Bioquímica
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ENZIMAS
Las enzimas son biocatalizadores (polímeros biológicos) que aceleran la velocidad
de las reacciones químicas que ocurren en nuestro cuerpo.
Casi todas las enzimas son proteínas (excepciones notables son ARN ribosomales y
ribozimas).
Las deficiencias de la cantidad o actividad catalítica de las enzimas claves puede
sobrevenir de defectos genéticos, déficit nutricional o toxinas.
Las enzimas defectuosas pueden producirse por: 1. Mutaciones genéticas
2 .Virus o bacterias patógenos.
Son importantes en la producción de productos alimenticios o el aumento del valor
del mismo, ejem: proteasa quimosina (renina) es la utilizada en la elaboración del
queso.
Son catalizadores estereoespecificos y de manera típica catalizan solo un
estereoisómero.
Pueden convertir sustratos no quirales en productos quirales.
Su nombre frecuente describe la reacción que catalizan seguido por el sufijo –asa.
Las enzimas se agrupan en seis clases:
1. Oxidorreductasas: catalizan oxidaciones y reducciones.
2. Transferasas: catalizan la transferencia de porciones, como grupos glucosilo,
metilo o fosforilo.
3. Hidrolasas: catalizan la división hidrolítica de C—C, C—O,
C—N y otros enlaces covalentes.
4. Liasas: catalizan la división de C—C, C—O, C—N y otros enlaces covalentes
mediante eliminación de átomo, dejando dobles enlaces.
5. Isomerasas: catalizan cambios geométricos o estructurales dentro de una
molécula.
6. Ligasas: catalizan la unión de dos moléculas en reacciones acopladas a la
hidrólisis de ATP.
muchas coenzimas,
cofactores y grupos
prostéticos son derivados
de vitamina B
Las enzimas utilizan múltiples mecanismos para lograr la catálisis.
Resumen
El estudio de la cinética enzimática —los factores que afectan los índices de reacciones
catalizadas por enzima— revela los pasos individuales mediante los que las enzimas
transforman sustratos en productos.
La DG, el cambio general de la energía libre para una reacción, es independiente del
mecanismo de reacción, y no proporciona información respecto a los índicesde reacciones.
La Keq es una proporción de constantes de índicede reacción, se calcula a partir de las
concentraciones de sustratos y productos en equilibrio, o a partir de la proporción k1/k21.
Las enzimas no afectan la Keq.
Las reacciones proceden por medio de estados de transición en los cuales DGF es la
energía de activación. La temperatura, la concentración de ion hidrógeno, la concentración
de enzima, la concentración de sustrato, y los inhibidores, afectan los índices de reacciones
catalizadas por enzima.[S2] en aumento
para una reacción de “pingpong” de dos sustratos. El aumento de la concentración de un
sustrato (S1) mientras se mantiene constante la del otro sustrato (S2) altera las
intersecciones tanto x como y, pero no la pendiente.
En la medición del índice de una reacción catalizada por enzima por lo general se emplean
condiciones de índice iniciales, para las cuales la ausencia virtual de producto impide de
forma efectiva que ocurra la reacción inversa.
Las formas lineales de la ecuación de MichaelisMenten simplifican la determinación de
Km y Vmáx. Una forma lineal de la ecuación de Hill se usa para evaluar la cinética de
unión a sustrato cooperativa mostrada por algunas enzimas multiméricas. La pendiente n, el
coeficiente de Hill, refleja el número, la naturaleza y la fuerza de las interacciones de los
sitios de unión a sustrato. Un valor de n de más de 1 indica cooperación positiva.
Los efectos de inhibidores competitivos simples, que por lo general semejan sustratos, se
superan al aumentar la concentración del sustrato. Los inhibidores no competitivos simples
disminuyen la Vmáx pero no afectan la Km.
Los sustratos pueden añadirse en un orden al azar (cualquier sustrato puede combinarse
primero con la enzima) y en un orden forzoso (el sustrato A debe unirse antes que el
sustrato B)
.
En reacciones de “pingpong”, uno o más productos se liberan a partir de la enzima antes de
que se hayan añadido todos los sustratos.
Importancia biomédica:
2. Fosforribosilación de purinas.
Gran parte del DNA se asocia con proteínas histona para formar una estructura
llamada nucleosoma, que consta de un octámero de histonas alrededor del cual se
envuelven alrededor de 150 bp de DNA.
El DNA muy activo en el aspecto transcripcional (los genes) suele estar agrupado en
regiones de cada cromosoma. Dentro de estas regiones, los genes pueden estar
separados por DNA inactivo en estructuras nucleosómicas. En eucariotas la unidad
de transcripción —la parte de un gen que es copiada por la RNA polimerasa— a
menudo consta de regiones de DNA codificadoras (exones) interrumpidas por
secuencias interpuestas de DNA no codificador (intrones).
Ácidos grasos
En varias especies se han identificado más de 100 ácidos grasos distintos. Los ácidos grasos
difieren entre sí en la longitud de sus colas de hidrocarburo, la cantidad de dobles enlaces
carbonocarbono, las posiciones de los dobles enlaces en las cadenas y la cantidad de
ramificaciones. Algunos ácidos grasos comunes en los mamíferos. La mayor parte de los ácidos
grasos tienen un pKa aproximado de 4.5 a 5.0, y por consiguiente están ionizados al pH
fisiológico.
Los ácidos grasos son una forma de detergente, porque tienen una larga cola hidrofóbica y una
cabeza polar Como es de esperar, la concentración de ácido graso libre en las células es muy
baja, porque altas concentraciones de ácidos grasos libres podrían romper las membranas. La
mayor parte de los ácidos grasos están formados por lípidos más complejos. Están unidos a
otras moléculas mediante un enlace de éster en el grupo carboxilo terminal.
Triacilgliceroles
Los ácidos grasos son combustibles metabólicos importantes, en especial en los mamíferos.
Como los átomos de carbono de los ácidos grasos están más reducidos que los de las proteínas o
los carbohidratos, la oxidación de los ácidos grasos produce más energía (~37 kJ g–1) que la
oxidación de proteínas o carbohidratos (~16 kJ g–1 cada uno). En general, los ácidos grasos se
almacenan en forma de lípidos neutros llamados triacilgliceroles. Como indica su nombre, los
triacilgliceroles están formados por tres residuos de acilo graso esterificados con glicerina, un
azúcar alcohol de tres carbonos. Los triacilgliceroles son muy hidrofóbicos. En consecuencia, a
diferencia de otros carbohidratos, se pueden almacenar en células en forma anhidra, esto es, las
moléculas no están solvatadas por agua, lo cual ocuparía espacio y añadiría masa, reduciendo la
eficiencia del almacenamiento de energía.
Las grasas y los aceites son mezclas de triacilgliceroles. Pueden ser sólidos (grasas),o líquidos
(aceites), dependiendo de sus composiciones de ácidos grasos y de la temperatura.
Los triacilgliceroles que sólo contienen grupos acilo graso saturado y de cadena larga tienden a
ser sólidos a la temperatura corporal, y los que contienen grupos acilo graso no saturados o de
cadena corta, tienden a ser líquidos. Una muestra de triacilgliceroles naturales puede contener
hasta 20 o 30 especies moleculares que difieren en la composición de sus ácidos grasos.
La mayor parte de los lípidos en la dieta humana promedio son triacilgliceroles. Esos lípidos se
descomponen en el intestino delgado por acción de las lipasas. Esas enzimas se sintetizan como
zimógenos en el páncreas, y son secretadas en el intestino delgado, donde se activan. La lipasa
pancreática cataliza la hidrólisis de los ésteres primarios (en el C1 y C3) de los
triacilgliceroles, liberando los ácidos grasos y generando monoacilgliceroles. Como los lípidos
no son solubles en el agua, la digestión de los lípidos se lleva a cabo en presencia de detergentes
enérgicos, llamados sales biliares que son derivados anfipáticos del colesterol. Las micelas de
las sales biliares solubilizan los ácidos grasos y los monoacilgliceroles, de tal modo que se
pueden difundir y ser absorbidos por las células de la pared intestinal. Los lípidos se transportan
por el organismo en forma de complejos de lípido y proteína, llamados lipoproteínas. En la
mayor parte de las células, los triacilgliceroles coalescen en forma de gotitas de grasa. Esas
gotitas a veces se ven cerca de las mitocondrias en células que se basan en ácidos grasos para
obtener su energía metabólica. En los mamíferos, la mayor parte de la grasa se almacena en el
tejido adiposo, formado por células especializadas llamadas adipocitos. Cada adipocito contiene
una gota grande de grasa que forma casi todo el volumen de la célula. Aunque están distribuidos
en los organismos de los mamíferos, la mayor parte de los tejidos adiposos están justo bajo la
piel y en la cavidad abdominal. La abundante grasa subcutánea sirve como depósito de
almacenamiento de energía y como aislador térmico.
Glicerofosfolípidos
Aunque los triacilgliceroles son los lípidos más abundantes en los mamíferos (por su peso), no
se encuentran en las membranas biológicas. Los lípidos más abundantes en la mayor parte de las
membranas son los glicerofosfolípidos (que también se llaman fosfoglicéridos); como los
triacilgliceroles tienen un soporte de glicerol. Los glicerofosfolípidos más sencillos, los
fosfatidatos, consisten en dos grupos acilo graso esterificados en el C1 y C2 del 3fosfato de
glicerol.
Esfingolípidos
Después de los glicerofosfolípidos, los lípidos más abundantes en las membranas vegetales y
animales son los esfingolípidos. En los mamíferos tienen abundancia especial en tejidos del
sistema nervioso central. La mayor parte de las bacterias no tienen esfingolípidos.
En las esfingomielinas, la fosfocolina está unida al grupo hidróxido en el C1 de una ceramida).
Nótese la semejanza de la esfingomielina y la fosfatidilcolina ambas moléculas son zwitteriones
que contienen colina, fosfato y dos colas hidrofóbicas largas. Las esfingomielinas existen en las
membranas plasmáticas de la mayor parte de las células de mamíferos, y son componente
principal de las vainas de mielina que rodean a ciertas células nerviosas. Los cerebrósidos son
glicoesfingolípidos que contienen un residuo de monosacárido unido a un enlace bglicosídico
al C1 de una ceramida. Los galactocerebrósidos, llamados también galactosilceramidas, tienen
un solo residuo de bDgalactosilo como grupo de cabeza polar. Los galactocerebrósidos
abundan en el tejido nervioso,y forman casi el 15% de los lípidos en las vainas de mielina.
Muchos otros tejidos en los mamíferos contienen glucocerebrósidos, ceramidas con un grupo b
Dglucosilo en la cabeza. En algunos glicoesfingolípidos, una cadena lineal hasta de tres
residuos más de monosacárido está unida a la mitad de galactosilo o glucosilo de un
cerebrósido. Los gangliósidos son glicoesfingolípidos más complejos, donde las cadenas de
oligosacárido que contienen ácido Nacetilneuramínico (NeuNAc) están unidas a una ceramida.
El NeuNAc es un derivado acetilado del carbohidrato ácido siálico, y forma los grupos de
cabeza en gangliósidos aniónicos.
Los gangliósidos están en las superficies celulares, con las dos cadenas de hidrocarburo
de la mitad de ceramida incrustadas en la membrana plasmática, y los oligosacáridos
en la superficie extracelular.
Los gangliósidos y otros glicoesfingolípidos son parte del repertorio en la superficie celular de
diversas cadenas de oligosacárido, junto con las glicoproteínas. En forma colectiva, esos
marcadores proporcionan a las células marcas superficiales distintivas que pueden servir en
reconocimiento celular y comunicación de una célula a otra. Estructuras parecidas a los
antígenos de grupo hemático ABO en la superficie de las células humanas pueden ser
componentes de oligosacárido en glicoesfingolípidos, además de estar unidas a proteínas
formando glicoproteínas. La composición de los glicoesfingolípidos de membrana puede
cambiar en forma notable durante el desarrollo de tumores malignos.
El principal sistema amortiguador del líquido extracelular es el par HCO3/CO2
(bicarbonato/dióxido de carbono). En el líquido intracelular los dos sistemas
amortiguadores más importantes son los fosfatos y las proteínas.
Aunque el pKa del par HCO3/CO2 es bajo comparado con el pH del plasma (6.1
7.4), es un sistema amortiguador muy eficiente debido a que está en contacto con
una gran fuente de CO2 –que proviene del metabolismo y la velocidad a la que se
elimina el CO2 se puede variar con la frecuencia respiratoria.
La ecuación de HendersonHasselbach describe, p ara un pKa determinado, la
relación que hay entre la concentración de la base conjugada, el ácido y el p H de la
solución.
En la acidosis el pH de la sangre está por debajo de 7.35; en la alcalosis, por arriba de 7.45.
Las alteraciones ácidobase pueden ser metabólicas o respiratorias. En las alteraciones
metabólicas se altera el numerador de la ecuación de HendersonHasselbach, mientras
que en las respiratorias es el denominador .