(Note: This post is an excerpt from #182 of the Research Computing Teams Newsletter) So you, reader, will already understand that software is not “sustainable”. There’s no sustainability linter you can run over the code to highlight possible sustainability issues, no test suite you can run to check for sustainability regressions. Sustainability is not an inherent property of a piece of software. S
「高性能プログラミング」という観点で調べてみた。 まずは、 高性能プログラミング（名古屋大学 須田礼仁先生） (2011/11/08追記左はリンク切れの模様．)→高性能プログラミング 高性能プログラミング May9.gzに含まれているpptの出来に感動。キャッシュ、キャッシュライン、TLB、パイプライン等をここまで考慮してプログラムを書ける人ってほとんどいないと思う。プログラマ必読。この資料を使った昨日の須田先生の授業は今まで受けた授業で一番面白かった。 高性能並列プログラミング環境 建部修見先生1対1通信の注意点（１） •メッセージ到着順 –（2者間では）メッセージは追い越されない –3者間以上では追い越される可能性がある 1対1通信の注意点（２） •公平性 –通信処理において公平性は保証されない –P1とP2がP0にメッセージ送信 –P0は送信元を指定しないで受信を複数発行 •P0はP
MPI C++ Examples MPI is a directory of C++ programs which illustrate the use of the Message Passing Interface for parallel programming. MPI allows a user to write a program in a familiar language, such as C, C++, FORTRAN, or Python, and carry out a computation in parallel on an arbitrary number of cooperating computers. Overview of MPI A remarkable feature of MPI is that the user writes a single p
MPI「超」入門（C言語編） MPI「超」入門（C言語編） 東京大学情報基盤センター FOTRAN編は以下 http://nkl cc u tokyo ac jp/seminars/T2Kfvm/MPIprogf pdf http://nkl.cc.u-tokyo.ac.jp/seminars/T2Kfvm/MPIprogf.pdf Fundamental MPI 1 1 概要 概要 MPIとは • MPIとは • MPIの基礎：Hello World • 全体データと局所データ 全体デ タと局所デ タ • グループ通信（Collective Communication） • 1対1通信（Point-to-Point Communication） • 1対1通信（Point-to-Point Communication） Fundamental MPI 2 2 MPIとは （1/2） •
（2009年7月21日更新） 注意 原稿をイメージデータとして読み込んでPDFファイル化したため ､ サイズが大きくなっています。 全ページを含むファイルと ､ 章(またはいくつかの節)ごとに分割したファイルの2種類があります（内容は同じです）。 テキストの内容は今後不定期に加筆修正します ｡ ファイル名の末尾についている ｢20xx-xx-xx ｣ は、そのファイル内のページが最後に更新された日付を示します ｡ 簡易製本する際は ､i, iii, vページ(vは(2)のみ) ､ および本文の奇数ページ(例えば1-1,1-3, ･ ･ ･,2-1,2-3, ･ ･ ･)が ､ 見開きした右側のページになるようにして下さい ｡ 下記資料に関するお問い合わせは までご連絡下さい ｡ (1) 「チューニング技法入門」(旧「チューニング技法虎の巻」) 「スカラー・チューニング講習会」 で配
Xgridについて Appleによるxgridについての概要はここにあります． Xgridを使うには，以下のAppleによるヘルプが役立ちます．Xgridの設定に関する項目は，システムがMacOSX Serverであることを前提にしていますが，それ以外の項目はサーバ管理ソフトウェア（Xgrid Admin）をインストールすればMacOSX Serverでなくても参考にすることができます． Xgrid の概要 Xgrid について Xgrid のコンポーネント グリッドの計画を作成する Xgrid を設定する Xgrid を開始する／停止する Mac OS X Server で Xgrid エージェントを設定する Xgrid デスクトップエージェントを設定する Xgrid コントローラを設定する Xgrid のパスワードを設定する Xgrid 認証について サーバをエージェントにするためのパ
以下の URL から mpich のソースファイル （mpich.tar.gz) をダウンロードします。ここでは、2006年 12 月時点でのバージョン mpich-1.2.7p1 バージョンの生成について述べます。 http://www-unix.mcs.anl.gov/mpi/mpich1/ ダウンロードした mpich.tar.gz のアーカイブを Linux システム上の作業エリア（ここでは、/tmp 配下）に移動します。このアーカイブを以下のコマンドで展開します。 # tar xzvf mpich.tar.gz 展開すると、mpich-1.2.7 と言うディレクトリが作成されますので、そのディレクトリへ移動します。 # cd mpich-1.2.7p1 このディレクトリ配下に、configure と言うスクリプトファイルがありますので、このスクリプトを実行して、mpich 作成用
SMPP:Society for Massively Parallel Processing 本ページは2008年08月09日に更新しました 次回研究会の予告 第48超並列計算研究会 日時：2008年09月04日 13:00- 16:00 場所：東京・田町 キャンパス・イノベーションセンター東京 http://cic-hp.zam.go.jp/tokyo/access.php 特集：「ペタ・スケール・コンピューティングと並列処理の新たな展開」 詳しくはこちらをごらんください． 次回講習会の予告 Windows HPC講習会（協賛） 詳しくはこちらをごらんください． 超並列計算研究会とは 超並列計算研究会は、HPCや並列処理に関連したあらゆる事項に関して議 論、研究などを行う研究会です。 年に３〜５回の研究会の開催、見学会、講習会、その他を行っています。 最近は並列関係だけでなく、
偉大なるOSS LinuxやSolaris上でOSS（Open Source Software）を使いこなすためのノウハウを書き綴っています MPI(Message Passing Interface)ライブラリとしてMPICH2を使って並列プログラミング環境を構築する。HPC(High Performance Computing)クラスタの構築でもある。 ↓MPICH2のHPから最新版をダウンロードしてくる。 http://www-unix.mcs.anl.gov/mpi/mpich/ 現時点では mpich2-1.0.4p1.tar.gz になる。 早速ダウンロードしてインストールをすませる。 # tar zxvf mpich2-1.0.4p1.tar.gz -C /usr/local/src/ # cd /usr/local/src/mpich2-1.0.4p1/ # ./confi
MPIのインストール MPI(Message Passing Interface) PCクラスタにおいて複数のコンピュータに分散させて計算を行なうシステムの１つにMPI があります。計算を行なうための通信方法を定めたようなものです。 具体的にMPIを行なうプログラムに以下のようなものがあります LAM MPICH MPICH2 インテル クラスタ・ツールキット PGI クラスタ開発キット（CDK) インテルとPGIは、インテルコンパイラやPGIコンパイラと同時に使う商用のクラスタ用のソフトですが、フリーのプログラムに選択肢を絞りました。LAM、MPICH、MPICH2の主なフリーのMPIプログラムは３つなのですが、３つとも使用してみて、MPICH2を当面は使用することに決めました。 MPICH2のインストール MPICH2のホームページ よりソース(mpich2-1.0.3.tar.gz)
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