Enzimas

Enzimas
Biól. Cruz Carlos Castillo Camacho

biocruzccc@iztacala.unam.mx
Enzimas
★ 2.3.1 Importancia biomédica, estructura: apoenzima,

holoenzima, cofactor, zimógeno (proenzima) e isoenzima.
★ 2.3.2 Clasificación: Comisión de Enzimas de la IUB y
funciones generales. - Ejemplos de enzimas de importancia
médica.
★ 2.3.3 Definición de: sitio activo y sustrato. - Formación del
complejo enzima-sustrato. - Modelo enzimático: Koshland.
★ 2.3.4 Factores que modifican la actividad enzimática: pH y
temperatura.
★ 2.3.5 Inhibición enzimática: competitivo, no competitivo,
acompetitivo y alostérico.
1. Las Enzimas son proteínas
2. Las Enzimas tienen centro(s) activo(s)
3. Las Enzimas son específicas
4. Las enzimas “modifican” la velocidad de reacción
(incrementándola) pero no el equilibrio químico
Una proteína se define por lo que es …
∙Peso Molecular
∙Composición de aminoácidos
∙Secuencia
∙Estructura
Sin embargo
Una enzima se define por lo que hace …
● Reacción que cataliza

● Sustrato/Producto
● Especificidad
● pH optimo de acción
● Temperatura optima de acción
● etc.
Enzimas
• En su gran mayoría son proteínas que catalizan

reacciones químicas en los seres vivos, siempre y
cuando sean termodinámicamente posibles.
• Existen moléculas de RNA y anticuerpos con actividad

catalítica que se conocen con el nombre de ribozimas y
abzimas respectivamente.
Enzimas
• Prácticamente todas las reacciones químicas
que tienen lugar en los seres vivos están
catalizadas por enzimas.
• Las enzimas son catalizadores específicos:

cada enzima cataliza un solo tipo de reacción,
y casi siempre actúa sobre un único sustrato
o sobre un grupo muy reducido de ellos.
En una reacción catalizada por un enzima:
• La sustancia sobre la que actúa el enzima se llama sustrato.
• El sustrato se une a una región concreta de la enzima,

llamada sitio activo, que comprende:
– (1) un sitio de unión formado por los aminoácidos que
están en contacto directo con el sustrato
– (2) un sitio catalítico, formado por los aminoácidos
directamente implicados en el mecanismo de la reacción.
• Una vez formados los productos el enzima puede comenzar

un nuevo ciclo de reacción
Cofactores
• Algunas enzimas se asocian con moléculas de
carácter no proteíco que son necesarias para
su funcionamiento – cofactores.
• Iones metálicos: Zn2+ o Fe2+
• Moléculas orgánicas: NAD+, FAD+, coenzima A
y coenzima C
Zimógenos
• Un zimógeno o pro-enzima es un precursor
enzimático inactivo, es decir, no cataliza
ninguna reacción como hacen las enzimas.
Para activarse, necesita de un cambio
bioquímico en su estructura que le lleve a
conformar un centro activo donde pueda
realizar la catálisis.
Isoenzimas
• Son enzimas que difieren en la secuencia de
aminoácidos, pero que catalizan la misma
reacción química. Usualmente difieren en los
mecanismos de regulación y en las
características cinéticas.
• Ejemplos: Amilasa - Existen dos isoenzimas
amilasa “P” o pancreática, que pasa más
fácilmente a la orina y la “S” o salival.
Clasificación de las Enzimas
Necesidad de un sistema de clasificación
- Muchos nombres eran poco informativos, cuando no
engañosos, respecto a la reacción catalizada, como:
-emulsina,
-diaforasa,
-enzima amarilla antigua,
-etc.
- En muchos casos se utilizaban varios nombres para una misma enzima, como:
-invertasa,
-sacarasa,
-invertina y
-b-fructofuranosidasa.
- Por otra parte, un mismo nombre se aplicaba a enzimas diferentes, como p. ej.,
-“sintetasa”.
* En 1956 la Unión Internacional de Bioquímica (IUB) creó la Comisión de Enzimas (EC).
*La misión de dicha comisión era, según palabras textuales de sus declaración programática:
“Considerar la clasificación y nomenclatura de enzimas y coenzimas, sus unidades de actividad

y métodos estándar de ensayo junto con los símbolos utilizados en la descripción de la cinética
enzimática.”
* En 1961 la Comisión publicó las bases para una nomenclatura y clasificación de las enzimas.
* Posteriormente se disolvió la Comisión y la IUB creó el Comité Permanente de Enzimas que se

encargó de la aplicación de la nueva nomenclatura.
* En 1964 se publica la primera lista de 874 enzimas clasificadas y nombradas sistemáticamente.

Clasificación de las enzimas de acuerdo con la Enzyme Commission (EC)
* La clasificación sistemática de las enzimas de acuerdo con el sistema propuesto por la EC

sigue un criterio funcional según el cual las enzimas se clasifican según el tipo de reacción
catalizada.
* La EC asigna un nombre sistemático y un código numérico particular a cada enzima conocido.
EC 4.1.1.89 biotin-dependent malonate decarboxylase (25 November 2008)

Nombre sistemático:
En nombre sistemático consta de tres partes:
a) sustrato sobre el que actúa la enzima,

b) acción química que cataliza,
c) terminación universal –ase (en inglés) –asa (en español).
Ejemplo:
G-6-P ←→ F-6-P
Sustrato: Glucosa-6-P Acción: Isomerización
Nombre: glucosa-6-fosfato isomerasa
* Al ser la reacción reversible, esta enzima también podría haberse nombrado

como:fructosa-6-fosfato isomerasa, en cuyo caso el sustrato sería la Fructosa-6-P
Clasificación de acuerdo a su función
Categoría Función
Oxidorreductasas Reacciones de oxidación-reducción
Transferasas Transferencia de un grupo funcional
Hidrolasas Ruptura de una molécula mediante la
adición de H2O
Liasas Ruptura no hidrolítica de enlaces
Isomerasas Transformación en su isómero
Ligasas Formación de enlaces. Requiere ATP
Grupo 1: Oxidorreductasas
• Transferencia de protones o electrones de un
sustrato a otro.
• Se dividen en:
– Deshidrogenasas
– Oxidasas
– Peroxidasas
– Oxigenasas
– Hidroxilasas
– Reductasas
– Etc.
Grupo 2: Transferasas
• Catalizan la transferencia de un grupo
funcional.
• Se dividen en:
– Metiltransferasas
– Aciltransferasa
– Fosfotransferasas
– Sulfotransferasas
– Selenotransferasas
Grupo 3: Hidrolasas
• Catalizan la hidrólisis de un enlace químico.
• Se dividen en:
– Esterasas
– Glicosidasas
– Peptidasas
– Arginasas
– ATPasas
– Etc.
Grupo 4: Liasas
• Catalizan procesos de ruptura de enlaces por
medio de mecanismos diferentes a la
oxidación o hidrólisis.
• Se dividen en:
– Descarboxilasas
– Aldolasas
– Deshidratasas
– Hidratasas
– Etc.
Grupo 5: Isomerasas
• Transforma un isómero de un compuesto
químico en otro.
• Se dividen en:
– Racemasas
– Cis-trans isomerasas
– Epimerasas
– Mutasas
– Etc.
Grupo 6: Ligasas
• Catalizan la unión de dos moléculas a partir de
la formación de enlaces covalentes.
• Se dividen en:
– DNA ligasas (ATP y NAD+)
– RNA ligasas
– Amina ligasas
– Acetato ligasas
– Etc.
Ejemplos de enzimas con importancia
clínica
Enzima Órgano o enfermedad de interés
Fosfatasa ácida Cáncer de próstata
Fosfatasa alcalina Enfermedades hepáticas y óseas
Amilasa Enfermedades pancreáticas
Lactato deshidrogenasa Hígado, corazón, eritrocitos
Aldolasa Músculo y corazón
Arginasa Hepatopatías
Elastasa Colagenopatías
Plasmina Cuaguloptías
Lipasa Páncreas
γ-glutamiltranspeptidasa Hepatopatías
Óxido-reductasas. Transferasas. Hidrolasas.
➔ Catalizan reacciones de ➔ Transfieren grupos ➔ Catalizan reacciones en

óxido-reducción entre dos moleculares de una molécula las que se logra la rotura
sustratos. donadora a una aceptora. de enlaces como C-O,
*Reacción de transferencia de uno o Amino, carboxilo, carbonilo, metilo, C-N y O-P por la adición
dos electrones acompañadas del fosforilo y acilo. de agua.
cambio compensatorio en la cantidad Prefijo trans. Esterasas, fosfatasas y
de hidrógeno y de oxígeno en la EJEMPLO: transcarboxilasas, proteasas.
molécula. transmetilasas y transaminasas.
EJEMPLO: Deshidrogenasas y
reductasas.
Isomerasas.
Ligasas.
Liasas. ➔ Catalizan varios tipos de
reordenamientos
intramoleculares, ➔ Catalizan la formación
➔ Catalizan reacciones en las que Isomerasas: azúcares interconvierten de enlaces entre dos
ciertos grupos se eliminan para aldosas (contienen aldehídos) en moléculas de sustrato.
formar un doble enlace o se cetosas (cont. cetona). Muchas incluyen el término
añaden a un doble enlace. Epimerasas: Catalizan la inversión de sintetasa y otras se denominan
Descarboxilasas, hidratasas, átomos de carbono asimétricos. carboxilasas.
deshidratasas, desaminasas y Mutasas: Catalizan la transferencia
sintasas. intramolecular de grupos funcionales.
Sitio Activo
• Las moléculas de enzimas contienen
hendiduras o cavidades denominadas sitio
activo. El sitio activo está formado por las
cadenas laterales de residuos específicos, lo
que ocasiona que tenga un arreglo
tridimensional particular, diferente al resto de
la proteína. Este sitio es afín por la estructura
tridimensional del sustrato.
enzima
sustrato
Sitio activo Sitio activo

vacío ocupado
• El sitio activo la enzima (E) une al substrato (S)
formando un complejo enzima-substrato (ES).
En el complejo ES, E transforma a S en él o los
productos, formando el complejo
enzima-producto (EP), finalmente la enzima
libera del sitio activo a P, regenerándose.
Eficiencia catalítica
• La mayoría de las reacciones catalizadas por
enzimas son muy eficientes y transcurren
desde 106 hasta 1014 veces más rápido que la
misma reacción no catalizada. El número de
estas moléculas transformadas a producto por
molécula de enzima en cada segundo, se
conoce como el número de recambio.
Ejemplos de eficiencia catalítica
Las enzimas son muy específicas por el substrato de la reacción que catalizan.
Interactúan con una o muy pocas moléculas y catalizan únicamente un tipo de reacción,
por lo que las moléculas con las que interactúan deben ser muy parecidas, tanto en
composición, como en estructura tridimensional.
Modelos enzimáticos.
• Modelo de llave – cerradura: Propuesto por el
químico Emil Fisher, supone que la estructura
del sustrato y la del sitio activo de la enzima
son exactamente complementarias.
• Modelo de ajuste inducido: (Koshland, 1954)
La unión del sustrato al centro activo del
enzima desencadena un cambio
conformacional que da lugar a la formación
del producto.
Factores que modifican la actividad
enzimática
• pH: Las enzimas poseen grupos químicos
ionizables. Según el pH del medio, estos
grupos pueden tener carga positiva, negativa o
neutra. Como la conformación de las proteínas
depende, en parte, de sus cargas eléctricas,
habrá un pH en el cual la conformación será la
más adecuada para la actividad catalítica.
• La mayoría de los enzimas son muy sensibles a
los cambios de pH. Desviaciones de pocas
décimas por encima o por debajo del pH
óptimo pueden afectar drásticamente su
actividad.
• En general, los aumentos de temperatura
aceleran las reacciones químicas: por cada 10°
C de incremento, la velocidad de reacción se
duplica. Las reacciones catalizadas por
enzimas siguen esta ley general. Sin embargo,
al ser proteínas, a partir de cierta
temperatura, se empiezan a desnaturalizar por
el calor.
Inhibición enzimática
• La actividad de una enzima se puede
bloquear.
• Inhibidores que ocurren naturalmente en las
células (regulación metabólica)
• Agentes tóxicos o drogas (acción tóxica).
• Agentes farmacológicos (acción terapéutica).
Tipos de inhibición
• Reversible: el inhibidor puede disociarse de la
enzima porque no se une por enlaces
covalentes.
• Irreversible: el inhibidor se une

covalentemente a la enzima, casi siempre a un
grupo de la cadena lateral de los aminoácidos
en el sitio activo. La enzima queda inactiva
permanentemente.
Inhibición competitiva
• El inhibidor competitivo es muy similar al
sustrato normal de la enzima. Dada esa
similitud estructural, este inhibidor se une
reversiblemente al sitio activo de la enzima.
Se pude revertir el efecto aumentando la concentración de sustrato

Inhibición no competitiva
• El inhibidor se une a la enzima en un lugar
distinto al sitio activo.
La Vmax corresponde al
valor máximo al que
tiende la curva
experimental, y la Km
corresponde a la
concentración de sustrato
a la cual la velocidad de la
reacción es la mitad de la
Vmax.
• Con un inhibidor competitivo, la reacción
puede alcanzar en algún momento su Vmax
normal, pero se necesita de una mayor
concentración de sustrato para alcanzarla. La
Vmax no cambia, pero la Km aparente es mayor.
• Con un inhibidor no competitivo, la reacción
nunca puede alcanzar su Vmax, sin importar
cuánto sustrato añadamos. La reacción
alcanza ½ de su nueva Vmax es igual a la del
inhibidor competitivo (no cambia).
Inhibición Acompetitiva
• El inhibidor se combina sólo con el complejo
enzima-sustrato, por lo que ejerce su efecto
únicamente cuando hay un nivel elevado de
E-S.
Diferencias
Tipo de Inhibición Vmax Km
Competitiva No cambia Aumenta
No Competitiva Disminuye No cambia
Acompetitiva Disminuye Disminuye
Inhibidor Alostérico
• Es aquel que cuando se une a una enzima,
ocasiona un cambio estructural en el sitio
activos, de manera que las enzimas funcionan
menos eficientemente.

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★ 2.3.1 Importancia biomédica, estructura: apoenzima,

Una enzima se deﬁne por lo que hace …

● Reacción que cataliza

• En su gran mayoría son proteínas que catalizan

• Existen moléculas de RNA y anticuerpos con actividad

• Las enzimas son catalizadores específicos:

• La sustancia sobre la que actúa el enzima se llama sustrato.

• El sustrato se une a una región concreta de la enzima,

• Una vez formados los productos el enzima puede comenzar

“Considerar la clasificación y nomenclatura de enzimas y coenzimas, sus unidades de actividad

* Posteriormente se disolvió la Comisión y la IUB creó el Comité Permanente de Enzimas que se

* En 1964 se publica la primera lista de 874 enzimas clasificadas y nombradas sistemáticamente.

* La clasificación sistemática de las enzimas de acuerdo con el sistema propuesto por la EC

* La EC asigna un nombre sistemático y un código numérico particular a cada enzima conocido.

EC 4.1.1.89 biotin-dependent malonate decarboxylase (25 November 2008)

En nombre sistemático consta de tres partes:

a) sustrato sobre el que actúa la enzima,

Nombre: glucosa-6-fosfato isomerasa

* Al ser la reacción reversible, esta enzima también podría haberse nombrado

➔ Catalizan reacciones de ➔ Transﬁeren grupos ➔ Catalizan reacciones en

Sitio activo Sitio activo

• Irreversible: el inhibidor se une

Se pude revertir el efecto aumentando la concentración de sustrato

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