Fuente: https://www.genome.

gov/11510905/preguntas-maacutes-frecuentes/

Qu es un genoma?

Un genoma es una coleccin completa de cido desoxirribonucleico (ADN) de un

organismo, o sea un compuesto qumico que contiene las instrucciones genticas
necesarias para desarrollar y dirigir las actividades de todo organismo. Las molculas del
ADN estn conformadas por dos hlices torcidas y emparejadas. Cada hlice est formada
por cuatro unidades qumicas, denominadas bases nucletidas. Las bases son adenina (A),
timina (T), guanina (G) y citosina (C). Las bases en las hlices opuestas se emparejan
especficamente; una A siempre se empareja con una T, y una C siempre con una G.

El genoma humano contiene aproximadamente 3.000 millones de estos pares de bases,

los cuales se encuentran en los 23 pares de cromosomas dentro del ncleo de todas
nuestras clulas. Cada cromosoma contiene cientos de miles de genes, los cuales tienen
las instrucciones para hacer protenas. Cada uno de los 30.000 genes estimados en el
genoma humano produce un promedio de tres protenas.

Qu es secuenciar y cmo se secuencia un genoma?

Secuenciar significa determinar el orden exacto de los pares de bases en un segmento de

ADN. Los cromosomas humanos tienen entre 50.000.000 a 300.000.000 pares de bases.
Debido a que las bases existen en pares, y la identidad de una de las bases en el par
determina el otro miembro del par, los cientficos no tienen que presentar las dos bases
del par.

El principal mtodo utilizado por el PGH para producir la versin final del cdigo gentico
humano se basa en un mapa, o en una secuencia basada en BAC, que es el acrnimo en
ingls de "cromosoma artificial bacteriano". El ADN humano es fragmentado en piezas
relativamente grandes pero de un tamao manejable (entre 150.000 y 200.000 pares de
bases). Los fragmentos son clonados en bacterias, las cuales almacenan y replican el ADN
humano para que as pueda ser preparado en cantidades lo suficientemente grandes
como para secuenciarlo. Si se los escoge cuidadosamente para minimizar las
superposiciones, se necesita unos 20.000 clones BAC diferentes para abarcar los 3.000
millones de pares de bases del genoma humano. A la coleccin de clones BAC que
contienen todo el genoma humano se la denomina una "biblioteca BAC".

En el mtodo basado en BAC, se hace un "mapeo" de cada clon BAC para determinar el
lugar de donde proviene el ADN del genoma humano en los clones BAC. El uso de este
enfoque garantiza que los cientficos puedan conocer la ubicacin exacta de las letras del
ADN que son secuenciadas en cada clon y su relacin espacial con el ADN humano
secuenciado en otros clones BAC.

Para la secuenciacin, se corta a cada clon BAC en fragmentos todava ms pequeos que
tienen una longitud de cerca de 2.000 bases. Estas piezas se denominan "subclones". En
estos subclones se lleva a cabo una "reaccin en secuencia". Despus, los productos de la
reaccin en secuencia son introducidos en la mquina secuenciadora (secuenciador). El
secuenciador genera de 500 a 800 pares de bases de A, T, C y G en cada reaccin en
secuencia, por lo que cada base es secuenciada unas diez veces. Luego una computadora
juntas estas secuencias cortas para formar tramos continuos de secuencia que
representan el ADN humano en el clon BAC.

De quin fue el ADN secuenciado en el Proyecto Genoma Humano?

Esto se mantiene intencionalmente en secreto para proteger a los voluntarios que

proporcionaron las muestras de ADN para su secuenciacin. La secuencia se deriva del
ADN de varios voluntarios. Para garantizar que no sean reveladas las identidades de los
voluntarios, se desarroll un proceso muy cuidadoso para contratar a los voluntarios y
para reunir y mantener las muestras de sangre que fueron la fuente del ADN.

Los voluntarios respondieron a los anuncios pblicos locales colocados cerca de los
laboratorios donde fueron preparadas las "bibliotecas" de ADN. Los candidatos fueron
contratados entre una poblacin diversa. Los voluntarios proporcionaron muestras de
sangre despus de haber sido aconsejados extensamente y luego dieron su
consentimiento informado. De 5 a 10 veces los voluntarios donaron sangre y sta fue
eventualmente usada en la misma proporcin, por lo cual ni siquiera los voluntarios
podan conocer si su muestra fue utilizada. Se quitaron todas las etiquetas antes de elegir
las muestras reales.

Qu quiere decir que se ha terminado el Proyecto Genoma Humano?

El objetivo principal del Proyecto Genoma Humano fue definido por primera vez en 1988
por una comisin especial de la Academia Nacional de Ciencias (NAS) de EE.UU., y fue
adoptado ms tarde mediante una serie detallada de planes quinquenales escritos
conjuntamente por los Institutos Nacionales de la Salud y el Departamento de Energa. En
este momento, los objetivos principales trazados por la Academia Nacional de Ciencias
han sido logrados, incluyendo la terminacin esencial de una versin de alta calidad de la
secuencia humana. Otros objetivos incluan la creacin de mapas fsicos y genticos del
genoma humano, los cuales se lograron a mediados de la dcada de 1990, as como
tambin el mapeo y secuenciacin de un juego de cinco organismos modelo, incluyendo el
ratn. Todos estos objetivos fueron logrados dentro del tiempo y el presupuesto
estimados primeramente por la comisin de la NAS.

De forma notable, un gran nmero adicional de objetivos que no se consideraban posibles

en 1988 fueron aadidos durante el camino y se los logr con xito. Los ejemplos incluyen
bosquejos avanzados de las secuencias de los genomas del ratn y la rata, y tambin un
catlogo de bases variables en el genoma humano.

El genoma humano ha sido secuenciado completamente?

S - dentro de los lmites de la tecnologa de hoy, el genoma humano est tan completo
como debe estarlo. Permanecen pequeos vacos que son irrecuperables en cualquier
mtodo actual de secuenciacin, y totalizan alrededor del 1 por ciento de la porcin del
genoma que contiene los genes, o eucromatina. Se deben inventar nuevas tecnologas
para obtener la secuencia de esas regiones.

Sin embargo, la porcin del genoma que contiene los genes est completa en casi todas
las formas funcionales para propsitos de investigacin cientfica y est disponible de
manera pblica y gratuita. Aunque ahora est terminado el Proyecto Genoma Humano,
los cientficos continuarn desarrollando y aplicando nuevas tecnologas para los pocos
problemas difciles que restan. Por su parte, NHGRI continuar apoyando una amplia
variedad de investigaciones para desarrollar nuevas tecnologas de secuenciacin, para
interpretar la secuencia humana y utilizar la nueva comprensin del genoma humano para
mejorar la salud humana.

No anunciaron ustedes hace tres aos, en una ceremonia en la Casa Blanca, que la
secuencia del genoma humano estaba completa?

El 26 de junio de 2000, el Consorcio Internacional para la Secuenciacin del Genoma

Humano anunci la produccin de un borrador de la secuencia del genoma humano. En
abril de 2003, este consorcio anunci una versin esencial terminada de la secuencia del
genoma humano. Esta versin, que est disponible para el pblico, proporciona casi toda
la informacin necesaria para hacer investigaciones utilizando el genoma completo.

La diferencia entre el borrador y las versiones finales est definida por la cobertura, el
nmero de vacos y el ndice de error. El borrador de la secuencia cubra el 90 por ciento
del genoma con un ndice de error de uno en 1.000 pares de bases, pero haba ms de
150.000 vacos y slo el 28 por ciento del genoma haba alcanzado el criterio de
terminado. En la versin de abril de 2003, existen menos de 400 vacos y el 99 por ciento
del genoma est terminado con un ndice de exactitud de menos de un error por cada
10.000 pares de bases. Las diferencias entre las dos versiones son significativas para los
cientficos que utilizan la secuencia para realizar investigaciones.

Quin posee el genoma humano?

Todas las partes del genoma secuenciado por el Proyecto Genoma Humano fueron hechas
pblicas inmediatamente - en realidad, los nuevos datos sobre el genoma se anuncian
cada 24 horas. Es verdad que en aos pasados las compaas privadas han presentado
miles de patentes sobre genes humanos. Desconocemos cuntas de dichas patentes se
han presentado, o si se han concedido las patentes o si stas se pueden hacer cumplir. La
mayor parte de solicitudes de patentes no han sido consideradas, por lo que
desconocemos realmente cunto del genoma, si hay algo, puede ser utilizado
gratuitamente para propsitos comerciales.

Quin particip en el Consorcio Internacional del Proyecto Genoma Humano?

El Proyecto Genoma Humano no se hubiera terminado tan pronto y eficazmente sin la

fuerte participacin de las instituciones internacionales. En Estados Unidos, los
contribuyentes al esfuerzo incluyen a los Institutos Nacionales de la Salud (NIH), que
empezaron a participar en 1988 cuando crearon la Oficina para la Investigacin del
Genoma Humano, que luego fue ascendida a Centro Nacional para la Investigacin del
Genoma Humano en 1990, y despus a Instituto Nacional para la Investigacin del
Genoma Humano (NHGRI) en 1997; y el Departamento de Energa (DOE) de EE.UU., donde
las discusiones sobre el PGH empezaron ya en 1984. Sin embargo, casi toda la
secuenciacin verdadera del genoma fue realizada en numerosas universidades y centros
de investigacin en todo Estados Unidos, el Reino Unido, Francia, Alemania, Japn y China.

El Consorcio Internacional para la Secuenciacin del Genoma Humano incluye:

El Whitehead Institute/MIT Center for Genome Research, Cambridge, Mass., EE.UU.

El Wellcome Trust Sanger Institute, el Wellcome Trust Genome Campus, Hinxton,

Cambridgeshire, Reino Unido

Washington University School of Medicine Genome Sequencing Center, St. Louis, Mo.,
EE.UU.

United States DOE Joint Genome Institute, Walnut Creek, Calif., EE.UU.

Baylor College of Medicine Human Genome Sequencing Center, Department of Molecular

and Human Genetics, Houston, Tex., EE.UU.

RIKEN Genomic Sciences Center, Yokohama, Japn

Genoscope y CNRS UMR-8030, Evry Cedex, Francia

GTC Sequencing Center, Genome Therapeutics Corporation, Waltham, Mass., EE.UU.

Department of Genome Analysis, Institute of Molecular Biotechnology, Jena, Alemania

Beijing Genomics Institute/Human Genome Center, Institute of Genetics, Chinese Academy

of Sciences, Beijing, China

Multimegabase Sequencing Center, The Institute for Systems Biology, Seattle, Wash.,
EE.UU.

Stanford Genome Technology Center, Stanford, Calif., EE.UU.

Stanford Human Genome Center and Department of Genetics, Stanford University School
of Medicine, Stanford, Calif., EE.UU.

University of Washington Genome Center, Seattle, Wash., EE.UU.

Department of Molecular Biology, Keio University School of Medicine, Tokio, Japn

University of Texas Southwestern Medical Center at Dallas, Dallas, Tex., EE.UU.

University of Oklahoma's Advanced Center for Genome Technology, Dept. of Chemistry

and Biochemistry, University of Oklahoma, Norman, Okla., EE.UU.

Max Planck Institute for Molecular Genetics, Berln, Alemania

Cold Spring Harbor Laboratory, Lita Annenberg Hazen Genome Center, Cold Spring Harbor,
N.Y., EE.UU.

GBF - German Research Centre for Biotechnology, Braunschweig, Alemania

Cunto cost a los contribuyentes estadounidenses el Proyecto Genoma Humano?

En 1990, el Congreso estableci el financiamiento para el Proyecto Genoma Humano y fij

como fecha de terminacin el 2005. Aunque los estimados sugeran que el proyecto
costara un total de $3.000 millones durante este perodo, el proyecto termin costando
menos de lo esperado, cerca de $2.700 millones en dlares del ao fiscal 1991. Adems, el
proyecto se termin ms de dos aos antes de la fecha programada.

Tambin es importante considerar que el Proyecto Genoma Humano probablemente se

pagar econmicamente por s solo muchas veces - si se considera que la investigacin
basada en el genoma jugar un papel importante en la implantacin de industrias
biotecnolgicas y de desarrollo de medicamentos, sin mencionar el mejoramiento de la
salud humana.

Por qu se apart una porcin del presupuesto de NHGRI para consideraciones ticas?

Desde el comienzo del Proyecto Genoma Humano, ha estado claro que la expansin del
conocimiento cientfico sobre el genoma tendra un profundo impacto en la humanidad.
Para maximizar el potencial de los efectos beneficiosos, mientras se minimizan al mismo
tiempo los riesgos de los efectos perjudiciales, fue esencial realizar la investigacin sobre
una amplia gama de temas relacionados con la adquisicin y utilizacin de la informacin
genmica.

El cinco por ciento del presupuesto anual del NHGRI est dedicado al anlisis de las
implicaciones ticas, legales y sociales (ELSI, por sus siglas en ingls) relacionadas con la
investigacin del genoma humano, incorporando recomendaciones especficas a las
actividades del NHGRI y proporcionando orientacin a quienes establecen las polticas y al
pblico. El programa ELSI del NHGRI, del cual se considera que no tiene precedentes en las
ciencias biomdicas en trminos de alcance y nivel de prioridad, proporciona una base
efectiva desde la cual se valoran las implicaciones de la investigacin del genoma, y ha
dado como resultado varias mejoras notables al PGH.

Un ejemplo es la decisin de secuenciar el ADN de varios individuos annimos en lugar de

hacerlo de un individuo conocido, a fin de proteger la privacidad. Otro ejemplo es el
desarrollo de pautas de privacidad gentica y borradores de legislacin que son
ampliamente utilizados. El programa ELSI del NHGRI se utiliza ahora como modelo para los
grandes esfuerzos cientficos financiados con fondos pblicos.

Cmo se presenta el panorama de la ciencia mdica para los prximos 50 aos?

Tener la secuencia esencial completa del genoma humano es similar a tener todas las
pginas de un manual que se necesita para hacer el cuerpo humano. Ahora, el desafo
para los investigadores y cientficos es determinar la forma de leer el contenido de todas
esas pginas, luego entender cmo trabajan todas las partes juntas y descubrir la base
gentica de la salud y la patologa de las enfermedades humanas. A este respecto, la
investigacin basada en el genoma permitir eventualmente a la ciencia mdica el
desarrollar unas herramientas de diagnstico altamente eficaces, para entender mejor las
necesidades de salud de la gente sobre la base de su composicin gentica individual, y
para disear tratamientos nuevos y altamente eficaces para las enfermedades.

Los anlisis individualizados, basados en el genoma de cada persona, conducirn a una

forma muy poderosa de medicina preventiva. Seremos capaces de aprender sobre los
riesgos de enfermedades futuras en base al anlisis del ADN. Mdicos, enfermeras,
consejeros genticos y otros profesionales del cuidado de la salud podrn trabajar con las
personas para concentrar los esfuerzos en las cosas que son ms probables que
mantengan la salud de un individuo en particular. Esto podra significar una dieta o un
cambio en el estilo de vida, o podra significar vigilancia mdica. Pero habr un aspecto
personalizado sobre lo que haremos para mantenernos sanos. Luego, a travs de nuestra
comprensin a nivel molecular sobre la forma en que aparecen cosas como la diabetes, las
enfermedades cardacas o la esquizofrenia, podremos ver toda una nueva generacin de
intervenciones, muchas de las cuales sern medicinas bastante ms eficaces y precisas
que aquellas que estn disponibles hoy en da.

Cundo podemos esperar medicinas nuevas y mejores?

Es importante ser cuidadoso en cuanto a la creacin de expectativas. La mayor parte de

las nuevas medicinas basadas en el genoma completo aparecern quizs en unos 10 a 15
aos, aunque ms de 350 productos biotcnicos - muchos basados en la investigacin
gentica - se encuentran actualmente en ensayos clnicos, segn la Organizacin de la
Industria Biotecnolgica. Por lo general toma ms de una dcada para que una compaa
realice la clase de estudios clnicos necesarios para obtener la aprobacin de mercadeo de
parte de la Administracin de Alimentos y Medicinas.

Los exmenes, sin embargo, llegarn ms rpidamente, especialmente la capacidad de

predecir los riesgos futuros de salud para un individuo, y la capacidad para implementar
un mtodo mejor en medicina preventiva. En la prxima dcada, tambin estaremos
mejor capacitados para determinar las medicinas que funcionan mejor para los individuos,
sobre la base de su composicin gentica.

Cmo ha afectado el Proyecto Genoma Humano a la investigacin biolgica?

La investigacin biolgica ha sido tradicionalmente una empresa bastante individualista,

con los investigadores realizando sus bsquedas mdicas ms o menos
independientemente. La magnitud de los desafos tecnolgicos y la inversin financiera
necesaria impuls al Proyecto Genoma Humano a reunir equipos interdisciplinarios, que
abarcaban desde ingeniera, informtica, as como tambin biologa; procedimientos
automticos siempre que sean posibles; e investigacin concentrada en los centros
principales para maximizar las economas de escala.

Como resultado, la investigacin que involucra a otros proyectos relacionados con el

genoma (por ejemplo, el Proyecto Internacional HapMap para estudiar la variacin
gentica humana y la Enciclopedia de Elementos de ADN, o Proyecto ENCODE) se
caracteriza ahora por esfuerzos a gran escala y cooperativos que abarcan a muchas
instituciones, a menudo de muchos pases diferentes, trabajando en colaboracin. La era
de la investigacin en equipos ya est aqu.

Adems, para introducir enfoques a gran escala en biologa, el Proyecto Genoma Humano
produjo toda clase de nuevas herramientas y tecnologas que pueden ser utilizadas por
cientficos individuales para llevar a cabo investigaciones a menor escala de una forma
mucho ms eficaz.

La era del genoma empez en abril?

S. Estamos entrando a una nueva era de descubrimientos que transformarn la salud

humana. Nuestro conocimiento eventual sobre el funcionamiento del genoma tiene el
potencial para cambiar de forma fundamental las percepciones ms bsicas de nuestro
mundo biolgico. Es difcil predecir lo que se aprender y cmo se aplicar el
conocimiento futuro, pero hay pocas dudas de que la comprensin del genoma
revolucionar nuestro concepto de salud y mejorar la condicin humana de forma
notable.

Ahora que el genoma est completo, qu har el NHGRI?

La visin de futuro del NHGRI, que se publicar el 24 de abril de 2003 en la revista Nature,
detalla un panorama diverso y excitante de nuevas posibilidades. El NHGRI se enfocar
particularmente en las oportunidades para aplicar los resultados del Proyecto Genoma
Humano en avances en medicina, incluyendo proyectos que se elaborarn sobre la
secuencia completa del genoma humano. Esto es particularmente verdadero para
proyectos de gran alcance internacional que requieren de una extensa coordinacin e
inversin pblica para garantizar que los resultados y los descubrimientos permanezcan
disponibles gratuitamente en el dominio pblico.

Un ejemplo es el proyecto del NHGRI de hacer un mapa de la variacin gentica, o

HapMap, el cual acelerar el descubrimiento de genes relacionados con enfermedades
comunes como el asma, cncer, diabetes y enfermedades cardacas. El HapMap tambin
podra ser un recurso poderoso para el estudio de los factores genticos que contribuyen
a la variacin en respuesta a las influencias medioambientales, en la susceptibilidad a las
infecciones y en la eficacia de los medicamentos y vacunas. Otro ejemplo es el proyecto
ENCODE, que se propone crear una enciclopedia total de los elementos funcionales
codificados en la secuencia del ADN, catalogando la identidad y la ubicacin precisa de
todos los genes codificantes o no codificantes de protenas dentro del genoma.