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Preguntas de Final BCM

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1) Fundamentos químicos.

2) Proteínas:

⦁definicion : Macromolécula compuesta por 1 o mas cadenas polipeptidicas con una secuencia lineal
especifica.

⦁estructuras y qué fuerzas las estabilizan

Estructura Determinada por Estabilizada por

1RIA secuencia de aá uniones covalentes (agregar


puentes disulfuro)

2RIA Plegamiento “local” de los aá puentes de H

3RIA Plegamiento global de la puentes de H, uniones de Van


proteína der Waals

4RIA Diferentes dominios en una uniones covalentes y débiles,


misma proteínas, con sus por complementariedad muchas
cadenas y motivos veces

SUPRAMOLECULAR Diferentes proteínas, formando Uniones débiles, más que nada


una maquinaria molecular (como por complementariedad
el replicosoma)

⦁complementaridad molecular
Las proteinas se unen e interactuan entre si por
Complementaridad molecular : Forma + Cantidad de interacciones debiles
La complementariedad molecular es la interaccion entre moléculas cuyas formas, carga y otras propiedades
físicas son complementarias.
Se pueden formar múltiples interacciones no covalentes entre moléculas complementarias, provocando que se
unan con fuerza pero no así entre moléculas no complementarias. (definicion del Glosario del lodish)

⦁formas de regulacion (covalentes y no covalentes).

REGULACIÓN ALOSTERICA: Modificacion en estructura 3ria y/o 4ria que modifica una funcion de una
actividad .
Se da por la unión de una molécula en una ubicación (sitio alostérico) que modifica las condiciones de
unión de otra molécula, en otra ubicación (sitio catalítico) de la enzima, distante de la primera.
Activación por proteolisis: Algunos enzimas no se sintetizan como tales, sino como proteínas
precursoras sin actividad enzimática. Para activarse, los zimógenos sufren un ataque hidrolítico que
origina la liberación de uno o varios péptidos.
Mecanismo regulacion Tipo (covalente/alosterica) Importancia

Ubiquitinización Covalente Marca proteínas para su


degradación

Fosforilación Covalente Cambia conformación de una


proteína por ende su función.

Cooperativa Alostérica La unión de una proteína


aumenta afinidad por otra
molécula

Inhibición por producto alostérica Producto final inhibe una enzima


clave en la vía

⦁COMO ESTUDIAR PROTEÍNAS


3) ADN
⦁estructuras y qué fuerzas las estabilizan
ADN: Ácido nucleico formado por 2 cadenas complementarias helicoidales antiparalelas.
Posee desoxiribosa como PENTOSA.

Estructura que estabilizan la doble helice

1) Puentes de hidrógeno entre las bases apareadas

2) Apilamiento de bases + interacción hidrofóbica.


Parte hidrofóbica: bases en el interior de la cadena
Parte hidrofílica: Fosfatos y pentosa de la cadena en el exterior.

Estructura ADN ARN

1ria secuencia nucleótidos secuencia de nucleótidos

2ria Doble hélice on surco menor y macrocadena que se cierra


surco mayor sobre sí misma

3ria Asociada a proteínas (histonas) Se pliega para una conformación


ultracompactación más estable

⦁definiciones

-Nucleósido :Base nitrogenada + Pentosa


-Nucleótido : Base nitrogenada + Pentosa + Ácido fosfórico

-Alelo: una de dos o más formas alternativas de un gen. Las células diploides contienen dos alelos de cada gen,
localizados en el sitio correspondiente (locus) sobre cromosomas homólogos.

-Cromátida: copia de un cromosoma replicado, formado durante la etapa S del ciclo celular, que está unida por el
centrómero a la otra copia (cromátide hermana). Durante la mitosis, ambas se separan y cada una se convierte en
un cromosoma de una de las dos células hijas.

-Cromosoma: molécula de ADN y sus proteínas asociadas (histónicas y no histónicas).

-Cromatina: complejo de histonas, ADN y proteínas no histónicas que conforman el cromosoma (tengo duda si
difieren en algo, para mí son lo mismo)

eucromatina (laxa, se puede transcribir); heterocromatina (densa, no se puede transcribir)

-Nucleosoma: Unidad básica de la estructura de la cromatina.


-Cariotipo:
“Número, forma y tamaño del conjunto completo de cromosomas en metafase de una célula eucarionte”; se suele
presentar de manera artificial como en la imagen abajo.
-Gen: Secuencia de DNA necesaria para la síntesis de un producto génico funcional
(polipéptido o RNA).

Secuencia promotora : secuencias de nucleótidos definidas, como la cajas "TATA" y "TTGACA".


Los promotores se localizan al principio del gen a transcribir, indican el punto de inicio para la síntesis
de RNA.
-Proteoma: es la totalidad de las proteínas que se expresan en una célula determinada.

Que es el codigo de histonas y como se origina ?

⦁compactación
⦁cómo estudiar

4) replicación, transcripción y traducción

⦁explicar proceso pasos etc


⦁dibujar replicosoma
⦁Explicar corte y empalme alternativo y qué producen
⦁ Esquematizar como esta compuesto un ARNt
⦁Explicar los paso y su importancia para la maduracion de un ARN.
⦁Qué es un promotor, cual es su rol en la transcripción, que son los factores de elongación para que sirven y que
nucleotidos utiliza para realizar su trabajo

⦁los elementos necesarios para el inicio, elongación y fin de la

traducción y explique la importancia de cada uno de ellos.. que pondría

5) Regulacion de la expresion genica


6) Tecnicas de biologia celular y microscopia

⚫ Que es la resolucion ?
Es la capidad de un sistema optico de diferenciar dos puntos entre si . Es inversamente proporcional al limite de
resolucion .

⚫que es el límite de resolución y de qué depende?


Es la distancia minima que pueden estar 2 puntos y todavia diferenciarse entre si .
Distancia= long de onda/ (indece de refraccion x apertura numerica )
El límite de resolución (y por ende la resolución) depende de:
λ (longitud de onda): cuanto menor es la longitud de onda, menor es la D
n . sen θ (apertura numérica): cuanto mayor es la AN, menor es el D. Es la capacidad de colectar luz. El ángulo θ está
relacionado con el lente. Cuando se utilizan lentes de inmersión en aceite, el n (índice de refracción) del
aceite es más similar al del vidrio y por lo tanto la mayor parte de los rayos se refractan. En las lentes secas, n (aire)= 1, menor
AN que en lentes de inmersión.

⚫ Explique fluorescencia.
Se irradia una muestra a una determinada longitud de onda, se va a excitar un electrón va a haber una desexcitación no radiativa
y finalmente emitirá a una longitud de onda mayor.

⚫ Explique microcopia de epifluorescencia:


la luz incidente que va a excitar al fluorocromo sigue el mismo camino óptico que el haz de luz que se emite (ambas
van por el objetivo).
Se tiene una fuente de luz que emite en todas las longitudes de onda, pasa por un filtro de absorción y llega a un espejo
dicrioico que refleja la longitud de onda de absorción, atraviesa el objetivo, incide en la muestra, se excita y emite el
fluorocromo. La luz emitida pasa por el espejo dicroico (que únicamente refleja una longitud de onda y permite el paso de todas
las demás), atraviesa el filtro de emisión y llega a nuestros ojos.
El observador nunca recibe la luz con que se excita la muestra, sólo se ve la luz emitida.

⚫Explique tecnica FRET (fluorescence resonance energy transfer).


Al excitarse un fluorocromo si hay otros fluorocromos cerca éstos pueden excitarse con la longitud de onda de emisión del
primero. Este fenómeno ocurre si las moléculas están lo suficientemente cerca (5nm).
Nos permite ver la interacción entre e inter proteínas (si los fluorocromos están en dos puntos de una misma proteína y se
acercan por un cambio conformacional).

⚫Explique tecnica FRAP (Fluorescence recovery after photobleaching).


Se irradia con luz láser de la longitud de onda apropiada la molécula en el sitio que fluoresce y se produce un “blanqueo”(
fluoróforos en esta región al recibeir una iluminación de alta intensidad que hace que su tiempo de vida de fluorescencia
caduque rápidamente).
Se evalúa cuánto tarda en recuperarse la fluorescencia (por desplazamiento de proteínas, por ejemplo). Nos permite el estudio
de la velocidad de difusión, velocidad de transporte o compartimentalización.

⚫ Definir (SIN EXPLICAR LA TECNICA) que es el cDNA. Como haria para amplificar el cDNA. Que ventajas tiene
tener una biblioteca de cDNA.

Es una hebra de ADN de doble cadena, en la que una de sus ramas constituye una secuencia totalmente
complementaria del ARN mensajero a partir del cual se ha sintetizado.
Se suele utilizar para la clonación de genes de interes.
Para amplificarlo se puede usar dos metodos
1) Vectores plasmidios:plásmidos se aislan de las bacterias y pueden ser cortados por las enzimas de restricción
junto con DNA humano, obteniendo fragmentos de restricción con extremos cohesivos que al colocarse con DNA
ligasas le permiten la formación de un plásmido de DNA recombinante.
2) Reacción de polimerización en cadena (PCR): La reacción consiste en lo siguiente:
1º-Calentamiento para separar las hebras: se tiene el DNA, se calienta a 90ºC en un primer paso, esto
separa las hebras.
2º-Hibridación de los cebadores: para que la DNA pol replique se requieren primers, y se utilizan primers
que señalen la secuencia que se quiere amplificar (se le da un marco de lectura al proceso de
replicación)
3º-Se requieren también nucleótidos trifosfato y de la DNA pol, que en este caso se la llama Taq polimerasa ya que
es una isoforma específica que presenta resistencia a altas temperaturas. (Este paso ocurre a 72ºC)

⚫ Que son las gotas lipidicas ? Como estudiarlas ?


⚫ Qué es una línea celular y qué diferencias tiene con cultivo primario.

⚫ Que es un Raton knockout. Para q sirve y como se obtiene.Esquematizar.


Es un raton modificado por ingeniería genética para que uno o más de sus genes estén inactivados mediante una
técnica llamada bloqueo de genes.
⚫ La siguiente figura representa la estructura y el funcionamiento del operón Lac. En relación a esto responda:
a) Que es un Operón y en que tipo de células se encuentra.
b) Complete las referencias del esquema del operón Lac que se presenta a continuación indicando para cada
condición, si el operón está activo o no, justificando brevemente su respuesta.

⚫Quiero estudiar la localización celular de una proteína X: a) Clasifique las proteínas asociadas a membrana
según su interacción.
b) Qué es una línea celular y qué diferencias tiene con cultivo primario.
c) Qué tipo de vector se usa? Esquematice y explique su estructura.

⚫ los elementos necesarios para el inicio, elongación y fin de la


traducción y explique la importancia de cada uno de ellos.. que pondrían?
⚫Que es un vector de expresión para que se usa y cuales son sus componentes ?
⚫Diga¿Qué3 métodos
es una célula transfectada y transformada?
para reconocer que la célula fue transformada *
Célula transfectada: célula eucarionte a la cual se le insertó un DNA ajeno
Célula transformada: célula procariota a la cual se le insertó un DNA ajeno
Las colocó en un medio con antibiótico y aquellas que incorporaron el vector sobreviven y las que
no mueren.

⚫ A) Qué son los genes master y cuál es su función?


Son los que actúan como factor clave controlando a otros genes. Su acción determina el comportamiento de estos
genes y dirige sus funciones.
EJ: gen Sxl, el gen maestro para el desarrollo sexual en Drosophila,

7) Biomembranas

⚫ Cual es la molécula principal de la bicapa lipídica ?


Fosfatidilcolina , tiene una cola hidrófoba (con 2 ácidos grasos) y una cabeza polar, tiene forma cilíndrica y tiende a
ordenarse en forma de bicapa en medio acuoso.
Forma de los fosfolípidos

fosfatidilcolina fosfatidiletanolamina Isofosfolípidos

>componente mayoritario Tiene una cabeza más pequeña (con un solo ácido graso)
en membrana que el área de su cola, tiene forma tienen forma de cono
>forma cilíndrica es el mejor de cono y tiende a tomar una fase invertido y tienden a formar
arreglo que puede tener en hexagonal. estructuras micelares.
el espacio para evitar el
contacto con el agua es

>forma bicapas.

⦁Asimetría de bicapa:

Composición disímil de los lípidos de ambas hemicapas de la membrana plasmática.

⦁Asimetría de membrana:

Composición disímil de los lípidos y de las proteínas de ambas hemicapas de la membrana plasmática.

⦁ Estructura de la asimetría de bicapa:

Hemicapa interna

● Fosfatidiletanolamina (PE) [forma cónica - señal EAT ME cuando transloca a la hemicapa externa]

● Fosfatidilserina (PS): con carga negativa [forma cilíndrica]

● Fosfatidilinositol (PI): importante en vías de señalización [vías PIPKinasas/Fosfolipasas]

Hemicapa externa

● Fosfatidilcolina (PC): mayoritariamente [forma cilíndrica]

● Esfingomielina (SM):
● Glicolípidos (GSL): marcación/reconocimiento y protección

Dar dos ejemplos fisiológicos de asimetría d bicapa.

⚫ a). ¿Qué significa que la membrana sea fluida y de qué depende que las células de E.coli conserven la fluidez de
la misma.

Las cadenas acilo hidrocarbonadas de los fosfolípido y glicolípidos de membrana son los principales determinantes
de la fluidez de membrana, aunque también la modulan el tamaño y la carga de los grupos polares.

⚫ La bomba Na+/K+ ATPasa A. ¿Que proteína transportadora es? ¿Cuál es el mecanismo de transporte mediado
por esta proteína? Y ¿Qué requerimientos energéticos posee? B. ¿Por qué decimos que es electrogénica? Justifique.
C.

A.- bomba clase P. Hidroliza ATP, fosforilándose, para intercambiar 3 iones Na+, que salen de la célula, por 2 iones
K+, que entran a la célula. B.- Se dice que es una bomba electrogénica debido a que el intercambio de iones, con
sus cargas, es dispar, es decir, se eliminan del interior de la célula 3 cargas positivas, cuando se ingresan 2,
provocando un potencial de membrana negativo respecto del interior de la célula.

⦁Definir potencial de membrana.

⦁Definir El potencial de reposo de membrana y explicar qué pasa al inhibir a esta bomba.

El potencial de reposo de la membrana celular es la diferencia de potencial que


existe entre el interior y el exterior de una célula. Lo que mantiene a este
potencial en reposo es la concentración del ion potasio (K + ).

Depende de :
1) Canales iónicos no regulados (K + )
2) Bomba Na + /K + ATPasa

Al inhibir la bomba Na+/ K+ ATPasa desaparecen gradientes iónicos .

⦁Definir potencial de acción

Actividad electrica rapida , transitoria que sigue la ley del todo o nada y que se propaga por la membrana.
Consiste en una alteración del potencial eléctrico a través de la membrana
celular causada por la apertura o cierre de canales iónicos regulados por
voltaje.
Ley del todo o nada: Una vez desencadenado un potencial de acción en cualquier punto de la
membrana el proceso de despolarización viaja por toda la membrana si las condiciones son las
adecuadas, o no lo hace en absoluto.

⦁ Porque la propagación es unidireccional ?


Es unidireccional ya que antes de un potencial de acción nuevo, se encuentra en un periodo refractario absoluto lo
que le impide retroceder.
Los canales Na+ están inactivados y para volver a activarse primero deben pasar a su conformacion cerrada para
luego activarse nuevamente.

⚫ Sobre expresión (a través de un vector plasmídico) de una enzima que agrega dobles enlaces en los ácidos
grasos. Qué sucede con:
a) La fluidez de la membrana? De qué depende la fluidez?

En el caso que se agreguen dobles enlaces con estereoquímica cis, la fluidez de la membrana aumentará, debido a
un menor empaquetamiento por parte de ese ácido graso, cuya conformación cis promueve una menor interacción
entre los fosfolípidos contiguos. En el caso que se agreguen dobles enlaces con estereoquímica trans, la fluidez de
la membrana será menor por un mayor empaquetamiento debido a la reducción de espacio que ocupa ese
fosfolípido, lo cual le permite mayor interacción entre los demás fosfolípidos.

La fluidez de la membrana depende de:

1)TEMPERATURA (↑ , habrá mayor energía cinética por parte de los fosfolípidos, los cuales tendrán un mayor
movimiento, y por ende, su empaquetamiento será menor por presentar menos interacciones entre las colas
hidrófobas)
2)Largo de la cadena de los ácidos grasos (a mayor longitud, habrá más interacciones hidrófobas entre moléculas
similares, y esto promoverá un mayor empaquetamiento, con lo cual habrá menor fluidez)
3) Estereoquimica cis en los dobles enlaces de las cadenas de ácidos grasos (una estereoquímica cis presupone
que el ácido grasos ocupará mayor espacio, con lo cual habrá menos interacciones entre fosfolipidos,
disminuyendo la fluidez)
-el colesterol en la membrana (en este caso, si hubiera una membrana poco fluida, es decir, muy empaquetada, el
colesterol interaccionaría con las colas hidrofóbicas de los fosfolípidos y aumentaría la fluidez de la membrana; en
caso de ser una membrana fluida, este colesterol interaccionará con las colas hidrófobas de los fosfolípidos
empaquetándolos y disminuyendo la fluidez de la membrana)
b) Las proteínas multipaso.

⚫ a) Que es el potencial de reposo de membrana? Como se da?


b) Realizar el gráfico del potencial.

⦁Definir gradiente electroquímico

Fuerza conductora que determina la direccion energéticamente favorable del transporte de un ion (o molécula
cargada) a través de la membrana.
Gradiente CONCENTRACIÓN + Gradiente ELECTRICO = Gradiente ELECTROQUÍMICO

⚫ Que es una balsa lipídica ? Que es la asimétrica de bicapa. Clasificación de proteínas según interacción con
membrana.

Una balsa lipídica es un dominio de membrana en la cual se encuentran fosfolípidos con cadenas de ácidos
grasos más extensas, los cuales determinan un sitio de composición específica tanto para lípidos como
proteínas, en los cuales se pueden dar procesos que requieren de tales proteínas en una conformación que sólo
adquieren en dichas lipid raft.

-proteínas integrales de membrana:son aquellas que presentan dominios hidrofóbicos, y por ende se encuentran
íntimamente relacionadas con el núcleo hidrófobo de la membrana.

-proteínas periféricas de membrana:son aquellas proteínas que interaccionan con componentes de la membrana
mediante interacciones electrostáticas.

● ¿Cómo se estudian las proteínasde membrana ?

Se utiliza un detergente (iónico -fuerte- o no iónico) para aislar proteínas integrales, porque involucran
interacciones hidrofóbicas.

Variando pH o fuerza iónica podemos aislar proteínas periféricas, porque sólo involucran interacciones
electrostáticas. No obstante, se puede utilizar un detergente iónico “suave”.

⚫ Transporte de glucosa desde la luz intestinal a la sangre b) mecanismo de función de los transportadores
nombrados
⚫ (estructurales/funcionales) entre los transportadores GLUT1 y SGLT1? Una seria que GLUT es un uniportador y el
otro un simportador; uno transporta glucosa a la sangre y el otro desde el extracelular al interior de la célula.

Uniportador Acoplado Bombas Canal


Simporte antiporte

Gasto energia No No Si NO

Mecanismo difusión facilitada a Activo 2drio Activo 1rio Transporte Pasivo


favor gradiente Acoplado a
gradiente de un ion Gasto ATP

Transporte a contra NO SImporte SI No


corriente Antiporte

Ejemplo Glut 1 y 2 SGLT Sodio iones especificos

Molecula a Urea, glucosa Glucosa , iones, aa Iones, moleculas Canal Na


transportar hidrofilicas Canal H
canal K

BOMBAS

Tipo P Tiṕo V Tipo F Tipo ABC

Gasto energia ATP → ADP +Pi ATP Sintetiza ATP ATP

Iones HoK Mete H Moleculas pequeñas


Na o Ca

Estructura Centro de union Los e- pasan por Tiene una cadena de Tiene 2 dominios
que cambia citocromos transportadores de transmembrana + 2
conformacion y electrones que dominios de union a
afinidad con Pi aprovecha la energia ATP
para generar ATP
7) Compartimentos. Y 8)Tránsito transmembrana

⚫ Comparación de procariontes y eucariontes.


Procarionte Eucarionte
1.- Poco compleja, tiene un único 1.- Multicompartimentalizada.
compartimento. 2.- La transcripción se da en el núcleo y hay una
2.- La traducción es simultánea a la maduración del ARNm en el mismo. Además
transcripción. de procesamientos post transcripcionales del
3.- Hay un solo origen de replicación. ARNm (ver en especial casos donde interviene
4.- Habrá una sola ARNpol y un solo factor de la proteìna Argonauta).
replicación (sigma). 3.- Hay varios orígenes de replicación.
5.- 4.- La ARNpol II será la encargada de la
6.- transcripción, la cual interaccionará con varios
7.- factores de transcripción (ver también factores
de elongación).
5.-
6.-
7.-

Transporte a co o po secuencia señal receptor canal de Peptidasa Fuente de energía
traduccional translocación Señal

Nucleo Post Señal Receptores Complejo del No Hidrólisis GTP


Locaclizacion solubles poro nuclear (a GDP)
nuclear (importinas y
Rica en aa (+), exportinas)
en cualquier
lugar de la
secuencia
primaria

mitocondria Post (aunque N-terminal Sí (TOM y ídem receptor Sí ATP (por parte
las proteínas SAM//TIM23, de las
ingresan TIM22 y OXA) chaperonas)
desplegadas
por acción de
las chaperonas
Hsp70)

Reticulo Co N-terminal SRP (partícula SEC61 NO GTP ---> GDP


endoplasmatico
(secuencia de de
traslocalización reconocimiento
al RE) de señal) y
receptor SRP
(membrana RE)

Peroxisoma Post C-terminal, Pex 5 (soluble) Pex 10 y Pex 12 NO ATP


SKL en citosol.
(Serina leucina Pex 14 en
lisina) membrana
+
Pex adaptador

⦁Explicar que consecuencias traeria una mutación en TIM23, en Chaperona mitocondrial y en la secuencia señal

⦁Importacia N-glicosilacion

La N-glicosilación marca o dirige el plegamiento de las proteínas del retículo.


A la proteína desplegada se le produce la ruptura de las dos últimas glucosas de la cadena de hidratos de carbono.
La glucosa restante es reconocida por una proteína chaperona del retículo que requiere de Ca 2+ para su funcionamiento
(calnexina o calcireticulina). Se produce el plegamiento correcto de la proteína y por una glicosidasa se quita la última
glucosa y la proteína plegada correctamente sale del RE.
Si la proteína no se pliega correctamente, se le quita la última glucosa por la glicosidasa y vuelve al ciclo siendo reconocida
por una glucosil transferasa que le va a agregar la glucosa terminal volviendo a repertir el ciclo.
● ¿Hasta cuando esto ocurre?

Los N-oligosacáridos son temporizadores. Existe una hidrólisis lenta de una de las manosas del esqueleto carbonado por la
enzima manosidasa. Mientras la manosa no se haya oxidado el ciclo puede continuar, cuando se hidroliza la manosa es
una señal para que la proteína que no se pudo plegar salga del retículo por un traslocador, una N-glucanasa quita los
azúcares restantes, es poliubiquitinizada y enviada el proteasoma.

⦁Cuando una proteína está mal plegada desencadena una respuesta de proteínas mal plegadas. Es una señalización para que en el
núcleo se activen genes para la síntesis de chaperonas que ayuden al plegamiento de las proteínas.

Esto ocurre por 3 mecanismos:

● Proteína IRE1: cuando hay una proteína mal plegada que induce una señal esta se va a autofosforilar, va a
dimerizar y va a exhibir un dominio de endoribunucleasa que va a madurar un mRNA de una proteína reguladora de
genes que al llegar al núcleo va a inducir la transcripción de mRNA de proteínas chaperonas.

● PERK: se autofosforila y esto inactiva el inicio de la traducción, habrá menos proteínas que entrarán al retículo.
Esto va a producir la traducción selectiva de proteínas que van a aumentar la transcripción de genes de proteínas
chaperonas.

● ATF 6: proteína e memebrana del RE, lva al Golgi, en éste es clivada y se transforma en una proteína soluble
y actúa como reguladora de genes.
9) Tránsito vesicular
RE a Golgi Trans Golgi a Cis Golgi -Golgi a Endosoma
-Trans Golgi a Lisosoma
- M.P. a Endosoma
Sentido Anterógrado Retrógrado Retrógrado
cubierta COP II COP I Clatrina

Proteína G Sar 1 ArF ArF


Proteína Adaptadora Sec 23 Coatómero AP1/AP2
Sec 24

Secuencia de Di-ácida KDEL Manosa-6-fosfato


señalización en prot
cargas
(Asp-X-Glu)
Receptor Sec24 Red KDEL Receptor M6P

● Las 2 funciones de una cubierta vesicular son:


1-Favorecer la curvatura

2-Seleccionan y concentran las proteínas carga.

Los fosfoinositoles como marcadores de orgánulos y dominios de membrana.El fosfatidilinositol


se encuentra en la hemicapa citosólica en baja concentración.

⚫ ‎a) explicar detalladamente el camino que hace la hidrolasa lisosomal desde que se sintetiza hasta que llega a los
lisosomas b) vía relacionada con los lisosomas

⚫ cuál es la proteína transportadora que lleva H+ al interior de los lisosomas, la vía que transporta los materiales que
van a los lisosomas, cómo hacen los lisosomas para mantener los H+ en su interior sin perder su electroneutralidad,

⚫ explicar mecanismo de endocitosis de un liposoma.


3)explica la endocitosis de ldl

⚫para que sirve el liposoma en la celula



‎ un cuadro comparando el trasporte a peroxisomas y mitocondrias ( co o post traduccional,
pregada/desplagada, sec. señal, peptisada señal, receptor, traslocon)

⚫ se quiere realizar estudio de vesículas que transportan de trans Golgi al cis Golgi con GFP, con vector
plasmidico y anticuerpos: anti COP I, anti COP II, anti retromero.... a) explique cómo debe ser el vector b)
que anticuerpo se debe usar, explicar la vía de transporte y que proteínas se transportan

⚫ Una de las causas de la hipercolesterolemia familiar es la falla en la captación e internalización de


partículas de LDL debido a una disminución o ausencia de la actividad de los receptores para LDL de la
membrana plasmática.
a) Explique en detalle el proceso de endocitosis de estas lipoproteínas en condiciones normales. (Puede
realizar esquema debidamente justificado)
b) Que utilidad tiene para la célula, endocitar este tipo de partículas?

⚫A) Realizar un esquema de los componentes de la vía endocítica. Incluír red trans-golgi y membrana
plasmática.
8B) Enumerar procesos que se llevan a cabo en la maduración de un endosoma.
8C) Endocitosis mediada por receptor (no me acuerdo lo que preguntaba)

⚫ a) Describa la estructura de la cubierta de una vesícula de Clatrina, especificando como se disponen las
diferentes proteinas que la componen (pueden hacer esquema con referencias). b) Indique cual es la funcion
de los diferentes componentes de la cubierta de clatrina. c) Indique que vías del transito intracelular estan
mediados por vesiculas de clatrina. d) Que sucedera con una vesicula de clatrina en formacion en una celula
que presenta una mutacion en la dinamina que no le permite hidrolizar GTP. Justifique su respuesta

⚫ Una de las causas de la hipercolesterolemia familiar es la falla en la captación e internalización de


partículas de LDL debido a una disminución o ausencia de la actividad de los receptores para LDL de la
membrana plasmática.
a) Explique en detalle el proceso de endocitosis de estas lipoproteínas en condiciones normales. (Puede
realizar esquema debidamente justificado)
b) Que utilidad tiene para la célula, endocitar este tipo de partículas?

⚫ explicar mecanismo de endocitosis de un liposoma.


⚫ explica la endocitosis de ldl

10) AutoFagia
¿Qué es la autofagia? ¿Cuál es su mecanismo?
enumerar y describir brevemente los pasos de la autofagia.
¿Qué proteínas intervienen en la autofagia?
¿Cuáles son los pasos de la formación del autofagosoma?
¿Cuál es la función de la LC3?
¿Cuál es la función de cada uno de los complejos?
Describir molecularmente la autofagia selectiva.


11) Vias señalizacion
En que parte se involucran la via GPCR y via RTK
En la Via IP3 con receptor GPCR y en Via con receptor RTK se activan las fosfolipasas beta y gamma, las cuales son
analogas y fosforilan fosfatidil inositol de la membrana plasmatica para obtener DAG (diacilglicerol) y IP3 (inositol). Por
lo tanto ambas aumentan la concentracion de calcio citosolico y activan la PKC (factor de transcripsion)

⚫ cómo se aumenta el calcio intracelular,


Mediante 4 vias :
Via IP3 (receptor GPCR)
Via IP3 (receptor RTK)
Via IP3 (receptor citoquina )
Via WNT

⚫ Tipos de receptores de membrana. Cual es la proteína que une calcio y porqué se le llama proteína interruptora.,por
qué el calcio se mantiene a bajas concentraciones en el citosol y cómo se mantiene a bajas concentraciones dentro de
la célula.

⚫ explicar que son las proteinas G, cómo se activan y cuál es su funcion, cómo se clasifican en base a la estructura y
mencionar 3 procesos celulares diferentes que involucren la participación de proteínas G distintas. Elegir uno y
explicarlo detalladamente.

⚫ colera
a) que pasa si la proteina gs alfa queda activada
b) via de regulacion de la que se menciona
c) como afecta esta via a la enfermedad o algo asi

⚫ El cólera es una enfermedad causada por la bacteria Vibrio cholerae a través de una toxina con actividad
enzimática. Esta enzima cataliza la unión ADP-ribosa a la subunidad Gαs de una proteína G trimérica; como
consecuencia Gαs está siempre activa.
a) Explique que significa que la proteína Gαs este activa
b) Que via de señalización se encuentra asociada a Gαs ? Explíquela en detalle hasta la activación del efector
citosolico.
c) Que tipo de receptor activa fisiológicamente a la prot. Gαs? Explique dicha activación.

⚫ Completar cuadro vias


Wnt/B-cat Hedghog Noch delta IP3 JAK—STA IP3K NF-kB
enina T
Receptor Frizzled Ihog / Notch GPCR JAK receptores
Patched / cinasasa TNF-alfa
Smoothened (trímero)
(en
vesículas)

Ligando Wnt Hedgehog (delta, en Acetilcolina Interferon,,ho el ejemplo


(glucoprotein procariotas) rmona del teórico:
a) Símil delta; crecimiento
ésta se TNF-alfa
encuentra
interacciona
ndo con la
membrana
plasmática

Tipo Vias que Vias que GPCR citoquinas RTK “Vías que
dependen de dependen de dependen de
proteínas proteínas proteínas
latentes latentes latentes”

Funcion Proliferación Proliferación Diferenciació Aumentar Proliferación Median


n por Calcio respuestas
contacto citosolico inflamatorias
Activar y de
PKC(factor inmunidad
de nata
transcripcion
)

⚫ El cólera es una enfermedad causada por la bacteria Vibrio cholerae a través de una toxina con actividad
enzimática. Esta enzima cataliza la unión ADP-ribosa a la subunidad Gαs de una proteína G trimérica; como
consecuencia Gαs está siempre activa.
a) Explique que significa que la proteína Gαs este activa
b) Que via de señalización se encuentra asociada a Gαs ? Explíquela en detalle hasta la activación del efector
citosolico.


c) Que tipo de receptor activa fisiológicamente a la prot. Gαs? Explique dicha activación.
la vía que activa el ciclo celular(ras mapk) y como la activaba(por rb-e2f). En base a esto me preguntaron un poco el
punto de restriccion y puntos de control del ciclo.

¿Cómo actúa el MITOGENO?


EL MITOGENO va a interactuar con su receptor especifico, activando la vía de señalización dependiente de la proteína
RAS asociadas a proteínas GEF, la traducción de esta señal produce derivadas fosforilación que va a favorecer la
activación de genes de respuesta temprana, los cuales son transcriptos a proteínas como la Myc, Jun y Fos, que no son
más que proteínas que actúan como factores de transcripción que promueven la transcripción de genes de respuesta
tardía como las CDK/G1-S.
MITOGENO → RECEPTOR → Vía RTK-RAS → Vía MAPK → Myc Jun Fos → CDK/G1-S

⚫ q receptores acoplados a enzimas inducen el crecimiento y la supervivencia. Elegir 1 via y explicarla


12) citoesqueleto

Tipo de Monómero Nro de Union de la que Ejemplo de


filamentos protofilamento forma parte función
s
Microtubulos tubulina 13 Transporte
intracel y
localizacion
celula
Intermedios proteínas en 8 Desmosomas y Resistencia
alfa-hélice, hemidesmoso mecánica
mas
Microfilamentos actina 2 Uniones Forma y
adherens locomocion

⚫ definición de concentración crítica ,catastrofe y rescate.


Cc critica. es la cc de monomero en el cual la vel de polimerazacion y despolimerazacion son iguales
(estado estacionario)

Catastrofe se da cuando la vel de hidrolisis del gtp alcanza la velocidad polimerizacion gtp del extremo mas

Rescate: cuando se vuelve a contruir un casquete de gtp y asi vuelve a crecer el extremo mas

⚫mencionar 1 proteínas accesorias que modifican (y como) la disposición de los microfilam de actina (o
algo así no recuerdo bien)

Microfilamentos:
gelsolina Se une a la actina polimerizada y la “tuerce” produciendo un corte.
proteinas de uniones laterales cofilina , se une a la actina unida a ADP.

⚫ La concentración de monomeros solubles de actina (Actina-G) en una celula se encuentra entre 50-200
veces
Que mecanismo utiliza la celula para evitar el autoensamblaje de estos monomeros en filamento?
Proteinas accesorias.
timosina se une a uno a los monomeros.

Como modula la celula este mecanismo de regulacion, en caso de requerir la polimerizacion de los
monomeros?
Profilina desplaza a la timosina para dejar al monomero libre. Esta regulada por fosforilaciones y/o union
fosfoinositido. Ademas favorece adp a atp .

5 parametros modificables:
nucleacion, cc critica, polaridad de polimerizacioon, ntp y las uniones laterales.

⚫ Nombrar las proteínas accesorias del citoesqueleto de actina, la función de los filamentos intermedios
⚫describir tipos de actina en quimiotaxis.
_ proteinas g involucradas y que proteinas reclutan

⚫fagocitosis (explicar detalladamente, vías rho y rac)


⚫ a) Describa como está organizado el citoesqueleto de actina en la quimiotaxis..
b) Cuales son las proteínas G involucradas?

13) Ciclo celular

⚫Que pasa en que cada fase ?


⚫Funcion ciclinas
⚫Puntos de control .
⚫La proteólisis es importante para la regulación del ciclo celular eucarionte. Mencione la/s fase/s
dónde se evidencia

Eventos en cada fase .


- Proteínas que regulan el ciclo celular
- Maquinaria proteica activa durante
esta fase
- Modificaciones inhibitorias de las Cdk
-check point

⚫Fase M eventos.
⚫ Envoltura nuclear. En qué fase del ciclo se desensambla, qué complejos Cdk-ciclina están
involucrados en este proceso (Calabrese aclaró "con nombre y apellido, e indicar a qué fase
corresponde) y mecanismo del proceso.

⚫Formación del huso mitótico y actividad quinasa aurora B


⚫Que es un centrosoma ? Que funcion cumplen?
⚫ Dibujar componentes del huso mitótico incluyendo 2 cromosomas ,explicar por medio de que
estructura se unen los cromosomas al huso y cómo varía esto en mitosis y meiosis .

⚫Que es la recombinación homóloga ? en qué procesos se da?


⚫Comparar la estructura del cromosoma interfásico y el mitótico.

Mitosis Meiosis

“significado biológico” Duplicar células somáticas Generar células haploides


(así estaba en el examen) para aumentar la variación
genética de una especie
mediante recombinacion

Replicacion ADN Fase S


en que fase se produce

En que fase se produce la


separacion de cromatides
hermanas
14) Fecundacion y diferenciacion

⚫ el huso mitótico, esquema, diferencias de él en mitosis y meiosis, a que se une el huso


en el cromosoma (o algo así), y como se separan las cromátidas hermanas

⚫ genes de respuesta temprana:


a) Menciona algunos ejemplos de genes de respuesta temprana, indicando cual es el tipo
de ligando que induce el aumento en la expresión de los mismos.
b) En qué etapa del ciclo celular eucarionte aumenta la expresión de estos genes y cuál
es la principal consecuencia de este incremento en las células.
c) Describa el mecanismo celular que permite superar el punto de restricción en las
células eucariontes.

Que es un mitogeno , describa secuencias de union de un mitogeno a su receptor (solo


incluya en su respuesta las consecuencias que tendra a nivel de la transcripcion y del
ciclo celular )

15)apoptosis
⚫ Defenir apoptosis : proceso regulado de muerte celular programada con el fin de controlar desarrollo y crecimiento de una
celula. Mediado por una cascada de caspasas y marcada por una serie de cambios morfologicos bien definidos .
Por lo tanto tiene Control sobre Homeostasis en el número de células y Control de calidad celular.

Apoptosis Necrosis

Energia Si( es un proceso regulado ) No . Independencia de ATP.

Procesos

Membrana La conserva Se destruye

Inflamacion No Si

Volumen celula Disminuye Aumenta

Describir aspectos bioquimicos de la apoptosis ( fragmentacion nucleo , ampollas membrana ect)


Fragmentación del DNA endonucleasas
Cambios en la membrana plasmática Fosfatidilserina
Pérdida del potencial de membrana mitocondrial CITOCROMO C (intermembranas mitocondriales)

⚫ Completar esquema de apoptosis (figura 18-12 del Alberts)


⚫la familia de las Bcl2, que via de la apoptosis regulan,
⚫ a) Mencione 2 estimulos que puedan desencadenar la via intrinseca de la apoptosis. b) Describa la vía intrinseca de
la apoptosishasta la activacion de las caspasas ejecutoras, indicando claramente la funcion de cada uno de las
principales proteinas que participan de dicha via c) uno de los eventos bioquimicos caracteristicos de la apoptosis que
ocurre una vez activada las caspasas ejecutoras es la degradacion de proteinas que forman parte de las uniones
celula-celula (C-C) y celula-matriz (C-M). Mencione tres proteinas que formen parte de las uniones C-C y C-M que sean
sustrato de las caspasas, justificando cual es el tipo de union que se ve afectada en c/caso

⚫explicar detalladamente dos vías en las que una señal de supervivencia inhiba la apoptosis,

16) Cancer

Definir protooncogen. Oncogen y gen supresor de tumores. Dar ejemplos

Mencione 6 características de células de cáncer.

Las condiciones de malignidad, por qué es que hacen que la célula sea maligna?

Mencione al menos 2 mecanismos para pasar de protooncogen a oncogen.

como produce cancer el HPV.

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