Nombre : Cáceres Mesías Nohely

Nivel 1
Selección 3 ( 2o )

TAREA
- Pregunta 1
. Tropomiosina :
Está formada por dos cadenas alfa helicoidales ensambladas como
hileras y asociadas a los filamentos de actina. Las hileras de
tropomiosina se extienden a lo largo de todo el filamento de actina y se
localizan en los dos surcos que dejan dichos filamentos. Su principal
función es regular la interacción entre los filamentos de actina y las
cabezas de miosina. Su acción en el contracción muscular se debe a un
cambio conformacional que permite o impide el contacto de las cabezas
de miosina con los filamentos de actina. En el estado de relajación, la
tropomiosina bloquea el contacto actina-miosina, pero el aumento de la
concentración de calcio hace que se produzca la contracción muscular.

. Titina :
La titina se puede considerar como el tercer filamento de los
sarcómeros. Tras la actina y la miosina, es la tercera proteína más
abundante en el músculo y es la proteína más larga identificada hasta la
fecha (38138 aminoácidos). Ancla su extremo N-terminal en la línea Z y
el extremo C-terminal en la línea M. Tanto uno como otro extremos se
solapan con los de otras titinas de sarcómeros adyacentes formando así
un sistema continuo. Parte de la proteína tiene propiedades elásticas y
parece contribuir a la resistencia al estiramiento de los sarcómeros,
además de establecer una longitud máxima para el sarcómero.
- Pregunta 2 :
Homocisteína :
La homocisteína es un aminoácido azufrado (que contiene azufre), no
proteinógeno, es decir, que no forma parte de las proteínas. Procede de
la metionina, que es otro aminoácido que forma parte de las proteínas.
La homocisteína (HC) es un aminoácido azufrado importante en la
transferencia de grupos metilos en el metabolismo celular, este ha sido
considerado factor influyente en el desarrollo de enfermedades
cardiovasculares y cerebrovasculares.
Recientes estudios se han enfocado en el análisis a la relación existente
entre la hiperhomocisteinemia (aumento de la concentración plasmática
de homocisteína) y el daño a células neuronales; en mecanismos
neurotóxicos como: aumento del estrés oxidativo y generación de
derivados de homocisteína así como el incremento en la toxicidad de la
proteína β-amiloide, entre otros.
- Pregunta 3 :
. DNA – A :
Cuando un DNA está muy concentrado, o en el medio en el que esté
se reduce la humedad relativa por debajo del 75%, se ha observado
que el DNA-B cambia su conformación a una de otro tipo
denominada DNA-A. 
Características:
- Giro de la hélice: dextrógiro
- Diámetro de la hélice: 2,55 nm

. DNA – B :
El DNA-B es el modelo propuesto por Watson y Crick sobre la
estructura secundaria del DNA y es la forma predominante en
las células.

Como resultado de la asimetría de cada par de nucleótidos el ADN-B

presenta surcos de tamaño diferente, y como cada par de bases gira
unos 35º respecto al anterior, estos surcos se van repitiendo. Son las
zonas donde las bases nitrogenadas van a ser accesibles desde el
exterior. Se van alternando así dos tipos de surcos: un surco mayor y
un surco menor.

Características:

- Giro de la hélice: dextrógiro

- Diámetro de la hélice: 2,34 nm

. DNA – Z :
El DNA-Z es una de las varias formas que puede adoptar DNA. Esta
conformación de DNA se configura como una doble hélice levógira (con
giro hacia la izquierda) con un esqueleto en zigzag. Esta configuración se
genera en determinadas secuencias, que alternan purinas y pirimidinas.
 Características:

- Giro de la hélice: levógiro
- Diámetro de la hélice: 1,84 nm

- Pregunta 4 :
Un ciclotrón es un tipo de acelerador de partículas. El método
directo de acelerar iones utilizando la diferencia de potencial
presentaba grandes dificultades experimentales asociadas a los
campos eléctricos intensos. El ciclotrón evita estas dificultades por
medio de la aceleración múltiple de los iones hasta alcanzar
elevadas velocidades sin el empleo de altos voltajes.

- Pregunta 5 :
. Cromatografía de exclusión molecular :
La cromatografía de exclusión molecular (a menudo también llamada
filtración en gel o de tamiz molecular) es una de las técnicas más sencillas
de las empleadas en la separación de proteínas y ácidos nucleicos. Este
tipo
de cromatografía se realiza en columnas cilíndricas rellenas con algunos
de
los geles que se fabrican con este fin y que pueden ser de varios tipos:
dextranos con enlaces cruzados (sephadex), agarosa (sepharose, Bio-gel
A),
poliacrilamida (Bio-gel B), etc. Todos estos geles (fase estacionaria) se
hallan constituidos por gránulos (partículas) de un material esponjoso
hidratado, que contiene poros con un tamaño de diámetro determinado.
Cuando se hace pasar una mezcla de moléculas de distinto tamaño, a
través de una columna de filtración en gel; aquellas moléculas con un
tamaño mayor que el diámetro de los poros de las partículas, sólo podrán
moverse en su camino, a través de la fase estacionaria, en el espacio que
queda entre las partículas; y por lo tanto, no se verán retrasadas en su
descenso. En cambio aquellas moléculas capaces de penetrar en las
partículas se verán retrasadas por la fase estacionaria; en mayor medida,
cuanto menor sea su tamaño. Por lo tanto, las moléculas eluden en este
tipo de cromatografía por orden decreciente de tamaño molecular.
. Cromatografía de intercambio iónico :
La cromatografía de intercambio iónico es un método que permite la
separación de moléculas basada en sus propiedades de carga eléctrica. Se
compone de dos fases: la fase estacionaria o intercambiador iónico, y la
fase móvil. La fase estacionaria insoluble lleva en la superficie cargas
electrostáticas fijas, que retienen contra iones móviles que pueden
intercambiarse por iones de la fase móvil, la cual suele ser una disolución
acuosa con cantidades moderadas de metanol u otro disolvente orgánico
miscible con agua que contiene especies iónicas generalmente en forma
de buffer. Los iones de ésta compiten con los analitos por los sitios activos
de la fase estacionaria.

- Pregunta 6 :
. Cremallera de leucina :

Una cremallera de leucina es un motivo estructural secundario

de proteínas que crea fuerzas de adhesión a través de hélices alfa en
paralelo. Es un dominio de dimerización común en proteínas
involucradas en la expresión génica. La leucina zipper (cremallera de
leucina): aparece a las proteínas de unión al ADN y otras proteínas
en un motivo estructural (motivo). Cuando la misma o diferente de
la cadena de polipéptido de dos de doble superficie de α-hélice
hidrófobo (a menudo contienen un residuo de leucina) del círculo
formado por la interacción de un círculo formado cuando dimérica
cremallera de leucina
Función :
Su función es reconocer a los promotores
Es una proteína importante para el proceso de transcripción
 Sin embargo , un factor de transcripción no solo actúa por medio de
una unión física al ADN sino también puede reconocer a otro factor
o a una de las polimerasas

. Dedos de Cinc :
Los dedos de cinc son pequeños motivos
estructurales de proteínas que pueden coordinar uno o más iones
de cinc para ayudar a estabilizar sus pliegues. Normalmente
funcionan como módulos de interacción que unen el ADN, ARN,
proteínas y moléculas pequeñas. Estas proteínas tienen un rol
estructural esencialmente. Este rol puede consistir en bajar la
entalpía de plegamiento de una proteína e inducir una
conformación activa, o bien, estabilizar una estructura cuaternaria
en particular. El zinc también tiene un rol regulativo, es decir, no
participa en los varios pasos catalíticos, pero su presencia sí
incrementa la rapidez catalítica. El nombre de "dedo de cinc" fue
acuñado para describir la hipótesis de la estructura de la unidad
repetida del factor de transcripción IIIA en Xenopus laevis.

- Pregunta 7:
. FISH
FISH o hibridación fluorescente in situ es una técnica citogenética de
marcaje de cromosomas mediante la cual estos son hibridados
con sondas que emiten fluorescencia y permiten la visualización,
distinción y estudio de los cromosomas así como de las anomalías
que puedan presentar. Esta técnica permite la rápida determinación
de aneuploidías, microdeleciones, duplicaciones, inversiones, así
como la adjudicación de un marcador genético a un cromosoma
(cartografía genética).
- Pregunta 8 :
Las proteínas iniciadoras reconocen secuencias de nucleótidos
específicas en esos puntos y facilitan la fijación de
otras proteínas que permitirán la separación de las dos hebras de
ADN formándose una horquilla de replicación. Un gran número
de enzimas y proteínas intervienen en el mecanismo molecular de la
replicación, formando el llamado complejo de replicación
 o replisoma. Estas proteínas y enzimas son homólogas
en eucariotas y arqueas, pero difieren en bacterias.
. Proteínas SSB :
Las proteínas SSB en células procariotas(single-stranded DNA
binding proteins o proteínas ligantes de ADN de cadena sencilla) son
un conjunto de proteínas encargadas de la estabilización de la
apertura del ADN de cadena sencilla generada por la acción de
las helicasas durante el proceso de replicación del ADN.[1] Estas
evitan el auto apareamiento entre las bases complementarias de la
cadena, protegiéndola de la acción de las nucleasas y de
asociaciones intracatenarias. Su análoga en células eucariotas se
conocen como RPA (proteins a replications).
Topoisomerasa II :
Son enzimas capaces de actuar sobre la topología del ADN, ya sea
enredándolo para permitir que se almacene de manera más
compacta o desenredándolo para que controle la síntesis de
proteínas y para facilitar la replicación del mismo. Estas enzimas son
necesarias debido a los inherentes problemas causados por la
configuración estructural del ADN.
Helicasa :
es una enzima vital en los seres vivos ya que participa en los
procesos de duplicación y reproducción celular de
este, transcripción, recombinación y reparación del ADN, y
de biogénesis de ribosoma. Su misión es romper los puentes de
hidrógeno que unen las bases nitrogenadas, haciendo así posible
que otras enzimas puedan copiar la secuencia del ADN.
Son proteínas que se van desplazando longitudinalmente a lo largo
de los enlaces fosfodiéster del ácido nucleico
Ligasa:
son aquellas enzimas que catalizan la unión de dos moléculas a
partir de la formación de enlaces covalentes acompañado por la
hidrolisis del ATP.
Primasa:
es una enzima que sintetiza pequeños fragmentos de ARN sobre la
cadena rezagada en la replicación del DNA, de unos 10 nucleótidos,
conocidos como cebadores, complementarios a la hebra
de ADN que se copia durante la replicación. 

- Pregunta 9 :
. proof-reading:
Las ADN polimerasas también realizan otras funciones durante el
proceso de replicación. Además de participar en la elongación,
desempeñan una función correctora y reparadora gracias a su
actividad exonucleasa 3', que les confiere la capacidad de degradar
el ADN partiendo de un extremo de este. Es importante que existan
 estos mecanismos de corrección ya que de lo contrario los errores
producidos durante la copia del ADN darían lugar a mutaciones.
En bacterias, las cadenas de ADN originales y recién hechas se
pueden diferenciar por una característica estado de metilación . Una
cadena de ADN antigua tiene grupos metilo CH3 en algunas de sus
bases, mientras que cadena de ADN recién hecha todavía no habrá
recibido su grupo metilo
En eucariontes, los procesos que permiten identificar la cadena
original en la reparación de mal apareamiento usan el
reconocimiento de mellas (rupturas en las cadenas sencillas)
presentes solo en el ADN recién sintetizado

 Reversión directa: algunas reacciones químicas que dañan el ADN

pueden ser "deshechas" directamente por enzimas de la célula.
 Reparación por escisión: el daño a una o unas cuantas bases de ADN
se suele arreglar al eliminar (escindir) y reemplazar la región dañada.
En la reparación por escisión de bases, solo se quita la base dañada.
En la reparación por escisión de nucleótidos, como en la reparación
de mal apareamiento que vimos antes, se elimina una sección de
nucleótidos.
 Reparación de ruptura de la doble cadena: se utilizan dos vías
principales, la unión de extremos no homólogos y la recombinación
homóloga, para reparar rupturas en la doble cadena del ADN (es
decir, cuando un cromosoma entero se divide en dos pedazos).
Su dirección es de 3’ a 5’