Molécula

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Para otros términos similares, véase Molécula (desambiguación).

Representación esquemática de los átomos (bolas negras) y los enlaces moleculares

(barras blancas-grises) de una molécula de Fullereno C60, es decir, una sustancia
elemental formada por sesenta átomos de carbono.
En química, una molécula (del nuevo latín molecula, que es un diminutivo de la
palabra moles, 'masa') es un grupo eléctricamente neutro y suficientemente estable
de al menos dos átomos en una configuración definida, unidos por enlaces químicos
fuertes (covalentes o enlace iónico).123456

En este estricto sentido, las moléculas se diferencian de los iones poliatómicos.

En la química orgánica y la bioquímica, el término "molécula" se utiliza de manera
menos estricta y se aplica también a los compuestos orgánicos (moléculas orgánicas)
y en las biomoléculas.

Antes, se definía la molécula de forma menos general y precisa, como la más pequeña
parte de una sustancia que podía tener existencia independiente y estable
conservando aún sus propiedades fisicoquímicas. De acuerdo con esta definición,
podían existir moléculas monoatómicas. En la teoría cinética de los gases, el
término molécula se aplica a cualquier partícula gaseosa con independencia de su
composición. De acuerdo con esta definición, los átomos de un gas noble se
considerarían moléculas aunque se componen de átomos no enlazados.7

Una molécula puede consistir en varios átomos de un único elemento químico, como en
el caso del oxígeno diatómico (O2),8 o de diferentes elementos, como en el caso del
agua (H2O).9Los átomos y complejos unidos por enlaces no covalentes como los
enlaces de hidrógeno o los enlaces iónicos no se suelen considerar como moléculas
individuales.

Las moléculas como componentes de la materia son comunes en las sustancias

orgánicas (y por tanto en la bioquímica). También conforman la mayor parte de los
océanos y de la atmósfera. Sin embargo, un gran número de sustancias sólidas
familiares, que incluyen la mayor parte de los minerales que componen la corteza,
el manto y el núcleo de la Tierra, contienen muchos enlaces químicos, pero no están
formados por moléculas. Además, ninguna molécula típica puede ser definida en los
cristales iónicos (sales) o en cristales covalentes, aunque estén compuestos por
celdas unitarias que se repiten, ya sea en un plano (como en el grafito) o en tres
dimensiones (como en el diamante o el cloruro de sodio). Este sistema de repetir
una estructura unitaria varias veces también es válida para la mayoría de las fases
condensadas de la materia con enlaces metálicos, lo que significa que los metales
sólidos tampoco están compuestos por moléculas. En el vidrio (sólidos que presentan
un estado vítreo desordenado), los átomos también pueden estar unidos por enlaces
químicos sin que se pueda identificar ningún tipo de molécula, pero tampoco existe
la regularidad de la repetición de unidades que caracteriza a los cristales.

Casi toda la química orgánica y buena parte de la química inorgánica se ocupan de

la síntesis y reactividad de moléculas y compuestos moleculares. La química física
y, especialmente, la química cuántica también estudian, cuantitativamente, en su
caso, las propiedades y reactividad de las moléculas. La bioquímica está
íntimamente relacionada con la biología molecular, ya que ambas estudian a los
seres vivos a nivel molecular. El estudio de las interacciones específicas entre
moléculas, incluyendo el reconocimiento molecular es el campo de estudio de la
química supramolecular. Estas fuerzas explican las propiedades físicas como la
solubilidad o el punto de ebullición de un compuesto molecular.
Las moléculas rara vez se encuentran sin interacción entre ellas, salvo en gases
enrarecidos y en los gases nobles. Así, pueden encontrarse en redes cristalinas,
como el caso de las moléculas de H2O en el hielo o con interacciones intensas, pero
que cambian rápidamente de direccionalidad, como en el agua líquida. En orden
creciente de intensidad, las fuerzas intermoleculares más relevantes son: las
fuerzas de Van der Waals y los puentes de hidrógeno.

La dinámica molecular es un método de simulación por computadora que utiliza estas

fuerzas para tratar de explicar las propiedades de las moléculas.

Índice
1 Definición y sus límites
2 Tipos de moléculas
3 Descripción
4 Moléculas en la teoría cuántica
4.1 Aproximación de Born-Oppenheimer
5 Véase también
6 Referencias
6.1 Bibliografía
6.2 Enlaces externos
Definición y sus límites
De manera menos general y precisa, se ha definido molécula como la parte más
pequeña de una sustancia química que conserva sus propiedades químicas, y a partir
de la cual se puede reconstituir la sustancia sin reacciones químicas. De acuerdo
con esta definición, que resulta razonablemente útil para aquellas sustancias puras
constituidas por moléculas, podrían existir las "moléculas monoatómicas" de gases
nobles, mientras que las redes cristalinas, sales, metales y la mayoría de vidrios
quedarían en una situación confusa.

Las moléculas lábiles pueden perder su consistencia en tiempos relativamente

cortos, pero si el tiempo de vida medio es del orden de unas pocas vibraciones
moleculares, estamos ante un estado de transición que no se puede considerar
molécula. Actualmente, es posible el uso de láser pulsado para el estudio de la
química de estos sistemas.

Las entidades que comparten la definición de las moléculas, pero tienen carga
eléctrica se denominan iones poliatómicos, iones moleculares o moléculas ion. Las
sales compuestas por iones poliatómicos se clasifican habitualmente dentro de los
materiales de base molecular o materiales moleculares.

Ejemplo de molécula poliatómica: el agua

Las moléculas están formadas por partículas. Una molécula viene a ser la porción de
materia más pequeña que aún conserva las propiedades de la materia original. Las
moléculas se encuentran fuertemente enlazadas con la finalidad de formar materia.
Las moléculas están formadas por átomos unidos por medio de enlaces químicos.

Una molécula es una unidad de sustancia que puede ser monoatómica o poliatómica. La
unidad de todas las sustancias gaseosas es la molécula.10

Tipos de moléculas
Las moléculas se pueden clasificar en:

Moléculas discretas: constituidas por un número bien definido de átomos, sean estos
del mismo elemento (moléculas homonucleares, como el dinitrógeno o el fullereno) o
de elementos distintos (moléculas heteronucleares, como el agua).

Molécula de dinitrógeno, el gas que es el componente mayoritario del aire

Molécula de fullereno, tercera forma estable del carbono tras el diamante y el
grafito

Molécula de agua, "disolvente universal", de importancia fundamental en

innumerables procesos bioquímicos e industriales

Representación poliédrica del anión de Keggin, un polianión molecular

Macromoléculas o polímeros: constituidas por la repetición de una unidad

comparativamente simple —o un conjunto limitado de dichas unidades— y que alcanzan
pesos moleculares relativamente altos.

Representación de un fragmento de ADN, un polímero de importancia fundamental en la

genética

Enlace peptídico que une los péptidos para formar proteínas

Representación de un fragmento lineal de polietileno, el plástico más usado

Primera generación de un dendrímero, un tipo especial de polímero que crece de

forma fractal

Descripción
La estructura molecular puede ser descrita de diferentes formas. La fórmula
molecular es útil para moléculas sencillas, como H2O para el agua o NH3 para el
amoníaco. Contiene los símbolos de los elementos presentes en la molécula, así como
su proporción indicada por los subíndices.

Para moléculas más complejas, como las que se encuentran comúnmente en química
orgánica, la fórmula química no es suficiente, y vale la pena usar una fórmula
estructural o una fórmula esqueletal, las que indican gráficamente la disposición
espacial de los distintos grupos funcionales.

Cuando se quieren mostrar variadas propiedades moleculares, o se trata de sistemas

muy complejos como proteínas, ADN o polímeros, se utilizan representaciones
especiales, como los modelos tridimensionales (físicos o representados por
ordenador). En proteínas, por ejemplo, cabe distinguir entre estructura primaria
(orden de los aminoácidos), secundaria (primer plegamiento en hélices, hojas,
giros…), terciaria (plegamiento de las estructuras tipo hélice/hoja/giro para dar
glóbulos) y cuaternaria (organización espacial entre los diferentes glóbulos).

Figura 1. Representaciones de la terpenoide, atisano, 3D (centro izquierda) y 2D

(derecha). En el modelo 3D de la izquierda, los átomos de carbono están
representados por esferas azules; las blancas representan a los átomos de hidrógeno
y los cilindros representan los enlaces. El modelo es una representación de la
superficies molecular, coloreada por áreas de carga eléctrica positiva (rojo) o
negativa (azul). En el modelo 3D del centro, las esferas azul claro representan
átomos de carbono, las blancas de hidrógeno y los cilindros entre los átomos son
los enlaces simples.
Moléculas en la teoría cuántica
La mecánica clásica y el electromagnetismo clásico no podían explicar la existencia
y estabilidad de las moléculas, ya que de acuerdo con sus ecuaciones una carga
eléctrica acelerada emitiría radiación por lo que los electrones necesariamente
perderían energía cinética por radiación hasta caer sobre el núcleo atómico. La
mecánica cuántica proveyó el primer modelo cualitativamente correcto que además
predecía la existencia de átomos estables y proporcionaba explicación cuantitativa
muy aproximada para fenómenos empíricos como los espectros de emisión
característicos de cada elemento químico.

En mecánica cuántica una molécula o un ion poliatómico se describe como un sistema

formado por {\displaystyle N}N electrones de masa {\displaystyle m}m y
{\displaystyle M}M núcleos de masas {\displaystyle m_{j}}{\displaystyle m_{j}}. En
mecánica cuántica las interacciones físicas de estos elementos se presentan por un
hamiltoniano cuántico, cuyos autovalores serán las energías permitidas del sistema
y cuyas autofunciones describirán los orbitales moleculares de la molécula, y de
esos objetos se podrán deducir las propiedades químicas de la molécula. En lo que
sigue se designará mediante e, la carga de cada electrón, mientras que la de cada
núcleo, con {\displaystyle Z_{j}}{\displaystyle Z_{j}} protones, será
{\displaystyle Z_{j}e}{\displaystyle Z_{j}e}. Para estudiar este sistema es
necesario analizar el siguiente hamiltoniano cuántico:

(1){\displaystyle {\hat {H}}_{mol}=-\sum _{j=1}^{N}{\frac {\hbar ^{2}}{2m}}\nabla

_{x_{j}}^{2}-\sum _{j=1}^{M}{\frac {\hbar ^{2}}{2m_{j}}}\nabla _{y_{j}}^{2}+V(x,y)}
{\displaystyle {\hat {H}}_{mol}=-\sum _{j=1}^{N}{\frac {\hbar ^{2}}{2m}}\nabla
_{x_{j}}^{2}-\sum _{j=1}^{M}{\frac {\hbar ^{2}}{2m_{j}}}\nabla _{y_{j}}^{2}+V(x,y)}

definido sobre el espacio de funciones antisimetrizadas de cuadrado integrable

{\displaystyle L_{sym}^{2}(\mathbb {R} ^{3(N+M)})}{\displaystyle L_{sym}^{2}
(\mathbb {R} ^{3(N+M)})}, las coordenadas asociadas a las posiciones de los
electrones vienen dadas por {\displaystyle x=(x_{\dot {a}}2,\dots ,x_{N})\in
\mathbb {R} ^{3N}}{\displaystyle x=(x_{\dot {a}}2,\dots ,x_{N})\in \mathbb {R}
^{3N}} y la de los núcleos atómicos vienen dadas por {\displaystyle
y=(y_{1},\dots ,y_{M})\in \mathbb {R} ^{3M}}{\displaystyle y=(y_{1},\dots
,y_{M})\in \mathbb {R} ^{3M}}. Y las interacciones electrostáticas entre electrones
y núcleos vienen dadas por el potencial {\displaystyle V(x,y)}{\displaystyle
V(x,y)} que se puede escribir como:

(2){\displaystyle V(x,y)={\frac {1}{2}}\sum _{i\neq j}{\frac {e^{2}}{\|x_{i}-

x_{j}\|}}-\sum _{i,j}{\frac {Z_{j}e^{2}}{\|x_{i}-y_{j}\|}}+{\frac {1}{2}}\sum
_{i\neq j}{\frac {Z_{i}Z_{j}e^{2}}{\|y_{i}-y_{j}\|}}}{\displaystyle V(x,y)={\frac
{1}{2}}\sum _{i\neq j}{\frac {e^{2}}{\|x_{i}-x_{j}\|}}-\sum _{i,j}{\frac
{Z_{j}e^{2}}{\|x_{i}-y_{j}\|}}+{\frac {1}{2}}\sum _{i\neq j}{\frac
{Z_{i}Z_{j}e^{2}}{\|y_{i}-y_{j}\|}}}

donde el primer término representa la interacción de los electrones entre sí, el

segundo la interacción de los electrones con los núcleos atómicos, y el tercero las
interacciones de los núcleos entre sí. En una molécula neutra se tendrá obviamente
que:

{\displaystyle \sum _{j=1}^{M}Z_{j}=N}{\displaystyle \sum _{j=1}^{M}Z_{j}=N}

Si {\displaystyle M=1}{\displaystyle M=1} se tendrá un átomo polielectrónico si

{\displaystyle Z_{1}>1}{\displaystyle Z_{1}>1}, y un átomo hidrogenoide si
{\displaystyle Z_{1}=1}{\displaystyle Z_{1}=1}.
Aproximación de Born-Oppenheimer
Resolver el problema de autovalores y autofunciones para el hamiltoniano cuántico
dado por (1) es un problema matemático difícil, por lo que es común simplificarlo
de alguna manera. Así dado que los núcleos atómicos son mucho más pesados que los
electrones (entre 103 y 105 veces más) puede suponerse que los núcleos atómicos
apenas se mueven comparados con los electrones, por lo que se considera que están
congelados en posiciones fijas, con lo cual se puede aproximar el hamiltoniano (1)
por la aproximación de Born-Oppenheimer dada por:

(3){\displaystyle {\hat {H}}_{mol,N}^{BO}(y)=-\sum _{j=1}^{N}{\frac {\hbar ^{2}}

{2m}}\nabla _{x_{j}}^{2}+V(x,y)}{\displaystyle {\hat {H}}_{mol,N}^{BO}(y)=-\sum
_{j=1}^{N}{\frac {\hbar ^{2}}{2m}}\nabla _{x_{j}}^{2}+V(x,y)}

definido sobre el espacio de funciones {\displaystyle L_{sym}^{2}(\mathbb {R}

^{3N})}{\displaystyle L_{sym}^{2}(\mathbb {R} ^{3N})} y donde {\displaystyle
y\in \mathbb {R} ^{3M}}{\displaystyle y\in \mathbb {R} ^{3M}} es la posición de los
núcleos que para el análisis se considera fija. El resultado básico de este
análisis viene dado por el siguiente resultado matemático:

Teorema de Kato

Los operadores {\displaystyle {\hat {H}}_{m}ol}{\displaystyle {\hat {H}}_{m}ol} y

{\displaystyle {\hat {H}}_{mol,N}^{BO}(y)}{\displaystyle {\hat {H}}_{mol,N}^{BO}
(y)} son autoadjuntos y acotados inferiormente.

Tosio Kato
La propiedad de ser autoadjunto implicará que las energías son cantidades reales, y
el que sean acotados inferiormente implicará que existe un estado fundamental de
mínima energía por debajo del cual los electrones no pueden decaer, y por tanto,
las moléculas serán estables, ya que los electrones no pueden perder y perder
energía como parecían predecir las ecuaciones del electromagnetismo clásico. Dos
resultados matemáticos adicionales nos dicen como son las energías permitidas de
los electrones dentro de una molécula:11

Teorema HVZ para átomos y moléculas BO

El espectro esencial {\displaystyle \sigma _{ess}({\hat {H}}_{mol,N}^{BO})=[\Sigma

_{N},\infty )}{\displaystyle \sigma _{ess}({\hat {H}}_{mol,N}^{BO})=[\Sigma
_{N},\infty )}, donde {\displaystyle \Sigma _{N}=\inf({\hat {H}}_{mol,N-1}^{BO})}
{\displaystyle \Sigma _{N}=\inf({\hat {H}}_{mol,N-1}^{BO})}, la energía
{\displaystyle \Sigma _{N}}{\displaystyle \Sigma _{N}} se denomina umbral de
ionización.

W. Hunziker, C. Van Winter y G. M. Zhislin

Además dentro de la mecánica cuántica puede demostrarse que pueden existir iones
positivos (cationes, con carga positiva comparable al núcleo atómico), mientras que
no es igual de fácil tener iones negativos (aniones), el siguiente resultado
matemático implica tiene que ver con la posibilidad de cationes y aniones:11

Teorema

Para {\displaystyle N<\sum _{j}Z_{j}+1}{\displaystyle N<\sum _{j}Z_{j}+1}, el

hamiltoniano {\displaystyle {\hat {H}}_{mol,N}^{BO}}{\displaystyle {\hat
{H}}_{mol,N}^{BO}} tiene un número infinito de autovalores (energías permitidas)
por debajo del umbral de ionización {\displaystyle \Sigma _{N}}{\displaystyle
\Sigma _{N}}, además los estados ligados {\displaystyle \Psi _{N}^{(i)}
(x_{1},x_{2},\dots ,x_{N})}{\displaystyle \Psi _{N}^{(i)}(x_{1},x_{2},\dots
,x_{N})}, con energías {\displaystyle E_{N}^{(i)}<\Sigma _{N}}{\displaystyle
E_{N}^{(i)}<\Sigma _{N}} satisfacen la cota exponencial

{\displaystyle \int _{\mathbb {R} ^{3N}}|\Psi _{N}^{(i)}(x)|^{2}e^{2\alpha \|

x\|}d^{3N}x<\infty ,\qquad \forall \alpha <{\sqrt {\Sigma _{N}-E_{N}^{(i)}}}}
{\displaystyle \int _{\mathbb {R} ^{3N}}|\Psi _{N}^{(i)}(x)|^{2}e^{2\alpha \|
x\|}d^{3N}x<\infty ,\qquad \forall \alpha <{\sqrt {\Sigma _{N}-E_{N}^{(i)}}}}

Véase también
Compuesto químico
Nanotecnología
Número de Avogadro
Volumen molar
Referencias
Unión Internacional de Química Pura y Aplicada: (1994) /M04002.html molecule,
Compendium of Chemical Terminology, conocido como Gold Book.
Pauling, Linus (1970). General Chemistry. Nueva York: Dover Publications, Inc.
ISBN 0-486-65622-5.
Ebbin, Darrell, D. (1990). General Chemistry, 3th Ed. Boston: Houghton Mifflin Co.
ISBN 0-395-43302-9.
Brown, T. L. (2003). Chemistry - the Central Science, 9th Ed.. Nueva Jersey:
Prentice Hall. ISBN 0-13-066997-0.
Chang, Raymond (1998). Chemistry, 6th Ed.. Nueva York: McGraw Hill. ISBN 0-07-
115221-0.
Zumdahl, Steven S. (1997). Chemistry, 4th ed. Boston: Houghton Mifflin. ISBN 0-
669-41794-7.
Chandra, Sulekh. Comprehensive Inorganic Chemistry. Nueva Era Publishers. ISBN
8122415121.
Thibodeau, Gary A.; Patton, Kevin T. (2008-06). Estructura y función del cuerpo
humano. Elsevier España. ISBN 9788480863551. Consultado el 5 de febrero de 2018.
Vaquerizo, Dulce María Andrés (2016). Ciencias aplicadas a la actividad
profesional 4º ESO. Editex. ISBN 9788490788097. Consultado el 5 de febrero de 2018.
Ocampo, Dapueto, Piovano (2009). «1». En Universidad Nacional del Litoral, ed.
Química General. Santa Fé, Argentina: Ediciones UNL. p. 9. ISBN 978-987-508-965-5.
Gustafson, S. J. & I. M. Sigal, 2011, p. 101.
Bibliografía
Gustafson, S. J. & I. M. Sigal (2011): Mathematical Concepts of Quantum Mechanics,
Springer-Verlag, ISBN 938-3-642-21866-1.
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