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Aspergillus: Memoire de Fin D'Etude

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‫الجوهىريت الجسائريت الذيوقراطيت الشعبيت‬ N° série

République Algérienne Démocratique et Populaire


‫وزارة التعلين العبلي و البحث العلوي‬
Ministère de l’Enseignement Supérieur et de la Recherche Scientifique
‫جبهعت الشهيذ حوت لخضر الىادي‬
Université Echahid Hamma Lakhdar El -OUED
‫كليت علىم الطبيعت و الحيبة‬
Faculté des Sciences de la Nature et de la Vie
‫قسن البيىلىجيب الخلىيت و الجسيئيت‬
Département de Biologie Cellulaire et Moléculaire

MEMOIRE DE FIN D’ETUDE

En vue de l'obtention du diplôme de Master Académique en Sciences


Biologiques
Spécialité: Toxicologie
THEME

Détermination des mycotoxines


d'Aspergillus: caractérisation et réduction
de la toxicité
Présenté Par :
Melle BEN BORDI Intissar
Melle OUBIRI Feriel

Devant le jury composé de :


Président : Mme LOUAFI Hayet M.A.A, Université d’El Oued.
me
Examinateurs : M BOUKHARI Dalel M.A.A, Université d’El Oued.
Promoteur : Mr LAICHE Ammar Touhami M.C.B, Université d’El Oued

Promotion: Juin/ 2019


Dédicaces

Je remercie, tout d’abord, Dieu tout puissant, pour

avoir guidé mes pas vers un avenir inchaallah prometteur.

Je dédie ce modeste travail à mes chers parents pour

leur encouragement et leur soutien moral.

A mes belles sœurs Djihad, Karima , Aroua et mes frère

Ahmed Tedjani ; Mohammed Ziad .

Et le chèr ; mon neveu Mohammed Racime

A mes enseignants ainsi qu’à tous les étudiants de ma

promotion.

A tous mes amies et tous ceux qui j’aime.

Feriel
Dédicaces

A ma mère et mon père pour leurs sacrifices

A mes sœurs AYA et AHMED ,et AYUOB et


ACHRAF et IHABE

A tout la famille BENBORDI ET ANAD

A touts mes amis (es) sans exception

Intissar
REMERCIEMENTS

En premier lieu nous tenons à remercier ALLAH précieux pour

nous avoir aidés à réaliser ce travail. Nous remercions notre

promoteur M. LAICHE Ammar Touhami pour l’honneur qu’il nous a

fait en dirigeant ce travail, pour ses aides, ses conseils, tout au long

de l’élaboration de ce modeste travail.

Nous remercie également les membres du jury d'avoir accepté de

jurer ce travail; Mme. LOUFI Hayet en tant que présidente et Mme.

BOUKHARI Dalel en tant qu'examinatrice.

En fin, que tous ceux qui ont participé de près ou de loin à la

réalisation de ce travail, trouveront ici l’expression de notre profonde

gratitude.

Résumé
Sommaire
Dédicaces ................................................................................................... i

REMERCIEMENTS ...................................................................................... iii


Résumé
Sommaire .................................................................................................... iv
Listes des tableaux..................................................................................... vii
Listes des figures ...................................................................................... viii
Listes D'abréviations ................................................................................... x
Introduction ................................................................................................. 0
Chapitre I : synthèse bibliographique....................................................... 3
1-Les moisissures .......................................................................................................... 4
1.1 - Généralités .................................................................................................... 4
1.2- Cycle de vie ................................................................................................... 5
1.3- Conditions de croissance: .............................................................................. 6
1.3.1- Eléments nutritifs: .................................................................................. 6
1.3.2- Facteurs physicochimiques:.................................................................... 6
1.4 - Modes de reproduction ................................................................................. 7
2-Aspergillus:................................................................................................................ 8
2.1-Systématique................................................................................................... 8
2.2- Principales espèces: ....................................................................................... 9
3 -Les mycotoxines: .................................................................................................... 12
3.1- Généralité sur les mycotoxines :.................................................................. 12
3.2- Les principales mycotoxines: ...................................................................... 12
a- Les aflatoxines: ........................................................................................... 13
b- L’ochratoxine A: ........................................................................................ 13
c- Les fumonisines: ......................................................................................... 14
d- Les trichothécènes: ..................................................................................... 15
e- La zéaralénone: ........................................................................................... 16
3.3-Biosynthèse des mycotoxines :..................................................................... 16
3.4-Facteurs influençant la production des mycotoxines.................................... 17
3.4.1-Champignons toxinogènes..................................................................... 17

iv
3.4.2-Facteurs environnementaux ................................................................... 17
3.4.3-Influence du substrat.............................................................................. 18
3.4.4-Autres facteurs ....................................................................................... 18
3.5. Effets des mycotoxines: ............................................................................... 18
3.6-Normes et aspects Réglementaire des Mycotoxines: ................................... 20

Chapitre II: Matériel et Méthodes .......................................................... 21


1- Matériel................................................................................................................... 22
1.1-Matériel de laboratoire ................................................................................. 22
1.2- Les Milieux de culture ................................................................................. 22
1.3- les bouillons: ................................................................................................ 22
1.4. Matériel végétal : ......................................................................................... 22
1.5-Souches microbienne : .................................................................................. 23
2-Méthodes ................................................................................................................. 23
2.1- Isolement des moisissures (Méthodes de dilution) :.................................... 23
2.2- Mise en évidence des moisissures (méthode directe d’ulster): ................... 24
2.3- Purification de la souche ............................................................................. 24
2.4- Identification des souches........................................................................... 24
2.4.1- Identification macroscopique ............................................................... 25
2.4.2- Identification microscopique ................................................................ 25
2.4.3- Identification des genres par la technique de scotch ............................ 25
2.5- Critères d’identification des moisissures : ................................................... 26
2.6-Activités antimicrobiennes: .......................................................................... 26
2.6.1- Préparation des microorganismes d’essai: ............................................ 26
2.6.2- Ensemencement: ................................................................................... 27
2.7- Fermentation et extraction des toxines: ....................................................... 27
2.8-Méthode de diffusion sur disques : ........................................................... 30
2.9-Réductions de la toxicité des souches fongiques isolées .............................. 31

Chapitre III : Résultats et Discussion ..................................................... 32


1.Isolement :................................................................................................................ 33
1.1 Méthode de dilution: ..................................................................................... 33
1.2- Méthode d’ulster:......................................................................................... 33
2- Identification des souches...................................................................................... 34
3-Détermination de l’activité antimicrobienne : ......................................................... 38
4- Réductions de la toxicité des souches fongiques isolées: ....................................... 42

Conclusion .................................................................................................. 45
Référence bibliographique
Annexes
Listes des tableaux

N° Titre page
principaux genres de moisissures et leurs mycotoxines
Tableau 01 12
associées(GHERRAS S, El HIMER N. 2017).
Principaux facteurs influençant la production des mycotoxines
Tableau 02 17
à différentes étapes dela chaîne alimentaire
Effets des principales mycotoxines sur l’homme et
Tableau 03 mécanismes d’action cellulaires et moléculaires identifiés 19
(GHERRAS et EL2017).
Qualités maximales admissibles d’aflatoxine(HIGHLEY et
Tableau 04 20
al., 1994).
Tableau 05 Souches tests (les bactéries pathogènes et la levure ). 23
Souche obteneus dans les graines contaminées de blé et
Tableau 06 34
d’arachide par la méthode d’ulster Méthode de dilution.
Tableau 07 Différents caractères macroscopique des isolats fongiques. 36
Comparaison des extraits d’acétate d’éthyle et
Tableau 08 chloroformiques et leurs effets sur chaque de 41
microorganismes pathogènes
résultat du test d’antagonisme des bactéries lactique 1 et2 , sur
Tableau 09 42
les souches d'aspergillus
Listes des figures

N° Titre Page
Quelques champignons filamenteux (TOUATI R, AMOR-
Figure01 4
CHELIHI L.2016).
Figure02 Cycle de vie des champignons (Site web, 2019) 5

Figure03 Schéma de la reproduction des moisissures(Site web,2020) 7


Principaux caractères morphologiques des Aspergillus
Figure04 8
(RAPER et FENNELL, 1965).
Aspect micro et macroscopique d'Aspergillus flavus (TABUC
Figure05 9
,2007)
Aspect micro et macroscopique d'Aspergillus fumigatus
Figure06 10
(TABUC ,2007)
Aspect micro et macroscopique d'Aspergillus niger (TABUC
Figure07 10
,2007)
Aspect micro et macroscopique d' Aspergillus ochraceus
Figure08 11
(Raperet al., 1965)
Culture de 7 jours sur gélose au malt à 25 oC d'Aspergillus
Figure09 11
oryzae (TABUC ,2007).
Structure de l’aflatoxine B1 et de la
Figure10 31
stérigmatocystine(GHERRAS S, El HIMER N. 2017)
Structure chimique de l’ochratoxine A (OTA) (GHERRASS,
Figure11 14
El HIMERN 2017)
Structure de la fumonisine B1 (GHERRAS S, El HIMER N.
Figure12 15
2017)
Structure générale semi développée des trichothécènes (IPCS,
Figure13 15
1990).
Structure chimique de la zéaralènone (WILLIE et
Figure14 16
MOREHOUSE, 1977)
Biosynthèse des mycotoxines (LEYRAL et VIERLING,
Figure15 16
2007)
Figure16 L’échantillons utilisés ( blé et arachide) 24
Figure17 Isolement des moisissures par la Méthode de dilution 25
Méthode d’identification microscopique des moisissures par
Figure18 26
la technique de Scotch
Figure19 Préparation des microorganismes d’essai 28

Figure20 Fermentation des champignons et filtration de surnageant. 29


L’extraction de mycotoxine par l’acétate d’éthyle et le
Figure21 29
chloroforme
Fermentation et extraction des champignons endophytes avec
Figure22 30
l’acétate d’éthyleet le chloroforme
Figure23 Technique de diffusion sur disques 31
Colonies obtenues dans les graines contaminées d’arachide
Figure24 34
par la méthode de dilution.
Colonies obtenues dans les graines contaminées de blé et
Figure25 35
d’arachide par la méthode d’ulster
Effet de chaque extrait fongique obtenu par l’acétate d’éthyle
Figure26 40
et le chloroforme sur E. coli
Effet de chaque extrait fongique obtenu par l’acétate d’éthyle
Figure27 41
et le chloroforme sur Klepsilla sp.
Effet de chaque extrait fongique obtenu par l’acétate d’éthyle
Figure28 41
et le chloroforme sur Listeria sp.
Effet de chaque extrait fongique obtenu par l’acétate d’éthyle
Figure29 42
et le chloroforme sur Candida sp
Quelques zones d’inhibition de différentes bactéries lactiques
Figure30 44
testés sur les isolats d'Aspergillus.
Variation de zone d’inhibition entre différentes souches
Figure31 45
d'Aspergillus et SN B1.
Variation de zone d’inhibition entre différentes souches
Figure32 46
d'Aspergillus et SN B2
Listes D'abréviations

 A: Aspergillus
 Ac: acétate d’éthyle-
 B1: Lactococcuslactissubsp. Lactis
 B2: Streptococcus thermophilus
 Chl: chloroforme
 CYP 450: cytochromes P450
 CDA : CzapekDox Agar
 DMSO: dimethylsulfoxide
 DON: Trichothécéne: (déoxynyvalénol , toxine T-2 ,diacétoxyscirpénol ,
nivalénol)
 FAO: Organisation des Nations unies pour l’alimentation et l’agriculture.
 K.p: klebsiellapneumoniaATCC 700603
 LMR: limite, maximale de résidus.
 Lis.inno : listeria innocuaCLIP 74915
 MH : Muller Hinton
 M3: Candida albicansIPA 200
 OMS: Organisation mondiale de la santé
 OTA: Ochratoxine A
 P: Penicillium-
 ZEA: La zéaralénone
Introduction

Introduction
Introduction

Introduction
Les moisissures sont des champignons microscopiques qui ont des actions bénéfiques
mais aussi néfastes pour l’homme. Plusieurs moisissures, notamment les genres Aspergillus,
Fusarium, Penicillium, sont connus pour être des contaminants des produits agricoles et/ou
pour leur capacité à produire des métabolites toxiques :mycotoxines (CAHAGNIER et al.,
1998).

Ces moisissures sont exploitées pour la production d’enzymes (protéase et pectinase


produites par A. niger), d’acides organiques (acide citrique et gluconique par des espèces
d’Aspergillus et Penicillium), de médicaments (production de pénicilline par P. chrysogenum,
de céphalosporine par Cephalosporiumacremonium)( Perry et al., 2004).

Environ 22%des antibiotiques identifiés et 40% des enzymes produits industriellement


sont élaborés par les champignons filamenteux (STROHL, 1997). Outre de ces intérêts
bénéfiques, les champignons sont capables de provoquer également d’importants dégâts,
notamment dans le domaine agronomique, la contamination fongique des denrées
alimentaires, destinées à l’homme ou à l’animal, est le principal dommage qui va entraîner de
nombreux problèmes (PITT et al., 2000).

Or, la présence indésirable des moisissures modifient l’aspect des produits


alimentaires, dû notamment à la production de pigments, comme par exemple un pigment
foncé, la mélanine (BULTER etDAY, 1998). Le développement de ces champignons sur les
aliments peut leur donner des odeurs de moisissures. Il y a donc une réduction quantitative et
qualitative de la valeur alimentaire de la denrée et une baisse du rendement des récoltes.

Les métabolites produits par ces champignons lors de leur croissance sur l’aliment
sont aussi des éléments majeurs dans l’altération des denrées alimentaires. Des manifestations
dans la qualité organoleptique (en modifiant le goût de la denrée par exemple) mais aussi de
graves problèmes sanitaires surgissent, c’est le risque d'intoxication due à la présence
demycotoxines. Mais il faut signaler que la contamination des moisissures sur les aliments ne
signifie pas obligatoirement la présence de mycotoxines.
L’entrée des mycotoxines dans la chaîne alimentaire de l’homme s’effectue soit par
des denrées consommées directement (arachides, pistaches, amandes…); soit indirectement
par des produits dérivés (par ex. farine de céréales) à partir desquels sont élaborés des
aliments finis (par ex. produits issus de la panification, de la biscuiterie, céréales pour petit-
déjeuner) (REBOUX, 2006).

3
Introduction

Les troubles causées par ces substances se manifestent par des syndromes variés, il
peut y avoir un effet spécifique toxique sur un organe bien déterminé, cependant la plupart
provoquent des lésions graves d'un seul tissu ou de plusieurs tissus, mais c'est surtout le foie
qui est le plus touché. D'autres effets peuvent apparaitre tels les gastro-entérites, les
hémorragies et les paralysies etc.
Comme la présence des moisissures dans les récoltes est un phénomène naturel, il
serait impossible d’éliminer toute trace de mycotoxines des produits alimentaires. Cependant
il est possible de minimiser la contamination en prenant des précautions au niveau de
l’entreposage et la manutention des récoltes après la moisson et en inspectant rigoureusement
les produits avant la mise sur le marché. La réduction des taux des mycotoxines relève à la
fois du rôle des agriculteurs, des commerçants et des industriels (ABDELLAH, 2004).

L’objectif de notre travail est la recherche des mycotoxines à partir des genres
d'Aspergillus, isolés à partir d'arachide et blé contaminés. En effet, le travail s’articule sur :

 L’isolement, la purification et l’identification de souches fongiques productrices des


mycotoxines.
 L’extraction des mycotoxines .
 Etudes de l'activité antimicrobienne des souches isolées.
 Réductions de la toxicité des souches fongiques isolées.

2
Chapitre I : synthèse bibliographique

Chapitre I
Synthèse bibliographique
Chapitre I Synthèse bibliographique

1-Les moisissures
1.1 - Généralités
Les moisissures sont des organismes eucaryotes pluricellulaires capables de se
développer sur divers substrats. Elles sont hétérotrophes vis-à-vis du carbone et dégradent les
matières organiques en les transformant en matières minérales qu’elles assimilent par
absorption. Les moisissures ont un rôle capital dans le cycle de la matière.
En effet en dégradant les matières organiques, elles participent à la formation de
l’humus ; la couche supérieure du sol. Elles sont omniprésentes dans notre environnement
(sol, eau, plantes...) et sont véhiculées par l'air, les matières premières, les hommes et les
animaux. Il ya environ 99 000 espèces fongiques ont été décrites mais on estime que leur
nombre total pourrait atteindre 5 millions (KUPFERSCHMIDT, 2012).

Figure01: Quelques champignons filamenteux (TOUATI R, AMOR-CHELIHI L.2016).

Les moisissures sont des champignons filamenteux hétérotrophes qui ont des actions
bénéfiques et parfois néfastes pour l’homme. Plusieurs moisissures notamment les genres
Aspergillus, Penicillium et Fusariumsont connues pour être des contaminants des produits

4
Chapitre I Synthèse bibliographique

agricoles et/ou pour leur capacité à produire des métabolites secondaires toxiques (MEYER
et al. ,2004).
Les moisissures toxinogènes peuvent se développer sous tous les climats, sur tous les
supports solides ou liquides dès l’instant où les conditions nécessaires à la croissance décrites
précédemment sont réunies (PATERSON, 2006).
1.2- Cycle de vie
Le cycle de vie des moisissures est illustré par 4 principales étapes (Figure2) :
germination, développement, reproduction et dormance/latence. Le cycle de vie des
moisissures en milieu intérieur débute lorsqu’une spore se dépose sur une surface lui offrant
les conditions nécessaires à sa croissance. En fait, la germination se déclenchera par la
présence d’eau combinée ou non à certains facteurs très spécifiques comme l’intensité de la
lumineuse, certaines températures ou types d’éléments nutritifs. La spore germera alors et
donnera naissance à un premier filament non différencié, appelé hyphe, qui s’allongera pour
former un ensemble appelé mycélium. Cet ensemble de filaments, plus ou moins ramifiés,
constitue le thalle des champignons. En présence de conditions favorables à la sporulation, le
mycélium donnera naissance à des structures plus spécialisées, qui produiront des spores
asexuées (conidies) ou, plus rarement, des spores sexuées. Chaque moisissure produit un très
grand nombre de spores dont l’ensemble, se présentent très souvent sous un aspect poudreux
et coloré à la surface de la moisissure. La taille, la forme et la couleur des spores de
moisissures varient grandement d’une espèce à l’autre. Par contre, en microscopie, toutes les
spores d’une même espèce sont de couleur, de dimension et de forme relativement constante
ce qui, dans bien des cas, constitue un élément d’identification taxonomique(TOUATI R,
AMOR-CHELIHI L.2016).

Figure02: Cycle de vie des champignons (Site web, 2019).

5
Chapitre I Synthèse bibliographique

1.3- Conditions de croissance:


1.3.1- Eléments nutritifs:
Le Carbone et l’azote sont les éléments nutritifs les plus importants pour les
moisissures, avec la présence de quelques ions minéraux (Potassium, Phosphore,
Magnésium…)en très faibles quantités(GHERRAS S, El HIMER N. 2017).
1.3.2- Facteurs physicochimiques:
Les facteurs physicochimiques ont une grande influence sur le développement
desmoisissures ainsi que sur la germination, nous citons successivement quelquesparamètres
importants.
a-Température:
La température joue un rôle prépondérant dans la croissance mycélienne, elle
intervient également dans la sporulation et la germination des spores (BOURGEOIS,1989).
La plupart des moisissures sont mésophiles avec des optima de croissance de25 à 35°C
(BOTTON et al.,1999).
Quelques espèces sont thermotolérantes ou thermophiles et peuvent croître à haute
température au-dessus de 50°C avec une croissance optimale aux environ de 20à25°C,
Aspergillus fumigatusen est un bon exemple (NICKLIN etal.,2000).D’autres sont des
psychrophiles ou psychrotolérantes se développant à bassestempératures (entre -5 et 10°C)
tels que Helicostylumpulchrum, Chrysosporiumpannorumet Cladosporiumherbarum, ces
espèces peuvent survivre même à -60°C,on les rencontre dans des entrepôts frigorifiques
(DAVET, 1996 ; BOTTON et al.,1999).
b-Humidité:
Elle est optimale entre 0,78 et 0,84 pour Aspergillus flavus .C'est le facteur le plus
important et commun à toutes les moisissures (MORCEAU., 1974).
c-pH:
Le développement d’un champignon sur un substrat donné est liée à des propriétés
inhérentes au champignon telles que la capacité a produire des métabolites (enzyme,
pigments, synthèse de toxine) .La tolérance au pH est assez grande pH = 2 à
7,5(MELETIADIS et al ., 2001).
d-Oxygène:
La plupart des moisissures sont aérobies et exigent une bonne oxygénation et un taux
de CO2 inférieur ou égal à 10% cependant, certains tolèrent des quantités relativement faible
d’oxygène et peuvent même se développer en anaérobiose(MELETIADIS et al., 2001).

6
Chapitre I Synthèse bibliographique

e-Lumière
Les radiations du spectre visible (380 – 720) n’ont en général pas d’action sur la
croissance végétative des champignons mais peuvent agir sur la sporulation. La plupart des
moisissures n’exigent pas de lumière pour leur croissance, ni pour la germination de leurs
spores (BOTTON et al.,1999).
1.4 - Modes de reproduction
La plupart des champignons possèdent deux modalités de reproduction: la reproduction
asexuée (imparfaite ou végétative), et la reproduction sexuée. La reproduction végétative des
champignons résultant d'une fragmentation du thalle ou d'une sporulation, représente le plus
souvent la principale source de dissémination du parasite lors de la fragmentation du thalle
.Les ramifications se séparent les unesdes autres à la suite de la dégénérescence de la partie
basale d'hyphe dont elles dérivent. Il est rare que l’ensemble du cytoplasme du thalle se
transforme en sporeslors de la multiplication végétative.
La reproduction sexuée des champignons comporte une plasmogamie (fusion des
cytoplasmes de deux gamètes) suivie d'une caryogamie (fusion des noyauxcorrespondants) et
d'une méiose (division réductionnelle). Les types de spores sexuéessont au nombre de quatre :
l’oospore, la zygospore, l’ascospore et la basidiospore(STANIER et al., 1966). Lemycélium
bien que contenant un cytoplasme mobile, et lui-même incapable de sedéplacer à cause de la
rigidité de ses parois. On parle aussi communément desmoisissures pour désigner les
champignons chez lesquels les organes de fructificationontune structure nettement
filamenteuse. Elles s'opposent aux champignonscomestibles ; dans les corps fructifiant sont
charnus (LECLERC et al., 1983).

Figure 03: Schéma de la reproduction des moisissures(Site web,2020).

7
Chapitre I Synthèse bibliographique

2-Aspergillus:
C’est un genre appartenant à la classe des Ascomycètes. Le thalle, hyalin ou coloré,
présente un mycélium cloisonné portant de nombreux conidiophores dressés, terminés en
vésicule (Figue4) (Raper et Fennell, 1965)

Figure 04 : Principaux caractères morphologiques des Aspergillus (RAPER et


FENNELL, 1965).
2.1-Systématique
Les champignons du genre Aspergillus sont des moisissures, autrement dit des
champignons microscopiques filamenteux, qui vivent en saprobiose dans de très nombreux
écosystèmes.
les Aspergillus appartiennent à l’embranchement des Ascomycota qui regroupe des
champignons à mycélium cloisonné (champignons septomycètes) présentant une reproduction
sexuée avec formation d’asques contenant des ascospores.
Les champignons du genre Aspergillus sont inclus dans le sous-embranchement des
Pezizomycotina, la classe des Eurotiomycetes, la sous-classe des Eurotiomycetidae, et l’ordre
des Eurotiales qui est caractérisé par des asques contenus dans des ascocarpes de type
cléistothèce ou plus rarement gymnothèce, et par une multiplication asexuée par phialides
produisant des phialoconidies (HIBBETT et al., 2007 ; BENNETT, 2010).

8
Chapitre I Synthèse bibliographique

Plus de 300 espèces appartenant au genre Aspergillus ont été décrites. Les critères
d’identification sont principalement morphologiques. Cependant, l’application des outils de
caractérisation moléculaire a montré que cette identification strictement phénotypique pouvait
conduire à des erreurs d’identification et que certains regroupements d’espèces n’avaient pas
de fondement (BALAJEE et al., 2006).
Pour tenir compte des résultats de caractérisation moléculaire, des « sous-genres »
appelées « sections » ont été créés. Les sections regroupent toutes les espèces
morphologiquement semblables mais génétiquement différentes. Les moisissures du genre
Aspergillus sont actuellement réparties dans 6 sections principales : Usti, Flavi, Nigri,
Circumdati, Clavati et Fumigati.
La section Fumigati regroupe 33 espèces (23 du genre Neosartorya et 10 du genre
Aspergillus). Elle inclut Aspergillus fumigatus ainsi que Aspergillus lentulus, une espèce
récemment identifiée grâce à l’analyse de séquences partielles des gènes de la ß-tubuline et de
la calmoduline (BALAJEE et al., 2005).
Parmi les espèces responsables d’aspergillose chez l’homme et chez les oiseaux,
Aspergillus fumigatus est la plus communément rencontrée (KUNKLE, 2003). Les espèces
Aspergillus flavus et Aspergillus niger ainsi qu’Aspergillus nidulanset Aspergillus terreus
sont incriminées comme agents pathogènes possibles mais dans une moindre mesure en zone
tempérée (JONES et OROSZ, 2000).
2.2- Principales espèces:
Aspergillus flavus : le champignon se développe rapidement sur les milieux
classiques
(géloses au malt et Sabouraud) à 22-25°C. La température optimale de croissance est
37°C. Sur le milieu de culture A. flavusforme des colonies duveteuses à poudreuses, d’abord
blanches, puis jaune, puis vert-jaune. Le revers peut être incolore, rosâtre ou brun-rouge foncé
pour les souches productrices de sclérotes (Figure 5) (TABUC ,2007)

Figure 05 : Aspect micro et macroscopique d'Aspergillus flavus (TABUC ,2007).

9
Chapitre I Synthèse bibliographique

Aspergillus fumigatus : on distingue un mycélium à croissance rapide sur les milieux


de culture classiques à 37°C. A. fumigatusest une espèce thermotolérante dont latempérature
de croissance est comprise entre 15 et 48°C ; la température optimale étant située aux
alentours de 40 et 42°C. Cette espèce peut se développer jusqu’à 57°C (Morin, 1994).
A.fumigatusforme des colonies d’abord blanches, puis bleu-vertes et enfin vert foncé à gris
noirâtre. Le revers peut être incolore, jaune, vert ou brun-rouge suivant les souches (Figure 6).

Figure 06 : Aspect micro et macroscopique d'Aspergillus fumigatus(TABUC ,2007).

Aspergillus niger: ce champignon pousse rapidement (2-3 jours) sur les milieux
deculture classiques (géloses au malt et Sabouraud). La température optimale de croissance
varie généralement entre 25 et 30°C, mais A. nigerpeut se développer jusqu’à 42°C. Les
colonies d’A. nigersont granuleuses, blanches au début, puis jaunes et, à maturité, elles
deviennent noires. Le revers des colonies est incolore ou jaune pâle. Sur le milieu Czapek, A.
nigerforme des colonies à mycélium blanc ou jaune, et revers souvent incolore (Figure 7)
((TABUC ,2007).

Figure 07 : Aspect micro et macroscopique d'Aspergillus niger (TABUC ,2007).

31
Chapitre I Synthèse bibliographique

Aspergillus ochraceus : ce champignon pousse rapidement (2-3 jours) sur les milieux

de culture classiques à une température de 25 à 30°C. Les colonies d’A. ochraceussont


poudreuses ou granuleuses, blanches au début, puis jaunes ou ocre-jaunes à chamois. Le
revers de colonies est incolore au jaune pâle (Figure 8) (RAPER et al., 1965).

Figure 08:Aspect micro et macroscopique d' Aspergillus ochraceus (TABUC ,2007).

Aspergillus oryzae : il se développe rapidement sur les milieux classiques (géloses


aumalt et Sabouraud) à 22-25°C. Sur milieu de culture A. oryzaeforme des colonies
duveteuses à poudreuses, d’abord de couleur blanche, puis jaune, et enfin vert-jaunâtre à vert
olive. Le revers peut être incolore ou jaunâtre (Figure 9).

Figure 09: Culture de 7 jours sur gélose au malt à 25 oC d'Aspergillus oryzae


(TABUC ,2007).

33
Chapitre I Synthèse bibliographique

3 -Les mycotoxines:
3.1- Généralité sur les mycotoxines :
Le therme mycotoxine dérive du grec « mycos », signifiant champignon et du latin
toxicum signifiant « poison ». Les mycotoxine sont des molécules capables, a de faible
concentration, d’induire un effet toxique (ROBOUX et al.,2006).
Ce sont des métabolites secondaires peu volatiles, élaborés par diverses moisissures
sous certaines conditions environnementales. A l’heure actuelle seules certaines espèces de
moisissures sont connue comme ayant la capacité de produire des toxines. Leur biosynthèse
est dépendante de plusieurs facteurs, dont la température, l’intensité lumineuse, le dioxyde de
carbone dans l’air, les éléments nutritifs disponibles et la présence et la présence d’autres
espèces en compétition (HENDEY et al., 1993).
Chaque mycotoxines n’est pas nécessairement spécifique à une moisissure donnée. La
gliotoxine, par exemple : peut aussi bien être produite par Aspergillus fumigatusque par
Trichodermaviridae. De même, une moisissure donnée peut produire plusieurs toxines :
Aspergillus fumigatus, agent étiologique de certaines atteintes pulmonaires, fabrique plus de
huit toxines différentes(MAHEUX, 1998).
Tableau 01: principaux genres de moisissures et leurs mycotoxines associées(GHERRAS
S, El HIMER N. 2017).
Espèce fongique productrice Mycotoxine associées
Gliotoxine , funagilline , acide helvolique , trypacidine ,
Aspergillus sp. fumitrémorgines , fumiquinazolines , aflatoxines ,
ochratoxines ,stérigmatocystine .
Alternariasp. Alternariol , acide , ténuazonique
Claviceps sp. Alcaloïde (ergotamine et dérivés)
Trichothécéne (déoxynyvalénol , toxine T-2
Fusariumsp. ,diacétoxyscirpénol , nivalénol ), zéralénone ,
fumonisines , fusarine ,moniliformine
Penicillium Ochratoxine A ,pénitrem , acide cyclopiazonique ,
patuline , citrinine

3.2- Les principales mycotoxines:


Les principales mycotoxines peuvent être produites par 5 types de champignons
:Aspergillus, Penicillium, Fusarium, Claviceps et Alternaria. Compte tenu de leurspropriétés
toxiqueschez l’homme et l’animal et de leur fréquence de contaminationdes matières
premières et desaliments, les mycotoxines les plus importantes sont lesaflatoxines,
l’ochratoxine A, lesfumonisines, les trichothécènes et la zéaralénone.( Behnas D ,Benayache
A.2015).

32
Chapitre I Synthèse bibliographique

a- Les aflatoxines:
Les aflatoxines sont des toxines produites par A. flavus(qui produit aussi del’aflatrem,
de l’acide cyclopiazonique et de l’acide aspergillique) et A. parasiticus. Les aflatoxines (B1,
B2, G1, G2, M1, M2) (Figure 10) sont reconnues comme étant les plus puissants cancérigènes
naturels. L’intoxication aiguë par les aflatoxines se traduit par des symptômes de dépression,
anorexie, diarrhée, ictère ou d’anémie, pouvant aller jusqu’à la mort (QUILLIEN, 2002).
Les aflatoxines apparaissent dans les noix (cacahuètes, noix du Brésil ...), les céréales,
les poivres séchés et de nombreux autres aliments d'origine végétale. On trouve l’aflatoxine M
dans le lait de vaches nourries de fourrage contaminé. Il s'agit en l'occurrence d'aflatoxine B
métabolisée (4-hydroxylée) (QUILLIEN, 2002).

Figure 10 : Structure de l’aflatoxine B1 et de la stérigmatocystine(GHERRAS S, El


HIMER N. 2017).

b- L’ochratoxine A:
La famille des ochratoxines comprend une dizaine de molécules connues,
maisl’ochratoxine A est le représentant le plus important (Figure11). Cette mycotoxine est
produite par différentes espèces de Penicillium (P. verrucosum, P. viridicatum…) et
d’Aspergillus (A. ochraceus…).
En effet, la température optimale de production de l’OTA par l’Aspergillus
ochraceusest de 28 °C, cette production étant fortement réduite à 15°C ou 37°C. Au contraire,
Penicillium viridicatumse développe et peut produire de l’OTA dans une gamme de
températures qui varie de 4 à 30°C.

Dans les régions froides, l'OTA est donc plutôt produite par des Penicillium, alors que
dans les régions chaudes, ce sont plutôt les Aspergillus qui la synthétisent (POHLAND
etal.,1992; VARGA et al., 1996).

31
Chapitre I Synthèse bibliographique

La toxicité de cette mycotoxine peut varier en fonction de l'espèce, du sexe, de la voie


d'administration (POHLAND et al., 1992).Chez l’homme, l’OTA est suspecte d’être
impliquée dans la néphropathie en démiquedes Balkans. Elle est classée dans le groupe 2B
des molécules cancérigènes chez l’animal est possiblement cancérigènes chez l’homme
(VRABCEVA et al., 2004).

Figure11: Structure chimique de l’ochratoxine A (OTA) (GHERRASS, El HIMERN


2017).
c- Les fumonisines:
Les fumonisines sont un groupe de mycotoxines caractérisées à la fin des années 80
etproduites par Fusariumverticilloides, une moisissure présente dans le monde entier
etfréquemment retrouvée sur le maïs. Plusieurs souches de F. verticilloidesisolées d’autres
substrats comme le sorgho et l’avoine produisent des quantités importantesde
fumonisines(AYALEW etal., 2006). Ces toxines peuvent aussi être produites par F.
proliferatumet F. nygamaiqui parasiteprincipalement le sorgho et le millet (NELSON et al.,
1992).On aaussi montré que les fumonisines peuvent être élaborées par F. oxysporumet
F.polyphialidicum ; A. alternatasp. Lycopersipeutsynthétiseraussi des fumonisines(ABBAS
etal., 1997).
Aujourd’hui la famille des fumonisines comprend 15 molécules
différentes.Lesfumonisines B1, B2 et B3 (Figure12) sont les plus répandues dans le
mondecomme des contaminants naturels des céréales.La toxicité des fumonisines est
caractérisée par l’apparition de signes cliniques trèsdifférents en fonction des espèces
(COLVIN etal., 1993).

34
Chapitre I Synthèse bibliographique

Figure12: Structure de la fumonisine B1 (GHERRAS S, El HIMER N. 2017).

d- Les trichothécènes:
C’est une famille composée d’environ 148 composés, tous produits par de nombre
uses espèces fongiques dont celles des genres Fusarium, Penicillium,
Cephalosporum,Myrothecium, Trichoderma et Stachybotrys. Les mycotoxines les
plusétudiées dans ce groupe sont le déoxynivalénol (DON), les toxines T-2 et HT-2(OMS,
1980).
La toxine DON est une vomitoxine qui contamine les céréales en particulier le blé,
l'orge, le maïs, le seigle, l'avoine, et le riz. L'occurrence de la toxine DON est associée
principalement avec F. graminarumetF. culmorum. La DON peut provoquer des effets
adverses après administration. L'administration d'une dose aiguë est caractérisée par deux
effets toxicologiques à savoir la perte de l'appétit et les vomissements(CREPPY, 2002).
Les toxines T-2 et HT-2 sont deux toxines produites sur les céréales (blé, orge,
maïs,riz, avoine…) et les produits à base de céréales. Elles sont produites par de nombreuses
espèces de Fusarium .La toxine T-2 est un inhibiteur potentiel de la synthèse protéique. Alors
que la toxine HT-2 a pour cible le système immunitaire(BOTTALICO, 1998).

Figure 13 : Structure générale semi développée des trichothécènes (IPCS, 1990).

35
Chapitre I Synthèse bibliographique

e- La zéaralénone:
La zéaralénone (ZEA) ou toxine F-2 est produite par les espèces appartenant au
genreFusarium, en particulier F. graminearum, F. semitectum, F. equiseti, F.crookwellense et
F. culmorum. Elle peut être également être synthétisée par F.tricinctum, F. oxysporum, F.
sporotrichoïdes et F. laterium. La production de cettemycotoxine est favorisée lorsque les
températures sont situées entre 10 et 15°C(ABBAS et al., 1988 ; TABUC, 2007).
La ZEA est une lactone de l’acide résorcyclique sans toxicité intrinsèque mais de
parsa similitude avec l’oestrogène (Figure 14). La principalemoisissure responsable de la
production de cette mycotoxine est Fusariumgraminearummême si d’autres champignons
sont capables de la produire. Sa répartition est mondiale, elle est présente dans l’ensilage, le
foin, le maïs ou d’autres céréales (WHITLOW etal., 2001).

Figure14: Structure chimique de la zéaralènone (WILLIE et MOREHOUSE, 1977).

3.3-Biosynthèse des mycotoxines :


Les mycotoxines sont produites par nombreuses moisissures dotées génétiquement d’un
pouvoir toxinogène. Elles doivent cependant croitre sur un substrat permettant l’expression du
pouvoir desécrétion des toxines de ces champignons (CHAPELAND-LECLERC Fet al.,
2005).

Figure 15:Biosynthèse des mycotoxines (LEYRAL et VIERLING, 2007).

36
Chapitre I Synthèse bibliographique

3.4-Facteurs influençant la production des mycotoxines


3.4.1-Champignons toxinogènes
Le type et la quantité de mycotoxine dépendent des espèces fongiques qui les
produisent(LACEY, 1986). Elles diffèrent dans leur caractère morphologique, génétique et
dans leurs places écologique. Les champignons toxinogènes peuvent être classés en deux
groupes principaux:
1- Les champignons de champs qui contaminent les produits agricoles avant ou pendant
la récolte, principalement Fusariumet Alternariamais aussi des Aspergillus dans le cas des
raisins.
2- Les champignons de stockage (par exemple les Penicillium et Aspergillus) qui
tendent à contaminer les denrées alimentaires pendant leur stockage(CHRISTENSEN, 1974).
3.4.2-Facteurs environnementaux
Les facteurs environnementaux affectant la production de mycotoxine sont d'origine
physique, chimique ou biologique (Mitchell et al., 2004). Cependant, ces facteurs agissent
rarement d'une façon indépendante, en effet leurs interactions sont habituellement plus
importantes que l’effet d’un facteur simple. Le tableau 2 présente quelques facteurs
environnementaux qui peuvent influencer la production de mycotoxine à différentes étapes de
la production (HESSELTINE, 1976).
Tableau 2: Principaux facteurs influençant la production des mycotoxines à différentes
étapes dela chaîne alimentaire
Pendant le
Facteur Au champ A la récolte Stockage

Physique
- Humidité + + +
Rapidité de séchage - + +
Ré humidification - + +
Humidité relative + + +
- température + + +
- damage mécanique + + +
- mélange de grains - + +

Chimique
- CO2 - - +
- O2 - - +
- nature du substrat + - +
- nutrition minérale + - +
- - +

Biologique
- stress de plante + - +
- vecteurs invertébrés + - +
- infection fongique + - +

37
Chapitre I Synthèse bibliographique

- différences entre les + - +


variétés des plantes + - +
- différences entre + - +
+ + +
+ - +

+ :Effet ; - Pas d’effet

3.4.3-Influence du substrat
Les mycotoxines sont produites par de nombreuses moisissures dotées génétiquement
d’un pouvoir toxinogène. Cependant la nature du substrat peut influencer l’expression du
pouvoir de sécrétion des toxines (REBOUX, 2006).
Il est important de noter que des différences dans cette expression, peuvent être
observées au sein d'une même espèce et expliquer les différences de pouvoir toxinogène
observées entre "souches". En outre, des souches au sein d'une même espècene disposent pas
toute du système enzymatique requis pour la production des mycotoxines (NICHOLSON et
al., 2003).
Ainsi les progrès de la chémotaxonomie ont permis de démontrer que pour une même
espèce les profils des substances produites sont différents si on prélève le champignon sur le
substrat naturel ou à partir d’une culture en boîte de Pétri. L’exemple le plus parlant concerne
Penicillium roqueforti, incapable de produire une toxine sur le fromage de Roquefort, alors
qu’in vitro il est en mesure desecréter un métabolite très toxique (CHAPELAND et al.,
2005).
3.4.4-Autres facteurs
Des micro-organismes « de concurrence » peuvent affecter la production de
mycotoxinesur les produits agricoles. Ils peuvent augmenter ou gêner la formation des
mycotoxinesen changeant le métabolisme de l'organisme producteur, par la concurrence pour
les substrats, en changeant les conditions environnementales les rendant défavorables pour la
production de mycotoxine ou en produisant des composés inhibiteurs (LACEY, 1986).
Les interactions avec d'autres microorganismes peuvent également être différentes
dans les différentes conditions environnementales (CAIRNS et al., 2003).Plusieurs facteurs
additionnels peuvent influencer la production des mycotoxines dans le champ. Ils peut s’agir
des pratiques agricoles comme le labourage et la rotation de récolte, les fongicides utilisés, la
variété de la planteet les différences géographiques (LANGSETH et al., 1995).
3.5. Effets des mycotoxines:
Les mycotoxines constituent un danger imminent qui tire le signal d’alarme, en raison
des pertes économiques importantes qui sont liées à leurs effets sur la santé de l’homme, sur

38
Chapitre I Synthèse bibliographique

la productivité animale et sur le commerce national et international. La FAO estime que plus
de 25 % des récoltes mondiales sont significativement contaminées par des mycotoxines
(KRSKA, 2009).
L’ingestion d’aliments contaminés par les mycotoxines peut être à l’origine de
toxicités aiguës ou chroniques nommées mycotoxicoses. Cependant, les intoxications aiguës
sont rares, spécifiquement chez l'homme, en raison des faibles quantités pouvant être ingérées
avec des aliments contaminés. Mais, l’intoxication chroniqueest souvent à craindre et ce, à
cause de l’effet cumulatif des doses fixées sur des organes cibles, tels que le foie ou le rein
(LECLERC et al., 2005).
Les mycotoxines peuvent aussi avoir des effets carcinogènes, mutagènes, tératogènes
et immunosuppresseurs. En outre, certaines mycotoxines peuvent altérer des réactions
immunitaires et réduire ainsi, la résistance aux infections. Du coup, il est, maintenant,
largement considéré comme leur effet le plus important, surtout dans les pays en
développement (PAMEL et al.,2010).

Tableau 03: Effets des principales mycotoxines sur l’homme et mécanismes d’action
cellulaires et moléculaires identifiés (GHERRAS et EL2017).
Mécanismes d’action cellulaires et
Mycotoxine Effets moléculaires

Hépatotoxicité Formation d’adduits à l’ADN


Génotoxicité Péroxydation lipidique
Aflatoxine B1 et M1 Bioactivation par des CYP 450
Cancérogénicité
Immunomodulation Conjugaison aux Glutathion- transférases

Néphrotoxicité Impact sur la synthèse des protéines


Ochratoxine A et B Génotoxicité Inhibition de la production d’ATP
Immunomodulation Détoxication par les peptidases

Induction de l’apoptose progéniteur


Hématopoïétique et cellules immunitaires
Hémato toxicité Impact sur la synthèse des protéines
Trichothécènes
Immunomodulation Altération des immunoglobulines
(A et B)

Neurotoxicité Inhibition indirecte d’enzymes


Patuline
Mutagenèse in vitro
Liaison aux récepteurs oestrogéniques
Zéaralénone Fertilité Reproduction Bioactivation par des déshydrogénases
Conjugaison aux glucuronyltransférases

Lésion du système nerveux Inhibition de la synthèse de céramide et


central altération du rapport
Fumonisine B1
Hépatotoxicté sphinganine/sphingosine
Génotoxicité Altération du cycle cellulaire
Immunomodulation

39
Chapitre I Synthèse bibliographique

3.6-Normes et aspects Réglementaire des Mycotoxines:


Quelques 60 pages ont publié des règlements concernant la contamination des produits
alimentaires et des aliments pour animaux par des aflatoxines. Dans les pays industrialisés, les
qualités maximales admissibles (limite, maximale de résidus ; LMR) sont fixées comme suit :
(HIGHLEY etal., 1994).

Tableau 04 : Qualités maximales admissibles d’aflatoxine(HIGHLEY et al., 1994).


Quantités maximales
Marchandise Aflatoxines admissibles (ug/Kg)

Alimentation humaine 5 à 30

Aliments pour bébés 5 à 20

Aliments pour bétail laitier, jeune bétail 5 à 20

Aliments pour porcins et volaille 10 à 30

Aliments pour bovins et caprins 20 à 300

Les Mycotoxines sont très résistantes et ne peuvent être réduites ni par la cuisson, ni
par d’autres procédés quelconques, ce qui implique que les denrées alimentaires infestés
doivent être détruites.

Les limites maximales sont fixées à 8μg/Kg pour l’aflatoxines B1 et 15μg/Kg pour les
aflatoxines totales. En ce qui concerne les ochratoxines, les teneurs maximales sont fixées à
5μg/Kg pour les céréales brutes destinées à être triées avant l’utilisation pour l’alimentation
humaine et une teneur de 3μg/Kg pour les céréales et leur produits dérivés utilisés.
(AGRIOS, 1994).

21
Chapitre II: Matériel et Méthodes

Chapitre II
Matériel et Méthodes
Chapitre II Matériel et Méthodes

Le présent travail porte sur l’identification et l’extraction des mycotoxines Aspergillus


isolés à partir des grains d'arachide et de blé, l'évaluation de leur toxicité et la réduction de
cette dernière. Ce travail a été initié et réalisé dans le laboratoire de la faculté des sciences de
la nature et de la vie de l’université El-Chahid Hamma Lakhdar d'El-oued.
1- Matériel
1.1-Matériel de laboratoire
- Etuve
- Balance de précision
- Hotte à flux laminaire
- Agitateur va-et-vient
- Autoclave
- Agitateur Vortex
- Microscope
- Evaporateur rotatif
- Broyeur (Warring-blendor)
- Verrerie : boîtes de Pétri, Erlenmeyers, fioles jaugées, béchers, ballons, tubes à essais,
pipettes, ampoules à décanter, colonne à verre, micro seringues Hamilton, cuve d’élution.
- Les gants de laboratoire.
- Les bavettes.
1.2- Les Milieux de culture
 Milieu CDA (CzapekDox Agar)
 Agar Dextrose Potatoes (PDA)
 Milieu Sabauroud
 Gélose Mueller-Hinton
 Gélose nutritive
1.3- les bouillons:
 PDA(Potatoes Dextrose Agar acidifié).
 Bouillon nutritive.
1.4. Matériel végétal :
Les échantillon sont été prélevé à partir de différents vendeurs d'arachides et de blé
dans la wilaya d'- El oued, à savoir :
- Un échantillons d’arachide (avec enveloppe, sans enveloppe).
- Un échantillons de blé.

22
Chapitre II Matériel et Méthodes

Figure 16: L’échantillons utilisés (arachide avec enveloppe et arachide sans enveloppe
et blé)

1.5-Souches microbienne :
Dans la présente études, plusieurs souches microbiennes pathogènes ont été utilisées
pour démonter l'activités antimicrobiennes des souches fongiques isolées à partir de nos
échantillons (tableau 5).
Tableau 05 : Souches tests (les bactéries pathogènes et la levure ).

Nom de souche et Code référence Abréviation

Candida albicansIPA 200 M3

listeria innocuaCLIP 74915 Lis.inno

Klebsiella pneumonia ATCC 700603 K.p

Escherichia coli ATCC 8737 E. coli

2-Méthodes
2.1- Isolement des moisissures (Méthodes de dilution) :
De chaque échantillon, 5g d'arachide broyés o sont additionnés à 45 ml d’eau
physiologique, Ensuite, 1 ml de cette dernière est ajouté à9ml d’eau physiologique pour avoir
la dilution 10-1. Des boites Pétri contenant les milieux:Sbauraud., milieu Czapek, sont
ensemencées avec 1ml des dilutions et l’incubation dure 5 à 7j à 25 °C et 30 °C.

21
Chapitre II Matériel et Méthodes

Figure17: Isolement des moisissures par la Méthode de dilution


2.2- Mise en évidence des moisissures (méthode directe d’ulster):
C’est une méthode de mise en évidence de la moisissure de surface et de profondeur
des grains étudiée. Tapisser la boite de pétrie par pda . Afin de crée une atmosphère humide
dans la boite et on mets 5graine d'arachides ou de blé dans la boite.
L’incubation se fait à 25C°pendant 5 à 7 jours Cette méthode et préconisée dons le
cadre de la détermination de la flore de surface d’un aliment pour juger l’efficacité de tel ou
tel mode de stockage (LAOUID et NEFTIA, 2007)
Nous avons fermé les boites cultivés dès le début de localisation jusqu'à dernière étape
par para film pour éviter tout risque de contamination.
2.3- Purification de la souche
La purification des souches est effectuée par le repiquage au centre de boite contenant
le même milieu et dans les mêmes conditions d’incubation jusqu’à l’obtention des souches
pures (GUIRAUD, 2003).
2.4- Identification des souches
L’identification des moisissures est basée sur les caractères culturaux (observation
macro-scopique) et l’observation microscopiques ainsi que des propriétés biochimiques
(BOTTON et al., 1990).

24
Chapitre II Matériel et Méthodes

2.4.1- Identification macroscopique


L’observation macroscopique est réalisée sur la face et le revers de la boite, en basant
sur la détermination de l’aspect des colonies et la forme et la couleur des spores et la vitesse
de croissance et le diamètre de la colonie (BOTTON et al., 1990).
2.4.2- Identification microscopique
L’identification microscopique des champignons repose sur plusieurs méthodes, les
méthodes les plus utilisées est méthode de scotch (CHABASSE, 2002).
2.4.3- Identification des genres par la technique de scotch
La technique de scotch consiste à adhérer à l’aide d’un bout de scotch (technique du
drapeau) une fraction mycélienne à partir d’une culture jeune et de la coller sur une lame
contenant quelques gouttes de lactophénol(CHABASSE, 2002). A partir des mêmes cultures
on prend un autre fragment de scotch et on le recolle sur une lame préalablement étalée par
une goutte de bleu de méthylène diluée avec deux goutte de l’eau physiologique. Les
observations microscopiques sont effectuées aux grossissements ×10, ×40 et ×100 à l’aide
d’un microscope(GUEZLANE et al., 2011).

Figure 18: Méthode d’identification microscopique des moisissures par la technique de


Scotch

25
Chapitre II Matériel et Méthodes

2.5- Critères d’identification des moisissures :


L’identification des moisissures fait essentiellement appel aux caractères culturaux et
à la morphologie, rarement à des propriétés biochimiques; elle nécessite souvent l’utilisation
des milieux standards favorisant la croissance ou la reproduction et permettant ainsi une
expression correcte des caractères à étudier : Aspergillus, , en particulier, à savoir :
 Vitesse de croissance
 Texture de thalle (veloute, laineux, etc.…).
 Couleur de thalle (pigmentation du mycélium, couleur des conidies).
 Couleur de revers de la culture et présence d’un pigment diffusible.
 Odeur.
 Exsudat (gouttelettes transpirées par le mycélium aérien).
Tous les caractères doivent être notés avec précision en utilisant, la précision du
microscope et l’huile d’immersion qui déterminent exactement les dimensions du thalle et le
contenu des conidiospores. (BOTTON et al, 1990).
2.6-Activités antimicrobiennes:
Pour rechercher l’activité antimicrobienne des Aspergillus isolés, on utilise la
technique de la double culture.
2.6.1- Préparation des microorganismes d’essai:
Les souches sélectionnées ont été revivifiées dans des tubes contenant 9 ml de
bouillon nutritif « Nutrientbroth » à l’aide d’une pipette Pasteur flambée et incubées à 37°C et
la levure à 30°C pendant 24 heures avant d’être utilisées dans les tests de l’activité.
A partir de chaque tube de bouillon nutritif mentionnant un trouble, on a ensemencé
par stries une boite de Pétri contenant la gélose nutritive puis incubées à 37°C pendant 18
heures. Après incubation on a raclé à l’aide d’une pipette pasteur quelques colonies bien
isolées et parfaitement identiques, puis on a déchargé la pipette dans 5 ml d’eau
physiologique stérile.

26
Chapitre II Matériel et Méthodes

Figure 19 : Préparation des microorganismes d’essai


2.6.2- Ensemencement:
La suspension bactérienne a été ensemencée à l’aide d’un écouvillon stérile sur des
boites de Pétri contenant le milieu Muller Hinton (MH). L’écouvillon a été trempé dans la
suspension bactérienne, puis il est essoré on le faire tournant sur la paroi interne de tube afin
de le décharger au maximum. Le milieu MH a été frotté sur la totalité de leur surface gélosée
de haut en bas, en stries serrés (BOUGHACHICHE et al., 2005).
2.7- Fermentation et extraction des toxines:
Les champignons ainsi ayant un résultat positif au dépistage et identifiés, ont été mis à
croitre sur du PDA a 25°C pendant cinq jours, deux à trois pièces (0.5 x 0.5 cm) de chaque
champignon ont été inoculées dans des erlenmeyers de 500 ml contenant 300 ml de PDB
(potato dextrose broth) et répété deux fois (XIAOLING et al., 2010), ils seront après incuber
à 25°C pendant trois semaines avec une agitation périodique à 150 tours/minute, après ça le
contenu est filtré à travers une gaze stérile pour séparer le mycélium du bouillon de culture
(BARIK et al., 2010; MOHANTA et al., 2008), ce dernier est centrifugé a 3000 tours/min
pendant 10 min, et le surnagent a été récupéré (MADKI et al., 2010).

27
Chapitre II Matériel et Méthodes

Figure 20: Fermentation des champignons et filtration de surnageant.

Figure 21: L’extraction de mycotoxine par l’acétate d’éthyle et le chloroforme

28
Chapitre II Matériel et Méthodes

Figure 22: Fermentation et extraction des mycotoxine avec l’acétate d’éthyleet le


chloroforme (et al., 2010).

29
Chapitre II Matériel et Méthodes

2.8-Méthode de diffusion sur disques :


Afin de déterminer l’activité antimicrobienne des extraits obtenus par l’extraction à
l’acétate d’éthyle et le chloroforme. La méthode de diffusion sur disques a été utilisé
(HAZALIN et al., 2009). Les boites contenant d' agar nutritif et du Sabouraud ont été
inoculées avec 100 μl de levure respectivement (MOHANTA et al., 2008; YAMAÇ et
BILGILI, 2006).
Chaque extrait fongique a été dissous dans du dimethylsulfoxide (DMSO) de façon à
obtenir une concentration de 1mg/ml, 10 μl de chaque extrait ont été déposé àl'aide d’une
pipette sur les disques stériles (6 mm de diamètre) placés à la surface des géloses
préalablement inoculés avec les bactéries et les champignons pathogènes, le DMSO a aussi
été utilisé en tant que contrôle négatif (HAZALIN et al., 2009).
Les boites ainsi terminées ont été mise pendant 2 heures à 4°C afin que les métabolites
puissent diffuser ensuite elles ont été misent a incuber à 37°C pendant 24 heures pour les
bactéries, 30°C pendant 48 heures pour la levure et 72 heures pour les champignons.Le
diamètre des zones claires autour des disques révélant l’activité antimicrobienne des extraits
ont été mesuré. Et les tests ont été effectués en triplicata(YAMAÇetILGILI,2006).

Figure 23 :Technique de diffusion sur disques

11
Chapitre II Matériel et Méthodes

2.9-Réductions de la toxicité des souches fongiques isolées


Deux bactéries lactiques, isolées à partir de lait de chamelle, sont testées pour leur
pouvoir antifongique suivant la méthode de diffusion par des disques, décrite par TADESSE
et al., (2004).
Les souches lactiques utilisées lors de la présente étude sont:
 Souche 01: Lactococcuslactissubsp. lactis
 Souches 02: Streptococcus thermophilus
Elle consiste à déposer des disques vierges imprégnés des surnageant obtenu après
centrifugation de bouillon à 4000 tours / min pendant 15 min, à la surface des boites de Pétri
(Sabouraud) préalablement inoculées par la souche cible. La boite ainsi préparée est incubée à
37°C pendant 72 heures. L’inhibition se manifeste par la présence de zones claires autour
d’un trouble formé par la croissance de souche cible.
Le diamètre de la zone d’inhibition est calculé à partir des bordures de la zone
comprenant le diamètre du disque (6mm). L’inhibition est considérée positive lorsque le
diamètre de la zone est supérieur à 1mm (Allouche et al., 2010).

13
Chapitre III : Résultats et Discussion

Chapitre III
Résultats et Discussion
Chapitre III Résultats et Discussion

1.Isolement :
1.1 Méthode de dilution:
Une biodiversité fongique est assez importante (moisissure et levure) a été rélevée,
après effectuée une analyse mycologique de nos échantillons sur milieu czapek. Ceci est
illustrée ci dessous dans la figure 24 (différentes souches fongiques obtenues sur milieu
czapek)..

Figure 24: Colonies obtenues dans les graines contaminées d’arachide par la méthode
de dilution.
1.2- Méthode d’ulster:
L’isolement des moisissures a été réalisé par la méthode d’ulster ou la méthode
directe de Botton et al,. (1990) qui repose sur le principe de stimulation du développement
des moisissures par incubation des grains.
Pour l’identification des genres, nous avons examiné les caractères culturaux et
morphologiques (Bouchet., 2005). En effet, pour les caractères culturaux nous avons:
vitesse de croissance; couleur des colonies; texture du thalle; présence ou absence des
mucorale ; couleur et changement de la couleur du milieu; présence ou absence d’odeurs
caractéristiques (figure 24).

11
Chapitre III Résultats et Discussion

Figures 25 : Colonies obtenues dans les graines contaminées de blé et d’arachide par
la méthode d’ulster

Après l'isolement d'aspergillus par la méthode de dilution et méthode d’Ulster,


nous obtenus des souche de couleur différente Tableau 6 :
Tableau 06: Souche obteneus dans les graines contaminées de blé et d’arachide par la
méthode d’ulster Méthode de dilution.

Méthode Méthode d’ulster Méthode de dilution

L'échantillon Blé Arachide Arachide

couleur de souche Vert; noir Vert; blanc; noir Blanc; noir

 Par la Méthode de dilution: on a obtenu une seul souche d'aspergillus isolée à


partir d'arachide .
 Par la Méthode d’ulster: on a obtenu trois souches d'aspergillus isolées à partir
d'arachide et de blé.

2- Identification des souches


L’identification des trois souches d'aspergillus a été réalisée en tenant compte de
leurs caractères macroscopiques (couleur, aspect de colonie et le revers des boites), après
une culture de 5 -7 jours sur milieu Sabouraud et PDA, et microscopiques (forme de thalle
et des spores). Ceci est rendu possible grâce à la clé d’identification de BARNETT ET
HUNTER (1972). Les souches fongiques identifiées sont consignées dans le tableau 7.

14
Chapitre III Résultats et Discussion

D'après les résultats obtenus, on peut dire que nos isolats appartiennent probablement
au espèces suivantes respectivement:

 Aspergillus sp1: Aspergillus flavus


 Aspergillus sp2: Aspergillus fumigatus
 Aspergillus sp3: Aspergillus niger

15
Chapitre III Résultats et Discussion

Tableau 07 : Différents caractères macroscopique des isolats fongiques.


Genres et espèces
Souches Caractères microscopiques (Pré-identification)
Caractères macroscopiques
Fongiques

GX100
- Colonies de couleur verte,
- Texture poudreuse,
- Croissance de 5 à 7 jours.

Règne: champignons
Division: Deuteromycotina
Aspergillus sp1 Classe: Hyphomycètes
(S1) Famille: Moniliaceae
- conidiophore: long 1mm hyalin, verruqueux ,avec des Ordre: Moniliales
aspérités . Genre: Aspergillus
- vésicule: sphériques. Espèce: Aspergillus flavus
- Phialides: directement insérées sur la vésicule ou
portées par des métules.
- conidies: globuleuses ,vert pâle, échinulées.
-Tête: unisériée ou bisériée

Règne: champignons
Division: Deuteromycotina
Classe: Hyphomycètes
- Colonies bleu vert puis verte foncé. Famille: Moniliaceae
Aspergillus sp2 GX100
- Croissance rapide de 3 à 5 jours Ordre: Moniliales
(S2)
Genre: Aspergillus
Espèce: Aspergillus fumigatus

16
Chapitre III Résultats et Discussion

-condiophore: court ,lisse et incolore ,avec evasement


progressif au sommet
-Vésicule: Hémisphérique.
-phialides: Directement groupées
-Conidies: Globuleuses,échinulèes
-Tête: Unisériée
GX100

- Colonies d'abord blanches puis


granuleuses noires .
- Croissance rapide de 5 à 7 jours. Règne: champignons
Division: Deuteromycotina
Classe: Hyphomycètes
Famille: Moniliaceae
Aspergillus sp3 Ordre: Moniliales
(S3) -Conidiophore: très long lisse hyalin ou brunâtre Genre: Aspergillus
-Vésicule: globuleuses Espèce: Aspergillus niger
-Phialides: insérées sur la vésicule par l'intermédiaire de
métules ,disposé sur tout le pourtour de la vésicule.
-Conidies: globuleuses brunes échinulées souvent
disposées en chaînes.
-Tête: bisériée radiée ,noire à maturité.

17
Chapitre III Résultats et Discussion

3-Détermination de l’activité antimicrobienne :


Après fermentation et extraction à l’aide de l’acétate d’éthyle et le chloroforme, les
extraits des trois souches fongiques ont été examinés sur leur activité antimicrobienne par
la méthode de diffusion sur disques. Les différents extraits ont montré une activité
antimicrobienne plus ou moins considérable, et où les zones d’inhibition allaient de 0 à 13
mm pour les extraits d’acétate d’éthyle, et de 0 à 12 mm pour les extraits chloroformiques.
Les diamètres de toutes les zones d’inhibition sont résumés dans le tableau 8 et les figures
26,27,28 et 29; pour les différentes souches pathogènes testées respectivement.

mm 14

12

10
zone d'inhibition de 8
chloroforme
zone d'inhibition 6
d’acétate d’éthyle
4

0
Aspergillus Aspergillus Aspergillus
flavus fumigatus niger

Figure 26: Effet de chaque extrait fongique obtenu par l’acétate d’éthyle et le
chloroforme sur E. coli

Pour E. coli : l’effet le plus important a été obtenu par l’extrait d’acétate d’éthyle
par Aspergillus fumigatus dont la zone est de13 mm, contrairement à faible effet par les
extraits d’acétate d’éthyle d' Aspergillus flavus dont la zone été de 8 mm.

18
Chapitre III Résultats et Discussion

mm
12

10

8
zone d'inhibition de
chloroforme 6
zone d'inhibition
d’acétate d’éthyle 4

0
Aspergillus Aspergillus Aspergillus
flavus fumigatus niger

Figure 27: Effet de chaque extrait fongique obtenu par l’acétate d’éthyle et le
chloroforme sur Klepsilla sp.

Pour Klepsilla: l’effet le plus important a été obtenu par l’extrait d’ l’acétate
d’éthyle par Aspergillus niger , dont la zone est de12 mm, contrairement à faible effet par
les extraits d’acétate d’éthyle Aspergillus fumigatus dont la zone été de 7 mm.

mm
12

10

8
zone d'inhibition de
chloroforme 6
zone d'inhibition
d’acétate d’éthyle 4

0
Aspergillus Aspergillus Aspergillus
flavus fumigatus niger

Figure28 : Effet de chaque extrait fongique obtenu par l’acétate d’éthyle et le


chloroforme sur Listeria sp.
Pour Listeria: l’effet le plus remarquable a été obtenu par l’extraits d’chloroforme
par Aspergillus flavus dont la zone est de12 mm, contrairement aucune effet sur les extraits
d’acétate d’éthyle par Aspergillus flavus et l’extraits de chloroforme par Aspergillus niger.

19
Chapitre III Résultats et Discussion

mm 12

10

8
zone d'inhibition de
chloroforme 6
zone d'inhibition
4
d’acétate d’éthyle
2

0
Aspergillus Aspergillus Aspergillus
flavus fumigatus niger

Figure 29 : Effet de chaque extrait fongique obtenu par l’acétate d’éthyle et le


chloroforme sur Candida sp.

Pour candida: l’effet le plus grand a été obtenu par l’extraits d’acétate d’éthyle par
Aspergillus flavus dont la zone été de12 mm, contrairement aucune effet sur les extraits
d’acétate d’éthyle par Aspergillus niger et l’extraits de chloroforme par Aspergillus niger
et Aspergillus flavus;
D'après le tableau 8; pour les extraits d’acétate d’éthyle, l’effet le plus grand a été
obtenu par l’extrait de E.coli. par Aspergillus fumigatus dont la zone été de1.3 cm,
contrairement à candida par les extraits d'Aspergillus niger n’ont eu aucun effet. Pour les
extraits chloroformiques, la plus importante zone d’inhibition a été observée chez l’extrait
sur E.coli, qui a donné une zone d’inhibition de 12 mm contre listeria et candida n’ont eu
aucune effet sur souche 1 et souche3. Le genre Aspergillus a montré une activité contre
plusieurs microorganismes pathogènes par (MADKI et al., 2010; MARIA et al., 2005).
La différence obtenue entre l’effet des extraits d’acétate d’éthyle et
chloroformiques, sachant que chaque solvant différent permet d’extraire des composés
différents; peut-être expliquée par le fait que les composants bioactifs n’ont pas été bien
dissous ou en très petite quantité, donnant peu d’effet aux extraits chloroformiques, et le
plus probable c’est que les composants bioactifs ont la polarité qui est le mieux extraite par
l’acétate d’éthyle (OGUNDARE et al., 2006).

41
Chapitre III Résultats et Discussion

Tableau 08: Comparaison des extraits d’acétate d’éthyle et chloroformiques et leurs effets sur chaque de microorganismes pathogènes .
grain Bactéries Levure
E.COLI KLEPSILA LISTERIA CANDIDA
Résultat Diamètre Résultat Diamètre Résultat Diamètre Résultat Diamètre
S1 Chl + 0.9cm + 3 + 3.2 - 1
Ac + 0.8cm + 1.9 - 1 + 3.3
S2 Chl + 1.2cm + 1.8 + 1.7 + 1.8
Ac + 1.3cm + 1.7 + 1.7 + 1.9
S3 chl + 1.1cm + 1.9 - 1 - 1
Ac + 0.9cm + 3.2 + 1.9 - 1

43
Chapitre III Résultats et Discussion

4- Réductions de la toxicité des souches fongiques isolées:


L'action inhibitrice des bactéries lactiques est déterminée par la méthode de la
diffusion sur disques. Cette méthode a été réalisée pour la recherche de l’activité anti-
Aspergillus.

Bactéries Souches d'Aspergillus


Lactiques S1 S2 S3
Diamètre Diamètre Diamètre
SN B1 Résultat Résultat Résultat
(mm) (mm) (mm)
+ 10mm - 1 - mm8
SN B2 + 12mm + 10mm - 1
Tableau 09: résultat du test d’antagonisme des bactéries lactique 1 et2 , sur les souches
d'aspergillus

Les résultats du test d’antagonisme à partir des extraits de Lactococcus lactis subsp.
Lactis (B1)et Streptococcus thermophilus (B2) sont illustrés dans le tableau 9 et la figure 30.

Figure 30: Quelques zones d’inhibition de différentes bactéries lactiques testés sur les
isolats d'Aspergillus.
Les enjeux de ce travail étaient d’explorer la capacité des souches lactiques à inhiber
la croissance de Fusarium sp. Ces études sont essentielles pour une meilleure utilisation de
ces souches lactiques comme agents de bioprotection. D'après les figures 31 et 32;

42
Chapitre III Résultats et Discussion

Pour la souche Lactococcus lactis subsp. Lactis, l’effet le plus importants a été obtenu
sur Aspergillus flavis dont la zone été de10 mm, contrairement, on n'assiste à aucun effet
sur l'aspergillus fumigatus.
Pour la souches Streptococcus thermophilus: l’effet le plus grand a été obtenu sur
Aspergillus flavus dont la zone été de13 mm , par contre; sur l'Aspergillus niger n’ont eu
aucune effet.

mm 10
9
8
7
6

zone d'inhibition 5
4
3
2
1
0
Aspergillus Aspergillus Aspergillus
flavus fumigatus niger

Figure 31: Variation de zone d’inhibition entre différentes souches d'Aspergillus et SN


B1.

mm 12

10

zone d'inhibition 6

0
Aspergillus Aspergillus Aspergillus
flavus fumigatus niger

Figure 32 : Variation de zone d’inhibition entre différentes souches d'Aspergillus et SN


B2.

41
Chapitre III Résultats et Discussion

Les bactéries lactiques présentant des activités anti fongiques ont été également isolées
d’autres systèmes biologiques tels que les ensilages (MAGNUSSON & SCHNÜRER, 2001),
le lait cru et les saucissons (SCHWENNINGER et al ., 2005). Les bactéries lactiques sont
depuis des décennies utilisées pour réaliser la fermentation des produits et assurer leur
conservation, elles ont de ce fait acquis le statut GRAS (GENERALLY RECOGNIZED AS
SAFE) (DALIE, 2010)
Les résultats les plus probants sont obtenus lorsque la bactérie est inoculée dans le
milieu de culture 48 heures avant l’ensemencement du champignon. SELON DALIE,
(2010),une activation importante de la production de toxines associée à une réduction de
croissance fongique est observée.
L’observation microscopique des zones de confrontation du champignon avec les
bactéries lactiques a montré l’apparition d’un mycélium stérile, qui veut dire qu’il y a une
inhibition de la sporulation. Ces résultats sont confirmés par les travaux de : LAREF et
GUESSAS, 2013 ; MUHIALDIN et HASSAN, 2011 et STRÖM,2005).
L’activité antifongique en utilisant le surnageant stérile a été aussi observée sur les
Espèces Aspergillus niger, Aspergillus tubingensis et Penicillium crustosum par NDAGANO
(2012).
Toutes les bactéries lactiques utilisées dans cette étude (Lactococcus lactis subsp.
Lactis et Streptococcus thermophilus ) ont montré une activité antifongique vis-à-vis des
différentes souches fongiques utilisées. Ces résultats sont les mêmes que celles de
BIANCHINI (2010) qui a travailler sur l’effet des composés antifongiques produits par
Lactobacillus plantarum sur la croissance d’Aspergillus spp.
SELON LIET. (2012) et DALIE et al . (2010), l’inhibition des champignons et des
mycotoxines par les bactéries lactiques apparait comme une stratégie promotrice pour le bio-
contrôle des moisissures qui contaminent les aliments et les végétaux.

44
Conclusion

Conclusion
Conclusion

Conclusion
Les champignons endophytes sont d’excellentes sources de nouveaux produits
naturels bioactifs avec un potentiel d’exploitation dans une grande variété de domaines
médicaux, agricoles et industriels.
Le présent travail est une contribution à l’étude mycologique et recherche des souches
toxinogènes isolées à partir d'arachide et le blé commercialisés dans dans la ville d'El-Oued,
cette étude dévoile la présence d’une grande biodiversité de contaminants fongiques.
Selon les résultats d’identification préliminaire de l’isolat obtenu basé sur l’étude
macroscopique et microscopique, par diverses méthodes mycologiques, il semble que la
méthode de dilution et la méthode directe d’Ulster permet un isolement plus performant des
moisissures d’un point de vue qualitatif et quantitatif où les genres les plus dominants sont :
Apsergillus,. : A.flavus, A.niger, A.fumigatus.
L’effet inhibiteur des mycotoxines d'Aspergillus testés sur les bactérie pathogènes par
la méthode des puits sur le milieu Muller-Hinton, montre une activité inhibitrice importante.
Le test de diffusion sur disques a démontré que tous les extraits avaient une activité inhibitrice
sur au minimum un ou plusieurs microorganismes pathogènes. les zones d’inhibitions varient
pour les extraits d’acétate d’éthyle entre 0 et 13mm, et entre 0 et 12 mm pour les extraits
chloroformique. Les extraits d’acétate d’éthyle avais plus d’effet que les extraits
chloroformiques.
Les résultats obtenus montrent que parmi les champignons endophytes étudiés ceux
appartenant au genre Aspergillus, présentent une activité antibactérienne sur les bactéries
pathogènes E.coli, Klepsilla, listeria et une levure pathogène (Candida albicans) testées et
une activité antifongique.
Les résultats de la méthode de diffusion sur disque de 02 souches de bactéries
lactiques (Lactococcuslactissubsp. Lactis, Streptococcus thermophilus) , ont montré que les
bactéries lactiques utilisées sécrètent des substances bioactives et qui ont un effet anti-
Aspergilllus, avec une valeur de zone d’inhibition assez importantes.
Afin de confirmer ou d’infirmer les résultats obtenus et de mieux comprendre les
mécanismes d’action de ces microorganismes, il serait souhaitable d’effectuer des études
complémentaires sur :
 Elargir l' échantillonnage en augmentant le nombre des variétés infectées par
l'aspergillus.
 Effectuer une identification plus profonde; moléculaire.
 Caractériser les mycotoxines produit par les souches isolées.

46
Référence bibliographique

Références
bibliographiques
Références bibliographiques

 ABBAS, H.K., Smeda, R.J., Duke, S.O., Shier, W.T., 1997.Fumonisin-


Plantinteractions, Bulletins of the Institute for Comprehensive Agricultural Sciences,
KinkiUniversity, 5: 63-73.
 AGRIOS G.N., 1994. Plant pathology. 4èmeedition. Academic Press. New York: 60-
75.
 AYALEW, A., FEHRMANN, H., LEPSCHY, J., BECK, R., ABATE,D., 2006,
Natural occurrence of mycotoxins in staple cereals from Ethiopia, Mycopathologia,
162 1:.57-63.
 ZINEDINE, A.M. BETBEDER, M. FAID AND M. BENLEMLIH, L. IDRISSI
AND E.E2004. Creppy. Ochratoxin A determination in dried fruits and black olives
from Morocco Alimentaria 359: 73-76.
 BALAJEE, S. A., D. NICKLE, J. VARGA, AND K. A. MARR. 2006. Molecular
studies reveal frequent misidentification of Aspergillus fumigatus by morphotyping.
Eukaryot Cell 5:1705-12.
 BALAJEE, S. A., J. L. GRIBSKOV, E. HANLEY, D. NICKLE, AND K. A.
MARR. 2005. Aspergillus lentulus sp. nov., a new sibling species of A. fumigatus.
Eukaryot Cell 4:625-32. 31.
 BARIK B. P., TAYUNG K., JAGADEV P. N. and DUTTA S. K. Phylogenetic
placement of an endophytic fungus Fusarium oxysporum isolated from Acorus
calamus rhizomes with antimicrobial activity . European Journal of Biological
Sciences 2010; 2: 8-16.
 BEHNAS D ,BENAYACHE A.2015. Mémoire présenté en vue de l’obtention du
Diplôme de Master en microbiologie. Edition Berti:17
 BENNETT, J. 2010. An Overview of the Genus Aspergillus. In M. Machida and K.
Gomi (ed.), Aspergillus Molecular Biology and Genomics.
 BOTTALICO, A. 1998 .Fusariumdiseases of cereals: species complex and related
mycotoxin profiles in Europe. J Plant Pathol, 80 2: 85-103.
 BOTTON B. ET AL. 1990. Les moisissures utiles et nuisibles. Importance
industrielle. 2eme édition. Masson. Paris:18, 34-207.
 BOTTON B., BRETON A., FEVRE M., GAUTHIER S., GUY P., LARPENT
J.P., REYMOND P., SANGLIER J.J., VAYSSIER Y. & VEAU P. 1999 .
Moisissures utiles et nuisibles. Importance industrielle. Masson. Paris: 12-426.
Références bibliographiques

 BOTTON. B, BRETON. A, FEVRE. M, GUY. P.H, IARPENT. J.P, SANGLIER.


J.J, VAYSSIER. V AND VEAU.P, 1990. Moisissures utiles et nuisibles. Importance
Industrielle. Masson:20-191
 BOUGHACHICHE.F, REGHIOUA. S, OULMI. L, ZERIZER.H ,KITOUNI.M,
BOUDMEMAGH. A, BOULAHROUF. A, 2005: Isolement d’actinomycetales
productrice de substance antimicrobiennes à partir de la SEBKHA DE AIN MLILA.
23: 5-10.
 BOURGEOIS C.M., MESCLE J.F., ZUCCA J. 1989. Microbiologie alimentaire.
Aspect microbiologique de la sécurité et de la qualité des aliments. Lavoisier. Paris:
216-244.
 BUTLER, M. J., DAY, A. W. 1998. Fungal melanins: a review. Can. J. Microbiol.,
44,1115-1136.
 CAIRNS, V., HOPE, R., MAGAN, N. 2003. Environmental factors and competing
mycoflora affect growth and ochratoxin production by Penicillium verrucosum on
wheat grain. Aspects of Applied Biology, 68: 81-90.
 CHABASSE.D, 2002.Les moisissures d’intérêt médical. Cahier N°25 de formation de
biologie médicale: 25-27.
 CHAPELAND-LECLERC F, PAPON N, NOËL T, VILLARD J. 2005.
Moisissures et risques alimentaires (mycotoxicoses). Rev Fr Laboratoires;373:61–6.
 CHRISTENSEN, C.M. 1974. Storage of cereal grains and their products, American
Association of Cereal Chemists, St.Paul, Minnesota, USA.
 COLVIN, B.M., COOLEY, M., BEAVER, R.W., 1993.Fumonisintoxicosis in
swine: clinical and pathologic findings, J. Vet. Diagn. Invest, 5:232-241.
 CREPPY, EE. 2002.Update of survey, regulation and toxic effects of mycotoxins in
Europe. ToxicolLett, 127:19-28.
 DALIE DKD. 2010.Biocontrôle des moisissures dugenre Fusarium productrices
defumonisines parsélection de bactéries lactiques autochtones de maïs.PhDthesi,
University of Bordeaux I, France.
 DAVET P. 1996. Vie microbienne du sol et production végétale. INRA. Paris: 52-57.
 DEVARAJU. R AND SATISH. S, 2011. Endophytic mycoflora of Mirabilis jalapa
L. and studies on antimicrobial activity of its endophytic Fusarium sp. Asian Journal
of Experimental Sciences.2: 75-79.
 GHERRAS S, El HIMER N. 2017. Mémoire présenté en vue de l’obtention du
Diplôme de Master en Toxicologie industrielle et environnemental :7-20 .
Références bibliographiques

 GUEZLANE.B, TBIBEL.N, KAHLOUCHE.B, ATMANI.G.S, 2011.


microbiologie Travaux Pratiques 2ème année TCB et LMD, 4éme édition corrigée.
 GUIRAUD P.J. 1998. Microbiologie alimentaire. Agro-Alimentaire. Edition
DUNOD. Paris.
 GUY LEYRAL, ELISABETH VIERLING, 2007. microbiologie et toxicologie des
aliments : hygiène et sécurité alimentaires, 4ème éd,-Rueil –Malmaison : Doin ;
Bordeaux : CRDP d’Aquitaine, (Biosciences et techniques : Sciences des aliments).
 HAZALIN N. A., RAMASAMY K., LIM S. M., WAHAB I. A., COLE A. L. AND
ABDUL MAJEED A. B.2009. Cytotoxic and antibacterial activities of endophytic
fungi isolated from plants at the National Park, Pahang, Malaysia. BMC
Complementary and Alternative Medicine; 9: 46.
 HENDEY K.H. & COLE C.E. 1993. Areviws of mycotoxins in indoor air .
J.Toxical.Environ. Health. 38 (2): 183- 198.
 HESSELTINE, C.W. 1976. Conditions leading to mycotoxin contamination of foods
and feeds. In: Mycotoxins and other fungal related food problems (edited by Rodricks,
J.V.), Advances in Chemistry Series No. 149., American Chemical Society,
Washington DC, USA.
 HIBBETT, D. S., M. BINDER, J. F. BISCHOFF, M. BLACKWELL, P. F.
CANNON, O. E. ERIKSSON, S. HUHNDORF, T. JAMES, P. M. KIRK, R.
LUCKING, H. THORSTEN LUMBSCH, F. LUTZONI, P. B. MATHENY, D. J.
MCLAUGHLIN, M. J. 2007. A higher-level phylogenetic classification of the Fungi.
Mycol Res 111:509-47 .
 HYGHLY, E., ENRIGHT E.J., BANKS H.J. et CHAMP B.R.,.1994. Stored
productprotection. Proceeding of the international working conference on Stored
Product Protection.Volume 2. CAB International. Canberra :969-1083.
 JONES, M. P., AND S. E. OROSZ. 2000. Presented at the Seminars in Avian and
Exotic Pet Medicine.
 KUNKLE, R. A. 2003. Fungal diseases. In Y. M. Saif (ed.), Diseases of poultry 11th
Edition.
 KUPFERSCHMIDT, K.2012. Attack of the Clones." Science 337(6095): 636-638.
 LACEY, J. 1986. Factors affecting mycotoxin production. In: Mycotoxins and
phycotoxins (edited by Steyn, P.S. and Vleggaar, R.), 6th International IUPAC
symposium on mycotoxins and phycotoxins, Pretoria, South Africa.
Références bibliographiques

 LANGSETH, W., HOIE, R., GULLORD, M. 1995. The influence of cultivars,


location and climate on deoxynivalenol contamination in Norwegian oats 1985-1990.
Acta Agriculturae Scandinavica, Section B: Soil and Plant Science, 45: 63-67.
 LAREF N, GUESSAS B, KIHAL M. 2013. Antifungalcompounds production in
differenttemperatures, pHand modified MRS Agar by Lactobacillus strains.Journal of
Biological Sciences 13: 94-99.
 LECLERC, F. C., PAPON, N., NOEL, T., VILLARD, J. 2005. Moisissures et
risques alimentaires (Mycotoxicoses). Revue Francophone des Laboratoires. 373:61-
66.
 LECLERC, H., IZARD, D., OHUSSON, M., WATTRE, P. ET JAKUBCZAKE.
1983 .Microbiologie générale: 26-27.
 MADKI M. A., MANZOOR A. S., POWAR P. V. AND PATIL K. S. 2010.
Isolation and Biological Activity of Endophytic Fungi fromWithania Somnifera.
International Journal of Pharmaceutical Sciences; 2: 848-858.
 MAGNUSSON, J., &SCHNU¨RER, J. 2001. Lactobacillus coryniformissubsp.
coryniformisstrain Si3 produces a broad-spectrumproteinaceousantifungal compound.
Applied and environmentalMicrobiology, 67: 1–5.
 MAHEUX L . 1998. Session on microbial contamination occupational and
environmental health servoices agency , (edn) Health Canada. Canada.
 MARIN, S., N. MAGAN, A.J. RAMOS, AND V. SANCHIS. 2004. Fumonisin
producing strains ofFusarium: a review of their ecophysiology. J. Food Prot. 67: 1792-
1805.
 MEYER, A., DEIANA, J. & BERNARD, A. 2004. Cour de microbiologie générale.
Doin. France.
 MITCHELL, D., PARRA, R., ALDRED, D., MAGAN N. 2004. Water and
temperature relations of growth and ochratoxin A production by Aspergillus
carbonarius strains from grapes in Europe and Israel. J. Appl. Microbiol., 97, 439–
445.
 MOHANTA J., TAYUNG K. and MOHAPATRA U. 2008. Antimicrobial
potentials of endophytic fungi inhabiting three Ethnomedicinal plants of Similipal
Biosphere Reserve, India. The Internet Journal of Microbiology; 5(2).
 MOREAU C. 1974.Moisissures toxiques dans l'alimentation Paris -Vie Masson et Cie
1974 471p
Références bibliographiques

 MUHIALDIN B J, HASSAN Z. 2011. Screening of lacticacidbacteria for


antifungalactivityagainst Aspergillus oryzae. American Journal of AppliedSciences
8:447-451.
 NDAGANO D. 2012. Etude de l’activité antifongiquedes bactéries lactiques isolées
de produitsalimentaires fermentés et caractérisation de leursmétabolites inhibiteurs.
PhDthesis, University ofLiege, Belgiu.
 NELSON, P.E., PLATTNER, R.D., SHACKELFORD, D.D., DESJARDINS,
A.E., 1992 . FumonisinBl production by Fusariumspecies other than F moniliforme in
Section Liseolaand by some related species, Appl. Environ. Microbiol, 5:986-989.
 NICHOLSON, T.P., RUDD, B.A.M., DAWSON, M., LAZARUS, C.M.,
SIMPSON, T.J., COX, R.J. 2003. Design and utility of oligonuc leotide gene probes
for fungal polyketide synthases. Chem. and Biol., 8:157-178.
 NICKLIN J., GRAEME-COOK K., PAGET T., KILLINGTON R. 2000.
L’essentiel en microbiologie. Edition Berti: 210-216.
 OMS. 1980.Mycotoxines. Critères d’hygiène de l’environnement 11. publications. De
l’OMS. Genève:142.
 PAMEL, E. V., VLAEMYNCK, G., HEYNDRICKX, M., HERMAN, L.,
VERBEKEN, A., DAESELEIRE, E. 2010. Mycotoxin production by pure fungal
isolates analysed by means of an uhplc-ms/msmultimycotoxin method with possible
pitfalls and solutions for patulin-producing isolates. MycotoxRes: 1-11.
 PATERSON, R. R. M.2006. "Fungi and fungal toxins as weapons." Mycological
research 110(9): 1003-1010.
 PITT, J.I. 2000. Toxigenic fungi: which are important? Medical Mycology, 38, 17-
22.
 POHLAND, A.E., NESHEIM, S., FRIEDMAN, L. 1992.Ochratoxin A, a review,
Pure, Appl. Chem., 64: 1029-1046.
 QUILLIEN, J-F. 2002.Les mycotoxines. Institut National de la Recherche
Agronomique (INRA) - Centre de Réseaux pour l'Innovation en Agriculture et
Agroalimentaire (CRIAA), Paris, France:1-24.
 RAPER K.B. & FENNELL . 1965. The genus Aspergillus. Food Microbiol 5: 163-
176
 REBOUX, G. 2006. Mycotoxins: health effects and relationship to other organic
compounds. Revue française d’allergologie et d’immunologie clinique, 46, 208–212
Références bibliographiques

 STANIER, R., DOUDOROFF, M., ADELBERGED, A. 1966.Microbiologie


générale. Deuxième édition Masson et éditeur 120, Boulevard saint germain, paris: 88.
 STROHL, W.R. 1997. Industrial antibiotics: today and the future. In WR (ed)
Biotechnology of antibiotics, 2nd edn. Marcel Dekkr. New York: 1-47.
 STRÖMK. 2005.Fungalinhibitorylacticacidbacteria-Characterization and application
of LactobacillusplantarumMiLAB 393. PhD. thesis, SwedishUniversity of
AgriculturalSciences. ISSN 1652-6880,ISBN 91-576-7036-6
 TABUC K.2007. Thése présentée pour obtenirle titre de docteur de l’institut national
polytechnique de toulouse et de l’universite de bucarest en pathologie, mycologie,
genetique et nutrition :30-31.
 TOUATI R, AMOR-CHELIHI L.2016. Mémoire présenté en vue de l’obtention du
Diplôme de Master en microbiologie. Edition Berti.: 3-6.
 VRABCHEVA, T., PETKOVA-BOCHAROVA, T., GROSSO, F., NIKOLOV, I.,
CHERNOZEMSKY ,I.N.,CASTEGNARO, M., DRAGACCI, S. 2004. Analysis of
ochratoxinA in foods. consumed byinhabitants from an area with balkan endemic
nephropathy: a 1 monthfollow-up study, J Agric Food Chem., 52 (8): 2404-2410.
 WHITLOW, W. ETHAGLER, W.M. 2001.Mycotoxin contamination of feedstuffs –
An additional stress factor for dairy cattle. in 25esymposium sur les bovinslaitiers.
 WILLIE, T.D, ET MOREHOUSE, L.G. 1977.Mycotoxic fungi, mycotoxins,
mycotoxicoses: Mycotoxic fungi and chemistry of mycotoxins:538.
 XIAOLING C., XIAOLI L., SHINING Z., JUNPING G., SHUIPING W.,
XIAOMING L., ZHIGANG S. AND YONGCHENG L. 2010. Cytotoxic and
topoisomerase I inhibitory activities from extracts of endophytic fungi isolated from
mangrove plants in Zhuhai, China. Journal of Ecology and The Natural Environment:
017-024.
 YAMAÇ M. AND BILGILI F. 2006. Antimicrobial Activities of Fruit Bodies and/or
Mycelial Cultures of Some Mushroom Isolates. Pharmaceutical Biology; 44: 660-667.

Site web
 www.aspergillus.man.ac.uk, 2019
 http://tpeconservation1s2.free.fr/moisissures.html,2020
 http://www.oxoid.com/UK/blue/prod_detail/prod_detail.asp?pr=CM0097&org=74&c=U
K&lang=FR
 http://solabia.com/solabia/produitsDiagnostic.nsf/0/31622773AEA7D493C12574B8002C
B7DF/$file/FT_G%C3%A9lose%20PDA_BK095-BM186_v8.pdf.
Annexes

Annexes
Annexes

Annexes

Milieux de culture

Deux milieux de culture ont été préparés, afin de manifester le maximum des
champignons de stockage.

Milieu de Czapek (Isolemnt d'Aspergillus)

- NaNO3 3,0 g
- MgSO4 7H2O 0,5 g
- KCl 0,5 g
- FeSO4 7H2O 0,01 g
- K2HPO4 1,0 g
- Saccharose 30,0 g
- Agar 15,0 g
Il est conseillé de compléter ce milieu par 1 ml d'une solution de ZnSO4 7H2O 1,0 g,
CuSO4 5H2O 0,5 g dans 100 ml d'eau.

Milieu Pda (Isolment des champignons)

Pour 1 litre de milieu


-200 g de pomme de terre
-15 g sucre
-20 g agar agar bactériologique
-1 litre d'eau distillée
Résumé

‫هلخص‬

Abstract

Résumé
Résumé
Résumé
Aspergillus c’est un genre des champignons capable de synthèse les mycotoxine.
Dans ce travail nous avons étudié la contamination des aliments commercialisés à l'EL- Oued par les
mycotoxines. Pour cela, un total d'échantillons, 1échantillons de blé et 1échantillons d'arachide ont été prélever
dans différents points de vente la ville d'EL- Oued. Isolement et purification des genres Aspergillus dans les
arachides et les Blé par deux méthodes : la méthode directe d’Ulster et la méthode classique de dilution Ceci
permet de répertorier trois souches: A.flavus, A.niger, A.fumigatus Les extraits obtenus par l’extraction à
l’acétate d’éthyle et le chloroforme des 3 souche Aspergillus ayant eu un résultat positif au dépistage de
l’activité antimicrobienne, les zones d’inhibitions varient pour les extraits d’acétate d’éthyle entre 0 et 13mm, et
entre 0 et 12 mm pour les extraits chloroformique.
Réductions de la toxicité des souches Aspergillus isolées par bactéries lactiques ayant eu un résultat positif par
la méthode de diffusion sur disque, les zones d’inhibitions varient pour les Lactococcuslactissubsp. Lactis entre
0 et 10mm, et entre 0 et 12 mm pour Streptococcus thermophilus.
Mot clés : Aspergillus ,Contamination, Mycotoxines, Bactéries lactiques, Réduction de la toxicite.

‫هلخص‬
‫ درسنا جلوخ األطعوة الحً ٌتحن جستوٌق ا فتً هذٌنتة‬،‫الزشاشٍات جنس هن أنواع الفطزٌات القادرة على جصنٍع السووم الفطزٌة فً هذا العول‬
‫ عٍنة هن القوح وعٍنة هن الفول السودانً هن اهاكن هخحلفة فً هذٌنتة‬، ‫ جن أخذ هجووعة هن عٍنات‬، ‫الوادي بواسطة السووم الفطزٌة ل ذا الغزض‬
‫ طزٌقتة أولستحز الوشاشتزة وطزٌقتة الحخفٍت الالسستٍالٍة الستس ت‬:‫ عزل وجنقٍة نوع الزشاشٍات فً الفول السودانً والقوح بطزٌقحٍن‬.‫وادي سوف‬
: A. Flavus A.niger A. fumigatus ً‫الحً جن جحذٌذها ه‬
‫اخحشار الوسحخلصات الحً جن الحصتول علٍ تا عتن طزٌتس ا ستحخزات باستحخذام أستٍحات كٌوٍتل وكلوروفتورم هتن الزشاشتٍات اخحلفتث نحٍجتة هنتاطس‬
.‫ هلن لوسحخلصات الاللوروفورم‬32 ‫ و‬1 ‫ وبٍن‬، ‫ هلن‬31 ‫ و‬1 ‫الحوشٍظ لوسحخلصات أسٍحات اإلٌوٍل بٍن‬
‫ جخحلت‬، ‫ الوعزولة بواسطة بالحٍزٌا حاهط اللشنٍك الحً ل ا نحٍجة اٌجابٍة عن طزٌس جقنٍة نشز القزص‬Aspergillus ‫جخفٍضات فً سوٍة سس ت‬
Lactococcus lactis sub sp. Lactis(Streptococcus ‫ هلتن للعقذٌتة الوحشتة للحتزارة‬32 ‫ و‬1 ‫ وبتٍن‬، ‫ هلتن‬31 ‫ و‬0: ‫هنتاطس الحوشتٍظ بتٍن‬
thermophilus).
.‫ بالحٍزٌا حاهط أللشنٍك‬،‫ جخفٍط السوٍة‬،‫الحلوخ‬، ‫ الزشاشٍة‬، ‫ السووم الفطزٌة‬: ‫الكلوبث الوفتبحيت‬

Abstract
Aspergillus is a genus of fungi capable of synthesizing the mycotoxin In this work, the contamination of
EL- Oued foodstuffs with mycotoxins was studied. A total of 1 samples of Wheat, 1samples of peanut were
purchased from popular markets of EL- Oued. The mycological study by two methods: From ulster and the
dilution method showed a large number of fungal contaminants. After microscopic identification The
Identification strains are: A.flavus ,A.niger, A.niger. evaluate the antimicrobial of Aspergillus by Ethyl acetate
and chloroform extracts obtained Inhibition zones vary between 0 and 13 mm for the ethyl acetate extracts, and
from 0 and 13 mm for the chloroform extracts. Reductions in the toxicity of isolated Aspergillus strains by
lactic acid bacteria having a positive result by the disk diffusion method, the zones of inhibition vary for
Lactococcuslactissubsp. Lactis between 0 and 10mm, and between 0 and 12 mm for Streptococcus
thermophilus.
Keywords:, Mycotoxin , Aspergillus, lactic acid bacteria , Contamination, Reductions in the toxicity.

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