Biologi Metabolisme (SFILE
Biologi Metabolisme (SFILE
Biologi Metabolisme (SFILE
nr BIO 3
Anabolisme
A. PENDAHULUAN Daya absorpsi energi cahaya oleh pigmen
Metabolisme adalah reaksi biokimia dalam fotosintetik pada kloroplas:
METABOLISME 1
materi78.co.nr BIO 3
D. FOTOSINTESIS Reaksi terang (light-depending reaction) adalah
Fotosintesis adalah anabolisme karbohidrat reaksi yang bergantung pada cahaya, dan terjadi
yang membutuhkan cahaya sebagai sumber dalam tilakoid (grana).
energi. Reaksi terang secara singkat:
Tahapan fotosintesis adalah reaksi terang dan NADPH
reaksi gelap. H2O d O2 + NADP+ + H+ + e + ATP
(reaksi tidak setara)
2e
4H+
4e ATP NADP+
pQ cyt ADP
reduktase
PII/P680 4e 4e PI/P700
pC
2e Fd
2e NADPH
2H2O 4e
O2 + 4e + 4H+ 2e NADP+
ruang tilakoid
membran
tilakoid
ATP sintase
stroma
ADP
pQ plastokuinon PII/P680 fotosistem II ATP
cyt kompleks sitokrom PI/P700 fotosistem I
pC plastosianin Fd kompleks ferredoksin 4H+
METABOLISME 2
materi78.co.nr BIO 3
Hasil reaksi terang berupa ATP dan NADPH, 2) Jalur C4 (jalur Hatch-Slack)
serta H+ dari ATP sintase selanjutnya digunakan Jalur C4 dilakukan oleh tumbuhan yang hidup
dalam reaksi gelap. di lahan terbuka tidak teduh.
Tumbuhan dapat menentukan penggunaan Tumbuhan C4 tidak dapat membuka
sistem transpor elektron. stomatanya secara penuh pada siang hari,
1) Jika jumlah ATP untuk reaksi gelap cukup, sehingga CO2 ditimbun terlebih dahulu
maka sistem yang dominan adalah aliran menjadi oksaloasetat (atom karbon 4) baru
elektron non-siklik. kemudian mengalami siklus Calvin.
2) Jika jumlah ATP untuk reaksi gelap kurang, CO2
NADPH akan terakumulasi, menyebabkan 1C
d C6H12O6 + NADP+
(reaksi tidak setara)
Reaksi gelap dapat berlangsung menurut empat CO2
1C
macam jalur:
1) Jalur C3 (siklus Calvin) SIKLUS CALVIN
Jalur C3 dilakukan oleh tumbuhan pada
Pada tumbuhan C4, penimbunan terjadi pada
umumnya.
mesofil, sedangkan siklus Calvin terjadi di
Pada jalur C3, fiksasi CO2 menghasilkan PGA jaringan penyokong vaskuler.
(atom karbon 3). Siklus Calvin terjadi pada
3) Jalur CAM (Crassulacean Acid Metabolism)
mesofil.
Jalur CAM dilakukan oleh tumbuhan yang
6CO2 hidup di iklim gurun/kering atau epifit,
ribulosa bifosfat 1C
karboksilase contohnya famili Crassulaceae, Agavaceae
(rubisko) FIKSASI CO2
dan Cactaceae.
Tumbuhan CAM tidak dapat membuka
6 ribulosa 1,5- stomatanya sama sekali pada siang hari,
bifosfat (RuBP)
5C 6 3-fosfogliserat 6 3-fosfogliserat sehingga CO2 ditimbun seperti jalur C4 pada
(PGA) (PGA) malam hari, namun siklus Calvin baru terjadi
pada siang hari keesokannya.
REGENERASI
6ATP 3C 3C 6ATP
4) Jalur C2/fotorespirasi (jalur Glikolat)
REDUKSI
6ADP 6ADP Jalur C2 terjadi apabila tumbuhan mendapat
6ATP 6 1,3- 6 1,3- intensitas cahaya yang terlalu tinggi.
bifosfogliserat bifosfogliserat Akibat intensitas cahaya terlalu tinggi:
(BPG) (BPG)
4P 6ADP a. Konsentrasi O2 dalam daun menjadi
6P tinggi, sehingga CO2 tidak dapat masuk.
6NADPH 6NADPH
6P b. O2 akan diikat oleh RuBP (fotorespirasi).
10 dihidroksi- 6NADP+ 6NADP+ c. Tidak terjadi fotosintesis (menurunkan
aseton fosfat
3C 12 gliseraldehida produksi glukosa).
3-fosfat (PGAL) Glukosa yang dihasilkan tumbuhan dapat
10 PGAL 3C dimodifikasi menjadi karbohidrat, protein atau
lemak, dan disimpan dalam bentuk cadangan
SINTESIS makanan yang berbeda-beda.
glukosa 2 PGAL
6C
2P
METABOLISME 3
materi78.co.nr BIO 3
Percobaan sederhana para ilmuwan yang 5) Percobaan lain-lain
menjelaskan proses fotosintesis antara lain: Fotosintesis akan menghasilkan O2 lebih
1) Percobaan Ingenhousz banyak jika:
Percobaan Ingenhousz dilakukan meng- a. Kadar CO2 meningkat.
gunakan Hydrilla sp. b. Intensitas cahaya meningkat.
c. Gelombang cahaya optimal (selain
kuning dan hijau).
gelembung
O2 E. KEMOSINTESIS
Kemosintesis adalah anabolisme karbohidrat
yang membutuhkan senyawa kimia sebagai
H2O sumber energi.
Hydrilla sp. Kemosintesis dilakukan oleh oleh bakteri
kemoautotrof, dan merupakan reaksi oksidasi.
Fotosintesis membutuhkan cahaya dan Contoh-contoh kemosintesis:
H2O, dan menghasilkan O2. 1) Bakteri nitritasi
2) Percobaan Sachs Contoh: Nitrosomonas dan Nitrosococcus.
Percobaan Sachs dilakukan dengan menutup 2NH4+ + 3O2 → 2NO2- + 2H2O + energi
sebagian daun selama sehari. 2) Bakteri nitratasi
Tahapan percobaan Sachs: Contoh: Nitrobacter dan Nitrococcus.
1. Daun yang telah diberi perlakuan direbus 2NO2- + 3O2 → 2NO3- + energi
dalam air. 3) Bakteri hidrogen
2. Rebus secara tidak langsung alkohol dan Contoh: Hydrogenobacter dan Bacillus
daun untuk melarutkan klorofil. panctotrophus.
3. Ambil daun dan letakkan pada cawan 2H2 + O2 → 2H2O + energi
petri untuk ditetesi lugol/iodin.
4) Bakteri metana
4. Bagian daun yang ditutup akan berubah
Contoh: Methanonas.
warna menjadi pucat, sedangkan yang
CH4 + 2O2 → CO2 + 2H2O + energi
tidak ditutup berwarna biru tua atau
5) Bakteri belerang
hitam.
Contoh: Beggiatoa dan Thiospirillum.
Fotosintesis menghasilkan glukosa
2H2S + O2 → 2S + 2H2O + energi
(amilum).
2S + 2H2 + 3O2 → 2H2SO4 + energi
3) Percobaan Engelmann 6) Bakteri besi
Percobaan Engelmann dilakukan meng- Contoh: Galionella, Thiobacillus ferooxidans,
gunakan alga Spirogyra dan bakteri aerob. Leptothrix.
koloni bakteri Fe2+ → Fe3+ + energi
aerob Spirogyra
4FeCO3 + O2 + 6H2O → 4Fe(OH)3 + 4CO2 +
energi
Energi yang dihasilkan dari kemosintesis
selanjutnya digunakan untuk membentuk
glukosa dari CO2, CO32- atau CH4.
kloroplas
METABOLISME 4
materi78.co.nr BIO 3
Katabolisme
A. PENDAHULUAN glukosa
6C
Metabolisme adalah reaksi biokimia dalam ATP
tubuh makhluk hidup yang melibatkan substrat
heksokinase
dan enzim untuk menghasilkan produk.
ADP
Metabolisme terbagi menjadi dua, yaitu glukosa 6-fosfat
katabolisme dan anabolisme.
Pengertian katabolisme dan anabolisme: fosfoglukosa isomerase
Katabolisme Anabolisme fruktosa 6-fosfat
mengubah senyawa mengubah senyawa
ATP
organik menjadi anorganik menjadi
senyawa anorganik senyawa organik fosfofruktokinase
mengurai molekul menyusun (sintesis) ADP
fruktosa-1,6-difosfat
kompleks menjadi molekul sederhana
sederhana menjadi kompleks
menghasilkan ATP menggunakan ATP aldolase
METABOLISME 1
materi78.co.nr BIO 3
Reaksi dekarboksilasi oksidatif asam piruvat: 2 asetil-KoA
2C
2NADH
2KoA
2 a.piruvat d 2 asetil-KoA + 2NAD+ + 2H+ + 4e + 2CO2 2NAD+ 2 oksalo-
2 sitrat
2 asam piruvat 2NADH asetat 6C 2H2O
3C
4C 2H2O
2NAD+ 2 malat 2H2O
2 isositrat
1C 2H2O
2NADH 1C
2CO2 2 fumarat 2NAD+
2 asetil 2CO2
2FAD
2C 2NADH
2koenzim A 2FADH2 2 α-ketoglutarat
(KoA) 2 suksinat 2NAD+ 5C
2KoA 1C
2NADH
2 asetil-KoA 2CO2
2ADP + 2P 2 suksinil-KoA 2H2O
Siklus Kreb (siklus asam sitrat) adalah siklus yang 4C 2KoA
2 ATP
terjadi setelah dekarboksilasi oksidatif asam
Transpor elektron (kemiosmosis) adalah proses
piruvat. Siklus ini terjadi dalam matriks mitokondria.
pelepasan energi berupa proton (H+) dan
Reaksi siklus Kreb:
elektron (e) dari molekul NADH dan FADH2 yang
6NADH dibentuk selama katabolisme. Reaksi ini terjadi
dalam matriks mitokondria.
2 asetil-KoA d 6NAD+ + 6H+ + 12e
Reaksi transpor elektron:
+ 2FAD + 4H+ + 4e + 4CO2 + 2ATP
10 NADH + O2 d 10 NAD+ + H2O + 30 ATP
2FADH2 2 FADH2 + O2 d 2 FAD + H2O + 4 ATP
I NADH dehidrogenase cyt b sitokrom b H+
II suksinat dehidrogenase cyt c sitokrom c H+
Q ubikuinon cyt a sitokrom a H+
H+
H+ H + H+ O2 ruang
H+
intermembran
Q
membran
I e cyt c
cyt b cyt a dalam
II
ATP sintase
matriks
10 NADH mitokondria
e
10 H+ + 20 e + NAD+ 2FADH2 FAD + 4 H+ + 2 e ADP + P
24e + 6O2 + 24H+ H+
H+ dipompa keluar 3 H+ dipompa keluar 2 ATP
kali melalui: kali melalui: 12H2O
kompleks I cyt b 6H2O
cyt b cyt a 6H2O
cyt a
SIKLUS KREB
METABOLISME 2
materi78.co.nr BIO 3
5) Poin 2, 3, dan 4 menyebabkan perbedaan Pembentukan etanol atau asam laktat
gradien muatan, sehingga proton dipompa dilakukan setelah glikolisis jika sel mengalami
kembali melalui ATP-sintase. kekurangan O2. Jika tidak, maka akan dilanjutkan
6) Proton (H+) yang bergerak melalui ATP- ke respirasi aerob.
sintase memacu pembentukan ATP (sesuai Pembentukan etanol dilakukan oleh jamur
jumlah yang telah dihitung di atas). golongan ragi (contohnya Saccharomyces).
ADP + P d ATP
7) Agar ATP tetap terbentuk, proton dan
elektron pada akhir sistem transpor akan Reaksi pembentukan etanol:
berikatan dengan O2 membentuk air (O2 2 asam piruvat d 2C2H5OH + 2CO2
sebagai penerima elektron terakhir).
2 asam piruvat
24H+ + 6O2 + 24e d 12H2O 2H2O 3C
Respirasi aerob menghasilkan ATP sejumlah:
piruvat 1C
Tahapan +ATP -ATP karboksilase 2CO2
Glikolisis 4 ATP 2 ATP 2 asetaldehida
Dekarboksilasi oksidatif - - 2C
2NADH
Siklus Kreb 2 ATP - alkohol
Transfer elektron 34 ATP - dehidrogenase
2NAD+
Total 38 ATP
2 etanol
D. RESPIRASI ANAEROB
Pembentukan asam laktat dilakukan oleh
Respirasi anaerob (fermentasi) adalah
hewan dan manusia.
katabolisme karbohidrat yang membutuhkan
Reaksi pembentukan asam laktat:
senyawa selain O2 sebagai oksidator (penerima
elektron terakhir dari reaksi). 2 asam piruvat d 2 asam laktat
2NADH
Respirasi anaerob menghasilkan ATP sejumlah:
+ +
glukosa d 2 a.piruvat + 2NAD + 2H + 4e + 2ATP Tahapan +ATP -ATP
glukosa Glikolisis 4 ATP 2 ATP
6C Pembentukan asam laktat - -
2ATP
Total 2 ATP
METABOLISME 3
materi78.co.nr BIO 3
E. KATABOLISME LEMAK DAN PROTEIN a. Mengubah asam lemak menjadi asetil-
Tahapan katabolisme lemak: KoA.
Katabolisme asam lemak b. Mengubah gliserol menjadi PGAL.
1) Reaksi β-oksidasi 3) Katabolisme protein masuk ke dalam
sistem katabolisme karbohidrat dengan
Asam lemak bebas diaktifkan dulu menjadi
transminasi atau deaminasi asam amino
asam lemak palmitat-KoA (asil-KoA), dengan
menjadi suatu rantai atom karbon.
menggunakan 2 ATP.
Asil-KoA akan dibawa menuju mitokondria
sel dan dioksidasi menjadi asetil-KoA.
asil-KoA + 7O2
d 8 asetil-KoA + 42H2O + 35 ATP
2) Siklus Kreb
Dalam siklus Kreb, asetil-KoA akan dioksidasi
menjadi CO2.
8 asetil-KoA + 16O2
d 104H2O + 16CO2 + 96 ATP
Katabolisme gliserol
1) Gliserol akan diubah menjadi gliseraldehida
3-fosfat (PGAL).
2) Gliseraldehida 3-fosfat selanjutnya masuk ke
katabolisme karbohidrat.
Katabolisme asam lemak menghasilkan ATP
sejumlah:
Tahapan +ATP -ATP
Reaksi β-oksidasi 35 ATP 2 ATP
Siklus Kreb 96 ATP -
Total 129 ATP
METABOLISME 4