BIOQUÍMICA

Prof. Diana Blach

Programa de Química _ Facultad de ciencias básicas y tecnologías
 NUCLEO TEMATICO 1
1. ESTRUCTURA Y FUNCIÓN MOLECULAR
Composición y estructura del agua.
Propiedades fisicoquímicas del agua
Autoensamblaje molecular
Presión osmótica (electrolitos)
Soluciones amortiguadoras

La bioquímica trata de explicar la vida a nivel molecular,

ofrece respuestas a preguntas fundamentales como “¿De
qué estamos hechos?” o “¿Cómo funcionamos?”

2
 Agua
¿Cuál es la naturaleza de la sustancia que constituye alrededor de
70% de la masa de la mayoría de los organismos?
Las propiedades físicas y químicas son consecuencia de su estructura polar única y
de su concentración elevada. Entre las propiedades más importantes del agua esta
su capacidad para interactuar con un gran número de sustancias.

CONCEPTOS CLAVE
• La molécula de agua, polar, forma enlaces
de hidrógeno con otras moléculas.
• Varios tipos de fuerzas no covalente
actúan en las moléculas biológicas.
• El agua disuelve tanto sustancias iónicas
como polares.
 Agua
¿importancia fundamental del agua para la vida?
1. Interacciones débiles en los sistemas acuosos.
2. Ionización del agua, ácidos débiles y bases débiles.
3. Tamponamiento contra cambios de pH en los sistemas biológicos.
4. El agua como reactivo bioquímico.
5. Adecuación del ambiente acuoso a los organismos vivos (pH,
temperatura, oxígeno disuelto).

La hidratación (la interacción no covalente de las moléculas de agua

con los solutos) desempeña en la arquitectura, la estabilidad y la
dinámica funcional de macromoléculas como las proteínas y los ácidos
nucleicos.

Los enlaces de hidrogeno confieren al agua sus

propiedades extraordinarias
 Estructura molecular del agua

dipolo

Estructura tetraédrica del agua Cargas de una molécula de agua Modelo espacial de una molécula de
En el agua, dos de los cuatro orbitales sp3 del Los dos átomos de hidrógeno de cada agua
oxígeno están ocupados por dos pares molécula llevan cargas parciales Como la molécula de agua tiene una
solitarios de electrones. Cada uno de los otros positivas. El átomo de oxígeno lleva una geometría plegada, la distribución de la
dos orbitales sp3 semillenos se complementa carga parcial negativa. carga dentro de la molécula es asimétrica.
con la adición de un electrón del hidrógeno. Por consiguiente, el agua es polar.
 Enlace de hidrogeno

Agregado tetraédrico de En el agua líquida, cada molécula tiene el potencial de

Moléculas de agua formar enlaces de hidrógeno hasta con otras cuatro
moléculas de agua, pero cada enlace dura apenas unos
10–12 s. Como resultado, la estructura del agua oscila
continuamente conforme las moléculas de agua giran,
se flexionan y se reorientan.

→ Son gases ¿por qué?

Debido a su capacidad de formar enlaces de

hidrógeno, el agua es altamente cohesiva.
Figura 1. Estructura del hielo.
Cada molécula de agua actúa como donador para dos
enlaces de hidrógeno y como aceptor para dos enlaces
de hidrógeno, de modo que interactúa con otras cuatro
moléculas de agua en el cristal.
 Enlace de hidrogeno

Propiedades térmicas del agua

Enlaces de hidrógeno en el hielo: Los

Si el agua siguiera el patrón se fundiría a enlaces de hidrógeno en el hielo producen una
−100°C y herviría a −91°C. estructura muy abierta. El hielo es menos
denso que el agua en su estado líquido.
 Propiedades fisicoquímicas del agua
Calor específico. Se define como la cantidad Calor de fusión. Es la energía que se gasta en la
de energía calorífica necesaria para elevar la fusión de un mol de un sólido. Un mol de agua equivale
temperatura de 1 gramo de una sustancia en 1 ºC: a 18 gramos, entonces, para poder fundir 18 gramos de
Esta energía es alta para el agua (1 cal/g). agua se necesitan 80 cal/g.

NOTA: Para congelar un mol de

agua (18g) se necesita remover la
misma cantidad de energía que se
absorbe al descongelarlo.
 Propiedades fisicoquímicas del agua

Propiedades térmicas del agua

 Propiedades fisicoquímicas del agua
Calor de evaporación. Representa la cantidad de Tensión superficial. Es una fuerza de atracción
energía cinética que requieren las moléculas en el estado que se manifiesta en la superficie de un líquido, debido a
líquido y poder vencer su mutua atracción. El calor de la atracción que sufren las moléculas de la superficie
evaporación del agua es también alto. hacia el seno (interior del líquido).

Las fuerzas que se encargan de la

tensión superficial son la adhesión
y la cohesión
 Propiedades disolventes del agua
Constante dieléctrica. es una medida de la
capacidad de un solvente de reducir las atracciones Hidratación. Es la capacidad que tienen las
electrostáticas entre iones disueltos. A mayor constante moléculas de agua para rodear a los iones. Las
dieléctrica del solvente, menor capacidad de los iones de moléculas de agua se orientan de acuerdo con la carga
asociarse entre sí. Esta gran capacidad para reducir las de los iones y se acomodan en capas concéntricas
fuerzas de atracción entre partículas con cargas opuestas alrededor del ión. Cabe aclarar que cuando el solvente
le ha valido el título de disolvente universal. no es el agua, recibe el nombre de solvatación.
 Propiedades disolventes del agua

Esferas de solvatación de las moléculas de agua

alrededor de los iones Na+ y Cl−
La solvatación del ion está vinculada a su tamaño y
a su densidad de carga, ya que de él depende la
cantidad de moléculas de disolvente que lo rodean.

Ejemplo 1: Iones de Sodio (Na⁺) vs. Cesio (Cs⁺)

Ejemplo 2: Iones de Calcio (Ca²⁺) vs. Magnesio (Mg²⁺)

Ejemplo 3: Iones de Aluminio (Al³⁺) vs. Litio (Li⁺)

 Tipos de enlaces

Interacciones no covalentes son por lo

Enlaces covalentes implican la
general electrostáticas; es decir, se producen
distribución compartida de electrones
entre el núcleo positivo de un átomo y las nubes
con superposición o mezcla de orbitales.
electrónicas negativas de otro átomo cercano.
 Tipos de enlaces
Figura. Fuerza relativa de los enlaces en
las moléculas biológicas.
Enlace covalente

Enlace de hidrogeno Los

enlaces de hidrógeno son un tipo
de fuerza electrostática.

Radio de van der Waals de

un átomo aislado es la distancia
desde su núcleo hasta su superficie
electrónica efectiva.
 Tipos de enlaces
Figura. Fuerza relativa de los enlaces en
las moléculas biológicas.
Interacciones intermoleculares no covalentes
 Fuerzas coulombianas

Ácido glutámico se
ioniza a pH fisiológico
Lisina se ioniza
a pH fisiológico
NOTA: Pocas veces se forman puentes salinos estables
entre biomoléculas en presencia de agua, debido a que se
prefiere la hidratación de los iones.
Ión-ión o par iónico.
La mayoría de los puentes salinos de las biomoléculas se
produce en depresiones relativamente exentas de agua o
en las interfaces de biomoléculas donde el agua está
Ión-dipolo.
+ excluida.
 Fuerzas de van der Waals

Interacciones dipolo-dipolo.
Interacciones Keesom
Energía aproximada de 9 kJ · mol–1

Interacciones dipolo-dipolo inducido.

Interacciones Debye

Interacciones dipolo inducido-dipolo inducido.

Interacciones de London
Energía aproximada de 0,3 kJ · mol–1
 Agua estructurada
Representación esquemática del agua estructurada
sobre la superficie de una macromolécula polar.

Figura. Porción de una célula de Dictyostelium (ameba)

visualizada por tomografía crioelectrónica Las estructuras
rojas son filamentos de la proteína actina; ribosomas y otros
complejos macromoleculares se colorean en verde; las
membranas tienen tono azul.
 Efecto hidrófobo

¿Por qué es termodinámicamente

dodecano (un alcano C12)
desfavorable disolver una sustancia
hidrófoba en agua?

Esta restricción sobre la estructura del agua

representa una pérdida de entropía en el
Efecto hidrofóbico o solvofóbico sistema.

Química supramolecular
 Autoensamblaje molecular

Las moléculas anfifílicas experimentan tanto

interacciones hidrófilas como el efecto hidrófobo.

Micela formada por moléculas anfifílicas.

 Autoensamblaje molecular
Concentración Micelar Crítica (CMC)
 Autoensamblaje molecular
El cambio de energía libre que conlleva la
disolución de un soluto apolar en agua es,
por tanto, desfavorable:
ΔG = ΔH - TΔS

Una bicapa lipídica es una barrera

contra la difusión
El costo energético de transferir un grupo polar
hidratado a través de las colas de lípido, no polares,
es demasiado alto. (En contraste, pequeñas
moléculas no polares como O2 pueden pasar a
Bicapa lipídica. través de la bicapa con relativa facilidad.)

Liposomas.
 Autoensamblaje molecular

Composición iónica del líquido intracelular y extracelular

Mimetizadores de membrana
Una barrera del tipo de bicapas
puede mantener concentraciones
específicas de iones o moléculas
pequeñas, aunque las
concentraciones externas de estas
sustancias sean muy distintas.

Sudor y ejercicio
 Presión osmótica
Ósmosis es el paso espontáneo de moléculas de disolvente a través de una membrana
semipermeable que separa una disolución con menor concentración de soluto de una disolución
con mayor concentración.

Presión osmótica
Con el tiempo el agua se difunde
desde el lado A (más diluido) al lado B
(más concentrado). La presión
osmótica detiene el flujo neto de agua
a través de la membrana.
 Presión osmótica
El efecto de la concentración de soluto sobre
las propiedades coligativas del agua es
independiente de las propiedades químicas
del soluto; depende únicamente del número
de partículas de soluto (moléculas, iones) en
una determinada cantidad de agua.

La presión osmótica (π), medida como la fuerza

necesaria para oponerse al movimiento del agua
viene dado por la ecuación de van’t Hoff

Osmosis y medida de la presión osmótica

27
 Presión osmótica
R es la constante de los gases

T es la temperatura absoluta.

ic es la osmolaridad de la disolución, el
producto del factor de van’t Hoff (i), que es una
medida del grado de disociación del soluto.

Para disoluciones de varios solutos

𝝅 = 𝑹𝑻 (𝒊𝟏 𝑪𝟏 + 𝒊𝟐 𝑪𝟐 +….+ 𝒊𝒏 𝑪𝒏 )
28
 La ósmosis
el movimiento de agua a través de una membra semipermeable
impulsado por diferencias en la presión osmótica, es un factor muy
importante en la vida de la mayoría de las células.

Solución Isotónicas Soluciones hipotónica Soluciones hipertónica

29
 La ósmosis
Puesto que el efecto de los solutos en la osmolaridad Glucógeno
depende del número de partículas disueltas, no de su
masa, las macromoléculas (proteínas, ácidos nucleicos,
polisacáridos) tienen un efecto mucho menor en la
osmolaridad de una disolución que la que tendría una
misma masa de sus componentes monoméricos.

Por ejemplo, un gramo de un polisacárido compuesto

por 1.000 unidades de glucosa tiene el mismo efecto en
la osmolaridad que un miligramo de glucosa.

30
 Electrolitos
Las principales alteraciones en la composición del plasma.
2. En los niveles séricos de sodio: hipernatremia o hiponatremia.
3. En los niveles séricos de potasio: hiperkalemia o hipokalemia.

Sodio (Na)
•Adultos: de 136 a 145 mEq/l
Potasio (K)
•Adultos: de 3.5 a 5 mEq/l

PROBLEMA
Un paciente de 72 kg de masa corporal ha perdido el 5% de su peso corporal debido a la diarrea.
Un análisis de electrolitos encuentra: 2,8 mEq/L de potasio. Cuál es el procedimiento para reponer
las pérdidas (déficit) de potasio si se cuenta con ampollas de 10 mL KCl al 20 mEq y 500 ml de
solución salina hipotónica.
Determinar cuántos mOsm/L de electrolitos ha perdido el paciente.
 Ionización del agua
Puesto que la ionización reversible es crucial para el papel del agua en la
función celular, el grado de ionización del agua se puede expresar en
términos cuantitativos.

donde Keq es la constante de equilibrio de la reacción.

 Relación entre [H+] y [OH–].

La escala de pH puede utilizarse para

determinar la concentración de [H+]:

El pH afecta la estructura y actividad de macromoléculas

biológicas; el pH de la sangre y de la orina se utiliza por ejemplo
para diagnosticar enfermedades.
 Ácidos, bases y pH
Un valor de pK describe la tendencia de un ácido a ionizarse

pH normal de la sangre (7,4). Un estado

inferior se denomina acidosis si es
superior al normal se denomina alcalosis.

34
 Ácidos débiles
Por ejemplo, el ácido acético se ioniza en parte, o dona sólo algunos de sus protones al agua:

La constante de disociación del ácido acético es 1.74 10–5.

A mayor Ka, mayor probabilidad de que el ácido se ionice.

A mayor Ka de un ácido, menor su pK y mayor su “fuerza” como ácido

 Ácidos débiles
El pH de una solución y su relación con el pK

Ecuación
Henderson-Hasselbalch.
 Amortiguadores

Los amortiguadores consisten en ácidos débiles y sus bases

conjugadas. Una solución amortiguada puede oponerse a cambios de pH
porque se establece un equilibrio entre los componentes del amortiguador.
 Capacidad amortiguadora

La capacidad depende de dos factores:

(1) la concentración del par ácido-base conjugada.
(2) el cociente de sus concentraciones.

Los amortiguadores más eficaces son

aquellos que contienen concentraciones
iguales de ambos componentes, o que su
pH es igual a su pKa.
Capacidad amortiguadora

Titulación de ácido fosfórico con NaOH.

El ácido fosfórico es un ácido poliprótico
que libera tres protones de forma
secuencial cuando se valora con NaOH.
 Amortiguadores fisiológicos
El sistema amortiguador más importante incluye CO2 (que en
Tampón bicarbonato sí es un producto del metabolismo) en el plasma sanguíneo.

El pK para este proceso es de 6.1

• La concentración de CO2 se mantiene baja, y es regulada mediante

cambios en la frecuencia respiratoria.
• La concentración de bicarbonato permanece elevada porque los riñones
excretan H+.

La proporción de HCO3− y CO2 permanece inalterada

Amortiguadores fisiológicos
Amortiguadores fisiológicos