Biodiversidad de Las Bacterias Ácido
Biodiversidad de Las Bacterias Ácido
Biodiversidad de Las Bacterias Ácido
Albariño (Vitis vinifera L.) cultivada en Val do Salnés. Estudio de sus aplicaciones. 2017
2017
aplicaciones.
TESIS DE DOCTORADO
Año: 2017
Este trabajo ha sido parcialmente financiado por el proyecto PGIDIT06RAG018E “Estudio
de la microbiota maloláctica del Val del Salnés” concedido por la Xunta de Galicia y
desarrollado en colaboración con la bodega Condes de Albarei, así como con la Universidad
de Vigo
Jacobo López Seijas ha disfrutado de una Beca Predoctoral concedida por la Universidad de
Vigo, así como de una beca Leonardo concedida por la Excma. Diputación Provincial de
Lugo para la realización de una estancia en la Universidad de Viena, Austria.
A MI FAMILIA
AGRADECIMIENTOS
Me gustaría expresar mi más sincero agradecimiento a todas las personas que me han
acompañado a lo largo de estos años, y especialmente:
A mis compañeras Belén, Abi y Andrea, siempre dispuestas a echar una mano, a dar
un consejo, ya sea personal o profesional, a compartir horas y horas haciendo esta aventura
más agradable y amena. Habéis sido un gran apoyo y tenéis gran parte de culpa de que esto
haya llegado a buen término. A Ana Belén, que a pesar de compartir poco tiempo contigo, me
ayudaste a integrarme en el laboratorio.
A todas las personas que han pasado por el laboratorio de Microbiología Industrial y
Biotecnología Microbiana: Guille, Iria, Fernando, Daniel, Ángeles,… así como a las/los demás
miembros del área de Microbiología, en especial a Rosa Farto y Leticia Rivera, ya que todos
habéis aportado vuestro granito de arena, aunque en muchos casos ni os hayáis dado cuenta.
A las Dras. Pilar Combarro, Elisa Longo y Teresa Pérez, por vuestras palabras
amables, vuestros consejos y, en muchos caso, por vuestro ejemplo.
A la Dra. Ana Gago y al Dr. J. Manuel Leão, por permitirme llevar a cabo una parte
importante de esta tesis en vuestro laboratorio. Gracias por vuestra amabilidad y paciencia, y
por adentrarme en el interesante mundo de la Química Analítica.
i
A mis padres y hermano, porque seguramente estaréis orgullosos de mí al tener este
“libro” en vuestras manos, sin saber que soy yo el que está orgulloso de vosotros. Os estaré
eternamente agradecido porque sólo gracias a vosotros esto se ha hecho realidad.
A mis amigos, porque no todo va a ser trabajar. Habéis conseguido que no me vuelva
loco……creo.
A ti, Vanesa, por animarme cada día, por escucharme, por entenderme…, en
definitiva, por quererme. Sin ti mi vida ya no tendría sentido.
ii
TABLA DE CONTENIDOS
TABLA DE CONTENIDOS
Abreviaturas .................................................................................................................................... i
Introducción
1. Introducción ................................................................................................................................... 43
1.1. Industria vitivinícola en España: geografía y producción ..................................................... 43
1.2. Origen del exceso de acidez .................................................................................................. 45
1.3. Control de la acidez en los vinos ........................................................................................... 45
1.3.1. Control químico ............................................................................................................ 46
1.3.2. Control biológico: fermentación maloláctica ............................................................... 46
1.3.2.1. Concepto y factores físico-químicos que afectan al desarrollo ........................ 46
1.3.2.2. Impacto en vinos .............................................................................................. 48
1.3.2.2.1. Reducción de la acidez .......................................................................... 48
1.3.2.2.2. Modificación del perfil aromático, color y textura................................ 48
1.3.2.2.3. Estabilidad microbiológica ................................................................... 49
1.3.2.2.4. Seguridad del producto ......................................................................... 50
1.3.2.3. Biodiversidad de BAL ...................................................................................... 51
1.3.2.4. Dinámica poblacional ....................................................................................... 51
1.3.3. Fermentación malo-alcohólica con Schizosaccharomyces ........................................... 53
1.3.4. Enzima maloláctico ...................................................................................................... 54
1.3.5. Mejora genética de cepas vínicas ................................................................................. 54
1.4. Tecnología de la fermentación maloláctica ........................................................................... 55
1.4.1. Fermentación espontánea ............................................................................................. 55
1.4.2. Fermentación dirigida con cultivos iniciadores ............................................................ 56
1.4.2.1. Momento de la inoculación ................................................................................ 56
1.5. Problemática en la consecución de la FML ........................................................................... 57
1.6. Obtención de cultivos iniciadores ......................................................................................... 58
2. Materiales y Métodos .................................................................................................................... 60
2.1. Medios de cultivo .................................................................................................................. 60
2.2. Aislamiento de bacterias ácido lácticas ................................................................................. 61
2.3. Otras cepas bacterianas utilizadas en este estudio ................................................................. 61
2.4. Conservación de los aislados bacterianos ............................................................................. 62
2.5. Elaboración del perfil bioquímicos de asimilación de azúcares ............................................ 62
2.6. Manipulación de ácidos nucleicos......................................................................................... 63
2.6.1. Extracción de ADN ...................................................................................................... 63
2.6.2. Amplificación del ADNr 16S ....................................................................................... 63
2.6.3. Amplificación de la región espaciadora intergénica (ISR) 16S/23S ............................. 64
2.6.4. Amplificación del gen recA .......................................................................................... 64
2.6.5. Purificación de fragmentos de ADN a partir de gel de agarosa .................................... 65
2.6.6. Secuenciación ............................................................................................................... 65
2.6.7. Digestión de ácidos nucleicos con enzimas de restricción .......................................... 66
2.7. Análisis bioinformático ......................................................................................................... 67
2.7.1. Bases de datos y herramientas bioinformáticas empleadas .......................................... 67
2.7.2. Elaboración de los árboles filogenéticos 16S y recA.................................................... 67
2.8. Microfermentaciones ............................................................................................................ 68
2.9. Determinación molecular de la presencia de genes codificantes de enzimas carboxilasas de
ácidos fenólicos ..................................................................................................................... 68
2.10. Determinación de la actividad β-glucosidasa ....................................................................... 69
2.10.1. Actividad β-glucosidasa en células vivas ................................................................. 69
2.11. Determinación de la capacidad de producción de aminas biógenas..................................... 70
2.11.1. Determinación molecular de la capacidad de producción de ABs ............................ 70
2.11.2. Cuantificación de la producción de ABs .................................................................. 71
2.11.2.1. Reactivos y patrones ................................................................................... 72
2.11.2.2. Preparación de soluciones estándar y muestras de vino ............................. 72
2.11.2.3. Análisis UHPLC-MS/MS ........................................................................... 72
2.11.2.4. Parámetros de cuantificación ...................................................................... 73
2.12. Análisis de ácidos nucleicos mediante electroforesis en geles de agarosa ........................... 74
2.13. Determinación de la capacidad de degradación de ABs ...................................................... 75
3. Resultados y Discusión .................................................................................................................. 76
3.1. Aislamiento de bacterias lácticas .......................................................................................... 76
3.2. Identificación de los aislados mediante perfil de asimilación de azúcares ............................ 77
3.3. Identificación de los aislados mediante pruebas moleculares ............................................... 80
3.4. Esquema general del proceso de identificación .................................................................... 89
3.5. Ecología de las bacterias lácticas aisladas ............................................................................. 92
3.6. Caracterización enológica de las cepas de bacterias lácticas ................................................ 96
3.6.1. Actividad maloláctica .................................................................................................. 96
3.6.2. Formación de ABs ........................................................................................................ 99
3.6.3. Determinación de la capacidad de degradación de ABs ............................................. 101
3.6.4. Actividades β-glucosidasa y descarboxilasa de ácidos fenólicos ............................... 102
Capítulo II: Biocontrol de microorganismos patógenos mediante el empleo de LAB. Estudio
de aplicación en plantas de Solanum lycopersicum
AB Amina biógena
Abs. Absorbancia
ADN Ácido desoxirribonucleico
ARDRA Análisis de restricción del ADN ribosómico
ARN Ácido ribonucleico
ATP Adenosín trifosfato
BAL Bacteria ácido láctica
CECT Colección Española de Cultivos Tipo
CMI Concentración mínima inhibitoria
CMM Concentración mínima microbicida
D.O. Denominación de Origen
DGG Gel con gradiente de desnaturalización
EDTA Ácido etilendiaminotetraacético
FA Fermentación alcohólica
FML Fermentación maloláctica
GRAS Generalmente reconocidos como seguros
hdc Histidina descarboxilasa
HILIC Cromatografía de interacción hidrofílica
HIS Histamina
ISR Región espaciadora intergénica
MS Espectrometría de masas
NCBI “National Center for Biotechnology Information”
NP Nanopartícula
odc Ornitina descarboxilasa
p/v Peso por volumen
pb Pares de bases
PCR Reacción en cadena de la polimerasa
PUT Putrescina
PVDF Difluoruro de polivinilideno
SD Desviación estándar
i
sp. Especie
subsp. Subespecie
tdc Tirosina descarboxilasa
TEM Microscopía electrónica de transmisión
TYR Tiramina
U Unidad enzimática
UFC Unidad formadora de colonia
UHPLC Cromatografía líquida de alto rendimiento
UV Ultravioleta
v/v Volumen por volumen
ii
INTRODUCCIÓN GENERAL
INTRODUCCIÓN GENERAL
INTRODUCCIÓN GENERAL
El término “bacteria acido láctica” (BAL, o LAB, del inglés “lactic acid bacteria”)
tiene origen a principios del siglo XIX para denominar a un grupo heterogéneo de bacterias
que en la actualidad incluye a más de 30 géneros. La gran disparidad de criterios para la
definición de dicho término, con la formación de ácido láctico como único punto en común,
originaba una importante confusión en torno a qué bacterias o especies bacterianas debían ser
consideradas “bacterias ácido lácticas”.
Entre 1857 y 1863, Louis Pasteur desarrolla sus investigaciones en torno a las
fermentaciones vínicas, sin embargo, no será hasta 1873 cuando se produzca el primer
aislamiento de una bacteria acido láctica. Joseph Lister aísla una cepa de Bacterium lactis (en
la actualidad Lactococcus lactis) al tratar de reproducir los experimentos de Pasteur, lo que
permitirá el establecimiento de nuevos criterios fenotípicos para la determinación de los por
entonces denominados “lacto-bacilos”.
Pocos años después, en 1919, el trabajo de Orla-Jensen: “The lactic acid bacteria”
sentaría las bases de la sistemática de bacterias acido lácticas, para lo cual recurre a
características fenotípicas todavía en uso actualmente como son la morfología celular (cocos
3
INTRODUCCIÓN GENERAL
A B C
4
INTRODUCCIÓN GENERAL
Figura 2: Árbol filogenético desenraizado de los géneros de bacterias lácticas más representativos
(Axelson, 2004).
5
INTRODUCCIÓN GENERAL
Dentro del filo Firmicutes, las bacterias acido lácticas se engloban en el orden
Lactobacillales que incluye 13 géneros: Carnobacterium, Enterococcus, Lactobacillus,
Lactococcus, Leuconostoc, Oenococcus, Pediococcus, Streptococcus, Tetragenococcus,
Vagococcus, Aerococcus, Alloiococcus y Weissella siendo los géneros: Leuconostoc,
Oenococcus, Lactobacillus, Streptococcus, Lactococcus y Pediococcus los que tienen una
mayor presencia en procesos industriales de ámbito alimentario (Giraffa, 2014).
En 1995, Dicks et al. reclasificaron el género Oenococcus (Gr. n. oinos, vino; N.L.
masc. n. coccus) a partir de una especie incluida dentro del género Leuconostoc con especiales
características en cuanto a la asimilación de carbohidratos o su crecimiento en medio ácido.
Esta especie fue denominada Leuconostoc oenos por Garvie en 1967, en cuyo estudio ya se
mostraban algunas características claramente diferenciadoras dentro de dicho género.
Posteriormente, mediante el análisis genético-molecular llevado a cabo por Dicks y
6
INTRODUCCIÓN GENERAL
Del mismo modo que varias especies del genero Leuconostoc, son considerados en
muchos casos agentes perniciosos cuando aparecen de forma no controlada en productos
alimentarios, principalmente por su capacidad para producir diacetilo, sin embargo su
presencia puede resultar positiva e incluso en ocasiones son inoculados. Tienen una importante
presencia en vegetales frescos y fermentados, lo que se refleja en su empleo como estárteres
para la producción de chucrut (col blanca fermentada), alubias fermentadas, así como de otros
productos de estas características con un consumo y distribución más localizado. La
producción de carnes procesadas es también otra importante aplicación de algunas especies de
este género al haber sido empleadas recurrentemente en la elaboración de salchichas o jamón
curado (Franz et al., 2014).
7
INTRODUCCIÓN GENERAL
divergencia entre los caracteres de estas especies, así como a su importante diversidad
genética. Se encuentran ampliamente distribuidos en la naturaleza, en hábitats que van desde
el tracto gastrointestinal humano, a peces o plantas. Esta amplia variedad de hábitats abarca
un extenso rango de condiciones ambientales en las que estos microorganismos pueden
desarrollarse, lo que ha derivado en numerosas aplicaciones industriales, especialmente en la
industria alimenticia. Por ejemplo, estos microorganismos se encuentran entre las especies de
BAL más tolerantes a bajos valores de pH, con un rango entre 3 y 8, lo que les permite llevar
a cabo fermentaciones de productos alimentarios, principalmente vegetales (Axelson, 2004).
Del mismo modo, a pesar de que la temperatura óptima de crecimiento suele encontrarse entre
30 y 40 ºC, algunas especies pueden desarrollarse incluso a temperaturas cercanas al punto de
congelación o por encima de los 50 ºC (Pot et al., 2014).
Como el resto de las bacterias acido lácticas, el género Lactococcus incluye especies
de altos requerimientos nutricionales. Se trata de una especie homofermentativa que se
encuentra también ampliamente distribuida en la naturaleza, con forma oval, y que puede
aparecer de forma aislada o formando pares o cadenas. Son mesófilas y crecen a valores de
pH cercanos a la neutralidad. Su nombre deriva de su aislamiento en 1909 de leche fermentada
y en la actualidad, la producción de derivados lácteos es la principal aplicación de algunas
especies de este género, especialmente de Lactococcus lactis (Kim, 2014).
Las bacterias ácido lácticas son organismos quimiotrofos, es decir, obtienen su energía
de la oxidación de compuestos químicos, concretamente azúcares o hexosas. La oxidación de
azúcares constituye la principal ruta metabólica para la producción de energía en bacterias
lácticas (Ribereau-Gayon et al., 2000).
8
INTRODUCCIÓN GENERAL
es a menudo complejo y muestra un crecimiento escaso, debido en parte a que estas exigencias
nutricionales responden a necesidades específicas de cepa (Endo y Dicks, 2014).
9
INTRODUCCIÓN GENERAL
(o acetato, según la ruta), CO2 y ATP por cada mol de glucosa consumida (Liu, 2002; Muñoz
et al., 2011).
Figura 3: Rutas metabólicas para la fermentación de glucosa en bacterias ácido lácticas. A: Ruta
homofermentativa. B: Ruta heterofermentativa (Adaptado de Axelsson, 2004).
10
INTRODUCCIÓN GENERAL
Figura 4: Fermentación maloláctica. Estructura molecular del ácido málico y del ácido láctico
11
INTRODUCCIÓN GENERAL
Algunas bacterias ácido lácticas son capaces de llevar a cabo la conversión del ácido
málico en ácido láctico del vino (Fig. 4) en un proceso denominado fermentación maloláctica
(MLF, del inglés “malolactic fermentation”), estableciendo así un subgrupo dentro de las
BAL, el de las bacterias malolácticas.
Entre los ácidos orgánicos con mayor presencia en vino, el más abundante es el ácido
tartárico, pero la capacidad de las BAL para llevar a cabo su degradación es mucho menos
habitual que la mostrada para los dos casos anteriores, y generalmente implica a bacterias del
género Lactobacillus (Muñoz et al., 2011). Además, su degradación a menudo supone la
producción de ácido acético como producto final y con ello un incremento de la acidez volátil
del vino (Ribereau-Gayón, 2006; du Toit et al., 2011).
Las bacterias ácido lácticas tienen una capacidad muy limitada para emplear el
nitrógeno inorgánico. Debido a esto, necesitan de una fuente exógena de aminoácidos y
vitaminas en el medio en el que se desarrollan y son, de hecho, la mayoría de las especies de
BAL auxótrofas para al menos un aminoácido. Así, L. plantarum parece ser la única especie
cuyo ADN codifica enzimas para la síntesis de todos los aminoácidos excepto leucina,
isoleucina y valina y, en el caso contrario, L. johnsonii es incapaz de sintetizar la mayor parte
de ellos (Mayo et al., 2010), si bien estos requerimientos son, nuevamente, dependientes de
cepa (Axelsson, 2004, Endo y Dicks, 2014).
12
INTRODUCCIÓN GENERAL
Algunas especies presentan un sistema proteolítico que les permite la rotura de ciertas
proteínas presentes en el medio y el empleo de los aminoácidos resultantes de la misma para
su propio metabolismo. Estos sistemas proteolíticos tienen generalmente tres componentes
principales: proteinasas, o enzimas capaces de romper las proteínas en péptidos; un sistema de
transporte de estos al interior celular; y peptidasas en el citoplasma, encargados de convertir
estos péptidos en aminoácidos libres (Mayo et al., 2010). Este proceso proteolítico es de
especial importancia en la industria alimentaria en general y en la láctea en particular (Endo y
Dicks, 2014), donde los aminoácidos resultantes de la rotura de la caseína son a menudo
empleados por la célula bacteriana en la producción de sustancias aromáticas como alcoholes,
aldehídos, ácidos, esteres, y compuestos sulfurados.
Una situación similar ocurre en vinos, donde las proteínas procedentes de la uva y de
la lisis de las levaduras tras la fermentación alcohólica son transformados en péptidos y
aminoácidos libres cuyo catabolismo tiene importantes repercusiones organolépticas (Liu,
2002).
Las aminas biógenas, cuya repercusión sobre la salud del consumidor se tratará en
detalle más adelante, son también un producto del metabolismo de aminoácidos libres (Sumby
et al., 2014).
Los lípidos presentes en el vino tienen también su origen en la uva y las levaduras que
llevan a cabo la fermentación alcohólica (Liu, 2002).
A pesar de que existen algunas referencias a este mecanismo en bacterias ácido lácticas
(Esteban-Torres et al., 2015), no se han estudiado en profundidad los sistemas lipolíticos
encargados de esta reacción en vinos (Mathews et al., 2004).
13
INTRODUCCIÓN GENERAL
Metchnikoff sugirió, a principios del siglo XX, que las bacterias ácido lácticas podían
contribuir positivamente a la salud del ser humano. Desde entonces han sido numerosos los
estudios realizados en ese ámbito (Quinto et al., 2014).
El ser humano entra en contacto con estos microorganismos desde el momento del
nacimiento, al ser estas bacterias elementos principales de la microbiota vaginal. Una vez
comenzada la lactancia, la leche materna aporta en gran medida los organismos que
conformaran la microbiota intestinal del recién nacido (Mikelsaar et al., 1998). A partir de este
momento, las bacterias lácticas estarán presentes en diferentes biotopos, como la piel, intestino
o vagina, a lo largo de la vida del individuo, mientras éste se encuentre saludable.
Como se ha mencionado, los beneficios que las bacterias ácido lácticas pueden aportar
sobre la salud humana han sido ampliamente estudiados. Éstas forman parte esencial de la
microbiota intestinal humana, suponiendo una importante fuente de nutrientes como la
tiamina, riboflavina, ácido fólico o vitamina B12, que son absorbidos y empleados por el
hospedador (Ballongue, 2004).
Del mismo modo, son de sobra conocidas las actividades probióticas de este tipo de
microorganismos. En la actualidad existen evidencias de los efectos profilácticos y curativos
14
INTRODUCCIÓN GENERAL
que las bacterias lácticas tienen sobre enfermedades como diarreas rinitis, patologías de la piel,
intolerancia a la lactosa o incluso cáncer (Sharma et al., 2014).
15
INTRODUCCIÓN GENERAL
Esta capacidad para regular el sistema inmune tiene como efecto colateral una
importante mejora en individuos que presentan alguna enfermedad atópica, como asma, rinitis
alérgica, etc. a través de la regulación de la síntesis de IgE mediante la estimulación de la
producción de citoquinas antinflamatorias (Yasui et al., 1999; Ouwehand et al., 2002).
Desde sus primeras funciones como fermentos lácticos en la generación de queso y/o
leche agria, hasta la actualidad, el número de aplicaciones en esta industria se ha visto
enormemente ampliado debido, posiblemente, a la versatilidad y adaptabilidad de estas
bacterias a condiciones difíciles. Del mismo modo, la calificación de estas bacterias como
GRAS (Generally Regarded as Safe), ha impulsado la investigación en la aplicabilidad de estos
microorganismos para la sustitución de agentes químicos empleados en la conservación de
16
INTRODUCCIÓN GENERAL
productos alimenticios, cuya reducción o desaparición es cada vez más demandada por los
consumidores (Crowley et al., 2013).
Atendiendo al segundo criterio, los estárteres pueden ser, según Lawrence et al.
(1976):
En el caso de los yogures y leches fermentadas, las especies de bacterias lácticas más
habitualmente empleadas son S. salivarius subsp. thermophilus y L. delbrueckii subsp.
17
INTRODUCCIÓN GENERAL
bulgaricus (Auclair y Accolas, 1983), previamente definidas como termófilas, y que por lo
general son inoculadas conjuntamente como fermento mixto (Stanley, 1998; Oberman y
Libudzisz, 1998).
18
INTRODUCCIÓN GENERAL
Este control microbiológico tiene tres vías principales: el consumo de los nutrientes
necesarios para la proliferación de los microorganismos no deseados, la reducción del pH del
medio, o la síntesis y liberación de sustancias antimicrobianas como ácido láctico, ácidos
volátiles, peróxido de hidrógeno o las bacteriocinas anteriormente mencionadas (Reis et al.,
2012).
19
INTRODUCCIÓN GENERAL
control de diversos parámetros del proceso productivo así trata de garantizarlo), sin embargo,
en ocasiones la presencia de las bacterias acido lácticas puede suponer un deterioro en la
calidad del producto final, o incluso, un problema de salud para aquel que lo consuma. En este
sentido, algunas cepas de bacterias ácido lácticas pueden dar lugar a sustancias potencialmente
perjudicares como el carbamato de etilo o las aminas biógenas.
Figura 5: Principales aminas biógenas, aminoácidos precursores y enzimas que llevan a cabo su
síntesis.
Las aminas biógenas en cambio, son directamente sintetizados por las bacterias ácido
lácticas, a partir de la descarboxilación de aminoácidos residuales presentes en el medio, como
la histidina, tirosina u ornitina (Muñoz et al., 2011; Sumby et al., 2014). Esta reacción es
llevada a cabo por medio de las enzimas histidina descarboxilasa, tirosina descarboxilasa u
20
INTRODUCCIÓN GENERAL
21
INTRODUCCIÓN GENERAL
Tras este análisis, es posible realizar una aproximación a nivel de género, basándose
en la descripción fenotípica aportada por el Bergey’s Manual of Determinative Bacteriology
(Holt y Krieg, 1994).
22
INTRODUCCIÓN GENERAL
En aquellos casos en que no se da una complicación tan elevada, existe una amplia
variedad de técnicas moleculares para la determinación a nivel de género, especie, subespecie
o incluso cepa, de un aislado de bacterias ácido lácticas (Muñoz et al., 2011).
Los métodos de identificación basados en ADN pueden dividirse en dos tipos: aquellos
que emplean técnicas de PCR y los que se basan en la hibridación.
23
INTRODUCCIÓN GENERAL
Las secuencias de ADN ribosómico codifican para ARN ribosómico que, junto con
una serie de proteínas, conforman el ribosoma procariota (Fig. 6), constituido por dos
subunidades: una subunidad grande (50S), compuesta a su vez por dos subunidades llamadas
23S y 5S; y una subunidad pequeña denominada 30S que incluye a la subunidad 16S y 21
proteínas (Puertas, 1999).
24
INTRODUCCIÓN GENERAL
- Estos genes están presentes en todas las especies de vida libre conocidas, presentando
además una secuencia, estructura y función muy conservada.
- Se trata de genes relativamente fáciles de clonar y secuenciar, incluso cuando
provienen de bacterias no cultivables.
- La conservación de determinadas regiones permite el alineamiento de secuencias entre
especies.
- No parece probable la existencia de transferencia lateral de estos genes entre especies.
- Las elevadas tasas de sustitución entre especies permite inferir relaciones
filogenéticas.
Esta secuencia cuenta con aproximadamente 1500 pares de bases, con dominios
altamente conservados a ambos extremos del gen, lo que supone un aspecto idóneo para la
elaboración de cebadores que permitan la obtención del gen completo por PCR (Heyndrickx
25
INTRODUCCIÓN GENERAL
et al., 1996), y regiones variables que proporcionan la detección e/o identificación (Nour,
1998) .
Estas secuencias pueden ser empleadas de diversos modos en función del objetivo del
análisis:
6.2.2.1.1. Secuenciación
26
INTRODUCCIÓN GENERAL
6.2.2.1.2. ARDRA
Figura 7: Distribución de las regiones hipervariables dentro de la secuencia de ADNr 16S (www.gatc-
biotech.com).
27
INTRODUCCIÓN GENERAL
La secuencia que se encuentra entre los genes 16S y 23S (en adelante ISR, del inglés:
“Intergenic Spacer Region”) ha sido empleada con éxito también para la identificación de
bacterias acido lácticas (Singh et al., 2009).
Uno de estos métodos emplea el gen recA, que se ha mostrado como una importante
ayuda en la discriminación de bacterias, concretamente de bacterias ácido lácticas.
La proteína recA es un péptido de 352 aminoácidos (en E. coli) aislada por primera
vez en 1965 por Clark y Margulis, y presenta importantes funciones dentro de la célula (Miller
y Kokjohn, 1990; Eisen, 1995; Karling et al., 1995):
28
INTRODUCCIÓN GENERAL
La implicación directa en estas funciones vitales para la célula hace que la secuencia
de aminoácidos se encuentre evolutivamente muy conservada, manteniendo también la
estructura cuaternaria de la proteína. Sin embargo, sí se aprecian modificaciones en la
secuencia nucleotídica, modificaciones que se dan mayoritariamente en la tercera posición de
cada codón (Fig. 8) (Miller y Kokjohn, 1990).
Estos dos factores han conducido a que, desde principios de la década de los 90, el gen
recA haya sido propuesto como un marcador filogenético en procariotas (Torriani et al, 2001;
Rodríguez et al., 2007) ya que incluso la comparación entre árboles filogenéticos obtenidos a
partir de secuencias completas de ARNr 16S y recA bacterianos, han arrojado resultados
altamente similares (Eisen, 1995).
29
INTRODUCCIÓN GENERAL
Además de los descritos anteriormente, son de uso habitual para este fin los genes
rpoB, el factor de elongación tu o el citocromo C.
El gen rpoB codifica para la subunidad beta de la ARN polimerasa bacteriana, que
tiene una importancia clave en la célula bacteriana al encargarse de la transcripción. Su
presencia universal en bacterias, al igual que la secuencia de ADNr 16S, y la presencia de
regiones altamente conservadas, ha hecho que sea considerado como marcador genético y/o
cronómetro molecular (Bou et al., 2011).
El factor de elongación Tu, codificado por el gen tuf, cuya función en la célula
bacteriana radica en la traducción del ADN, ha sido menos empleado en la detección,
identificación y/o determinación de filogenias de bacterias ácido lácticas, aunque también se
ha demostrado su eficiencia para este fin (Chavagnat et al., 2002; Ventura et al., 2003).
En adición al análisis comparativo, existen otros métodos basados en los genes antes
mencionados que pueden ser empleados para la identificación bacteriana.
30
INTRODUCCIÓN GENERAL
Torriani et al. (2001) emplearon una PCR múltiple para la obtención de fragmentos
que les permitieron identificar las especies L. plantarum, L. pentosus y L. paraplantarum.
Éstas se encuentran filogenéticamente muy cercanas y su identificación mediante el análisis
de ADNr 16S se hace a menudo improductiva al arrojar porcentajes de similitud en dicha
secuencia de más de un 99% (Torriani et al., 2001; Singh et al., 2009). El mismo método fue
empleado con éxito por Pang et al. (2011) para la identificación de bacterias ácido lácticas
procedentes de ensilados de maíz y por Nisiotou et al., (2014), para la identificación de cepas
aisladas en uvas y vino.
Petri et al. (2013) diseñaron un grupo de cebadores con los que fueron capaces de
identificar, mediante PCR múltiple, 13 especies de bacterias ácido lácticas pertenecientes a las
especies L. brevis, L. buchneri, L. curvatus, L. hilgardii, L. plantarum, L. mesenteroides, O.
oeni, P. acidilactici, P. damnosus, P. inopinatus, P. parvulus, P. pentosaceus y Weissella
paramesenteroides, aisladas de vino.
Esta técnica destaca por su rapidez y fiabilidad, sin embargo su uso se limita a la
detección de especies o cepas determinadas, sin aportar información filogenética sobre las
mismas.
6.2.3. PCR/DGG
Renouf et al. (2006) emplearon la amplificación por PCR del gen rpo, y su posterior
electroforesis en gradiente desnaturalizante, para el seguimiento de la evolución de bacterias
31
INTRODUCCIÓN GENERAL
ácido láctica en varias áreas de la Denominación de Origen (D.O.) Burdeos, si bien los propios
autores reconocen la necesidad de complementar esta técnica con algún método cuantitativo.
Recientemente, Pérez-Martín et al., (2014) emplearon esta técnica sobre el gen ADNr-
16S para analizar la diversidad microbiológica de la D.O. Méntrida, permitiéndoles la
detección de O. oeni y Acetobacter sp. así como bacterias de la familia Enterobacteriaceae.
Figura 9: Evolución en el número de entradas en NCBI relativas a bacterias ácido lácticas hasta 2012
(de Vos, 2011).
32
INTRODUCCIÓN GENERAL
Un ejemplo de este tipo de enzimas son las glucosidasas. Estas enzimas son capaces
de romper los enlaces que dan lugar a glucósidos o compuestos glucoconjugados formados
por la unión de un glúcido y una molécula aromática, generalmente monoterpenos,
norisoprenoides y compuestos alifáticos o fenólicos (D’Incecco et al., 2004; Sieiro et al.,
2012). La hidrólisis enzimática de estos enlaces permite la liberación de la molécula aromática
posibilitando también su percepción sensorial, convirtiéndose así en proceso de especial
importancia en vinos, donde aproximadamente el 95% de los compuestos aromáticos están en
forma de glucósidos (Matthews et al., 2004).
Otras enzimas de interés, debido a la amplia variedad de sustratos sobre los que pueden
actuar, son las lacasas. Se trata de enzimas capaces de catalizar la rotura de substratos
orgánicos mediante la reducción de una molécula de oxígeno a dos moléculas de agua (Riva,
2006). Recientemente, Callejón et al. (2015) clonaron y caracterizaron una lacasa de L.
plantarum con capacidad para la degradación de aminas biógenas, tras demostrar que cepas
de esta especie eran capaces de degradar histamina, tiramina y putrescina, presentes en vino
(Callejón et al., 2014).
33
INTRODUCCIÓN GENERAL
7.2. Biocontrol
Ejemplos de estas sustancias son las bacteriocinas, nombre genérico empleado para
englobar a las sustancias antimicrobianas de origen bacteriano que tienen efecto inhibidor del
crecimiento sobre otras cepas o especies filogenéticamente cercanas al microorganismo
productor (Riley y Wertz, 2002).
34
INTRODUCCIÓN GENERAL
35
INTRODUCCIÓN GENERAL
36
JUSTIFICACIÓN Y OBJETIVOS
JUSTIFICACIÓN Y OBJETIVOS
JUSTIFICACIÓN Y OBJETIVOS
Aunque uno de los principales usos de las bacterias del ácido láctico es la de ser
utilizadas como cultivos iniciadores para la elaboración y/o transformación de distintos
alimentos, entre ellos el vino, diferentes estudios han explorado y demostrado también su
potencial para otras aplicaciones de gran trascendencia. Dentro de ellas cabe resaltar, entre
otras, su interés para la producción industrial de distintos metabolitos (destacando las
bacteriocinas), su importancia como probióticos o su posible empleo como agentes
bioprotectores. Sin embargo, estos estudios se han llevado a cabo mayoritariamente con
bacterias lácticas aisladas de productos lácteos. Es por esta razón por la que, aprovechando la
colección de bacterias lácticas obtenidas del trabajo de la fermentación maloláctica de los
vinos de la comarca de Val do Salnés, se planteó también en esta Tesis el estudio de algunas
de sus otras posibles aplicaciones.
39
JUSTIFICACIÓN Y OBJETIVOS
40
CAPÍTULO I
CAPÍTULO I Introducción
1. INTRODUCCIÓN
43
CAPÍTULO I Introducción
Concretamente, la región que da nombre a la D.O. Rías Baixas se caracteriza por tener
un clima, en general, templado sub-mediterráneo, con temperaturas en torno a los 20 ºC de
media en agosto y 18 ºC en septiembre, meses de maduración de la uva (Fuente: Xunta de
Galicia y AEMET), un grado menos, por ejemplo, que la media en la región vitivinícola de los
vinos de rueda, y dos grados menos que en la región de La Rioja.
Dentro de esta D.O se establecen a su vez las sub-zonas Val do Salnés, Condado do
Tea, Rosal y Ribeira do Ulla, zonas influenciadas por el Océano Atlántico (Vilanova y
Vilariño, 2005), en las que predomina el cultivar Albariño, uno de los más antiguos de la
región, siendo actualmente una de las variedades de uva más apreciadas de España (Diéguez
et al., 2003; Juega et al., 2014).
A pesar de esta influencia generalizada del Océano Atlántico, las sub-zonas de esta
región vitivinícola presentan diferencias climáticas que influyen directamente en el desarrollo
de las vides, y con ello, en las características y la calidad del vino producido en cada una de
ellas (Lorenzo et al., 2013). Así por ejemplo, la región de Rosal se diferencia de la región de
Val do Salnés, estudiada en este trabajo, por presentar temperaturas nocturnas más bajas, a
pesar de tratarse ambas de zonas templadas, mientras que la región de Condado do Tea está
incluida en un área de clima cálido (Queijeiro et al., 2006).
44
CAPÍTULO I Introducción
La acidez del vino viene determinada por la presencia de dos ácidos principales: el
ácido tartárico y el ácido málico (Ribéreau-Gayón, 2006).
Estos suponen más del 90% del total de ácidos de la uva, donde tienen su origen. La
concentración de ácido tartárico es relativamente constante, mientras que la de ácido málico
oscila en función del grado y condiciones de maduración, mostrando su mayor concentración
en la baya verde, contenido que se va reduciendo a medida que avanza dicha maduración
(Hidalgo, 2002). En consecuencia, los problemas derivados de la presencia de ácido málico en
el vino serán más marcados en climas fríos, donde a menudo la maduración no es completa y
por lo tanto hay una mayor transferencia de ese ácido al caldo durante el estrujado (Volschenk
et al., 2006).
A pesar de que la D.O. Rias Baixas no se encuentra entre las consideradas “de clima
frio” (Volschenk et al., 2006), las bajas temperaturas que se dan en esta zona durante el periodo
de maduración de la uva inciden directamente en la concentración de ácido málico (Sieiro et
al., 1990), que a menudo se encuentra en concentraciones en torno a los 4 - 5 g/L al final de la
fermentación alcohólica (FA).
Otro aspecto determinante en la presencia del ácido málico en vino es el procesado del
mismo. Mientras que los vinos blancos sufren una etapa de desfangado previo a la FA, donde
son retirados todos los elementos sólidos de la uva, los vinos tintos realizan dicha etapa en
presencia de la piel de la uva u hollejo, lo que, al encontrarse más tiempo en contacto con el
caldo, favorece el traspaso del ácido málico al mismo.
Debido a esto, los problemas de acidez ocasionados por este ácido son más habituales
en vinos tintos, pero su importancia se pone también de manifiesto en diferentes vinos blancos
(Nisiotou et al., 2014), siendo este el caso de la variedad Albariño cunado se cultiva en la ya
mencionada sub-zona de Val do Salnés.
45
CAPÍTULO I Introducción
misma, existiendo principalmente dos formas de llevar a cabo esta corrección: la aplicación
de métodos químicos, y la conducción de la fermentación maloláctica (FML) (Ribéreau-
Gayón, 2006).
46
CAPÍTULO I Introducción
generalmente en vinos tintos aunque también puede tener lugar en determinados blancos como
el Chardonnay (Juega et al., 2014).
Las bacterias ácido lácticas (BAL), en general, tienen un pH óptimo para su desarrollo
con valores que oscilan entre 4,2 y 4,5. El pH del vino se encuentra habitualmente entre 3 y 4
siendo el primero cercano al valor límite para la degradación de ácido málico, que se encuentra
en torno a pH 3,2. Aunque la conducción de la FML en estos valores supone por lo general
una ralentización en su desarrollo, evita la producción de ácido acético, al estar inhibida la
asimilación de azúcares por debajo de pH 3,5 (Hidalgo, 2002; Ribéreau-Gayón et al., 2006).
La temperatura óptima para crecimiento de las BAL, así como para el desarrollo de la
FML en vino se encuentra entre los 20 y los 25 ºC. Estas bacterias pueden desarrollarse a
temperaturas por debajo de estas temperaturas, aunque con una menor tasa de crecimiento, lo
que permite la conducción de dicha fermentación a las temperaturas habitualmente empleadas
en bodega, aunque de forma más lenta (van de Guchte et al., 2002; du Toit et al., 2011)
Las bacterias malolácticas son especialmente sensibles al proceso del sulfitado del
vino. Este proceso se realiza mediante la adición de metabisulfito potásico, de forma que
eliminan las bacterias que lo pueden deteriorar, mientras que se permite el desarrollo de las
levaduras, lo que tiene como consecuencia que, incluso a bajas concentraciones de SO, el
desarrollo de la FML puede verse afectado o incluso inhibido (Du Toit y Pretorius, 2000).
47
CAPÍTULO I Introducción
El ligero incremento del pH del vino como consecuencia de la FML tiene efectos
colaterales en las características organolépticas del mismo. La conversión de ácido málico
sustituye el sabor agresivo de este por la acidez mucho más suave del ácido láctico (Lonvaud-
Funel, 1999).
48
CAPÍTULO I Introducción
Por otra parte, la producción de diacetilo y acetoína por parte de las especies
heterofermentativas, como consecuencia del metabolismo del ácido cítrico, proporciona
aromas a mantequilla que son considerados negativos cuando sobrepasan los 5‐6 mg/L en los
vinos blancos y 8‐9 mg/L en los tintos (Liu, 2002).
La textura y el color del vino también se pueden ver afectadas durante el desarrollo de
la FML (Lonvaud-Funel, 1999; Muñoz et al., 2011).
49
CAPÍTULO I Introducción
aminoácidos, vitaminas o azúcares residuales que no hayan sido empleados por las levaduras
durante la FA o liberados por las mismas durante su lisis (Volschenk et al., 2006).
50
CAPÍTULO I Introducción
El carbamato de etilo, es otro compuesto cuya producción ha de ser evitada por tratarse
de una sustancia pro carcinógena (Lonvaud-Funel, 1999). A pesar de que es producido
mayormente por las levaduras, algunas BAL pueden también originarlo a través del
metabolismo de la arginina (Volschenk et al., 2006).
Las BAL están presentes durante todos los pasos que llevan a la transformación del
mosto o zumo de uva en vino. Su principal fuente se encuentra en las uvas y hollejos, pero un
51
CAPÍTULO I Introducción
importante número puede provenir de los utensilios empleados o de las cubas en última
instancia (Muñoz et al., 2011).
Fin de la FML
Log (UFC/mL)
Inicio de la FML
FA
Latencia
Días
52
CAPÍTULO I Introducción
un pico de densidad poblacional de en torno a las 106 - 107 UFC/mL y, en caso de tratarse de
las cepas apropiadas (la capacidad de asimilación y transformación del ácido málico es
variable en función de la cepa bacteriana -Sumby et al., 2014- ), comienzan la FML, que durará
entre 5 días y 2-3 semanas (Muñoz et al., 2011).
Del mismo modo que existe una alternancia bacteria-levadura durante las etapas de
elaboración del vino, también se da una alternancia entre grupos bacterianos, principalmente
entre bacterias heterofermentativas y homofermentativas. Aunque la supervivencia de unas u
otras especies bacterianas depende principalmente de su adaptabilidad a las duras condiciones
de acidez y grado alcohólico del medio (Ribéreau-Gayón et al., 2006), en líneas generales
predominan las especies homofermentativas en las primeras fases del procesado (por ej. las
pertenecientes al género Pediococcus), que darán paso a las especies heterofermentativas,
habitualmente Lactobacillus, Leuconostoc y/u Oenococcus, pero sin que las primeras lleguen
a desaparecer completamente (Blasco-Escrivá, 2009).
53
CAPÍTULO I Introducción
temperatura óptima a la que lleva a cabo esta fermentación está en torno a 30 ºC, lo que podría
afectar negativamente a las características del vino (du Toit y Pretorius, 2000).
Otra opción que ha sido objeto de estudio para llevar a cabo la FML ha consistido en
la adición directa de la enzima maloláctica al vino. Esto tiene obvias ventajas al no existir la
posibilidad de desarrollo de ninguno de los aspectos negativos derivados del metabolismo de
las BAL, pero parece que su funcionamiento en las condiciones del vino no es el óptimo, al
verse inhibida por numerosas componentes del mismo (Ribéreau-Gayón et al., 2006).
54
CAPÍTULO I Introducción
obtener buenos rendimientos malolácticos evitando las desventajas del uso de cepas de BAL.
Este desvío de recursos hacia este campo da idea de las dificultades para conseguir una cepa
maloláctica óptima para su empleo en procesos de vinificación.
En este sentido, se están llevando a cabo numerosos intentos de clonación de este gen
en cepas de Lactobacillus que ya dispongan de la proteína transportadora. Schümann et al.
(2013), consiguieron expresar un gen maloláctico de O. oeni en una cepa de L. plantarum pero,
aunque consiguieron la conversión del ácido málico sin necesidad de una adaptación previa
de las células a las condiciones del vino, la expresión de la enzima maloláctica fue inhibida
rápidamente.
No sin detractores, la mayor barrera que alguna de estas técnicas y los productos de
las mismas encuentran para su aplicación son las restricciones legales presentes en la mayor
parte de los países productores de vino del mundo, así como la reticencia de la sociedad al
consumo de organismos modificados genéticamente o sus derivados.
55
CAPÍTULO I Introducción
Existen dos modalidades principales para conseguir una FML dirigida: la inoculación
con bacterias malolácticas durante las primeras etapas de la FA, es decir, co-inoculadas con la
levadura, o al final de la misma (post-FA) (du Toit et al., 2011; Bartowsky et al., 2015). Ambas
prácticas presentan ventajas e inconvenientes, por lo que su empleo ha de establecerse en base
a las características de cada vino y/o de la cepa o especie de bacteria láctica empleada.
56
CAPÍTULO I Introducción
Ésta producción de ácido acético parece ser la principal causa de que el sector
vitivinícola este dividido entre los que apoyan esta práctica y los que la rechazan, ya que la
mayor parte de los estárteres comerciales están basados en cepas de la especie O. oeni, especie
heterofermentativa que puede dar lugar a ácido acético a través del metabolismo de los
azúcares del mosto (Bartowsky et al., 2015).
57
CAPÍTULO I Introducción
A esto hay que sumar que, cuando estos cultivos iniciadores se inoculan tras la FA,
generalmente requieren de un período de latencia más largo, debido a la necesidad de las
células bacterianas de adaptarse a unas duras condiciones para su desarrollo. Este período
supone un riesgo de proliferación de organismos indeseados, prolongando además el tiempo
de consecución de una FML aceptable (Abrahamse y Bartowsky, 2012).
Cuando los cultivos iniciadores van a ser empleados en co-inoculación, adquiere una
especial importancia la selección de cepas homofermentativas debido a la presencia de
azúcares en elevadas concentraciones. El empleo de estos azúcares por parte de las cepas
heterofermentativas a menudo desemboca en la producción de ácido acético, y con ello de un
incremento indeseado de la acidez del vino. Del mismo modo, las bacterias inoculadas en esta
modalidad han de ser compatibles con la levadura conductora de la FA, a fin de evitar la
inhibición del crecimiento de las bacterias malolácticas por esta (Fugelsang y Edwards, 2007).
58
CAPÍTULO I Introducción
59
CAPÍTULO I Materiales y Métodos
2. MATERIALES Y MÉTODOS
Medio MRS (de Man, Rogosa y Sharpe 1960, Panreac): Peptona 10 g/L, Extracto de
carne 5 g/L, Extracto de levadura 5 g/L, D (+)-Glucosa 20 g/L, Di-potasio hidrogeno fosfato
2 g/L, Di-amonio hidrogeno citrato 2 g/L, Acetato sódico 5 g/L, Sulfato de magnesio 0,1 g/L,
Sulfato de manganeso 0,05 g/L, pH 6,5. Este medio fue suplementado con jugo de tomate
(10%) cuando fue necesario. Para la elaboración de medio sólido se añadió una concentración
de 15 g/L de agar.
Medio MLO (Medio para Leuconostoc oenos; Caspritz y Radler, 1983): Triptona 10
g/L, Extracto de levadura 5 g/L, Glucosa 10 g/L, Fructosa 5 g/L, Sulfato de magnesio 0,2 g/L,
Sulfato de manganeso 0,05 g/L, Citrato de diamonio 3,5 g/L, 1 ml de Tween 80, Cisteína HCl
0,5 g/L, ácido l-málico 10 g/L, pH 5,5. Cuando fue necesario se solidificó con agar a una
concentración de 20 g/L.
Todos los medios, excepto el que incluye vino natural, fueron esterilizados en
autoclave a 121 ºC durante 15 min, 1 atm de presión.
60
CAPÍTULO I Materiales y Métodos
Una primera selección de los aislados de presuntas bacterias malolácticas fue realizado
en base a su morfología celular, a su carácter Gram, y a la reacción frente a peróxido de
hidrógeno (catalasa). Se seleccionaron bacterias de forma cocoide o bacilar, Gram-positivas y
catalasa negativas.
61
CAPÍTULO I Materiales y Métodos
Especie Cepa
Las cepas fueron conservadas en medio MRS o MLO suplementado con un 30% de
glicerol, a una temperatura de -20 ºC.
Se empleó el kit comercial API® 50CHL (bioMérieux® SA). Para ello se inoculó el
medio incluido en el kit con una concentración celular correspondiente al grado 2 de la escala
de McFarland, proveniente de un cultivo crecido previamente en medio MRS a 30 ºC durante
2-7 días en función de la especie.
Se añadió este medio a las celdillas en la cantidad apropiada y se cubrieron con aceite
de parafina estéril para crear una atmosfera anaerobia. La incubación se realizó a 30 ºC y la
lectura se llevó a cabo tras 48 h, agrupando los aislados en base a la tabla de identificación
proporcionada por el fabricante.
62
CAPÍTULO I Materiales y Métodos
Para la extracción del ADN cromosómico, las bacterias fueron cultivadas durante 5 -
7 días en tubos con 10 mL de medio MRS suplementado con un 10% de jugo de tomate, a 30
°C. Un mililitro de cada cultivo fue transferido a viales Eppendorf y centrifugado a 14000 x g
durante 5 minutos (Microfuge® 22R Centrifuge, Beckman Coulter™). Una vez eliminado el
sobrenadante, el sedimento fue tratado con el kit Wizard® Genomic DNA Purification Kit
(Promega).
Para ello las células se resuspendieron en 480 µL de EDTA (50 mM, pH 8), incluyendo
en este punto un paso consistente en un choque térmico, realizando un ciclo previo de
congelación/descongelación (-80 °C, 5 min; 80 °C, 5 min) para, en adelante, continuar con los
pasos indicados en dicho kit.
63
CAPÍTULO I Materiales y Métodos
Para la amplificación de esta región del ADN bacteriano se empleó el método descrito
anteriormente por Moreira et al. (2005). Los cebadores empleados fueron: 16-1A: 5’-
GAATCGCTAGTAATCG -3’ como directo y 23-1B: 5’- GGGTTCCCCCATTCGGA -3’
como reverso.
La mezcla de reacción empleada fue la misma que para la amplificación del ADNr
16S y las condiciones de amplificación utilizadas fueron: 94 ºC durante 2 min, 35 ciclos de:
94 ºC durante 30 s, 55 ºC durante 1 min, 72 ºC durante 1 min, y una elongación final a 72 ºC
durante 10 min, en el termociclador Primus 96 plus, MWG AG Biotech.
Para la amplificación del gen recA se empleó el método descrito por Torriani et al.
(2001). Se realizaron dos tipos de PCR, una múltiple con cebadores específicos de especie y
una PCR estándar con cebadores degenerados.
64
CAPÍTULO I Materiales y Métodos
Para ello, la banda que contenía el ADN de interés fue cortada con una cuchilla y el
fragmento depositado en un vial Eppendorf de 1,5 mL, y tratado con el kit Geneclean ® Kit
(MP Biomedicals, LLC).
2.6.6. Secuenciación
65
CAPÍTULO I Materiales y Métodos
Temp. Secuencia
Enzima Concentración BSA Tiempo Sitio de corte Referencia
(ºC) diana
Figura 4: Fragmento del alineamiento de las secuencias ADNr 16S de las especies L. casei, L. paracasei
y L. rhamnosus. Diana de reconocimiento de la enzima BtgZI marcada en verde. La flecha indica el
sitio de corte.
66
CAPÍTULO I Materiales y Métodos
Las bases de datos del NCBI (Nacional Center for Biotechnology Information), fueron
empleadas para la búsqueda de las secuencias de ADN que serían incluidas en los árboles
filogenéticos para verificar el agrupamiento.
BlastN (Basic local alignment search tool) (Altschul et al., 1990), fue empleado para
realizar la comparación entre las secuencias obtenidas de las cepas objeto de estudio y aquellas
depositadas en las bases de datos. http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi.
ClustalW (Larkin et al., 2007), fue empleado para realizar el alineamiento de las
secuencias de ADN obtenidas tanto de las bases de datos como a partir de las cepas aisladas
en este estudio. http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/clustalw2/.
MEGA versión 5.0 (Tamura et al., 2011), fue empleado para la elaboración de los
árboles filogenéticos.
pDRAW32 “DNA analysis software” (AcaClone), fue empleado para llevar a cabo la
predicción virtual de los cortes con las enzimas de restricción que serían posteriormente
empleadas. http://www.acaclone.com/.
Para obtener los árboles filogenéticos, utilizando las secuencias del gen 16S de un
fragmento del gen recA, se emplearon los programas ClustalW2 (Chenna et al., 2003) y
MEGA versión 5 (Tamura et al., 2011).
67
CAPÍTULO I Materiales y Métodos
2.8. Microfermentaciones
Se prepararon cultivos frescos de las diferentes cepas sembrando los mismos en Agar-
Vino (pH 4,5), a 28 ºC. Una vez crecidos en este medio, fueron inoculados en un medio líquido
compuestos por el mismo vino, suplementado con un 10% de MRS (pH final = 4) para preparar
los inóculos. Estos se utilizaron para inocular las microfermentaciones a una densidad celular
de 105 células/mL. El vino sin inocular se incluyó como control. La fermentación transcurrió
a 20 ºC durante 15 días, tras los cuales los vinos fueron centrifugados y conservados para su
posterior análisis. Los ensayos se realizaron por duplicado.
68
CAPÍTULO I Materiales y Métodos
El precipitado fue lavado dos veces con solución salina (NaCl 0,85%) a 13000 x g
durante 3 min tras lo cual las células fueron resuspendidas en dicha solución (1 mL).
La mezcla de reacción se llevó a cabo en un volumen total de 160 µL, de los cuales
80 µL corresponden a tampón McIlvaine (McIlvaine, 1921) 200 mM (ácido cítrico 0,1 M y
69
CAPÍTULO I Materiales y Métodos
K2HPO4 0,2 M), preparado a pH 4,0. Cuarenta microlitros corresponden a la suspensión celular
descrita anteriormente, y los restantes 40 µL corresponden al sustrato 4-nitrofenil β-D-
glucopiranósido (Sigma-Aldrich GmBH), preparado a una concentración 4 mM en H2O
MilliQ, para obtener una concentración final de 1 mM. Se determinó la actividad β-glucosidasa
a 18 ºC, por ser esta una de las más habitualmente empleadas en procesos de vinificación.
Las reacciones se llevaron a cabo durante 1 hora, por duplicado, tras lo cual se
detuvieron mediante la adición de 320 µL de Na2CO3 0,5 M.
Una unidad enzimática se definió como la cantidad de enzima necesaria para liberar 1
µM de 4-nitrofenol en un minuto de reacción a 18 ºC.
70
CAPÍTULO I Materiales y Métodos
Para ello se emplearon tres PCRs por cada cepa estudiada, con los cebadores descritos
por de las Rivas et al. (2005), mostrados en la Tabla 3. La mezcla de reacción consistió en:
ADN 30 ng, 200 µM cada oligonucleótido, 2,5 mM de MgCl2 y 2,5 U de Taq polimerasa
(Takara) en un volumen total de 50 µL. Los cebadores empleados se añadieron a la mezcla de
reacción a las concentraciones: 2 µM para los cebadores P1-rev y P2-for, 0,3 µM para los
cebadores JV16HC y JV17HC, y 1 µM para los cebadores Nº 3 y Nº 16.
A pesar de que los autores de este protocolo llevan a cabo el mismo a modo de PCR
múltiple, en nuestro caso se realizó de forma independiente para cada uno de los genes, ya que
la amplificación inespecífica de otras secuencias puede dar lugar artefactos que solapen las
bandas de interés, y por lo tanto, arrojar falsos positivos o negativos.
Tabla 3: Cebadores empleados en la determinación molecular de la presencia de los genes hdc, tdc y
odc.
71
CAPÍTULO I Materiales y Métodos
72
CAPÍTULO I Materiales y Métodos
Tabla 4: Datos de calibración derivados de una calibración de siete puntos para la histamina, tiramina
y putrescina, utilizando el método HILIC-MS/MS para la determinación de aminas biógenas en el vino.
Coeficiente de
Rango Lineal LDD a LDC b
Compuesto Pendiente Intersección determinación
(µg/mL) (µg/mL) (µg/mL)
(R2)
73
CAPÍTULO I Materiales y Métodos
Los productos de amplificación de los genes codificantes para las enzimas amino
descarboxilasas se analizaron mediante electroforesis en gel de agarosa (2 % agarosa, TAE -
40 mM Tris/Acetato, 1 mM EDTA, pH 8-, 80 v) empleándose un marcador comercial de 100
a 1000 pb (Biorom).
74
CAPÍTULO I Materiales y Métodos
Se empleó el método descrito por Callejón et al. (2014) con algunas modificaciones.
Para ello, las cepas de bacterias malolácticas fueron cultivadas en MRS suplementado con
histamina, tiramina y putrescina, cada una de ellas a 10 mg/L, a 30 ºC hasta alcanzar la fase
exponencial, en un volumen de 50 mL. Posteriormente, los cultivos fueron centrifugados a
2894 x g durante 10 min, lavadas con 40 mL de tampón fosfato (50 mM, pH 7,4) y, finalmente
resuspendidas en el mismo tampón suplementado con el inhibidor de proteasas fluoruro de
fenilmetilsulfonilo (PMSF) 1 mM.
Para obtener el extracto celular, las células se rompieron mecánicamente con perlas de
vidrio de 107 µm (Sigma-Aldrich), mediante vortex durante 10 min, tras lo cual se
centrifugaron a 25000 x g durante 15 min y el sobrenadante se conservó a -20 ºC hasta su uso.
75
CAPÍTULO I Resultados y Discusión
3. RESULTADOS Y DISCUSIÓN
La región vinícola Val do Salnés, perteneciente a la D.O. Rías Baixas en España, posee
un clima Atlántico de temperaturas suaves (Lorenzo et al., 2013), diferenciado por presentar
temperaturas nocturnas bajas, y que cultiva mayoritariamente la variedad blanca Vitis vinifera
Albariño.
Los vinos obtenidos con esta variedad en esta zona, debido a su exceso de acidez,
deben completar en muchas ocasiones la FML. Sin embargo, con frecuencia, se ha constatado
la dificultad para conseguir un exitoso desarrollo de este proceso de manera espontánea o la
implantación de cultivos iniciadores comerciales en estos vinos. Estas razones han justificado
llevar a cabo este estudio sobre la biodiversidad de BAL asociada a los vinos de esta región,
así como su caracterización con objeto de determinar su potencial para la preparación de
nuevos starters autóctonos.
Analizando la distribución de estas especies en base a las etapas de procesado del vino
se aprecia que la gran mayoría de las cepas se aíslan durante la fase de fermentación
maloláctica con un 77,1% (27) de éstas, mientras que solo un 5,7% (2) se obtienen durante la
76
CAPÍTULO I Resultados y Discusión
fermentación alcohólica. En la etapa de mosto se aislaron un 17,1% (6) del total de cepas,
siguiendo la progresión habitual, descrita previamente (Pardo et al. 1989; Sieiro et al. 1990;
Renouf et al. 2006).
Esta frecuencia de aislamiento puede calificarse como baja o muy baja si se compara
con los datos de muchas regiones vinícolas estudiadas (Mesas et al., 2011; Sebastian et al.,
2011), sobre todo si se tiene en cuenta que fue necesario concentrar las muestras para conseguir
aislar las bacterias, aunque frecuencias de aislamiento bajas han sido reportadas también en
otras regiones productoras (Bae et al., 2006; Valdés La Hens et al., 2014). Los resultados
encontrados en el presente estudio son consistentes con las dificultades para la consecución
exitosa de la fermentación maloláctica en la región objeto de estudio, manifestadas
frecuentemente por los productores.
El empleo del kit comercial API® 50CHL permitió la elaboración del perfil de
asimilación de azúcares de cada uno de los aislados bajo estudio, comparativamente con el
obtenido a partir de las cepas de colección de las especies de bacterias lácticas más
comúnmente encontradas en vino. Dichos perfiles bioquímicos se muestran en la Fig. 5.
77
CAPÍTULO I
78
Figura 5: Perfiles bioquímicos de asimilación de azúcares obtenidos mediante el empleo del kit comercial API ® 50CHL.
Resultados y Discusión
CAPÍTULO I Resultados y Discusión
79
CAPÍTULO I Resultados y Discusión
Por otra parte, es interesante destacar las importantes diferencias encontradas entre los
perfiles de asimilación de carbohidratos de los aislados y sus respectivas cepas de referencia.
Estas diferencias pueden tener su explicación en los distintos medios de los que fueron
aisladas. Un ejemplo claro se encuentra en los aislados vínicos del grupo L. plantarum, que se
mostraron incapaces de asimilar lactosa, al contrario que las cepas de referencia incluidas en
dicho grupo y que fueron aisladas de productos lácteos. Este medio presenta una elevada
concentración de este carbohidrato y las cepas aisladas a partir del mismo están adaptadas para
su utilización.
La secuenciación del ADNr 16S de las bacterias aisladas en este trabajo y su posterior
comparación con la misma región disponible en las bases de datos, agrupó los 35 aislados en
6 grupos (Tabla 4): grupo Lactobacillus hilgardii, grupo Oenococcus oeni, grupo Lactococcus
lactis, grupo Pediococcus damnosus, grupo Lactobacillus paracasei/ casei y grupo
Lactobacillus plantarum/ pentosus.
80
CAPÍTULO I Resultados y Discusión
Nombre del aislado Especie según 16S* Nombre del aislado Especie según 16S*
* La columna “Especie según 16S” refleja la especie o especies en que sería incluido el aislado si solo
se tuviese en cuenta el porcentaje de identidad de la secuencia 16S (no mostrado) arrojado por el
programa blastn de Blast® (Basic Local Alignment Search Tool - http://blast.ncbi.nlm.nih.gov).
En aquellos grupos que incluyen dos especies, el porcentaje de identidad obtenido fue
del 100% para cualquiera de las dos, corroborando los agrupamientos realizados mediante el
test API® 50CHL. En ambos casos se incluyó en el análisis una especie filogenéticamente
cercana, L. rhamnosus CECT 288 en el grupo L. casei/paracasei y L. paraplantarum CECT
5787 en el grupo L. plantarum/ pentosus, a fin de verificar la ausencia de las mismas entre los
aislados incluidos en dichos grupos.
A partir de las secuencias génicas codificantes para la subunidad 16S del ribosoma
bacteriano de los aislados utilizados en este trabajo, así como de las depositadas en los bancos
de datos, se pudo establecer un árbol filogenético (Fig. 6) que agrupó los aislados en 6 grupos,
4 de ellos coincidentes con los grupos establecidos mediante el perfil de asimilación de
carbohidratos. Además, permitió incluir en algunos de estos grupos los aislados que no
pudieron ser incluidos en el test API® 50CHL por su pobre crecimiento y permitió el
agrupamiento de los aislados pertenecientes a las especies O. oeni y L. lactis.
81
CAPÍTULO I Resultados y Discusión
Figura 6: Árbol filogenético de máxima verosimilitud del gen ADNr 16S para las especies objeto de
estudio elaborado mediante los programas ClustalW2 y MEGA 5. Bootstrap de 1500 réplicas.
Tal como se indicó anteriormente, la identificación de los aislados fue completada y/o
confirmada mediante un análisis ARDRA. La digestión enzimática del ADNr 16S con enzimas
de restricción permitió confirmar las cepas pertenecientes a los géneros Oenococcus y
Pediococcus, así como las de la especie L. hilgardii.
82
CAPÍTULO I Resultados y Discusión
Concretamente, el corte enzimático del ADNr 16S con BfaI y AluI resultó en el mismo
perfil de bandas para las cepas UVI-24 , UVI-25 y UVI-29 que el obtenido para la cepa O.
oeni CECT 217, incluyendo a los aislados obtenidos en este estudio dentro de dicha especie
(Fig. 7).
A B
C
El corte de esta secuencia génica con HaeIII y, de nuevo con AluI, confirmó la
pertenencia de los aislados UVI-28, UVI-31, UVI-33, UVI-34, y UVI-35 a la especie
Pediococcus damnosus (Fig. 8).
A B
83
CAPÍTULO I Resultados y Discusión
El corte con MseI, tanto de las muestras analizadas en este estudio como de las cepas
de colección correspondientes, proporcionó el mismo patrón de bandas en los aislados UVI-4,
UVI-13, UVI-14, UVI-15, UVI-16, UVI-17, UVI-18, UVI-20, UVI-21, UVI-26 y en la cepa
de colección perteneciente a la especie L. hilgardii. La pertenencia de los aislados a esta
especie fue verificada, además, mediante la digestión con AluI y HaeIII. El patrón de digestión
de estos aislados con las enzimas AluI y HaeIII y MseI se muestra en la Fig. 9.
A B C
Figura 9: Perfil de restricción obtenido tras el corte de los fragmentos de ADNr 16S con las enzimas
MseI (A), AluI (B) y HaeIII (C). M: Marcador HyperLadder™ I (Bioline); 1: Lactobacillus hilgardii
CECT 4786; 2: Perfil correspondiente a los aislados UVI-4, UVI-13, UVI-14, UVI-15, UVI-16, UVI-
17, UVI-18, UVI-20, UVI-21 y UVI-26.
Del mismo modo que en el estudio de Rodas et al. (2005), el corte enzimático de esta
secuencia génica con BfaI (Fig. 10) nos permitió establecer la diferenciación entre los dos
grupos más homogéneos anteriormente descritos: L. casei/ paracasei y L. plantarum/
pentosus/ paraplantarum. Dada la proximidad entre las especies del primero de estos grupos
y L. rhamnosus, se introdujo en el análisis ARDRA la cepa de colección L. rhamnosus CECT
84
CAPÍTULO I Resultados y Discusión
288 para descartar la presencia de esta especie entre los aislados obtenidos en este trabajo. Esta
enzima proporciona un patrón de bandas diferente en cada uno de ellos, corroborando el
agrupamiento realizado previamente. Tras este corte enzimático se procedió a trabajar con
cada uno de ellos de forma independiente.
A B
B B
C C
Figura 10: Perfil de restricción obtenido tras el corte de los fragmentos de ADNr 16S con la enzima
BfaI. (A): M: Marcador HyperLadder™ I (Bioline); 1: L. rhamnosus CECT 288; 2: L. casei CECT 475;
3: L. paracasei CECT 4175; 4: Perfil correspondiente a los aislados UVI-2, UVI-12, UVI-1, UVI-5,
UVI-3 y UVI-7 (grupo L. casei/ paracasei/ rhamnosus). (B): M: marcador HyperLadder™ I (Bioline);
1: L. plantarum CECT 220; 2: L. pentosus CECT 4023; 3: L. paraplantarum CECT 5787; 4: Perfil
correspondiente a los aislados UVI-6, UVI-8, UVI-10, UVI-11 y UVI-19 (grupo L. plantarum/
pentosus/ paraplantarum).
Tanto en las digestiones correspondientes a los aislados que se estudian en este trabajo,
como en las pertenecientes a las cepas de L. casei y L. paracasei de la CECT, se obtuvieron
dos fragmentos de 250 y 1.250 pb aproximadamente, lo que de nuevo coincide con los cortes
in sílico realizados previamente.
85
CAPÍTULO I Resultados y Discusión
En este punto, y debido a la similitud entre las secuencias del ADNr 16S (100% de
identidad), se hizo imprescindible el empleo adicional de otras herramientas moleculares como
la región intergénica 16S/23S (ISR o “intergenic spacer region”) y el gen recA. Esta similitud
ya había sido descrita por Dellaglio et al. (2002) para las cepas de la ATCC (American Type
Culture Collection) de dichas especies, proponiendo la inclusión de ambas especies en la
especie L. casei.
La secuencia ISR había sido empleada con éxito por Moreira et al. (2005) para la
identificación de especies pertenecientes al género Lactobacillus. El análisis RFLP de esta
86
CAPÍTULO I Resultados y Discusión
secuencia con la enzima VspI nos aportó la identificación definitiva de los aislados de ese
grupo como pertenecientes a la especie L. paracasei, al proporcionar fragmentos de 250 y 350
pares de bases, tanto en los aislados como en la cepa de colección CECT 4175, no siendo así
en L. casei CECT 475, confirmando la utilidad de dicha secuencia como herramienta a la hora
de discernir entre estas especies. En la Fig. 12 se puede apreciar el perfil de restricción
obtenido para la cepa de L. paracasei CECT 4175, mientras que la enzima no presenta ningún
sitio de corte sobre el ISR de L. casei CECT 475. En este análisis se introdujo nuevamente L.
rhamnosus que había sido descartada anteriormente, a fin de verificar dicho descarte y con
ello confirmar la utilizad de la enzima BtgZI para la identificación de las especies de este grupo
filogenéticamente próximo.
Figura 13: Amplificación del gen recA con cebadores específicos: M: Marcador HyperLadder™ I
(Bioline); 1: L. plantarum CECT 220; 2: L. pentosus CECT 4023; 3: L. paraplantarum CECT 5787; 4:
Perfil correspondiente a los aislados UVI-6, UVI-8, UVI-9, UVI-10 y UVI-11.
87
CAPÍTULO I Resultados y Discusión
Se esperaba, tras la amplificación del gen recA con sus cebadores específicos, un
fragmento de 107 pb en la especie L. paraplantarum CECT 5787, sin embargo lo obtenido fue
un producto de PCR similar al de L. plantarum CECT 220 (318 pares de bases). Dichas
amplificaciones se muestran en la Fig. 13.
Este resultado sólo podría ser explicado asumiendo una identificación incompleta de
la cepa proporcionada por la Colección Española de Cultivos Tipo. Muchas de las cepas
depositadas en las distintas colecciones de microorganismos han sido identificadas solamente
empleando métodos bioquímicos, insuficientes para una identificación correcta a nivel de
especie. Además, el alineamiento de las secuencias recA de estas dos cepas (L. plantarum
CECT 220 y de L. paraplantarum CECT 5787), obtenidas con los oligonucleótidos
degenerados, aporta un 100% de identidad entre las 245 pares de bases alineadas, lo que
confirma esta posibilidad.
El alineamiento de las secuencias recA de 245 pares de las cepas aisladas en nuestro
laboratorio y las disponibles en las bases de datos generó unos agrupamientos con una marcada
diferenciación interespecífica, permitiendo identificar a los aislados estudiados en este trabajo
(UVI-6, UVI-8, UVI-9, UVI-10 y UVI-11) como L. plantarum. Este agrupamiento se aprecia
claramente en el árbol filogenético generado a partir de dicho alineamiento (Fig. 14).
UVI-6
UVI-10
L.paraplantarum CECT 5787
L.plantarum AJ2861191
100
L.plantarum AJ2922551
L.plantarum CECT 220
UVI-9
UVI-8
L.plantarum AJ2719621
L.paraplantarum AJ2719631
L.paraplantarum AJ2861201
100
L.paraplantarum AJ6216621
L.pentosus AJ2861181
0.02
Figura 14: Árbol filogenético de máxima verosimilitud obtenido con un fragmento de 245 pares de
bases del gen recA elaborado mediante el programa MEGA 5. Bootstrap de 1500 réplicas.
88
CAPÍTULO I Resultados y Discusión
Por lo tanto, los resultados de este análisis corroboran la utilidad del gen recA para la
identificación de estas especies del género Lactobacillus que se encuentran filogenéticamente
muy cercanas, como ya había sido propuesto anteriormente (Torriani et al., 2001; Rodríguez
et al., 2007), e identifican los aislados incluidos en este grupo como L. plantarum.
El estudio realizado en este trabajo muestra que, aunque el ADNr 16S puede ser
utilizado con éxito en la identificación a nivel de especie de algunos microorganismo, en
muchos casos no es suficiente, al igual que ocurre con las pruebas bioquímicas. En estos casos
es necesario recurrir a otro tipo de estudios, que serán diferentes en función del grupo de
microorganismos del que se trate, y que deben ser utilizados conjuntamente con los primeros
en una identificación polifásica.
89
CAPÍTULO I Resultados y Discusión
Figura 15: Esquema general del proceso de identificación de los aislados de bacterias ácido lácticas.
90
CAPÍTULO I Resultados y Discusión
Tabla 5: Tabla resumen del proceso de identificación de los aislados de bacterias lácticas.
Análisis
Año de Etapa de Secuenciación 16S-ARDRA restricción Secuenciación
Nombre API 50CH
Aislamiento muestreo* ADNr 16S (enzima/s) ISR gen recA
(enzima/s)
L. plantarum
CECT 220
L.
paraplantarum
CECT 5787
L. plantarum/L.
UVI-6 paraplantarum/L.
pentosus
L. plantarum/L.
UVI-8 paraplantarum/L.
pentosus L. plantarum/L.
L. plantarum/L.
2007 FML L. plantarum/L. paraplantarum/L.
paraplantarum/L. - L. plantarum
pentosus
UVI-9 paraplantarum/L. pentosus
pentosus (BfaI)
L. plantarum/L.
UVI-10 paraplantarum/L.
pentosus
UVI-11 -
l. casei CECT 475
L. paracasei
CECT 4175
L. rhamnosus
CECT 288
L. casei/L.
UVI-1 paracasei/ L.
rhamnosus
L. casei/L.
UVI-2 paracasei/ L.
rhamnosus
L. casei/L.
UVI-3 paracasei/ L.
rhamnosus L. casei/L.
L. casei/L. paracasei/ paracasei/ L. L. paracasei
2007 FML L. casei/L. -
L. rhamnosus rhamnosus (VspI)
UVI-5 paracasei/ L.
rhamnosus (BfaI, BtgZI)
L. casei/L.
UVI-7 paracasei/ L.
rhamnosus
UVI-12 -
L. casei/Lb.
UVI-19 paracasei/ Lb.
rhamnosus
L. hilgardii CECT
4786
UVI-4
UVI-13
UVI-14
UVI-15
UVI-16 FML
UVI-17 2007 L. hilgardii
L. hilgardii L. hilgardii - -
UVI-18 (MseI, AluI, HaeIII)
UVI-20
UVI-21
UVI-22 FA
UVI-23 FA
UVI-26 2008 M
O. oeni CECT
217
UVI-24
O. oeni
UVI-25 2008 M - O. oeni
(AluI, BfaI)
- -
UVI-29
P. damnosus
CECT 793
UVI-28 -
UVI-31 P. damnosus
UVI-32 - P. damnosus
2008 FML P. damnosus - -
UVI-33 P. damnosus (AluI, HaeIII)
UVI-34 -
UVI-35 P. damnosus
L. lactis CET 185
UVI-27 Lc. lactis
2008 M Lc. lactis - - -
UVI-30 -
*M= Mosto
FA= Fermentación alcohólica
MLF= Fermentación maloláctica
91
CAPÍTULO I Resultados y Discusión
2007 2008
100% 100%
37% 33%
75% Lc. lactis
75%
L. paracasei
P. damnosus
50% 100% 21% 50% 100%
L. plantarum 50% O. oeni
92
CAPÍTULO I Resultados y Discusión
Datos aportados por otros autores (Mesas et al., 2011; González-Arenzana et al.,
2013), muestran una mayor diversidad en las etapas previas a la fermentación maloláctica de
vinos tintos, lo que, en nuestro caso solo se cumple el segundo año.
Analizando los resultados de los dos años en conjunto, destaca L. hilgardii como la
única especie encontrada en FA, además de dominar en la etapa de FML, etapa en la que
comparte presencia con L. paracasei, L. plantarum y P. damnosus. En la primera etapa del
proceso de vinificación sería O. oeni la especie dominante, aunque, de nuevo, L. hilgardii tiene
una presencia importante, junto con L. lactis (Fig. 17).
93
CAPÍTULO I Resultados y Discusión
Figura 17: Distribución de los aislados (gráfico central) y diversidades microbiológicas (gráficos
adyacentes) por especie en función de la etapa de vinificación. Verde: FML; Naranja: FA; Azul: M.
6,3%
9,4% L. hilgardii
31,3% L. paracasei
P. damnosus
12,5%
L. plantarum
O. oeni
L. lactis
18,8%
21,9%
Figura 18: Distribución de los aislados de BAL en función de especie, teniendo en cuenta las dos
anualidades.
94
CAPÍTULO I Resultados y Discusión
En total se han identificado 6 especies diferentes lo que podría estimarse como una
elevada diversidad dado el bajo número de aislados analizado. Además es destacable que, a
diferencia de lo que se ha descrito para la mayoría de las regiones vinícolas estudiadas
tradicionalmente (Ruiz et al., 2010; González-Arenzana et al., 2012; Pérez-Martín et al.,
2015), las especies de BAL predominantes en los vinos de la variedad Albariño cultivada en
esta región pertenecen al género Lactobacillus y no a la especie O. oeni que, además, no se ha
encontrado en FML en ninguno de los años analizados. Sin embargo, nuestros datos coinciden
con los de algunas regiones vinícolas estudiadas recientemente para las que también se han
descrito como predominantes las especies del género Lactobacillus (Bravo-Ferrada et al.,
2013; Testa et al., 2014; Henríquez-Aedo et al., 2016).
95
CAPÍTULO I Resultados y Discusión
Varios criterios se han establecido para la selección de cepas BAL como cultivos
iniciadores en enología (Volschenk et al., 2006). Un rápido crecimiento en vino, una elevada
actividad maloláctica, la no producción de aminas biógenas (principalmente histamina) o
aromas desagradables, entre otros, son factores importantes a considerar para esta selección.
Para llevar a cabo la caracterización enológica de las bacterias lácticas aisladas en este
trabajo, en una primera selección se escogieron los aislados que mostraron mejor crecimiento
en los medios de laboratorio y agar vino, y que presentaron un perfil diferente de asimilación
de azucares en la prueba API 50CH: 1 aislado de la especie L. plantarum (UVI-9), 2 aislados
de O. oeni (UVI-25), 3 aislados de la especie L. paracasei (UVI-2, UVI-3 y UVI-5) y 10
aislados de la especie L. hilgardii (UVI-13, UVI-14, UVI-15, UVI-16, UVI-17, UVI-18, UVI-
20, UVI-21, UVI-23 y UVI-26).
96
CAPÍTULO I Resultados y Discusión
Del total de cepas de bacterias ácido lácticas incluidas en el estudio, el 50% (8) fueron
capaces de llevar a cabo una fermentación maloláctica satisfactoria tras 15 días de incubación
a 22 ºC, alcanzando una reducción en el contenido de ácido málico de más de un 75% (Fig.
19), dejando su concentración por debajo de 1,5 g/L. La actividad maloláctica fue altamente
variable entre y dentro de las especies estudiadas, desde un 2,67% en la cepa UVI-3 a un 76,7%
en la cepa UVI-17 (Fig. 19).
Tabla 6: Ensayos de microvinificación con las cepas seleccionadas: Concentración de ácido málico,
ácido láctico, y acidez volátil tras 15 días de fermentación a 22 ºC.
Cepa Ácido málico g/L Ácido láctico g/L Acidez volátil g/L b
Control a 3,95 (± 0,39) 0,67 (± 0,43) 0,21 (± 0,01)
UVI-2 (L. paracasei) 0,98 (± 0,11) 3,40 (± 0,07) 0,12 (± 0,01)
UVI-3 (L. paracasei) 3,65 (± 0,07) 0,08 (± 0,04) 0,22 (± 0,00)
UVI-5 (L. paracasei) 2,48 (± 0,25) 1,95 (± 0,28) 0,18 (± 0,00)
UVI-9 (L. plantarum) 3,48 (± 0,04) 0,10 (± 0,00) 0,23 (± 0,01)
UVI-13 (L. hilgardii) 3,58 (± 0,04) 0,08 (± 0,04) 0,22 (± 0,01)
UVI-14 (L. hilgardii) 1,23 (± 0,04) 3,68 (±0,04) 0,21 (± 0,03)
UVI-15 (L. hilgardii) 3,55 (± 0,07) 0,03 (± 0,04) 0,23 (± 0,01)
UVI-16 (L. hilgardii) 3,55 (± 0,07) 0,03 (± 0,04) 0,22 (± 0,01)
UVI-17 (L. hilgardii) 1,03 (± 0,04) 4,00 (± 0,07) 0,22 (± 0,01)
UVI-18 (L. hilgardii) 1,05 (± 0,00) 3,35 (± 0,14) 0,11 (± 0,03)
UVI-20 (L. hilgardii) 1,18 (± 0,04) 3,93 (± 0,04) 0,23 (± 0,01)
UVI-21 (L. hilgardii) 1,10 (± 0,14) 3,78 (± 0,25) 0,16 (± 0,02)
UVI-23 (L. hilgardii) 1,08 (± 0,11) 3,90 (± 0,00) 0,19 (± 0,01)
UVI-24 (O. oeni) 3,55 (± 0,07) 0,03 (± 0,04) 0,23 (± 0,00)
UVI-25 (O. oeni) 3,48 (± 0,04) 0,18 (± 0,04) 0,23 (± 0,01)
UVI-26 (L. hilgardii) 4,03 (± 0,25) 0,83 (± 0,18) 0,33 (± 0,01)
Medias ± desviación estándar.
a: Vino sin inocular; b: acidez volátil expresada como g/L de ácido acético.
97
CAPÍTULO I Resultados y Discusión
100
90
Consumo de ác. málico (%)
80
70
60
50
40
30
20
10
0
Aislado
Figura 19: Porcentaje total de ácido málico consumido por cada uno de los aislados tras 15 días de
incubación a 22 ºC.
Estos resultados son consistentes con los obtenidos por Juega et al. (2009) en vinos
blancos Albariño y Caíño, en los cuales ni las cepas autóctonas de O. oeni ni las comerciales,
inoculadas al final de la fermentación alcohólica, fueron capaces de llevar a cabo una
fermentación maloláctica satisfactoria. Du Toit et al. (2011) describen también una mejor
actividad maloláctica de varias especies de Lactobacillus frente a la obtenida tras la
inoculación de O. oeni en vinos con un pH superior a 3,5, como es el caso del vino empleado
en el presente estudio (pH 3,8).
98
CAPÍTULO I Resultados y Discusión
Las bacterias lácticas son consideradas las principales responsables del incremento en
aminas biógenas de los vinos (Landete et al., 2007). Las aminas biógenas, dependiendo de su
concentración, pueden ocasionar numerosos efectos adversos sobre la salud (Shalabay, 1996).
En concreto, la histamina da lugar a una toxicidad significativa, sobre todo en personas con
especial sensibilidad (Landete et al., 2005).
Por ello, esta capacidad debe ser testada a la hora de proponerlas como estárteres
malolácticos. La habilidad para la síntesis de las tres principales aminas biógenas presentes en
los vinos (histamina, tiramina y putrescina) (García-Ruiz et al., 2011) fue evaluada en las ocho
cepas que mostraron una mayor actividad maloláctica. En una primera aproximación se intentó
poner de manifiesto esta capacidad a nivel molecular mediante la amplificación por PCR de
los genes hdc (histidina descarboxilasa implicada en la ruta de síntesis de histamina), odc
(ornitina descarboxilasa implicada en la síntesis de putrescina) y tdc (de la ruta de síntesis de
tiramina) de acuerdo con el protocolo de De las Rivas et al., 2005. Los resultados se muestran
en la Fig. 20.
pb M 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10
1000 - 11 12
A 700 -
2000 -
B 1500 -
500 -
C
300 -
Figura 20: Amplificación de los genes tdc (A), odc (b) y hdc (B) en las BAL seleccionadas. M: 1 kb
Ladder (Biorom); 1: Control positivo (A: L. brevis CECT 5354 para el gen tdc, B: L. helveticus CECT
403 para el gen odc y C: L. rhamnosus CECT 288 para el gen hdc); 2: UVI-14; 3: UVI-5; 4: UVI-20;
5: UVI-17; 6: UVI-18; 7: UVI-21; 8: UVI-23; 9: UVI-22; 10: UVI-2.
99
CAPÍTULO I Resultados y Discusión
Al tratar de amplificar el gen tdc se obtuvo una banda de menor tamaño al esperado y
que sí se amplificó en el control positivo L. brevis CECT 5354 con su tamaño correcto (Fig.
20A). Ante lo dudoso de este resultado, tres de la bandas amplificadas se secuenciaron
comprobándose, efectivamente, que no corresponden a la tirosina descarboxilasa, por lo que
este método no resultó concluyente para las especies L. hilgardii y L. paracasei. El gen odc
solo fue amplificado en la cepa UVI-5 y en la cepa de L. helveticus CECT 403 empleada como
control positivo, encontrándose ausente en el resto de las cepas estudiadas (Fig. 20B). Por
último, el gen hdc no fue amplificado a partir de ninguna de las cepas analizadas
comparativamente con la cepa L. rhamnosus CECT 288 utilizada como control positivo (Fig.
20C). Estos datos coinciden con los obtenidos por Nisiotou et al. (2004) quienes también
encontraron una muy baja presencia del gen codificante para la histidina descarboxilasa en
bacterias lácticas.
En segundo lugar, la capacidad de las citadas 8 cepas para liberar aminas biógenas al
vino fue estudiada mediante LC/MS-MS. La separación completa de las tres aminas biógenas
en muestras de vino se llevó a cabo satisfactoriamente usando cromatografía de interacción
hidrofílica (HILIC). Los resultados se muestran en la Tabla 7.
Tabla 7: Presencia de los genes hdc, odc y tdc, y concentraciones de histamina, tiramina y putrescina
detectadas en los análisis de vino mediante LC/MS-MS, tras 15 días de fermentación con las cepas de
bacterias ácido lácticas seleccionadas.
† Presencia (+) o ausencia (-) de los genes tdc, odc y/o hdc (incremento en concentración de la
correspondiente amina biógena frente al control, en mg/L). nd: no detectado. SD < 0,01.
100
CAPÍTULO I Resultados y Discusión
En los vinos inoculados con la cepa UVI-5, que presenta el gen odc, no se detectó
putrescina, lo que puede ser explicado teniendo en cuenta que el incremento significativo en
aminas biógenas en el vino depende no solo de la capacidad de la cepa para producirlas sino
de la concentración de los precursores presentes en el mismo (Lonvaud-Funel, 2001). Esto
explica también que la concentración de aminas biógenas sea habitualmente superior en vinos
tintos que en blancos en los que estos precursores aparecen generalmente en menor
concentración (Bauzá et al., 1995; Smit et al., 2008).
Se ha demostrado que algunas bacterias del ácido láctico pueden degradar aminas
biógenas mediante enzimas amino oxidasas (Capozzi et al., 2012). Esta característica está
considerada también de interés en los estárteres malolácticos. Utilizando el método descrito
por Callejón et al. (2014) se intentó determinar la capacidad para sintetizar enzimas amino
oxidasas en las cepas malolácticas seleccionadas. La ausencia de éstas tras los análisis
realizados descartan la capacidad para degradar aminas biógenas en las cepas de bacterias
lácticas incluidas en dicho análisis.
101
CAPÍTULO I Resultados y Discusión
Tabla 8: Actividad β-glucosidasa en las ocho cepas seleccionadas por su actividad maloláctica.
102
CAPÍTULO I Resultados y Discusión
A pesar del gran número de estudios sobre O. oeni, son escasas las referencias acerca
de la actividad β-glucosidasa tanto en L. paracasei como en L. hilgardii. Marazza et al. (2008)
encontraron actividad β-glucosidasa en cepas de L. paracasei, con una gran variabilidad entre
las cepas estudiadas, y Honi et al. (2013) y Pérez-Martin et al. (2012) encontraron dicha
actividad en cepas de L. paracasei aisladas de productos lácteos. Hasta donde nosotros
sabemos, solamente el estudio de Pérez-Martin et al. (2012) analiza cepas vínicas de la especie
L. hilgardii en busca de actividad β-glucosidasa, obteniendo resultados negativos, aunque
Mtshali et al. (2010) han demostrado la presencia de genes codificantes para esta enzima en
cepas vínicas de L. hilgardii, lo que es consistente con los resultados obtenidos en este estudio.
Además, algunos autores han estudiado esta actividad en especies cercanas, como L. casei
(Coulon et al., 1998) o L. plantarum (Sestelo et al., 2004; Spano et al., 2005).
pb M 1 2 3 4 5 6 7 8 9
400 -
300 -
200 -
Figura 21: Amplificación mediante PCR del gen pdc. M: Marcados 100 pb Bioron Plus Ladder; 1: L.
brevis CECT 5354; 2: UVI-21; 3: UVI-20; 4: UVI-23; 5: UVI-17; 6: UVI-18; 7: UVI-14; 8: UVI-5; 9:
UVI-2.
103
CAPÍTULO I Resultados y Discusión
Los fenoles volátiles producidos por las bacterias malolácticas pueden añadir
complejidad aromática al vino o impactar negativamente en sus características sensoriales
dependiendo de su concentración (Mtshali et al., 2010). En concreto, en algunos estudios, se
ha cuestionado la idoneidad de L. hilgardii como bacteria maloláctica de interés al atribuírsele
la capacidad de impactar negativamente en el aroma del vino debido a la producción de fenoles
volátiles (du Toit et al., 2011). Al igual que en otras características estudiadas, nuevamente,
en este caso, se demuestra que se trata de una propiedad de la cepa más que de la especie y,
las caracterizadas en este estudio, no presentarían el riesgo referido anteriormente.
Por otra parte, la capacidad para producir fenoles volátiles que pudieran afectar
negativamente al aroma del vino fue descartada en las ocho cepas que mostraron actividad
maloláctica. Por último, tanto las cepas de L. hilgardii como L. paracasei mostraron capacidad
para producir β-glucosidasa en distintas concentraciones por lo que podrían contribuir a
mejorar y diferenciar el perfil aromático de los vinos de la región estudiada confiriéndoles
tipicidad. Los resultados muestran que las cepas del género Lactobacillus seleccionadas en
este trabajo (en particular L. paracasei UVI-2 y L. hilgardii UVI-23) son buenas candidatas
104
CAPÍTULO I Resultados y Discusión
para estudios de vinificación a escala piloto y ser propuestas como nuevos starters
malolácticos autóctonos.
105
CAPÍTULO II
CAPÍTULO II Introducción
1. INTRODUCCIÓN
109
CAPÍTULO II Introducción
En el caso de las bacterias, los efectos del consumo de determinadas especies son de
sobra conocidos y expuestos en la bibliografía médica. Las infecciones por Salmonella, por
110
CAPÍTULO II Introducción
ejemplo, pueden causar dolores abdominales, náusea, vómito y diarrea, mientras que aquellas
producidas por Clostridium presenta un cuadro clínico que va desde una diarrea acuosa con
dolores abdominales de diferente intensidad, a una enterocolitis hemorrágica necrosante (Acha
y Szyfres, 2005).
En enología, los hongos pueden tener un impacto variable. Su presencia puede ser
considerada positiva en determinados vinos (por ejemplo, el vino Mâcon del Domaine de la
Bongran, elaborado tras la contaminación con Botritis), sin embargo, en la mayoría de los
casos son tratados como contaminantes que han de ser erradicados, a fin de evitar la pérdida
total del producto. Especies de Aspergillus aparecen habitualmente asociadas a la uva.
Concretamente, A. niger, supone la especie de Aspergillus más común en este fruto, siendo
además una de las principales fuentes de ocratoxina A (Hocking et al., 2007). En la vid, los
principales hongos patógenos incluyen las especies Botritis cinerea, Uncinula necátor (Oídio),
Plasmopara vitícola (Mildiu o “Mildew”), Guignardia bidwellii (podredumbre negra o “Black
rot”), Phomopsis vitícola (excoriosis de la vid), Eutipa lata (Cantoral y Collado, 2011) y
Fusarium oxysporum (Omer et al., 1999).
111
CAPÍTULO II Introducción
112
CAPÍTULO II Introducción
En la permanente lucha contra los agentes que afectan tanto a la industria agrícola
como a la alimentaria, a menudo y de manera recurrente se han empleado pesticidas de origen
químico como mecanismo de control frente a las bacterias, hongos, nematodos o insectos que
las causan. Así, es habitual el empleo de organofosforados, carbamatos y/o hidrocarburos
clorados en el tratamiento o prevención de plagas en cultivos (Koul, 2011). Sin embargo,
muchos de estos compuestos permanecen inalterados a lo largo de la cadena alimentaria,
alcanzando al consumidor final, además de las graves implicaciones medioambientales que
supone su uso indiscriminado.
113
CAPÍTULO II Introducción
Así, por ejemplo, pesticidas como el malatión, insecticida de uso generalizado en todo
el mundo, se encuentran en el grupo 2A, y fungicidas como el clorotalonil, es clasificado como
posible carcinógeno (Grupo 2B).
El empleo de organismos vivos y/o productos derivados de los mismos para el control
de plagas, pestes y microorganismos indeseados para la industria alimentaria y agrícola, ha
experimentado un fuerte auge en los últimos 150 años. Esto se ha reflejado en un incremento
de un 10% anual del mercado de este tipo de productos, frente al 1-2% de incremento de
aquellos basados en agentes químicos (Koul, 2011).
Agentes de control biológico (ACB) incluyen bacterias, hongos, virus, y/o nematodos,
que han demostrado una elevada eficiencia en el control de organismos perniciosos, con el
valor añadido de ser poco o nada nocivos para el medio ambiente.
114
CAPÍTULO II Introducción
- ACB microbianos: emplean organismos vivos e incluyen bacterias, hongos, virus, y/o
nematodos, y que han demostrado una elevada eficiencia en el control de agentes perniciosos,
con el valor añadido de ser poco o nada nocivos para el medio ambiente. Uno de los más
empleados es Bacillus thuringiensis, que produce una endotoxina que resulta nociva para los
insectos una vez entra en su sistema digestivo. En el caso de los antifúngicos, destacan especies
del género Trichoderma (AgroGuard® WG - LST S.A.-), Candida, como C. oleophila (Aspire®
-Ecogen-) o C. sake (Candifruit® -IRTA-), del género Pseudomonas (Bio-Save® -JET Harvest
Solutions-) o de Bacillus (Rhizo-Plus® -FZB Biotechnik GmbH-) entre otros (Mari et al.,
2014).
115
CAPÍTULO II Introducción
116
CAPÍTULO II Introducción
para evitar o reducir el impacto que los microorganismos más perniciosos tienen sobre estos
productos.
Las BAL además, cumplen la mayor parte de los criterios establecidos por Nunes
(2012) para la selección de agentes de biocontrol mencionados en el apartado anterior, a
excepción de sus necesidades nutricionales, que a menudo son relativamente complejas
aunque dependen de la cepa utilizada. Sin embargo, las condiciones que encuentran en la
mayor parte de los productos alimenticios proporcionan aquellas sustancias que las BAL
necesitan para su desarrollo, al tratarse muchos de ellos del hábitat natural de estos
microorganismos, como es el caso de frutas y verduras, o derivados de los mismos (Douillard
y de Vos, 2014).
Las especies de Lactobacillus, L. plantarum (Laitila et al., 2002; Sathe et al., 2007;
Trias et al., 2008), L. paracasei (Hassan y Bullerman, 2008), L. acidophilus (Garcha et al.,
2012), L. casei o L. fermentum (Wang et al., 2011) así como especies del género Pediococcus:
P. pentosaceus (Rouse et al., 2008) y Lactococcus: L. lactis (Trias et al., 2008), han
117
CAPÍTULO II Introducción
Los microorganismos más estudiados para esta finalidad han sido los asociados a la
rizosfera. Concretamente, especies de los géneros Bacillus, Azospirillum o Rhizobium han
demostrado tener efectos beneficiosos sobre la germinación y sobre el crecimiento de
determinadas plantas (Vaikuntapu et al., 2014; Giassi et al., 2016). Aunque en menor medida,
varios autores han estudiado también la capacidad de las BAL para la estimulación del
crecimiento vegetal. Concretamente, Limanska et al. (2013) pusieron de manifiesto esta
habilidad sobre plántulas de tomate y Shrestha et al. (2014) mostraron que cepas de bacterias
lácticas eran capaces de estimular el crecimiento de plantas de pimiento, lo que justifica la
búsqueda de efectos fitoestimuladores entre algunas de las bacterias lácticas aisladas de otros
orígenes, en particular de las aisladas en el capítulo anterior.
118
CAPÍTULO II Materiales y Métodos
2. MATERIALES Y MÉTODOS
Tabla 1: Cepas empleadas en la determinación del efecto antimicrobiano de las bacterias lácticas.
Las cepas de bacterias ácido lácticas (BAL) utilizadas fueron aquellas pertenecientes
a las especies Lactobacillus hilgardii (UVI-13, UVI-14, UVI-15, UVI-16, UVI-17, UVI-18,
UVI-20, UVI-21, UVI-23 y UVI-26), Lactobacillus plantarum (UVI-6, UVI-8 y UVI-10),
Lactobacillus paracasei (UVI-3, UVI-5, UVI-1, UVI-2, UVI-7, UVI-11, UVI-12 y UVI-19)
y Lactococcus lactis (UVI-27).
Medio MRS (de Man, Rogosa y Sharpe, Panreac): ver composición en el Capítulo 1,
Sección 1.1. Este medio fue utilizado para el crecimiento y mantenimiento de las cepas de
bacterias ácido lácticas.
119
CAPÍTULO II Materiales y Métodos
Medio Mueller-Hinton (Panreac): Almidón 1,5 g/L, Infusión de carne 2 g/L y Peptona
de caseína hidrolizada 17,5 g/L. Este medio fue empleado para el crecimiento y mantenimiento
de las cepas de los géneros Xanthomonas, Staphylococcus y Bacillus.
Para la elaboración de medio sólido se añadió, en todos los casos, agar a una
concentración de 20 g/L. Todos los medios, tanto sólidos como líquidos, fueron esterilizados
mediante autoclave a 121 ºC y 1,1 atmósferas de presión, durante 15 min.
2.3. Determinación in vitro del efecto antagónico de las BAL frente a bacterias y
levaduras
La estimación del antagonismo entre las bacterias lácticas seleccionadas y las bacterias
objeto de biocontrol se llevó a cabo en medio MRS+CN a fin de permitir el crecimiento de
todos los microorganismos ensayados, lo cual fue verificado previamente.
120
CAPÍTULO II Materiales y Métodos
2.4. Determinación in vitro del efecto antagónico de las BAL frente a hongos
filamentosos
Una vez crecidos éstos, se realizó un raspado de la superficie de los mismos y se añadió
solución salina (NaCl 0,8%) a fin de obtener una suspensión de esporas o conidios que fue
posteriormente ajustada a 104 conidios/mL.
La suspensión celular de las cepas de BAL seleccionadas para el estudio fue obtenida
como se ha indicado en el apartado anterior. La densidad celular de cada una de las cepas de
bacterias lácticas se ajustó a 106 células/mL.
Este ensayo se realizó contemplando dos variantes: en una de ellas se sembraron las
bacterias y los hongos simultáneamente, mientras que en la otra se estableció un tiempo de
incubación de 48 h entre la inoculación de las bacterias y la de los hongos (en ese orden).
Como controles, se dispusieron placas sembrando cada uno de los hongos, como se indicó
121
CAPÍTULO II Materiales y Métodos
anteriormente, sin la presencia de bacterias. En ambos casos, las placas se incubaron durante
72 horas en el caso de A. niger y 144 h en el caso de F. oxysporum, a 28 ºC.
Una vez seleccionadas las BAL en base a su capacidad para el biocontrol in vitro de
F. oxysporum, se realizó un ensayo para determinar su potencial aplicación en cultivos reales.
Al tratarse de un hongo patógeno, entre otros cultivos, del tomate, se emplearon semillas de
Lycopersicum esculentum de la variedad Marmande Cuarenteno (Eurogarden Iberica S.A.)
como modelo para llevar a cabo los ensayos in vivo.
Por otra parte, se analizó el efecto que la presencia del hongo tiene sobre plantas de
tomate y la capacidad de las BAL para reducir dicho efecto, para lo cual se siguió el protocolo
descrito por Omar et al. (2006) con algunas modificaciones. Las semillas se mantuvieron a
remojo durante 3 h, tras lo cual se trasladaron a un germinador donde se mantuvieron durante
122
CAPÍTULO II Materiales y Métodos
Todas las plantas fueron regadas cada 4 días con 13 mL de agua corriente estéril por
planta, aplicada desde la base de la maceta para evitar el lavado de bacterias, y con un mililitro
de suspensión bacteriana (106 células/mL) aplicada en la base del tallo. Cada tratamiento
estuvo conformado por 13 réplicas. Se establecieron dos controles: uno de ellos tratado solo
con el hongo, inoculado del modo y a la densidad antes mencionados, y otro sin adición de
hongo ni de bacteria.
123
CAPÍTULO II Materiales y Métodos
El grado de inhibición del crecimiento de las bacterias y levaduras probadas por parte
de las cepas lácticas bajo estudio se determinó mediante la medición del radio del halo de
inhibición de las mismas en torno a la gota de la suspensión de las BAL.
124
CAPÍTULO II Resultados y Discusión
3. RESULTADOS Y DISCUSIÓN
125
CAPÍTULO II Resultados y Discusión
126
CAPÍTULO II Resultados y Discusión
Figura 1: Halos de inhibición mostrados por algunas de las cepas lácticas frente a Bacillus cereus CECT
193 (A) y Bacillus thuringiensis CECT 4497 (B).
Tabla 2: Efecto antagónico mostrado por cada una de las cepas objeto de estudio en función del halo
de inhibición.
Cepas testigo
Cepa
BAL B. cereus B. thuringiensis
S. S. X. S.
C. glabrata
epidermidis aureus campestris cerevisiae
UVI-26 * ** - - - - -
UVI-13 - * - - - - -
UVI-14 * ** - - - - -
UVI-15 * *** - - - - -
L. hilgardii UVI-16 * ** - - - - -
UVI-17 * * - - - - -
UVI-18 * * - - - - -
UVI-20 * ** - - - - -
UVI-21 ** - - - - - -
UVI-23 * ** - - - - -
UVI-6 - nd *** ** - - -
L. plantarum UVI-8 - - - - - - -
UVI-10 - ** ** ** - - -
UVI-3 * * * ** - - -
UVI-5 - * * ** - - -
UVI-1 * * ** *** - - -
UVI-2 *** nd - - - - -
L. paracasei
UVI-7 * * ** ** - - -
UVI-11 * * *** ** - - -
UVI-12 * * ** *** - - -
UVI-19 * * ** ** - - -
(-) no inhibición; (*) radio de inhibición < 3,6 mm; (**) radio de inhibición entre 3,6 y 6,1 mm, (***) radio de
inhibición > 6,1 mm; (nd) no determinado.
127
CAPÍTULO II Resultados y Discusión
En primer lugar se observa que ninguna de las cepas ensayadas fue capaz de inhibir el
desarrollo de las levaduras probadas, lo que concuerda con los resultados obtenidos por Rouse
et al. (2007) quienes fueron también incapaces de inhibir el crecimiento de cepas de los
géneros Saccharomyces o Cándida, mediante el empleo de una cepa de L. plantarum. En este
estudio se demuestra, además, que las especies L. hilgardii, L. paracasei y L. lactis tampoco
tienen capacidad para inhibir el crecimiento de las levaduras.
En segundo lugar, se aprecia también que ninguna de las cepas probadas tiene
capacidad para inhibir a la bacteria Gram negativa X. campestris, patógena de plantas. En este
sentido, Anas et al. (2008) describen un mayor efecto inhibidor frente a bacterias Gram
positivas que sobre Gram negativas tras la aplicación de varias cepas de Lactobacillus,
observación que concordaría con los resultados del presente estudio. Sin embargo, la ausencia
de efectos inhibitorios sobre dicha bacteria fitopatógena discrepa con otros resultados descritos
previamente en los que se aprecia un importante antagonismo de algunas cepas de L.
plantarum o L. casei frente a esta especie (Visser et al., 1986, Trias et al. 2008).
Con respecto a las cepas Gram positivas utilizadas como testigo, se observa que todas
ellas fueron inhibidas por, al menos, una de las especies de bacterias lácticas mencionadas
anteriormente apreciándose, además, una elevada variabilidad intraespecífica tanto en el grado
de inhibición como en el espectro de actividad. Es destacable también que una de las cepas
lácticas probadas, L. plantarum UVI-8, no mostró capacidad para inhibir a ninguno de los
microorganismos testigo. Esta cepa, aunque no tendría utilidad aplicada, podría ser de gran
interés en próximos estudios encaminados a dilucidar el/los mecanismos de inhibición
utilizados por las cepas efectivas.
128
CAPÍTULO II Resultados y Discusión
Figura 2: Distribución interespecífica de las medidas de los halos de inhibición frente a cada uno de las
de las cepas testigo. Los resultados se muestran como la media entre los radios de cada especie ± SD.
129
CAPÍTULO II Resultados y Discusión
130
CAPÍTULO II Resultados y Discusión
(Hamed et al., 2011; Gerez et al., 2013; Gomah y Zohri, 2014) debido a su capacidad para
producir y liberar metabolitos como reuterina, ácidos orgánicos como el ácido láctico, o
compuestos fenólicos (Dalié et al., 2010) o a la producción de sustancias antifúngicas de
naturaleza proteica (Gerez et al., 2013). Sin embargo, la posible capacidad antifúngica de las
bacterias lácticas procedentes del vino no había sido estudiada con anterioridad. Por esta razón,
se decidió probar también en este trabajo el posible efecto inhibitorio de las bacterias
malolácticas sobre hongos fitopatógenos y/o alterantes de alimentos.
Para cada bacteria probada se realizaron dos ensayos, uno en el que el hongo y la
bacteria se sembraron simultáneamente y otro en el que se cultiva la bacteria previamente
durante 48 h, antes de sembrar el hongo. Un ejemplo de este bioensayo se muestra en la Fig.
3 y el conjunto de los resultados se presentan en las Fig. 4 y 5.
131
CAPÍTULO II Resultados y Discusión
A B
Figura 3: Efecto antimicrobiano de la cepa L. plantarum UVI-10 frente F. oxysporum (B) y control
mostrando el crecimiento normal del hongo en ausencia de la bacteria (A).
Primeramente se observa que ninguna de las cepas bajo estudio fue capaz de inhibir
al hongo Aspergillus niger, cuyo crecimiento alcanzó a cubrir la placa de medio de cultivo en
menos de 72 horas, sin apreciarse reducción de su desarrollo en aquellas que contenían
suspensión de BAL. Este resultado concuerda con un estudio llevado a cabo por Hassan y
Bullerman (2008), en el que ninguna de las cepas de bacterias lácticas ensayadas, y aisladas
de estárteres comerciales de levadura, fue capaz de reducir el crecimiento de A. niger NRRL
326. Su rápido desarrollo en medio MRS podría estar detrás de esta observación, al no permitir
la proliferación suficiente de las bacterias y con ello la formación de las sustancias
antimicrobianas implicadas en la inhibición. Sin embargo, parece más probable que sea debido
a la incapacidad de las cepas probadas para sintetizar sustancias inhibitorias ya que, la
inhibición del crecimiento de este hongo por parte de cepas de bacterias lácticas como L. casei
o L. plantarum ha sido descrito en otras ocasiones (Dalié et al., 2010; Gerez et al., 2013).
132
CAPÍTULO II Resultados y Discusión
Figura 4: Inhibición del crecimiento de F. oxysporum, expresado como % de reducción del radio de la
colonia en presencia de cada una de las cepas lácticas ensayadas tras la inoculación simultanea de ambos
microorganismos (barras de rayas) y con una incubación de 48 horas de la batería láctica previa a la
inoculación del hongo (barras de puntos). Se presenta la media ± SD. Los asteriscos indican diferencias
significativas (p ≤ 0,05) entre las dos modalidades de inoculación antes mencionadas.
Si tomamos las cepas en su conjunto y comparamos los dos ensayos para cada una de
ellas (Fig. 4), se observa que para 4 (UVI-3, 5, 7 y 10), el efecto inhibitorio es
significativamente mayor cuando las bacterias tienen la posibilidad de desarrollarse antes de
enfrentarse al hongo, sin embargo, para las otras cuatro no; aunque en todos los casos parece
detectarse una tendencia en el sentido de un efecto favorecedor de la pre-incubación de la
bacteria antes de la inoculación del hongo.
Comparando el grado de inhibición del hongo por parte de las distintas cepas de
bacterias lácticas, sin (Fig. 5A) y con (Fig. 5B) pre-cultivo de la bacteria láctica, se observa
una cierta variabilidad en el poder inhibitorio de las distintas cepas probadas, manifestada por
las diferencias significativas encontradas ente ellas, siendo el grado de inhibición del hongo
superior al 44% en todos los casos. Las diferencias oscilan entre un 44% para la cepa UVI-5
y un 55% para la cepa UVI-10, en el caso del ensayo en el que la bacteria y el hongo se
siembran simultáneamente y, entre un 56% para la cepa UVI-12 y un 76% para la cepa UVI-
7, en el caso del ensayo en el que la bacteria se incuba previamente. Cuando se comparan estos
resultados con los mejores datos obtenidos por otros autores con cepas de otros orígenes, se
constata una vez más la alta eficacia antifúngica en el caso de las bacterias malolácticas. Laitila
133
CAPÍTULO II Resultados y Discusión
Figura 5: Inhibición del crecimiento de F. oxysporum en presencia de cada una de las cepas lácticas
ensayadas tras la siembra simultanea de ambos microorganismos (A) y con una incubación de 48 horas
de la bacteria láctica previa siembra del hongo (B). Se presenta la media ± SD. Letras diferentes indican
diferencias significativas (p ≤ 0,05).
En estudios previos, la capacidad de las bacterias lácticas para inhibir a las especies
del genero Fusarium resultó controvertida. Los trabajos llevados a cabo por Hassan y
Bullerman (2008) revelaron un importante efecto inhibidor de cepas de L. paracasei, aisladas
a partir de boza, sobre dos especies de Fusarium (F. graminearum, F. proliferatum). En
cambio, en el lado contrario, Gomah y Zohri (2014) obtuvieron una escasa o nula reducción
del crecimiento de F. graminearum, F. proliferatum y F. culmorum al aplicar cepas de la
especie L. plantarum. En el presente trabajo se demuestra la efectividad de las bacterias
lácticas de origen vínico sobre este género al inhibir las cepas de L. plantarum y L. paracasei
el desarrollo de la especie F. oxysporum.
134
CAPÍTULO II Resultados y Discusión
135
CAPÍTULO II Resultados y Discusión
2008; Gerez et al., 2013), propiedad ésta que depende también de la cepa, justificando
nuevamente el screening a este nivel, y que puede considerarse muy deseable de cara a su uso
como bioconservantes en productos en cuya elaboración y/o composición se requiere la
presencia de hongos o levaduras viables, como en el caso del queso, pan o vino. Además de
las ya mencionadas ventajas, en relación con la seguridad alimentaria, del uso de las bacterias
lácticas como bioconservantes alternativos a los productos sintéticos, su desarrollo puede tener
otros beneficios. Gomah y Zohri, (2014) y Shi et al. (2014), demostraron que además del efecto
antifúngico, el crecimiento de estas bacterias junto al hongo alterante puede acarrear un
importante descenso en la producción de micotoxinas (entre el 50 y el 75%), así como una
reducción de su concentración por la unión de estas a la biomasa bacteriana (Dalié et al., 2010).
De gran interés para un futuro próximo será poder indagar y profundizar más sobre los
mecanismos utilizados por estos microorganismos para inhibir el desarrollo de otras bacterias
y/o hongos.
Una vez determinada la capacidad de las bacterias lácticas de origen vínico para inhibir
in vitro el desarrollo del hongo fitopatógeno F. oxysporum, se llevó a cabo un primer estudio
con el fin de estimar el potencial efecto protector que dichas bacterias pueden tener in vivo
sobre las plantas de Lycopersicon esculentum var. Marmande Cuarenteno. Se escogieron para
ello las cepas L. plantarum UVI-10 y L. paracasei UVI-12, seleccionadas en base a una
elevada actividad antifúngica en los ensayos previos.
En primer lugar, se evaluó la capacidad de las dos bacterias lácticas para proteger a
las semillas de la acción perniciosa del hongo evaluando su efecto sobre la tasa de
germinación. Como se muestra en la Fig. 6, y a diferencia de lo descrito para bacterias lácticas
de otros orígenes (Abdel-Aziz et al., 2014), no se encontraron diferencias significativas en la
tasa de germinación entre los ensayos que incluían las semillas inoculadas con el hongo y
aquellos en los que se adicionaron además las bacterias probadas, no permitiendo concluir un
efecto protector por parte de las bacterias malolácticas en las condiciones de este experimento.
Sin embargo, sí parece apreciarse una tendencia en el sentido de un efecto favorable cuando
se añaden las bacterias lácticas.
136
CAPÍTULO II Resultados y Discusión
137
CAPÍTULO II Resultados y Discusión
Figura 7: Efecto cualitativo de la inoculación de las plantas de tomate con F. oxysporum y con las
combinaciones F. oxysporum + L. paracasei UVI-12 y F. oxysporum + L. plantarum UVI-10.
En una segunda parte del ensayo se evaluó el posible efecto protector de las bacterias
lácticas seleccionadas sobre la infección inducida en la planta con F. oxysporum. Los
resultados se muestran en la Fig. 9 en la que se aprecia una reducción significativa del 24 %
sobre el efecto dañino de F. oxysporum, usado como control, en las plantas tratadas con L.
138
CAPÍTULO II Resultados y Discusión
Figura 9: Efecto de la inoculación de las plantas de tomate con F. oxysporum y con las combinaciones
F. oxysporum + L. paracasei UVI-12 y F. oxysporum + L. plantarum UVI-10. Se presenta la media ±
SD. Letras diferentes indican diferencias significativas (p ≤ 0,05).
Son relativamente pocos los estudios que hacen referencia a la inhibición in vivo de F.
oxysporum por parte de bacterias lácticas, a pesar de que el interés en el control de este hongo
con métodos biológicos se ha visto incrementado desde el año 2000 (Raza et al., 2016) debido
a las importantes repercusiones económicas que tiene para la industria agroalimentaria. En la
mayor parte de los casos, son especies o géneros bacterianos y/o fúngicos propios de la
rizosfera los empleados en dichos estudios. Especies de Trichoderma, Bacillus, Burkholderia
o Pseudomonas (Larkin y Fravel, 1998; Mao et al., 1998; Omar et al., 2006) han demostrado
un notable efecto inhibidor de este hongo tras su aplicación en plantas de tomate. Sin embargo,
hasta donde alcanza nuestro conocimiento, solo Hamed et al. (2011) han demostrado, en un
experimento que exige la protección previa de la semilla, la capacidad de las bacterias lácticas
(aisladas a partir de productos lácteos), para la bioprotección de plantas frente al ataque o los
efectos perniciosos de F. oxysporum.
139
CAPÍTULO II Resultados y Discusión
Este efecto ha sido previamente estudiado en una gran diversidad bacteriana que, de
manera habitual, se encuentra asociada a las raíces conformando el microbioma de la rizosfera
(Urrea et al., 2011; Vaikuntapu et al., 2014; Giassi et al., 2016). Este tipo de estudios, sin
embargo, no se habían realizado con bacterias lácticas de origen vínico por lo que,
paralelamente a los estudios de biocontrol, en este trabajo, se trató de determinar si las cepas
lácticas seleccionadas L. plantarum UVI-10 y L. paracasei UVI-12 podían afectar
positivamente al desarrollo vegetal, empleando nuevamente plantas de tomate como modelo.
140
CAPÍTULO II Resultados y Discusión
Figura 10: Efecto del tratamiento de las plantas de Lycopersicon esculentum con las bacterias L.
plantarum UVI-10 y L. paracasei UVI-12 (A) y comparativa con las plantas infectadas con F.
oxysporum (B). Se presenta la media ± SD. Letras diferentes indican diferencias significativas (p ≤
0,05).
141
CAPÍTULO II Resultados y Discusión
En conclusión, los resultados obtenidos en este trabajo demuestran que las bacterias
lácticas asociadas a los vinos, seleccionadas adecuadamente, podrían ser potencialmente
utilizadas como agentes biopreservativos, de biocontrol y como biofertilizantes, bien de
manera individual o en tratamientos integrales con otras sustancias y/o prácticas, permitiendo
la producción de alimentos más seguros en el marco de una agricultura más sostenible. En este
sentido, sería de gran interés repetir y reproducir los resultados de este experimento en un
estudio más amplio, así como probar la actividad de las bacterias estudiadas en este trabajo
frente a otros patógenos y en diferentes cultivos. Por otra parte, el uso real de estos
microorganismos para las citadas aplicaciones dependerá también de que se siga
profundizando en el estudio de los mecanismos responsables de su actividad antimicrobiana y
de sus propiedades fitoestimuladoras, pero sobre todo, de la puesta a punto de protocolos de
campo eficaces para su aplicación.
142
CAPÍTULO III
CAPÍTULO III Introducción
1. INTRODUCCIÓN
1.1. Definición
145
CAPÍTULO III Introducción
Figura 1: Proceso general de síntesis de AgNPs a partir de AgNO3. Adaptado de Sudeep y Kamat,
(2005).
146
CAPÍTULO III Introducción
147
CAPÍTULO III Introducción
glúcidos y/o sales liberados al medio de forma natural o artificial (Sintubin et al., 2009).
Dos especies del género Bacillus, Bacillus flexus y Bacillus cereus, fueron empleadas
por Priyadarshini et al. (2013) y Babu y Gunasekaran (2013) respectivamente para la síntesis
extracelular de AgNPs a partir de medio de cultivo, mientras que Thiruneelakandan et al.
(2013) llevaron a cabo la síntesis de este tipo de NPs a partir de un extracto acuoso obtenido
del lavado de L. plantarum.
148
CAPÍTULO III Introducción
Los mecanismos de acción mediante los cuales las AgNPs ejercen su actividad
antimicrobiana están siendo objeto de numerosas investigaciones, y hasta el momento han sido
solo parcialmente esclarecidos. La mayor parte de los estudios se han realizado en bacterias.
Tras su aplicación, las AgNPs tienen su primera diana en las envueltas celulares
(Morones et al., 2005; Lok et al., 2006) actuando, posteriormente, sobre otras estructuras
celulares (Fig. 2).
Figura 2: Diferentes mecanismos de acción antimicrobiana de las AgNPs (Pandey et al., 2014).
Se ha demostrado la afinidad de los iones Ag+ por los grupos hidroxilo de los azúcares
y el ion carboxilato de los aminoácidos presentes en estas cubiertas (Lin et al., 2005).
Mirzajani et al. (2011) han sugerido que el principal efecto se da sobre la pared de
peptidoglucano en bacterias Gram positivas, generando huecos en la misma por la liberación
de unidades de ácido n-acetil murámico procedente del peptidoglucano. Estas modificaciones
en la estructura y morfología de la pared celular y el consiguiente acceso de las NPs a
membrana plasmática, inducirían un incremento de la permeabilidad de la misma y,
finalmente, llevarían a la muerte celular (Morones et al., 2005).
149
CAPÍTULO III Introducción
Lok et al. (2005) plantean un mecanismo de acción de las AgNPs sobre las envueltas
celulares de E. coli según el cual estas partículas podrían romper ciertos componentes
(lipopolisacáridos) de la membrana externa de bacterias Gram negativas. Al mismo tiempo, la
liberación de iones Ag+ induciría una caída de la fuerza protón motriz, llevando a una pérdida
masiva de potasio intracelular. Esta pérdida de la fuerza protón motriz podría darse por la
unión de los iones Ag+ a los grupos tiol de las proteínas transportadores de membrana lo que
lleva a su inactivación (Feng et al., 2000).
La liberación de oxígeno activo (ROS) es otro de los mecanismos por los cuales las
AgNPs ejercen su acción antimicrobiana. Este oxígeno activo puede reducirse a H2O2 o grupos
OH, entre otros radicales libres, que provocan importantes daños en las células microbianas
(Dakal et al., 2016).
Otra diana de las AgNPs se encuentra en el interior celular. Los iones Ag+ tienen
tendencia a unirse y reaccionar con compuestos que presentan fósforo en su estructura
molecular (Morones et al., 2005). Uno de los principales compuestos intracelulares de estas
características es el ADN, sobre el que las AgNPs ejercen su actividad inhibiendo la
replicación y la expresión de proteínas vitales para la célula (Pal et al., 2007).
150
CAPÍTULO III Introducción
Del mismo modo, los hongos filamentos han sido también objeto de estudio para su
control mediante AgNPs. Así por ejemplo, Kim et al. (2012) consiguieron inhibir el desarrollo
de un importante número de hongos fitopatógenos, mediante la aplicación de AgNPs, si bien
éstas fueron producidas por métodos químicos. Vivek et al. (2011) mostraron un importante
efecto inhibidor del crecimiento de Mucor indicus, Fusarium dimerum, Trichoderma reesei y
Humicola insolens tras la aplicación de AgNPs producidas de manera biológica.
151
CAPÍTULO III Materiales y Métodos
2. MATERIALES Y MÉTODOS
Medio MRS (de Man, Rogosa y Sharpe, Panreac): ver composición en el Capítulo 1,
Sección 1.1. Este medio fue utilizado para el crecimiento y mantenimiento de las cepas de
bacterias ácido lácticas.
Todos los medios, tanto sólidos como líquidos, fueron esterilizados mediante
autoclave a 121ºC y 1,1 atmósferas, durante 15 minutos.
C. glabrata CECT 1448 fue cultivada en medio Sabouraud a 30 ºC, Klebsiella sp. fue
cultivada en medio Mueller-Hinton a 37 ºC y B. cereus CECT 193 se cultivó en medio
Mueller-Hinton a 30 ºC.
152
CAPÍTULO III Materiales y Métodos
2.3. Reactivos
La obtención del extracto acuoso para preparar las nanopartículas se realizó según
describe Durán et al. (2007) con modificaciones. Se partió de cultivos de bacterias ácido
lácticas en medio MRS a 30 ºC y en anaerobiosis, crecidos hasta alcanzar la fase exponencial
tardía. En este punto las células se recuperaron mediante centrifugación, se estimó su peso
húmedo y se realizó un lavado de las mismas con H2O destilada estéril para, posteriormente,
ajustar la concentración celular a 7 g/L mediante la adición del volumen apropiado de H2O
destilada estéril. Las suspensiones de células (100 ml) fueron posteriormente transferidas a
matraces de 500 mL donde se mantuvieron durante 72 horas a 30 ºC, con una agitación de 200
rpm. Transcurrido este tiempo el sobrenadante fue recuperado por centrifugación (10000 x g /
20 min) y conservado a 4 ºC hasta su utilización.
153
CAPÍTULO III Materiales y Métodos
Figura 3: Esquema del ensayo simultaneo del efecto de las diferentes variables en la producción de
AgNPs a partir de los tres extractos.
154
CAPÍTULO III Materiales y Métodos
155
CAPÍTULO III Materiales y Métodos
Para preparar los inóculos para estos ensayos, los microorganismos testigo fueron
cultivados en medio Sabouraud en el caso de C. glabrata y Mueller-Hinton en el caso de las
bacterias. La incubación se llevó a cabo hasta que las células alcanzaron la fase exponencial
(durante 24 - 48 horas), a 30 ºC para las especies C. glabrata CECT 1448 y B. cereus CECT
193, y a 37 ºC en el caso de Klebsiella sp.
Se realizó un ensayo cualitativo del efecto antimicrobiano de las AgNPs. Para ello se
empleó el método descrito por Wei et al. (2012) con algunas modificaciones: las cepas testigo
fueron sembradas por extensión (100 µL de una suspensión de 106 células/mL) en placas de
los medios apropiados (Sección 2.2). Estas placas se dividieron en tres segmentos, en cada uno
de los cuales se añadió una gota de 5 µL de suspensión de AgNPs y se incubaron a las
temperaturas mencionadas anteriormente durante el tiempo necesario para la aparición de un
césped denso.
Para ello se realizaron diluciones seriadas del extracto con NPs a partir de una
concentración correspondiente 50 µg/mL de Ag+, cuando su producción se encontraba en los
valores 0,5 y 1 de absorbancia, en microtubos con los medios de cultivo mencionados
anteriormente.
156
CAPÍTULO III Materiales y Métodos
Como control negativo se realizó el mismo ensayo para estimar la CMI y CMM del
extracto celular sin AgNPs siguiendo el mismo procedimiento. Todos los ensayos fueron
realizados por duplicado.
157
CAPÍTULO III Resultados y Discusión
3. RESULTADOS Y DISCUSIÓN
Las bacterias ácido lácticas han demostrado también capacidad para sintetizar
nanopartículas (Nair y Pradeep, 2002; Sintubin et al., 2009; Korbekandi et al., 2011; Dhoondia
et al., 2012; Priyadarshini et al., 2013; Matei et al., 2015; Sásková et al., 2016), en este caso
centrándose los estudios existentes principalmente en la especie Lactobacillus plantarum y en
cepas aisladas a partir de productos lácteos. En cambio, esta capacidad no había sido estudiada
previamente en cepas malolácticas de origen vínico.
Mediante la incubación de las células de estas cepas en agua destilada, según se indica
en Materiales y Métodos, se obtuvieron tres extractos acuosos con potencial capacidad
158
CAPÍTULO III Resultados y Discusión
reductora para sintetizar NPs. Esta actividad ha sido atribuida a la presencia de diferentes
biomoléculas liberadas por las células bacterianas al medio, como exopolisacáridos
(Raveendran et al., 2013) o aminoácidos (Saifuddin et al., 2009), entre otras.
El uso de los extractos con potencial actividad reductora, preparados según se describe
en este trabajo tendría la ventaja de que no requeriría de la purificación de las nanopartículas,
sería muy sencillo y muy económico.
159
CAPÍTULO III Resultados y Discusión
Figura 5: Espectros UV-Vis obtenidos tras 24 horas de incubación a 30 ºC de los extractos procedentes
de las cepas L. hilgardii UVI-18, L. paracasei UVI-2 y L. plantarum UVI-6, en presencia de AgNO3.
Por otra parte, se ha constatado que el incremento en los valores de absorbancia está
relacionado con una mayor síntesis de AgNPs (Korbekandi et al., 2012) por lo que en adelante
se empleará este parámetro como indicador de la misma. Atendiendo a ello, los extractos L.
hilgardii UVI-18 y L. paracasei UVI-2 permitirían sintetizar cantidades de nanopartículas
muy superiores (entre 3 y 4 veces) a L. plantarum UVI-6 (Fig. 5).
160
CAPÍTULO III Resultados y Discusión
Los espectros obtenidos tras la medición de la absorbancia UV-Vis a los tres tiempos
confirmaron la producción de nanopartículas en los tres extractos, aunque los niveles de
síntesis más altos se observaron en todos los casos a las 72 h (Fig. 6).
Del estudio de los espectros UV-Vis, se comprobó que en ningún caso la síntesis de
nanopartículas se da cuando la incubación se lleva a cabo en ausencia de luz (Fig. 6A), a
diferencia de lo que había sido descrito en estudios previos en los que la síntesis se llevaba a
cabo en oscuridad (Zaki et al., 2011; Thiruneelakanda et al., 2013; Matei et al., 2015; Sásková
et al., 2016). En contraposición a esta observación, cuando los extractos fueron sometidos a
luz continua producida por un foco de 40 W, se obtuvieron espectros UV-Vis característicos
de la plata coloidal, con picos entre los 350 y los 460 nm (Zaki et al., 2011) (Fig. 6B).
Esto explicaría los resultados obtenidos por numerosos autores, que muestran una
producción de AgNPs mucho más lenta en oscuridad, con rangos que van desde las 24 horas
a los 7 días (Zaki et al., 2011; Thiruneelakanda et al., 2013; Matei et al., 2015; Sásková et al.,
2016) frente a aquellas producidas en presencia de luz ambiental (Ranganath et al., 2012; Wei
et al., 2012). En nuestro caso, la ausencia de producción en condiciones de oscuridad podría
ser explicada por el corto período de tiempo en el que se llevó a cabo la síntesis.
161
CAPÍTULO III Resultados y Discusión
Figura 6: Espectros UV-Vis obtenidos a partir de los extractos de las cepas L. hilgardii UVI-18, L.
paracasei UVI-2 y L. plantarum UVI-6, tras 72 horas de incubación en presencia de AgNO 3 1 mM a
diferentes temperaturas y en presencia de luz o en oscuridad.
En general, las muestras sometidas a una agitación de 200 rpm mostraron picos de
absorbancia superiores a aquellas incubadas en estático, a excepción del extracto procedente
de la cepa L. hilgardii UVI-18, que dio lugar a un pico de absorbancia superior a 1 al ser
incubado en estático a una temperatura de 22 ºC, por encima de valores obtenidos en agitación
a otras temperaturas. Las temperaturas consideradas óptimas fueron 22 ºC en L. hilgardii UVI-
18 y L. paracasei UVI-2 y de 35 ºC en el extracto procedente de la cepa L. plantarum UVI-6.
162
CAPÍTULO III Resultados y Discusión
síntesis de AgNPs en Medio Nitrato tras el crecimiento de E. coli. Estos autores mostraron un
incremento de la producción de nanopartículas paralelo al incremento en la temperatura de
reacción, hasta alcanzar su óptimo a 60 ºC. En nuestro caso, la formación de las AgNPs a
temperaturas más moderadas permitiría una importante reducción en los costes de producción
de las mismas.
Tras los ensayos anteriores, y teniendo en cuenta las referencias previas (Guranathan
et al., 2009; Sintubin et al., 2009) que sugieren una mayor producción de AgNPs a valores de
pH del medio alcalinos y a la implicación de los grupos hidroxilo en dicha producción, se
procedió a determinar el efecto de la adición de NaOH sobre la formación de nanopartículas
utilizando los extractos obtenidos en este estudio. Para ello, en este caso, la obtención de los
espectros UV-Vis se realizó tras dos horas de incubación.
163
CAPÍTULO III Resultados y Discusión
Los mayores valores de absorbancia se obtuvieron en los tres extractos con una
concentración de NaOH de 1,2 mM (Fig. 7B). Esta mejora de la síntesis de AgNPs en extracto
celulares alcalinos había sido descrita por Sintubin et al. (2009), quienes obtuvieron su óptimo
de producción de estas nanopartículas en medio básico, a partir de biomasa celular de L.
fermentum.
Figura 7: A: Espectros UV-Vis obtenidos tras la incubación de los extractos L. hilgardii UVI-18, L.
paracasei UVI-2 y L. plantarum UVI-6 durante 2 horas, en presencia de AgNO3 (1 mM) y a diferentes
concentraciones de NaOH. B: Cambio de coloración de los extractos por la formación de AgNPs a las
diferentes concentraciones de NaOH.
164
CAPÍTULO III Resultados y Discusión
A diferencia de lo encontrado por el citado autor, quien describió una evolución lineal
en la síntesis de AgNPs a lo largo del tiempo, en nuestro caso, solamente uno de los extractos
mostró esta tendencia (L. plantarum UVI-6), mientras que los extractos de L. paracasei UVI-
2 y L. hilgardii UVI-18 mostraron una evolución de tipo logarítmico en la formación de las
mismas (Fig. 8B).
165
CAPÍTULO III Resultados y Discusión
Figura 8: A: Picos máximos de absorbancia obtenidos para cada uno de los extractos en las condiciones
óptimas. B: Evolución de la formación de AgNPs en cada uno de los extractos a lo largo del tiempo.
166
CAPÍTULO III Resultados y Discusión
Algunos autores habían descrito previamente la utilidad de las bacterias ácido lácticas
para la síntesis biológica de AgNPs (Sintubin et al., 2009; Nair y Pradeep, 2002; Korbekandi
et al., 2011; Matei et al., 2015), sin embargo, en todos los estudios previos el origen de las
cepas eran los productos lácteos siendo esta la primera vez que se describe dicha capacidad
para las bacterias malolácticas de los vinos. Además, este estudio describe también por primera
vez la capacidad de las especies L. paracasei y L. hilgardii para sintetizar AgNPs, siendo
ambas las que mejores resultados mostraron en términos de producción, si se comparan con la
especie más estudiada L. plantarum.
167
CAPÍTULO III Resultados y Discusión
Figura 9: Distribución de los tamaños obtenidos a partir de una muestra de 220 AgNPs.
168
CAPÍTULO III Resultados y Discusión
Figura 10: Microfotografía TEM de las AgNPs sintetizadas con el extracto L. paracasei UVI-2 en
condiciones óptimas. Las Fig. A, B y C muestran las morfologías circular, hexagonal y triangular
respectivamente.
Con relación a la morfología de las AgNPs sintetizadas, más del 90% presentaron
morfología circular (Fig. 10A), y en menor proporción, formas hexagonales (Fig. 10B) y
triangulares (Fig. 10C), siendo éstas las formas características de las AgNPs sintetizadas por
microorganismos (Wei et al., 2012), y las más activas en cuanto a sus efectos antimicrobianos
(Pal et al., 2007). Si bien en la imagen solo se pueden apreciar NPs como figuras planas,
probablemente se trate de diferentes formas tridimensionales de las mismas.
169
CAPÍTULO III Resultados y Discusión
3.6. Capacidad de las AgNPs sintetizadas para penetrar las células y efecto
antimicrobiano
Figura 11: A: Imagen TEM de las AgNPs en el interior de una célula de B. cereus; B: Desestructuración
de la pared celular bacteriana (señalada con flechas azules) tras el tratamiento con AgNPs; C: Imagen
amplificada de las NPs en el interior celular. Las flechas rojas señalan las nanopartículas.
Las imágenes muestran la capacidad de las AgNPs para desestructurar las envueltas
celulares externas (Fig. 11, inserto B) y penetrar al interior de la célula (Fig. 11, inserto C). En
base a ello, las nanopartículas sintetizadas en este trabajo podrían ejercer una actividad
antimicrobiana mediante cualquiera de los mecanismos propuestos hasta ahora y descritos en
170
CAPÍTULO III Resultados y Discusión
la introducción de este capítulo (Morones et al., 2005; Pal et al., 2007; Mirzajani et al. 2011;
Singh et al., 2015). El empleo de las AgNPs como microbicidas está recibiendo un creciente
interés, especialmente desde la irrupción y diseminación de los agentes patógenos resistentes
a antibióticos ya que han sido propuestas como una alternativa en estas situaciones al haber
demostrado actividad antimicrobiana frente a bacterias de importancia clínica y, en menor
medida, frente a hongos (Morones et al., 2005; Rudramurthy et al., 2016; Tashi et al., 2016).
Dentro de las bacterias, las especies más utilizadas para probar el efecto
antimicrobiano de las AgNPs han sido Escherichia coli (como Gram-negativa) y
Staphylococcus aureus (como Gram-positiva). Para testar el efecto antimicrobiano de las
AgNPs sintetizadas en este trabajo se ha escogido, como bacteria Gram-negativa, una cepa de
Klebsiella sp. debido a la creciente atención que las autoridades sanitarias tienen que prestar a
las cepas de esta bacteria que se han convertido en resistentes a todos los antibióticos (Arana
et al., 2016; Utt y Wells, 2016) y, como Gram-positiva, una cepa de Bacillus cereus
responsable de intoxicaciones alimentarias e infecciones graves asociadas a pacientes
inmunodeprimidos, resistente también a numerosos antibióticos, entre ellos las cefalosporinas
de 3ª generación (Kervick et al., 1990). Además, para evaluar la actividad antimicrobiana de
las nanopartículas frente a los hongos, se ha incluido en el estudio la levadura Candida
glabrata, considerada un patógeno emergente con un alto número de cepas resistentes a los
antifúngicos triazólicos (Tapia, 2008).
Estos ensayos mostraron una inhibición completa del crecimiento de B. cereus en las
zonas en las que se inoculó la suspensión de AgNPs, siendo esta inhibición equivalente con
los tres extractos (Fig. 12A). En el caso de la inoculación sobre un cultivo de C. glabrata (Fig.
12B), la inhibición del crecimiento no fue completa, aunque sí se produce un menor desarrollo
171
CAPÍTULO III Resultados y Discusión
del cultivo en aquellas zonas en las que hay presencia de nanopartículas. En todos los casos se
comprobó que la inhibición no era producida por compuestos sintetizados por las propias
bacterias ácido lácticas empleadas y que pudieran estar presentes en el extracto, reproduciendo
con el extracto celular sin AgNPs el ensayo descrito, lo que arrojó resultados de negativos.
A B. cereus B C. glabrata
172
CAPÍTULO III Resultados y Discusión
Tabla 1: Actividad antimicrobiana de las AgNPs, expresada como CMI y CMM, (en µg/mL de Ag+).
CMI CMM
Algunos autores (Kim et al., 2007; Jain et al., 2010) han descrito un mayor efecto
antimicrobiano de las AgNPs sobre las bacterias Gram-negativas en comparación con las
Gram-positivas y lo han atribuido a la mayor dificultad para desestructurar y atravesar las
paredes celulares de estas últimas. Sin embargo, otros investigadores (Suresh et al., 2010; Wei
et al., 2012; y Rahisuddin et al., 2015), han descrito el efecto contrario, en concreto utilizando
nanopartículas de síntesis biológica. En el caso de las NPs sintetizadas en este trabajo, la
eficacia parece más bien dependiente del extracto (tipo de nanopartículas presentes) utilizado
y la cepa a la que se enfrenta, como había sido descrito previamente (Rodríguez-Arguelles et
al., 2015) para AgNPs sintetizadas en diferentes tipos de quitosano.
Con respecto a las AgNPs sintetizadas en este estudio, las CMI obtenidas para
Klebsiella sp. y B. cereus (≤ 0,78 – 1,56 μg/mL) son muy inferiores a las encontradas por
173
CAPÍTULO III Resultados y Discusión
Pourmand et al. (2013) para K. pneumoniae (10 μg/mL) y por Buszewski et al. (2016) para B.
subtilis (6,25 μg/mL). Esto mismo ocurre cuando se comparan con las diferentes CMI
recogidas en Durán et al. (2016) o en Rudramurthy et al. (2016) para distintas cepas de
diferentes especies de bacterias y levaduras, lo que pone de manifiesto para las AgNPs
obtenidas a partir de las bacterias lácticas estudiadas en este trabajo una potente actividad
antimicrobiana destacando, además, que es la primera vez que se describe para las especies L.
paracasei y L. hilgardii.
En resumen, el presente estudio demuestra que las bacterias ácido lácticas procedentes
del vino pueden ser empleadas para la síntesis de AgNPs, utilizando un método sencillo,
económico, no tóxico y respetuoso con el medio ambiente, siendo la primera vez que se usan
con esta finalidad las especies L. paracasei y L. hilgardii.
Tiempo
Sistema [AgNO3 ] [Células] Tamaño Producción
Referencia Especie Forma(b) de
Reductor (a) (mM) (g/L) (nm) (Abs.)
síntesis
Medio de
Chaudhari et al. 2012 Lactobacillus spp. 1 - 39-41 C 3 días 3
cultivo (LC)
Dhoondia et al. 2012 L. mindensis Biomasa 0,5 - 2-20 C/T 7 días 2,7
E. coli Medio de
Guranathan et al., 2014 42-89 C 24 horas 2,3
cultivo (LC)
Korbekandi et al. 2011 L. casei Biomasa 6 5 10-25 - 50 horas 4
L. plantarum Medio de
Matei et al. 2015 1 - 15-20 C/H 24 horas -
cultivo (LC
Ranganath et al. 2012 Lactobacillus spp. Biomasa 1 - 2-20 C 12 horas 0,7
B. subtilis Medio de
Saifudin et al., 2009 5-50 C/ T 5 días 0,9
cultivo (LC)
Sásková et al. 2016 L. casei Biomasa 4 - 12-27 - 21 días -
L. farciminis
L. parabuchneri
L. plantarum
Sintubin et al. 2009 Biomasa 5,8 5 5-15 - 1 min -
L. fermentum
L. brevis
L. rhamnosus
L. plantarum Extracto
Thiruneelakandan et al. 2013 1 4 - - 24 horas 0,8
acuoso
Acinetobacter sp.
Stenotrophomonas
maltofilica Medio de
Zaki et al., 2011 3,5 - 15-50 C 6 días 4
E. coli cultivo (LC)
B. megaterium
Zhang et al. 2014 L. fermentum Biomasa 9 10 3-10 C 24 horas 2,3
L. paracasei 3-26 C/H/T 5 horas 2,11
Extracto
Este estudio L. plantarum 1 7 - - 5 horas 1,74
acuoso
L. hilgardii - - 3 horas 1,75
174
CAPÍTULO III Resultados y Discusión
Los datos obtenidos utilizando el método de síntesis puesto a punto en este trabajo
muestran una excelente relación entre los niveles de producción y los cortos tiempos de
producción utilizados, si se comparan con otros estudios que también utilizan cepas
bacterianas (Tabla 2), originando NPs de tamaño adecuado para ser utilizadas en diferentes
aplicaciones biológicas. Pero además, este método, a diferencia de la mayoría de los descritos
(Tabla 2), parte de un extracto reductor libre de células y componentes de medio de cultivo,
preparado en agua, evitando así la necesidad de recuperar las nanopartículas del interior de las
células o adheridas a ellas. Por otra parte, la evaluación de su actividad biológica, mostró que
presentan una potente actividad antimicrobiana, en particular frente a microorganismos
patógenos, cuando se compara con la mayoría de las otras AgNPs descritas.
175
CONCLUSIONES
CONCLUSIONES
- Ocho de las cepas aisladas presentaron capacidad para consumir ácido málico en distinto
grado, sin incrementar significativamente la acidez volátil, en las condiciones y características
de los vinos de la región objeto de estudio, resultando esta una característica dependiente de
la cepa y no de la especie.
- El análisis de las cepas que mostraron actividad maloláctica puso de manifiesto que carecen
de capacidad aminogénica que pueda comprometer la seguridad del producto elaborado, que
no producen fenoles volátiles que puedan impactar negativamente en el aroma del vino y que
sintetizan, en distintas concentraciones, beta-glucosidasas que pueden contribuir a potenciar y
diferenciar el perfil aromático del vino, confiriéndole tipicidad regional.
- Atendiendo a los criterios aplicados en este estudio, se seleccionan como más adecuadas para
conducir la FML en los vinos de la variedad Albariño de la región de Val do Salnés, las cepas
L. paracasei UVI-2 y L. hilgardii UVI-23 que, además, se proponen como potenciales nuevos
estárteres malolácticos autóctonos.
179
CONCLUSIONES
- Todas las cepas malolácticas analizadas presentaron capacidad para inhibir in vitro, en mayor
o menor grado, el crecimiento de F. oxysporum. En cuatro de las cepas probadas se observó
un incremento significativo en el grado de inhibición del hongo tras un periodo previo de
crecimiento de la bacteria de 48 h. Además, se encontró una variabilidad significativa en el
grado de inhibición de F. oxysporum entre algunas de las cepas bacterianas probadas,
alcanzándose con la cepa más efectiva (L. paracasei UVI-7) una inhibición del crecimiento
del hongo del 76%.
- Atendiendo a los niveles de producción en relación al tiempo de síntesis, así como al tipo y
tamaños de partículas obtenidas y la actividad antimicrobiana mostrada, el método puesto a
punto en este estudio puede considerarse muy competitivo y ventajoso en relación a otros
métodos descritos previamente.
180
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CURRICULUM VITAE
MAYO 2017
2. FORMACIÓN ACADÉMICA
3. EXPERIENCIA INVESTIGADORA
5. OTROS MÉRITOS
1. Formación investigadora
2. Otros cursos
c. Idiomas: