Molécula Historia - Wikipedia, La Enciclopedia Libre
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Casi toda la química orgánica y buena parte de la química inorgánica se ocupan de la síntesis y reactividad de
moléculas y compuestos moleculares. La química física y, especialmente, la química cuántica también
estudian, cuantitativamente, en su caso, las propiedades y reactividad de las moléculas. La bioquímica está
íntimamente relacionada con la biología molecular, ya que ambas estudian a los seres vivos a nivel molecular.
El estudio de las interacciones específicas entre moléculas, incluyendo el
reconocimiento molecular es el campo de estudio de la química
supramolecular. Estas fuerzas explican las propiedades físicas como la
solubilidad o el punto de ebullición de un compuesto molecular.13
Las moléculas rara vez se encuentran sin interacción entre ellas, salvo en
gases enrarecidos y en los gases nobles. Así, pueden encontrarse en redes
cristalinas, como el caso de las moléculas de H2O en el hielo o con
interacciones intensas, pero que cambian rápidamente de direccionalidad,
como en el agua líquida. En orden creciente de intensidad, las fuerzas
intermoleculares más relevantes son: las fuerzas de Van der Waals y los
puentes de hidrógeno. Una imagen de microscopía de
túnel de barrido de moléculas de
La dinámica molecular es un método de simulación por computadora que pentaceno, que consisten en
utiliza estas fuerzas para tratar de explicar las propiedades de las cadenas lineales de cinco anillos de
moléculas. carbono.2
Ciencia molecular
La ciencia de las moléculas se denomina química molecular o física molecular, dependiendo de si se centra
en la química o en la física. La química molecular se ocupa de las leyes que rigen la interacción entre las
moléculas que da lugar a la formación y ruptura de enlaces químicos, mientras que la física molecular se
ocupa de las leyes que rigen su estructura y propiedades. En la práctica, sin embargo, esta distinción es
imprecisa. En las ciencias moleculares, una molécula consiste en un sistema estable (estado ligado)
compuesto por dos o más átomos. Los iones poliatómicos pueden considerarse a veces como moléculas
cargadas eléctricamente. El término molécula inestable se utiliza para especies muy reactivas, es decir,
conjuntos de corta duración (resonancias) de electrones y núcleos, como radicales, iones moleculares,
moléculas de Rydberg, estados de transición, complejos de van der Waals, o sistemas de átomos en colisión
como en el condensado de Bose-Einstein.
Historia y etimología
Según la Real Academia Española el vocablo «molécula» deriva del latín moles 'mole' o 'masa' y el sufijo
diminutivo -ula 'masa pequeña'.14
Molécula (1794) - «partícula extremadamente diminuta», del francés molécule (1678), del Nuevo Latín
molecula, diminutivo del latín moles masa, barrera. Un significado vago al principio; la moda de la
palabra (utilizada hasta finales del siglo xviii solo en forma latina) se remonta a la filosofía de
Descartes.15 16
La definición de molécula ha ido evolucionando a medida que ha aumentado el conocimiento de la estructura
de las moléculas. Las definiciones anteriores eran menos precisas, y definían las moléculas como las
partículas más pequeñas de sustancia químicas puras que aún conservan su composición y sus propiedades
químicas.17 Esta definición a menudo se rompe ya que muchas sustancias en la experiencia ordinaria, como
rocas, sales, y metales, se componen de grandes redes cristalinas de átomos de enlace químico o iones, pero
no están hechas de moléculas discretas.
Las moléculas lábiles pueden perder su consistencia en tiempos relativamente cortos, pero si el tiempo de
vida medio es del orden de unas pocas vibraciones moleculares, estamos ante un estado de transición que no
se puede considerar molécula. Actualmente, es posible el uso de láser pulsado para el estudio de la química de
estos sistemas.
Las entidades que comparten la definición de las moléculas, pero tienen carga eléctrica se denominan iones
poliatómicos, iones moleculares o moléculas ion. Las sales compuestas por iones poliatómicos se
clasifican habitualmente dentro de los materiales de base molecular o materiales moleculares.
Las moléculas están formadas por partículas. Una molécula viene a ser la
porción de materia más pequeña que aún conserva las propiedades de la
materia original. Las moléculas se encuentran fuertemente enlazadas con
la finalidad de formar materia. Las moléculas están formadas por átomos
unidos por medio de enlaces químicos.
Enlaces
Los átomos que forman las moléculas se mantienen juntos mediante enlaces covalentes o enlaces iónicos.
Varios tipos de elementos no metálicos existen solo como moléculas en el medio ambiente. Por ejemplo, el
hidrógeno solo existe como molécula de hidrógeno. Una molécula de un compuesto está formada por dos o
más elementos.19 Una molécula homonuclear está formada por dos o más átomos de un solo elemento.
Mientras que algunas personas dicen que un cristal metálico puede considerarse una sola molécula gigante
unida por enlaces metálicos,20 otros señalan que los metales actúan de manera muy diferente a las
moléculas.21
Covalente
Un enlace covalente es un enlace químico que implica el intercambio de pares de electrones entre átomos.
Estos pares de electrones se denominan pares compartidos o pares de enlace, y el equilibrio estable de
fuerzas atractivas y repulsivas entre átomos, cuando comparten electrones, se denomina enlace covalente.22
Iónico
El enlace iónico es un tipo de enlace
químico que implica la atracción
electrostática entre iones con carga
eléctrica opuesta y es la interacción
principal que se produce en los
El sodio y el flúor experimentan una compuestos iónicos. Los iones son Un enlace covalente que forma H2
reacción redox para formar fluoruro átomos que han perdido uno o más (derecha) donde dos átomos de
de sodio. El sodio pierde su electrón electrones (denominados cationes) y hidrógeno comparten los dos
externo para adoptar una electrones.
átomos que han ganado uno o más
configuración electrónica estable, y
electrones (denominados aniones).23
este electrón entra en el átomo de
flúor en forma exotérmica. Esta transferencia de electrones se denomina electrovalencia en contraste
con la covalencia. En el caso más simple, el catión es un átomo de metal y
el anión es un átomo no metálico, pero estos iones pueden ser de
naturaleza más complicada, por ejemplo, iones moleculares como NH4+ o SO4 2−.
Descripción
La estructura molecular puede ser descrita de diferentes formas. La fórmula molecular es útil para moléculas
sencillas, como H2O para el agua o NH3 para el amoniaco. Contiene los símbolos de los elementos presentes
en la molécula, así como su proporción indicada por los subíndices.
Para moléculas más complejas, como las que se encuentran comúnmente en química orgánica, la fórmula
química no es suficiente, y vale la pena usar una fórmula estructural o una fórmula esqueletal, las que indican
gráficamente la disposición espacial de los distintos grupos funcionales.
Cuando se quieren mostrar variadas propiedades moleculares, o se trata de sistemas muy complejos como
proteínas, ADN o polímeros, se utilizan representaciones especiales, como los modelos tridimensionales
(físicos o representados por ordenador). En proteínas, por ejemplo, cabe distinguir entre estructura primaria
(orden de los aminoácidos), secundaria (primer plegamiento en hélices, hojas, giros…), terciaria (plegamiento
de las estructuras tipo hélice/hoja/giro para dar glóbulos) y cuaternaria (organización espacial entre los
diferentes glóbulos).
En mecánica cuántica una molécula o un ion poliatómico se describe como un sistema formado por
electrones de masa y núcleos de masas . En mecánica cuántica las interacciones físicas de estos
elementos se presentan por un hamiltoniano cuántico, cuyos autovalores serán las energías permitidas del
sistema y cuyas autofunciones describirán los orbitales moleculares de la molécula, y de esos objetos se
podrán deducir las propiedades químicas de la molécula. En lo que sigue se designará mediante e, la carga de
cada electrón, mientras que la de cada núcleo, con protones, será . Para estudiar este sistema es
necesario analizar el siguiente hamiltoniano cuántico:
(1)
(2)
donde el primer término representa la interacción de los electrones entre sí, el segundo la interacción de los
electrones con los núcleos atómicos, y el tercero las interacciones de los núcleos entre sí. En una molécula
neutra se tendrá obviamente que:
Aproximación de Born-Oppenheimer
Resolver el problema de autovalores y autofunciones para el hamiltoniano cuántico dado por (1 (https://es.wi
kipedia.org/wiki/Mol%C3%A9cula#Equation_1)) es un problema matemático difícil, por lo que es común
simplificarlo de alguna manera. Así dado que los núcleos atómicos son mucho más pesados que los electrones
(entre 103 y 105 veces más) puede suponerse que los núcleos atómicos apenas se mueven comparados con los
electrones, por lo que se considera que están congelados en posiciones fijas, con lo cual se puede aproximar el
hamiltoniano (1 (https://es.wikipedia.org/wiki/Mol%C3%A9cula#Equation_1)) por la aproximación de
Born-Oppenheimer dada por:
(3)
definido sobre el espacio de funciones y donde es la posición de los núcleos que para el
análisis se considera fija. El resultado básico de este análisis viene dado por el siguiente resultado
matemático:
Teorema de Kato
Tosio Kato
La propiedad de ser autoadjunto implicará que las energías son cantidades reales, y el que sean acotados
inferiormente implicará que existe un estado fundamental de mínima energía por debajo del cual los
electrones no pueden decaer, y por tanto, las moléculas serán estables, ya que los electrones no pueden
perder y perder energía como parecían predecir las ecuaciones del electromagnetismo clásico. Dos resultados
matemáticos adicionales nos dicen como son las energías permitidas de los electrones dentro de una
molécula:24
Además dentro de la mecánica cuántica puede demostrarse que pueden existir iones positivos (cationes, con
carga positiva comparable al núcleo atómico), mientras que no es igual de fácil tener iones negativos
(aniones), el siguiente resultado matemático implica tiene que ver con la posibilidad de cationes y aniones:24
Teorema
Véase también
Compuesto químico
Nanotecnología
Número de Avogadro
Volumen molar
Sólidos moleculares
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Bibliografía
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