Table des matières

INTRODUCTION......................................................................................................................................2

A- VIRUS WEST NILE...............................................................................................................................2

DEFINITION.........................................................................................................................................2

ORIGINE.............................................................................................................................................3

CARACTERISTIQUE..............................................................................................................................4

EPIDEMIOLOGIE..................................................................................................................................4

HABITA............................................................................................................................................4

TRANSMISSION...............................................................................................................................4

REPARTITON GEOGRAPHIQUE.......................................................................................................5

POUVOIR PATHOGENE........................................................................................................................5

MOYENS DE LUTTE.............................................................................................................................6

MANIFESTATION CLINIQUE.................................................................................................................6

B- ROTAVIRUS.........................................................................................................................................7

DEFINITION.........................................................................................................................................7

ORIGINE..............................................................................................................................................7

CARACTERISTIQUE..............................................................................................................................8

EPIDEMIOLOGIE..................................................................................................................................8

HABITAT..........................................................................................................................................8

TRANSMISSION ET PROPAGATION..................................................................................................9

POUVOIR PATHOGENE........................................................................................................................9

MOYENS DE LUTTE...........................................................................................................................10

MANIFESTATION CLINIQUE...............................................................................................................10

CONCLUSION........................................................................................................................................11
 République de côte d’Ivoire

Union-Discipline-Travail

Ministère de l’Enseignement Supérieur et de la recherche scientifique

EXPOSE DE MICROORGANISME
EMERGENT ET ALIMENT

Année Universitaire

2023-2024 PATHOGENE EMERGENT: VIRUS WEST NILE;

ROTAVIRUS

Présentée par:

BERETE MOHAMED ALI

AKPESS ESME JOELLE ESTHER

ENSEIGNANTE
Pr DADIE

Dr OUATTARA
INTRODUCTION

Aujourd’hui, on considère que plusieurs facteurs inhérents aux modes de vies

modernes favorisent l’émergence de nouveaux virus et la propagation de virus
existants. Un virus émergent est un virus qui apparait au sein d’un hôte, c’est-à
dire qu’il était jusqu’à présent inconnu à l’intérieur de l’organisme qu’il infecte.
Parmi ces virus émergent, le rotavirus et le virus West Nile feront l’objet de notre
attention

A- VIRUS WEST NILE

I- DEFINITION

Le virus de la fièvre de West Nile est un Flavivirus apparenté aux virus de

l’encéphalite St Louis, de l’encéphalite japonaise et de la fièvre jaune. La
maladie touche les humains, les chevaux et quelques espèces d’oiseaux. La
plupart des individus atteints présentent peu de signes cliniques ; des troubles
neurologiques graves peuvent néanmoins survenir, entraînant parfois la mort. Le
spectre d’hôtes du virus de la fièvre de West Nile est extrêmement large. Il se
réplique chez les oiseaux, les reptiles, les amphibiens, les mammifères, les
moustiques et les tiques. Le virus de la fièvre de West Nile est une maladie listée
dans le Code sanitaire pour les animaux terrestres de l’Organisation mondiale de
la santé animale (OMSA) et elle doit être déclarée à l’OMSA.

II- ORIGINE

Isolé pour la première fois en Ouganda en 1937, le virus de la fièvre de West

Nile a été incriminé comme étant la cause d’une épidémie humaine survenue en
Israël en 1951. Le rôle des moustiques dans la transmission virale a été
clairement démontré en Égypte dans les années 1950. Les oiseaux sauvages ont
été identifié comme réservoir du virus à peu près au même moment. Les
premiers cas équins de fièvre de West Nile ont été signalés plusieurs années plus
tard. La pathogénicité du virus pour les espèces aviaires domestiques a été
démontrée pour la première fois en 1997, lorsqu’une maladie paralysante affecta
des troupeaux de jeunes oies en Israël.

En août 1999, la fièvre de West Nile a fait une première incursion en Amérique
du Nord, probablement suite à l’importation d’un oiseau infecté, causant la mort
de nombre d’oiseaux sauvages ou de zoos dans la ville de New York, ainsi que
de chevaux et d’humains. En moins de dix ans la maladie s’est propagée dans
toute l’Amérique du Nord y compris le Mexique et le Canada, puis elle a gagné
l’Amérique du Sud. Depuis 1998, des foyers d’encéphalite équine due au virus
de la fièvre de West Nile ont été signalés en Italie, en France et en Amérique du
Nord. D’après les enquêtes sérologiques conduites dans plusieurs régions
d’Europe et du Moyen-Orient, près d’un tiers des chevaux testés avaient été
exposés au virus, y compris ceux qui ne présentaient aucun signe clinique

Appartenant à la famille des Flaviviridae, au

III- CARACTERISTIQUE genre Flavivirus, le virus de West Nile est un
virus enveloppé exposant à sa surface les
protéines M (membrane) et E (enveloppe).
Celles-ci enferment la nucléocapside virale
constituée de la protéine C et du génome viral
qui est un ARN monocaténaire de polarité
positive et infectieux d’environ
11 000 nucléotides. C’est un virion enveloppé
icosaédrique de 40 à 50 nm de diamètre dont
le génome est formé d’un simple brin d’ARN
de polarité positive d’environ 11 kilobases

IV- EPIDEMIOLOGIE

1- HABITA

Les oiseaux sont les hôtes habituels du virus, intervenant activement dans la
Dissémination virale. Le virus infecte les moustiques mais aussi les mammifères
considérés Comme des hôtes accidentels (essentiellement les chevaux, l’homme
occasionnellement). Toutefois, les principaux réservoirs sont les oiseaux
migrateurs ainsi que les espèces de Passereaux (geais, roselins mainates
religieux, moineaux et corneilles)

2- TRANSMISSION

La transmission du virus à l’homme se fait par un moustique infecté. Il n’y a pas

de contamination interhumaine possible. Le virus peut également être
transmis, plus rarement, par les produits d’origine humaine : transfusion
sanguine et transplantation d’organes, de tissus ou de cellules. Des cas de
transmission de la mère à l’enfant durant la grossesse, l’accouchement et
l’allaitement ont également été décrits.

3- REPARTITON GEOGRAPHIQUE

Le virus West Nile est distribué à l’échelle mondiale. Il circule en Afrique, à

Madagascar, Au Moyen Orient, en Océanie, en Inde, sur le continent américain
et en Europe. En France il est Présent autour du bassin méditerranéen

V- POUVOIR PATHOGENE

La plupart des personnes infectées par le VNO demeurent asymptomatiques. La

fièvre du Nil occidental est habituellement d’intensité légère et dure de 3 à 6
jours. Les principaux symptômes comprennent une fièvre d’apparition soudaine
accompagnée de frissons, d’éruption cutanées, d’un malaise général, de maux de
tête, de dorsalgies, de douleur musculaire et oculaire
 VI- MOYENS DE LUTTE

Il n’existe pas de traitement spécifique de la maladie. Il n’existe pas non plus de

vaccin disponible à ce jour. Le traitement est donc purement symptomatique. La
prophylaxie est essentielle : elle passe par la lutte contre les vecteurs notamment
l’utilisation de répulsif contre les moustiques par la surveillance des hauts
principaux.

VII- MANIFESTATION CLINIQUE

La fièvre de West Nile touche surtout les humains, les équidés et quelques
espèces d’oiseaux. Chez le cheval, les principaux signes cliniques d’atteinte
neurologique due au virus de la fièvre de West Nile sont les suivants : perte
d’appétit, dépression, ataxie, contractions musculaires, paralysie partielle, cécité
apparente, mouvements d’appui de la tête, grincements de dents, désorientation,
convulsions, une démarche en cercle et difficulté à avaler. L’affaiblissement,
généralement localisé dans les membres postérieurs, est parfois suivi de
paralysie. Dans certains cas, la maladie peut évoluer vers un coma et la mort. La
présence de fièvre n’est pas systématique. De nombreuses espèces aviaires sont
résistantes au virus. Chez les oiseaux susceptibles, tels que les oies, l’atteinte
neurologique se manifeste sous diverses formes allant d’une incapacité à se tenir
debout à une paralysie des pattes et des ailes. Lorsqu’ils sont dérangés, ces
oiseaux plus susceptibles restent prostrés ou présentent une mauvaise
coordination des mouvements. Chez les oies le taux de mortalité oscille entre
20% et 60%. Il n’existe pas de traitement spécifique contre la maladie, hormis le
traitement symptomatique. La guérison intervient spontanément dans la plupart
des cas, chez l’homme comme chez l’animal.
 B- ROTAVIRUS

I- DEFINITION

Le rotavirus est un virus responsable de gastroentérites chez l'enfant. La

gastroentérite, aussi appelée « gastro », est une inflammation de la paroi de
l'estomac et de l'intestin qui provoque de la diarrhée et des vomissements.

II- ORIGINE

Rotavirus a été identifié en 1973 par Ruth Bishop à Melbourne. Les rotavirus
sont la première cause de gastro-entérites graves chez les nourrissons et les
jeunes enfants dans le monde. Ils semblent pouvoir infecter les glandes
salivaires, la salive devenant alors un agent infectieux ; avec les norovirus, ils
causent des gastro-entérites chez environ 300 millions de nouveau-nés et jeunes
enfants par an.
 III- CARACTERISTIQUE

Le rotavirus humain est classé dans le genre Rotavirus de la famille des

Reoviridea. Le Rotavirus est un virus non enveloppé en forme de roue et de 70
nm de diamètre. Il possède une Capside icosaédrique à trois couches. Le génome
viral est constitué de 11 segments d’ARN Bicaténaire. Le rotavirus peut être
classé en sept sérogroupes (A-G).

IV- EPIDEMIOLOGIE

1- HABITAT

Les humains sont le seul réservoir du Rotavirus, Ce virus est très résistant et
peut persister en milieu extérieur pendant quelques semaines.
 2- TRANSMISSION ET PROPAGATION

Le virus se propage d’une personne a une autre, tout spécialement si les

personnes qui souffre de diarrhée ne se lavent pas soigneusement les mains
après être allé à la scelle. Une infection peu également survenir lorsque les
personnes mettent leurs mains à la bouche après avoir touchés un objet
contaminé par des selles infectées. Ce type de transmission par des selles
infectées est appelé transmission oro-fécale. Des personnes peuvent également
s’infectées en mangeant des aliments ou en buvant de l’eau contaminé par le
virus. Les adultes peuvent être infectés en contact étroit avec un nourrisson
infecté, mais une infection grave est rare.

3- REPARTITION GEOGRAPHIQUE

Le rotavirus, omniprésents dans le monde, sont la première cause de diarrhées

aigües chez les petits enfants. En suisse, selon les études et données de l’office
fédéral de la statistique, l’on estime le nombre de malades a 6600 et le nombre
d’hospitalisation a 1500 par an chez les enfants de moins de 5 ans.

V- POUVOIR PATHOGENE

L’infection causée par le rotavirus dure de 3 à 8 jours, avec une moyenne de 4 à

6 jours. La période d’incubation du virus dure de 24 à 72 heures. La dose
infectieuse est inconnue. Le virus infecte les cellules matures des villosités de
l'épithélium de l'intestin grêle ; Syndrome caractérisé par de la fièvre et des
vomissements, suivis d'une diarrhée aqueuse, parfois associé à une
déshydratation sévère et létale chez l’enfant ; les troubles neurologiques associés
au déséquilibre électrolytique, la méningite.

Principale cause de gastro-entérite chez l'enfant ; les plus forts taux d'infection
s'observent chez les enfants âgés de 4 mois à 3 ans ; l'infection est
habituellement asymptomatique chez l’adulte.

VI- MOYENS DE LUTTE

La gastroentérite virale reste bénigne et de courte durée, elle ne nécessite pas de

traitement antibiotique. Le risque principal est la déshydratation principalement
chez le nourrisson. Il est conseillé de consulter un médecin en cas d’absence
d’amélioration des symptômes pour les personnes les plus fragiles, les femmes
enceintes et les personnes de bas âges. Se laver les mains soigneusement et
régulièrement est le moyen le plus efficace pour lutter contre le virus après être
allé aux toilettes, avant de s’occuper d’un enfant ou de manger et de cuisiner.

VII- MANIFESTATION CLINIQUE

Le rotavirus cause la diarrhée. Mais il existe d’autres symptômes. Comme des

nausées, des vomissements, de la fièvre, des maux d’estomac, une respiration de
plus en plus rapide. Une diminution de l’urine que l’on peut constater au niveau
des couches du bébé, moins humides que d’habitude… Les enfants comme les
adultes, dans les cas les plus sévères, peuvent souffrir de déshydratation,
nécessitant parfois une hospitalisation.

En pratique, de la fièvre est d’abord constatée chez l’enfant. Ensuite, il vomit,

puis fait de la diarrhée qui peut s’étendre sur plusieurs jours. Il a la bouche
sèche, la peau l’est aussi dans les cas les plus graves, et l’enfant semble très
fatigué. Parce qu’il perd beaucoup de liquides, il a particulièrement soif et peut
demander à boire plus que d’ordinaire.

CONCLUSION

En sommes les agents infectieux sont en constante évolution et l’action de

l’homme interagit avec ceux-ci, leur cycle écologique et épidémiologique
favorise ainsi les émergences sans que l’on puisse réellement affirmer que l’on
assiste depuis plusieurs décennies à leur augmentation, leur détection étant
maintenant grandement facilitée. Si nous disposons de moyens de lutte efficace
contre les maladies infectieuses répertoriées, nous ne pouvons prétendre pouvoir
prévoir et empêcher la survenu de toutes les émergences infectieuses
REFERENCES

RiceCM. Flaviviridae: the viruses and their replication, 3rd ed.Philadelphie :

Lippincott-Raven Press, 1996. [Google Scholar]

https://www.pasteur.fr/fr/centre-medical/fiches-maladies/west-nile

http://www.cfsph.iastate.edu/DiseaseInfo/disease.php?name=west-nile-
virus&lang=en

http://www.merckvetmanual.com/SearchResults?query=west+nile+fever