BIOQUÍMICA
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BIOQUÍMICA
BIOQUÍMICA
LA QUIMICA DE LA VIDA:
Cuando el carbono se oxida, pierde electrones, se calienta.
POLARIDAD
El agua es una molécula polar, tiene más fuerza de atracción hacia otros compuestos
polares.
También lo es el metanol, molécula hidrofílica (interacciona bien con el agua, es
soluble)
No lo es un ácido graso por ejemplo (parte hidrófoba, apolar, no se lleva bien con el
agua, en ella no se disuelve, formará micelas…). Las membranas celulares están
hechas de moléculas apolares, para poder aislarse del exterior.
ISOMEROS
Son compuestos que tienen la misma fórmula molecular pero diferente estructura
entre los átomos, lo que conlleva a resultados diferentes tanto físicos como sus
propiedades.
ISÓMEROS ESTRUCTURALES:
o Anómeros: El alfa y beta de cada disacárido o tal. Los anómeros son aquello que
difieren en la configuración del carbono asimétrico, por ejemplo, el alfa y beta D
glucosa.
REACCIONES
Condensación: Reacción de un ácido carboxílico con un grupo amina (formando un péptido
por ej.) liberándose agua. Esto es una condensación, formándose un enlace covalente, y
formar polímeros.
Hidrólisis: Se rompe un enlace covalente cuando reacciona con agua, mediante ella.
Las biomoléculas más importantes suelen ser polímeros.
CÁLCULO DEL PH
LA IMPORTANCIA DEL PH EN LA BIOLOGIA HUMANA
Un hombre de 45 años con náuseas, vómitos y con fuerte dolor abdominal. (Hay que hacerle
una bioquímica sanguínea, para medir el nivel de CO2, O2, el pH sanguíneo y niveles de
bicarbonato en sangre). Tiene una presión de co2 de 85mmHg, una presión parcial de o2 de 43
mmHg y un pH de 7,61 y la concentración plasmática de bicarbonato es de 82Mm
Nivel alto co2 (35-45mmHg)
Nivel bajo o2 (75-100mmhg)
pH muy fuera del rango normal lo que más nos preocupa (todos lo son)
Altísimo nivel de concentración de bicarbonato. (22-26 mM)
Es normal que si alta concentración de co2, alta concentración de bicarbonato. Es DP.
ACIDOSIS (pH menor del normal)-ALKADOSIS (mayor del normal)
FORMULA DE HENDERSON-HASSELBACH: (apuntes a mano)
Conclusión: tiene alcalosis, estaba hiperventilando el paciente ya que a nivel alto de co2 mayor
pH (más básico entonces).
Habrá que suministrar al paciente soluciones que le permitan amortiguar el pH.
HIDRATOS DE CARBONO
Los hidratos de carbono (carbohidratos, glúcidos, sacáridos o azúcares) son las moléculas
orgánicas más abundantes de la naturaleza. Los más simples están compuestos por C, H y O
con la fórmula estequiométrica (CH2O) (que expresada como Cn(H2O)n explica el nombre de
hidrato de carbono). Sin embargo, muchos derivados no retienen esta fórmula y pueden
contener N, P o S. Su tamaño es variado (desde menos de 100 Da hasta millones de Da),
porque pueden existir en forma de monómeros libres (llamados monosacáridos) o como
cadenas con varios monosacáridos unidos covalentemente. Además, los carbohidratos pueden
unirse a proteínas y lípidos, dando lugar a glucoconjugados.
NOMENCLATURA
No existe una nomenclatura sistemática para la gran mayoría de los carbohidratos. Más bien
se usa un nombre común para cada uno de ellos. En el caso de los monosacáridos y disacáridos
sus nombres comunes terminan en -osa.
La -ulosa suele ser la cetosa de la aldosa correspondiente: eritrosa/eritrulosa, ribosa/ribulosa
MONOSACÁRIDOS
Los monosacáridos son aldehídos o cetonas con dos o más grupos hidroxilo. Más
concretamente, los monosacáridos están formados por una cadena lineal de carbonos unidos
por un enlace covalente simple. Cada carbono está unido a un grupo hidroxilo, excepto uno de
ellos que forma parte de un grupo carbonilo. Los monosacáridos cuyo grupo carbonilo está en
un extremo de la cadena (grupo aldehído) se denominan aldosas; mientras que aquellos con el
carbonilo en el segundo carbono (grupo cetona) se denominan cetosas. Por tanto, los
monosacáridos son polihidroxialdehidos (aldosas) o polihidroxicetonas (cetosas). Son solubles
en agua e insolubles en disolventes no polares. La mayoría son dulces.
El número de átomos de carbono varía entre 3 y 8. Los monosacáridos más comunes son las
triosas, las tetrosas, las pentosas y las hexosas. A continuación, se muestran algunos de los
monosacáridos más representativos.
.
Todos los monosacáridos, excepto la dihidroxiacetona, tienen al menos un carbono
asimétrico (marcado en rojo en la imagen superior). Los cuatro grupos de átomos unidos al
átomo de carbono asimétrico se pueden organizar en el espacio de diferentes maneras, lo que
da como resultado distintos isómeros ópticos o estereoisómeros. La gran mayoría de los
monosacáridos que se encuentran en la naturaleza son estereoisómeros de la serie D. Es
decir, tienen el grupo hidroxilo en el átomo de carbono asimétrico más alejado del grupo
principal (por ejemplo, carbono 5 en el caso de D-glucosa) orientado hacia el lado derecho en
la proyección de Fischer.
PODER REDUCTOR DE LOS MONOSACÁRIDOS
Los monosacáridos son agentes reductores. El carbono carbonilo se puede oxidar a un grupo
carboxilo mediante agentes oxidantes relativamente suaves. Esto tiene implicaciones
prácticas. La concentración de glucosa en sangre u orina se puede determinar mediante una
reacción catalizada enzimáticamente basada en la capacidad reductora de la glucosa.
CICLACIÓN DE LOS MONOSACÁRIDOS
Aunque las estructuras de los monosacáridos frecuentemente se representan como moléculas
de cadena lineal, de hecho, en solución acuosa, las aldotetrosas y todos los monosacáridos de
cinco o más átomos de carbono se encuentran predominantemente como estructuras cíclicas.
La proyección de Haworth es la manera más común de representar la estructura cíclica de los
monosacáridos.
Los anillos de monosacáridos se generan por la reacción del grupo carbonilo con un grupo
hidroxilo del propio monosacárido, formando un hemiacetal (en el caso de las aldosas) o
un hemicetal (en el caso de las cetosas). Los anillos de seis miembros se conocen
como piranosas y los anillos de cinco miembros como furanosas. El carbono involucrado
en la ciclación del monosacárido se conoce como carbono anomérico y es un carbono
asimétrico. Los dos estereoisómeros de un monosacárido cíclico se conocen como
anómeros (αα y ββ). En solución, la apertura del anillo seguida de una nueva ciclación
puede dar como resultado la interconversión entre anómeros. Este proceso se
llama mutarrotación.
Ayudas para la interpretación de la proyección de Haworth:
o El anillo se debe imaginar perpendicular al papel (o la pantalla). A veces, los enlaces
más cercanos al lector se muestran más gruesos que los más alejados para dar una sensación
de perspectiva
o El átomo de oxígeno ocupa la esquina superior derecha (en piranosas) o el centro
superior (en furanosas)
o Los sustituyentes que están a la derecha en la proyección de Fischer están abajo en la
proyección de Haworth. Los sustituyentes que están a la izquierda en la proyección de Fischer
están arriba en la proyección de Haworth
o En los estereoisómeros D, el grupo terminal -CH 2OH se coloca sobre el plano del anillo
VIDEO EXPLICATIVO:
Ciclación de la glucosa (aldohexosa)
DISACÁRIDOS Y POLISACÁRIDOS
DISACÁRIDOS
Un disacárido se forma por la unión de dos monosacáridos a través de un enlace O-
glucosídico. El enlace O-glucosídico es un enlace tipo éter entre un carbono anomérico y un
carbono hidroxilo (en este caso de otro monosacárido). La formación de este enlace es una
reacción de condensación; mientras que su degradación es una reacción de hidrólisis.
En contacto con el agua un monosacárido se cicla y se descicla todo el rato, ósea habrá alfas y
betas siempre, pero cuando el carbono anomérico forma un enlace O-glucosídico con otro
monosacárido, ya no se puede desciclar, el de la izquierda, pero el carbono anomérico del
segundo monosacárido esta libre, este si se puede desciclar y ciclar todo el rato en el agua.
CLASIFICACIÓN DE LOS DISACÁRIDOS
Los disacáridos se agrupan en:
Disacáridos reductores: el enlace O-glucosídico se establece entre el carbono anomérico de un
monosacárido y un grupo -OH de otro monosacárido que no está unido a su carbono
anomérico. Este último carbono conserva su capacidad reductora.
Disacáridos no reductores: el enlace O-glucosídico se establece entre dos carbonos
anoméricos. A diferencia de los anómeros de los que se derivan, los glucósidos anoméricos no
se interconvierten por mutarrotación, perdiendo su capacidad reductora. Por tanto, si ambos
carbonos anoméricos participan en el enlace O-glucosídico, el disacárido no tiene poder
reductor.
NOMENCLATURA
Los disacáridos se nombran por un nombre común o un nombre que se refiere a sus
monosacáridos y tipo de enlace, siguiendo esta secuencia:
Monosacárido no reductor terminado en -il
Posición de los átomos de carbono en el enlace glucosídico
Segundo monosacárido terminado en -osa
La configuración del carbono anomérico es de especial importancia porque no hay posibilidad
de interconversión con el otro anómero.
A continuación, se muestran algunos disacáridos relevantes:
La sacarosa es un disacárido formado por una glucosa y una fructosa unidas mediante
un enlace α1→2. La sacarosa se conoce comúnmente como azúcar de mesa y se
obtiene de la caña de azúcar o de la remolacha azucarera. La sacarosa no contiene
carbonos anoméricos libres, por lo tanto, es un azúcar no reductor.
En la sacarosa, el alfa y beta de los dos monosacáridos importan, ósea tienen que ser
como es. No como en los demás, que al tener el c anomérico libre podía ser el alfa o
beta indiferentemente (solo el segundo monosacárido que tenía el c anomérico libre).
La capacidad reductora tiene que estar abierto el monosacárido, por eso la sacarosa
como ninguno de los dos no se puede desciclar, no se puede abrir, no reduce. En
cambio, la lactosa si es reductora porque uno de los monosacáridos se puede abrir.
POLISACÁRIDOS
Los polisacáridos (también conocidos como glucanos o glicanos) son los glúcidos más
abundantes en la naturaleza. Son azúcares no reductores, poco o nada solubles en agua,
donde generalmente dan soluciones coloidales, no tienen sabor dulce y no sufren
mutarrotación.
Los polisacáridos son grandes polímeros compuestos por decenas o miles de unidades de
monosacáridos unidas entre sí por enlaces O-glucosídicos.
Según la naturaleza de sus unidades monoméricas, podemos tener:
Homopolisacáridos u homoglucanos: por repetición de un solo monosacárido (glucanos,
mananos, fructanos, etc.).
Heteropolisacáridos o heteroglucanos: dos o más tipos de monosacáridos en el
polímero.
La longitud de un polisacárido varía dentro de unos límites, aunque, a diferencia de otros
biopolímeros como las proteínas, los polisacáridos no tienen un número definido de residuos.
La forma de la cadena: lineal o ramificada. El grado de ramificación también puede ser
diferente.
Los polisacáridos se pueden clasificar según su función en:
Polisacáridos de reserva: actúan como depósitos de combustible.
Polisacáridos estructurales: mantienen las estructuras biológicas.
Polisacáridos de reserva
Los polisacáridos de reserva son homopolisacáridos. Almacenan monosacáridos que pueden
utilizarse como fuente de energía. Los polisacáridos de reserva más importantes son el
almidón en las células vegetales y el glucógeno en las células animales. Ambos se encuentran
en el citoplasma formando gránulos.
El glucógeno consta de cadenas lineales de residuos de glucosa unidas por enlaces α1→4 con
ramificaciones en posiciones α1→6.Las ramificaciones aparecen aproximadamente cada 10
residuos y dan lugar a una estructura de “árbol”. Prácticamente todas las células de mamíferos
contienen glucógeno, pero es especialmente abundante en el hígado(4 a 8% en peso de tejido)
y en las células del músculo esquelético(0.5 a 1%). A pesar de la menor proporción, alrededor
del 70% del glucógeno total del cuerpo se almacena en las células musculares.
La diferencia fundamental con los polisacáridos de reserva es la presencia de enlaces ββ, lo
que da como resultado una estructura muy alargada. Las cadenas de celulosa se estabilizan
mediante enlaces de hidrógeno entre glucosas vecinas. Esto da lugar a estructuras lineales que
están asociadas entre sí por enlaces de hidrógeno entre cadenas. Como resultado, la celulosa
se empaqueta en fibras con gran resistencia a la tensión. La gran cantidad de enlaces de
hidrógeno intramoleculares también limita la capacidad de formar enlaces de hidrógeno con
el agua. Las fibras de celulosa, a su vez, se asocian con otros polisacáridos formando una
estructura compleja entrecruzada.
La mayoría de los animales, incluyendo los humanos, no pueden utilizar celulosa como
fuente de glucosa. Nuestro arsenal metabólico carece de enzimas capaces de catalizarla
hidrólisis de los enlaces glucosídicos ββ de la celulosa. En cualquier caso, la celulosa es
importante en nuestra dieta porque constituye la fibra dietética que facilita el tránsito
intestinal.
Ciertos microorganismos secretan celulasa y pueden catalizar la hidrólisis de la celulosa. La
presencia de estos microorganismos en el tracto digestivo de los rumiantes permite que estos
animales utilicen celulosa para obtener energía. Las termitas también tienen protozoos en sus
intestinos capaces de digerir la celulosa. Muchos hongos también producen celulasas, lo que
les permite utilizar la madera como fuente de glucosa.
La quitina es otro ejemplo de homopolisacárido estructural. La quitina está presente
en la pared celular de los hongos y el exoesqueleto de los artrópodos (por ejemplo,
crustáceos, arácnidos e insectos). Es la segunda molécula orgánica más abundante en
la naturaleza. Se compone de unidades de N-acetil-glucosamina con
enlaces β1→4.Esta configuración del enlace glucosídico da como resultado la
formación de fibras extensas que la mayoría de los animales no pueden digerir. La
quitina forma una matriz en la que también se produce la mineralización.
HETEROPOLISACÁRIDOS
El peptidoglucano es un componente rígido de las paredes celulares bacterianas. Es
un heteropolisacárido lineal de N-acetilglucosamina y ácido N-acetilmurámico unidos por
enlaces β1→4. Los polímeros lineales están entrelazados por péptidos cortos que
proporcionan rigidez a la pared celular.
La lisozima, una enzima que se encuentra en nuestras lágrimas, cataliza la degradación del
enlace glucosídico entre la GlcNAc y el MurNAc destruyendo las células bacterianas.
La penicilina, y otros antibióticos relacionados, actúa contra enzimas responsables de la
formación de los enlaces entre los péptidos de los entrecruzamientos del peptidoglucano.
Glucosaminoglucanos: La matriz extracelular de nuestras células es rica en heteropolisacáridos
que, junto con las proteínas fibrosas, aportan fuerza y resistencia a los tejidos. Estos
heteropolisacáridos se conocen como glucosaminoglucanos, polímeros lineales con
enlaces β1→4 de disacáridos.
Los grupos carboxilo y sulfato cargados negativamente forman enlaces de hidrógeno con
moléculas de agua, creando un gel hidratado. Esto aumenta la viscosidad del medio y le
da una consistencia elástica proporcionando un soporte flexible para la matriz
extracelular.
Algunos ejemplos de glucosaminoglucanos son el ácido hialurónico, el sulfato de
condroitina, el sulfato de queratán, el heparán sulfato y la heparina.
El ácido hialurónico es un elemento característico del tejido conectivo que actúa como
“cemento” intercelular. Se encuentra en gran cantidad en el humor vítreo y el líquido sinovial
de las articulaciones, los cartílagos y los tendones. Es un polisacárido viscoso, de alto peso
molecular que actúa como agente lubricante. La hialuronidasa es una enzima secretada por
bacterias patógenas que cataliza la hidrólisis del ácido hialurónico, disminuyendo la viscosidad
del medio extracelular y haciendo a los tejidos más susceptibles a la invasión bacteriana.
El enlace beta en agua se vuelve viscoso, por eso las articulaciones, el humor vitreo tal. Son
viscosos , tienen enlaces beta y contienen agua.
Hyaluronic acid
La heparina es un glucosaminoglicano con alto contenido en sulfato. La heparina no es un
polisacárido estructural extracelular, sino que se almacena dentro de los gránulos secretores
de los mastocitos y se libera en los vasos allí donde se produce una lesión tisular (tal vez para
proteger contra las infecciones, aunque su función aún no está clara). Como medicamento, se
usa ampliamente por sus propiedades como anticoagulante.
*(DE ESTO HAY QUE SABER QUE ES UN
GLUCOSAMINOGLUCANO, O SEA SABER
IDENTIFICAR QUE ES UNO DE ELLOS, PERO NO
HACE FALTA SABERSE CADA MOLÉCULA.)
PROTEINAS
Son heteropolímeros de alfa-aminoácidos.
Conformación = función. Si se desconforma la proteína, pierde la función que tenía. No se
rompen enlaces, cambian los ángulos. Esto provoca las enfermedades neurodegenerativas, por
los priones, un mal plegamiento proteico.
Un cambio de configuración supone una ruptura de enlace. Las proteínas no cambian su
configuración.
Hay unas fuerzas que permiten la compactación de la proteína: enlaces de hidrógeno,
interacciones hidrofóbicas, fuerzas electrostáticas, fuerzas de Van der Waals.
ESTRUCTURAS:
PRIMARIA: Secuencia de aminoácidos.
SECUNDARIA: Es el plegamiento regular, hélice o láminas
Alfa hélice: La queratina.
Beta laminar:
Hélice de colágeno: Las prolinas se hidroxilan y eso permite la formación de
puentes hidrogeno.
Cada fibra de colágeno está formada por la triple hélice estabilizados por ph o
puentes disulfuro.
TERCIARIA: La disposición espacial de la proteína
CUATERNARIA: Más de una cadena polipeptídica, la derivada de las interacciones entre
las cadenas polipeptídicas. Las interacciones en esta estructura, permite la aparición de
nuevas propiedades en la proteína, que antes no había.
ENLACE:
El enlace peptídico es rígido y plano y tiene una configuración trans.
La conformación de la proteína va a decidir los ángulos del enlace, aunque en general se diga
que son de 180º.
NUCLEÓTIDOS Y ÁCIDOS
NUCLEICOS
ENZIMAS
LÍPIDOS
Los lípidos constituyen un grupo químicamente heterogéneo de compuestos con una
característica común, su baja solubilidad en agua y su solubilidad en disolventes no polares.
ÁCIDOS GRASOS
Los ácidos grasos son el componente más común de los lípidos. Químicamente son ácidos
carboxílicos con una cadena alifática que contiene de 4 a 36 átomos de carbono.
Los ácidos grasos naturales más comunes son no ramificados y contienen un número par de
entre 12 y 24 carbonos. El número par de carbonos es consecuencia de su mecanismo de
síntesis, que tiene lugar mediante la condensación de unidades de acetato (de dos carbonos
cada una). La solubilidad de los ácidos grasos disminuye a medida que aumenta el número de
átomos de carbono.
Los átomos de carbono de los ácidos grasos se enumeran como C1, C2, C3, etc., partiendo del
grupo COOH. Alternativamente, pueden numerarse comenzando por el grupo metilo
como ω1ω1, ω2ω2, ω3ω3, etc.
Los ácidos grasos pueden ser saturados o insaturados. Los ácidos grasos saturados carecen de
dobles enlaces entre carbonos. Los ácidos grasos insaturados pueden
ser monoinsaturados (un doble enlace) o poliinsaturados (con dos o más dobles enlaces).
Se nombran agregando el sufijo “-enoico” después del nombre del hidrocarburo precedido por
el tipo y la posición del doble o los dobles enlaces. También se denominan por el esqueleto de
carbonos o tienen un nombre común.
Por ejemplo:
Ácido cis-9-octadecenoico» 18:1ΔΔ9 » ácido oleico
Los dobles enlaces en los ácidos grasos insaturados naturales se encuentran comúnmente
en configuración cis.
En la mayoría de los ácidos grasos monoinsaturados, el doble enlace se encuentra entre C9 y
C10. En los ácidos grasos poliinsaturados (PUFA, del inglés polyunsaturated fatty acids), los
dobles enlaces suelen estar separados por un grupo metileno (−CH2−−CH2−).
Los ácidos grasos insaturados tienen puntos de fusión más bajos en comparación con los
ácidos grasos saturados del tamaño correspondiente, debido a que no se pueden empaquetar
tan fácilmente.
Existen dos ácidos grasos esenciales para los humanos (es decir, son necesarios pero nuestro
metabolismo no puede sintetizarlos):
Ácido linoleico (18:2ΔΔ9,12)
Ácido αα-linolénico (18:3ΔΔ9,12,15)
Ambos ácidos grasos deben aportarse en la dieta.
Otro PUFA importante es el ácido araquidónico (20:4ΔΔ5,8,11,14), precursor de prostaglandinas,
tromboxanos y leucotrienos.
Por último, diversos estudios clínicos y epidemiológicos sugieren que los ácidos grasos
poliinsaturados con un doble enlace entre el tercer y cuarto carbono del extremo metilo
(PUFA ω3ω3) tiene un potencial efecto protector frente a enfermedades cardiovasculares. Esta
asociación podría estar relacionada con el papel de estos ácidos grasos en la inflamación, la
agregación plaquetaria, la hipertensión o la hiperlipidemia. La “dieta mediterránea” es rica en
PUFA ω3ω3.
Los ácidos grasos trans se forman por hidrogenación parcial de ácidos grasos insaturados.
Están presentes en productos lácteos y de panadería, ya que en su elaboración se utilizan
aceites vegetales que han sido parcialmente deshidrogenados (lo que aumenta la estabilidad
de los aceites a altas temperaturas y da a los alimentos un mejor sabor y textura). Los dobles
enlaces trans permiten que el ácido graso adopte una conformación más extendida. De esa
manera, los ácidos grasos trans pueden empaquetarse con mayor regularidad y presentan
puntos de fusión más altos que las formas cis.
Los ácidos grasos trans se consideran nocivos para la salud. La ingesta de grasas trans se ha
asociado con un mayor riesgo de enfermedad cardíaca, diabetes, etc.
TRIACILGLICÉRIDOS
Los triacilglicéridos (TAG) contienen tres ácidos grasos esterificando los tres grupos
hidroxilo del glicerol. También se conocen como triglicéridos o grasas neutras.
Los átomos de carbono del glicerol se designan como αα, ββ y γγ, o como 1, 2 y 3. Los TAG de
origen natural suelen contener dos o tres ácidos grasos diferentes. Cada especie animal tiene
un patrón característico de composición de ácidos grasos. Así, la grasa corporal humana
contiene 50% de ácido oleico, 25% de ácido palmítico, 10% de linoleico y 5% de ácido
esteárico. Un TAG típico en humanos es el 1-estearoil, 2-linoleoil, 3-palmitoil glicerol.
Debido a que los grupos hidroxilo polares del glicerol y los grupos carboxilo polares de los
ácidos grasos están formando enlaces éster, los TAG son moléculas no polares, hidrófobas,
insolubles en agua.
Los aceites son TAGs que contienen una alta proporción de ácidos grasos insaturados o de
cadena corta. Los aceites se encuentran generalmente en las plantas y son líquidos a
temperatura ambiente. Las grasas contienen más ácidos grasos saturados y de cadena larga y,
en consecuencia, son sólidos a temperatura ambiente. Las grasas son principalmente de origen
animal.
En nuestro organismo, los TAGs se encuentran predominantemente en adipocitos. La función
principal de los TAGs es almacenar energía y proporcionar aislamiento.