O Conselho Disciplinar é o órgão de consulta do Reitor no exercício do poder disciplinar. Compete a este órgão a emissão de parecer para aplicação de penas graves, de acordo com o estabelecido no artigo 66.ᵒ dos Estatutos.
Nos termos do disposto no artigo 67.ᵒ dos Estatutos, o Conselho Disciplinar é composto pelo Reitor ou um professor por ele designado, que preside, dois professores ou investigadores, dois estudantes e dois representantes do pessoal não docente e não investigador. O órgão reúne sempre que convocado pelo presidente. Os membros não podem abster-se.
Membros
Presidente: Mário João Ferreira Monte, Professor;
José Bernardo Rodrigues Brilha, Professor;
Paula Cristina Costa Alves Monteiro Ludovico, Professora;
Tiago José dos Santos Nogueira, Estudante;
Tito Castelo David Correia, Estudante;
José Carlos Salgado Azevedo, Trabalhador Não Docente e Não Investigador;
Vítor Alexandre Abreu Pacheco, Trabalhador Não Docente e Não Investigador.