Mikrobiologi

KOMPETENSI DASAR:
1.7 Mengelompokkan jamur berdasarkan ciri-ciri, cara reproduksi, dan mengaitkan
peranannya dalam kehidupan

INDIKATOR:
1.7.1 Menjelaskan ciri-ciri umum Divisio dalam Kingdom Fungi.
1.7.2 Menjelaskan dasar pengelompokkan Fungi.
1.7.3 Menggambarkan struktur tubuh jamur dari berbagai golongan.
1.7.4 Membedakan berbagai golongan jamur berdasarkan ciri-ciri morfolginya
1.7.5 Menjelaskan cara-cara perkembangbiakan yang ditemukan pada berbagai golongan
jamur.
1.7.6 Membedakan spora vegetatif dan generatif berbagai golongan jamur.

Medium berfungsi untuk mengisolasi, menumbuhkan mikroorganisme,
memperbanyak jumlah, menguji sifat- sifat fisiologi, dan menghitung jumlah mikroba. Dalam proses pembuatan medium harus disterilisasi dan menerapkan metode aseptis untuk menghindari kontaminasi pada medium. Praktikum ini bertujuan untuk mempelajari prosedur umum untuk merekonstitusi (mengembalikan kepada keadaan asalnya) medium berbentuk bubuk (terdehidrasi) dan menaruhnya dalam jumlah yang dikehendaki ke dalam wadah-wadah yang sesuai. Serta mempelajari ciri morfologi dan kultural mikroorganisme yang tumbuh sebagai koloni murni.Pada percobaan ini dapat disimpulkan bahwa pembuatan media pertumbuhan bakteri dilakukan dengan media nutrient agar (NA) didapatkan hasil positif mengandung bakteri pada sampel tangan dan sampel tutup botol. Bentuk koloni pada kedua sampel berbeda tergantung spesiesnya. Pertumbuhan dan bentuk
morfologi bakteri juga dapat dipengaruhi oleh kondisi lingkungan, faktor biotik, dan abiotik.

Streptokoke su sitne, loptaste bakterije, nepokretne, čije ćelije nakon deobe ostaju zajedno gradeći pri tom duže ili kraće lance. Neke vrste su značajne za proizvodnju mlečnih proizvoda, dok druge mogu da izazovu oboljenja kod ljudi i životinja. Streptokoke se mogu podeliti na osnovu zahteva za kiseonikom (aerobne, fakultativno anaerobne ili anaerobne); na osnovu antigenih karakteristika i na osnovu tipa hemolize.
Hemoliza je pojam koji označava raspadanje crvenih krvnih ćelija (eritrocita). Bakterijske kulture imaju sposobnost da dovedu do hemolize kada se uzgajaju na krvnom agaru. Postoje tri tipa hemolize koji pomažu razlikovanje streptokoka u mikrobiologiji, tako da se razlikuju α (alfa), β (beta) i γ (gama) hemolitičke streptokoke. Kod α hemolize kolonije streptokoka formiraju zonu hemolize koja je zelenkaste boje. Kod β hemolize streptokoke stvaraju zonu žute boje oko svojih kolonija. Ovaj tip hemolize se naziva i kompletna hemoliza, jer su svi eritrociti razgrađeni u medijumu oko i ispod bakterijske kolonije. Ukoliko bakterija ne dovede do hemolize, zona oko kolonija na agaru ostaje ne promenjena, i takve bakterije su ne hemolitične bakterije, a tip hemolize je γ hemoliza.

Tempe adalah makanan tradisional yang dihasilkan dari fermentasi biji kedelai atau beberapa bahan lainnya. Tujuan penelitian ini untuk mengetahui pengaruh penambahan rempah-rempah terhadap kualitas tempe berdasarkan warna, tekstur, aroma, dan rasa tempe serta mengetahui perbedaan kualitas tempe yang ditambah dengan berbagai macam rempah-rempah. Hasil skoring warna tempe menunjukkan warnanya yang paling bagus adalah kemiri, ketumbar, bawang putih dengan rata-rata 4. Skoring kepadatan tempe yang paling padat adalah merica , ketumbar, cabai dengan rata-rata 4. Skoring aroma tempe yang memiliki aroma bagus adalah kemiri, merica, bawang putih dengan rerata 4 dan skoring pada rasa tempe yang memiliki rasa enak adalah kemri dan ketumbar dengan rerata 4. Penambahan rempah-rempah dalam proses pembuatan tempe dapat meningkatkan kualitas tempe, dengan menambah cita rasa. Rempah-rempah terkandung nutrisi yang juga diperlukan untuk pertumbuhan kapang, sehingga miselium kapang tumbuh lebih optimal. Warna, tekstur, aroma dan rasa tempe dengan penambahan rempah-rempah menunjukkan warna yang bervariasi.
Kata Kunci:  Tempe, Rempah, Kedelai & Suplemen

Mikrobiologi pangan merupakan bagian penting dari mikrobiologi terapan. Mikroba dan pangan memiliki keterkaitan yang sangat erat. Kehadiran mikroba pada bahan pangan dapat menentukan kualitas dan tingkat keamanan pangan. Mikroba dapat menyebabkan kerusakan makanan dan keracunan bagi manusia yang mengkonsumsi. Namun demikian, mikroba juga merupakan agen bioproses yang dapat meningkatkan nilai gizi suatu bahan pangan.
Mikroba telah banyak dimanfaatkan dalam bidang pangan dan industri. Ukurannya yang mikroskopis memungkinkan rasio antara luas permukaan dan volume menjadi tinggi sehingga kontak dengan substrat menjadi maksimum. Tidak hanya ukuran, kemampuan reproduksinya yang cepat dibandingkan dengan organisme lain membuat pemanfaatan mikroba unggul dalam bidang industri.
Buku ajar ini berisi tentang sejarah dan ruang lingkup mikrobiologi pangan, peranan mikroba pada pangan, faktor-faktor yang mempengaruhi pertumbuhan mikroba pada bahan pangan, kerusakan pangan dan pengendaliannya, penyakit akibat bahan pangan, fermentasi, dan teknik-teknik analisis mikrobiologi pada bahan pangan. Buku ajar ini ditulis sebagai bahan ajar dalam Mata Kuliah Mikrobiologi Pangan, serta sebagai referensi di bidang mikrobiologi terapan

Keanekaragaman mikrobia yang meliputi bakteri, khamir, dan kapang dapat diklasifikasikan berdasarkan similaritas karakter atau DNA fingerprinting. Metode taksonomi yang digunakan adalah taksonomi Adansonian atau taksonomi numerik-fenetik yang berdasarkan nilai indeks similaritas antar strain mikrobia yang digunakan. Nilai indeks similaritas dapat dianalisis menggunakan Ssm (Simple Matching Coefficient), berdasarkan karakter double negative, dan Sj (Jaccard Coefficient), tidak berdasarkan karakter double negative.
Mikrobia yang diklasifikasikan pada percobaan ini adalah bakteri, khamir, dan kapang dengan enam macam strain yaitu strain A, B, C, D, E, dan F. Klasifikasi keenam strain mikrobia tersebut berdasarkan koleksi data karakterisasi morfologi koloni, morfologi, hasil uji biokimia, dan hasil uji fisiologis. Selain itu, 20 strain bakteri penghasil alkalin protease berdasarkan hasil DNA fingerprinting juga diklasifikasikan secara numerik-fenetik menggunakan program MVSP (Multivariate Statistical Package).

Uji biokimia adalah pengujian larutan atau zat-zat kimia dari bahan-bahan dan proses-proses yang terjadi dalam tubuh makhluk hidup, sebagai upaya untuk memahami proses kehidupan dari sisi kimia. Uji fisiologi bisanya identik dengan uji biokimia. Uji biokimia yang biasanya dipakai dalam kegiatan identifikasi bakteri atau mikroorganisme yang antara lain uji katalase, koagulase, dan lain-lain. Pengujian biokimia merupakan salah satu hal yang sangat penting dalam dunia mikrobiologi. Uji-uji biokimia yang biasanya dipakai dalam kegiatan identifikasi bakteri atau mikroorganisme yaitu antara lain adalah uji MR-VP, uji gula-gula, uji SIM, Uji TSIA, Uji Indol, dan Uji Simmons Citrate.

Mikroorganisme merupakan makhluk hidup yang berukuran sangat kecil yaitu dalam skala micrometer atau micron (µ) atau sepersejuta meter dan tidak dapat dilihat dengan mata telanjang. Dalam kepentingan praktis, mikroorganisme sering disebut sebagai mikroba atau kuman, yang termasuk dalam golongan mikroorganisme adalah bakteri (eubactera, archaebacteria), fungi (yeasts, molds), protozoa, microscopic algae dan virus serta beberapa macam cacing (helmints). Mikroorganisme tersebut harus memiliki syarat-syarat tertentu agar dapat digunakan dalam bidang mikrobiologi industry. Pada bidang mikrobiologi industri, mikroorganisme seperti bakteri, fungi dan lainnya dapat menghasilkan metabolit primer dan sekunder. Metabolit primer adalah senyawa-senyawa kimia yang dihasilkan oleh mikroba dan dibutuhkan oleh mikroba tersebut untuk pertumbuhannya (Rahman et.al, 1992). Metabolit primer antara lain asam-asam organik dan asam-asam amino. Lactobacillus bulgaricus merupakan bakteri homofermentatif yang terutama memproduksi asam laktat melalui proses glikolisis/pemecahan glukosa. Asam organik adalah senyawa organik yang mempunyai derajat keasaman (bahasa Inggris: acidic properties). Asam organik yang paling umum adalah asam alkanoat yang memiliki derajat keasaman dengan gugus karboksil-COOH, dan asam sulfonat dengan gugus-SO 2 OH mempunyai derajat keasaman yang relatif lebih kuat. Sedangkan Asam amino adalah komponen utama protein, yang ditemukan dalam semua organisme hidup dan memainkan peranan dalam sel hidup. Pada proses metabolisme mikroba tidak semuanya berhasil dalam memproduksi metabolit primer. Hal ini disebabkan oleh faktor-faktor yang dapat mempengaruhi produksi metabolisme, sehingga tidak menghasilkan produk metabolit primer. Faktor-faktor tersebut antara lain seperti suhu, pH, substrat, media dan lain sebagainya. dari latar belakang di atas, penulis ingin mengkaji lanjut tentang "Prinsip Mikroorganisme Pemroses Produksi Berbagai Metabolit Primer".

Mikrobiologi tanah adalah bagian disiplin mikrobiologi yang mempelajari kehidupan, aktivitas, dan peranan mikroorganisme di dalam tanah. Tanah merupakan lingkungan kompleks yang ditempati mikroorganisme beraneka ragam. Ciri-ciri lingkungan tanah bervariasi menurut letak dan iklimnya. Tanah juga memiliki kedalaman, sifat-sifat fisik, komposisi kimiawi dan asal yang berbeda. Komposisi tanah terdiri dari materi nonorganik 45% ( Si, Al, Fe, Ca, Mg, K, Na, P, dan lain-lain), materi organik 5 % (karbohidrat, protein, lipid, dan lain-lain), air (25 %) dan udara (25 %). sementara organisme di tanah terdiri dari vertebrata, invertebrata,dan mikroorganisme.

Pengantar mikrobiologi adalah salah satu buku yang direkomendasikan untuk mahasiswa yang sedang mengambil mata kuliah mikrobiologi di Fakultas Keguruan Ilmu Pendidikan khususnya Program Studi Pendidikan Biologi. Pengantar mikrobiologi memuat materi mata kuliah mikrobiologi sebagai berikut. (1) Sejarah mikrobiologi. (2) Perbandingan sel prokariotik dan eukariotik. (3) Ciri-ciri virus, archaeobacteria, dan eubacteria. (4) Fungi, protozoa, dan alga. (5) Pengaruh faktor luar terhadap pertumbuhan mikroba. (6) Metabolisme mikroorganisme. (7) Pertumbuhan dan perkembangan mikroba. (8) Peranan mikroorganisme dalam kehidupan. Buku ini mencoba membantu para mahasiswa yang sedang mengambil mata kuliah mikrobiologi untuk memahami konsep mikrobiologi.

KOMPETENSI DASAR:
3.5 Mengidentifikasi struktur, cara hidup, reproduksi dan peran bakteri dalam kehidupan

INDIKATOR:
3.5.1 Menjelaskan ciri-ciri archebacteria dan eubacteria
3.5.2 Membedakan ciri-ciri archebacteria dan eubacteria.
3.5.3 Menjelakan cara mengisolasi bakteri.
3.5.4 Menjelaskan cara perkembangbiakan bakteri.
3.5.5 Menjelaskan berbagai peranan bakteri yang menguntungkan/merugikan dalam kehidupan

Mikrobiologi kedokteran adalah ilmu yang mempelajari mikroorganisme sebagai penyebab penyakit infeksi, cara mendiagnosis, pengobatan, pencegahan dan pengendalian infeksi. 
Suatu mikroorganisme yang membuat kerusakan atau kerugian terhadap tubuh inang disebut sebagai patogen. Sedangkan kemampuan mikroorganisme untuk menimbulkan penyakit disebut pathogenesis. Ketika suatu mikroorganisme memasuki inang yang memasuki jaringan tubuh dan memperbanyak diri, mikroorganisme dapat menimbulkan infeksi. Jika keadaan inang rentan terhadap infeksi dan fungsi biologinya rusak, maka hal ini dapat menimbulkan penyakit. Patogen merupakan beberapa jenis mikroorganisme atau organisme lain yang berukuran yang lebih besar yang mampu menyebabkan penyakit.

Virologi merupakan cabang ilmu biologi yang mempelajari tentang
virus. Virologi penting untuk dipelajari dalam kaitannya dengan
kesehatan, industri farmasi, peternakan, perikanan dan pertanian. Virus
diketahui sebagai parasit intraselular obligat yang berukuran
ultramikroskopis. Virus hanya dapat bereproduksi di dalam sel hidup
sebagai inangnya. Umumnya, virus terasosiasi dengan penyakit tertentu,
baik manusia, hewan, maupun tumbuhan. Virus juga mampu menginfeksi mikroba seperti bakteri.
Buku ajar ini berisi tentang apa itu virus, ciri-ciri umum virus, sejarah
perkembangan virologi, struktur partikel virus, klasifikasi, reproduksi
virus, peranan virus dalam kehidupan baik yang menguntungkan maupun yang merugikan, dan metode-metode yang digunakan di laboratorium untuk analisis virus. Pada setiap Bab terdapat capaian pembelajaran yang hendak dicapai. Selain itu, setiap Bab juga dilengkapi dengan Aktivitas Kelas dan Tes Formatif yang membantu untuk mencapai tujuan pembelajaran dan untuk memperdalam materi pada setiap babnya. Buku Ajar ini ditulis sebagai bahan ajar dalam Mata Kuliah Virologi di Program Studi S1 Biologi, serta sebagai referensi di bidang mikrobiologi.

Mikrobiologi lingkungan air adalah ilmu yang mengacu pada studi tentang mikroorganisme yang hidup di air atau yang dapat diangkat dari satu habitat yang lain dengan air. 

Ada dua jenis utama dari air yaitu:
1. Air Tanah
2. Air Permukaan

Berikut lingkungan perairan meliputi:
1. Lingkungan air laut di mana mikroorganisme terdapat di seluruh bagian laut dari permukaan air laut sampai dasar relung yang terdalam. Di lingkungan laut lepas memiliki populasi mikroorganisme yang relatif lebih rendah, di lingkungan pantai populasi mikroorganisme terdapat lebih banyak. Hal ini karena lingkungan pantai kaya akan nutrien yang berasal dari daratan.
2. Lingkungan air tawar di mana pada umumnya lingkungan perairan tawar lebih banyak mengandung nutrien jika dibandingkan dengan lingkungan perairan laut. Lingkungan perairan tawar dibagi menjadi 2 kategori yaitu :
- Habitat lentik contoh danau, kolam.
- Habitat lotik contoh mata air, sungai.
3) Lingkungan perairan payau (peralihan air tawar ke air laut) atau merupakan lingkungan perairan tawar merupakan daerah transisi antara perairan tawar dan laut.