Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
EHF
Ідентифікатори
Символи
EHF , ESE3, ESE3B, ESEJ, ETS homologous factor
Зовнішні ІД
OMIM : 605439 MGI: 1270840 HomoloGene: 7301 GeneCards: EHF
Пов'язані генетичні захворювання
ожиріння [ 1]
Онтологія гена
Молекулярна функція
• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• комплекс Ґольджі • нуклеоплазма • клітинне ядро
Біологічний процес
• multicellular organism development • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • проліферація • epithelial cell proliferation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • epithelial cell differentiation • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • диференціація клітин
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 11: 34.62 – 34.66 Mb
Хр. 2: 103.09 – 103.13 Mb
PubMed search
[ 2]
[ 3] Вікідані
EHF (англ. ETS homologous factor ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[ 4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 300 амінокислот , а молекулярна маса — 34 892[ 5] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MILEGGGVMN LNPGNNLLHQ PPAWTDSYST CNVSSGFFGG QWHEIHPQYW
TKYQVWEWLQ HLLDTNQLDA NCIPFQEFDI NGEHLCSMSL QEFTRAAGTA
GQLLYSNLQH LKWNGQCSSD LFQSTHNVIV KTEQTEPSIM NTWKDENYLY
DTNYGSTVDL LDSKTFCRAQ ISMTTTSHLP VAESPDMKKE QDPPAKCHTK
KHNPRGTHLW EFIRDILLNP DKNPGLIKWE DRSEGVFRFL KSEAVAQLWG
KKKNNSSMTY EKLSRAMRYY YKREILERVD GRRLVYKFGK NARGWRENEN
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції , альтернативний сплайсинг .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
Lim J.H., Cho J.-Y., Park Y.B., Park J.-W., Kwon T.K. (2006). ESE-3 transcription factor is involved in the expression of death receptor (DR)-5 through putative Ets sites. Biochem. Biophys. Res. Commun . 350 : 736—741. PMID 17027647 DOI :10.1016/j.bbrc.2006.09.102
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
(0.6) Інші