Curso Propedéutico a la carrera de Médico

Cirujano: Bioquímica y Biología Molecular.

Aminoácidos y Proteínas.
EM. Alejandro Agustín Vite García.
 Proteínas: Panorama general.
• Las proteínas son un grupo diverso de macromoléculas.

• Diversidad relacionada con la disponibilidad de 20 monómeros de aminoácidos, los

cuales pueden estar teóricamente unidos para formar a las propias proteínas de
tamaños y formas invariables.

Conceptos de importancia en el entendimiento de las proteínas.

Aminoácidos. Monómeros de proteínas.

Péptidos. Moléculas con pesos moleculares bajos compuestos

de menos de 50 aminoácidos.
Polipéptidos. Moléculas con altos pesos moleculares, que van de
miles a millones de daltons.
Proteínas. Moléculas que consisten en una o más cadenas de
polipéptidos.
 Diversidad
proteica:
Todas las proteínas
presentan una
enorme diversidad
de tamaños, formas
y funciones.
 Diversidad proteica.
Proteína. Función.

Anticuerpos. Proteínas del sistema inmunitario

que protegen contra virus y
bacterias.
Factores de elongación Tu y Proteínas procariotas que facilitan la
Ts. elongación en la síntesis proteica.
Alcohol deshidrogenasa. Enzima que interconvierte aldehídos
y alcoholes.
Actina. Componentes del citoesqueleto de
los eucariotas.
Hemoglobina. Proteína que transporta oxígeno
desde los pulmones a todo el
cuerpo.
Lisozima. Enzima que destruye las paredes
celulares bacterianas.
 Diversidad proteica.
Proteína. Función.

Rodopsina. Proteína sensible a la luz que se

encuentra en las células de los
bastones en la retina del ojo.
RNA polimerasa. Proteína central en el complejo
proteico que transcribe el DNA
para convertirlo en RNA.
Mioglobina. Proteína que almacena oxígeno
en las células musculares.
Pepsina. Enzima que degrada las
proteínas producidas en las
células del estómago.
Ciclooxigenasa. Enzima que cataliza la primera
reacción en una vía que sintetiza
derivados de ácidos grasos.
 Generalidades de aminoácidos.
● Aminoácido: monómero de proteínas.
Aminoácidos estándar. Se encuentran de forma
natural en las proteínas.
Aminoácidos no estándar. Con residuos de
aminoácidos modificados
químicamente.

● Se encuentran 20 L-aminoácidos disponibles de

forma natural en las proteínas.

● Todos los aminoácidos son ASIMÉTRICOS (excepto

Gly)

● Tienen un comportamiento ANFÓTERO (ácido o

base)

● En solución acuosa, son ANFIPÁTICOS.

 ESQUELETO DE CARBONO DEL AMINOÁCIDO.

NH3 O NH2
GRUPO AMINO.
(+)

GGRUPO COOH O COO

CARBOXILO. (-)

HIDRÓGENO. RADICAL H

-R (CONFIERE
PROPIEDADES
CADENA LATERAL.
AL
AMINOÁCIDO.
 Clasificación de los
aminoácidos.
Los aminoácidos se clasifican en:
POLARES, NO POLARES, ÁCIDOS Y BÁSICOS.
 Clasificación de los aminoácidos.
Aminoácidos no polares. Aminoácidos polares.

● Aminoácidos ● Aminoácidos hidrofílicos.

hidrofóbicos. ● Radicales capaces de
● Contienen radicales de establecer interacciones
hidrocarburos sin carga. electrostáticas con el
● Se subdividen en alifáticos agua.
y aromáticos. ● Radicales altamente
REACTIVOS.
● Alifáticos: glicina, alanina,
valina, leucina, isoleucina, ● Serina, treonina,
metionina y prolina. asparagina, glutamina,
● Aromáticos: fenilalanina y tirosina y cisteína.
triptófano. ● Tirosina: ¿Aromático o
polar?
 Aminoácidos no polares.

Glicina Alanina
Valina
Leucina
Isoleucina

Prolina
Fenilalanina
Triptófano
Metionina
 Aminoácidos polares.

Serina Treonina Cisteína

Asparagina
Tirosina Glutamina
 Clasificación de los aminoácidos.
Aminoácidos ácidos. Aminoácidos básicos.

● Tienen cadenas laterales ● Tienen carga positiva a

con grupos carboxilo pH fisiológico.
(COOH)
● Pueden formar enlaces
● Ácido aspártico y ácido
glutámico. iónicos con los
aminoácidos ácidos.
● Usualmente llamados
aspartato y glutamato ● Lisina, arginina e
porque a pH fisiológico histidina.
tienen carga negativa.
 Aminoácidos ácidos y básicos.

Histidina
Aspartato
Glutamato Lisina
Arginina
 FUNCIONES BIOLÓGICAS DE LOS AMINOÁCIDOS.

Algunos actúan Precursores de Actúan como

como mensajeros moléculas intermediarios
químicos. nitrogenadas metabólicos.
Síntesis de Incluyen los Arginina, citrulina y
neutrotransmisores componentes de ornitina. (ciclo de la
y hormonas. bases nitrogenadas, urea)
grupos hemo y Glucógeno sintasa
clorofila. (fosforilación de la
enzima)
 Esteroisómeros de aminoácidos.
• Los aminoácidos asimétricos, con carbonos quirales alfa, pueden permanecer
como esteroisómeros.

ESTEROISÓMEROS: MOLÉCULAS QUE DIFIEREN SÓLO EN LA DISPOSICIÓN ESPACIAL

DE SUS ÁTOMOS.

• Cuando los esteroisómeros son imágenes especulares entre si, se les llama
ENANTIÓMEROS y no pueden superponerse entre sí.

ISÓMEROS ÓPTICOS: ESTEROISÓMEROS CAPACES DE ROTAR LA LUZ POLARIZADA

HACIA LA DERECHA (-D) O HACIA LA IZQUIERDA (-L)

• Didácticamente distinguiremos al L-aa del D-aa por la posición del grupo amino
respecto al carbono quiral alfa.
Esteroisómeros de aminoácidos: enantiómeros.
Comportamiento anfótero del aminoácido.

-1 0 +1

Forma aniónica. Forma zwitterion. Forma catiónica.

Grupo carboxilo Grupo amino cargado Grupo amino

cargado (-) (+) cargado (+)

Grupo amino Grupo carboxilo Grupo carboxilo

disociado. cargado (-) disociado.
Comportamiento anfótero del aminoácido.
 PUNTO ISOELÉCTRICO.
• Refiere al pH en el que el aminoácido no lleva carga eléctrica neta/parcial.

Cuando un aminoácido se encuentra en su punto isoeléctrico logra una

dipolaridad neutra así como un punto de mínima solubilidad.

• En forma catiónica, el aminoácido se encontrará por debajo de su punto

isoeléctrico.
• En forma zwitterion, el aminoácido se encuentra en su punto isoeléctrico.
• En forma aniónica, el aminoácido se encuentra por arriba de su punto
isoeléctrico.
EL ENLACE PEPTÍDICO.
Los enlaces peptídicos son
enlaces de carácter fuerte que
ocurren para la formación de
péptidos.

● Son formados cuando el par de

electrones no compartido del
átomo de nitrógeno amino de un
aminoácido, ataca el carbono
carboxilo de otro mediante
reacciones de sustitución.

● COMPARTICIÓN DE ELECTRONES.
● Cada enlace peptídico libera una
molécula de agua.
 Formación de péptidos.
Aminoácidos Nombre del Enlaces Moléculas de
unidos. péptido. peptídicos. agua liberadas.
Dos Dipéptido Uno Una

Tres Tripéptido Dos Dos

Cuatro Tetrapéptido Tres Tres

Cinco Pentapéptido Cuatro Cuatro

Seis Hexapéptido Cinco Cinco

Siete Heptapéptido Seis Seis

Ocho Octapéptido. Siete Siete

El enlace peptídico.
 Con el enlace peptídico, el péptido
adquiere una configuración amino
terminal (N-terminal) y carboxilo terminal
(C-terminal)
Ambos grupos terminales funcionarán
como extremos libres que no
interaccionarán ni formarán enlaces.
 PROTEÍNAS.
Se pueden clasificar
Con la excepción de mediante los siguientes
las moléculas de criterios:
agua, LAS 1. De acuerdo con sus
funciones.
PROTEÍNAS SON LAS 2. Por similitudes en su
BIOMOLÉCULAS secuencia de
MÁS ABUNDANTES aminoácidos.
3. Por su forma.
EN LOS 4. Dada su composición
ORGANISMOS tridimensional
VIVOS. determinada.
 Funciones de las proteínas.

Catálisis Estructura Movimiento

Aceleran Composición de Se involucran en
reacciones tejidos mediante todos los
químicas. propiedades movimientos
específicas. celulares.

Defensa Regulación Almacenamiento

Fungen como Modifican o Son reservorio de
proteínas promueven nutrientes
protectoras. determinadas esenciales.
funciones celulares.
Proteínas biológicas de acuerdo con su función.
Función asociada. Proteínas.

Catálisis Enzimas (alcohol deshidrogenasa,

citrato sintasa, PFK-1, aldolasa,
catalasa)
Estructura Colágena, fibroína, elastina.

Movimiento Actina, tubulina y proteínas asociadas.

Defensa Fibrinógeno, trombina,

inmunoglobulinas.
Regulación Glucagon, insulina, hormona del
crecimiento.
Almacenamiento Ovoalbúmina, lactoalbúmina, caseina.
 Proteínas transportadoras.

Muchas proteínas funcionan como

transportadoras de moléculas y
iones a través de las membranas o
entre las células.

La bomba ATPasa, la hemoglobina,

los transportadores de glucosa
(GLUT) y las lipoproteínas son
ejemplos de ellas.
 Existen 2 formas principales de proteínas.

Proteínas fibrosas. Proteínas globulares.

• Moléculas largas en forma de • Moléculas esféricas
bastones. compactas.
• Insolubles en agua. • Son solubles en agua.
• Físicamente resistentes. • Tienen funciones dinámicas
• Funciones estructurales y de (transporte, catálisis y
protección. transporte)
 Proteínas simples y conjugadas.
1. PROTEÍNAS SIMPLES: AQUELLA MACROMOLÉCULA COMPUESTA ÚNICAMENTE POR
AMINOÁCIDOS.

2. PROTEÍNAS CONJUGADAS: AQUELLA MACROMOLÉCULA QUE CONSISTE EN UNA

PROTEÍNA SIMPLE COMBINADA CON UN COMPONENTE NO PROTEICO LLAMADO
GRUPO PROSTÉTICO.

Proteína CON grupo prostético: HOLOPROTEÍNA.

Proteína SIN grupo prostético: APOPROTEÍNA.

Los grupos prostéticos suelen desempeñar un papel importante, incluso crucial en la

función de las proteínas.
Toda proteína conjugada se clasificará de acuerdo a la naturaleza de sus grupos
prostéticos.
Las proteínas y sus grupos prostéticos.

GLUCOPROTEÍNAS. HEMOPROTEÍNAS.
CONTIENEN UN CONTIENEN GRUPOS
COMPONENTE DE HEMO.
CARBOHIDRATO.

LIPOPROTEÍNAS FOSFOPROTEÍNAS.
CONTIENEN POSEEN GRUPOS
MOLÉCULAS DE FOSFATO (IONES
LÍPIDOS. INORGÁNICOS)
 ESTRUCTURA PROTEICA.
Estructura primaria. Representa la secuencia de
aminoácidos. Se especifica mediante la
información genética.
Estructura Disposiciones localizadas de
secundaria. aminoácidos adyacentes mediante un
plegamiento de la cadena polipeptídica.
Estructura terciaria. Refiere a la forma tridimensional y
nativa que adquiere el polipéptido.
Estructura Proteínas que consisten en 2 o más
cuaternaria. cadenas de polipéptidos o
subunidades.
Estructura PRIMARIA.

1. Cada polipéptido tiene una

secuencia lineal específica de
aminoácidos que están unidos
por enlaces peptídicos.

2. Las secuencias polipeptídicas

se encuentran dictadas por la
información genética
localizada en el código
genético.
 Estructura SECUNDARIA.
1. Refiere a una estructura proteica que consta de varios patrones repetitivos.
2. Los tipos más observados son la alfa-hélice y la lámina-beta-plegada.

Tanto la alfa-hélice como la lámina beta-plegada se estabilizan mediante enlaces por

puente de hidrógeno localizados entre los grupos carbonilo y N-H en la cadena principal
del polipéptido.

Alfa- hélice: ESTRUCTURA RÍGIDA EN FORMA DE BARRA QUE SE FORMA CUANDO UNA CADENA
POLIPEPTÍDICA SE TUERCE EN UNA CONFORMACIÓN HELICOIDAL DERECHA. HAY 3.6 RESIDUOS
POR VUELTA DE LA HÉLICE. LOS GRUPOS R SE EXTIENDEN HACIA AFUERA DESDE LA HÉLICE.
DETERMINADOS AMINOÁCIDOS COMO LA GLICINA, EL TRIPTOFANO, LA PROLINA Y EL
ASPARTATO NO SON COMPATIBLES CON LAS ESTRUCTURAS DE LA ALFA- HÉLICE.

Beta lámina plegada: SECUENCIA DONDE UN SEGMENTO PEPTÍDICO SE EXTIENDE

COMPLETAMENTE EN UNA ESTRUCTURA DE TIPO ZIG-ZAG. PUEDEN SER PARALELAS O
ANTIPARALELAS.
• LÁMINA BETA PARALELA: PUENTES DE HIDRÓGENO DISPUESTOS EN LA MISMA DIRECCIÓN.
• LÁMINA BETA ANTIPARALELA: PUENTES DE HIDRÓGENO EN DIRECCIÓN CONTRARIA.
 Lámina beta
Alfa hélice. plegada.
 Motivos supersecundarios.
1. Refieren a las combinaciones de alfa-hélices y láminas-beta.
2. En ocasiones, la mayoría de las proteínas globulares contiene diversas
combinaciones entre las cuales ubicamos:

Unidad beta-alfa-beta. Dos segmentos paralelos de lámina beta se conectan

por medio de un segmento de alfa hélice.
Bucle de horquilla beta. Giro de 180 grados que comúnmente involucra de 2 a
7 residuos de lámina beta antiparalela unidas a
hidrógeno
Barriles beta. Se forman cuando diversas láminas beta se pliegan
entre sí.
Meandro beta. Dos o más láminas beta antiparalelas se conectan por
bucles cortos de aminoácidos polares.
Llave griega. La lámina beta antiparalela de dobla sobre si misma en
un patrón de cerámica común griega.
 MOTIVOS SUPERSECUNDARIOS.

Unidades beta-alfa- Meandros beta. Barriles beta. Llave griega. Unidad alfa-
beta. alfa.
 Estructura terciaria.
1. Se refiere a las conformaciones tridimensionales únicas que las proteínas asumen cuando se pliegan en sus
estructuras nativas (BIOLÓGICAMENTE ACTIVAS)

PLEGAMIENTO PROTEICO: PROCESO EN EL QUE UNA MOLÉCULA NACIENTE NO ORGANIZADA ADQUIERE

UNA ESTRUCTURA ALTAMENTE ORGANIZADA, SE PRODUCE COMO CONSECUENCIA DE LAS INTERACCIONES
ENTRE LAS CADENAS LATERALES DE LA MOLÉCULAS.

EL PLEGAMIENTO PROTEICO CONTRIBUYE A LA DISMINUCIÓN DE LA ENTROPÍA DE LA MACROMOLÉCULA.

• Muchos polipéptidos se pliegan de tal manera que los residuos de aminoácidos distantes entre sí en la
estructura primaria se acercan mucho.

• Las proteínas globulares son compactas debido al empaquetamiento eficiente a medida que el polipéptido
de pliega. La mayoría de las moléculas de agua se excluyen del interior de la proteína, lo que hace posible la
interacción entre los grupos polares y no polares.

• Las proteínas grandes ( mayores a 200 residuos de aminoácidos) contienen varias unidades compactas
llamadas dominios estructurales.
 ¿Qué es un dominio
estructural?
● Los dominios estructurales son segmentos
estructuralmente independientes que
cumplirán con funciones específicas, como la
unión a diversos iones o a moléculas
pequeñas.

Estructura central tridimensional: PLIEGUE.

● Pliegue Rossman (unión a nucleótidos)

● Pliegue de globina (unión al oxígeno)
 Fuerzas que estabilizan la estructura terciaria:

1. PUENTES DISULFURO: ENTRE RESIDUOS DEL GRUPO TIOL DE 2

CISTEINAS.

2. ATRACCIONES ELECTROSTÁTICAS: ENLACES ENTRE GRUPOS

FUNCIONALES (AMINO DE 1 AMINOÁCIDO CON CARBOXILO DE
OTRO)

3. PUENTES DE HIDRÓGENO: ENTRE RADICALES HIDROXILO DE

CADENA LATERAL Y GRUPO CARBOXILO DE OTRO
AMINOÁCIDO.

4. INTERACCIONES HIDROFÓBICAS: ENTRE CADENAS LATERALES

DE AMINOÁCIDOS NO POLARES.
Estructura cuaternaria.

1. Proteínas compuestas por varias cadenas polipeptídicas.

2. Usualmente se les denomina complejos proteicos.

SUBUNIDAD: CADA COMPONENTE DENTRO DEL COMPLEJO

PROTEICO.

OLIGÓMEROS: PROTEÍNAS DE MÚLTIPLES SUBUNIDADES EN

DONDE LOS POLIPÉPTIDOS SON DIFERENTES O IDÉNTICOS.

PROTÓMEROS: COMPONENTES DE LOS OLIGÓMEROS.

PUEDEN TENER UNA O MÁS SUBUNIDADES.

• Las subunidades de los polipéptidos se ensamblan y se

mantienen unidas mediante interacciones no
covalentes, como interacciones hidrofóbicas,
electrostáticas y puentes de hidrógeno, así como por
enlaces covalentes.
 Desnaturalización de una proteína.
DESNATURALIZACIÓN: PROCESO DE LA ALTERACIÓN DE LA ESTRUCTURA PROTEICA, QUE PUEDE
IMPLICAR O NO EL DESPLIEGUE DE LAS PROTEÍNAS.

1. DEPENDIENDO EL GRADO DE DESNATURALIZACIÓN PUEDE PERDER PARCIAL O

COMPLETAMENTE SU ACTIVIDAD BIOLÓGICA.

2. LA MAYORÍA DE LAS PROTEÍNAS NO SE RENATURALIZAN, DEBIDO A QUE SE ENFRENTAN CON

PROCESOS QUÍMICOS IRREVERSIBLES.

CONDICIONES DE DESNATURALIZACIÓN.

Cambios en el pH por ácidos y Aumento de concentraciones de

bases fuertes. sal en solución acuosa de
proteína.
Disolventes orgánicos. Iones de metales pesados.

Detergentes. Cambios de temperatura.

Agentes reductores (ej. Urea) Estrés mecánico. (agitación y

molienda)
 El
PLEGAMIENTO
PROTEICO.
Proteínas chaperonas en el plegamiento de las proteínas.
• Las proteínas chaperonas son una red de proteínas que forman un papel central en el control de
calidad de las proteínas celulares al facilitar el plegamiento de las proteínas celulares al facilitar el
plegamiento proteico de las proteínas nacientes y el replegamiento de las ya existentes.

PROTEÍNAS CHAPERONAS CONOCIDAS.

PROTEÍNAS FUNCIÓN.

Chaperonas asociadas a los ribosomas. Se unen al ribosoma y al polipéptido emergente.

Evitan el plegamiento antes de que el polipéptido
emerja del ribosoma.
Hsp 70. Estabilizan y promueven el plegamiento de las
proteínas nacientes.
Hsp 90. Finalizan el proceso del plegamiento proteico y
coordinan el ensamblaje de las mismas.
Chaperoninas. Promueven el replegamiento de polipéptidos de
forma más rápida y eficiente.
Plegamiento
por
chaperonas
moleculares.
Enfermedades por mal plegamiento proteico.
Proteínas biológicas.
Queratina.
● Proteína fibrosa compuesta
de alfa-hélices.
● Se encuentra en la lana, piel,
uñas, cabello/pelo y en los
cuernos de los animales.
● Se estabiliza por puentes de
hidrógeno y por puentes
disulfuro.
● Forma de espiral “enrollada”
Proteínas biológicas.

Colágeno.
● Consta de 3 cadenas polipeptídicas.
● Funcional en estructura cuaternaria.
● Se sintetiza en las células del tejido
conectivo.
● Se secreta en el espacio extracelular
y forma parte de la matriz del tejido
conectivo.
● Según la zona en la que se
encuentre cumple con diversas
funciones.
Proteínas biológicas.

Mioglobina.
● Se encuentra en músculo cardiaco y
estriado.
● Le otorga a los tejido un color rojo
específico.
● Compuesto de una cadena
polipeptídica con 8 residuos de
alfa-hélice.
● Se estabiliza por interacciones no
covalentes entre cadenas laterales
de aminoácidos.
Proteínas biológicas.

Hemoglobina.
● Proteína esférica ubicada en los
eritrocitos.
● Transporta oxígeno de los pulmones
a los tejidos del cuerpo.
● Se compone de 2 cadenas alfa y 2
cadenas beta.
● Se encuentra funcional en
estructura cuaternaria.
Fisiología de la hemoglobina y
mioglobina.

1. Mioglobina.
A Pco2 BAJAS, ALTA afinidad por el O2.
A Pco2 ALTAS, BAJA afinidad por el O2.

2. Hemoglobina.
A Pco2 BAJAS, BAJA afinidad por el O2.
A Pco2 ALTAS, ALTA afinidad por el O2.