea loc în perioada 16-27 septembrie 2019, la aceeași instituție, la etajul al doilea. Bibliografia pentru examen va fi pusă la dispoziția concurenților pe site-urile web ale Institutului de Biochimie și ale SCOSAAR începând cu 20 august 2019.
Rezultatele examenului vor fi făcute publice înainte de 30 septembrie 2019, iar rezultatele finale vor fi făcute publice pe 8 octombrie 2019.
Examenul lingvistic va avea loc numai în instituții certificate. Vor fi acceptate, certificatele care au fost acordate de instituții aprobate de SCOSAAR în ultimii 2 ani.
For the registration to the doctoral colloquium, the Romanian candidates must bring the following documents:
Approved student positions at the Institute of Biochemistry: 9.
PhD Advisor | Training topic | Number of open positions | Bibliography | ||
---|---|---|---|---|---|
without bursary | with bursary | ||||
1 | Dr. Petrescu Ştefana Maria | Cellular and molecular biology | 0 | 2 | bibliography |
2 | Dr. Szedlacsek Ştefan Eugen | Enzimology and cellular signaling | 0 | 2 | bibliography |
3 | Dr. Petrescu Andrei Jose | Bioinformatics and structural biology | 0 | 1 | bibliography |
4 | Dr. Nichita Norica Beatrice | Molecular virusology | 1 | 3 | bibliography |
Total: 9 |
Following the contest on September 24, 2019, 6 candidates were accepted.
PhD Field | PhD Advisor | Approved candidates |
---|---|---|
Biology | Dr. Petrescu Ştefana Maria |
Anghel G. Sorina Andreea with bursary
Orobeți N. (Iosub) Cristina Ștefana with bursary |
Biology | Dr. Nichita Norica Beatrice |
Cucoș S.V. Lia Maria with bursary
Pantazică GH. Ana-Maria with bursary Ghionescu S.A. Alina-Veronica with bursary |
Biology | Dr. Petrescu Andrei Jose | Sârghie O. Larisa with bursary |
Total: 6. 6 with bursary, 0 without. |
Admiterea candidatilor la doctorat se face prin concurs, care se organizeaza la sediul Institutului de Biochimie.
Pentru sesiunea octombrie 2018 inscrierile se vor face la sediul Institutului de Biochimie, Splaiul Independentei 296, Sector 6, Bucuresti, in perioada 10-21 septembrie 2018.
Concursul se va desfasura in perioada 1 - 12 octombrie 2018, in acelasi sediu, etajul 2. Bibliografia aferenta colocviului este disponibila candidatilor pe site-ul Institutului de Biochimie.
Rezultatele finale vor fi afisate pe data de 26 octombrie 2018.
Examenul de competente lingvistice se sustine in cadrul institutiilor acreditate. Sunt acceptate si certificatele de competente lingvistice eliberate in ultimii 2 ani de catre institutii recunoscute de SCOSAAR.
Approved student positions at the Institute of Biochemistry: 8.
PhD Advisor | Training topic | Number of open positions with bursary | Bibliography | ||
---|---|---|---|---|---|
1 | Dr. Petrescu Ştefana Maria | Cellular and molecular biology | 1 | bibliography | |
2 | Dr. Nichita Norica Beatrice | Molecular virusology | 2 | bibliography | |
3 | Dr. Szedlacsek Ştefan Eugen | Enzimology and cellular signaling | 2 | bibliography | |
4 | Dr. Elena Ganea | plierea si deplierea proteinelor | 1 | bibliography | |
5 | Dr. Petrescu Andrei Jose | Bioinformatics and structural biology | 2 | bibliography | |
Total: 8 |