UNIVERSITE DES SCINCES ET DE LA

TECHNOLOGIE D'ORAN MOHAMED BOUDIAF

Thme :

Alcanivorax
borkumensis
(bactrie mangeuse
de ptrole )
EXPOSE
MICROBIOLOGIE
MASTER 1 (GPE)

PRESENTE PAR :

 EL AISSAOUI EL MELIANI MED EL AMINE .

BERRIA ABOUBAKR .
BENABELA IMENE .

2014 /2015

sommaire

INTRODUCTION .

HISTOIRE .

DEFINITION .

CLASSIFICATION .

DESCRIPTION .

GENOME .

STRUCTURE LA CELLULE DU
METABOLISME ET DU CYCLE DE VIE .

METABOLISME .

BORKUMENSIS ET BIOSURFACTANTS .
ROLE DANS LA BIODEGRADATION DU
PETROLE.

POTENTIEL "ANTI-OIL" AGENT DE

DVERSEMENT .

ECOLOGIE .

CONCLUSION .

BIBLIOGRAPHIES .

Introduction :
Plusieurs millions de tonnes de ptrole s'coulent chaque anne dans les ocans,
en majeure partie la suite d'activits humaines. Ces dversements entranent de
graves consquences environnementales et conomiques. Des milliers d'oiseaux
et d'autres animaux sont tus ou blesss et le rtablissement des habitats ctiers
et marins peut ncessiter des annes. Les seuls cots de l'limination du ptrole
sont considrables. Les pcheurs sont galement affects ds lors que leurs
prises sont contamines et ne peuvent tre vendues, et le tourisme est affect
lorsque des plages sont recouvertes de ptrole.
Une quipe de chercheurs europens a dcod le gnome d'une bactrie
essentielle dans la dgradation du ptrole, l'Alcanivorax borkumensis. Ils
esprent prsent que leur comprhension de la biochimie de ce microorganisme conduira l'laboration de nouveaux procds efficaces et
respectueux de l'environnement pour l'assainissement de l'eau en cas de
pollution au ptrole.

Histoire :
1) premires apparitions :
dans les eaux du Golfe du Mexique, dans une nappe de ptrole sous-marine
Sadaptant rapidement aux circonstances, des bactries se sont attaques aux
hydrocarbures qui polluent les eaux du Golfe du Mexique depuis laccident de la
plateforme ptrolire sous-marine de BP. Cette biodgradation du ptrole est une

bonne nouvelle pour les eaux du Golfe. Ce sont des bactries vivant en
profondeur, aimant les eaux froides (autour de 5C), qui dgradent le ptrole.

2) analyse du laboratoire :
Ces chercheurs ont analys plus de 200 chantillons collects en 17 endroits en
mai et juin dans le Golfe du Mexique, lintrieur et autour dune nappe sousmarine dhydrocarbures situe plus de 1.000 mtres de profondeur. Grce
lutilisation dune puce ADN capable de dtecter plus de 50.000 espces
diffrentes de bactries en un temps record, les microbiologistes ont dtect la
prsence dune nouvelle espce de la famille des Oceanospirillales.
Les concentrations de bactries sont deux fois plus importantes dans la nappe
dhydrocarbures qu lextrieur. De plus les gnes bactriens ncessaires la
dgradation du ptrole taient eux aussi prsents en grandes quantits, ce qui
suggre que ce sont des bactries spcialises dans la digestion du ptrole qui
ont migr vers la nappe.
une autre tude sur la prsence de nappes dhydrocarbures sous-marine
soulignait que le taux doxygne navait pas chut comme on pouvait lattendre
en cas de prsence massive de bactries mangeuses de ptrole. Les scientifiques
craignaient que cela cre des zones mortes dans les eaux du Golfe. Hazen et

ses collgues observent que la biodgradation par les bactries ne saccompagne

pas dune baisse importante de loxygne nouvelle rassurante.

Dfinition :
Alcanivorax borkumensis est une bactrie marine , alcane dgradant qui se
propage naturellement et devient prdominant dans le ptrole brut , contenant
eau de mer de l' azote et du phosphore . Ils sont actuellement considres
comme des organismes pour dgrader le ptrole (les plus importantes du
monde ) .

Classification :
Rgne

Bacteria

Embranchement

Proteobacteria

Classe

Gammaproteobacteria

Ordre

Oceanospirillales

Famille

Alcanivoraceae

Genre

Alcanivorax

Description :
Borkumensis est une bactrie en forme de btonnet sans flagelles qui obtient son
nergie principalement des alcanes consommateurs (un type d'hydrocarbure ) . Il
est arobie , ce qui signifie qu'il utilise l'oxygne pour obtenir de l'nergie , et il
est halophile , ce qui signifie qu'il a tendance vivre dans des environnements
qui contiennent du sel , comme l'eau sale de l'ocan . Il est galement Gram
ngatif , ce qui signifie essentiellement qu'il a une paroi relativement mince de la
cellule . Il est galement immobiles ; Toutefois , d'autres organismes qui
semblent tre dans le mme genre sont mobiles par flagelles

Gnome :
Le gnome de A. borkumensis est un seul chromosome circulaire qui contient
3.120.143 paires de bases. Il est trs adapt l'huile de ptrole dgradants . Par
exemple, une certaine squence sur les codes du gnome de la dgradation d'une
certaine gamme d'alcanes . Le gnome de A. borkumensis a de nombreuses
squences qui codent pour chaque type diffrent d'alcane , ce qui lui permet
d'tre trs souple et versatile . Son gnome contient galement des instructions
pour la formation de biosurfactants qui aide dans le processus de dgradation .
Pour faire face aux menaces externes , le gnome de A. borkumensis galement
des codes pour plusieurs mcanismes de dfense. Faire face des concentrations
leves d'ions sodium ( l'eau de mer ) , et la protection contre le rayonnement
UV connu sur la surface de la terre sont la fois important pour les bactries A.
borkumensis , dont le gnome contient des moyens de rsoudre ces deux
problmes .

Structure de la cellule , du mtabolisme et du cycle de vie :

Alcanivorax borkumensis , un chemoorganotroph Gram ngatif en forme de tige
, est capable d'utiliser des n-alcanes comme source de carbone et d'nergie
principe par l'utilisation de la large gamme d'enzymes de dgrader le ptrole
qu'il possde , mais ils peuvent aussi utiliser un nombre limit de composs
organiques tels que les hydrocarbures aliphatiques , les acides gras volatils , et
du pyruvate . Cependant, on ne peut pas utiliser des sources de carbone telles
que des sucres ou des acides amins . Les cellules cultives avec du pyruvate ont
t observs tre de 2,0 3,0 micromtres de longueur et de 0,4 07
micromtres de diamtre , toutefois , les cellules taient plus courts ( 1,0 1,5
micromtres de longueur ) lorsque les cellules ont t cultives avec des nalcanes en tant que source de carbone . Lorsque la croissance lente borkumensis
utilise des n-alcanes exclusivement , les microbes produisent des lipides de
glucose tensioactifs extracellulaires et membranaires appeles biosurfactants .
Ces biosurfactants rduire la tension superficielle de l'eau de 72 29 mN m - 1
et agissent comme mulsifiants naturels qui amliore la rupture des mulsions
huile -dans-eau [4,5] . En raison de la faible solubilit de l'huile dans l'eau, plus
la dgradation de l' huile a lieu l'interface huile - eau o borkumensis attache et
forme un biofilm autour des gouttelettes d'huile .

mtabolisme :
Borkumensis principalement utilise des alcanes comme source d'nergie /
carbone , mais il peut utiliser quelques autres composs organiques .
Contrairement la plupart des autres cellules, il ne peut pas consommer les
substances les plus courants tels que des sucres ou des acides amins comme
source d' nergie .
Pour augmenter le taux d'une population de bactries A. borkumensis , du
phosphore et des composs azots . Ces substances agissent comme un engrais
pour les bactries et les aider grandir un rythme acclr .

Borkumensis et biosurfactants :
Lorsque A. bactries borkumensis utilisent alcanes comme source d' nergie ,
chaque cellule forme une biosurfactant .
Un bio-tensioactif est une couche supplmentaire de matriau qui forme le long
de la membrane cellulaire . Les substances qui composent le biosurfactant de
borkumensis peuvent rduire la tension superficielle de l' eau , ce qui contribue
la dgradation de l'huile . Ils sont galement des mulsifiants , qui servent en

outre crer l'mulsion huile / eau , ce qui rend plus soluble dans l'huile .
Borkumensis forme un biofilm autour d'une goutte d' huile dans l'eau de mer et
procde utiliser biosurfactants et mtabolisme dgrader l'huile en une
substance soluble dans l'eau .

Rle dans la biodgradation du ptrole :

L'Huile de ptrole est toxique pour la plupart des formes de vie et de la pollution
de l'environnement par le ptrole il provoque de graves problmes cologiques .
Une quantit considrable de l'huile de ptrole dans la mer est limin par les
activits de biodgradation microbienne des communauts microbiennes.
Borkumensis est une bactrie hydrocarbonoclastic rcemment dcouvert et est
probablement le plus important dgradeur mondiale de ptrole . Borkumensis est
capable de dgrader l'huile dans des environnements d'eau de mer . Il est connu
comme un organisme hydrocarbonoclastic , avec la racine " clastiques " signifie
qu'il peut diviser quelque chose en parties ( dans ce cas, hydrocarbures ) . Le
ptrole brut , ou du ptrole , est compose essentiellement d'hydrocarbures , un
produit qui est constitu d'une longue chane d'atomes de carbone lis des
atomes d'hydrogne . Alors que la plupart des organismes utilisent des sucres ou
des acides amins pour leur source de carbone / nergie , borkumensis utilise des
alcanes, un type d'hydrocarbure , dans son processus mtabolique . Ce rgime
permet borkumensis de prosprer dans des environnements marins qui ont t
touchs par les dversements de ptrole . Grce son mtabolisme ,
borkumensis peut briser l'huile en composs inoffensifs . Cette capacit fait de
cette espce en particulier une source potentielle majeure pour la bioremdiation
des milieux marins huile pollue .

Potentiel "anti-oil" agent de dversement :

Les dversements d'hydrocarbures peuvent se produire pendant le transport de
ptrole ou lors de l'extraction . Ces dversements peuvent dverser des quantits
importantes de ptrole dans l'ocan et de polluer l'environnement , affectant les
cosystmes de prs ou de loin .
Normalement , plusieurs annes sont ncessaires pour un cosystme se
remettre compltement ( le cas chant) d'un dversement de ptrole , les
scientifiques se sont penchs sur les moyens d'acclrer le nettoyage des zones
touches par un dversement de ptrole . La plupart des efforts utilisent jusqu'
prsent engagement / travail humain direct liminer physiquement l'huile de
l'environnement . Cependant , borkumensis prsente une alternative possible .
Depuis borkumensis dcompose naturellement les molcules d'huile un tat
non polluant , il serait utile pour l'cosystmes de rcuprer rapidement d'une
catastrophe en cas de dversement de ptrole . Les organismes aussi poussent

naturellement dans l'eau de mer contamine par le ptrole , ce sont donc une
espce indigne. Si le processus borkumensis utilise pour briser le ptrole
pourrait tre acclr ou rendu plus efficace , ce serait d'aider la rcupration des
cosystmes .
Voici quelques exemples :
encourager la croissance de borkumensis ( par le phosphore et la
fertilisation azote )
encourager le mtabolisme de borkumensis ils mtabolisent plus
rapidement et plus .

cologie :
Borkumensis se trouve naturellement dans les environnements d'eau de mer .
Elle est plus frquente dans les zones ocaniques contenant de l'huile de ptrole
( si des dversements , des champs naturels , ou d'autres sources ) , mais il peut
tre trouv en petites quantits dans l'eau non pollue . Il a t trouv travers le
monde dans divers endroits la fois dans les environnements ctiers et milieux
ocaniques . Il peut galement se dvelopper dans les zones mares lourds et
d'autres courants lis mer / dbit . On le trouve uniquement sur ou proximit de
la surface de l'eau.
Borkumensis peut vivre dans des salinits variant de 1,0 12,5 % et des
tempratures allant de 4 35 C . L'abondance de borkumensis dans des
environnements de ptrole est affect parce que les bactries utilisent les

composs dans l'huile comme source d' nergie , donc les populations de
borkumensis prosprer naturellement des dversements d'hydrocarbures ou
d'autres endroits similaires .
Borkumensis supplante d'autres espces du genre Alcanivorax , probablement en
raison de son ADN hautement flexible et le mtabolisme . Borkumensis
supplante galement d'autres organismes alcanes dgradant tels que
Acinetobacter venetianus .
Aprs une certaine priode de temps , une grasse et une solution saline contenant
environnement borkumensis et Acinetobacter venetianus finiraient par devenir
domin par borkumensis parce borkumensis peut consommer une grande varit
d' alcanes que les autres espces connues .

conclusions :
Ces rsultats fournissent de nouveaux
aperus sur les adaptations
mtaboliques ncessaires la
croissance sur alcanes et dans la base
gnomique de la vie
hydrocarbonoclastic . Depuis les cartes
2 - D ont rvl un certain nombre de
protines rguls la hausse avec des
fonctions inconnues dans le
mtabolisme des alcanes , leur tude
va srement apporter des informations
plus importantes dans ce mode de vie
unique.

BIBLIOGRAPHIES
Martins VAP et al. (2008). "Genomic Insights into Oil
Biodegradation in Marine Systems". Microbial Biodegradation:
Genomics and Molecular Biology. Caister Academic Press.
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 http://cordis.europa.eu/news/rcn/26097_fr.ht
ml
http://jb.asm.org/content/188/11/3763.full
http://actu-science.nouvelobs.com/bacteriemarine.html